Capitolo 2 - Omero

‣ Analisi degli amminoacidi di ciascun peptide: unaaliquota di ciascun peptide separato in cromatografiao in elettroforesi viene sottoposta ad analisi degliamminoacidi. Questo passaggio non è indispensabile,può fornire comunque alcuni dati molto utili: valutazione del grado di purezza del peptide: se unpeptide non è puro non può essere sottopostoall'analisi sequenziale, ma deve essere ulteriormentepurificato;valutazione del numero e del tipo di amminoacidipresenti nel peptide.‣ Analisi sequenziale di ciascun peptide: la sequenzadi ciascun peptide purificato viene quindideterminata con il metodo di Edman.‣ Allineamento dei peptidi: a questo punto si conoscela sequenza dei singoli peptidi della proteina, manon il loro ordine. Le ulteriori informazioni siottengono dall'allineamento dei peptidi. Si deve cioèsottoporre la proteina ad una digestione diversa ingrado di produrre peptidi di dimensioni più elevate,che contengano nella loro sequenza più peptidioriginati dalla prima digestione. Questi peptidiottenuti dalla seconda digestione vengono anch'essisequenziati e dovrebbero permettere di stabilirel'ordine di sequenza dei primi peptidi e quindil'intera struttura della proteina.