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5región particular del genoma: gen candidatoy clonado posicional con marcadoresmoleculares. Sin embargo, el principallogro en el estudio de caracteres multifactorialesradica, no tanto en la detecciónde QTL, sino en desenmarañar losgenes que los constituyen.GEN CANDIDATOUn gen candidato es aquel que intervieneen algún proceso fisiológico conocido,relacionado con el carácter en estudio,por ejemplo el gen del halotano (gen Halo RYR1) y es la estrategia que máscomúnmente se emplea. Por consiguiente,esta estrategia involucra el estudio delo que se conoce acerca de la bioquímicay/o genética del carácter en todas lasespecies en las que se ha documentado,con la idea de identificar los genes queposiblemente podrían corresponder allocus responsable. Con frecuencia se hanidentificado y clonado muchos loci confunción conocida en la región en la queestá situado el QTL.Las empresas debendecidir cuál essu “cerdo ideal” yestablecer sus objetivosde selección.CLONADO POSICIONAL CONMARCADORES MOLECULARESLos marcadores son secuencias de ADN,vecinas de algún gen que afecta a un caráctercuantitativo. Estas secuencias son generalmentemicrosatélites y polimorfismos enla longitud de los fragmentos de restricción(RFLP, Restriction Fragment Length Polymorphisms).Las características deseablesde los marcadores son:• Elevada variabilidad.• Especificidad para una sola zona delgenoma.• Repartidos por todo el genoma.• Asociados con los QTL.Esta estrategia se suele llevar a cabocuando no existen genes candidatos en laregión donde se ha mapeado el QTL, y es ➔TRAS LA LOCALIZACIÓN DE UN QTLES NECESARIO PROCEDERA SU CONFIRMACIÓN MEDIANTEEXPERIMENTOS REPETIDOS.Una vez propuesto el gen candidato, elsiguiente paso es buscar las mutacionesexistentes mediante técnicas molecularesy confirmar mediante estudios de segregaciónque dichas variaciones alélicaspueden explicar la variabilidad fenotípicadel carácter en cuestión.La gran ventaja de este enfoque es que,si el gen candidato es efectivamente elgen responsable del QTL, se detectanincluso loci con efectos pequeños.Sus principales desventajas son dos:• La existencia de una región donde semapea el QTL tan amplia que puedanexistir muchos genes candidatos.• La posibilidad de dejar de proponergenes candidatos con un efecto grandesobre el carácter en estudio sólo por lafalta de conocimiento sobre su funcionamiento.Una vez que el gen candidato ha sidoconfirmado, parece sencillo optar porseleccionar aquellos animales con elgenotipo favorable para el carácter objetode selección.’112

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