Podstawowe procedury laboratoryjne w ... - digicollection.or..
Podstawowe procedury laboratoryjne w ... - digicollection.or..
Podstawowe procedury laboratoryjne w ... - digicollection.or..
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
<strong>Podstawowe</strong> <strong>procedury</strong><br />
<strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong><br />
w bakteriologii klinicznej<br />
1
<strong>Podstawowe</strong><br />
<strong>procedury</strong><br />
<strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong><br />
w bakteriologii<br />
klinicznej<br />
3
Wydane przez W<strong>or</strong>ld Health Organization w 2003 r. pod tytułem ,,Basic Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y<br />
Procedures in Clinical Bacteriology’’, wydanie 2<br />
© W<strong>or</strong>ld Health Organization 2003<br />
© Copyright f<strong>or</strong> the Polish edition by Wydawnictwo Lekarskie PZWL, Warszawa 2005<br />
Dyrekt<strong>or</strong> Generalny W<strong>or</strong>ld Health Organization udzielił praw<br />
na wydanie w języku polskim Wydawnictwu Lekarskiemu PZWL,<br />
które jest całkowicie odpowiedzialne za polskie wydanie.<br />
Wszelkie prawa zastrzeżone.<br />
Przedruk i reprodukcja w jakiejkolwiek postaci<br />
całości bądź części książki<br />
bez pisemnej zgody wydawcy są zabronione.<br />
Redakt<strong>or</strong> ds. publikacji medycznych mgr Anna Plewa<br />
Redakt<strong>or</strong> mgr Alicja Pałkiewicz<br />
Redakt<strong>or</strong> techniczny Maria Karczewska<br />
K<strong>or</strong>ekta Zespół<br />
Projekt okładki i stron tytułowych Jolanta Krafft-Przeździecka<br />
Dawkowanie leków<br />
Aut<strong>or</strong>zy i Wydawnictwo dołożyli wszelkich starań, aby wybór i dawkowanie leków w tym<br />
opracowaniu były zgodne z aktualnymi wskazaniami i praktyką kliniczną. Mimo to, ze<br />
względu na stan wiedzy, zmiany regulacji prawnych i nieprzerwany napływ nowych<br />
wyników badań dotyczących podstawowych i niepożądanych działań leków, Czytelnik<br />
musi brać pod uwagę inf<strong>or</strong>macje zawarte w ulotce dołączonej do każdego opakowania, aby<br />
nie przeoczyć ewentualnych zmian we wskazaniach i dawkowaniu. Dotyczy to także<br />
specjalnych ostrzeżeń iśrodów ostrożności. Należy o tym pamiętać, zwłaszcza w przypadku<br />
nowych lub rzadko stosowanych substancji.<br />
ISBN 83-200-3133-8<br />
Wydanie I<br />
Wydawnictwo Lekarskie PZWL<br />
00-251 Warszawa, ul. Miodowa 10<br />
tel. (0-prefiks-22) 695-40-33<br />
Księgarnia wysyłkowa:<br />
tel. (0-prefiks-22) 695-44-80<br />
infolinia: 0 801-142-080<br />
www.pzwl.pl<br />
e-mail: promocja 0 pzwl.pl<br />
Skład i łamanie: EGRAF, Warszawa<br />
Druk i oprawa: Pabianickie Zakłady Graficzne S.A., Pabianice<br />
4
Przedmowa do polskiego wydania<br />
Pierwszym, podstawowym celem diagnostyki mikrobiologicznej jest identyfikacja<br />
czynnika etiologicznego zakażenia. Wskazanie drobnoustroju odpowiedzialnego<br />
za infekcję jest podstawą wyb<strong>or</strong>u sposobu leczenia, postępowania zmierzającego<br />
do ograniczenia jego rozprzestrzeniania się, a także oceny rokowania.<br />
Rozpoznanie danego mikro<strong>or</strong>ganizmu może być dokonane przez bakterioskopowe<br />
badanie próbki od pacjenta, hodowlę i identyfikację. Czynnik etiologiczny<br />
zakażenia można też identyfikować na podstawie obecności w próbkach<br />
antygenów, które wykrywa się za pomocą serologicznych metod diagnostycznych.<br />
Jeszcze inną drogą postępowania jest wykrywanie charakterystycznego dla<br />
drobnoustroju kwasu nukleinowego, do czego służą wprowadzone w ostatnich<br />
latach techniki molekularne. Pośrednio czynnik etiologiczny zakażenia może być<br />
rozpoznany na podstawie swoistych przeciwciał wytw<strong>or</strong>zonych w zakażonym<br />
<strong>or</strong>ganizmie. Odpowiednio dobrane antygeny i metody pozwalają na oznaczenie<br />
zarówno klas, jak i miana przeciwciał.<br />
Wybór metody diagnostycznej jest podyktowany wieloma względami, takimi jak:<br />
zdolność drobnoustrojów do wzrostu w warunkach in vitro i szybkość jego<br />
wzrostu, charakter zakażenia i jego przebieg, wyposażenie lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium, wykształcenie<br />
personelu, wreszcie możliwości finansowe. Prawidłowe wykonanie<br />
badania mikrobiologicznego, niezależnie od zastosowanej metody, wymaga<br />
postępowania według określonych szczegółowo procedur, które obejmują:<br />
pobranie i transp<strong>or</strong>t próbek, metodę przeprowadzenia badania w pracowni<br />
mikrobiologicznej, sposób opracowania, wydania i interpretacji wyniku. Wydane<br />
pod patronatem WHO ,,<strong>Podstawowe</strong> <strong>procedury</strong> <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong> w bakteriologii<br />
klinicznej’’ (Basic Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y Procedures in Clinical Bacteriology) to publikacja<br />
podsumowująca aktualne wytyczne w zakresie dob<strong>or</strong>u materiału w określonych<br />
zakażeniach i pobierania próbek, identyfikacji drobnoustrojów <strong>or</strong>az oznaczania<br />
lekoop<strong>or</strong>ności. Inf<strong>or</strong>macje w niej zawarte mają na celu ujednolicenie techniki<br />
badań mikrobiologicznych i podniesienie jakości usług lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych w krajach<br />
rozwijających się i tych, w których diagnostyka mikrobiologiczna nie jest dobrze<br />
z<strong>or</strong>ganizowana lub doceniana, na co wskazuje wysokie zużycie antybiotyków<br />
i szybko wzrastająca liczba szczepów wieloop<strong>or</strong>nych.<br />
Publikacji, którą mają Państwo przed sobą, nie można traktować jako zbi<strong>or</strong>u<br />
obowiązujących procedur, może ona jednak pomóc w tw<strong>or</strong>zeniu własnych<br />
procedur w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium mikrobiologicznym, być cennym źródłem nauki metod<br />
diagnostycznych, szczególnie prostych i tanich, szczegółowo w podręczniku<br />
opisanych. Niektóre metody diagnostyczne dotyczą ch<strong>or</strong>ób w Polsce nie spotykanych,<br />
np. cholera, wrzód miękki, mycetoma, jednak szybkie i częste przemieszczanie<br />
się ludzi ustawicznie grozi przemieszczaniem się drobnoustrojów, a łatwy<br />
dostęp domało popularnych w Polsce procedur diagnostycznych może pomóc<br />
w rozpoznaniu, a więc w zapobieganiu i rozpowszechnieniu się niekonwencjonalnego<br />
zakażenia. Niniejsza publikacja będzie z pewnością cennym podręcznikiem,<br />
szczególnie dla studentów analityki medycznej, wydziału lekarskiego i stomatologii,<br />
na rynku brak bowiem opracowania z zakresu diagnostyki mikrobiologicznej,<br />
której studenci uczą się na ćwiczeniach.<br />
Opisane w publikacji <strong>procedury</strong> nie uwzględniają komercyjnych metod badawczych<br />
opartych na aparatach i podłożach do monit<strong>or</strong>owanego posiewu krwi<br />
ipłynów ustrojowych, do przyspieszonej diagnostyki gruźlicy <strong>or</strong>az gotowych<br />
5
podłożach do przesiewowych półilościowych badań moczu. ,,<strong>Podstawowe</strong> <strong>procedury</strong><br />
<strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong> w bakteriologii klinicznej’’ zawierają opis metod identyfikacji<br />
i oznaczania lekowrażliwości drobnoustrojów opierających się na podłożach<br />
różnicujących i prostych testach wskaźnikowych, bez uwzględnienia metod<br />
półautomatycznych lub automatycznych. Metody oznaczania lekowrażliwości<br />
i identyfikacja nowych mechanizmów op<strong>or</strong>ności, ze względu na zmieniającą się<br />
sytuację epidemiologiczną, wymagają ciągłej modyfikacji i aktualizacji, stąd<br />
<strong>procedury</strong> opisane w podręczniku należy traktować jako ogólne, w praktyce<br />
opierając się przede wszystkim na rekomendacjach Krajowego Ośrodka Referencyjnego<br />
ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów.<br />
Podręcznik nie uwzględnia metod molekularnych i immunochemicznych w diagnozowaniu<br />
zakażeń. Zgodnie z tytułem przedstawione są rzeczywiście podstawowe<br />
<strong>procedury</strong> <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong> i warto podkreślić,że k<strong>or</strong>zyści dla mikrobiologa<br />
z takiego podejścia do diagnostyki są naprawdę duże. Szczególnie cenne jest<br />
przypomnienie, jak ważny jest i ile inf<strong>or</strong>macji może dostarczyć preparat<br />
bezpośredni: można nauczyć się oszczędności, liczyć czas badania. Cenną częścią<br />
podręcznika jest podkreślanie w każdym z rozdziałów konieczności kontroli<br />
wewnątrz- i zewnątrzlab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych procedur <strong>or</strong>az kontroli sprzętu i testów.<br />
Podsumowując, przedstawiona publikacja może być pomocna w opracowaniu<br />
i wdrożeniu tańszych, a jednocześnie rzetelnych metod diagnostyki mikrobiologicznej.<br />
Prof. dr hab. med. Anna Przondo-M<strong>or</strong>darska<br />
6
Spis treści<br />
Wstęp ................................................ 10<br />
Wprowadzenie .......................................... 11<br />
Zapewnienie jakości badań bakteriologicznych ................. 12<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12<br />
Definicje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12<br />
Wewnętrzna kontrola jakości ............................... 16<br />
Zewnętrzna kontrola jakości ............................... 27<br />
CZE˛ŚĆ I. BADANIA BAKTERIOLOGICZNE ..................... 29<br />
Krew ................................................. 30<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30<br />
Kiedy i u kogo może wysta˛pić bakteriemia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30<br />
Pobieranie próbek krwi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31<br />
Podłoża do posiewu krwi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32<br />
Prowadzenie hodowli z krwi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33<br />
Płyn mózgowo-rdzeniowy ................................. 36<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36<br />
Pobieranie i transp<strong>or</strong>t próbek .............................. 36<br />
Ocena makroskopowa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37<br />
Badanie mikroskopowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37<br />
Wstępna identyfikacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39<br />
Oznaczanie lekowrażliwości ............................... 40<br />
Mocz ................................................. 41<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41<br />
Pobieranie materiału do badania . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41<br />
Hodowla i interpretacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43<br />
Interpretacja wyników posiewu ilościowego moczu . . . . . . . . . . . . . . . 46<br />
Identyfikacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47<br />
Oznaczanie lekowrażliwości ............................... 47<br />
Kał ................................................... 48<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48<br />
Czynniki etiologiczne i objawy kliniczne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48<br />
Właściwe ukierunkowanie diagnostyki <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j . . . . . . . . . . . . . . 50<br />
Pobieranie i przesyłanie próbek kału . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51<br />
Badanie wizualne próbek kału . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52<br />
Podłoża transp<strong>or</strong>towo-wzbogacaja˛ce i posiew próbek kału . . . . . . . . . 53<br />
Podłoża do hodowli patogenów jelitowych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53<br />
Wstępna izolacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54<br />
Wstępna identyfikacja izolowanych szczepów ................... 56<br />
Końcowa identyfikacja mikrobiologiczna . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62<br />
Identyfikacja serologiczna . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67<br />
7
SPIS TREŚCI<br />
Zakażenia górnych dróg oddechowych ....................... 73<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73<br />
Fl<strong>or</strong>a fizjologiczna gardła ................................. 73<br />
Bakteryjne czynniki zapalenia gardła ......................... 74<br />
Pobieranie i przesyłanie próbek ............................. 75<br />
Mikroskopia bezpośrednia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76<br />
Hodowla i identyfikacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76<br />
Badanie lekowrażliwości .................................. 78<br />
Zakażenia dolnych dróg oddechowych ....................... 79<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79<br />
Najczęstsze postacie kliniczne zakażeń ....................... 79<br />
Pobieranie próbek plwociny . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81<br />
Opracowanie plwociny w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
(w zakażeniach niegruźliczych) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81<br />
Hodowla Mycobacterium tuberculosis ........................ 85<br />
Interpretacja hodowli M. tuberculosis ......................... 88<br />
<strong>Podstawowe</strong> zasady bezpieczeństwa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88<br />
Ch<strong>or</strong>oby przenoszone droga˛ kontaktów seksualnych ............ 89<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89<br />
Zapalenie cewki moczowej u mężczyzn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90<br />
Próbki z żeńskich narza˛dów płciowych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93<br />
Próbki z owrzodzeń narza˛dów płciowych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96<br />
Ropne wydzieliny, rany i ropnie ............................ 100<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100<br />
Postacie kliniczne i najczęstsze czynniki etiologiczne . . . . . . . . . . . . . 100<br />
Pobieranie i transp<strong>or</strong>t próbek .............................. 103<br />
Ocena makroskopowa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104<br />
Badanie mikroskopowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105<br />
Hodowla . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107<br />
Identyfikacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108<br />
Badanie lekowrażliwości .................................. 112<br />
Zakażenia bakteriami beztlenowymi .......................... 113<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113<br />
Podział bakterii ze względu na wymagania tlenowe . . . . . . . . . . . . . . 113<br />
Diagnostyka zakażeń bakteriami beztlenowymi . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114<br />
Oznaczanie wrażliwości na antybiotyki ....................... 119<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119<br />
<strong>Podstawowe</strong> zasady oznaczania lekowrażliwości ................ 119<br />
Kliniczna definicja terminów ,,op<strong>or</strong>ny’’ i ,,wrażliwy’’ ............... 120<br />
Wskazania do rutynowego oznaczania lekowrażliwości ............ 122<br />
Wybór leków do oznaczania lekowrażliwości<br />
w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach klinicznych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123<br />
Zmodyfikowana metoda Kirby-Bauera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125<br />
Bezpośrednie a pośrednie oznaczanie lekowrażliwości ............ 133<br />
Czynniki techniczne wpływaja˛ce na wielkość<br />
strefy zahamowania w metodzie dyfuzyjno-kra˛żkowej . . . . . . . . . . . 134<br />
Kontrola jakości ........................................ 136<br />
8
SPIS TREŚCI<br />
Badania serologiczne .................................... 138<br />
Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138<br />
Metody kontroli jakości ................................... 138<br />
Reakcje serologiczne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 141<br />
Odczyny serologiczne w diagnostyce kiły ...................... 142<br />
Wykrywanie aglutynin w g<strong>or</strong>a˛czce . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150<br />
