Forord - Skog og landskap

Genetisk variasjon hos jordskokk
Figur 6 a, b og c. Figuren viser resultatene fra analysen av PCR- produkt i 2%
agarosegel. Det første sporet på hver rekke er alltid størrelsesstandard. Tallene
over sporene markerer hvilken plante som er testet, og minustegnet markerer
negativ kontroll. Figur 5A viser resultatet av agarosegel med PCR- produkt med
markør II (ORS 310), III (ORS 311) og IV (ORS 317) på alle plantene. Figur 5B
viser resultater fra agarosegel med PCR- produkt med markør V(ORS 331), VI
(ORS 338) og VII (ORS 351) på alle plantene. Figur 5C viser resultatene fra
agarosegeltesting med av PCR- produkt med markør VIII(ccmp5) og
IX(NTCP39).
Fra figuren kan vi se at det ikke ble resultat på plante 37 og 38 på noen av
primerne. Det er da trolig at DNA- isoleringen har vært mislykket og dette
ble gjort på nytt. På resultatet fra markør II (ORS 310) kan man ikke se
bånd og det konkluderes med at primeren ikke har virket. Resultatene fra
markør III (ORS 311) og IV (ORS 317) er det klare bånd og vi
konkluderer med at primerne har virket. Båndene fra markør V(ORS 331)
er klare og tydelige og primerne har virket. Resultatene fra VI (ORS 338)
og VII (ORS 351) er noe mer uklare, uten at vi kan si hvorfor, men disse
forkastes ikke fordi det er interessant å se hva som blir resultatet av
analysen i 3130 Genetic Analyzer. Resultatene fra markør VIII(ccmp5) og
IX(NTCP39) er også klare og tydelige og primerne har virket. Med
utgangspunkt i disse resultatene ble markørene I(Kontroll L), III(ORS 311
A), IV(ORS 317 A), V(ORS 331 A), VI(ORS 351 A), VII(ORS 388 A),
VIII(ccmp5 Fwd) og IX(NTCP39 Fwd) bestilt på nytt, med 5’ merket
ende. Vi konkluderte med at markør II ikke fungerte, og forkastet denne.
Markør I, som er Kontrollmarkøren(I) brukt til positiv kontroll bestilte vi
også merket av, men den ble ikke testet i bildene vist over fordi den er
positiv på alle plantene(data ikke vist).
25