Dragoş Lucian Gorgan - Editura Bioflux
Dragoş Lucian Gorgan - Editura Bioflux
Dragoş Lucian Gorgan - Editura Bioflux
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Din care, rezultă:<br />
S<br />
12<br />
L<br />
1X<br />
L<br />
2X<br />
L<br />
Dacă notăm cu R <br />
<br />
m<br />
XY<br />
d<br />
<br />
m<br />
<br />
i3<br />
L<br />
R<br />
iY<br />
<br />
2<br />
1<br />
m2 m<br />
<br />
i3<br />
1<br />
i 3<br />
şi 1i<br />
2 <br />
i3<br />
2i<br />
S12 2T R1<br />
R2<br />
<br />
d12<br />
<br />
<br />
2<br />
m<br />
d<br />
1<br />
m 2<br />
d1id2i d<br />
ij<br />
3i<br />
j<br />
, atunci S12 poate fi exprimată:<br />
m2 2<br />
Desigur, Sij poate fi calculată în acelaşi mod dacă înlocuim 1 şi 2 cu i şi j în<br />
ecuaţia de mai sus. Ultima ecuaţie necesită mult mai puţin timp de calcul decât cea<br />
anterioară. Mai mult, dacă T este acelaşi pentru toate perechile de tipul i şi j, Sij poate<br />
fi înlocuit cu:<br />
Qij m2 dij Ri<br />
R j<br />
în scopul de a calcula valoarea relativă a lui Sij.<br />
O dată cu determinarea celei mai mici valori a lui Sij, poate fi creat un nou nod (A),<br />
care permite conectarea taxonilor i şi j. Lungimile braţelor (bAi şi bAj) din acest nod<br />
până la taxonii i şi j sunt date de:<br />
b<br />
b<br />
Ai<br />
Aj<br />
2<br />
2<br />
1<br />
d R R <br />
m2 m2 1<br />
d R R <br />
m2 m2 ij<br />
ij<br />
i<br />
i<br />
j<br />
j<br />
, (Saitou şi Nei, 1987)<br />
Aceste valori sunt determinate prin metoda pătratului minim, pentru actuala<br />
topologie a arborelui. Următorul pas, este calcularea distanţei între noul nod A şi<br />
taxonii rămaşi (k; 3≤k≤m) (Figura 11).<br />
Figura 11 Separarea nodului A de restul taxonilor, (Nei şi Kumar, 2000)<br />
44
Change language