GDNF geeni sekveneerimine ja mutatsioonide analüüs ...

SissejuhatusKaasasündinud neeru ja kuseteede anomaaliad ehk CAKUT on kõige sagedasemakskrooniliste neeruhaiguste ja surma põhjuseks laste ja noorukite seas (Song ja Yosypiv, 2010).CAKUT hõlmab neerude tasemel esinevate laia struktuursete ja funktsionaalsete väärarengutevahemikku (Song ja Yosypiv, 2010). Viimaste aastate jooksul läbi viidud uuringud ontõestanud, et vastsündinutel mitmel anatoomilisel kujul esinev CAKUT on polügeennehaigus, mida põhjustavad mitme geeni muutused korraga (Hildebrandt, 2010).GDNF geen on üheks nefrogeneesi põhielemendiks, mis tagab neerude ja kuseteede korrektsearengu. Mutatsioonid selles geenis või geeni üldine puudumine võivad viia erinevate neeru jakuseteede anomaaliate tekkeni. Kuna GDNF geeni ekspressioon ja neerude ning kuseteedeareng on otseselt seotud (Michos jt., 2010), võib oletada, et ka CAKUT võib olla põhjustatudseni veel leidmata mutatsioonist antud geenis. Kuigi CAKUT-i tekkepõhjuste kohta on tehtuderinevaid uuringuid, pole seni selle otsest seost GDNF geenis olevate mutatsioonidega veelleitud (Jeanpierre jt., 2011).Käesoleva töö eesmärgiks oli leida mutatsioonid GDNF geenis, mis võiksid potentsiaalseltpõhjustada CAKUT-i teket. Selle jaoks uuriti Eesti geenivaramuga liitunud erinevate neeru jakuseteede anomaaliatega inimeste DNA proove, sekveneerides Sangeri meetodiga GDNFgeeni kodeerivat ja 3’ mittekodeerivat ala. Eksperimendi lõpus analüüsiti DNA proovereferents-GDNF geeni vastu.4