Pakiet Informacyjny ECTS

Metody instrumentalneWydział Nauk PrzyrodniczychKierunek MikrobiologiaRodzaj studiów: studia stacjonarne I stopniaKOD Przedmiotu: 213.4IV93.K0329Tryb studiówstacjonarneNazwa przedmiotu:Jednostka organizacyjna US:Katedra Biochemii, Katedra GenetykiRok Semestr Rodzaj zajęć:LiczbagodzinIII 5 wykłady 305 Ćwiczenia30laboratoryjneMETODY INSTRUMENTALNEPunktyECTS:Typ przedmiotuJęzykwykładowy5 obowiązkowy polskiniestacjonarneProwadzący przedmiotProf. dr hab. Jolanta Tarasiuk, dr Dorota Kostrzewa-Nowak, dr Robert Nowak, dr Anna Nowakowska, mgrAgnieszka MaruszewskaProf. dr hab. Bogumiła Skotarczak, dr Anna Rymaszewska, dr Beata WodeckaWymagania wstępne: 4Chemia ogólna i analityczna, chemia fizyczna, chemia organiczna, biofizyka, informatykaCele przedmiotu:Zapoznanie się z wybranymi metodami instrumentalnymi stosowanymi w badaniach mikrobiologicznychMetody dydaktyczne:Wykład, ćwiczenia laboratoryjneTreści merytoryczne przedmiotu:Wykłady: Techniki pomiarów pH-metrycznych. Podstawy metod spektroskopowych.; wykorzystanie czytnikówmikropłytek. Podstawy cytometrii przepływowej; techniki sortowania komórek. Wybrane technikichromatograficzne. : Metody badania genomu, techniki analizy DNA; enzymy restrykcyjne, klonowanie DNA,hybrydyzacja, powielanie fragmentów DNA, sekwencjonowanie. Metody identyfikacji mutacji i zmianpolimorficznych. Metody przesiewowe, wykrywanie znanych mutacji, mapowanie i metody identyfikacji genów.Ćwiczenia: Metody elektroanalityczne – pH-metria: budowa i obsługa pH-metru, techniki i zastosowania pomiarów pH-metrycznych.Podstawy metod spektroskopowych – budowa i zasada działania spektrofotometrów, pomiary spektrofotometryczne, pomiarykinetyczne, czytniki mikropłytek. Podstawy cytometrii przepływowej – budowa i zasada działania podstawowych elementówcytometru, przygotowanie materiału do badań, zebranie i analiza danych, możliwe zastosowania cytometrii przepływowej. Metodychromatograficzne – wysokosprawna chromatografia cieczowa (HPLC): budowa i zasada działania chromatografu cieczowego,podstawowe parametry charakteryzujące rozdział chromatograficzny, analiza chromatogramów. Metody wirownicze: typy wirówek,budowa i obsługa ultrawirówki, wirówki z chłodzeniem, mikrowirówki. Typy rotorów, probówek wirowniczych; wirowanie wgradientach. Techniki elektroforetyczne – elektroforeza pionowa i horyzontalna, rodzaje żeli i buforów, aparaty do elektroforezy.Techniki izolacji DNA z różnych materiałów biologicznych oraz techniki oceny jakościowej i ilościowej izolatów DNA. Technikiwykrywania DNA w materiałach biologicznych – PCR, PCR-RFLP, PCR w czasie rzeczywistym, sekwencjonowanie. Technikidokumentacji i analizy obrazu.Forma i warunki zaliczenia:Zaliczenie na ocenęLiteratura podstawowa:Kocjan R. (red.), Chemia analityczna. Tom 2. Analiza instrumentalna, PZWL, Warszawa 2002Kozik A., Rąpała-Kozik M., Guevara-Lora I., Analiza instrumentalna w biochemii. Wybrane problemy i metodyinstrumentalnej biochemii analitycznej, Instytut Biologii Molekularnej UJ, Kraków 2001Ciba J. (red.), Poradnik chemika analityka T. 2 - analiza instrumentalna, WNT, Warszawa 1998Literatura uzupełniająca: