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Introduction bibliographique
Tableau 2 Caractéristiques des génomes de Pyrococcus, Adapté de Lecompte et al., 2007
P. abyssi P. horikoshii P. furiosus
Taille du chromosome (pb) 1 765 118 1 738 505 1 908 253
Régions codantes 91,10% 91,20% 92,50%
Contenu en G+C 44,70% 41,90% 40,80%
ARNs stables
ARNt 46 46 46
ARNt avec introns Trp, Met Trp, Met Trp, Met
ARNr 16S‐23S 16S‐23S 16S‐23S
5Sa, 5Sb 5Sa, 5Sb 5Sa, 5Sb
7S 7S 7S
ORFs 1765 2061 2208
Familles de paralogues 621 606 845
Fonction putative 51% 20% ‐
Gènes Informationnels 14% ‐ ‐
Gènes Opérationnels 37% ‐ ‐
Fonction inconnue 49% 80% ‐
Eléments mobiles
Intéines 14% 14 10
Séquences d’Insertion (IS) 1 vestige 1 vestige 24
8 intéines localisées au même site d’insertion dans les 3 Pyrococcus reflètent la forte conservation
de ces éléments. P. furiosus diffère par un génome de plus grande taille et par la présence de
séquences d’insertion (ISs) (Tableau 2). Le génome de P. furiosus contient également un plus
grand nombre de paralogues. Ces différences sont en accord avec les phylogénies basées sur
l’ARNr 16S indiquant que P. abyssi et P. horikoshii ont divergé après la spéciation de P.furiosus.
L’analyse par paire des 3 génomes montre que P. abyssi et P. horikoshii sont plus proches (1122kb
en commun) que P. abyssi et P. furiosus (847) et que de P. horikoshii et P. furiosus (898kb). Le plus
grand fragment conservé est observé entre P. abyssi et P. horikoshii (300kb). Un nombre
important de réarrangements chromosomiques sont intervenus depuis la divergence de P.
furiosus vis‐à‐vis de l’ancêtre commun à P. abyssi et P. horikoshii. Entre ces 2 proches génomes, il
y a 17 inversions et transpositions.
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