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Universidad Austral de Chile - Tesis Electrónicas UACh ...

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2.3.1 Caracterización bacteriana utilizando el gen ribosomal 16S<br />

En la década <strong>de</strong> 1980, como lo señala CLARRIDGE (2004), un nuevo estándar para<br />

i<strong>de</strong>ntificación <strong>de</strong> bacterias comenzó a <strong>de</strong>sarrollarse en los laboratorios <strong>de</strong> Woese y <strong>de</strong><br />

otros investigadores, <strong>de</strong>mostrando que las relaciones filogenéticas <strong>de</strong> las bacterias y<br />

<strong>de</strong> todas las formas <strong>de</strong> vida, se pue<strong>de</strong>n <strong>de</strong>terminar mediante la comparación <strong>de</strong> una<br />

parte estable <strong>de</strong>l código genético.<br />

La parte <strong>de</strong>l ADN más utilizado para propósitos taxonómicos en bacterias es el gen<br />

ARNr 16S, siendo indiscutible que la información contenida en este gen, ha jugado un<br />

papel fundamental en la microbiología.<br />

El gen ARNr 16S es una secuencia <strong>de</strong> aproximadamente 1.500 nucleótidos, contiene<br />

regiones altamente conservadas, que permiten establecer la relación taxonómica<br />

profunda entre familias, clases y filos, así como regiones variables que posibilitan<br />

discriminar entre especies <strong>de</strong>ntro <strong>de</strong>l mismo género (TORTORI, 2003). Estas<br />

características permitieron utilizar el gen como marcador filogenético y herramienta <strong>de</strong><br />

i<strong>de</strong>ntificación (MAC-FADDIN, 2003).<br />

El análisis <strong>de</strong>l los genes <strong>de</strong> ARNr, con el uso <strong>de</strong> las bases <strong>de</strong> datos <strong>de</strong> referencia <strong>de</strong><br />

alta calidad, proporciona un método eficaz para la i<strong>de</strong>ntificación <strong>de</strong> microorganismos<br />

(HARMSEN y KARCH, 2004).<br />

2.3.2 Operones ribosómicos. Todas las bacterias contienen genes codificantes para<br />

diferentes ARNs ribosomales. Estos genes que codifican los ARN ribosomales están<br />

organizados en operones. En eubacterias, cada operón ribosómico (rrn) incluye genes<br />

para los ARNr: 23S (rrl), 16S (rrs) y 5S (rrf), separados por regiones espaciadoras o<br />

intergénicas (IG) y contiene a<strong>de</strong>más genes para uno o más ARN <strong>de</strong> transferencia<br />

(BARRY et al., 1991).<br />

El producto <strong>de</strong> la transcripción <strong>de</strong>l operón a partir <strong>de</strong> dos promotores P1 y P2, situados<br />

en la región anterior a rrs, es procesado por la enzima ARNasa III, la que mediante<br />

cortes en sitios específicos da origen a las tres clases <strong>de</strong> ARNr, el o los ARNt y las dos<br />

regiones IG (GÜRTLER y STANISICH, 1996).<br />

A continuación en la FIGURA 3, se representa esquemáticamente la organización <strong>de</strong><br />

un operón ribosómico.<br />

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