Cours-3-201112Fichier PDF - e-nautia

Mécanisme catalytique des protéases à sérineCaractéristiques• Triade catalytique His Asp Ser.– Proches dans site actif mais éloignés en séquence.• His57, Asp102, Ser195 Trypsine• Asp32, His64, Ser221 Subtilisine• Fixation et stabilisation de l'état de transition intermédiaire en fournissantdes groupes pouvant former des liaisons hydrogène avec la charge négativecrée sur l'oxygène– Trou de l'oxyanion• Pas de spécificité absolue de substrat. Fixation non spécifique par la chaîneprincipale, possibilité d’hydrolyser après une grande variété de chaîneslatérales• Hydrolyse préférentielle après certains acides aminés– chymotrypsine: grand aromatique– trypsine: Lys ou Arg• Le résidu avant la liaison coupée est orienté dans une poche de l'enzyme.– Poche de spécificité. NomenclatureStructure des Protéines II. 2011/2012. Chap 3