Odczyn ASO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152<br />
Wykrywanie antygenów bakteryjnych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155<br />
CZE˛ŚĆ II. NAJWAŻNIEJSZE PODŁOŻA I ODCZYNNIKI ........... 157<br />
Wprowadzenie .......................................... 158<br />
Patogeny, podłoża i odczynniki diagnostyczne ................. 159<br />
Krew . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 160<br />
Płyn mózgowo-rdzeniowy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 161<br />
Mocz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 161<br />
Kał ................................................. 162<br />
Górne drogi oddechowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 164<br />
Dolne drogi oddechowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 165<br />
Próbki z układu moczowo-płciowego do diagnostyki ch<strong>or</strong>ób<br />
przenoszonych droga˛ kontaktów seksualnych . . . . . . . . . . . . . . . . . 165<br />
Ropa i wysięki ......................................... 166<br />
Lista rekomendowanych podłoży i odczynników diagnostycznych dla<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów mikrobiologicznych o średnim poziomie referencyjności 167<br />
Wybrana literatura uzupełniaja˛ca ............................ 171<br />
Sk<strong>or</strong>owidz ............................................. 172<br />
9
Wstęp<br />
Ch<strong>or</strong>oby zakaźne są najczęstszą przyczyną zgonów w krajach rozwijających się,<br />
ich diagnozowanie i leczenie stanowi ważne wyzwanie dla służby zdrowia.<br />
Światowa Organizacja Zdrowia (WHO, W<strong>or</strong>ld Health Organization) od wielu lat<br />
wspiera rozwój i wprowadzanie standardowych technik w diagnostyce <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j.<br />
Pierwszy program pod patronatem WHO z 1960 roku dotyczył standaryzacji<br />
oznaczania lekowrażliwość patogenów bakteryjnych. W 1976 roku 1<br />
WHO Expert Committee on Biological Standardization wskazał na konieczność<br />
stosowania metody dyfuzyjno-krążkowej w oznaczaniu wrażliwości na antybiotyki<br />
2 .<br />
Równocześnie podjęto działania w celu wprowadzenia kontroli jakości badań<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych. W 1981 roku WHO ustanowiła Międzynarodowy Program<br />
Kontroli Jakości Badań Mikrobiologicznych. Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia, które uczestniczą<br />
w programie, mogą pełnić przewodnią rolę we wprowadzaniu kontroli jakości<br />
badań w skali kraju na wszystkich poziomach systemu usług medycznych.<br />
Publikacja, którą mają Państwo przed sobą, jest podsumowaniem aktualnych<br />
wytycznych WHO, dotyczących pobierania próbek do badań lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych,<br />
identyfikacji drobnoustrojów <strong>or</strong>az oznaczania lekoop<strong>or</strong>ności. Wprowadzenie do<br />
praktyki <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j inf<strong>or</strong>macji zawartych w podręczniku ma na celu ujednolicenie<br />
techniki badań mikrobiologicznych i oceny lekowrażliwości <strong>or</strong>az<br />
podniesienie jakości usług lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych, zarówno na poziomie centralnym, jak<br />
iśrednim. Podręcznik koncentruje się raczej na procedurach niż na podstawowych<br />
technikach mikroskopowania i barwienia, które zostały opisane szczegółowo<br />
w innych publikacjach WHO 3 .<br />
1<br />
The public health aspects of antibiotics in feedstuffs. Rep<strong>or</strong>t on a W<strong>or</strong>king Group, Bremen,<br />
1–5 October 1973. Copenhagen, WHO Regional Office f<strong>or</strong> Europe, 1973 (document no. EURO 3604<br />
(2)).<br />
2<br />
WHO Expert Committee on Biological Standardization. Twenty-eight rep<strong>or</strong>t. Geneva, W<strong>or</strong>ld Health<br />
Organization, 1977 (WHO Technical Rep<strong>or</strong>t Series, No. 610).<br />
3<br />
Manual of basic techniques f<strong>or</strong> a health lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y, 2 nd ed. Geneva, W<strong>or</strong>ld Health Organization,<br />
2003.<br />
10
Wprowadzenie<br />
Koszty związane z ch<strong>or</strong>obami zakaźnymi wciąż stanowią nieprop<strong>or</strong>cjonalnie duże<br />
obciążenie dla budżetu zdrowia w krajach rozwijających się. Według Światowego<br />
Rap<strong>or</strong>tu Zdrowia (The w<strong>or</strong>ld health rep<strong>or</strong>t) 1 ostra biegunka jest przyczyną<br />
2,2 milionów zgonów rocznie. Ostre infekcje układu oddechowego (głównie<br />
zapalenie płuc) są kolejną ważną przyczyną śmiertelności, odpowiedzialną za<br />
około 4 miliony zgonów rocznie. Analiza dostępnych danych wskazuje, że<br />
w krajach rozwijających się patogenami wywołującymi zapalenie płuc w dzieciństwie<br />
są częściej niż wirusy, takie bakterie, jak Haemophilus influenzae<br />
i Streptococcus pneumoniae. Wróżnych regionach świata pojawiły się szczepy<br />
H. influenzae wytwarzające β-laktamazy i S. pneumoniae o zmniejszonej wrażliwości<br />
na benzylopenicylinę, sprawiając, że nadzór nad tymi patogenami jest<br />
c<strong>or</strong>az bardziej istotny.<br />
Ch<strong>or</strong>oby przenoszone drogą kontaktów seksualnych są c<strong>or</strong>az częstsze. W konsekwencji<br />
niewystarczającego nadz<strong>or</strong>u epidemiologicznego i niedostatecznych<br />
działań profilaktycznych aktualne są wciąż zagrożenia epidemią lub pandemią,<br />
wywołaną czynnikami bakteryjnymi lub wirusowymi. Dla skutecznej kontroli<br />
i profilaktyki ch<strong>or</strong>ób zakaźnych konieczny jest rozwój prostych narzędzi nadz<strong>or</strong>u<br />
epidemiologicznego i monit<strong>or</strong>owania ch<strong>or</strong>oby <strong>or</strong>az prostych i czułych metod<br />
diagnostycznych.<br />
Aby sprostać wyzwaniom w wyżej opisanej sytuacji, system usług lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych<br />
musi być oparty na współpracy sieci lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów wykonujących diagnostykę<br />
mikrobiologiczną dla centrów medycznych, lekarzy klinicystów i epidemiologów.<br />
Złożoność zadań powinna wzrastać prop<strong>or</strong>cjonalnie: od podstawowych,<br />
poprzez średnie, do centralnych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów (zależnie od poziomu referencyjności<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium — przyp. tłum.). Tylko w ten sposób możliwe będzie dostatecznie<br />
szybkie zebranie istotnych inf<strong>or</strong>macji, które usprawnią nadzór, umożliwią<br />
wczesną diagnostykę epidemii lub nietypowych zakażeń <strong>or</strong>az rozwój, zastosowanie<br />
i ocenę określonych środków interwencji.<br />
1<br />
The w<strong>or</strong>ld health rep<strong>or</strong>t 2000, Geneva, W<strong>or</strong>ld Health Organization, 2000.<br />
11
Zapewnienie jakości badań<br />
bakteriologicznych<br />
Wprowadzenie<br />
Programy zapewniania jakości są skutecznym sposobem zagwarantowania<br />
standardówusług diagnostyki <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j i podnoszenia tych standardów, jeśli<br />
zachodzi potrzeba. W mikrobiologii pojęcie jakości wykracza poza zagadnienia<br />
techniczne, dotycząc szybkości, kosztów <strong>or</strong>az przydatności klinicznej testu. Testy<br />
<strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong> są stosunkowo drogie i wraz z postępem medycyny prop<strong>or</strong>cjonalnie<br />
zwiększają obciążenie budżetu służby zdrowia.<br />
Definicje<br />
Cechą testu dobrej jakości jest jego wartość kliniczna, np.: w profilaktyce<br />
i leczeniu ch<strong>or</strong>oby. Inne cechy jakości testu, to:<br />
• Niezawodność: Czy wynik jest wiarygodny?<br />
• Powtarzalność: Czy otrzymamy taki sam wynik w powtórnym badaniu?<br />
• Szybkość: Czy test jest wystarczająco szybki, aby był użyteczny dla lekarza<br />
zalecającego leczenie?<br />
• Współczynnik koszt–k<strong>or</strong>zyść: Czy koszt badania jest prop<strong>or</strong>cjonalny do k<strong>or</strong>zyści<br />
dla pacjenta i społeczeństwa?<br />
Czynniki wpływaja˛ce na wiarygodność<br />
i powtarzalność wyników lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych<br />
Przyczyny błędów:<br />
• Personel. Wyniki pracy personelu lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium pozostają wścisłym związku<br />
ze stopniem edukacji i dokształcaniem, doświadczeniem <strong>or</strong>az warunkami<br />
zatrudnienia.<br />
• Czynniki środowiskowe. Na wyniki mogą wpływać: warunki przestrzenne,<br />
oświetlenie, wentylacja, temperatura, nadmierny poziom hałasu, niebezpieczne<br />
warunki pracy.<br />
• Materiał do badań. Sposób i czas pobrania materiału do badań <strong>or</strong>az pochodzenie<br />
próbki, często pozostające poza kontrolą lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium, mają bezpośredni<br />
związek z możliwością uzyskania wiarygodnych wyników. Czynnikami,<br />
wpływającymi na jakość wyników, które pozostają pod kontrolą lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium,<br />
są: transp<strong>or</strong>t, przechowywanie, przygotowanie próbek do badania <strong>or</strong>az identyfikacja.<br />
Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium pełni funkcję edukacyjną wobec osób odpowiedzialnych<br />
za pobieranie i transp<strong>or</strong>t próbek. Pisemne instrukcje powinny być<br />
przygotowane w przystępny sposób i regularnie omawiane z klinicystami<br />
i pielęgniarkami.<br />
• Materiały <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>. Jakość odczynników, chemikaliów, szklanych naczyń,<br />
barwników, podłoży do hodowli <strong>or</strong>az zwierząt lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych wpływa<br />
na wiarygodność wyników badań.<br />
• Metody badań. Niektóre metody są bardziej wiarygodne niż inne.<br />
• Sprzęt. Brak sprzętu, niewystarczające lub niezgodne ze standardem wyposażenie<br />
są przyczyną uzyskiwania niewiarygodnych wyników.<br />
12
PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ<br />
• Badanie i odczyt. Pospieszne odczytywanie wyników lub brak badania<br />
wystarczającej liczby pól mikroskopowych mogą być powodem błędów.<br />
• Sprawozdanie. Błędy w przepisywaniu lub niekompletne opisy wyników.<br />
Jakość interpretacji wyników badań<br />
W mikrobiologii szczególnie ważna jest interpretacja wyników. Na każdym etapie<br />
badania próbki rezultaty powinny być interpretowane w celu wyb<strong>or</strong>u, do<br />
kolejnego etapu badania, testu optymalnego pod względem szybkości i wiarygodności.<br />
Zapewnienie jakości w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
mikrobiologicznym<br />
Zapewnienie jakości jest sumą działań, w które zaangażowane jest lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium,<br />
aby zapewnić dobrą jakość wyników. Działania te muszą być:<br />
– kompletne: aby zapewnić kontrolę na każdym etapie procesu — od pobrania<br />
próbki do przedstawienia końcowego wyniku lekarzowi (ryc. 1);<br />
– racjonalne: aby skoncentrować się na najbardziej krytycznych etapach procesu;<br />
– regularne: aby zapewnić stałą kontrolę procedur;<br />
– częste: aby szybko wykryć i sk<strong>or</strong>ygować błędy.<br />
DOBRA JAKOŚĆ BADAŃ LABORATORYJNYCH<br />
TO DOBRA JAKOŚĆ MEDYCYNY<br />
Zapewnienie jakości pozwala na możliwie oszczędne stosowanie drogich testów;<br />
określa także zasadność i wartościowość nowych testów, podnosi jakość usług<br />
szpitalnych i pozaszpitalnych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów <strong>or</strong>az zapewnia p<strong>or</strong>ównywalność<br />
otrzymanych wyników niezależnie od miejsca ich wykonania.<br />
Rodzaje gwarancji jakości<br />
Istnieją dwa rodzaje gwarancji jakości: wewnętrzna i zewnętrzna.<br />
• Wewnętrzna. Tak zwana KONTROLA JAKOŚCI. Każde lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium ma<br />
system sprawdzania jakości wykonywanych przez siebie testów.<br />
Na wewnętrzną kontrolę jakości składają się:<br />
– cia˛gły monit<strong>or</strong>ing jakości testów;<br />
– pełne sprawdzanie wszystkich etapów diagnostyki: od pobrania próbki do<br />
badania (jeśli jest to możliwe) do odesłania końcowego wyniku.<br />
Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia mają etyczną odpowiedzialność wobec pacjenta za przedstawienie<br />
dokładnych i przydatnych wyników.<br />
WEWNE˛TRZNA KONTROLA JAKOŚCI JEST NIEZBE˛DNA<br />
DLA PRAWIDŁOWEGO FUNKCJONOWANIA PROCEDURY<br />
13
ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH<br />
PACJENT Z INFEKCJA˛<br />
Przechowywanie<br />
▲<br />
Pobieranie<br />
materiału<br />
10<br />
▼<br />
Próbka,<br />
dane kliniczne<br />
Transp<strong>or</strong>t, oznaczanie<br />
▼<br />
Ocena makroskopowa, zapach<br />
▼<br />
Mikroskopia, interpretacja<br />
▼<br />
WYNIK WSTE˛PNY<br />
przekazany lekarzowi<br />
▼<br />
▼<br />
Hodowla: wybór podłoża, temperatury, atmosfery<br />
▼<br />
Izolacja czystych kolonii, antybiogram<br />
▼<br />
Identyfikacja, interpretacja<br />
(zanieczyszczenie, komensal lub patogen)<br />
Ryc. 1. Etapy diagnostyki mikrobiologicznej zakażenia u pacjenta.<br />
WYNIK KOŃCOWY<br />
przekazany lekarzowi<br />
• Zewnętrzna. Tak zwana OCENA JAKOŚCI. Wyniki działalności lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
kontrolowane są przez zewnętrzną instytucję. W niektórych krajach podleganie<br />
zewnętrznej ocenie jakości jest obowiązkowe (regulacje rządowe) i wymagane<br />
do uzyskania licencji.<br />
Na zewnętrzną ocenę jakości składają się:<br />
– okresowy monit<strong>or</strong>ing jakości testów;<br />
– wybiórcza kontrola procesu identyfikacji i niekiedy technik izolacji.<br />
▼<br />
WHO 90960<br />
Kryteria jakości w mikrobiologii<br />
Przydatność kliniczna<br />
Ważnym kryterium jakości badania mikrobiologicznego jest jego przydatność<br />
w zapobieganiu i leczeniu ch<strong>or</strong>ób zakaźnych; jest to tak zwana przydatność<br />
kliniczna. Warunkiem koniecznym do uzyskania pożądanego efektu klinicznego<br />
jest współpraca między lekarzem i lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
Poniższe przykłady obrazują przydatność kliniczną:<br />
1. Izolacja kilku kolonii Gram-ujemnych pałeczek z plwociny lub z wymazu<br />
z gardła hospitalizowanego pacjenta <strong>or</strong>az identyfikacja drobnoustrojów z antybiogramem<br />
nie mają żadnego znaczenia klinicznego, ponieważ żadna z tych<br />
procedur nie wpłynie na podjęte leczenie.<br />
2. W przypadku izolacji Streptococcus pyogenes wykonanie pełnego antybiogramu<br />
nie ma znaczenia klinicznego, ponieważ benzylopenicylina jest lekiem<br />
z wyb<strong>or</strong>u, zawsze aktywnym in vitro.<br />
3. W przypadku izolacji Escherichia coli u pacjenta z biegunką bez domieszki<br />
krwi, identyfikacja serotypu nie jest klinicznie przydatna, jeśli nie można<br />
wykazać związku między serotypem a ch<strong>or</strong>obotwórczością.<br />
4. Rutynowa identyfikacja mieszanej fl<strong>or</strong>y beztlenowej widocznej w preparacie<br />
barwionym metodą Grama nie ma znaczenia klinicznego. Jest czasochłonna,<br />
droga i nie wpłynie na leczenie pacjenta.<br />
5. Jeśli z próbek pobranych z dróg oddechowych zostaną wyizolowane grzyby,<br />
celowe jest wykonanie testu identyfikującego Cryptococcus. Dalsza iden-<br />
14
PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ<br />
tyfikacja nie ma znaczenia klinicznego, ponieważ nie wpłynie na sposób<br />
leczenia pacjenta.<br />
Podsumowując, badanie dobrej jakości to takie, które jest dokładne i dostarcza<br />
inf<strong>or</strong>macji użytecznych w zapobieganiu i leczeniu ch<strong>or</strong>ób zakaźnych. Izolacja<br />
i identyfikacja wszystkich mikro<strong>or</strong>ganizmów w próbce nie jest konieczna.<br />
Wiarygodność<br />
Dla badań ilościowych wiarygodność badania jest mierzona przez p<strong>or</strong>ównanie<br />
otrzymanych wyników z rzeczywistą wartością. Poniżej przedstawiono przykłady<br />
badań tego typu:<br />
– określanie stężenia antybiotyków w surowicy;<br />
– pomiar wartości minimalnego stężenia hamującego (MIC) antybiotyków<br />
in vitro;<br />
– określanie miana przeciwciał w surowicy.<br />
Dla badań jakościowych wiarygodność badania określana jest przez ocenę<br />
