M - laboratoire PROTEE - Université du Sud - Toulon - Var

Ces travaux ont finalement permis de caractériser de manière approfondie huit souches isolées
à partir des plaques immergées dans la Méditerranée.
Il ressort de cette étude que :
• Toutes les bactéries sont des bacilles à Gram négatif, chargées négativement à leurs
surfaces ;
• La population au sein d’un même biofilm est hétérogène in situ ;
• On observe une certaine diversité taxonomique mais on retrouve 2 genres présents
majoritairement dans le cadre de cette étude : Pseudoalteromonas et Shewanella ;
• Certaines souches sont plus mobiles que d’autres ;
• Parmi les 8 souches identifiées et caractérisées, seule la souche TC5 semble (d’après
les résultats du Biofilm Ring Test) ne pas produire de matrice d’EPS tout en ayant des
capacités d’adhésion.
• De plus cette souche TC 5 se distingue également car elle est non mobile, présente un
caractère hydrophobe et a la capacité de fermenter certains sucres.
III-2 Démarche expérimentale pour l’extraction des EPS :
Cultures sur 100 boîtes de Pétri.
Le schéma du protocole mis au point est décrit page 17 et 18 et présenté en annexe 1.
Ce protocole a été mis au point avec pour objectif la récupération d’un maximum d’EPS (en
masse) tout en préservant l’intégrité des bactéries, afin de ne pas contaminer les échantillons
avec des composés intracellulaires.
Pour l’extraction des EPS, le choix d’une action chimique avec une résine échangeuse de
cations (Dowex – Forme Na + ) suivi d’une action physique (centrifugation à grande vitesse) a
été fait.
Le protocole a été appliqué sur les souches TC9 et FRN1. Le tableau suivant présente les
résultats obtenus en termes de quantité pour chaque échantillon récupéré.
TC 9 FRN 1
SN 6 0,052 SN 6 0,0795
CT 5 + CT 6 0,1415 CT 5 + CT 6
CT 4 jeté CT 4 jeté
CT 3 3,09 CT 3 23,91
SN 1 0,474
SN 1 + 2 + 3 0,2527 SN 2 + SN 3 0,24
Après partition Après partition
TC 9 SN6 inter 0,0113 FRN1 SN6 aq 0,0303
TC 9 SN 1 2 3 inter 0,256 FRN1 SN 23 inter 0,0729
TC 9 SN 6 aq 0,0285 FRN1 SN 2 3 aq 1,211
TC 9 SN 1 2 3 aq 0,0289 FRN 1 SN 6 inter 0,034
Tableau 4 : Tableau des masses (en g) des différentes fractions obtenues à partir des cultures de 100 boîtes
aq=phase aqueuse / inter=interphase
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