SKRIPT Humangenetik - DocCheck Campus
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Vorlesungsskript <strong>Humangenetik</strong><br />
WS 2008<br />
• Assoziation zwischen Allelen (an gekoppelten Loci)<br />
o Studiendesign: Trio (Transmission disequilibrium test (TDT), Fall-Kontroll-Studien<br />
o Kausaler Zusammenhang (Risikofaktoren)<br />
o Kopplungsgleichgewicht (Mitfahrer)<br />
o Populationsschichtung oder –stratifikation<br />
o Typ I Fehler: Problem der multiplen Testung, unabhängig Replikation erforderlich<br />
o Funktionelle Validierung erforderlich<br />
• SNP = Single nucleotide Polymorphism<br />
o Häufig – 1SNP pro 800bp, evolutionär stabil, manchmal krankheitsverursachend<br />
o Ca. 10 Mill. SNPs im menschlichen Genom davon etwa 3 Mill. häufig/bekannt<br />
o Geeignet als genetischer Marker, leicht detektierbar mit Hilfe von Arrays<br />
o Geeignet für Assoziationsstudien<br />
o Genotypisierung mittels TAQMAN-Technik<br />
• Linkage Disequilibrium (LD) = Kopplungsgleichgewicht: blockartiges Muster im menschlichen<br />
Genom<br />
• Genetische Karten: Beobachtung von Rekombinationsereignissen<br />
• Lod-Score<br />
o Logarithmus des odds-ratio, statistisches Maß für Kopplung<br />
o Wahrscheinlichkeit dass Kopplung vorliegt geteilt durch die Wahrscheinlichkeit, dass keine<br />
Kopplung vorliegt<br />
o Lodscore >3 Annahme von Kopplung, Lodscore < -2 Ausschluss von Kopplung<br />
• Blutsverwandtschaft (Konsanguinität) und Identity by descent (IBD = Kopplung)<br />
Verwandtschaftkoeffizient R = (1/2)^5 *4 = 1/8 = 12,5%<br />
• Homozygositätskartierung und gekoppelter Marker<br />
Abb.<br />
b. MOPD II = Microcephalic Osteodysplastic Primordial Dwarfism Type<br />
• PCNT-Mutation<br />
• Folgen: 6/26 milde bis schwere geistige Behinderung, 10/26 Moyamoya, Hirninfarkt/-blutung<br />
• Todesursachen: Kariomyopathie, Diabetes, Dyslipidämie, Subarachnoidalblutung<br />
c. Abstammungsuntersuchung (Vaterschaftstest)<br />
• 9-15 verschiedene hochpolymorphe Marker (ungekoppelt)<br />
• 3 Inkompatibilitäten = Ausschluss biologischer Vaterschaft<br />
• Bei Kompatibilität: Wahrscheinlichkeit, dass ein anderer Mann aus der Bevölkerung zufällig in<br />
Frage kommt<br />
d. Zwillinge<br />
• Entstehungsmöglichkeiten<br />
Tag der Spaltung 2.-4. Tag 4./5.-7. Tag 7.-13. Tag<br />
Stadium der<br />
2-4 Zellstadium Morula Stadium Ammnion voll<br />
Entwicklung<br />
ausgebildet<br />
Plazenta doppelt einfach einfach<br />
Chorion doppelt einfach einfach<br />
Amnion doppelt doppelt einfach<br />
Anteil Ca. 30% Ca. 70% Ca. 2 %<br />
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