27.07.2013 Views

Forord - Skog og landskap

Forord - Skog og landskap

Forord - Skog og landskap

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

Genetisk variasjon hos jordskokk<br />

16. Overførte løsningen, som inneholdt DNA, til et eppendorfrør.<br />

Passet på å merke røret godt.<br />

Beregning av DNA- utbytte<br />

For å få en idé om DNA- mengden ble det gjennomført en<br />

konsentrasjonsanalyse med et spektrofotometer av typen Helios gamma<br />

levert av Unicam. Spektrofotometeret ble innstilt på 260nm <strong>og</strong> 280nm.<br />

DNA- konsentrasjonen ble regnet ut ved: DNA-kons. i kyvetten (ug/ml) =<br />

Absorbansverdien fra 260 x 50 fordi en DNA-løsning med kons. 1 ug/ml<br />

gir absorbans 1 ved UV260. Så ble det ganget med grad av fortynning<br />

(35). DNAet ble fortynnet i vann 35x<br />

DNA 7 µl<br />

Destillert Vann 240 µl<br />

Valg av genetiske markører<br />

For å kjøre PCR trengs det primere som er komplementære til deler av<br />

DNA, slik at de kan feste seg. Vi brukte primere som fungerer i Solsikke,<br />

som er nært beslektet med jordskokk. Da ingen genetiske markører er<br />

funnet hos jordskokk, ønsket man å forsøke med markører fra solsikke.<br />

DNA- sekvenser hos nært beslektede arter er ofte veldig lik <strong>og</strong> det er<br />

demonstrert at genetiske markører isolert fra én art ofte kan benyttes til å<br />

studere genetisk variasjon hos andre, beslektede arter. Det måtte først<br />

plukkes ut et utvalg primere som forhåpentligvis skulle virke på<br />

jordskokk. Det ble valgt 6 primere som var listet i artikkelen S. Tang, S.J<br />

Knapp (2002): Microsatellites uncover extraordinary diversity in native<br />

American land races and wild populations of cultivated sunflower<br />

(primere fra genomisk DNA som er funnet å virke på en rekke<br />

angiospermarter), <strong>og</strong> 2 primere fra artikkelen Wills, D.M, Hester M. L<br />

13

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!