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.' ,o.""", ".~, '.' ~'.ChariTchadDagana __-4--------'----.SOD BFBP2BSOD8AAT38AAT2BF8P28PGM8 GP! 18Chobra ~ GP! 2 8CK 28ManzallaTurkanaBaringoBouaké VBamakoTchad(B)SelinguéSOD8aSodoréAwasaManzallaCK28QuarunSOD8BaringoFigure 16: Arbres phylogénétiques montrant les relations évolutives entre lespopulations de Oreochromis niloticus, obtenus avec le programme«MIX». (A) à partir d'une matrice présence/absence (P99). (B)à partir d'une matrice présence/absence (P 95 ). Le sens des flèchesindique la présence d'un caractère (>; vers le nom de la population)ou son absence (».-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------B. ADEPO-GOURENE Mémoire de Thèse
69(1) les populations d'Afrique de l'Ouest; (II) celles de l'Ethiopie; (III) lespopulations d'Egypte; (IV) les populations de l'Afrique de l'Est. Le réseau obtenuavec l'algorithme MIX, en utilisant les allèles dont la fréquence est inférieure à 5%,montre une structure voisine. Cependant les groupes III et IV sont moins bienindividualisés.Dans le but de déterminer le sens de la différenciation entre les groupesnous avons raciné les réseaux avec l'espèce-soeur Oreochromis aureus. Sur leréseau consensus obtenu (Fig. 17), on retrouve les quatre groupes précédemmentobservés. Oreochfomis aureus ne pertube donc pas la matrice. Cette espèceprésente des affinités avec le groupe l, lorsqu'on tient compte de tous les allèles, etavec le groupe III pour les allèles dont la fréquence est supérieure à 5%.Ces deux groupes appartiennent à Oreochromis niloticus niloticus. Aussi,cette sous-espèce apparaît comme celle qui possède le plus de caractères ancestrauxou plésiomorphes.2.3. IMPLICATIONS BIOGEOGRAPHIQUESL'étude de la différenciation génétique de Oreochromis niloticus sur touteson aire de distribution a pennis de montrer que les populations de O. n. niloticussont plus polymorphes que les populations des autres sous-espèces. Les analysesphylogénétiques, incluant la population de Oreochromis aureus, ont révélé que cettedernière a des affinités avec les populations de Oreochromis niloticus niloticus(Figure 18). Cette proximité est due à la présence des allèles LDH2B et AAT3B queO. n. niloticus partage avec O. aureus en plus des Il allèles que chaque sous-espècea, au moins, en commun avec cette dernière.B. ADEPO-GOURENE Mémoire de Thèse
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