Télécharger le manuscrit de thèse (pdf) - MathGon
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Introduction bibliographique<br />
l’intermédiaire <strong>de</strong>s régions palindromiques, sert <strong>de</strong> matrice à la syn<strong>thèse</strong> du brin complémentaire<br />
aboutissant à la formation d’ADN doub<strong>le</strong> brin.<br />
3.2 Fonctions communes<br />
En <strong>de</strong>hors d’un opéron réplicatif, <strong>de</strong> nombreux plasmi<strong>de</strong>s possè<strong>de</strong>nt <strong>de</strong>s gènes supplémentaires<br />
conférant <strong>de</strong>s propriétés plus ou moins spécifiques aux plasmi<strong>de</strong>s. Ils co<strong>de</strong>nt en général pour <strong>de</strong>s<br />
mécanismes <strong>de</strong> maintenance (partition), <strong>de</strong>s protéines permettant l’intégration dans <strong>le</strong><br />
chromosome <strong>de</strong> la cellu<strong>le</strong> hôte ou bien <strong>de</strong>s mécanismes impliqués dans <strong>le</strong> transfert intercellulaire<br />
du réplicon.<br />
3.2.1 La maintenance plasmidique<br />
La maintenance plasmidique regroupe l’ensemb<strong>le</strong> <strong>de</strong>s mécanismes permettant d’assurer un<br />
héritage vertical <strong>de</strong>s plasmi<strong>de</strong>s. El<strong>le</strong> est d’autant plus importante lorsque <strong>le</strong> plasmi<strong>de</strong> ne confère<br />
pas d’avantage évolutif à son hôte en environnement sé<strong>le</strong>ctif. Les mécanismes <strong>de</strong> maintenance<br />
font intervenir la recombinaison site‐spécifique reconstituant un réplicon fonctionnel après<br />
réplication (résolution <strong>de</strong>s dimères <strong>de</strong> plasmi<strong>de</strong>), <strong>de</strong>s mécanismes <strong>de</strong> partition et d’addiction<br />
assurant la perpétuation du plasmi<strong>de</strong> au cours <strong>de</strong>s divisions cellumlaires successives.<br />
La partition du plasmi<strong>de</strong> est sa capacité à se distribuer équitab<strong>le</strong>ment entre <strong>le</strong>s <strong>de</strong>ux cellu<strong>le</strong>s fil<strong>le</strong>s<br />
après division cellulaire. La perpétuation du plasmi<strong>de</strong> fait intervenir différents mécanismes en<br />
fonction du nombre <strong>de</strong> copies <strong>de</strong> l’élément. Les plasmi<strong>de</strong>s à haut nombre <strong>de</strong> copies se<br />
répartissent souvent aléatoirement lors <strong>de</strong> la division cellulaire. En effet, la probabilité qu'une<br />
cellu<strong>le</strong> se retrouve sans copie du plasmi<strong>de</strong> est <strong>de</strong> 2 ‐n où n est <strong>le</strong> nombre <strong>de</strong> copies avant la<br />
division. Ainsi, un plasmi<strong>de</strong> présent en 10 copies risque d'être perdu toutes <strong>le</strong>s 1024 divisions.<br />
Avec 20 copies, cette probabilité tombe à moins d'une chance sur un million (probabilité encore<br />
diminuée par l'encombrement volumique <strong>de</strong>s plasmi<strong>de</strong>s dans la cellu<strong>le</strong>). Bien que cette perte soit<br />
rare, el<strong>le</strong> confère dans certains cas un avantage évolutif pour la cellu<strong>le</strong> qui n’aura plus à supporter<br />
la charge énergétique que représente la réplication d’un nombre trop important <strong>de</strong> copies du<br />
plasmi<strong>de</strong>.<br />
La stabilisation d'un plasmi<strong>de</strong> à faib<strong>le</strong> nombre <strong>de</strong> copies dans la population qui l'héberge<br />
nécessite d'autres mécanismes faisant intervenir <strong>de</strong>s protéines spécialisées. Ces mécanismes sont<br />
appelés actifs. Ils appartiennent à différentes catégories et peuvent être cumulés sur un plasmi<strong>de</strong><br />
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