You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Genetisk variasjon hos jordskokk<br />
16. Overførte løsningen, som inneholdt DNA, til et eppendorfrør.<br />
Passet på å merke røret godt.<br />
Beregning av DNA- utbytte<br />
For å få en idé om DNA- mengden ble det gjennomført en<br />
konsentrasjonsanalyse med et spektrofotometer av typen Helios gamma<br />
levert av Unicam. Spektrofotometeret ble innstilt på 260nm <strong>og</strong> 280nm.<br />
DNA- konsentrasjonen ble regnet ut ved: DNA-kons. i kyvetten (ug/ml) =<br />
Absorbansverdien fra 260 x 50 fordi en DNA-løsning med kons. 1 ug/ml<br />
gir absorbans 1 ved UV260. Så ble det ganget med grad av fortynning<br />
(35). DNAet ble fortynnet i vann 35x<br />
DNA 7 µl<br />
Destillert Vann 240 µl<br />
Valg av genetiske markører<br />
For å kjøre PCR trengs det primere som er komplementære til deler av<br />
DNA, slik at de kan feste seg. Vi brukte primere som fungerer i Solsikke,<br />
som er nært beslektet med jordskokk. Da ingen genetiske markører er<br />
funnet hos jordskokk, ønsket man å forsøke med markører fra solsikke.<br />
DNA- sekvenser hos nært beslektede arter er ofte veldig lik <strong>og</strong> det er<br />
demonstrert at genetiske markører isolert fra én art ofte kan benyttes til å<br />
studere genetisk variasjon hos andre, beslektede arter. Det måtte først<br />
plukkes ut et utvalg primere som forhåpentligvis skulle virke på<br />
jordskokk. Det ble valgt 6 primere som var listet i artikkelen S. Tang, S.J<br />
Knapp (2002): Microsatellites uncover extraordinary diversity in native<br />
American land races and wild populations of cultivated sunflower<br />
(primere fra genomisk DNA som er funnet å virke på en rekke<br />
angiospermarter), <strong>og</strong> 2 primere fra artikkelen Wills, D.M, Hester M. L<br />
13