Prolil endopeptidasa eta piroglutamil peptidasa I ... - Euskara
Prolil endopeptidasa eta piroglutamil peptidasa I ... - Euskara
Prolil endopeptidasa eta piroglutamil peptidasa I ... - Euskara
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Piroglutamil <strong>peptidasa</strong> I<br />
Mutagenesi zuzendutako analisiaren bidez, katalisian zisteina batek zeregina zuela<br />
aurkitu zen, Cys-144-a hain zuzen ere (Yoshimoto <strong>eta</strong> lank., 1993). Entzima<br />
Escherichia coli-n espresatzea lortu zen <strong>eta</strong> x izpiak erabiliz kristalizatu zen, bere hiru<br />
dimentsiotako egitura argituz (Odagaki <strong>eta</strong> lank., 1999).<br />
Hurrengo lerro<strong>eta</strong>n entzima honen deskribapen zabalagoa egingo da, hau baita<br />
tesi hon<strong>eta</strong>n ikasi den entzimen<strong>eta</strong>riko bat.<br />
26<br />
4.2. EZAUGARRI BIOKIMIKOAK<br />
Ugaztunen <strong>piroglutamil</strong> <strong>peptidasa</strong> I-a 23700 Da-<strong>eta</strong>ko monomero moduan<br />
deskribatu da. Bakterioen <strong>eta</strong> ugaztunen entzimaren subunitatea SDS-PAGE bidez, 22-<br />
25 KDa-<strong>eta</strong>koa zela neurtu zen. Ugaztunen entzimaren forma natiboa monomerikoa<br />
zela egiaztatu zen, baina bakterio<strong>eta</strong>rako Mw balioak 50-91 KDa bitartekoak zirela<br />
ikusi zen. Badirudi Bacillus amyloliquefaciens-en entzima errekonbinanteak dimero<br />
moduan jokatzen duela (Yoshimoto <strong>eta</strong> lank., 1993), baina B. Amyloliquefaciens<br />
(Odagaki <strong>eta</strong> lank., 1999), Thermococcus litoralis (Singleton <strong>eta</strong> lank., 1999) <strong>eta</strong><br />
Pyrococcus furiosus-en (Tanaka <strong>eta</strong> lank., 2001) proteinak tetramero moduan<br />
kristalizatu dira. Entzimaren espresiorako, lotura disulfuroak erreduzituko dituen<br />
eragilea, adibidez DTTa, behar da <strong>eta</strong> bere pH optimoa 8,5-ekoa da. Trantsizio m<strong>eta</strong>l<br />
ionikoak, sulfidriloen blokeatzaileak <strong>eta</strong> 2-pirrilidona (pGlu taldearen analogoa)<br />
entzimaren inhibitzaileak dira (Cummins <strong>eta</strong> O'Connor, 1996). Entzima oso sentikorra<br />
da pGlu aminoazidoaren egituraren aldaketei (Tsuru <strong>eta</strong> lank., 1982) <strong>eta</strong> ezin du L-Pro-<br />
X lotura apurtu (Capecchi <strong>eta</strong> Loudon, 1985). L-pGlu-Pro lotura ere apurtezina da<br />
entzima honentzat (Cummins <strong>eta</strong> O'Connor, 1996).<br />
Aurretik aipatutako, sekuentziazio <strong>eta</strong> zuzendutako mutagenesi bidezko<br />
esperimentuek (Yoshimoto <strong>eta</strong> lank., 1993), bere triada katalitikoa argitu zuten, Cys-<br />
144, His-168 <strong>eta</strong> Glu-81 aminoazidoek osatutakoa hain zuzen ere. Bakterioaren<br />
entzima, sagua <strong>eta</strong> gizakiarenarekin konparatzean, ez da homologia handirik ikusten,<br />
baina triada katalitikoaren sekuentzia mantentzen da, Cys-149, His-168, Glu-85<br />
(Gizakiaren <strong>piroglutamil</strong> <strong>peptidasa</strong> I-erako) (Dando <strong>eta</strong> lank., 2003). Sekuentzia hau<br />
arratoi<strong>eta</strong>n ere mantentzen da.<br />
Katalisi mekanismoa ezagutzeko, entzimaren zenbait inhibitzaile garatu dira<br />
(Fujiwara <strong>eta</strong> lank., 1981a; Fujiwara <strong>eta</strong> lank., 1981b; Fujiwara <strong>eta</strong> lank., 1982). Hauek<br />
Sarrera