ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИВолков А.Н., Лошакова Л.Ю., Сух<strong>и</strong>х А.С., Ен<strong>и</strong>кеева А.Д., Бондарева Т.Ю.Кемеровская государственная мед<strong>и</strong>ц<strong>и</strong>нская академ<strong>и</strong>я,Кемеровск<strong>и</strong>й государственный ун<strong>и</strong>верс<strong>и</strong>тет,МОУ «Детск<strong>и</strong>й дом № 2»,г. КемеровоАССОЦИАЦИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ВАРИАНТОВ ПОЛИМОРФНОГОМАРКЕРА rs12640848 ГЕНА ENAM С ПОВЫШЕННЫМ РИСКОМРАЗВИТИЯ КАРИЕСА У ДЕТЕЙ ДОШКОЛЬНОГО ВОЗРАСТАПроведено стоматолог<strong>и</strong>ческое обследован<strong>и</strong>е <strong>и</strong> последующее генот<strong>и</strong>п<strong>и</strong>рован<strong>и</strong>е детей 2-6 лет, посещающ<strong>и</strong>х дошкольныеобразовательные учрежден<strong>и</strong>я г. Кемерово. ДНК выделял<strong>и</strong> сорбентным методом <strong>и</strong>з <strong>и</strong>нд<strong>и</strong>в<strong>и</strong>дуальных образцов буккальногососкоба. Ампл<strong>и</strong>ф<strong>и</strong>кац<strong>и</strong>ю участка гена ENAM, содержащего маркер rs12640848, выполнял<strong>и</strong> с помощью аллель-спец<strong>и</strong>ф<strong>и</strong>ческойПЦР. Детекц<strong>и</strong>ю продуктов ампл<strong>и</strong>ф<strong>и</strong>кац<strong>и</strong><strong>и</strong> осуществлял<strong>и</strong> электрофорет<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong> в 3 % агарозномгеле. Сопоставлены частоты аллелей <strong>и</strong> генот<strong>и</strong>пов пол<strong>и</strong>морфного маркера rs12640848 у благополучных по кар<strong>и</strong>есу детей(группа I, n = 139) <strong>и</strong> детей с очень высок<strong>и</strong>м уровнем <strong>и</strong>нтенс<strong>и</strong>вност<strong>и</strong> кар<strong>и</strong>еса (группа II, n = 144). В результате <strong>и</strong>сследован<strong>и</strong>яустановлена ассоц<strong>и</strong>ац<strong>и</strong>я вар<strong>и</strong>анта А <strong>и</strong>зучаемого маркера ENAM с повышенным р<strong>и</strong>ском детского кар<strong>и</strong>еса(OR = 1,51; СI 95%: 1,06-2,13). Генот<strong>и</strong>п G/G rs12640848 характер<strong>и</strong>зовался протект<strong>и</strong>вным действ<strong>и</strong>ем в отношен<strong>и</strong><strong>и</strong> даннойпатолог<strong>и</strong><strong>и</strong> в <strong>и</strong>зученной выборке.Ключевые слова: амелогенез; кар<strong>и</strong>ес; ENAM.Volkov A.N., Loshakova L.J., Suhih A.S., Enikeeva A.D., Bondareva T.J.Kemerovo State Medical Academy,Kemerovo State University,Boarding school for orphans N 2, KemerovoASSOCIATION OF GENETIC VARIANTS OF POLYMORPHIC MARKER rs12640848 IN ENAM GENEWITH HEIGHTENED RISK OF CARIES FORMATION IN PRESCHOOL CHILDRENDental examination and subsequent genotyping among 2-6 year old children attending preschool educational institutions inKemerovo were conducted. DNA was isolated by sorbent method from individual samples of buccal scraping. Amplificationof gene ENAM region, containing marker rs12640848, was performed by using allele-specific PCR. The detection of amplificationproducts was carried out electrophoretically in 3 % agarose gel. Frequencies of alleles and genotypes of polymorphicmarker rs12640848 in children advantaged by caries (group I, n = 139) and in ones with extremely high caries intensity level(group II, n = 144) were compared. The study revealed the association of A variant of examined marker ENAM with an increasedrisk of childhood caries (OR = 1,51; CI 95%: 1,06-2,13). Genotype G/G rs12640848 was characterized by protective effectagainst this abnormality in the studied sample.Key words: amelogenesis; caries; ENAM.