27.07.2013 Views

Forord - Skog og landskap

Forord - Skog og landskap

Forord - Skog og landskap

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

4<br />

Stine Kooyman<br />

kan vi lære mye om organismens respons på sykdommer, biol<strong>og</strong>isk<br />

virkemåte til grunnleggende prosesser i kroppen <strong>og</strong> skille mellom<br />

individer. Man kan <strong>og</strong>så lære mer om slektskap mellom arter gjennom<br />

studier av genetisk variasjon. Det finnes mange ulike metoder for å<br />

studere genetisk variasjon. Man kan sammenlikne hele DNA sekvensen til<br />

forskjellige individer, men dette er tidkrevende <strong>og</strong> dyrt. Inntil dette kan<br />

gjøres på en rask <strong>og</strong> billig måte benyttes en lang rekke analysemetoder.<br />

VNTR (Variable Number of Tandem Repeats)<br />

Korte DNA- sekvenser som er repetert flere ganger etter hverandre i<br />

tandem kalles VNTR. Om man da kutter med restriksjonsenzymer vil det<br />

gi fragmenter med ulik lengde avhengig av antall repetisjoner av VNTR.<br />

Dersom man behandler dette i en polyacrylamidgel vil man få ulike bånd<br />

alt ettersom hvor lange fragmentene blir, altså etter hvor mange repeterte<br />

sekvenser som er tilstede. VNTR- fragmentene kan <strong>og</strong>så analyseres ved<br />

hjelp av PCR. Primere vil feste seg på enkelte steder, <strong>og</strong> man vil få<br />

oppformert området mellom dem. Ved ulikt antall VNTR vil fragmentene<br />

få ulik lengde, noe som vil vises på en agarosegel (se figur 3 <strong>og</strong> 4).<br />

Dersom det repeterte elementet er veldig kort (200 eller færre baser)<br />

kalles VNTRen for en mikrosatellitt. Ingen vet akkurat hva disse<br />

segmentene gjør, men de kan ikke være så veldig viktige ettersom at de er<br />

ekstremt variable i lengde, <strong>og</strong> tilfeldig spredt rundt om i genomet. Ved å<br />

utføre PCR med et antall flankerende primere, kan et genetisk<br />

fingeravtrykk dannes, <strong>og</strong> gjøre det mulig å trekke konklusjoner om et<br />

individs identitet <strong>og</strong> genetisk forhold til andre individer, med stor<br />

sikkerhet (Dale,J . von Schantz, M. 2002). Det er først <strong>og</strong> fremst<br />

mikrosatellitter som brukes i denne oppgaven.

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!