zgodności wyniku ze stanem rzeczywistym. Poniżej przedstawiono przykłady<br />
opisanych badań:<br />
– identyfikacja patogenów;<br />
– oznaczanie wrażliwości izolatów na antybiotyki metodą dyfuzji krążkowej.<br />
Konieczne jest stosowanie standardowej terminologii. Zawsze należy używać<br />
międzynarodowych nazw drobnoustrojów, np.: Staphylococcus aureus, NIE<br />
,,patogenne gronkowce’’; Streptococcus pyogenes, NIE: ,,paci<strong>or</strong>kowce hemolizujące’’.<br />
Niezbędne jest stosowanie jednolitych, uznanych metod diagnostycznych. Oznaczanie<br />
lekowrażliwości metodą dyfuzji krążkowej powinno być wykonywane<br />
zgodnie z przyjętymi, międzynarodowymi standardami, na przykład zmodyfikowaną<br />
metodą Kirby-Bauera (str. 125).<br />
Powtarzalność<br />
Powtarzalność i precyzja wykonywanych badań ograniczone są przez dwa<br />
czynniki:<br />
1. Brak jedn<strong>or</strong>odności. Pojedyncza próbka pochodząca od pacjenta może<br />
zawierać więcej niż jeden drobnoustrój. Powtarzanie hodowli może więc<br />
prowadzić do izolacji różnych mikro<strong>or</strong>ganizmów.<br />
2. Brak stabilności. Wraz z upływem czasu mikro<strong>or</strong>ganizmy w próbce w różnym<br />
stopniu namnażają się lub giną. Powtarzanie hodowli może prowadzić do<br />
izolacji różnych drobnoustrojów. W związku z powyższym, w celu uzyskania<br />
większej dokładności, badania powinny być przeprowadzane jak najszybciej<br />
po pobraniu próbek.<br />
Skuteczność<br />
Skuteczność badań mikrobiologicznych jest to możliwość uzyskania właściwej<br />
diagnozy dotyczącej patogenu lub stanu patologicznego. Powyższa wartość<br />
oceniana jest według dwóch kateg<strong>or</strong>ii:<br />
15
ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH<br />
1. Czułość diagnostyczna.<br />
Czułość =<br />
ogólna liczba dodatnich wyników<br />
ogólna liczba zakażonych pacjentów<br />
Im większa czułość testu, tym mniejsza liczba fałszywie ujemnych wyników.<br />
Na przykład czułość agaru MacConkeya jest zbyt niska w odniesieniu do izolacji<br />
Salmonella typhi zkału. Ten ważny patogen jelitowy może zostać przeoczony<br />
z powodu nadmiernego wzrostu niepatogennych bakterii jelitowych.<br />
2. Swoistość diagnostyczna<br />
Swoistość =<br />
ogólna liczba ujemnych wyników<br />
ogólna liczba niezakażonych pacjentów<br />
Im większa swoistość testu, tym mniejsza liczba fałszywie dodatnich wyników.<br />
Przykłady:<br />
• Barwienie preparatów z plwociny metodą Ziehl-Neelsena jest wysoce<br />
swoiste w diagnostyce gruźlicy, ponieważ daje nieliczne fałszywie dodatnie<br />
wyniki.<br />
• Barwienie preparatów moczu metodą Ziehl-Neelsena jest dużo mniej<br />
swoiste, ponieważ daje wiele fałszywie dodatnich wyników (z powodu<br />
obecności atypowych prątków).<br />
• Test Widala ma bardzo niską swoistość w diagnostyce duru brzusznego,<br />
ponieważ krzyżowo reagujące przeciwciała, powstałe w przebiegu infekcji<br />
wywołanych pokrewnymi serotypami Salmonella, dają fałszywie dodatnie<br />
wyniki.<br />
Czułość i swoistość testu są ze sobą związane. Czułość testu może być wyższa<br />
kosztem zmniejszenia jego swoistości i vice versa. Obydwie wartości pozostają<br />
także w związku z częstością występowania danej ch<strong>or</strong>oby w badanej populacji.<br />
Wewnętrzna kontrola jakości<br />
Wymagania<br />
Program wewnętrznej kontroli jakości powinien być praktyczny, realny i ekonomiczny.<br />
Program wewnętrznej kontroli jakości nie powinien oceniać każdej <strong>procedury</strong>,<br />
odczynnika czy podłoża do hodowli każdego dnia pracy. Powinien oceniać<br />
procedurę, odczynniki czy podłoże do hodowli zgodnie z praktycznym schematem,<br />
uwzględniającym wpływ każdego elementu na jakość badania.<br />
Procedury<br />
Wewnętrzna kontrola jakości rozpoczyna się od właściwych działań lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
16
PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ<br />
Spis działań lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych<br />
Każde lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium powinno mieć wykaz działań, który obejmuje:<br />
– sprzątanie miejsca pracy,<br />
– zasady higieny osobistej,<br />
– zasady bezpieczeństwa,<br />
– wyznaczone poza obszarem lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium strefy socjalne i dla palących,<br />
– postępowanie ze skażonym materiałem i jego usuwanie,<br />
– odpowiednie szczepienia personelu, np. przeciw wirusowemu zapaleniu<br />
wątroby typu B,<br />
– dbałość o sprzęt,<br />
– pobieranie próbek na badania,<br />
– rejestrację próbek,<br />
– eliminację nieodpowiednich próbek,<br />
– postępowanie z próbką,<br />
– zapis wyników,<br />
– wydawanie wyników.<br />
Zawarte w spisie działania powinny być dokładnie realizowane, regularnie<br />
oceniane i aktualizowane.<br />
Dbałość o sprzęt<br />
Istotne znaczenie ma dbałość o wyposażenie lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. Badania wysokiej<br />
jakości nie mogą być wykonywane sprzętem niskiej jakości lub niewłaściwie<br />
utrzymanym.<br />
W tabeli 1 przedstawiono wykaz rutynowych działań, mających zapewnić<br />
właściwą dbałość o sprzęt. Zakres temperatur działającego urządzenia może być<br />
rejestrowany w f<strong>or</strong>mie przedstawionej na ryc. 2.<br />
Podłoża do hodowli<br />
Podłoża do hodowli mogą być przygotowywane ze składników podstawowych,<br />
z komercyjnie dostępnych podłoży sypkich lub zakupione w f<strong>or</strong>mie gotowej do<br />
użycia. Ze względów ekonomicznych, z uwagi na łatwość transp<strong>or</strong>tu i przechowywania<br />
<strong>or</strong>az wyższą jakość w p<strong>or</strong>ównaniu z podłożami przygotowanymi<br />
w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium, rekomendowane są komercyjnie dostępne podłoża sypkie. Dla<br />
uzyskania najlepszych wyników konieczne jest uwzględnienie uwag ujętych<br />
w poniższych punktach.<br />
Wybór podłoża<br />
Sprawnie działające lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium zaopatrzone jest w najmniejszy możliwy<br />
as<strong>or</strong>tyment podłoży zgodnych z profilem wykonywanych badań. Dobrym<br />
przykładem jest podłoże agarowe, które może być użyte jako baza do przygotowania<br />
agaru z krwią, agaru czekoladowego <strong>or</strong>az kilku innych selektywnych podłoży.<br />
Do izolacji patogennych Enterobacteriaceae zkału niezbędne jest jedno wysoce<br />
selektywne podłoże (agar Salmonella-Shigella lub agar z cytry-<br />
17
ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH<br />
nianem deoksycholanu) <strong>or</strong>az jedno mniej selektywne podłoże (agar MacConkeya).<br />
W celu identyfikacji Campylobacter spp. należy zastosować specjalne podłoże.<br />
Zamawianie i przechowywanie suchych podłoży<br />
1. Należy zamawiać ilość, która zostanie zużyta w ciągu 6 miesięcy lub<br />
maksymalnie w ciągu roku.<br />
2. Całość należy podzielić i umieścić w pojemnikach, których zawartość powinna<br />
zostać zużyta w ciągu 1–2 miesięcy.<br />
3. Szczelnie domknąć pokrywki pojemników. Suche podłoża abs<strong>or</strong>bują wilgoć<br />
z otoczenia. W wilgotnym klimacie należy uszczelnić zamknięcie pojemnika,<br />
używając parafiny woskowej (wypełnić przestrzeń między pokrywką i pojemnikiem<br />
roztopionym woskiem i poczekać do zastygnięcia).<br />
4. Zapisać datę zamknięcia na każdym pojemniku.<br />
5. Przechowywać w ciemnym, chłodnym, przewiewnym miejscu.<br />
6. Odwracać pojemnik tak, aby najpierw został zużyty starszy materiał.<br />
Tabela 1. Kontrola jakości sprzętu<br />
Anaerostat<br />
Sprzęt <strong>Podstawowe</strong> czynności Monit<strong>or</strong>owanie<br />
Cotygodniowe czyszczenie wnętrza pojemników.<br />
Reaktywacja katalizat<strong>or</strong>a po każdym cyklu<br />
(160°C, 2 h).<br />
Wymiana katalizat<strong>or</strong>a co 3 miesia˛ce<br />
Użycie paska wskaźnikowego z błękitem<br />
metylenowym w każdym cyklu.<br />
Odnotowanie czasu odbarwienia wskaźnika<br />
co tydzień<br />
Autoklaw Co miesia˛c czyszczenie i wymiana wody Sprawdzenie poziomu i uzupełnienie<br />
wody przed każdym cyklem.<br />
Zapis czasu i temperatury lub ciśnienia<br />
każdego cyklu.<br />
Cotygodniowy zapis wyniku testu z użyciem<br />
przetrwalników (przyp. tłum.:<br />
testy biologiczne)<br />
Wirówka<br />
Sterylizat<strong>or</strong> szkłana<br />
suche, g<strong>or</strong>a˛ce powietrze<br />
Przemywanie ścian wewnętrznych środkiem<br />
dezynfekcyjnym co tydzień <strong>or</strong>az<br />
po uszkodzeniu probówki lub rozlaniu<br />
zawartości<br />
Czyszczenie urza˛dzenia wewna˛trz co<br />
miesia˛c<br />
Cieplarka Czyszczenie ścianek wewnętrznych<br />
ipółek co miesia˛c<br />
Mikroskop<br />
Chłodziarka<br />
Łaźnia wodna<br />
Przecieranie soczewek szmatka˛ lub bibuła˛<br />
do soczewek po każdym dniu<br />
pracy<br />
Czyszczenie i smarowanie mechanizmu<br />
stolika co tydzień<br />
Przykrycie pokrowcem nie używanego<br />
urza˛dzenia<br />
Czyszczenie i rozmrażanie co 2 miesia˛ce<br />
i po każdym przerwaniu zasilania pra˛dem<br />
Przecieranie ścian wewnętrznych i wymiana<br />
wody co miesia˛c<br />
Zapis czasu i temperatury każdego<br />
cyklu<br />
Zapis temperatury na pocza˛tku każdego<br />
dnia pracy (zakres temp. 35<br />
± 1°C)<br />
Sprawdzenie ustawienia kondensat<strong>or</strong>a<br />
co miesia˛c<br />
Umieszczenie w pokrowcu z mikroskopem<br />
naczynia z błękitem krzemionkowym,<br />
w celu zapobiegania wzrostowi<br />
grzybów w wilgotnym środowisku<br />
Zapis temperatury każdego dnia rano<br />
(zakres temp.: 2 –8°C)<br />
Codzienne sprawdzanie poziomu wody<br />
Zapis temperatury pierwszego dnia każdego<br />
tygodnia (zakres temp.:<br />
55 –57°C)<br />
Przegla˛d<br />
techniczny<br />
i konserwacja<br />
Cotygodniowa<br />
kontrola uszczelek<br />
i szczelności<br />
zamknięcia<br />
Co 6 miesięcy<br />
Wymiana szczotek<br />
co rok<br />
Co 6 miesięcy<br />
Co 6 miesięcy<br />
Co rok<br />
Co 6 miesięcy<br />
Co 6 miesięcy<br />
18
PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ<br />
Temperatura<br />
Urza˛dzenie<br />
Pokój<br />
Odczytywać codziennie. Sprawdzić, czy odczytana wartość temperatury jest dopuszczalna.<br />
W przypadku nieprawidłowości zapisać temperaturę w rubryce.<br />
Data I II III IV V VI VII VIII IX X XI XII Data<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
1 1<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
2 2<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
3 3<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
4 4<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
5 5<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
6 6<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
7 7<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
8 8<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
9 9<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
10 10<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
11 11<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
12 12<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
13 13<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
14 14<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
15 15<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
16 16<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
17 17<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
18 18<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
19 19<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
20 20<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
21 21<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
22 22<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
23 23<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
24 24<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
25 25<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
26 26<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
27 27<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
28 28<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
29 29<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
30 30<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
31 31<br />
Ryc. 2. Zapisy temperatury działaja˛cych urza˛dzeń.<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
19
ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH<br />
7. Jeśli pojemnik został otwarty, zapisać datę jego otwarcia.<br />
8. Wyrzucić wszystkie suche podłoża, które ściemniały lub w których powstały<br />
zlepione grudki.<br />
9. Prowadzić rejestr przechowywanych podłoży.<br />
Przygotowanie podłoża<br />
1. Należy ściśle przestrzegać zaleceń producenta.<br />
2. Przygotować ilość, która zostanie zużyta przed upływem terminu przydatności<br />
(patrz poniżej).<br />
Tabela 2. Zestaw szczepów zalecanych w kontroli jakości a<br />
Gram-dodatnie ziarenkowce<br />
Enterococcus faecalis (ATCC 29212 lub<br />
33186)<br />
Staphylococcus aureus (ATCC 25923)<br />
Staphylococcus epidermidis<br />
Streptococcus agalactiae<br />
Streptococcus mitis<br />
Streptococcus pneumoniae<br />
Streptococcus pyogenes<br />
Gram-ujemne kwasoop<strong>or</strong>ne bakterie<br />
M<strong>or</strong>axella catarrhalis<br />
Haemophilus influenzae typ b<br />
β-laktamazoujemne<br />
β-laktamazododatnie<br />
Haemophilus parainfluenzae<br />
Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae<br />
Neisseria meningitidis<br />
Bakterie beztlenowe<br />
Bacteroides fragilis<br />
Clostridium perfringens<br />
Enterobacteriaceae<br />
Citrobacter freundii<br />
Enterobacter cloacae<br />
Escherichia coli (ATCC 25922)<br />
Klebsiella pneumoniae<br />
Proteus mirabilis<br />
Salmonella typhimurium<br />
Serratia marcescens<br />
Shigella flexneri<br />
Yersinia enterocolitica<br />
Inne Gram-ujemne pałeczki<br />
Acinetobacter lwoffi<br />
Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853)<br />
Vibrio cholerae (nie-01)<br />
Grzyby<br />
Candida albicans<br />
a<br />
Powinny zostać wybrane szczepy najbardziej odpowiadaja˛ce wymaganiom lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
Przechowywanie gotowych podłoży<br />
1. Ochrona przed światłem.<br />
2. Ochrona przed ciepłem. Podłoża zawierające krew, inne składniki <strong>or</strong>ganiczne<br />
lub antybiotyki powinny być przechowywane w chłodziarce.<br />
3. Termin przydatności gotowego podłoża, które jest przechowywane w niskiej<br />
temperaturze, w ciemnym miejscu, zależy od jego składu.<br />
Przeciętne terminy użyteczności:<br />
– probówki z bawełnianym k<strong>or</strong>kiem — 3 tygodnie;<br />
– probówki z nieszczelną nakładką — 2 tygodnie;<br />
– pojemniki z zakrętką — 3 miesiące;<br />
– płytki Petriego szczelnie zamknięte w plastikowych w<strong>or</strong>eczkach — 4 tygodnie.<br />
Kontrola jakości przygotowanych podłoży<br />
1. Oznaczenie pH. Wartość pH prawidłowo przygotowywanych sypkich podłoży<br />
nie musi być rutynowo sprawdzana. Podłoża przygotowywane ze składników<br />
20
PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ<br />
Tabela 3. Testy kontrolne dla powszechnie stosowanych podłoży<br />
Podłoże Inkubacja Organizm wskaźnikowy Oczekiwany wynik<br />
Agar z żółcia˛ i eskulina˛ 24 h Enterococcus faecalis Wzrost i zaczernienie<br />
Streptococcus α-hemolizuja˛cy Brak wzrostu<br />
Agar z krwia˛ 24 h, CO 2 Streptococcus pyogenes Wzrost i β-hemoliza<br />
S. pneumoniae Wzrost i α-hemoliza<br />
Agar czekoladowy 24 h, CO 2 Haemophilus influenzae Wzrost<br />
Dekarboksylaza (pokryta sterylnym<br />
olejem)<br />
– lizyny 48 h Shigella typhimurium Dodatni<br />
Shigella flexneri<br />
Ujemny<br />
– <strong>or</strong>nityny 48 h S. typhimurium Dodatni<br />
Klebsiella pneumoniae<br />
Ujemny<br />
Dihydrolaza<br />
– argininy 48 h S. typhimurium Dodatni<br />
Proteus mirabilis<br />
Ujemny<br />
Żelatynaza (szybki test) 24 h Escherichia coli Ujemny<br />
Serratia marcescens<br />
Dodatni<br />
Agar Kliglera (patrz Trójcukrowy agar<br />
żelazowy)<br />
Agar MacConkeya z fioletem krystalicznym<br />
24 h E. coli Czerwone kolonie<br />
P. mirabilis Bezbarwne kolonie (brak wzrostu<br />
mgławicowego)<br />
E. faecalis Brak wzrostu<br />
Bulion malonianowy 24 h E. coli Ujemny (kol<strong>or</strong> zielony)<br />
K. pneumoniae Dodatni (kol<strong>or</strong> niebieski)<br />