Кар<strong>и</strong>ес зубов относ<strong>и</strong>тся к ч<strong>и</strong>слу повсеместнораспространенных мульт<strong>и</strong>фактор<strong>и</strong>альных патолог<strong>и</strong>й,у детей зачастую протекает стрем<strong>и</strong>тельно<strong>и</strong> нос<strong>и</strong>т множественный (с<strong>и</strong>стемный) характер[1]. В ч<strong>и</strong>сле канд<strong>и</strong>датных генов заболеван<strong>и</strong>я рассматр<strong>и</strong>вают,прежде всего, гены структурных белковзубной эмал<strong>и</strong>: амелоген<strong>и</strong>н (AMELX), амелобласт<strong>и</strong>н(AMBN) <strong>и</strong> энамел<strong>и</strong>н (ENAM) [2].Энамел<strong>и</strong>н относ<strong>и</strong>тся к семейству секрет<strong>и</strong>руемыхкальц<strong>и</strong>й-связывающ<strong>и</strong>х фосфопроте<strong>и</strong>нов (SCPP), ш<strong>и</strong>рокопредставленных в эмал<strong>и</strong> зубов [3]. Белок секрет<strong>и</strong>руетсяамелобластам<strong>и</strong> <strong>и</strong> функц<strong>и</strong>он<strong>и</strong>рует толькопр<strong>и</strong> форм<strong>и</strong>рован<strong>и</strong><strong>и</strong> зубной эмал<strong>и</strong>. В ходе созреван<strong>и</strong>яткан<strong>и</strong> вещество подвергается протеол<strong>и</strong>зу <strong>и</strong> реабсорбц<strong>и</strong><strong>и</strong>в амелобласты [4].Изучен<strong>и</strong>е кл<strong>и</strong>н<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong> знач<strong>и</strong>мых генет<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong>х вар<strong>и</strong>антовENAM началось л<strong>и</strong>шь в последнее десят<strong>и</strong>лет<strong>и</strong>е,с выявлен<strong>и</strong>я ассоц<strong>и</strong>ац<strong>и</strong><strong>и</strong> локуса 4q11-q21 сКорреспонденц<strong>и</strong>ю адресовать:ВОЛКОВ Алексей Н<strong>и</strong>колаев<strong>и</strong>ч,650029, г. Кемерово, ул. Ворош<strong>и</strong>лова, 22а.ГБОУ ВПО КемГМА М<strong>и</strong>нздравсоцразв<strong>и</strong>т<strong>и</strong>я Росс<strong>и</strong><strong>и</strong>.Тел.: 8 (3842) 73-48-56; +7-905-949-32-85.E-mail: volkov_alex@rambler.ruнесовершенным амелогенезом (amelogenesis imperfecta,AI) [5]. К настоящему времен<strong>и</strong> в гене ENAMвыявлены <strong>и</strong> охарактер<strong>и</strong>зованы разл<strong>и</strong>чные мутац<strong>и</strong><strong>и</strong>,пр<strong>и</strong>водящ<strong>и</strong>е к патолог<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong>м <strong>и</strong>зменен<strong>и</strong>ям в зубнойэмал<strong>и</strong>: однонуклеот<strong>и</strong>дные замены [5, 6], <strong>и</strong>нсерц<strong>и</strong><strong>и</strong>[7, 8], делец<strong>и</strong><strong>и</strong> [9]. Очев<strong>и</strong>дно, что нормальное состоян<strong>и</strong>еданного гена необход<strong>и</strong>мо для прав<strong>и</strong>льного амелогенеза,а мутац<strong>и</strong><strong>и</strong> ENAM могут <strong>и</strong>меть негат<strong>и</strong>вныепоследств<strong>и</strong>я для состоян<strong>и</strong>я зубов, вплоть до потер<strong>и</strong>функц<strong>и</strong><strong>и</strong> эмал<strong>и</strong>.Частота мутац<strong>и</strong>й, ведущ<strong>и</strong>х к AI, невел<strong>и</strong>ка, а связанныес н<strong>и</strong>м<strong>и</strong> патолог<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong>е <strong>и</strong>зменен<strong>и</strong>я носят тяжелыйхарактер. Очев<strong>и</strong>дно, в по<strong>и</strong>ске генет<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong>хмаркеров детского кар<strong>и</strong>еса следует обращать вн<strong>и</strong>ман<strong>и</strong>ена пол<strong>и</strong>морф<strong>и</strong>змы, <strong>и</strong>меющ<strong>и</strong>е большее распространен<strong>и</strong>е<strong>и</strong> огран<strong>и</strong>ченный патолог<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong>й эффект.