You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
4<br />
Stine Kooyman<br />
kan vi lære mye om organismens respons på sykdommer, biol<strong>og</strong>isk<br />
virkemåte til grunnleggende prosesser i kroppen <strong>og</strong> skille mellom<br />
individer. Man kan <strong>og</strong>så lære mer om slektskap mellom arter gjennom<br />
studier av genetisk variasjon. Det finnes mange ulike metoder for å<br />
studere genetisk variasjon. Man kan sammenlikne hele DNA sekvensen til<br />
forskjellige individer, men dette er tidkrevende <strong>og</strong> dyrt. Inntil dette kan<br />
gjøres på en rask <strong>og</strong> billig måte benyttes en lang rekke analysemetoder.<br />
VNTR (Variable Number of Tandem Repeats)<br />
Korte DNA- sekvenser som er repetert flere ganger etter hverandre i<br />
tandem kalles VNTR. Om man da kutter med restriksjonsenzymer vil det<br />
gi fragmenter med ulik lengde avhengig av antall repetisjoner av VNTR.<br />
Dersom man behandler dette i en polyacrylamidgel vil man få ulike bånd<br />
alt ettersom hvor lange fragmentene blir, altså etter hvor mange repeterte<br />
sekvenser som er tilstede. VNTR- fragmentene kan <strong>og</strong>så analyseres ved<br />
hjelp av PCR. Primere vil feste seg på enkelte steder, <strong>og</strong> man vil få<br />
oppformert området mellom dem. Ved ulikt antall VNTR vil fragmentene<br />
få ulik lengde, noe som vil vises på en agarosegel (se figur 3 <strong>og</strong> 4).<br />
Dersom det repeterte elementet er veldig kort (200 eller færre baser)<br />
kalles VNTRen for en mikrosatellitt. Ingen vet akkurat hva disse<br />
segmentene gjør, men de kan ikke være så veldig viktige ettersom at de er<br />
ekstremt variable i lengde, <strong>og</strong> tilfeldig spredt rundt om i genomet. Ved å<br />
utføre PCR med et antall flankerende primere, kan et genetisk<br />
fingeravtrykk dannes, <strong>og</strong> gjøre det mulig å trekke konklusjoner om et<br />
individs identitet <strong>og</strong> genetisk forhold til andre individer, med stor<br />
sikkerhet (Dale,J . von Schantz, M. 2002). Det er først <strong>og</strong> fremst<br />
mikrosatellitter som brukes i denne oppgaven.