12.06.2015 Views

Williams-Beureni sündroomi kromosoomi regiooni 22 valgu ...

Williams-Beureni sündroomi kromosoomi regiooni 22 valgu ...

Williams-Beureni sündroomi kromosoomi regiooni 22 valgu ...

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

peal. 28 WBS lookuse geenist on erinevaid ühe geeni knock-out hiire mudeleid 11 (Osborne,<br />

2010).<br />

1.4 WBSCR<strong>22</strong> iseloomustus ja ülevaade funktsiooni uuringutest<br />

WBSCR<strong>22</strong> geen koosneb 45 kb pikkusele DNA alale jaotunud 12 eksonist ja kodeerib 281<br />

aminohappelist valku molekulmassiga 31,8 kDa ning isolektrilise punktiga pH 8,95 (Doll ja<br />

Grzeschik, 2001). Bioinformaatiliselt on ennustatud, et vaatluse all olevas <strong>valgu</strong>s esineb S-<br />

adenosüül-L-metioniini (SAM) sõltuv metüültransferaasi domeen (MTD) (Wang jt., 1997) ja<br />

kaheosaline tuuma lokalisatsiooni signaal (NLS – nuclear localization signal). On teada, et<br />

SAM-sõltuvad metüültransferaasid omavad sarnast seitsmest β-lehest koosnevat<br />

põhistruktuuri tuntud kui SAM-sõltuv MTaasne β-lehtstruktuur, kuid on võimelised<br />

metüleerima erinevaid substraate alates väikestest molekulidest nagu katehool (1,2-<br />

dihüdrobenseen) ja glütsiin kuni makromolekulideni nagu DNA, RNA ja <strong>valgu</strong>d (Cheng ja<br />

Roberts, 2001). WBSCR<strong>22</strong> <strong>valgu</strong> täpne roll rakus on küll teadmata, kuid UniProtKB<br />

andmetel on ennustatud, et see võiks olla seotud DNA metüleerimisega. DNA metülatsioon<br />

omab suurt tähtsust transkriptsiooni regulatsioonil.<br />

Paljude inimese geenide funktsioon on ennustatud mudelorganismide uurimisest (Bassett jt.,<br />

1995; Clayton jt., 1997). Sekveneeritud Saccharomyces cerevisiae genoom on laialt kasutatav<br />

mudelorganism eukarüootse raku uurimiseks (Goffeau jt., 1996). WBSCR<strong>22</strong> <strong>valgu</strong><br />

homoloogidest on iseloomustatud vaid S. cerevisiae SAM-i seondav metüültransferaas<br />

Bud23. 2008. aastal ilmunud artiklis näitasid Joshua White ja kolleegid, et Bud23 valk<br />

metüleerib ribosoomides tugevalt konserveerunud 18S rRNA jääki G1575 ja on vajalik pre-<br />

40S subühiku efektiivseks ekspordiks tuumast (White jt., 2008).<br />

2011. aastal vähiuurigute ajakirjas avaldatud artiklis näitasid Nakazawa ja kolleegid, et<br />

WBSCR<strong>22</strong> SAM-sõltuv MTD on tähtis edendamaks vähi metastaaside moodustumist ning et<br />

WBSCR<strong>22</strong> geeni knock-down vähirakkudes vähendab metastaaside moodustumist.<br />

Eesmärgiks oli identifitseerida uusi metastaaside moodustumisel osalevaid faktoreid. Selleks<br />

viidi läbi in vivo geneetiline sõeluuring, mille käigus loodi kõrgelt metastaatilisest hiire<br />

melanoomi rakuliini B16-BL6 geneetilisest materjalist retroviiruspõhine cDNA raamatukogu<br />

ning viidi see normaalse rakutsükliga CHO rakkudesse. Veenisiseselt süstiti<br />

CHO/raamatukogu hiirde. 28 päeva pärast koguti kopsudest ellujäänud rakud ning<br />

inokuleeriti uuesti veenisiseselt. Ellujäänud rakkudest identifitseeriti WBSCR<strong>22</strong> geeni<br />

järjestus, mis nimetati ümber Merm1-ks (Merm1 - metastasis-related methyltransferase 1).<br />

10

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!