Quelle est la contribution des milieux semi-naturels - Les thèses en ...

Chapitre 4milieu ouvert adjacent, c'est‐à‐dire encore que les DEI sont égales dans les deux milieuxde part et d'autre de la bordure. Ceci n'étant pas évident d'un point de vue écologique(pour des effets de lisière asymétriques sur des variables abiotiques, voir par exempleMatlack, 1993; Cadenasso et al., 1997), nous avons donc choisi d'appliquer l'analyseséparément sur les bois et les milieux ouverts, ce qui a conduit à la réalisation de huitNCAP (4 ensembles x 2 milieux).La méthode de la NCAP vise à ajuster des données écologiques caractérisantdes assemblages d'espèces à un gradient environnementaldont l'effet sur ces assemblages d'espèces est non linéaire. Ellesuit pour cela une progression en deux étapes.La première étape consiste à calculer une matrice de dissimilarité àpartir du tableau espèces‐relevés M, en utilisant (ici) une distancede Bray‐Curtis. Cette matrice de dissimilarité sert ensuite de base àune ordination (une analyse en coordonnées principales, plus précisément),qui aboutit à une matrice Q donnant les coordonnées des rrelevés du départ sur les s axes de l'ordination. La deuxième étapeest la recherche de:m, le nombre d'axes de Q à prendre en comptey, leur combinaison linéaireb, un nombre réelbxetels que la corrélation entre y et g(x) soit maximale.1bxeEn termes écologiques et dans le cas présent, y donne la position desassemblages présents dans les différents relevés sur le gradient écologiqueformé par l'ensemble des assemblages d'espèces rencontrés,gradient qui va de l'assemblage le plus typé "milieu ouvert" (on aalors y~0, ici) à celui le plus typé "forestier" (y~1, ici).La variable x représente le gradient environnemental influençant lesassemblages, ici il s'agit de la distance à la bordure. Le termebxeg(x) 1bxereprésente donc la distance à la bordure transformée par la fonctionlogistique, dans lequel le paramètre b donne la pente à l'origine; cettetransformation permet de rendre compte de l'effet non linéairede la distance à la bordure sur les assemblages d'espèces.La fonction g(x) dont le paramètre b a été optimisé peut alors êtreutilisée pour prédire la distance de la bordure à laquelle l'influencede la bordure sur les assemblages de Carabidae devient négligeable.En prenant un seuil de similarité de 95%, cela signifie que la DEIdans le bois est la distance x à laquelle g(x)=0,95 (dans le milieu ouvert,il faut prendre g(x)=0,05).Encadré 1. Détails de la méthode NCAP et calcul de la DEI.r relevésr relevés1010,950yys espècesMOrdinations axesQSélection etcombinaisonlinéaire des mpremiers axesr relevésxReprésentationgraphique0Calcul dela DEI0 DEIg(x)g(x)xx64