Сред<strong>и</strong> так<strong>и</strong>х возможных пред<strong>и</strong>кторов повышенногор<strong>и</strong>ска детского кар<strong>и</strong>еса рассматр<strong>и</strong>вал<strong>и</strong>сь л<strong>и</strong>шь маркерыrs3796703 <strong>и</strong> rs3796704, расположенные в транскр<strong>и</strong>б<strong>и</strong>руемойчаст<strong>и</strong> гена ENAM [10, 11]. Пр<strong>и</strong> этомне было установлено достоверного отл<strong>и</strong>ч<strong>и</strong>я частоткак<strong>и</strong>х-л<strong>и</strong>бо генет<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong>х вар<strong>и</strong>антов <strong>и</strong>зучаемых маркеровсред<strong>и</strong> детей с высок<strong>и</strong>м уровнем поражен<strong>и</strong>я зубовкар<strong>и</strong>есом, по сравнен<strong>и</strong>ю со здоровым<strong>и</strong> обследованным<strong>и</strong>.42 T. 11 № 2 2012
АССОЦИАЦИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ВАРИАНТОВ ПОЛИМОРФНОГО МАРКЕРА RS12640848 ГЕНА ENAMС ПОВЫШЕННЫМ РИСКОМ РАЗВИТИЯ КАРИЕСА У ДЕТЕЙ ДОШКОЛЬНОГО ВОЗРАСТАМожно констат<strong>и</strong>ровать, что по<strong>и</strong>ск <strong>и</strong>нформат<strong>и</strong>вногогенет<strong>и</strong>ческого маркера предрасположенност<strong>и</strong> к детскомукар<strong>и</strong>еса далек от завершен<strong>и</strong>я <strong>и</strong> требует <strong>и</strong>зучен<strong>и</strong>ядополн<strong>и</strong>тельных пол<strong>и</strong>морфных участков в структуреENAM <strong>и</strong> друг<strong>и</strong>х генов амелогенеза.Цель <strong>и</strong>сследован<strong>и</strong>я – <strong>и</strong>зучен<strong>и</strong>е характера ассоц<strong>и</strong>ац<strong>и</strong><strong>и</strong>генет<strong>и</strong>ческ<strong>и</strong>х вар<strong>и</strong>антов ранее не <strong>и</strong>зучавшегосяпол<strong>и</strong>морфного маркера rs12640848 гена ENAMс р<strong>и</strong>ском поражен<strong>и</strong>я кар<strong>и</strong>есом зубов у детей дошкольноговозраста.МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫИССЛЕДОВАНИЯСтоматолог<strong>и</strong>ческое обследован<strong>и</strong>е <strong>и</strong> последующеегенот<strong>и</strong>п<strong>и</strong>рован<strong>и</strong>е было проведено у детей в возрастеот 2 до 6 лет европео<strong>и</strong>дной этн<strong>и</strong>ческой пр<strong>и</strong>надлежност<strong>и</strong>,посещающ<strong>и</strong>х дошкольные образовательныеучрежден<strong>и</strong>я г. Кемерово. Изучен<strong>и</strong>е стоматолог<strong>и</strong>ческогостатуса ребенка предполагало определен<strong>и</strong>е состоян<strong>и</strong>явременных зубов в плане поражен<strong>и</strong>я <strong>и</strong>х кар<strong>и</strong>есомс помощью <strong>и</strong>ндекса кпу (сумма кар<strong>и</strong>озных,пломб<strong>и</strong>рованных <strong>и</strong> удаленных зубов временного пр<strong>и</strong>куса,пр<strong>и</strong> этом зубы, удаленные в результате ф<strong>и</strong>з<strong>и</strong>олог<strong>и</strong>ческойсмены, не уч<strong>и</strong>тывал<strong>и</strong>сь) с последующейоценкой <strong>и</strong>нд<strong>и</strong>в<strong>и</strong>дуального уровня <strong>и</strong>нтенс<strong>и</strong>вност<strong>и</strong> кар<strong>и</strong>еса(УИК). УИК рассч<strong>и</strong>тывал<strong>и</strong> как частное от делен<strong>и</strong>якпу на возраст обследуемого в соответств<strong>и</strong><strong>и</strong> сметод<strong>и</strong>кой, предложенной П.