Entwicklung von Strategien zur ... - KOPS - Universität Konstanz
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Abschlussbericht - <strong>Entwicklung</strong> <strong>von</strong> <strong>Strategien</strong> <strong>zur</strong> Feuerbrandbekämpfung im ökologischen Obstbau<br />
3.5 Quantifizierung des Feuerbranderregers auf Blüten<br />
Der Feuerbranderreger E. amylovora wurde in Blüten mit einer Real-Time PCR Methode gemes-<br />
sen. Die verwendeten Primer (Salm und Geider, 2004) binden an pEA29, ein E. amylovora spezifi-<br />
sches Plasmid. Alle Reaktionen wurden nach dem in Tabelle 3 gezeigten Schema angesetzt<br />
(Sickinger, 2008). Als Template wurde Blütenwaschwasser eingesetzt. Im Blütentestsystem wur-<br />
den je Wiederholung drei Blüten in Wasser abgewaschen, im Freilandversuch aus jeder Parzelle<br />
10 Blüten. Aus den nach der PCR-Reaktion erhaltenen ct-Werten wurde mit einer Standardgerade<br />
die Konzentration <strong>von</strong> E. amylovora in der Probe errechnet (Sickinger, 2008). Die Nachweisgren-<br />
ze der E. amylovora spezifischen Real-Time PCR lag bei einer Zelle je Reaktion. E. amylovora<br />
konnte also bis zu Konzentrationen <strong>von</strong> 200 Zellen/Blüte detektiert werden. Eine sichere Quantifi-<br />
zierung war ab 2.000 Zellen/Blüte möglich.<br />
Tabelle 3: Bestandteile eines Real-Time PCR Ansatzes zum Nachweis <strong>von</strong> E. amylovora<br />
Komponente Volumen (µl) Endkonzentration<br />
QuantiFast SYBR Green (2x) Qiagen 12,5 1x<br />
Primer p29TF (10µM) 1,25 0,5µM<br />
Primer p29TR (10µM) 1,25 0,5µM<br />
Template 10<br />
Gesamt 25<br />
3.6 Freilandversuche <strong>zur</strong> Feuerbrandbekämpfung<br />
3.6.1 Versuchsanlagen<br />
Abbildung 3:<br />
Versuchsanlage Karsee während der Apfelblüte<br />
2008.<br />
10