Agar z mannitolem 24 h Staphylococcus aureus Żółte kolonie<br />
Staphylococcus epidermidis Różowe kolonie<br />
E. coli Brak wzrostu<br />
Czerwień metylowa/Voges-Proskauer 48 h E. coli Dodatni/ujemny<br />
K. pneumoniae Ujemny/dodatni<br />
Agar Mueller-Hintona 24 h E. coli ATCC 25922<br />
S. aureus ATCC 25923<br />
Pseudomonas aeruginosa ATCC<br />
27853<br />
Bulion azotanowy 24 h E. coli Dodatni<br />
Acinetobacter lwofii<br />
Ujemny<br />
Utlenianie/fermentacja dekstrozy (bez<br />
oleju)<br />
Akceptowane rozmiary strefy zahamowania<br />
(tab. 24, str. 126)<br />
24 h P. aeruginosa Utlenianie na powierzchni<br />
A. lwofii Brak reakcji<br />
Woda peptonowa (indol) 24 h E. coli Dodatni<br />
K. pneumoniae Ujemny<br />
Deaminaza fenyloalaniny/chl<strong>or</strong>ek żelaza<br />
Salmonella-Shigella agar lub agar z cytrynianem<br />
deoksycholanu<br />
24 h E. coli Ujemny<br />
P. mirabilis Dodatni<br />
24 h E. coli Bez wzrostu<br />
S. typhimurium Bezbarwne kolonie<br />
Yersinia enterocolitica<br />
Bezbarwne kolonie<br />
S. flexneri Bezbarwne kolonie<br />
Bulion seleninowy 24 h S. typhimurium Wzrost po przesianiu<br />
E. coli Brak wzrostu po przesianiu<br />
Agar cytrynianowy Simmonsa (inkubacja<br />
z luźna˛ zakrętka˛)<br />
Agar z solami żółci i cytrynianem tiosiarczanowym<br />
48 h E. coli Brak wzrostu<br />
K. pneumoniae Wzrost, kol<strong>or</strong> niebieski<br />
24 h Vibrio spp. (nieaglutynuja˛ce) Żółte kolonie<br />
Agar Thayer-Martina 24 h, CO 2 Neisseria meningitidis Wzrost<br />
Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae<br />
Wzrost<br />
Staphylococcus spp.<br />
Brak wzrostu<br />
E. coli Brak wzrostu<br />
C. albicans Brak wzrostu<br />
Bulion tioglikolanowy 24 h Bacteroides fragilis Wzrost<br />
21
ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH<br />
Tabela 3 cd.<br />
a<br />
Podłoże Inkubacja Organizm wskaźnikowy Oczekiwany wynik<br />
Trójcukrowy agar żelazowy (głębokość<br />
co najmniej 2,5 cm; inkubacja z luźna˛<br />
zakrętka˛)<br />
24 h Citrobacter freundii A/A gaz a +H 2 S<br />
S. typhimurium K/A gaz a +H 2 S<br />
S. flexneri K/A gaz a<br />
A. lwofii Brak reakcji<br />
Podłoże z mocznikiem 24 h E. coli Ujemny<br />
P. mirabilis Dodatni (różowy)<br />
Voges-Proskauer (patrz Czerwień metylowa/Voges-Proskauer)<br />
A/A: punkt kwaśny; K/A: punkt zasadowy.<br />
podstawowych należy wcześniej schłodzić. W przypadku stałych podłoży do<br />
oznaczenia pH należy użyć powierzchniowej elektrody lub rozmiękczyć<br />
podłoże w wodzie destylowanej. Jeśli pH różni się od zalecanego więcej niż<br />
o 0,2 jednostki, należy je sk<strong>or</strong>ygować kwasem lub zasadą, lub przygotować<br />
nową partię.<br />
2. Kontrola sterylności. Testy sterylności powinny być przeprowadzane rutynowo<br />
dla podłoży, do których po sterylizacji w autoklawie dodano krew lub inne<br />
składniki. 3–5% próbek należy poddać inkubacji w temperaturze 35°C przez<br />
2 dni. Pozostałe schłodzić. Jeśli na płytce pojawią się więcej niż dwie kolonie,<br />
należy odrzucić całą badaną partię.<br />
3. Kontrola jakości. Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium powinno mieć zapas zestawów szczepów<br />
wz<strong>or</strong>cowych do monit<strong>or</strong>owania jakości podłoży. Lista zalecanych szczepów<br />
wz<strong>or</strong>cowych została przedstawiona w tabeli 2. Szczepy te mogą być uzyskane<br />
w trakcie rutynowej pracy lub pochodzić z komercyjnych czy też oficjalnych<br />
źródeł. Rekomendacje dotyczące utrzymania i wyk<strong>or</strong>zystania szczepów<br />
wz<strong>or</strong>cowych opisane zostały na str. 24.<br />
Lista testów przeprowadzanych dla powszechnie używanych podłoży przedstawiona<br />
została w tabeli 3.<br />
Procedury postępowania przy ocenie jakości nowych partii podłoża:<br />
1. Przygotować lekko mętną zawiesinę szczepów kontrolnych, p<strong>or</strong>ównującjąze<br />
wz<strong>or</strong>cem standardowego roztw<strong>or</strong>u siarczanu baru używanego w zmodyfikowanej<br />
metodzie Kirby-Bauera (McFarland 0,5) (patrz str. 125) i użyć jedno<br />
oczko ezy jako inoculum.<br />
2. Inkubować przez rutynowo stosowany okres i odczytać zgodnie z przyjętymi<br />
zasadami.<br />
3. Właściwie zapisać wyniki.<br />
Barwniki i odczynniki<br />
Zalecenia dotyczące testowania niektórych odczynników przedstawiono w tabeli<br />
4. Testy powinny być przeprowadzane:<br />
– za każdym razem przy przygotowywaniu nowej partii roztw<strong>or</strong>u roboczego;<br />
– co tydzień (niezbędne w przypadku zimnego barwnika Ziehl-Neelsena:<br />
klasyczny ma kilkumiesięczny termin przydatności).<br />
Odczynniki i barwniki powinny być dyskwalifikowane, jeśli:<br />
– termin ważności określony przez producenta jest przekroczony;<br />
– widoczne są oznaki psucia (zmętnienie, osad, zmiana barwy).<br />
22
PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ<br />
Antygeny i surowice odp<strong>or</strong>nościowe<br />
do diagnostyki<br />
W celu otrzymania możliwie najlepszych wyników badań zużyciem antygenów<br />
i surowic odp<strong>or</strong>nościowych należy:<br />
• Zawsze przestrzegać instrukcji producenta.<br />
• Przechowywać w zalecanej temperaturze. Niektóre odczynniki serologiczne<br />
nie tolerują zamrażania.<br />
Tabela 4. Testy jakości powszechnie stosowanych odczynników<br />
Odczynnik lub barwnik<br />
Gatunek użyty do testowania<br />
Wzrost<br />
Brak wzrostu<br />
Podłoże<br />
Kra˛żek z bacytracyna˛<br />
S. pyogenes (strefa zahamowania)<br />
E. faecalis Agar z krwia˛<br />
Katalaza S. aureus E. faecalis Agar tryptozowo-sojowy<br />
Osocze do koagulazy S. aureus S. epidermidis Agar tryptozowo-sojowy<br />
β-Glukuronidaza (PGUA) a E. coli K. pneumoniae Agar tryptozowo-sojowy<br />
Barwienie metoda˛ Grama Staphylococcus spp. E. coli Preparaty z mieszanki<br />
szczepów<br />
ONPG b E. coli S. typhimurium Trójcukrowy agar żelazowy<br />
lub agar Kliglera<br />
Kra˛żek z optochina˛<br />
S. pneumoniae (strefa zahamowania)<br />
Streptococcus mitis Agar z krwia˛<br />
Oksydaza Pseudomonas aeruginosa E. coli Agar tryptozowo-sojowy<br />
Kra˛żek z tellurydem<br />
E. faecalis (brak strefy zahamowania)<br />
Streptococcus agalactiae<br />
(strefa zahamowania)<br />
Agar z krwia˛<br />
Czynnik V (kra˛żek lub pasek) Haemophilus parainfluenzae Haemophilus influenzae Agar tryptozowo-sojowy<br />
Czynnik XV (kra˛żek lub pasek) H. influenzae Agar tryptozowo-sojowy<br />
Barwienie metoda˛ Ziehl-Neelsena Mycobacterium tuberculosis Mieszana, niekwasoop<strong>or</strong>na<br />
fl<strong>or</strong>a<br />
Preparat z rozmazem<br />
z plwociny c<br />
a<br />
Kwas 4-nitrofenylo-β-D-glukopiranozydouronowy (PGUA).<br />
b<br />
o-Nitrofenylo-β-D-galaktopiranozyd.<br />
c<br />
Przygotować wymazy od pacjentów zdrowych i ch<strong>or</strong>ych. Utrwalić w cieple, owina˛ć każdy papierem i przechowywać<br />
wchłodziarce.<br />
• Unikać powtarzanych zamrożeń i rozmrożeń. Przed zamrożeniem podzielić<br />
surowicę na odpowiednie p<strong>or</strong>cje, wystarczające do wykonania kilku<br />
testów.<br />
• Wyrzucić, jeśli upłynął termin ważności podany przez producenta.<br />
• Do testu aglutynacji z surowicami odp<strong>or</strong>nościowymi należy używać zawsze<br />
świeżych, czystych, zidentyfikowanych hodowli.<br />
• Zawsze, w każdej serii badań, wykonać test z surowicą kontrolną o znanej<br />
reaktywności. Surowica może pochodzić od pacjenta lub z komercyjnego<br />
źródła.<br />
• Jeśli to możliwe, aktywność surowicy powinna być wyrażana w jednostkach<br />
międzynarodowych (International Units, IU) na mililitr.<br />
• Pary surowic, pobranych od jednego pacjenta w ostrej fazie ch<strong>or</strong>oby i w fazie<br />
zdrowienia, powinny być badane z użyciem odczynników z tej samej<br />
partii.<br />
• Diagnostykę serologiczną kiły prowadzić zgodnie z przyjętymi krajowymi<br />
i międzynarodowymi procedurami.<br />
• Każda partia testów serologicznych powinna zawierać:<br />
– surowicę ujemną (kontrola swoistości);<br />
23
ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH<br />
– surowicę słabo dodatnią (kontrola czułości);<br />
– surowicę silnie dodatnią (kontrola miareczkowania), która powinna być<br />
przygotowana w rozcieńczeniu odpowiadającym jej mianu uzyskanemu<br />
w ostatnio wykonywanym teście.<br />
• Zawsze zapisywać wszystkie miana surowic kontrolnych.<br />
Oznaczanie wrażliwości na antybiotyki<br />
Zalecane jest rutynowe stosowanie zmodyfikowanej metody Kirby-Bauera (str.<br />
125). W celu uniknięcia błędów, należy przestrzegać poniższych zasad:<br />
• Krążki powinny mieć właściwą średnicę (6,35 mm).<br />
• Krążki powinny zawierać właściwe stężenie antybiotyku (tabela 24, str. 126).<br />
• Zapas krążków powinien być przechowywany w zamrażarce (–20°C).<br />
• Zestaw podręczny powinien być przechowywany nie dłużej niż 1 miesiąc<br />
wchłodziarce (2 – 8°C).<br />
• Do przeprowadzania badania jakości należy używać tylko agaru Mueller-<br />
-Hintona.<br />
• Właściwe pH (7,2 – 7,4) gotowego podłoża jest bardzo istotne w przypadku<br />
niektórych antybiotyków.<br />
• Gęstość inoculum powinna być standaryzowana, określona na podstawie<br />
wz<strong>or</strong>ca zmętnienia (str. 127).<br />
• Pomiar wielkości strefy powinien być dokładny.<br />
• Uzyskana średnica strefy zahamowania wzrostu powinna być interpretowana<br />
według wartości granicznych podanych w tabeli. Średnica strefy<br />
dla szczepów kontrolnych powinna zgadzać się z zakresami podanymi w tabeli<br />
24 (str. 126).<br />
• Trzy standardowe szczepy kontrolne, to 1 :<br />
– Staphylococcus aureus (ATCC 25923; NCTC 6571);<br />
– Escherichia coli (ATCC 25922; NCTC 10418);<br />
– Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853; NCTC 10622).<br />
• Badania kontrolne z wyk<strong>or</strong>zystaniem wymienionych szczepów powinny być<br />
przeprowadzane:<br />
– dla każdej nowej partii krążków;<br />
– dla każdej nowej partii podłoży;<br />
– raz w tygodniu, równolegle do antybiogramów wykonywanych rutynowo.<br />
• W celu zapisu i interpretacji wyników kontroli jakości, zalecane jest stosowanie<br />
wykresu przedstawionego na ryc. 16 (str. 137).<br />
Pozyskiwanie i przechowywanie<br />
szczepów kontrolnych<br />
Wybór szczepów iźródło ich pochodzenia<br />
Należy wybrać szczepy, których maksymalna liczba m<strong>or</strong>fologicznych, metabolicznych<br />
i serologicznych cech może być identyfikowana możliwie najmniejszą<br />
liczbą testów; zalecane szczepy kontrolne zebrano w tabeli 2.<br />
1<br />
Wymienione szczepy mogą być uzyskane z: American Type Culture Collection (ATCC), 10801<br />
University Boulevard, Manassas, VA 20110, USA; lub National Collection of Type Cultures (NCTC),<br />
PHLS Central Public Health Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y, 61 Colindale Avenue, London NW9 5HT, England.<br />
24
PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ<br />
Szczepy te można uzyskać z następujących źródeł:<br />
– prawidłowo zidentyfikowane izolaty z próbek klinicznych;<br />
– oficjalne kolekcje szczepów;<br />
– komercyjni producenci;<br />
– referencyjne lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia;<br />
– inne źródła z zewnętrzną kontrolą jakości.<br />
Przechowywanie szczepów<br />
Długoterminowe przechowywanie szczepów<br />
Metody długoterminowego przechowywania szczepów pozwalają na kilkumiesięczne<br />
lub nawet kilkuletnie przerwy między przesiewami. Najlepszymi<br />
metodami są: liofilizacja (suchy lód), przechowywanie w zamrażarce lub<br />
w ciekłym azocie, w temperaturze –70°C lub niższej. Metody alternatywne<br />
opisano poniżej.<br />
Glicerol w temperaturze –20°C<br />
1. Wzrost czystych hodowli na odpowiednim stałym podłożu.<br />
2. Wyrosłe kolonie zebrać ezą.<br />
3. Zawiesić niewielką ilość materiału w sterylnym neutralnym glicerolu.<br />
4. Umieścić 1 – 2 ml p<strong>or</strong>cje w zakręcanych pojemnikach lub w fiolkach.<br />
5. Przechowywać w temperaturze –20°C. Unikać powtarzania zamrożeń i rozmrożeń.<br />
Przesiewać co 12 – 18 miesięcy.<br />
Olej mineralny w temperaturze pokojowej 1<br />
1. Przygotować probówki ze skosem agarowym zawierającym wyciąg z serca.<br />
Dla wymagających mikro<strong>or</strong>ganizmów dodać świeżą lub ogrzaną krew.<br />
2. Wysterylizować olej mineralny (liquid petrolatum) w suchym g<strong>or</strong>ącym<br />
powietrzu (170°C przez godzinę).<br />
3. Posiać szczep na skosy agarowe.<br />
4. Jeśli widoczny jest wzrost hodowli, dodać sterylny olej mineralny na wysokość<br />
około 1 cm ponad poziom agaru.<br />
5. Konieczne przesiewy uzyskuje się przez zebranie hodowli spod warstwy oleju.<br />
6. Przechowywać w temperaturze pokojowej. Przesiewać co 6 – 12 miesięcy.<br />
Przechowywanie hodowli w temperaturze pokojowej (stosowane tylko dla<br />
niewymagających bakterii, takich jak gronkowce i Enterobacteriaceae)<br />
1. Przygotować probówki z wysokim słupkiem agaru, bez węglowodanu.<br />
Zalecany jest agar tryptozowo-sojowy (trawiony kazeiną agar sojowy).<br />
2. Posiać szczepy wkłuwając je w agar.<br />
3. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C.<br />
4. Zamknąć probówkę zakrętką lub k<strong>or</strong>kiem. W celu uszczelnienia zanurzyć<br />
zakrętkę lub k<strong>or</strong>ek w płynnej parafinie.<br />
5. Przechowywać w temperaturze pokojowej. Przesiewać raz w roku.<br />
1<br />
M<strong>or</strong>ton H.E., Pulaski E.J.: The preservation of bacterial cultures. Journal of Bacteriology, 1938,<br />
38: 163 – 183.<br />
25
ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH<br />
Przechowywanie szczepów na agarze cysteinowo-tryptozowym (CTA) (dla<br />
Neisseria i paci<strong>or</strong>kowców)<br />
1. Przygotować probówki zawierające podstawowe podłoże CTA.<br />
2. Posiać wkłuwając bakterie w podłoże.<br />
3. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C.<br />
4. Zamknąć probówkę zakrętką lub k<strong>or</strong>kiem. W celu uszczelnienia zanurzyć<br />
zakrętkę lub k<strong>or</strong>ek w płynnej parafinie.<br />
5. W przypadku Neisseria, przechowywać w temperaturze 35°C i przesiewać co<br />
2 tygodnie. W przypadku paci<strong>or</strong>kowców, przechowywać w temperaturze<br />
pokojowej i przesiewać co miesiąc.<br />
Podłoża z wyciągiem mięsnym dla bakterii beztlenowych<br />
1. Posiać szczepy.<br />
2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C.<br />
3. Zamknąć probówkę zakrętką lub k<strong>or</strong>kiem.<br />
4. Przechowywać w temperaturze pokojowej i przesiewać co 2 miesiące.<br />
Krótkoterminowe przechowywanie szczepów<br />
Hodowle szczepów kontrolnych, aktualnie wyk<strong>or</strong>zystywane do badań rutynowych,<br />
mogą być przygotowywane w poniższy sposób.<br />
Szybko rosnące mikro<strong>or</strong>ganizmy<br />
1. Posiać na skos agarowy tryptozowo-sojowy w zakręcanych probówkach.<br />
2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C.<br />
3. Przechowywać wchłodziarce. Przesiewać co 2 tygodnie.<br />
Paci<strong>or</strong>kowce<br />
1. Posiać na skos agarowy z krwią w zakręcanych probówkach.<br />
2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C.<br />
3. Przechowywać wchłodziarce. Przesiewać co 2 tygodnie.<br />
Meningokoki i Haemophilus<br />
1. Posiać na skos lub płytkę z agarem czekoladowym.<br />
2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C.<br />
3. Przechowywać w temperaturze pokojowej. Przesiewać 2 razy w tygodniu.<br />
Gonokoki<br />
1. Posiać na agar czekoladowy.<br />
2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C. Przesiewać co 2 dni.<br />
3. Zastępować szczepy kontrolne nowymi klinicznymi izolatami.<br />
26
PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ<br />
Rola referencyjnych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów<br />
Poniższe rodzaje materiałów do badań powinny być przesyłane do regionalnych<br />
lub centralnych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów referencyjnych:<br />
– materiały badane w kierunku rzadko izolowanych drobnoustrojów lub wymagające<br />
zastosowania wysoko specjalistycznych testów (np.: wirusologia,<br />
diagnostyka serologiczna ch<strong>or</strong>ób pasożytniczych);<br />
– pojedyncze duplikaty materiałów do badań, w celu kontroli wydawanych przez<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium wyników;<br />
