Carolo-Wilhelmina - Technische Universität Braunschweig

12 Carolo-Wilhelmina
DIRK W. HEINZ
(Priv.-Doz. Dr.); Jg. 1960; 1980-1986
Studium der Chemie an der Universität
Freiburg; 1986-1990 Dissertation
in Biochemie (Universität Basel
und CIBA-GEIGY AG) über Struktur
und Funktion von Proteaseinhibitoren;
1990-1993 Postdoc an der University
of Oregon, Eugene, USA – Erforschung
der Toleranz von Proteinstrukturenbzw.Aminosäureinsertionen
und -substitutionen; 1993-1998
Habilitand an der Universität Freiburg
– Habilitation im Fach Biochemie
über die Struktur der Phospholipasen
C; 1998-2002 Nachwuchsforschergruppenleiter
an der GBF in
Braunschweig – Strukturuntersuchungen
an bakteriellen Virulenzfaktoren;
seit Mai 2002 Leiter der Abteilung
Strukturbiologie an der GBF.
ABBILDUNG 6
Eingabemaske der Bioinformatik-Datenbank
PRODORIC (http://prodoric.tu-bs.de).
seits nach ihrer molekularen Masse und andererseits
nach ihrer Ladung getrennt. Identifiziert
werden die Proteine durch eine
massenspektrometrische Analyse der molekularen
Massen von durch Proteaseverdau
erzeugten Fragmenten. Dieses Fragmentierungsmuster
ist einmalig für jedes Eiweiß in
der Natur. Bei dieser Art von Analytik entsteht
durch die Untersuchung an tausenden
von Genen gleichzeitig eine riesige Datenfülle,
die es durch geeignete Bioinformatik-
Werkzeuge zu analysieren gilt.
Wir untersuchen in enger Zusammenarbeit
mit Dr. Lothar Jänsch (GBF) und Dr. Jan
Buer (GBF) mittels Proteomics und Genomics
die Unterschiede zwischen frei lebendem
und Mensch-assoziiertem Pseudomonas
aeruginosa. Dieses Bakterium ist ein typischer
Krankenhauskeim, der immungeschwächte
Menschen befällt und durch
seine Antibiotikaresistenz ein großes Problem
in Kliniken darstellt. Außerdem ist der
Keim eine der Haupttodesursachen von
Menschen mit Mukoviszidose. Unsere ersten
Ergebnisse deuten auf eine starke Beteiligung
des anaeroben Stoffwechsels des
Bakteriums – der ihm ein Überleben ohne
Sauerstoff ermöglicht – bei der Infektion
hin. Da Menschen diese Art Stoffwechsel
nicht besitzen, könnte auch dies ein Ansatzpunkt
zur Entwicklung neuer Antibiotika
sein.
Zur Auswertung und Dokumentation der
gewonnenen Daten sowie deren Integration
in schon vorhandene Literaturdaten
haben wir im Rahmen des Bioinformatik-
Kompetenzzentrums »Intergenomics« die
Datenbank PRODORIC (http://prodoric.
tu-bs.de) entwickelt. Mit ihr ist es möglich,
die gewonnenen Daten in Modelle zellulärer
Regulations- und Stoffwechselvorgänge
umzusetzen. Diese Vorhersagen sollen uns
helfen, mögliche Angriffspunkte für unsere
experimentellen Ansätze zur Wirkstoffentwicklung
zu erkennen.
Carolo-Wilhelmina 2/2002