Télécharger le manuscrit de thèse (pdf) - MathGon

estriction‐modification
Introduction bibliographique
Un autre type de système, proche des poison‐antidote, est le système restriction‐modification
(RM). D'ordinaire, il est utilisé par les cellules pour se protéger de l’infection par de l’ADN
étranger (un phage, par exemple). Il est caractérisé par la présence d'enzymes de restriction qui
clivent la molécule d'ADN invasive au niveau d'un site spécifique. Le génome de la bactérie est
protégé des enzymes de restriction grâce à une enzyme méthylant son ADN.
Ce système fonctionne également pour la stabilisation de plasmides. La différence fondamentale
avec les systèmes « classiques » poison‐antidote tient au fait que les deux enzymes ne forment
pas un complexe inactivant l'enzyme de restriction. De plus, l'effet de post‐segregational killing ne
résulterait pas d’une dégradation plus rapide de la méthylase permettant la toxicité du poison
(enzyme de restriction). Un modèle a été proposé dans lequel la dilution progressive des deux
enzymes au cours des divisions successives mènerait à un point où la méthylation ne sont plus
suffisantes à se protéger du peu d'enzymes de restriction encore présentes pouvant causer des
dommages irréparables à l’ADN.
3.2.2 Intégration
Certains plasmides possèdent la capacité d’intégrer leur génome dans le chromosome de leur
hôte. L’intégration est le résultat d’une recombinaison site‐spécifique. L’intégration de plasmide,
ou la formation de provirus, est effectuée par une recombinase de la famille des intégrases (Ints).
L’intégration se déroule en plusieurs étapes catalysées uniquement par cette enzyme. Les
mécanismes impliquant les recombinases et aboutissant à l’intégration de l’élément génétique
mobile sont détaillés dans le chapitre consacré aux éléments génétiques intégrés des Archaea
(Page 48)
4. Fonctions spécifiques
Les fonctions spécifiques ne sont pas indispensables à la survie du plasmide mais peuvent
néanmoins apporter un avantage à l’hôte cellulaire en cas de changement d’environnement. De
nombreuses souches ont été isolées du fait de la présence de plasmides conférant un avantage
sélectif. Les cas les plus documentés pose d’énormes problèmes de santé publiques, ils
concernent les plasmides codant des gènes de résistance aux antibiotiques (Schluter et al., 2007).
On peut également trouver des gènes impliqués dans la résistance aux métaux lourds (Unaldi et
al., 2003) ou l’exemple de certains Pseudomonas possédant l’opéron de gènes TOL impliqué dans
la dégradation des composés hydrocarbures aromatiques (Greated et al., 2002).
22