– materiały wymagające w przyszłości badań potwierdzających, różnicujących,<br />
oznaczania grup bądź typów patogenów o dużym znaczeniu dla zdrowia<br />
publicznego (np.: Salmonella, Shigella, Vibrio cholerae, Brucella, meningokoki<br />
i pneumokoki).<br />
Referencyjne lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia powinny dostarczać zestawy szczepów kontrolnych<br />
<strong>or</strong>az, na potrzeby szkoleń, standardowe surowice i odczynniki używane w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
referencyjnym.<br />
Jeśli lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium nie jest objęte programem zewnętrznej kontroli jakości,<br />
referencyjne lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium jest zobowiązane do przygotowywania ślepych, kodowanych<br />
próbek i hodowli, które służą do kontroli jakości pracy lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
w zakresie izolacji i hodowli.<br />
Zewnętrzna kontrola jakości<br />
W części tej omówiono elementy podlegające ocenie w programie zewnętrznej<br />
kontroli jakości (określanym jako ,,program testowania biegłości’’).<br />
Cele<br />
Celem programu kontroli jakości jest:<br />
– zagwarantowanie lekarzom i społeczeństwu dobrej jakości diagnostyki <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j;<br />
– ocena i p<strong>or</strong>ównanie wiarygodności wyników lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych w skali kraju;<br />
– identyfikacja powszechnie popełnianych błędów;<br />
– motywacja do przestrzegania ujednoliconych procedur;<br />
– motywacja do używania standardowych odczynników;<br />
– podjęcie czynności administracyjnych (łącznie z cofnięciem licencji) wobec<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów nie spełniających standardów;<br />
– motywacja do wprowadzenia wewnętrznych programów jakości.<br />
Zasady kontroli<br />
Zewnętrzna kontrola jakości polega na wysyłaniu kodowanych próbek do<br />
uczestniczących w niej lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów. Powyższe próbki powinny być włączone do<br />
badań rutynowych, traktowane i badane dokładnie w ten sam sposób, jak próbki<br />
kliniczne.<br />
Kontrolę należy prowadzić zgodnie z poniższymi zaleceniami:<br />
– powinna być przeprowadzana co najmniej 4 razy w roku;<br />
– powinna obejmować co najmniej 3 próbki;<br />
– czas na przygotowanie sprawozdania powinien być krótki, np. 2 tygodnie od<br />
otrzymania materiału do badań;<br />
27
ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH<br />
– instrukcje i f<strong>or</strong>mularze dotyczące sprawozdania powinny być dołączone do<br />
każdego zestawu próbek, a rap<strong>or</strong>t powinien być przygotowany w dwóch<br />
kopiach i przesłany w ściśle ustalonym terminie.<br />
Hodowle<br />
Hodowle powinny być włączone do identyfikacji i oznaczania wrażliwości na<br />
określoną liczbę antybiotyków; może to być czysta hodowla lub mieszanina<br />
dwóch lub więcej szczepów.<br />
Hodowle powinny należeć do co najmniej 3 pierwszych z poniższych 6 grup:<br />
1. Bakterie o dużym znaczeniu dla zdrowia publicznego, które są rzadko<br />
izolowane w rutynowej diagnostyce, np.: C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae,<br />
Salmonella paratyphi A.<br />
UWAGA: Brucella i Salmonella typhi nie powinny być wyk<strong>or</strong>zystywane<br />
w programach kontroli jakości, ponieważ mogą wywoływać poważne,<br />
przypadkowe zakażenia.<br />
2. Nietypowe biotypy, które są często identyfikowane nieprawidłowo, np.:<br />
H 2 S-dodatnie Escherichia coli, laktozoujemne E. coli, ureazoujemne Proteus.<br />
3. Nowe lub op<strong>or</strong>tunistyczne patogeny, np.: Yersinia enterocolitica, Vibrio<br />
parahaemolyticus, Burkholderia, Pseudomonas cepacia.<br />
4. Mieszane hodowle Shigella, Citrobacter, E. coli i Klebsiella mogą zostać<br />
wyk<strong>or</strong>zystane w celu oceny zdolności lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium do izolacji patogenów<br />
spośród wielu mikro<strong>or</strong>ganizmów komensalnych.<br />
5. Mieszane hodowle niepatogennych mikro<strong>or</strong>ganizmów mogą zostać wyk<strong>or</strong>zystane<br />
w celu oceny zdolności rozpoznawania próbek ujemnych.<br />
6. Bakterie o specyficznym wz<strong>or</strong>ze op<strong>or</strong>ności, np.: metycylinoop<strong>or</strong>ny S. aureus<br />
(MRSA).<br />
Surowice<br />
Program kontroli jakości powinien obejmować także badania serologiczne<br />
stosowane w poniższych zakażeniach:<br />
– kiła,<br />
– różyczka,<br />
– bruceloza,<br />
– infekcje paci<strong>or</strong>kowcowe,<br />
– dur brzuszny.<br />
Ocena i przedstawienie wyników<br />
Gdy wszystkie objęte programem kontroli lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia dostarczą swoje wyniki,<br />
należy przesłać im zestaw prawidłowych odpowiedzi. W ciągu miesiąca do<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów powinny zostać wysłane sprawozdania z analizą wyników. Każde<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium oceniane jest według punktacji. Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium powinno mieć<br />
nadany, sobie tylko znany numer. W ten sposób może p<strong>or</strong>ównać własne rezultaty<br />
z wynikami innych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów, które pozostają anonimowe.<br />
28
Część I<br />
Badania bakteriologiczne<br />
29
Krew<br />
Wprowadzenie<br />
Hodowle z krwi prowadzone są w celu izolacji i identyfikacji bakterii lub innych<br />
możliwych do wyhodowania mikro<strong>or</strong>ganizmów (drożdże, grzyby nitkowate).<br />
Obecność powyższych drobnoustrojów we krwi określa się mianem bakteriemii<br />
lub fungemii, która zazwyczaj jest stanem patologicznym. U zdrowych osób krew<br />
jest jałowa. Istnieje jednak kilka wyjątków: okresowa bakteriemia, która pojawia<br />
się krótko po ekstrakcji zęba lub po innych zabiegach stomatologicznych<br />
i chirurgicznych w obrębie zakażonych błon śluzowych, po bronchoskopii lub po<br />
cewnikowaniu pęcherza. Opisany typ bakteriemi dotyczy zwykle bakterii komensalnych<br />
i zazwyczaj przemija samoistnie dzięki fagocytozie zachodzącej w wątrobie<br />
i śledzionie.<br />
Sepsa jest terminem klinicznym, określającym bakteriemię z objawami klinicznymi<br />
ciężkiej infekcji, takimi jak: dreszcze, g<strong>or</strong>ączka, złe samopoczucie i spadek<br />
ciśnienia tętniczego. Skrajną postacią sepsy jest wstrząs. Wstrząs może być<br />
wywołany toksynami produkowanymi przez Gram-ujemne pałeczki lub Gram-<br />
-dodatnie ziarenkowce.<br />
Kiedy i u kogo może wysta˛pić bakteriemia<br />
Bakteriemia jest cechą niektórych ch<strong>or</strong>ób zakaźnych, np.: brucelozy, leptospirozy<br />
i duru brzusznego. Przewlekła bakteriemia występuje w zakażeniach łożyska<br />
naczyniowego, np.: w zapaleniu wsierdzia (endocarditis), zakażonym tętniaku<br />
i w zakrzepowym zapaleniu żył (thrombophlebitis).<br />
Przejściowa bakteriemia często towarzyszy zlokalizowanym infekcjom, takim<br />
jak: zapalenie stawów (arthritis), odleżyny, zapalenie pęcherzyka żółciowego<br />
(cholecystitis), zapalenie jelita cienkiego i okrężnicy (enterocolitis), zapalenie<br />
opon mózgowo-rdzeniowych (meningitis), zapalenie szpiku (osteomyelitis),<br />
zapalenie otrzewnej (peritonitis), zapalenie płuc (pneumonia), odmiedniczkowe<br />
zapalenie nerek (pyelonephritis) <strong>or</strong>az zakażenia ran pourazowych i chirurgicznych.<br />
Może pojawić się w wyniku różnych interwencji chirurgicznych, lecz<br />
u zdrowych osób zwykle ustępuje samoistnie.<br />
Bakteriemia i fungemia mogą być pochodzenia jatrogennego i wystąpić w wyniku<br />
wprowadzenia mikro<strong>or</strong>ganizmów drogą dożylną: przez skażony płyn podawany<br />
dożylnie, cewnik lub miejsce wkłucia. Obydwa typy infekcji mogą wystąpić<br />
u osób przyjmujących dożylnie narkotyki <strong>or</strong>az u osób w immunosupresji, do<br />
których zalicza się pacjentów zakażonych ludzkim wirusem upośledzenia<br />
odp<strong>or</strong>ności — z zespołem nabytego upośledzenia odp<strong>or</strong>ności (HIV/AIDS). Są one<br />
często wynikiem zakażeń ,,op<strong>or</strong>tunistycznymi’’ mikro<strong>or</strong>ganizmami i mogą mieć<br />
poważne konsekwencje. W tabeli 5 przedstawiono najczęstsze przyczyny bakteriemii<br />
i fungemii.<br />
30
CZE˛ŚĆ I<br />
Pobieranie próbek krwi<br />
Czas pobrania próbki<br />
Jeśli to możliwe, krew powinna zostać pobrana przed zastosowaniem antybiotyków.<br />
Najlepiej przed wystąpieniem dreszczy lub szczytu temperatury.<br />
Zaleca się pobranie dwu lub k<strong>or</strong>zystniej trzech próbek krwi w około godzinnych<br />
odstępach (lub krótszych, jeśli nie można opóźniać rozpoczęcia leczenia). Rzadko<br />
wskazane jest pobranie więcej niż trzech próbek. Zalety powtarzanych hodowli<br />
z krwi, to:<br />
– zmniejszone prawdopodobieństwo przeoczenia przejściowej bakteriemii;<br />
– potwierdzenie patogennej roli ,,saprofitycznych izolatów (np.: Staphylococcus<br />
epidermidis) przez wykazanie ich obecności w próbkach z kilku wkłuć.<br />
Tabela 5. Częste przyczyny bakteriemii i fungemii<br />
Gram-ujemne mikro<strong>or</strong>ganizmy<br />
Gram-dodatnie mikro<strong>or</strong>ganizmy<br />
Escherichia coli<br />
Staphylococcus aureus<br />
Klebsiella spp.<br />
S. epidermidis<br />
Enterobacter spp.<br />
α-Hemolizuja˛ce (zielenieja˛ce paci<strong>or</strong>kowce)<br />
Proteus spp.<br />
Streptococcus pneumoniae<br />
Salmonella typhi E. faecalis (grupa D)<br />
Salmonella spp., inne niż S. typhi S. pyogenes (grupa A)<br />
Pseudomonas aeruginosa S. agalactiae (grupa B)<br />
Neisseria meningitidis<br />
Listeria monocytogenes<br />
Haemophilus influenzae<br />
Clostridium perfringens<br />
Bacteroides fragilis (beztlenowe)<br />
Peptostreptococcus spp. (beztlenowe)<br />
Brucella spp.<br />
Candida albicans i inne drożdżopodobne<br />
Burkholderia (Pseudomonas) pseudomallei grzyby (np. Cryptococcus neof<strong>or</strong>mans)<br />
(w niektórych regionach)<br />
Ważne jest pobranie próbek krwi przed wprowadzeniem antybiotykoterapii<br />
empirycznej. Jeśli to konieczne, wybór antybiotyków może zostać zmodyfikowany<br />
po uzyskaniu wyników antybiogramu.<br />
Objętość próbki krwi<br />
Ponieważ liczba bakterii w mililitrze krwi jest zwykle mała, ważne jest pobranie<br />
właściwej objętości krwi: 10 ml z wkłucia u d<strong>or</strong>osłych; 2 – 5 ml mogą być<br />
wystarczające u dzieci, u których zwykle bakteriemia osiąga wyższe wartości;<br />
u niemowląt i now<strong>or</strong>odków często można uzyskać maksymalnie 1 – 2 ml. Każda<br />
próbka powinna być posiana do dwóch butelek: pierwszej do optymalnej hodowli<br />
ściśle tlenowych mikro<strong>or</strong>ganizmów, drugiej dla szczepów beztlenowych.<br />
Dezynfekcja skóry<br />
Skóra w miejscu wkłucia powinna być starannie przygotowana, z użyciem<br />
bakteriobójczego preparatu dezynfekującego: 2% roztw<strong>or</strong>u jodyny, 10% roztw<strong>or</strong>u<br />
poliwidonu jodyny, 70% alkoholu lub 0,5% roztw<strong>or</strong>u chl<strong>or</strong>heksydyny w 70%<br />
alkoholu. Przed pobraniem krwi środek dezynfekujący powinien odparować<br />
z powierzchni skóry. W celu uniknięcia ewentualnych podrażnień przy stosowaniu<br />
jodyny skórę należy przetrzeć 70% alkoholem.<br />
31
KREW<br />
Nawet po starannym przygotowaniu skóry niektóre bakterie mogą przetrwać<br />
wgłębszych warstwach i przedostać się do krwi, np.: S. epidermidis, Propionibacterium<br />
acnes, przetrwalniki Clostridium.<br />
Pseudobakteriemia (fałszywie dodatnie hodowle z krwi) może być efektem użycia<br />
skażonych roztw<strong>or</strong>ów dezynfekujących, strzykawek lub igieł.<br />
Powtarzalne izolacje nie występujących powszechnie mikro<strong>or</strong>ganizmów (np.:<br />
Burkholderia (Pseudomonas) cepacia, Pantoea (Enterobacter) agglomerans lub<br />
Serratia spp.) z jednego szpitala wzbudzają podejrzenie zakażenia szpitalnego<br />
i wymagają szczegółowych badań. Inną przyczyną skażenia próbki jest kontakt<br />
igły z niesterylnymi probówkami (lub roztw<strong>or</strong>ami), jeśli ta sama strzykawka<br />
została wcześniej użyta do pobrania krwi do badań biochemicznych lub odczynu<br />
opadania krwinek czerwonych (OB — odczyn Biernackiego — przyp. tłum.).<br />
Antykoagulant<br />
Zalecane jest użycie jako środka przeciwkrzepliwego polianetosulfonianu sodu<br />
(sodium polyanethol sulfonate — SPS), ponieważ hamuje on jednocześnie<br />
aktywność przeciwbakteryjną osocza i fagocytów. Jeśli natychmiast po pobraniu<br />
krew zostanie dodana do wystarczającej objętości (50 ml) bulionu i dokładnie<br />
wymieszana w celu uniknięcia tw<strong>or</strong>zenia się skrzepów, zastosowanie antykoagulantu<br />
nie jest konieczne. Każdy szpital i większość ośrodków zdrowia<br />
powinna być wyposażona w butelki z podłożem do posiewu krwi. Jeśli płynne<br />
podłoże jest niedostępne, krew należy przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium w probówce<br />
zawierającej sterylny roztwór antykoagulantu (cytrynian, heparyna lub SPS).<br />
W lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium próbka krwi natychmiast po otrzymaniu powinna zostać<br />
w warunkach aseptycznych przeniesiona do butelki z podłożem. Jeśli krew<br />
pobrana jest bez antykoagulantu, skrzep w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium może zostać w aseptycznych<br />
warunkach przeniesiony do bulionu, a surowica wyk<strong>or</strong>zystana do wykonania<br />
niektórych testów serologicznych (np.: odczyn Widala).<br />
Podłoża do posiewu krwi<br />
Wybór podłoży płynnych<br />
Bulion do posiewu z krwi i bulion tryptozowo-sojowy (TSB) powinny umożliwić<br />
wzrost wszystkich bakterii o znaczeniu klinicznym.<br />
Objętość bulionu<br />
Optymalnie krew powinna być wymieszana z bulionem w stosunku 1:10 (5 ml<br />
krwi w 50 ml podłoża), co zmniejsza stężenie antybiotyku i redukuje aktywność<br />
przeciwbakteryjną ludzkiego osocza.<br />
Butelki z podłożem do posiewu krwi<br />
Należy używać butelek z podłożem do posiewu krwi (125 ml), z podwójną<br />
nakrętką, której drugą warstwę stanowi gumowy krążek. Po napełnieniu butelki<br />
32
CZE˛ŚĆ I<br />
50 ml podłoża odkręcić nakrętkę opół obrotu. Nakryć zamknięcie kwadratowym<br />
fragmentem folii aluminiowej i umieścić butelkę w autoklawie w 120°C na<br />
20 minut. Natychmiast po autoklawowaniu, gdy butelka i podłoże sąjeszcze<br />
g<strong>or</strong>ące, delikatnie dokręcić nakrętkę, bez usuwania folii aluminiowej (w innym<br />
przypadku nakrętka nie będzie sterylna). Podczas stygnięcia podłoża wytwarza się<br />
częściowa próżnia, która ułatwi wprowadzenie próbki krwi przez gumową<br />
warstwę.<br />
Tuż przed wprowadzeniem materiału do butelki należy starannie zdezynfekować<br />
gumową część nakrętki.<br />
Przed wydaniem gotowej butelki z podłożem i przed jej użyciem powinno się<br />
sprawdzić przejrzystość zawartości. Podłoże, które wykazuje zmętnienie, nie<br />
powinno zostać użyte.<br />
Jeśli podejrzewa się obecność bakterii tlenowych (Pseudomonas, Neisseria) lub<br />
drożdży, w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium po otrzymaniu próbki należy zdezynfekować gumową<br />
część nakrętki i przekłuć ją sterylną igłą z bawełnianą zatyczką. Igła może zostać<br />
usunięta w chwili, gdy ciśnienie wewnątrz butelki osiągnie wartość ciśnienia<br />
atmosferycznego. Komercyjne butelki do posiewu krwi zawierają dwutlenek<br />
węgla stymulujący wzrost. W krajach, gdzie powszechnie występuje bruceloza,<br />
zalecane jest stosowanie, umożliwiającego wzrost Brucella spp., dwufazowego<br />
podłoża, złożonego z bulionu <strong>or</strong>az stałej warstwy agaru na jednej z gładkich<br />
powierzchni naczynia (Castaneda bottle). Do hodowli większości szczepów<br />
B. ab<strong>or</strong>tus wymagana jest obecność dwutlenku węgla.<br />
Prowadzenie hodowli z krwi<br />
Czas inkubacji<br />
Butelki do posiewu krwi powinny być inkubowane w 35 – 37°C i kontrolowane<br />
dwukrotnie w ciągu dnia (co najmniej przez pierwsze 3 dni) w celu oceny cech<br />
mikrobiologicznych wzrostu. Jałowe posiewy zwykle zawierają warstwę osadu<br />
