Rapport Scientifique UMR 7625 - Ecologie & Evolution - Université ...

Rattachée à l’Ecole Doctorale Diversité du Vivant (ED 374), EEM salue ses six jeunes docteurs,
dont elle fut l’équipe d’accueil jusqu’aux soutenances pendant la période de référence :
Guillaume CHAPRON (2004), Thomas TULLY (2004), Nicolas CHAMPAGNAT (2004, thèse de
mathématiques co-encadrée avec le Laboratoire Modèles Aléatoires, Université Paris X),
Samuel ALIZON (2006), Mathias GAUDUCHON (2006), Chi VIET TRAN (2006, thèse de
mathématiques co-encadrée avec le Laboratoire Modèles Aléatoires, Université Paris X),
Sébastien LION (2007). Six thèses sont en cours : Sébastien BALLESTEROS (EDDV, directeur :
Bernard CAZELLES), Dominique CARVAL (EDDV) et Arnaud POCHEVILLE (EDIFV)
(directeur : Régis FERRIERE), Sandrine ADIBA (EDIFV, directeur : Frantz DEPAULIS), Vincent
BANSAYE (ED Mathématiques) et Robin AGUILEE (EDIFV) (directeur : Amaury LAMBERT).
L’implication de l’équipe EEM dans la formation doctorale passe également par plusieurs coencadrements
et co-tutelles de thèses, ainsi que la participation des membres de l’équipe à de
nombreux comités de thèses hors UMR.
Illustrant l’enjeu de l’interface modélisation-expérimentation, EEM réunit le personnel en
charge de conduire le projet du CEREEP et de l’ECOTRON ILE-DE-FRANCE : Bruno VERDIER
(IR CNRS), Isabelle JOUANNEAU et Beatriz DECENCIERE (recrutées en CDD comme
Ingénieurs d’Etudes CNRS et ENS, respectivement), Régis FERRIERE (PR ENS, directeur du
projet).
C’est la qualité collective de l’équipe EEM qui est attestée par l’ensemble des contrats de
recherche nationaux (ACI, ANR) et internationaux (NSF) qu’elle remporta au cours de la
période écoulée, et par la nomination de son responsable à l’Institut Universitaire de France.
Conformément à son projet fondateur, les travaux de l’équipe s’organisent en trois grands
volets : modélisation mathématique des processus populationnels élémentaires ; application
à l’étude théorique de l’évolution des interactions écologiques intra et inter-spécifiques ;
évolution expérimentale et analyse des données moléculaires de polymorphisme.
A. Biologie mathématique des populations
Deux axes principaux ont été développés au cours de la période écoulée :
+ L’étude des dynamiques auto-organisées dans les grandes populations, produite par
synchronisation sous l’effet d’interactions internes (par exemple une sensibilité à la densité) ou
externes (par exemple les facteurs climatiques).
+ La construction et l’analyse de modèles probabilistes de la dynamique des populations
« discrètes », c’est-a-dire composées d’entités reproductives dont les caractères individuels sont
décrits explicitement.
• Synchronisation des grandes populations
(Bernard CAZELLES, Silvia DE MONTE)
Dans une population dont les individus ont une dynamique “interne” propre, par exemple
oscillatoire, des propriétés collectives sont susceptibles d’émerger. Les mécanismes
microscopiques et macroscopiques doivent alors être combinés pour comprendre comment les
caractéristiques individuelles se répercutent sur la dynamique des différent niveaux
d’organisation du système. La théorie mathématique de la synchronisation des systèmes
dynamiques permet d’aborder ce problème de manière générale.
Cette approche est à la base des travaux de l’équipe EEM utilisant des populations cellulaires
de la levure Saccharomyces cerevisiae comme système-modèle pour l'étude de la densitédépendance
des oscillations synchrones. En collaboration avec F. D’OVIDIO (LMD, ENS,
Paris), S. DANO et P.G. SORENSEN (Université de Copenhague), la combinaison d’un
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