А. Леусом (1990). Пр<strong>и</strong>значен<strong>и</strong><strong>и</strong> УИК не более 0,4 <strong>и</strong>ндекс оцен<strong>и</strong>вал<strong>и</strong> какн<strong>и</strong>зк<strong>и</strong>й; в пределах 0,5-0,8 – как средн<strong>и</strong>й; в пределах0,9-1,2 – как высок<strong>и</strong>й <strong>и</strong> от 1,3 <strong>и</strong> более – какочень высок<strong>и</strong>й.Генот<strong>и</strong>п<strong>и</strong>рован<strong>и</strong>е осуществлялось только сред<strong>и</strong>обследованных двух когорт с контрастным значен<strong>и</strong>ем<strong>и</strong>зучаемого пр<strong>и</strong>знака – л<strong>и</strong>ца со здоровым<strong>и</strong> зубам<strong>и</strong>(I группа, n = 139) <strong>и</strong> <strong>и</strong>нд<strong>и</strong>в<strong>и</strong>дуумы, <strong>и</strong>меющ<strong>и</strong>еочень высокое значен<strong>и</strong>е УИК (II группа, n = 144).Распределен<strong>и</strong>е показателя возраста во всех группахне являлось нормальным, так как отсутствовало равенствосреднего ар<strong>и</strong>фмет<strong>и</strong>ческого, мед<strong>и</strong>аны <strong>и</strong> моды.Вместе с тем, сформ<strong>и</strong>рованные группы был<strong>и</strong> сопостав<strong>и</strong>мыпо половозрастному составу <strong>и</strong> основнымвыборочным характер<strong>и</strong>ст<strong>и</strong>кам, что сделало правомерным<strong>и</strong>х прот<strong>и</strong>вопоставлен<strong>и</strong>е в ходе последующегоанал<strong>и</strong>за (табл. 1).Молекулярно-генет<strong>и</strong>ческое <strong>и</strong>сследован<strong>и</strong>е проведенов центральной научно-<strong>и</strong>сследовательской лаборатор<strong>и</strong><strong>и</strong>Кемеровской государственной мед<strong>и</strong>ц<strong>и</strong>нскойакадем<strong>и</strong><strong>и</strong>. Источн<strong>и</strong>ком ДНК обследуемых послуж<strong>и</strong>л<strong>и</strong>образцы буккального эп<strong>и</strong>тел<strong>и</strong>я, выделен<strong>и</strong>е ДНКосуществлял<strong>и</strong> сорбентным методом с <strong>и</strong>спользован<strong>и</strong>-Табл<strong>и</strong>ца 1Характер<strong>и</strong>ст<strong>и</strong>ка обследованных по возрастус учетом уровня <strong>и</strong>нтенс<strong>и</strong>вност<strong>и</strong> кар<strong>и</strong>еса (УИК) <strong>и</strong> полаЗдоровые(I группа)С очень высок<strong>и</strong>мУИК (II группа)ГруппыМальч<strong>и</strong>к<strong>и</strong> (n = 63)Девочк<strong>и</strong> (n = 76)Общая группа (n = 139)Мальч<strong>и</strong>к<strong>и</strong> (n = 84)Девочк<strong>и</strong> (n = 60)Общая группа (n = 144)Min222222Me4344,544ем наборов реагентов. В качестве сайта, содержащегооднонуклеот<strong>и</strong>дный пол<strong>и</strong>морф<strong>и</strong>зм, был выбран маркерrs12640848, расположенный в <strong>и</strong>нтронной област<strong>и</strong>гена ENAM. Для <strong>и</strong>дент<strong>и</strong>ф<strong>и</strong>кац<strong>и</strong><strong>и</strong> нуклеот<strong>и</strong>днойзамены A>G <strong>и</strong>спользовал<strong>и</strong> ампл<strong>и</strong>ф<strong>и</strong>кац<strong>и</strong>ю соответствующегоучастка методом аллель-спец<strong>и</strong>ф<strong>и</strong>ческойпол<strong>и</strong>меразной цепной реакц<strong>и</strong><strong>и</strong> с последующей детекц<strong>и</strong>ейампл<strong>и</strong>конов методом электрофореза в 3 % агарозномгеле.