krwi, pokrytą jasnożółtym przezroczystym bulionem. Dowodem wzrostu są:<br />
– kłaczkowaty osad na powierzchni warstwy krwi,<br />
– jednolite lub podpowierzchniowe zmętnienie,<br />
– hemoliza,<br />
– koagulacja bulionu,<br />
– kożuszek na powierzchni,<br />
– wytwarzanie gazu,<br />
– białe ziarna na powierzchni lub w głębszej warstwie krwi.<br />
Kiedy tylko pojawi się wzrost, butelkę należy otw<strong>or</strong>zyć w warunkach aseptycznych,<br />
pobrać sterylną ezą lub pipetą Pasteura niewielką ilość bulionu i przygotować<br />
rozmaz barwiony metodą Grama w celu oceny obecności mikro<strong>or</strong>ganizmów.<br />
Jednocześnie należy wykonać przesiew ezą na odpowiednie podłoża:<br />
– dla Gram-ujemnych pałeczek: agar MacConkeya, agar Kliglera, podłoże<br />
ruch-indol-ureaza (MIU), cytrynianowy agar Simmonsa;<br />
– dla małych Gram-ujemnych pałeczek: agar z krwią;<br />
– dla gronkowców: agar z krwią, agar z mannitolem;<br />
– dla paci<strong>or</strong>kowców: agar z krwią, z krążkiem z optochiną, bacytracyną<br />
i telurynem, agar z krwią baranią do testu CAMP, agar z żółcią i eskuliną.<br />
33
KREW<br />
W rutynowych posiewach krwi inkubacja dłuższa niż 7 dni nie jest konieczna.<br />
W niektórych przypadkach inkubacja może być przedłużona o kolejne 7 dni, na<br />
przykład przy podejrzeniu zakażenia pałeczkami Brucella lub innymi mikro<strong>or</strong>ganizmami<br />
o wysokich wymaganiach odżywczych, w przypadku zapalenia<br />
wsierdzia lub jeśli pacjent jest w trakcie antybiotykoterapii.<br />
Próbki krwi z niewidocznym wzrostem<br />
Niektóre mikro<strong>or</strong>ganizmy mogą rosnąć bez zmętnienia lub widocznych zmian<br />
w podłożu. Inne, jak na przykład pneumokoki, wykazują tendencję do autolizy<br />
i szybko giną. Z tego powodu niektóre lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia prowadzą rutynowe przesiewy<br />
na agar czekoladowy po 18 – 24 godzinach inkubacji. Próbki z niewidocznym<br />
wzrostem mogą być opracowywane w siódmym dniu inkubacji przez przeniesienie<br />
kilku kropel dobrze zmieszanej hodowli krwi (z użyciem sterylnych pipet<br />
Pasteura) do probówki z podłożem tioglikolanowym, którą inkubuje się i obserwuje<br />
przez kolejne 3 dni.<br />
Antybiogram<br />
Przy podejrzeniu obecności gronkowców lub Gram-ujemnych pałeczek można<br />
oszczędzając czas wykonać bezpośredni, niestandaryzowany antybiogram, używając<br />
dodatnich próbek jako inoculum. Sterylną wymazówkę należy zanurzyć we<br />
wstrząśniętym podłożu i odsączając nadmiar płynu, posiać na podłoże Mueller-<br />
-Hintona jak w metodzie standardowej (patrz str. 126). Wstępny odczyt może być<br />
wykonany po 6 – 8 godzinach inkubacji. W 95% przypadków rezultaty uzyskane<br />
tą metodą są zgodne ze standaryzowanym testem.<br />
Zanieczyszczenia<br />
Zanieczyszczenia hodowli krwi można uniknąć przez staranne przygotowanie<br />
skóry i dokładne przestrzeganie procedur aseptycznych w czasie posiewu<br />
i przesiewów. Jednakże nawet w idealnych warunkach 3 – 5% posiewów krwi jest<br />
,,skażonych’’ bakteriami ze skóry (S. epidermidis, P. acnes, Clostridium spp.,<br />
dyfteroidy) lub ze środowiska (Acinetobacter spp., Bacillus spp.).<br />
Powyższe mikro<strong>or</strong>ganizmy mogą być w niektórych sytuacjach patogenne,<br />
wywołując np. zapalenie wsierdzia. Rzeczywistą infekcję należy podejrzewać<br />
w poniżej wymienionych sytuacjach:<br />
– jeżeli ten sam <strong>or</strong>ganizm wyhodowano z dwóch butelek tej samej próbki krwi;<br />
– jeżeli ten sam <strong>or</strong>ganizm rośnie w hodowli więcej niż jednej próbki;<br />
– jeżeli wzrost jest szybki (w ciągu 48 godzin);<br />
– jeżeli różne izolaty jednego gatunku wykazują ten sam biotyp i wzór<br />
lekowrażliwości.<br />
Wszystkie wyniki hodowli powinny być przedstawiane lekarzowi łącznie<br />
z wynikami próbek prawdopodobnie zanieczyszczonych. Jednakże dla tych<br />
ostatnich nie należy wykonywać antybiogramu, a jedynie umieścić na wyniku<br />
odpowiedni komentarz, np. Propionibacterium acnes (fl<strong>or</strong>a skóry), Staphylococcus<br />
epidermidis (prawdopodobnie zanieczyszczenie). Jest to istotne dla<br />
nawiązania dobrej współpracy między lekarzami a personelem lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
34
CZE˛ŚĆ I<br />
Identyfikacja dwóch lub więcej drobnoustrojów z krwi prawdopodobnie wskazuje<br />
na wieloczynnikową bakteriemię, która może występować u wyniszczonych<br />
pacjentów, ale może być również rezultatem skażenia próbki. ,,Beztlenowcowa’’<br />
bakteriemia często wywołana jest przez kilka patogenów, np. w ciężkiej,<br />
pi<strong>or</strong>unującej bakteriemii, związanej z poważnym urazem lub zabiegiem chirurgicznym<br />
na jelicie grubym, występuje jeden lub kilka patogenów beztlenowych<br />
z jednym lub kilkoma patogenami tlenowymi.<br />
35
Płyn mózgowo-rdzeniowy<br />
Wprowadzenie<br />
Badanie płynu mózgowo-rdzeniowego jest ważne w diagnostyce bakteryjnego<br />
i grzybiczego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych i musi być traktowane jako<br />
badanie nadrzędne, wymagające właściwej uwagi personelu <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>go.<br />
Prawidłowy płyn mózgowo-rdzeniowy jest jałowy i przejrzysty, zwykle zawiera<br />
trzy lub mniej leukocytów w1mm 3 , nie zawiera erytrocytów. Jego chemiczny<br />
i cytologiczny skład zmienia się w stanach zapalnych opon mózgowo-rdzeniowych<br />
i mózgu, np. w zapaleniu mózgu (encephalitis) lub opon mózgowo-<br />
-rdzeniowych (meningitis). W rozdziale omówione zostanie jedynie badanie<br />
mikrobiologiczne, choć ocena liczby białych krwinek w płynie mózgowo-<br />
-rdzeniowym ma także istotne znaczenie.<br />
Najczęstsze, zależnie od wieku pacjenta, przyczyny zapalenia opon mózgowo-<br />
-rdzeniowych, zostały wymienione w tabeli 6, należy jednak pamiętać, że<br />
czynniki te mogą współistnieć.<br />
Pobieranie i transp<strong>or</strong>t próbek<br />
Podczas wykonywania przez lekarza punkcji lędźwiowej lub kom<strong>or</strong>owej do<br />
dwóch sterylnych probówek należy pobrać około 5– 10 ml płynu mózgowo-<br />
-rdzeniowego. Ze względu na niebezpieczeństwo jatrogennego bakteryjnego<br />
zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych, konieczna jest dokładna dezynfekcja<br />
skóry. Część próbki płynu mózgowo-rdzeniowego jest przeznaczona do przeprowadzenia<br />
badań biochemicznych i cytologicznych, pozostałą objętość płynu<br />
wyk<strong>or</strong>zystuje się do badań mikrobiologicznych. Ponieważ komórki szybko<br />
ulegają rozpadowi, próbka powinna zostać niezwłocznie dostarczona do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
i opracowana. Każde opóźnienie może być przyczyną nieprawidłowej oceny<br />
liczby komórek, nie odzwierciedlającej klinicznego stanu pacjenta.<br />
Tabela 6. Częste przyczyny bakteryjnego i grzybiczego zapalenia opon mózgowo-<br />
-rdzeniowych<br />
U niemowla˛t (do 2 miesia˛ca życia)<br />
Escherichia coli<br />
Inne Enterobacteriaceae: Salmonella spp., Citrobacter spp.<br />
Listeria monocytogenes<br />
Streptococcus agalactiae (grupa B)<br />
W innych grupach wiekowych<br />
Haemophilus influenzae (otoczkowy typ b) a<br />
Neisseria meningitidis<br />
Streptococcus pneumoniae<br />
Mycobacterium tuberculosis<br />
Listeria monocytogenes b<br />
Cryptococcus neof<strong>or</strong>mans b<br />
Staphylococcus spp. c<br />
a<br />
Rzadko powyżej 5. roku życia.<br />
b<br />
U pacjentów z niedob<strong>or</strong>em odp<strong>or</strong>ności (ła˛cznie z pacjentami z zespołem nabytego<br />
niedob<strong>or</strong>u odp<strong>or</strong>ności — AIDS).<br />
c<br />
Zwia˛zane z zabiegami neurochirurgicznymi i drenami pooperacyjnymi.<br />
36
CZE˛ŚĆ I<br />
Ocena makroskopowa<br />
Wygląd płynu mózgowo-rdzeniowego powinien być oceniony i opisany jako:<br />
klarowny, mglisty, mętny, ropny, żółty (związany z hemolizą lub żółtaczką jąder<br />
podk<strong>or</strong>owych), z domieszką krwi, z włóknami lub warstwą fibryny.<br />
Badanie mikroskopowe<br />
Przygotowanie próbki<br />
Jeśli w ocenie makroskopowej stwierdza się ropny płyn mózgowo-rdzeniowy<br />
(bardzo mętny), to badanie można przeprowadzić bez odwirowania. W pozostałych<br />
przypadkach płyn mózgowo-rdzeniowy powinien zostać odwirowany<br />
w sterylnej probówce (najlepiej o objętości 15 ml) w 10 000 g przez 5 – 10 minut.<br />
Usunąć supernatant, używając sterylnej pipety Pasteura z dopasowanym gumowym<br />
kapturkiem, i przenieść do innej probówki do testów biochemicznych i/lub<br />
serologicznych. Osad użyć do wykonania dalszych testów mikrobiologicznych.<br />
Mikroskopia bezpośrednia<br />
Do badania mikroskopowego użyć kropli osadu umieszczonej między szkiełkiem<br />
podstawowym i nakrywkowym, oceniając obecność:<br />
– leukocytów (wielojądrzaste neutrofile lub limfocyty),<br />
– erytrocytów,<br />
– bakterii,<br />
– grzybów.<br />
Przy podejrzeniu obecności drożdżaków Cryptococcus neof<strong>or</strong>mans na szkiełku<br />
podstawowym należy zmieszać pobrany ezą osad z tuszem chińskim, nakryć<br />
szkiełkiem nakrywkowym i oglądać preparat, poszukując typowych, otoczkowych,<br />
sferycznych f<strong>or</strong>m grzybów.<br />
W regionach, w których występuje śpiączka afrykańska, konieczne jest uważne<br />
poszukiwanie aktywnego ruchu wyposażonych w witkę świdrowców z rodzaju<br />
Trypanosoma.<br />
Wolno żyjące w wodzie ameby (Naegleria fowleri), które dostają się do<br />
ośrodkowego układu nerwowego przez nos, wywołują rzadkie i zazwyczaj<br />
śmiertelne zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych. Mogą być widoczne w preparacie<br />
bezpośrednim w postaci aktywnie p<strong>or</strong>uszających się ogranizmów, wielkością<br />
zbliżonych do neutrofilów.<br />
Barwienie preparatów metoda˛ Grama<br />
Czynniki wywołujące zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych są często widoczne<br />
w preparatach barwionych metodą Grama, stąd badanie to jest bardzo istotne.<br />
Preparaty należy wysuszyć na powietrzu, utrwalić łagodnie podgrzewając<br />
i wybarwić metodą Grama. Oglądać pod powiększeniem ×1000 (w immersji)<br />
przez co najmniej 10 minut lub do chwili stwierdzenia obecności bakterii.<br />
W tabeli 7 przedstawiono ważne obserwacje diagnostyczne związane z różnymi<br />
f<strong>or</strong>mami zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych.<br />
37
PŁYN MÓZGOWO-RDZENIOWY<br />
Tabela 7. Cechy płynu mózgowo-rdzeniowego w zapaleniu opon mózgowo-rdzeniowych<br />
Badana cecha<br />
Leukocytoza<br />
Stężenie glukozy<br />
Typ zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
Bakteryjne Gruźlicze Grzybicze Wirusowe (,,aseptyczne’’)<br />
Segmentowe polim<strong>or</strong>ficzne<br />
neutrofile<br />
Bardzo niskie:<br />
0,28 –1,1 mmol/l<br />
Monocyty (młode neutrofile)<br />
Niskie:<br />
1,1 –2,2 mmol/l<br />
Monocyty<br />
Niskie:<br />
1,1 –2,2 mmol/l<br />
Monocyty<br />
Prawidłowe:<br />
3,6 –3,9 mmol/l<br />
Stężenie białka Podwyższone Podwyższone Podwyższone Nieco podwyższone we<br />
wczesnej fazie zakażenia<br />
Preparat barwiony<br />
Zwykle widoczne bakterie<br />
(Gram)<br />
Rzadko dodatni<br />
(kwasoop<strong>or</strong>ne)<br />
Zwykle dodatni (tusz<br />
chiński)<br />
Ujemny<br />
Tabela 8. Wybór podłoża dla płynu mózgowo-rdzeniowego w zależności od wyników barwienia metoda˛ Grama a<br />
a<br />
b<br />
Obserwacja<br />
Gram-ujemne<br />
pałeczki<br />
Now<strong>or</strong>odki<br />
Inne grupy<br />
wiekowe<br />
Gram-dodatnie<br />
ziarenkowce<br />
Now<strong>or</strong>odki<br />
Inne grupy<br />
wiekowe<br />
Agar z krwia˛b + + + + z<br />
kra˛żkiem<br />
z optochina˛<br />
Gramujemne<br />
ziarenkowce<br />
Gramdodatnie<br />
pałeczki<br />
Brak<br />
mikro<strong>or</strong>ganizmów<br />
+ + +<br />
Agar z krwia˛ z S. aureus b + + +<br />
Agar czekoladowy (+) (+) (+)<br />
Agar MacConkeya + + + + + + +<br />
Bulion tryptozowo-sojowy + + + + + + +<br />
+=użyć; (+) = ewentualnie użyć.<br />
Inkubacja w atmosferze wzbogaconej CO 2 (eksykat<strong>or</strong>).<br />
Barwienie bakterii kwasoop<strong>or</strong>nych<br />
(metoda Ziehl-Neelsena)<br />
Pomimo niskiej czułości metody, przy podejrzeniu gruźliczego zapalenia opon<br />
mózgowo-rdzeniowych, zalecane jest barwienie rozmazu z osadu metodą Ziehl-<br />
-Neelsena. Barwiony preparat należy starannie oglądać przez co najmniej<br />
15 minut. Jeśli wynik jest ujemny, następnego dnia powtórzyć badanie, wykonując<br />
następny preparat z próbki.<br />
Hodowle<br />
Po stwierdzeniu obecności bakterii w preparacie barwionym metodą Grama<br />
należy wykonać posiew na odpowiednie podłoża (tabela 8). Jeśli nie wykazano<br />
obecności drobnoustrojów, należy wykonać posiew na podłoża o szerokim<br />
spektrum wzrostu, takie jak agar z krwią z posianym Staphylococcus aureus, który<br />
umożliwia wzrost H. influenzae. Płytki zawierające agar z krwią i agar<br />
czekoladowy powinny być inkubowane w 35°C w powietrzu atmosferycznym<br />
wzbogaconym w dwutlenek węgla. Wszystkie podłoża inkubować przez 3 dni<br />
i codziennie obserwować.<br />
Przy podejrzeniu gruźliczego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych należy<br />
wykonać posiew z osadu na co najmniej 3 podłoża Löwensteina-Jensena<br />
i inkubować przez 6 tygodni. Przez pierwsze 2 – 3 dni probówki powinny być<br />
inkubowane w pozycji poziomej z odkręconą opół obrotu nakrętką. Wzrost<br />
38
CZE˛ŚĆ I<br />
oceniać w cotygodniowych odstępach. Po zaobserwowaniu jakiegokolwiek<br />
wzrostu, najlepiej w bakteriologicznie bezpiecznych kom<strong>or</strong>ach, należy przygotować<br />
preparat, wysuszyć, utrwalić ciepłem i wybarwić metodą Ziehl-Neelsena.<br />
Obecność kwasoop<strong>or</strong>nych prątków jest równoznaczna z diagnozą gruźlicy.<br />
Wszystkie izolaty powinny zostać przesłane do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium referencyjnego<br />
w celu potwierdzenia diagnozy i określenia lekowrażliwości.<br />
Gdy na podstawie barwienia tuszem chińskim lub objawów klinicznych podejrzewa<br />
się zakażenie Cryptococcus neof<strong>or</strong>mans, należy wykonać posiewy z osadu<br />
do dwóch probówek z agarem Sabouraud i inkubować w35°C do miesiąca.<br />
C. neof<strong>or</strong>mans rośnie takżenapłytkach zawierających agar z krwią, które, jeśli to<br />
wskazane, powinny być inkubowane w 35°C przez tydzień.<br />
Wstępna identyfikacja<br />
Wzrost na agarze MacConkeya sugeruje obecność Enterobacteriaceae, która<br />
następnie powinna być potwierdzona z użyciem metod i podłoży zalecanych dla<br />
patogenów jelitowych.<br />
Kolonie Gram-dodatnich ziarenkowców ze strefą brzeżnej hemolizy typu β mogą<br />
wskazywać na obecność S. agalactiae (paci<strong>or</strong>kowce grupy B), która powinna<br />
zostać potwierdzona w odwrotnym teście CAMP (str. 117).<br />
Płaskie kolonie z wklęsłą częścią centralną i niewielką zieloną strefą hemolizy<br />
typu α to prawdopodobnie S. pneumoniae. Dla potwierdzenia należy na agarze<br />
z krwią, zawierającym gęsto posiane czyste kolonie badanego szczepu, umieścić<br />
6-milimetrowy krążek z optochiną.Pocałonocnej inkubacji pneumokoki wykażą<br />
14-milimetrową lub większą strefę zahamowania wzrostu wokół krążka. Najlepsze<br />
rezultaty uzyskuje się po inkubacji na agarze zawierającym krew baranią<br />
w atmosferze wzbogaconej w dwutlenek węgla. Jeśli odczyt pierwszej hodowli na<br />
agarze z krwią nie jest jednoznaczny, należy przesiać szczep i powtórzyć badanie.<br />
Kolonie H. influenzae rosną tylko na agarze czekoladowym <strong>or</strong>az jako kolonie<br />
satelitarne w pobliżu gronkowcowych posiewów na agarze z krwią. Dalsza<br />
identyfikacja może być przeprowadzona w teście aglutynacji szkiełkowej przy<br />
użyciu surowicy odp<strong>or</strong>nościowej H. influenzae typ b.<br />
Gram-ujemne dwoinki rosnące na agarze z krwią lub agarze czekoladowym, które<br />
dają szybko dodatni test oksydazowy, mogą być uznane za meningokoki.<br />
Potwierdzenie i identyfikacja grup serologicznych N. meningitidis (A, B, C) są<br />
oparte na odczynie aglutynacji szkiełkowej z użyciem właściwych surowic<br />
odp<strong>or</strong>nościowych. Ujemny odczyn aglutynacji nie wyklucza meningokoków,<br />
