Projekt 4. - Institut for Matematik og Datalogi - Syddansk Universitet
Projekt 4. - Institut for Matematik og Datalogi - Syddansk Universitet
Projekt 4. - Institut for Matematik og Datalogi - Syddansk Universitet
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
N a t u r v i d e n s k a b e l i g t P r o j e k t / F a r m a c e u t : V a l g f r i t P r o j e k t<br />
<strong>Projekt</strong> 31. Infektionsbiol<strong>og</strong>i: hvordan invaderer<br />
bakterier vores celler?<br />
Vejledere: Jakob Møller-Jensen jakobm@bmb.sdu.dk; Jonas Borch-Jensen jonasb@bmb.sdu.dk;<br />
Surabhi Kandige sukh@bmb.sdu.dk<br />
<strong>Institut</strong>: <strong>Institut</strong> <strong>for</strong> Biokemi <strong>og</strong> Molekylær Biol<strong>og</strong>i<br />
Praktisk del: <strong>Institut</strong> <strong>for</strong> Biokemi <strong>og</strong> Molekylær Biol<strong>og</strong>i<br />
Gruppeplacering: Biblioteket<br />
Gruppestørrelse: Mindst 3 <strong>og</strong> max 4 deltagere. Én gruppe kan arbejde med projektet<br />
Kommentarer: Dele af kursus<strong>for</strong>løbet vil <strong>for</strong>egå på engelsk.<br />
Keywords:<br />
Infektion, pat<strong>og</strong>ene mikroorganismer, cellekultur, protein- <strong>og</strong> lipidanalyser<br />
Abstract<br />
En række pat<strong>og</strong>ene mikroorganismer er i stand til at invadere celler i vores krop i <strong>for</strong>bindelse<br />
med infektion. Ved celleinvasion kan bakterierne opnå beskyttelse imod såvel kroppens immun<strong>for</strong>svar<br />
som antimikrobielle medikamenter.<br />
Nyere <strong>for</strong>skning har vist at invasionsprocessen kan indledes med at bakterierne binder til særlige<br />
cholesterol-rige domæner i værtscellens membran, de såkaldte lipid rafts. Vi ønsker i dette projekt<br />
at undersøge den bakterielle celleinvasion ved brug af både cellebiol<strong>og</strong>iske <strong>og</strong> biokemiske<br />
analyser.<br />
Følgende metoder vil anvendes i projektet:<br />
Dyrkning af human cellekultur<br />
Dyrkning af bakteriekultur<br />
Infektions<strong>for</strong>søg til undersøgelse af lipid rafts‟ betydning <strong>for</strong> bakteriel invasion<br />
Fremstilling af kunstige membranvesikler med defineret lipidkomposition<br />
Undersøgelse af bakteriernes binding til specifikke lipider ved vesikel-pull-down<br />
eksperimenter <strong>og</strong> fluorescensmikroskopi<br />
Identifikation af lipid-interagerende bakterielle proteiner vha. massespektrometri.<br />
Det <strong>for</strong>ventes at disse <strong>for</strong>søg vil føre til ny viden omkring molekylære interaktioner, der er afgørende<br />
<strong>for</strong> det tidlige stadie af bakteriel infektion.<br />
Minikurser<br />
Obligatoriske: <strong>Projekt</strong>arbejde (Microsoft, Nat)<br />
Anbefalede: Ingen<br />
Litteraturliste over metode artikler, som udleveres til de studerende<br />
1. van der Goot, F. G., van Nhieu, G. T., Allaoui, A., Sansonetti, P., and Lafont, F. (2004)<br />
Rafts can trigger contact-mediated secretion of bacterial effectors via a lipid-based mechanism,<br />
Journal of Biol<strong>og</strong>ical Chemistry 279, 47792-47798.<br />
2. Mañes S, del Real G, Martínez-A C. Path<strong>og</strong>ens: raft hijackers. Nat Rev Immunol.<br />
2003 Jul;3(7):557-68.<br />
3. Pizarro-Cerdá J, Cossart P. Bacterial adhesion and entry into host cells.<br />
Cell. 2006 Feb 24;124(4):715-27.<br />
33
Change language