Teraflop 73 - Novembre - cesca

un fet força habitual en disciplines
mèdiques tan diferents com
ara la biofísica, biologia molecular i estructural,
biomedicina, bioquímica, biotecnologia,
farmacologia, o immunologia
en ordre alfabètic d’especialitats. Aquest
increment en l’estudi de processos biològics,
mitjançant tècniques de simulació
assistida per ordinador, és degut a dos
factors fonamentals. D’una banda, les
noves generacions d’ordinadors que proporcionen
una major potència de càlcul i
representació gràfica i, de l’altra, el desenvolupament
de nous mètodes i algoritmes
en camps com la bioestadística, bioinformàtica,
física o química. Aquest grup
d’investigació ha fet ús d’aquestes tècniques
computacionals aplicant-les en l’estudi
de mecanismes de transducció de
senyals.
Cap
Leonardo Pardo
Integrants
M. Campillo, X. Deupi, M. Olivella i
A. Sanz
Període
1995-2003
Nombre de publicacions
29
Hores usades (3%)
CPQ: 20.987 h
N/V: 63.709 h
IBM: 1.168 h
Altres: 323 h
• “Glycoprotein Hormone Receptors: Determinants
in Leucine-rich Repeats Responsible
for Ligand Specificity”. EMBO J., Vol. 22,
2003, p. 2692-2703.
• “Activation of CCR5 by Chemokines Involve
an Aromatic Cluster Betweeen TMH 2 and 3”.
PUBLICACIONS L’ús d’ordinadors ha esdevingut
J. Biol. Chem., Vol. 278, 2003, p. 1892-1903.
• “3D-QSAR/CoMFA Model and Computatio-
Modelització biomolecular
Modelització i simulació de processos
biològics
“De les matemàtiques a la medicina: un repte per a la bioinformàtica”
Mecanismes de transducció
de senyals
Els receptors de membrana units a sistemes
efectors a través de proteïnes G, representen
un dels mecanismes cel·lulars
més importants de transducció de senyals.
Aquests receptors són capaços de reconèixer
senyals químics (neurotransmissors,
hormones, pèptids, sabors, olors,
entre altres), com físics (fotons de llum) i
regular multitud de funcions fisiològiques.
Com a exemple, podem indicar que estan
relacionats amb malalties neurodegeneratives
com ara el Parkinson o l’Alzheimer;
regulen funcions com per exemple l’ansietat,
la demència, l’esquizofrènia, la depressió,
etc.; són el major coreceptor del virus
de la sida sent responsables de la transmissió
de la malaltia, i són responsables de
nal Simulation for the Recognition of 5-HT4
Receptor Antagonists”. J. Med. Chem., Vol.
45, 2002, p. 4806-4815.
• “Design, Synthesis and Pharmacological
Evaluation of 5-HT1A Receptor Ligands to
Explore the 3-D Structure of the Receptor.
Mol. Pharmacol., Vol. 62, 2002, p. 15-21.
• “Influence of the Environment in the Confor-
Tots els membres de la família de receptors acoblats
a proteïnes G tenen un N-terminal extracel·lular,
un C-terminal intracel·lular, i set hèlixs
que travessen la membrana cel·lular (en blau),
units per llaços hidrofílics. Són capaços de reconèixer
senyals extracel·lulars i transmetre’ls
cap a l’interior de la cèl·lula, mitjançant un canvi
conformacional. En la figura es mostra la flexibilitat
de l’hèlix 2 del receptor CCR5 implicada en
aquest canvi conformacional.
malaties hereditàries per mutacions espontànies
en l’estructura que els fan constitutivament
actius. Són, per tant, una diana
fonamental d’empreses farmacèutiques,
en el seu afany per tal de dissenyar nous
fàrmacs. La construcció de models de receptor
(vegeu figura) a partir de tècniques
de modelització molecular assistida per
ordinador, ha esdevingut una eina útil per
a aquest disseny. ■
mation of α-helices”. Biophys. J., Vol. 82,
2002, p. 3207-3213.
• “Lys183 and Glu157 of the TSH Receptor:
two Interacting Residues with a Key Role in
Determining Specificity Towards TSH and
hCG”. Mol. Endo., Vol. 16, 2002, p. 722-735.