Test fonctionnel de mesure des activités enzymatiques de ...

tel-00126858, version 1 - 26 Jan 2007
Etude bibliographique
d’avoir une reconnaissance très fine et précise de modifications chimiques parfois
minimes.
Cette reconnaissance passe par la conformation spatiale bien particulière des
ADN N-Glycosylases. En effet, la plupart d’entre elles partagent une conformation
tridimensionnelle très proche bien qu’ayant des séquences peptidiques totalement
différentes. Elles ont aussi en commun un domaine de fixation à l’ADN de type
helice-boucle-helice (HbH). Ces similarités ont permis de les regrouper dans une
superfamille d’ADN N-Glycosylase.
Le Tableau 1 ci-dessous présente quelques ADN N-Glycosylases humaines
ainsi que les bases modifiées qu’elles peuvent reconnaître et exciser.
Glycosylase Bases reconnues et excisées Activité AP lyase
UNG Uracile non
ANPG 3-méthyladénine, 3-méthylguanine, 1,N²ethénoguanine
non
SMUG1 Uracile, 5-hydroxymethyluracile non
MBD4 Uracile, O 6 -méthylguanine oui
TDG Uracile, éthénocytosine non
OGG1 8-oxoG, FaPy-Guanine oui
MYH 2-OH-Adénine non
MPG 3-methylpurines, hypoxanthine, éthénoadenine non
NTHL1 Diols de thymine et de cytosine oui
NEIL1 FaPy-Adénosine, 8-oxoG oui
NEIL2 Diols de thymine et de cytosine oui
NEIL3 Non déterminé oui
Tableau 1 : Tableau regroupant différentes ADN N-Glycosylases humaines et leurs activités.
Il est à noter que certaines glycosylases présentent aussi une activité AP lyase, en plus
de leur activité N-Glycosylase, qui permet d’inciser l’ADN après formation du site
abasique. Nous allons le voir, cette activité AP lyase a une importance sur le
déroulement de la suite du mécanisme de réparation.
b) L’incision du brin d’ADN
Une fois que le site abasique est formé par l’ADN N-Glycosylase, une incision
dans le brin d’ADN doit avoir lieu afin de permettre la resynthèse de la base éliminée.
Cette incision peut être réalisée selon deux mécanismes distincts.
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