Guia para estudiar Patrones de Distribución de Especies

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Guia para estudiar Patrones de Distribución de Especies Amazónicas
El logaritmo del cero no está definido, y por eso hay que añadir una constante a a cada valor. El tamaño de esta constante
se determina según la exactitud de las mediciones en los datos. Por ejemplo, si se trata de números de individuos la
constante a es normalmente 1. Pero si se ha medido biomasas con una exactitud de 0,01 unidades, a puede ser 0,01. El
factor b es normalmente 1 cuando se trata de números de individuos, pero cuando los datos tienen valores menores de 1,
b puede ser definido como 100 para eliminar logaritmos negativos. En un caso como éste, el valor de a se determinará
según la exactitud de los valores después de la multiplicación con b.
La transformación logarítmica de las variables no debe hacerse automáticamente, pues primero hay que observar la
distribución de las variables para ver si la transformación es necesaria.
Con algunas variables medioambientales la transformación logarítmica puede ser justificable por razones ecológicas.
Esta clase de variables son, por ejemplo, aquéllas que indican la riqueza del suelo, como nitrógeno o potasio. Es lógico
pensar que un cambio con cierta cantidad de unidades de medición en la riqueza del suelo es más significativo cuando el
nivel de riqueza es bajo, y menos cuando la riqueza es alta. Se espera que las plantas reaccionen más a cambios
relativos que absolutos en el suelo. Con una transformación logarítmica uno logra eso; por ejemplo, que un aumento
doble, de 1 a 2 tenga, el mismo efecto en la distancia euclidiana que el aumento doble desde 100 a 200. La misma lógica
+
está detrás de los valores de pH. El pH es el logaritmo del contenido de iones H . Consecuentemente, uno no debe de
tomar el logaritmo de pH por segunda vez
Las matrices de similitud y distancia
La mayoría de los métodos presentados aquí están basados en matrices de similitud o distancia. Esta matriz consta de
valores de distancia (o similitud) entre cada par de parcelas. En la Tabla 6 se presenta un ejemplo de una matriz de
distancia, y en la Tabla 7 una matriz de similitud. En la diagonal de la matriz se encuentran los valores conseguidos
cuando se compara la parcela consigo misma. Una matriz de distancia tiene sólo ceros en la diagonal, mientras que una
matriz de similitud tiene unos a lo largo de la diagonal.
Tabla 6. Una matriz de distancia que presenta distancias euclidianas entre las parcelas según los datos de la Tabla 1. La
matriz de distancia está presentada aquí en su totalidad, pero vale observar que la matriz es idéntica en ambos lados de
la diagonal.
Parcela 1
Parcela 2
Parcela 3
Parcela 4
Parcela 5
Parcela 6
Tabla 7. Una matriz de similitud con base en los datos de la Tabla 1, utilizando el índice de Jaccard. Para matrices
simétricas de distancia o similitud se presenta muchas veces sólo el triángulo inferior o superior, como ocurre aquí.
Parcela 1
Parcela 2
Parcela 3
Parcela 4
Parcela 5
Parcela 6
Parcela 1
0
80
83
97
111
112
Parcela 1
1 0.67
Parcela 2 Parcela 3 Parcela 4 Parcela 5 Parcela 6
80
0
57
61
70
71
Parcela 2 Parcela 3 Parcela 4 Parcela 5 Parcela 6
1
83
57
0
64
99
104
0.33
0.25
1
97
61
64
0
45
55
0.25
0.50
0.67
1
111
70
99
45
0.00
0.20
0.25
0.50
1
0
14
112
71
104
55
14
0
0.00
0.25
0.00
0.25
0.67
1