ponieważ istnieją co najmniej cztery dodatkowe serogrupy. W tej sytuacji dla<br />
izolowanych szczepów należy określić zdolność do rozkładu węglowodanów,<br />
a hodowle przesłać do referencyjnego lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium centralnego. Wstępne wyniki<br />
powinny być przedstawiane lekarzowi na każdym etapie identyfikacji (barwienie<br />
metodą Grama, wzrost, aglutynacja itp.), z komentarzem, że zostanie przygotowany<br />
rap<strong>or</strong>t końcowy.<br />
Kolonie Gram-dodatnich pałeczek z brzeżną strefą β-hemolizy na agarze z krwią<br />
mogą wskazywać na Listeria monocytogenes. Zalecane jest wykonanie następujących<br />
testów potwierdzenia: dodatnia reakcja z katalazą, ruch w podłożu<br />
płynnym lub w MIU, wzrost i czarne przebarwienie na agarze z żółcią i eskuliną.<br />
39
PŁYN MÓZGOWO-RDZENIOWY<br />
Oznaczanie lekowrażliwości<br />
W przypadku Gram-ujemnych pałeczek i gronkowców należy zastosować<br />
standardową metodę krążkową (Kirby-Bauera).<br />
Niepotrzebne jest oznaczanie lekowrażliwości dla szczepów Listeria monocytogenes,<br />
S. agalactiae lub N. meningitidis, ponieważ w tej grupie op<strong>or</strong>ność na<br />
ampicylinę i benzylopenicylinę jest wyjątkowo rzadka.Wszystkie szczepy pneumokoków<br />
powinny mieć oznaczoną na agarze z krwią wrażliwość na chl<strong>or</strong>amfenikol<br />
i benzylopenicylinę. W ostatnim przypadku zalecany jest test krążkowy<br />
z oksacyliną (1 µg) (patrz str. 84, ,,Zakażenia dolnych dróg oddechowych’’).<br />
Szczepy H. influenzae powinny mieć oznaczoną wrażliwość na chl<strong>or</strong>amfenikol na<br />
agarze czekoladowym lub wzbogaconym krwią. Większość ampicylinoop<strong>or</strong>nych<br />
szczepów wytwarza β-laktamazy, których obecność można wykazać wykonując<br />
szybkie testy rekomendowane do badań skriningowych dla β-laktamazododatnich<br />
gonokoków (str. 92).<br />
40
Mocz<br />
Wprowadzenie<br />
Mocz jest materiałem najczęściej pobieranym do badań. Sprawia także najwięcej<br />
problemów, związanych z właściwym pobraniem, wyb<strong>or</strong>em metod hodowli<br />
i interpretacją wyników. Podobnie jak w przypadku innych materiałów, uzupełniające<br />
inf<strong>or</strong>macje dostarczone przez lekarza pozwalają lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium na uzyskanie<br />
możliwie najlepszych wyników posiewu.<br />
Najczęstszą lokalizacją zakażeń układu moczowego jest pęcherz moczowy<br />
(cystitis) i cewka moczowa. Stąd infekcja drogą wstępującą może dotrzeć do<br />
moczowodów (ureteritis), a następnie objąć nerkę (pyelonephritis). Kobiety są<br />
bardziej predysponowane do zakażeń układu moczowego niż mężczyźni, trudniejsze<br />
w ich przypadku jest także prawidłowe pobranie próbki moczu.<br />
Zarówno u kobiet, jak i mężczyzn zakażenie układu moczowego może przebiegać<br />
bezobjawowo, ostro lub przewlekle. Bezobjawowe infekcje mogą być zdiagnozowane<br />
przez posiew. Ostre zakażenie obserwowane jest częściej u kobiet<br />
(w różnym wieku); pacjenci zwykle leczeni są ambulat<strong>or</strong>yjnie i rzadko poddawani<br />
hospitalizacji. Przewlekłe zakażenie u mężczyzn, podobnie jak i u kobiet<br />
w każdym wieku, zwykle skojarzone jest z ch<strong>or</strong>obą podstawową (np.: odmiedniczkowe<br />
zapalenie nerek, ch<strong>or</strong>oba prostaty, wady wrodzone układu moczowo-<br />
-płciowego) i wiąże się z częstszą hospitalizacją. Bezobjawowe, ostre i przewlekłe<br />
zakażenia układu moczowego to trzy różne jednostki ch<strong>or</strong>obowe, dlatego wyniki<br />
badań lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych często wymagają różnej interpretacji.<br />
Bezobjawowe odmiedniczkowe zapalenie nerek u kobiet może pozostać nierozpoznane,<br />
często diagnozowane jest dopiero po wykonaniu dokładnego ilościowego<br />
badania mikrobiologicznego moczu. Występujące powszechnie przewlekłe<br />
zapalenie prostaty często jest przyczyną nawracających zakażeń układu<br />
moczowego.<br />
Niezależnie od typu najczęstszym czynnikiem etiologicznym zakażenia układu<br />
moczowego są bakterie jelitowe, w tym izolowana znacznie częściej niż inne<br />
patogeny Escherichia coli. U około 10% pacjentów mogą być obecne dwa<br />
patogeny jednocześnie odpowiedzialne za proces ch<strong>or</strong>obowy. Obecność trzech<br />
i więcej różnych drobnoustrojów w posiewie moczu zdecydowanie wskazuje na<br />
niewłaściwe pobranie materiału do badania lub zanieczyszczenie próbki. Obecność<br />
licznych patogenów obserwowana jest u pacjentów zzałożonym na stałe<br />
cewnikiem moczowym.<br />
Pobieranie materiału do badania<br />
W badaniu mikrobiologicznym moczu trudno przecenić znaczenie prawidłowego<br />
pobrania próbek moczu, transp<strong>or</strong>tu do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium <strong>or</strong>az badania wstępnego<br />
i posiewu. Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium jest odpowiedzialne za dostarczenie lekarzowi sterylnych,<br />
szklanych lub plastikowych kubków, słoików czy innych odpowiednich<br />
pojemników o szerokim wlocie. Powinny one zostać wysterylizowane g<strong>or</strong>ącym<br />
suchym powietrzem w autoklawie, następnie szczelnie zamknięte, a wieczka<br />
przykryte folią aluminiową.<br />
41
MOCZ<br />
Próbka moczu może zostać pobrana z wyk<strong>or</strong>zystaniem metod chirurgicznych, np.:<br />
przez nakłucie nadłonowe pęcherza moczowego, cystoskopię lub cewnikowanie.<br />
W innym przypadku lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium powinno dopilnować, aby mocz został pobrany<br />
ze środkowego strumienia po dokładnym umyciu okolicy cewki moczowej,<br />
zwłaszcza u kobiet i dzieci. Ponieważ mocz sam jest dobrą pożywką dla<br />
drobnoustrojów, posiew powinien zostać wykonany w ciągu 2 godzin od pobrania<br />
lub przechowywany w chłodziarce w 4°C do czasu dostarczenia do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
i posiany nie później niż 18 godzin od pobrania.<br />
Jeśli to możliwe, do posiewu należy użyć moczu pobranego rano. Zaleca się<br />
poprosić pacjenta w przeddzień wiecz<strong>or</strong>em o powstrzymanie się od oddania<br />
moczu do chwili pobrania próbki.<br />
Pacjentki powinny:<br />
1. Umyć dokładnie ręce wodą z mydłem i wytrzeć w czysty ręcznik.<br />
2. Rozchylić wargi sromowe, łechtaczkę i wargi sromowe przemyć starannie<br />
sterylnym płatkiem gazy i ciepłą wodą z mydłem, w kierunku od przodu do<br />
tyłu. Nie powinno się używać środków do dezynfekcji.<br />
3. Spłukać dokładnie łechtaczkę i wargi sromowe ciepłą wodą i osuszyć<br />
sterylnym płatkiem gazy. Podczas tej czynności wargi sromowe powinny<br />
pozostawać rozchylone, pacjentka nie powinna dotykać umytej powierzchni<br />
palcami.<br />
4. Oddać niewielką ilość moczu. Następnie zebrać większość pozostałego moczu<br />
do sterylnego pojemnika, zamykając pokrywkę zaraz po pobraniu próbki. Jest<br />
to próbka ze środkowego strumienia moczu.<br />
5. Zanieść do pielęgniarek zamknięty pojemnik, który powinien zostać niezwłocznie<br />
dostarczony do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
Pacjenci powinni:<br />
1. Umyć dokładnie ręce wodą z mydłem i wytrzeć w czysty ręcznik.<br />
2. Odsunąć napletek (jeśli pacjent nie jest obrzezany) i umyć żołądź sterylnym<br />
płatkiem gazy i ciepłą wodą z mydłem. Nie powinno się używać środków do<br />
dezynfekcji.<br />
3. Spłukać dokładnie żołądź ciepłą wodą i osuszyć sterylnym płatkiem gazy.<br />
Podczas tej czynności pacjent nie powinien dotykać palcami umytej powierzchni.<br />
4. Nasunąć napletek i oddać niewielką ilość moczu. Trzymając nasunięty<br />
napletek pacjent powinien zebrać większość pozostałego moczu do sterylnego<br />
pojemnika, zamykając pokrywkę zaraz po pobraniu. Jest to próbka ze<br />
środkowego strumienia moczu.<br />
5. Zanieść do pielęgniarek zamknięty pojemnik, który powinien zostać niezwłocznie<br />
dostarczony do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
Dla pacjentów leżących obowiązuje ta sama procedura, z wyjątkiem konieczności<br />
sk<strong>or</strong>zystania z pomocy pielęgniarki lub, jeśli to konieczne, wykonania przez nią<br />
całej <strong>procedury</strong> przygotowania pacjenta przed oddaniem moczu.<br />
W obydwu sytuacjach powinny zostać podjęte starania, aby właściwie pobrać<br />
mocz do sterylnego pojemnika <strong>or</strong>az aby niezwłocznie przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
próbkę wraz z inf<strong>or</strong>macjami o pacjencie, rozpoznaniem klinicznym, z zachowaniem<br />
wymaganych procedur.<br />
42
CZE˛ŚĆ I<br />
Niemowlęta i dzieci<br />
Uzyskanie właściwie pobranej próbki moczu w przypadku ch<strong>or</strong>ych leżących<br />
i nie współpracujących niemowląt <strong>or</strong>az dzieci może stanowić problem.<br />
Należy podać dziecku wodę lub inny napój do wypicia. Umyć narządy płciowe<br />
zewnętrzne. Dziecko można posadzić na kolanach matki, pielęgniarki<br />
lub innej osoby z personelu medycznego, która powinna zachęcić dziecko do<br />
oddania jak największej ilości moczu do sterylnego pojemnika. Pojemnik należy<br />
zamknąć i dostarczyć do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium, gdzie niezwłocznie podjęta zostanie<br />
diagnostyka.<br />
Hodowla i interpretacja<br />
Wszystkie próbki moczu dostarczone do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium medycznego powinny być<br />
od razu posiane lub umieszczone w chłodziarce w 4°C do momentu wykonania<br />
badania. Procedura badania obejmuje następujące etapy:<br />
1. Barwienie preparatów metodą Grama.<br />
2. Testy przesiewowe w kierunku znamiennej bakteriurii.<br />
3. Hodowle próbek moczu, w których wykazano obecność drobnoustrojów<br />
w badaniach przesiewowych i wszystkich próbek uzyskanych podczas<br />
cystoskopii, przez nakłucie nadłonowe (suprapubic bladder puncture — SBP)<br />
i cewnikowanie.<br />
4. Badanie lekowrażliwości izolatów bakteryjnych o znaczeniu klinicznym.<br />
Przygotowanie preparatów i barwienie metodą Grama jest ważnym elementem<br />
diagnostyki <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j. Używając sterylnej pipety Pasteura (jedna dla jednej<br />
próbki) należy nanieść na szkiełko kroplę wstrząśniętego, nie odwirowanego<br />
moczu. Pozostawić kroplę do wyschnięcia, bez rozmazywania, utrwalić przez<br />
podgrzanie i wybarwić. Oglądać używając olejku immersyjnego (w powiększeniu<br />
× 600 lub więcej) — poszukiwać bakterii, polim<strong>or</strong>ficznych leukocytów i komórek<br />
płaskonabłonkowych.<br />
Jedna lub więcej komórek bakteryjnych w polu widzenia w olejku immersyjnym<br />
zwykle wskazuje na obecność 10 5 lub więcej bakterii w mililitrze próbki.<br />
Obecność jednego lub więcej leukocytów w polu widzenia w olejku immersyjnym<br />
jest kolejną wskazówką zakażenia układu moczowego. W niezakażonych próbkach<br />
moczu bakterie i leukocyty występują w niewielkiej liczbie lub nie stwierdza<br />
się ich wcale. W próbkach pochodzących od pacjentek wykazanie licznych<br />
komórek płaskonabłonkowych, bez lub z obecnością bakterii, wskazuje na<br />
zanieczyszczenie fl<strong>or</strong>ą pochwową i konieczność powtórnego badania z oceną<br />
liczby bakterii w polu widzenia. Jeśli konieczny jest szybki wynik badania,<br />
lekarzowi powinna być dostarczona wstępna ocena barwionych preparatów<br />
z inf<strong>or</strong>macją o prowadzonej hodowli.<br />
Metody badań przesiewowych<br />
Brak leukocytów i bakterii w preparatach moczu barwionych metodą Grama,<br />
pochodzących z próbek pobranych według powyżej opisanych zasad, wyklucza<br />
infekcję. ,,Ujemna’’ próbka moczu w starannie wykonanym badaniu mikroskopowym<br />
nie musi być poddana hodowli. Alternatywnym prostym i skutecznym<br />
testem przesiewowym jest test paskowy na obecność esterazy leukocytowej<br />
43
MOCZ<br />
(redukcji azotanów). Paski zanurza się w próbce moczu zgodnie z instrukcją<br />
zawartą w ulotce. Różowe zabarwienie jest dodatnim wynikiem i wskazuje na<br />
obecność esterazy leukocytowej i/lub bakteriurię rzędu 10 5 w 1 ml. Próbki<br />
dodatnie w testach przesiewowych należy jak najszybciej poddać hodowli, aby<br />
zapobiec przerostowi przez nieznaczące szczepy. Jeśli paski nie wykażą różowego<br />
zabarwienia, badanie przesiewowe interpretowane jest jako ujemne i hodowla<br />
nie jest konieczna. Testy paskowe nie są wystarczająco czułe, aby wykryć<br />
bakteriurię mniejszą niż 10 5 komórek w 1 ml moczu.<br />
Posiew ilościowy i wstępna identyfikacja<br />
Zalecane są dwie metody posiewu ilościowego i wstępnej identyfikacji: metoda<br />
zużyciem kalibrowanej ezy <strong>or</strong>az metoda z użyciem zanurzonego papierowego<br />
filtra paskowego.<br />
Metoda z użyciem kalibrowanej ezy<br />
Zalecane jest użycie kalibrowanej plastikowej lub platynowej ezy, za pomocą<br />
której należy przenieść 1 µl moczu na podłoże do hodowli (agar MacConkeya<br />
z fioletem krystalicznym i nieselektywny agar z krwią).<br />
1. Wstrząsnąć delikatnie mocz, a następnie przechylić i 1-mikrolitrową ezą<br />
dotknąć powierzchni w taki sposób, aby zawiesić w niej płyn. Nigdy nie<br />
zanurzać oczka ezy w moczu.<br />
2. Umieścić 1 µl moczu na podłożu agarowym z krwią i rozmazać, tw<strong>or</strong>ząc prostą<br />
linię do środka płytki (1), następnie gęstym zygzakiem, pod kątem w prawo,<br />
przez początkową linię (2) i na koniec skośnym zygzakiem, przecinającym<br />
dwa poprzednie pasma (3) (ryc. 3).<br />
3. Posiać na podłoże MacConkeya w ten sam sposób.<br />
4. Inkubować płytki przez noc w 35°C.<br />
Agar z krwią i podłoże MacConkeya można zastąpić innymi nieselektwnymi<br />
podłożami (np.: CLED 1 , agar z fioletem krystalicznym i laktozą).<br />
Metoda pasków bibułowych<br />
Metoda pasków bibułowych Leigh&Williams 2 polega na abs<strong>or</strong>pcji określonej<br />
ilości moczu, który następnie jest przenoszony na płytkę zwłaściwym podłożem<br />
agarowym.<br />
Paski o długości 7,5 cm i szerokości 0,6 cm mogą być przygotowane na miejscu<br />
zużyciem specjalnego typu bibuły (patrz ryc. 4). Są oznaczone ołówkiem z jednej<br />
strony — 1,2 cm od końca. Metoda pasków bibułowych przed wprowadzeniem do<br />
rutynowych badań powinna zostać p<strong>or</strong>ównana z metodą zużyciem kalibrowanej<br />
ezy.<br />
Bibułowe paski należy przygotować w odpowiedniej ilości, umieścić we<br />
właściwym pojemniku i autoklawować. Sterylne paski są komercyjnie dostępne.<br />
1<br />
CLED: z niedob<strong>or</strong>em cystyny, laktozy i elektrolitów; Cystine-Lactose-Electrolyte Deficient.<br />
2<br />
Leigh D.A., Williams J.D.: Metoda wyk<strong>or</strong>zystywana do oznaczenia znamiennej bakteriurii<br />
w szerokiej grupie pacjentów. Journal of Clinical Pathology, 1964, 17: 498 – 503.<br />
44
CZE˛ŚĆ I<br />
Ryc. 3.<br />
Posiew bakterii na płytki hodowlane.<br />
1,2 cm 0,6 cm<br />
6,3 cm<br />
Ryc. 4. Bibułowy pasek stosowany w metodzie Leigh & Williamsa.<br />
WHO 91125<br />
CFU — colony-f<strong>or</strong>ming units (jednostki tw<strong>or</strong>za˛ce kolonie)<br />
Ryc. 5. Odciski zanurzonych w moczu bibułowych pasków napłytce agarowej i przeliczenie<br />
liczby kolonii na liczbę żywych komórek bakterii w 1 ml.<br />
Dla każdej badanej próbki moczu wyjąć z pojemnika sterylny pasek. Oznaczony<br />
koniec zanurzyć do wyznaczonej linii w dokładnie wstrząśniętej próbce moczu.<br />
Pasek natychmiast wyciągnąć, nadmiar moczu zostanie wchłonięty.<br />
Obszar poniżej oznaczenia, który zagina się na kształt litery ,,L’’, należy umieścić<br />
na 2 – 3 sekundy na płytce z agarem brolacynowym 1 lub agarze z fioletem<br />
krystalicznym i laktozą. Na jednej płytce można posiać kilka pasków, dzieląc<br />
powierzchnię na maksymalnie 16 prostokątów (ryc. 5). Należy zapewnić możliwość<br />
identyfikacji każdego prostokąta na podstawie numeru lub nazwiska<br />
pacjenta. Wyciągnąć drugi pasek z pojemnika i dokładnie powtórzyć procedurę,<br />
wykonując kolejne odciski identycznie jak pierwsze. Po naniesieniu duplikatu<br />
1<br />
Agar laktozowo-cystynowy z błękitem bromotymolowym.<br />
45
MOCZ<br />
odcisków płytkę inkubować w 35– 37°C, a następnie zliczyć wyrosłe<br />
kolonie z powierzchni każdego odcisku paska. Posługując się ryc. 5, na podstawie<br />
