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Système de partition I
Introduction bibliographique
Le système de partition I est le plus fréquent. Il code une protéine ATPase de la famille Walker A
(également appelé P‐loop). Ces ATPases WalkerA sont sous‐divisées en deux groupes : type Ia et
type Ib. Le type Ia comprend entre autre la protéine ParA du prophage P1 et SopA du plasmide F.
Le type Ib inclut ParF du plasmide pTP228 de Salmonela newport, ParA des plasmides pTAR
d’Agrobacterium tumefaciens et pB171 d’Escherichia coli. Quelques différences existent entre ces
deux types de Walker, notamment la présence d’un domaine HTH à l’extrémité N‐terminale
impliquée dans la régulation transcriptionnelle de l’opéron par.
Système de partition II
Le système de partition II le plus documenté est celui du plasmide R1. Il fait intervenir l’ATPase
ParM (moteur) et la protéine de fixation à l’ADN ParR (répresseur). Le site cis‐activateur servant
de « centromère » est nommé parC.
3.2.1.b Partition par mécanismes “passifs” : l’addiction au plasmide
Ces mécanismes augmentent la maintenance plasmidique en tuant les cellules n’ayant pas acquis
de plasmide. Ces systèmes sont rencontrés sous les appellations d’addiction au plasmide ou de
suicide post‐ségrégationel (PSK post segragational killing). Ils ont été identifiés sur de nombreux
chromosomes et plasmides à faible nombre de copies, aussi bien chez les Bacteria que chez les
Archaea. Le terme de tuerie est souvent abusif car les toxines possédent seulement un effet
bactériostatique inhibant la croissance des cellules ayant perdu le plasmide.
Ces systèmes sont généralement codés sous forme d’un opéron codant deux protéines : un
poison et son antidote. L'antidote est relativement instable par rapport au poison, il est
rapidement dégradé par l'activité d'une protéase ATP‐dépendante. L’antidote doit être maintenu
à une concentration suffisante pour contrecarrer l'effet du poison, ceci requiert la présence du
plasmide codant pour cette protéine. En effet, lors d’une division, une cellule ne reçevant pas de
plasmides voit l'antidote encore présent dans le cytoplasme rapidement se dégrader sans qu'il ne
puisse être synthétisé de novo. Le poison plus stable peut alors agir et tuer la cellule, d'où
l'appellation de post‐segregational killing. Le terme « module de dépendance » fait référence au
fait que la cellule est « accro » (addicted) à sa « dose » d'antidote pour survivre.
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