1:20), MUM-1/IRF4 (Santa Cruz, Biotechnology, Santa Cruz, CA, poliklonalno,razrijeđenje 1:100), CD138 (Novocastra, Newcastle, UK, klon 5F7, razrijeđenje 1:50),BCL2 (DakoCytomation, Denmark, klon 124, razrijeđenje 1:10), p53 (DakoCytomation,Denmark, klon DO-7, razrijeđenje 1:25) te CD30 (DakoCytomation, Denmark, klon Ber-H2, razrijeđenje 1:20).Postupci demaskiranja antigena su bili: BCL6, CD10, MUM1/IRF4, CD138 – lonac podpritiskom Pascal (DakoCytomation, Denmark), +125ºC, 30 sekundi, otopina etilendiamin tetraoctene kiseline (EDTA) pH8.0; BCL2, CD30 – mikrovalna pećnica, +95ºC,15 minuta, Target Retrieval otopina pH6.0 (DakoCytomation, Denmark); p53 –mikrovalna pećnica, +95ºC, 15 minuta, Target Retrieval otopina pH9.0(DakoCytomation, Denmark).Za vizualizaciju ekspresije biljega korišten je streptavidin-biotin set (LSAB)(DakoCytomation, Denmark). Rezovi tkiva i tkivnog microarray debljine 4µm sudeparafinirani, obrađeni standardnim, automatiziranim postupkom u Autostainer(DakoCytomation, Denmark) i kontrastirani hematoxylinom.Pozitivnim rezultatom svih analiziranih biljega smatran je nalaz specifične ekspresije u>30% tumorskih stanica prema radu Hans, CP i sur. (142). U pozitivnim tumorskimstanicama BCL6, MUM1/IRF4 i p53 proteinska ekspresija je primarno nuklearna (81).Proteinska ekspresija CD10, CD138, CD30 i BCL2 biljega je primarno membranska icitoplazmatska.Uzorci su klasificirani temeljem koekspresije pojedinih diferencijacijskih biljega u GCB iABC skupinu prema kriterijima Hans, CP i sur. (142). Fenotipski uzorci CD10+, BCL6+,MUM1-; CD10+, BCL6-, MUM1+ i CD10+, BCL6+, MUM1+ smatrani su GCB
fenotipom, a fenotipski uzorci CD10-, BCL6+, MUM1+ i CD10-, BCL6-, MUM1+ ABCfenotipom.3.4 Interfazna fluorescentna in situ hibridizacija (FISH) na parafinskimrezovima tkiva3.4.1 Priprema preparataRezovi tkiva debljine 4µm na silaniziranim predmetnim staklima (DakoCytomation,Denmark) deparafinirani su Histoclear otopinom (National Diagnostics, England) nasobnoj temperaturi tri puta kroz 5 minuta, te zatim isprani u 100% alkoholu na sobnojtemperaturi 2 minute. Rezovi su zatim rehidrirani u seriji alkohola 100%, 85% i 70%,2 minute u svakom i isprani u destiliranoj vodi na sobnoj temperaturi. Nakondeparafinacije rezovi su kuhani u antigen retrieval puferskoj otopini Target Retrieval pH9.0 (DakoCytomation, Denmark) na +95ºC u mikrovalnoj pećnici 15 minuta, zatimtretirani s pepsinom 0.1g/mL (Sigma, Germany) na +37ºC, 20 minuta, te dehidrirani useriji alkohola 70%, 85% i 100%, 2 minute u svakom i osušeni na zraku. Prema uputamaproizvođača pripremljene su direktno obilježene - dvobojna fuzijska proba LSI IgH/BCL2dual color, dual fusion translocatione probe (Vysis Inc., USA) i dvobojna razdvajajućaproba LSI BCL6 dual color, break apart rearrangement probe (Vysis Inc., USA). Nasvaki rez stavljeno je 2µL probe i pokriveno pokrovnicom površine 100 mm 2 koja jeučvršćena ljepilom. Predmetna stakla su stavljena u Hybridizer (DakoCytomation,
- Page 1 and 2: Središnja medicinska knjižnicaBor
- Page 3 and 4: Disertacija je izrađena u Odjelu z
- Page 5 and 6: 3.4 Interfazna fluorescentna in sit
- Page 7 and 8: H&E - hemalaun & eozinHIV - virus h
- Page 9 and 10: klasifikacije limfoidnih neoplazmi
- Page 11 and 12: Folikularni limfom (FL) - 25% svih
- Page 13 and 14: simptoma. MPI obuhvaća dob bolesni
- Page 15 and 16: 1.4 DNA microarray analiza genske e
- Page 17 and 18: molekularno različitih bolesti unu
- Page 19 and 20: Monoklonalna protutijela za pojedin
- Page 21 and 22: Common acute lymphoblastic leukaemi
- Page 23 and 24: Interakcijom s različitim efektors
- Page 25 and 26: između fenotipskih skupina i vrije
- Page 27 and 28: BCL2 protein je eksprimiran u stani
- Page 29 and 30: p53 protein se imunohistokemijski n
- Page 31 and 32: 2. Ciljevi istraživanja1. U primar
- Page 33 and 34: uključuje - MPI score 3 - veliki i
- Page 35: 3.2 Tkivni microarrayUzorci s dovol
- Page 39 and 40: Slika 1. Shematski prikaz LSI IgH p
- Page 41 and 42: 3.4.3 Analiza preparataKorišten je
- Page 43 and 44: 4. Rezultati4.1.1 Fenotipske karakt
- Page 45 and 46: Odnos imunofenotipskih skupina GCB
- Page 47 and 48: U slučajevima bez t(14;18)(q32;q21
- Page 49 and 50: 4.2 Usporedba proteinske ekspresije
- Page 51 and 52: Usporedbom imunofenotipskih skupina
- Page 53 and 54: 4.3 Usporedba utjecaja fenotipskih
- Page 55 and 56: Međutim, imunofenotipske skupine G
- Page 57 and 58: Uočena je statistički značajna r
- Page 59 and 60: učestalost t(14;18)(q32;q21) u GCB
- Page 61 and 62: iljega, MUM1/IRF4 i BCL6. Isto tako
- Page 63 and 64: kriterija, prema današnjim spoznaj
- Page 65 and 66: ekspresije gena koja bi imala za po
- Page 67 and 68: 7. Sažetak73 bolesnika s povećani
- Page 69 and 70: 8. Summary73 patients with lymph no
- Page 71 and 72: 11. Morgensztern D, Lossos IS. Mole
- Page 73 and 74: 33. Nanjangud G, Rao PH, Hegde A, e
- Page 75 and 76: 55. Bosga-Bouwer AG, van Imhoff GW,
- Page 77 and 78: 78. Lossos IS, Alizadeh AA, Diehn M
- Page 79 and 80: 100. Pescarmona E, De Sanctis V, Pi
- Page 81 and 82: 122. Fabiani B, Delmer A, Lepage E,
- Page 83 and 84: 143. Poulsen CB, Borup R, Nielsen F
- Page 85 and 86: 166. Pinyol M, Hernandez L, Martine
- Page 87 and 88:
189. Rubin MA, Dunn R, Strawderman
- Page 89:
Aktivno sam sudjelovala na 3 međun