Identifizierung und Charakterisierung von Interaktionspartnern des ...
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Material <strong>und</strong> Methoden<br />
geb<strong>und</strong>enes Protein <strong>und</strong> freie Antikörper zu entfernen. Anschließend wurde der Ansatz mit<br />
15 SDS-Loading-Puffer versetzt <strong>und</strong> für 3 Min. auf 90°C erhitzt. Dadurch wurde das<br />
geb<strong>und</strong>ene Protein <strong>von</strong> den Antikörpern gelöst. Nachfolgend wurden die Proteine mittels<br />
einer SDS-Gelelektrophorese (siehe 2.2.4.1) ihrer Größe nach aufgetrennt.<br />
Ein exemplarischer Reaktionsansatz:<br />
10 IVT-Produkt<br />
10 Dynabeads ® (Dynal)<br />
Die Coimmunopräzipitation dient dem Nachweis einer Interaktion zweier Proteine.<br />
Verfahren: Zwei Proteine (gewonnen durch eine IVT (siehe 2.2.4.5)) wurden mittels einer<br />
einstündigen Inkubation bei 30°C zur Interaktion angeregt. Anschließend wurden die Proben<br />
wie bei einer Immunopräzipitation behandelt (siehe oben). Die Proteine wurden dann in einer<br />
SDS-Gelelektrophorese (siehe 2.2.4.1) <strong>von</strong>einander getrennt <strong>und</strong> durch die radioaktive<br />
Markierung auf einem X-OMAT-Film visualisiert. Waren zwei statt einer Proteinbande zu<br />
erkennen, hatte eine Interaktion stattgef<strong>und</strong>en.<br />
Ein exemplarischer Reaktionsansatz:<br />
10 IVT-Produkt1<br />
10 IVT-Produkt2<br />
10 l Dynabeads ®<br />
2.2.5 Colony-Lift Filter Assay<br />
Diese Methode ermöglicht, die Messung der Aktivität <strong>von</strong> Galaktosidase.<br />
Verfahren: Pro Platte wurde je ein Filterpapier mit 2,5 ml Z-Puffer/X-gal-Lösung befeuchtet.<br />
Anschließend wurde ein unbehandeltes Filterpapier auf die Oberfläche einer mit Kolonien<br />
bewachsenen Platte gedrückt, um so die Zellen am Filterpapier zu fixieren. Filterpapier <strong>und</strong><br />
Petrischale wurden markiert, um die Orientierung <strong>des</strong> Filterpapiers auch später noch<br />
nachvollziehen zu können. Danach wurde das Filterpapier mit einer Pinzette abgenommen<br />
<strong>und</strong> für 10-15 Sek. in flüssigen Stickstoff gehalten. Das gefrorene Filterpapier wurde danach<br />
bei Raumtemperatur aufgetaut, luftblasenfrei auf das mit Lösung durchtränkte Filterpapier<br />
aufgebracht <strong>und</strong> bei 30°C bis zur Blaufärbung der Kolonien inkubiert. Die Blaufärbung<br />
signalisierte die Expression der Galaktosidase.<br />
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