Для стат<strong>и</strong>ст<strong>и</strong>ческой обработк<strong>и</strong> данных <strong>и</strong>спользовалсяпакет Statistica 6.0 с целью <strong>и</strong>зучен<strong>и</strong>я характерараспределен<strong>и</strong>я выборочных наблюден<strong>и</strong>й, определен<strong>и</strong>ямед<strong>и</strong>аны <strong>и</strong> моды, сравнен<strong>и</strong>я частот аллелей<strong>и</strong> генот<strong>и</strong>пов в группах с разным уровнем кар<strong>и</strong>еса методомχ 2 для табл<strong>и</strong>ц 2×2. Для всех в<strong>и</strong>дов анал<strong>и</strong>заразл<strong>и</strong>ч<strong>и</strong>я сч<strong>и</strong>тал<strong>и</strong> достоверным<strong>и</strong> пр<strong>и</strong> р < 0,05. Расчетотношен<strong>и</strong>я шансов [odds ratio (OR)] провод<strong>и</strong>л<strong>и</strong>по формуле OR = (a/b) / (c/d), где a – кол<strong>и</strong>честводетей II группы, <strong>и</strong>меющ<strong>и</strong>х <strong>и</strong>зучаемый аллель <strong>и</strong>л<strong>и</strong>генот<strong>и</strong>п; b – кол<strong>и</strong>чество детей II группы без данногоаллеля <strong>и</strong>л<strong>и</strong> генот<strong>и</strong>па; c – кол<strong>и</strong>чество детей I группы,<strong>и</strong>меющ<strong>и</strong>х <strong>и</strong>зучаемый аллель <strong>и</strong>л<strong>и</strong> генот<strong>и</strong>п; d –кол<strong>и</strong>чество детей I группы без данного аллеля <strong>и</strong>л<strong>и</strong>генот<strong>и</strong>па. Для каждого значен<strong>и</strong>я OR рассч<strong>и</strong>тывал<strong>и</strong>вел<strong>и</strong>ч<strong>и</strong>ну 95 % довер<strong>и</strong>тельного <strong>и</strong>нтервала (CI 95%)[12].РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕПоказател<strong>и</strong>,характер<strong>и</strong>зующ<strong>и</strong>евозраст детейв группе (лет)Mo333333Пр<strong>и</strong>мечан<strong>и</strong>е: Min, Max - м<strong>и</strong>н<strong>и</strong>мальное <strong>и</strong> макс<strong>и</strong>мальное значен<strong>и</strong>явозраста; Me - значен<strong>и</strong>е мед<strong>и</strong>аны; Mo - значен<strong>и</strong>е моды.Max666666Сред<strong>и</strong> обследованных детей, как со здоровым<strong>и</strong>зубам<strong>и</strong>, так <strong>и</strong> пораженных кар<strong>и</strong>есом, преобладающ<strong>и</strong>маллелем маркера rs12640848 являлся вар<strong>и</strong>ант G, чтохарактерно для европео<strong>и</strong>дных популяц<strong>и</strong>й (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP) (табл. 2). Час-Сведен<strong>и</strong>я об авторах:ВОЛКОВ Алексей Н<strong>и</strong>колаев<strong>и</strong>ч, канд. б<strong>и</strong>ол. наук, доцент, ЦНИЛ, ГБОУ ВПО КемГМА М<strong>и</strong>нздравсоцразв<strong>и</strong>т<strong>и</strong>я Росс<strong>и</strong><strong>и</strong>, г. Кемерово, Росс<strong>и</strong>я.E-mail: volkov_alex@rambler.ruЛОШАКОВА Лар<strong>и</strong>са Юрьевна, канд. мед. наук, доцент, зав. ЦНИЛ, ГБОУ ВПО КемГМА М<strong>и</strong>нздравсоцразв<strong>и</strong>т<strong>и</strong>я Росс<strong>и</strong><strong>и</strong>, г. Кемерово, Росс<strong>и</strong>я.СУХИХ Андрей Сергеев<strong>и</strong>ч, канд. фарм. наук, ст. науч. сотрудн<strong>и</strong>к, ЦНИЛ, ГБОУ ВПО КемГМА М<strong>и</strong>нздравсоцразв<strong>и</strong>т<strong>и</strong>я Росс<strong>и</strong><strong>и</strong>, г. Кемерово,Росс<strong>и</strong>я.ЕНИКЕЕВА Ас<strong>и</strong>я Дам<strong>и</strong>ровна, студентка, ГБОУ ВПО КемГУ М<strong>и</strong>нобрнаук<strong>и</strong> Росс<strong>и</strong><strong>и</strong>, г. Кемерово, Росс<strong>и</strong>я.БОНДАРЕВА Татьяна Юрьевна, детск<strong>и</strong>й врач-стоматолог, МБОУ «Детск<strong>и</strong>й дом № 2», г. Кемерово, Росс<strong>и</strong>я.T. 11 № 2 201243