M - laboratoire PROTEE - Université du Sud - Toulon - Var

Sommaire
I- Introduction .................................................................................................................................................... 4
I-1 Introduction bibliographique ..................................................................................................................... 4
I-1.1 Biofouling en milieu marin ................................................................................................................. 4
a) Conséquences économiques .............................................................................................................. 4
b) Conséquences écologiques ................................................................................................................ 5
c) Lutte contre le biofouling .................................................................................................................. 6
d) Les alternatives .................................................................................................................................. 7
e) Composés antifouling naturels d’origine marine ............................................................................... 8
I-1.2 Biofilms et biofouling ......................................................................................................................... 9
a) Chronologie ....................................................................................................................................... 9
b) Avantages de la vie en biofilm ........................................................................................................ 10
c) La matrice des biofilms bactériens .................................................................................................. 10
I-2 Introduction du sujet du stage ................................................................................................................ 15
II- Matériels et méthodes : ................................................................................................................................. 16
II-1 Souches bactériennes .......................................................................................................................... 16
II-2 Conservation des souches ................................................................................................................... 16
II-3 Milieux de culture ............................................................................................................................... 16
II-4 Préculture / Culture en biofilm............................................................................................................ 17
a) Préculture ........................................................................................................................................ 17
b) Culture en erlenmeyer ..................................................................................................................... 17
c) Culture en biofilm ........................................................................................................................... 17
II-5 Extraction des substances extrapolymériques. .................................................................................... 17
II-6 Protocole de partage ............................................................................................................................ 18
II-7 Résonance magnétique nucléaire (RMN) ........................................................................................... 18
II-8 Infra-rouge à transformée de Fourier (IR-TF) .................................................................................... 18
II-9 Chromatographie liquide à haute performance (CLHP) ..................................................................... 19
III- Résultats & Discussion .............................................................................................................................. 20
III-1 Résultats antérieurs.............................................................................................................................. 20
III-2 Démarche expérimentale pour l’extraction des EPS : Cultures sur 100 boîtes de Pétri. ...................... 22
III-3 Etude comparative de métabolites des souches cultivées en biofilm : cultures sur 10 boîtes de Pétri. 23
a) Partage ............................................................................................................................................. 24
b) Spectres RMN ................................................................................................................................. 25
c) Spectres IR-TF ................................................................................................................................ 27
d) CLHP .............................................................................................................................................. 28
IV- Conclusion et Perspectives ........................................................................................................................ 31
Références bibliographiques ................................................................................................................................. 32
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