22.12.2013 Views

Projekt 4. - Institut for Matematik og Datalogi - Syddansk Universitet

Projekt 4. - Institut for Matematik og Datalogi - Syddansk Universitet

Projekt 4. - Institut for Matematik og Datalogi - Syddansk Universitet

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

N a t u r v i d e n s k a b e l i g t P r o j e k t / F a r m a c e u t : V a l g f r i t P r o j e k t<br />

<strong>Projekt</strong> 35. Ion- <strong>og</strong> vandtransport proteiner i<br />

fiskegællen<br />

Vejleder: Steffen Søndergaard Madsen, steffen@biol<strong>og</strong>y.sdu.dk<br />

<strong>Institut</strong>: Biol<strong>og</strong>isk <strong>Institut</strong><br />

Praktisk del: Biol<strong>og</strong>isk <strong>Institut</strong>, <strong>for</strong>skningslaboratorium<br />

Gruppeplacering: Biblioteket<br />

Gruppestørrelse: Mindst 3 <strong>og</strong> max 4 deltagere. Én gruppe kan arbejde med projektet.<br />

Kommentarer: Ingen<br />

Keywords:<br />

iontransport, NaK-pumpen, aquaporiner, gællefunktion, hormoner, mRNA <strong>og</strong><br />

protein ekspression<br />

Abstract<br />

Fiskegællen har mange funktioner, bl.a. respiratoriske, syre-base regulatoriske <strong>og</strong> ionregulerende<br />

funktioner. Gællen har en kompleks tre-dimensionel struktur, der på trods af dens<br />

kompakte størrelse giver den et meget stort overfladeareal. Relativt få celletyper indgår i gællens<br />

opbygning: stukturelle (brusk- <strong>og</strong> søjleceller) <strong>og</strong> epithelceller (mukus, flise- <strong>og</strong> kloridceller).<br />

Kloridcellerne findes i flere sub-typer (ion-optagende <strong>og</strong> ion-udskillende), der varierer i antal<br />

afhængigt af ionindholdet i det omgivende vand. Gællens tynde struktur <strong>og</strong> høje permeabilitet<br />

bevirker at u<strong>for</strong>delagtige passive fluxer af vand <strong>og</strong> ioner opstår over gælleepithelet. Disse fluxer<br />

virker <strong>for</strong>styrrende på fiskens vand- <strong>og</strong> saltbalance <strong>og</strong> må kompenseres på flere <strong>for</strong>skellige niveauer<br />

<strong>for</strong> ikke at fiskens indre miljø <strong>for</strong>styrres. Et af de osmoregulerende organer er netop gællen,<br />

der både aktivt kan optage <strong>og</strong> udskille ioner - afhængig af saltholdigheden fisken lever i. Euryhaline<br />

fisk kan omstille sig mellem <strong>for</strong>skellige saltholdigheder, bl.a. <strong>for</strong>di deres gællefunktion<br />

kan omstilles fra netto ion-optagelse (i ferskvand) til netto ion-udskillelse (i saltvand). Denne<br />

omstilling involverer regulering af en række <strong>for</strong>skellige ion- <strong>og</strong> vandtransport proteiner der findes<br />

i gællens <strong>for</strong>skellige celler. Blandt disse kan nævnes Na + ,K + -pumpen, Na + ,K + , 2Cl - -<br />

cotransporteren, CFTR Cl - -kanalen <strong>og</strong> H + -pumpen. N<strong>og</strong>le af disse fungerer i både ferskvand <strong>og</strong><br />

saltvand (f.eks. Na + ,K + -pumpen), hvorimod andre fungerer når fisken opholder sig i enten ferskvand<br />

(H + -pumpen) eller saltvand (Na + ,K + , 2Cl - -cotransporteren, CFTR Cl - -kanalen). Derudover<br />

skal gællecellernes vand-permeabilitet reguleres <strong>for</strong> at sikre at cellernes volumen holdes konstant.<br />

Heri indgår regulering af aquaporiner – molekylære vandkanaler.<br />

<strong>Projekt</strong>et tager sigte på at karakterisere hvorledes gællefunktionen ændres i <strong>for</strong>bindelse med omstilling<br />

mellem saltholdigheder? Mængden <strong>og</strong> reguleringen af vigtige ion- <strong>og</strong> vandtransporterende<br />

proteiner i gællen kan undersøges på mRNA- <strong>og</strong> protein-niveau ved teknikker som spektrofotometri,<br />

enzymassays, Western blotting <strong>og</strong> kvantitativ real-time PCR (QPCR). Forsøg med hormonel<br />

regulering af ekspressionen kan evt. indgå. <strong>Projekt</strong>et vil give en stor mulighed <strong>for</strong> <strong>for</strong>dybelse<br />

i basale fysiol<strong>og</strong>iske <strong>og</strong> molekylære tilpasningsstrategier i <strong>for</strong>bindelse med miljøskift.<br />

Minikurser<br />

Obligatorisk: <strong>Projekt</strong>arbejde (Microsoft, Nat).<br />

Anbefalede: Ingen<br />

Litteraturliste over metode artikler, som udleveres til de studerende:<br />

Hirose, S., Kaneko, T., Naito, N. & Takei, Y. (2003) Molecular biol<strong>og</strong>y of major components of<br />

chloride cells. Comparative Biochemistry and Physiol<strong>og</strong>y 136B: 593–620.<br />

37

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!