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Test fonctionnel de mesure des activités enzymatiques de ...

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tel-00126858, version 1 - 26 Jan 2007<br />

Etu<strong>de</strong> bibliographique<br />

c) Resynthèse <strong>de</strong> la zone excisée<br />

Deux voies <strong>de</strong> resynthèse sont possibles, et pour chacune d’entre elles le<br />

nombre <strong>de</strong> nucléoti<strong>de</strong>s incorporés diffère :<br />

- La voie <strong>de</strong> resynthèse courte :<br />

Durant cette voie <strong>de</strong> resynthèse, un à <strong>de</strong>ux nucléoti<strong>de</strong>s sont incorporés par la<br />

polymérase β associée à XRCC1. En même temps que les nucléoti<strong>de</strong>s sont<br />

polymérisés, la polymérase β, qui a aussi une activité ADN-<strong>de</strong>soxyribophosphatase<br />

(dRpase), excise le 5’ <strong>de</strong>soxyribose-phosphate (dRp) généré lors <strong>de</strong> la coupure par<br />

l’endonucléase.<br />

- La voie <strong>de</strong> resynthèse longue :<br />

Contrairement à la voie courte, lors <strong>de</strong> la voie <strong>de</strong> resynthèse longue, un nombre<br />

plus important <strong>de</strong> nucléoti<strong>de</strong>s est incorporé, environ cinq à sept. Cette étape est<br />

réalisée par les mêmes polymérases que celles impliquées dans la resynthèse lors <strong>de</strong> la<br />

REN, à savoir : les polymérases ε ou δ associées au facteur <strong>de</strong> processivité PCNA. Les<br />

polymérases ε et δ n’ayant pas d’activité dRpase, les nucléoti<strong>de</strong>s qu’elles polymérisent<br />

provoquent une zone <strong>de</strong> recouvrement où l’ancien brin d’ADN n’est plus hybridé à<br />

son complémentaire. Une Flap endonucléase (FEN1) va alors venir le couper afin <strong>de</strong><br />

permettre à l’étape <strong>de</strong> ligation d’avoir lieu.<br />

Ce mécanisme <strong>de</strong> sélection entre l’une ou l’autre <strong>de</strong> ces <strong>de</strong>ux voies n’a pas<br />

encore été élucidée. Certains résultats ten<strong>de</strong>nt à montrer que cette sélection dépendrait<br />

<strong>de</strong> la glycosylase qui a réalisé l’excision 37 , d’autres qu’elle serait guidée par la<br />

capacité à éliminer le résidu dRp. L’hypothèse est que, si le résidu dRP est hydrolysé<br />

rapi<strong>de</strong>ment, alors la voie <strong>de</strong> resynthèse courte est favorisée et inversement 38 .<br />

d) L’étape <strong>de</strong> ligation<br />

Cette étape finale <strong>de</strong> la REB fait intervenir différents acteurs en fonction <strong>de</strong> la<br />

voie <strong>de</strong> resynthèse qui a été prise. Dans le cas <strong>de</strong> la voie courte, c’est le complexe<br />

ligase III / XRCC1 qui referme la double hélice d’ADN, lors <strong>de</strong> la voie longue c’est le<br />

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