M - laboratoire PROTEE - Université du Sud - Toulon - Var

- Isolement des exopolysaccharides
La nature des EPS dépend de la méthode utilisée pour les isoler, donc la méthode
d’extraction devra être adaptée au type d’EPS recherchés. De nos jours, il n’existe pas de
technique d’isolement universelle. Dans la littérature, de nombreuses techniques physiques,
chimiques ou une combinaison des deux sont décrites (exemple tableau 2) (Caudan et al.,
2012).
Elles sont réalisées à partir de centrifugation, filtration, traitement à la chaleur, sonication,
traitement avec des agents complexes, des résines échangeuses d’ions ou par utilisation
d’hydroxyde de sodium.
Tableau 2 : Comparaison de plusieurs méthodes d’extraction des protéines et polysaccharides de biofilms
bactériens (Caudan et al., 2012). PN=Protéines PS=Polysaccharides
Une des méthodes recommandée est l’utilisation de résines échangeuses de cations (Frolund
et al., 1996), qui permet de retirer les cations interagissant avec les groupements chargés
négativement (acides uroniques des polysaccharides, chaînes latérales d’acides aminés des
protéines) ceci, en préservant l’intégrité des cellules.
Fig. 12 : Les classes de faibles interactions physico-chimiques et les enchevêtrements des biopolymères qui
dominent la stabilité de la matrice d’EPS (Flemming and Wingender, 2010).
Afin d’obtenir un maximum d’exopolymères que ce soit en quantité ou bien en qualité, qu’ils
soient insolubles ou solubles, il est nécessaire de combiner les techniques chimiques et
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