Pratique de Sas Windows ...9.3 Volume 2 - Ined

3.5 L’exemple d’ODS Graphics en « Survival Analysis »
Ce premier exemple vise à montrer la manière de raisonner en matière de nouveau graphique lié à une procédure
statistique. L’utilisateur de Sas consultera pour ce faire la documentation liée à la procédure dans un des deux
manuels suivants : «Base Sas 9.3 Procedures Guide: Statistical Procedures »
http://support.sas.com/documentation/cdl/en/procstat/63963/PDF/default/procstat.pdf et/ou
http://support.sas.com/documentation/onlinedoc/stat/indexproc.html#stat93 adresse où les procédures
statistiques de Sas existent en fichiers pdf autonomes ! Chaque chapitre de procédure contient maintenant des
informations sur les statgraphs possibles. Pour ce qui suit, l’aspect « recherche et interprétation» a été rédigé par
Gil Bellis.
3.5.1 Les données
Les données prises comme exemple, portent sur des patients atteints d’une maladie génétique létale, qui ont été
suivis de 1992 à 2010 et dont les décès ont été systématiquement enregistrés. On souhaite connaître la survie de
ces patients selon la cohorte de naissance et le sexe, en fonction de la durée d’observation et de la survenue des
décès ; les effectifs et les décès dans ces cohortes sont les suivants :
- naissances de 1992 à 1996 (en 2010 cette cohorte a pu être suivie pendant 19 ans au maximum) : femmes : 447
patientes, 32 décès ; hommes : 475 patients, 16 décès ;
- naissances de 1997 à 2001 (en 2010 cette cohorte a pu être suivie pendant 14 ans au maximum) : femmes : 471
patientes, 7 décès ; hommes : 482 patients, 11 décès.
Pour interpréter la survie dans ce type d’étude, on dispose d’une fonction de survie S(t) qui donne la probabilité,
quand on appartient à telle ou telle cohorte, de survivre au moins jusqu’à la date t. La fonction de survie est
représentée graphiquement par une courbe de survie ; la durée de survie est estimée par des paramètres de
position et de dispersion.
Avant la version 9.2, on était obligé de recourir à des programmes spécifiques pour produire un graphique
élémentaire de courbe de survie : c’est l’ancien Sas Graph basée sur une table sortie d’un lifetest
goptions reset=all ;
axis1 order=(0.85 to 1.0 by 0.05) label=(angle=90 'Probabilité de survie') ;
axis2 order=(0 to 19 by 1) minor=(number=1) label=('Durée') ;
legend1 label=none mode=protect
position=(bottom left inside) offset=(8 4) across=1 order=(0 1)
value=(tick=1 justify=L "1992-1996 F"
tick=2 justify=L "1992-1996 H"
tick=3 justify=L "1997-2001 F"
tick=4 justify=L "1997-2001 H") ;
symbol1 line=1 interpol=stepj ;symbol2 line=2 interpol=stepj ;
symbol3 line=3 interpol=stepj ;symbol4 line=4 interpol=stepj ;
proc gplot data=sortie_cohorte_sexe ;
plot survival * duree_vie = cohorte_sexe / vaxis=axis1 haxis=axis2 legend=legend1 ;
title 'Survie selon la cohorte de naissance et le sexe (méthode de Kaplan-Meier)' ;
run ;quit ;
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