Télécharger le manuscrit de thèse (pdf) - MathGon

Introduction bibliographique
insoupçonné : il existe deux familles totalement différentes de procaryotes. L’étude de l’ARNr des
bactéries anaérobies méthanogènes a montré qu’elles forment un groupe homogène
représentant un taxon évolutif extérieur à celui des bactéries. Woese et ses collaborateurs ont
baptisé ces micro‐organismes archaeabactéries (Woese et al. 1977). La dichotomie
Procaryotes/Eucaryotes a alors été scindée pour aboutir à un arbre du vivant constitué de trois
règnes primaires : les archaeabactéries, les eubactéries et les eucaryotes. Le préfixe latin Archaea
fait référence aux biotopes dans lesquels vivent ces organismes, supposés se rapprocher de
l’atmosphère primitive terrestre (forte salinité ou pH, dépourvu d’O2, riche en H2 et C02 qui
constituent les matières premières pour la production de méthane). Leur découverte dans les
sources hydrothermales océaniques profondes a donné une nouvelle impulsion à l’hypothèse de
l’origine chaude de la vie tout en faisant basculer son lieu d’apparition de la surface de la planète
vers les profondeurs de la terre et des océans. Ces biotopes à grandes profondeurs auraient
permis l’apparition de la vie et son développement à l’abri de l’intense bombardement de
météorites dont la Terre a été le théâtre pendant les premiers 500 millions d’années de son
existence. Ces gigantesques bombardements pouvaient en effet volatiliser la couche supérieure
des océans, et stériliser la surface de la planète (Gogarten‐Boekels et al., 1995). De plus,
l’apparition de la vie en profondeur règlerait le problème posé par le rayonnement UV, délétère
pour les acides nucléiques, qui prévalait à cette époque en l’absence de couche d’ozone
protectrice. Enfin, un grand nombre de ces micro‐organismes atypiques présente un métabolisme
basé sur l’utilisation du soufre et du fer, deux éléments que l’on retrouve dans le scénario de
Wächtershaüser pour une origine autotrophe du vivant (Wachtershauser 1990).
Figure 5 Arbre phylogénétique des trois domaines du vivant basé sur l’ADNr
24