średniej liczby kolonii każdej pary pasków, można określić liczbę bakterii w 1 ml<br />
moczu.<br />
Natychmiast po wykonaniu powyższej <strong>procedury</strong>, używając sterylnej ezy, posiać<br />
próbki moczu na pół płytki agaru MacConkeya (z fioletem krystalicznym).<br />
Hodowla na agarze z krwią ułatwia szybką identyfikację Gram-dodatnich<br />
ziarenkowców. Płytki należy inkubować przez noc w temperaturze 35 – 37°C<br />
i następnego dnia ocenić wzrost. Do identyfikacji użyć izolowanych kolonii<br />
o podobnym wyglądzie. Jeśli istnieje taka potrzeba, inoculum konieczne do<br />
oznaczenia lekowrażliwości szczepu metodą dyfuzyjno-krążkową można przygotować<br />
z każdej z płytek (str. 112). W ten sposób następnego dnia dostępne będą<br />
zarówno wyniki identyfikacji, jak i lekowrażliwości.<br />
Interpretacja wyników posiewu ilościowego<br />
moczu<br />
Przez wiele lat warunkiem rozpoznania zakażenia układu moczowego było<br />
wykazanie obecności co najmniej 10 5 jednostek tw<strong>or</strong>zących kolonie (CFU<br />
— colony-f<strong>or</strong>ming units) w 1 ml odpowiednio pobranego moczu ze środkowego<br />
strumienia. Założenie to zostało zakwestionowane; według niektórych ekspertów<br />
obecność 10 4 CFU lub mniej może świadczyć o infekcji. Inni twierdzą, że<br />
obecność polim<strong>or</strong>ficznych leukocytów odgrywa istotną rolę w patologii i klinicznej<br />
manifestacji zakażenia układu moczowego. Nie można zdefiniować precyzyjnie<br />
minimalnej liczby bakterii w 1 ml moczu, która jednoznacznie świadczy<br />
o ZUM. Ogólne zasady sp<strong>or</strong>ządzania rap<strong>or</strong>tów przedstawiono poniżej.<br />
Kateg<strong>or</strong>ia 1: mniej niż 10 4 CFU w 1 ml. W rap<strong>or</strong>cie prawdopodobnie brak<br />
ZUM. (Wyjątki: jeśli mniej niż 10 4 CFU w 1 ml moczu pobranego<br />
bezpośrednio z pęcherza moczowego przez nakłucie nadłonowe<br />
lub cystoskopię; u kobiet z objawami zakażenia lub<br />
leukocyturią należy przeprowadzić identyfikację i wykonać antybiogram.)<br />
Kateg<strong>or</strong>ia 2: 10 4 – 10 5 CFU w 1 ml. Jeśli pacjent bez objawów, powtórzyć<br />
badanie moczu. Jeśli pacjent zgłasza objawy zakażenia układu<br />
moczowego, przeprowadzić identyfikację i wykonać antybiogram<br />
jednego lub dwu różnych obecnych w moczu typów kolonii<br />
bakteryjnych. Powyższa liczba bakterii przemawia za zakażeniem<br />
układu moczowego u pacjentów z objawami lub z leukocyturią.<br />
Jeśli liczba bakterii, jakość próbki moczu lub charakter zgłaszanych<br />
objawów wzbudzają wątpliwości, należy powtórzyć badanie.<br />
Rap<strong>or</strong>t powinien zawierać wartość CFU.<br />
Kateg<strong>or</strong>ia 3: więcej niż 10 5 CFU w 1 ml. Przedstawić wynik lekarzowi,<br />
przeprowadzić identyfikację i wykonać antybiogram jednego lub<br />
dwu różnych obecnych w moczu typów kolonii bakteryjnych.<br />
Powyższa liczba bakterii zdecydowanie wskazuje na zakażenie<br />
układu moczowego u wszystkich pacjentów, również u kobiet bez<br />
objawów zakażenia.<br />
Jeśli w próbkach moczu kateg<strong>or</strong>ii 2 lub 3 obecne są więcej niż dwa różne typy<br />
bakterii, należy przedstawić wynik jako: ,,Prawdopodobnie materiał zanieczyszczony.<br />
Proszę dostarczyć świeżą próbkę moczu ze środkowego strumienia’’.<br />
46
CZE˛ŚĆ I<br />
Identyfikacja<br />
Identyfikacja powinna zostać przeprowadzona możliwie najszybciej. Jeśli masywna<br />
infekcja dróg moczowych wywołana jest przez E. coli, do identyfikacji<br />
czerwonych kolonii na podłożu agarowym MacConkeya należy użyć szybkiego<br />
testu.<br />
Test β-glukuronidazowy do szybkiej identyfikacji<br />
E. coli 1<br />
Test określa zdolność drobnoustroju do wytwarzania enzymu β-glukuronidazy.<br />
Enzym hydrolizuje kwas 4-nitrofenylo-β-D-glukopyranozydouronowy (PGUA),<br />
produkt reakcji kwasu glukuronowego i p-nitrofenolu. Pojawienie się żółtego<br />
zabarwienia wskazuje na reakcję dodatnią.<br />
Procedura<br />
1. Przygotować gęstą mleczną zawiesinę bakterii w małej probówce zawierającej<br />
0,25 ml fizjologicznego roztw<strong>or</strong>u soli. Zawiesina powinna zostać przygotowana<br />
z kolonii rosnących na podłożu agarowym MacConkeya.<br />
2. Rozpuścić 300 mg kwasu 4-nitrofenylo-β-D-glukopyranozydouronowego<br />
(PGUA) i 100 mg wyciągu drożdży (Oxoid L21) 2 w 20 ml buf<strong>or</strong>u fosf<strong>or</strong>anowego<br />
(buf<strong>or</strong> Tris, pH 8,5). Uzyskać pH 8,5 ± 0,1. Dodać 0,25 ml podłoża<br />
do każdej z przygotowanych sterylnych probówek. Zamknąć probówki.<br />
Oznaczyć probówki jako PGUA i wpisać datę.<br />
3. Zawiesić w jednej z probówek z PGUA badaną gęstą zawiesinę bakterii.<br />
Inkubować probówkę przez 4 godziny w 35°C. Pojawienie się żółtego<br />
zabarwienia wskazuje na obecność β-glukuronidazy (wynik dodatni); jeśli nie<br />
pojawia się zmiana zabarwienia, wynik jest ujemny. Obecność żółtego<br />
pigmentowania wskazuje na brak wiarygodności testu; w takich przypadkach<br />
test należy powtórzyć.<br />
Szczepy kontrolne:<br />
Escherichia coli dodatni (żółty) wynik<br />
Shigella flexneri ujemny (bezbarwny) wynik<br />
Tabletki PGUA są dostępne komercyjnie.<br />
Oznaczanie lekowrażliwości<br />
Antybiogram (str. 112) powinien być wykonany tylko dla istotnych, według<br />
przedstawionych powyżej kryteriów, czystych hodowli zawierających kolonie<br />
o jednakowej m<strong>or</strong>fologii. Oznaczanie wrażliwości ma zazwyczaj większe<br />
znaczenie dla pacjentów hospitalizowanych lub z nawracającymi zakażeniami<br />
dróg moczowych w wywiadzie. Szczepy uzyskane w posiewach od pacjenta<br />
z ZUM występującym po raz pierwszy mogą nie wymagać wykonania antybiogramu.<br />
1<br />
Kilian M., B<strong>or</strong>row P.: Rapid diagnosis of Enterobacteriaceae. 1. Detection of bacterial glycosidases.<br />
Acta Pathologica et Microbiologica Scandinavica, Section B, 1976, 84: 245 – 251.<br />
2<br />
Dostępny z Oxoid Ltd, Wade Road, Basingstoke, Hampshire, RG24 8PW, England.<br />
47
Kał<br />
Wprowadzenie<br />
Zakażenia bakteriami jelitowymi, wywołującymi biegunkę, czerwonkę i g<strong>or</strong>ączki<br />
jelitowe, stanowią ważny problem zdrowotny na świecie. Infekcje biegunkowe są<br />
drugą po ch<strong>or</strong>obach sercowo-naczyniowych, a wśród dzieci najczęstszą przyczyną<br />
zgonu. W krajach rozwijających się z powodu biegunek rocznie umiera<br />
1,5 miliona dzieci w wieku od 1 roku do 4 lat. Ryzyko zgonu w tej grupie<br />
wiekowej jest 600-krotnie wyższe niż w krajach rozwiniętych. W niektórych<br />
krajach rozwijających się biegunki występują u dzieci dziesięć lub więcej razy<br />
w ciągu roku.<br />
Dzieci ulegając zakażeniom licznymi patogenami, często bez wystąpienia<br />
biegunki, wydalają zkałem potencjalnie ch<strong>or</strong>obotwórcze szczepy. Prowadzone<br />
obserwacje wykazały, że aktywna immunizacja przez wielokrotną ekspozycję<br />
<strong>or</strong>az przedłużony okres karmienia piersią mogą zapobiegać zach<strong>or</strong>owaniom<br />
i zabezpieczać przed wystąpieniem biegunek. Na uwagę zasługują trudności<br />
w ustaleniu czynnika etiologicznego biegunki w hodowli z pojedynczej próbki<br />
kału.<br />
Ze względu na wzrost częstości zakażeń HIV/AIDS i stosowanie chemioterapii<br />
immunosupresyjnej, biegunka pojawiająca się u pacjentów z niedob<strong>or</strong>em odp<strong>or</strong>ności<br />
stanowi c<strong>or</strong>az poważniejsze wyzwanie. Zakażenia te występują wpóźniejszym<br />
okresie ch<strong>or</strong>oby, ch<strong>or</strong>zy z HIV/AIDS są często leczeni do końca życia,<br />
a uzyskanie poprawy jest trudne. Lista bakterii jelitowych wywołujących<br />
biegunkę u pacjentów z HIV/AIDS jest długa i obejmuje: Campylobacter,<br />
Salmonella, Shigella <strong>or</strong>az mykobakterie. Ocenia się,że salmonelozy u pacjentów<br />
z HIV/AIDS, w p<strong>or</strong>ównaniu do osób niezakażonych, występują 20-krotnie<br />
częściej, a 5-krotnie częściej dochodzi u nich do bakteriemii. W Zairze 40%<br />
pacjentów z HIV/AIDS zgłaszało przewlekłą biegunkę, a u 84% pacjentów<br />
z biegunką utrzymującą się dłużej niż miesiąc wykryto zakażenie HIV.<br />
Czynniki etiologiczne i objawy kliniczne<br />
Rodzaj Salmonella obejmuje ponad 2000 serotypów. Wiele z nich może<br />
wywoływać infekcje zarówno u ludzi, jak i u zwierząt domowych. U ludzi<br />
zakażenie prowadzi do rozwoju nieżytu żołądka i jelit, duru brzusznego<br />
i bakteriemii z zajęciem lub bez zajęcia innych narządów. Nieżyt żołądka i jelit<br />
wywołany przez Salmonella zaczyna się zwykle nudnościami, wymiotami,<br />
kolkowym bólem brzucha i biegunką 8 – 48 godzin od spożycia skażonego<br />
pokarmu. Bez leczenia objawy utrzymują się zazwyczaj 3 – 5 dni. Leczenie<br />
przeciwbakteryjne nie przyspiesza ustąpienia objawów klinicznych, a może<br />
przedłużyć okres rekonwalescencji i bezobjawowego stanu nosicielstwa. W niepowikłanych<br />
przypadkach zakażeń wykonanie antybiogramu i leczenie przeciwbakteryjne<br />
nie są zalecane. Zastosowanie antybiotyków jest wskazane w przypadku<br />
wystąpienia bakteriemii. Niektórzy pacjenci stając się bezobjawowymi<br />
nosicielami Salmonella spp. mogą wydalać bakterie z kałem i moczem przez rok<br />
lub dłużej. Dodatnie posiewy z kału uzyskuje się przez okres dłuższy niż rok<br />
u około 3% pacjentów z durem brzusznym i u 0,2 – 0,6% pacjentów z zakażeniem<br />
innym serotypem Salmonella.<br />
48
CZE˛ŚĆ I<br />
Zakażenie Shigella spp. może przebiegać wróżny sposób: od bezobjawowych<br />
infekcji przez biegunkę bez g<strong>or</strong>ączki do czerwonki o ciężkim przebiegu. Objawy<br />
obejmują kolkowe bóle brzucha, nieefektywne i bolesne parcie (tenesmus) <strong>or</strong>az<br />
częste oddawanie małej objętości podbarwionych krwią stolców. Shigella spp. jest<br />
główną przyczyną czerwonki bakteryjnej, przed enteroinwazyjnymi i enterokrwotocznymi<br />
E. coli. Wiele przypadków ch<strong>or</strong>oby o średnim nasileniu nie<br />
wymaga leczenia przyczynowego. Jednakże w ciężkich zakażeniach lub gdy<br />
istnieje ryzyko rozwoju wtórnego rozsiewu w <strong>or</strong>ganizmie, wskazane jest<br />
zastosowanie antybiotykoterapii po wcześniejszym określeniu lekowrażliwości,<br />
koniecznym ze względu na dużą w wielu krajach op<strong>or</strong>ność na powszechnie<br />
stosowane antybiotyki. Znane są cztery grupy Shigella, obejmujące 39 serotypów<br />
i podtypów. Grupa A (S. dysenteriae), grupa B (S. flexneri), obejmująca liczne<br />
serotypy grupa C (S. boydii) <strong>or</strong>az grupa D (S. sonnei), do której należy tylko jeden<br />
serotyp. Najczęściej izolowanymi gatunkami Shigella w krajach rozwijających się<br />
są S. dysenteriae i S. flexneri, podczas gdy w krajach rozwiniętych występuje<br />
głównie S. sonnei.<br />
Zidentyfikowano co najmniej sześć różnych klas Escherichia coli wywołujących<br />
biegunki: enteropatogenne E. coli (EPEC), enterotoksyczne E. coli (ETEC),<br />
enterokrwotoczne i produkujące werotoksynę E. coli (EHEC lub VTEC),<br />
enteroinwazyjne E. coli (EIEC), enteroadhezyjne E. coli (EAEC) <strong>or</strong>az enteroagregacyjne<br />
E. coli (EAggEC). Cztery z powyższych klas są częstą przyczyną<br />
ch<strong>or</strong>ób biegunkowych w krajach rozwijających się. Jednakże identyfikacja<br />
szczepów wymaga przeprowadzenia testów serologicznych, testów toksyczności<br />
na hodowlach komórkowych, oceny patogeniczności na zwierzętach <strong>or</strong>az zastosowania<br />
sond genetycznych, które pozostają poza zakresem możliwości<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium średniego stopnia referencyjności. Wstępna identyfikacja najczęściej<br />
występującego serotypu O157:H7 szczepów VTEC możliwa jest na podstawie<br />
charakterystycznie ujemnego testu z s<strong>or</strong>bitolem. Test ten jednak jest<br />
ujemny także w przypadku E. fergusonii i E. hermanii. S<strong>or</strong>bitoloujemne szczepy<br />
E. coli wymagają więc dodatkowej identyfikacji przez serotypowanie z użyciem<br />
surowicy odp<strong>or</strong>nościowej E. coli O157. Wykazanie wytwarzania werotoksyny<br />
wskazuje na szczep VTEC.<br />
Cholera jest typowym przykładem toksycznej infekcji. Wszystkie objawy są<br />
związane z utratą płynów, spowodowaną działaniem wytwarzanej w jelitach<br />
enterotoksyny Vibrio cholerae. Stolec jest obfity, wodnisty i nie zawiera komórek<br />
zapalnych. Głównym celem leczenia jest uzupełnianie utraty płynów, a leczenie<br />
przeciwbakteryjne ma znaczenie jedynie drugoplanowe.<br />
V. cholerae rozprzestrzenia się bardzo szybko. Na podstawie różnic w antygenach<br />
somatycznych O wyróżnia się kilka serotypów, a serotyp O1 występuje w dwóch<br />
odmianach, określanych jako ,,klasyczna’’ i ,,El T<strong>or</strong>’’. Do 1992 roku uważano, że<br />
tylko serotyp O1 V. cholerae (klasyczny lub El T<strong>or</strong>) może wywołać epidemię<br />
cholery, a pozostałe serogrupy odpowiedzialne są za sp<strong>or</strong>adyczne przypadki<br />
cholery i zakażenia pozajelitowe. W 1992 roku na wschodnim wybrzeżu Indii<br />
wybuchła epidemia, która szybko rozprzestrzeniła się na sąsiednie kraje. Ta<br />
epidemia była wywołana V. cholerae należącym do wcześniej nieznanej<br />
serogrupy O139 Bengal. V. cholerae O139 izolowano dotychczas w 10 krajach<br />
południowo-wschodniej Azji, ale serotyp ten wydaje się zanikać.<br />
V. parahaemolyticus i kilka innych gatunków Vibrio (V. fluvialis, V. hollisae,<br />
V. mimicus)iAeromonas (A. hydrophila, A. sobria, A. caviae) wywołują zatrucia<br />
pokarmowe lub nieżyty żołądkowo-jelitowe u osób spożywających surowe lub<br />
niedogotowane owoce m<strong>or</strong>za.<br />
49
KAŁ<br />
W większości regionów świata Campylobacter jejuni i C. coli okazały się<br />
głównymi patogenami jelitowymi, które są izolowane równie często jak Salmonella<br />
i Shigella spp. Badania przeprowadzone wśród dzieci w Afryce i Azji<br />
wykazały, że częstość zakażeń wynosi od 19 do 38%, a bezobjawowe nosicielstwo<br />
dotyczy od 9 do 40% badanych. Ch<strong>or</strong>oba może mieć różny przebieg, od<br />
samoograniczającego się, krótkotrwałego zapalenia jelita cienkiego po pi<strong>or</strong>unujące<br />
zapalenie jelita cienkiego i okrężnicy, z ciężką biegunką, kolką brzuszną,<br />
g<strong>or</strong>ączką i bólami mięśniowymi. Stolce są początkowo śluzowe i płynne,<br />
a następnie mogą zmienić się w chlustające, wodniste, zawierające krew i ropę.<br />
Objawy wycofują się zwykle po tygodniu.<br />
U około 25% pacjentów dochodzi do nawrotu, który zwykle ma łagodniejszy<br />
przebieg. Infekcja ustępuje zazwyczaj samoistnie, bez antybiotykoterapii, stąd<br />
określanie lekowrażliwości izolowanych szczepów nie jest konieczne.<br />
Arcobacter butzleri, traktowane dotychczas jako rosnące w niskiej temperaturze<br />
Campylobacter, zostały ostatnio uznane za przyczynę biegunek występujących<br />
u dzieci w krajach rozwijających się.<br />
Występowanie u ludzi infekcji wywołanych Yersinia enterocolitica obserwowano<br />
głównie w północnej Europie, Japonii i Stanach Zjednoczonych. Większość<br />
izolowanych patogenów pochodziła od dzieci ze sp<strong>or</strong>adycznie występującą<br />
biegunką.<br />
Clostridium difficile jest główną przyczyną biegunki poantybiotykowej. Może<br />
wywołać różne postacie ch<strong>or</strong>oby, od średnio nasilonej biegunki do potencjalnie<br />
śmiertelnego pseudobłoniastego zapalenia okrężnicy. Rozpoznanie rzekomo<br />
błoniastego colitis jest możliwe na podstawie badania kolonoskopowego, a potwierdzenie<br />
<strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong> w tym przypadku nie jest konieczne. W diagnostyce<br />
<strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j dostępne są komercyjne testy, w tym hodowla, test aglutynacji<br />
lateksowej wykrywający białka komórkowe, testy ELISA wykrywające cytotoksyny<br />
i/lub enterotoksyny, hodowle komórkowe do oceny toksyczności cytotoksyn.<br />
Wielu pacjentów szpitalnych, zwłaszcza leczonych antybiotykami o szerokim<br />
spektrum działania, wydala bakterie z kałem przy braku objawów. Dlatego też<br />
hodowla bez wykazania obecności toksyn ma ograniczoną wartość diagnostyczną.<br />
Rotawirusy są jedynym niebakteryjnym czynnikiem opisanym w tym miejscu.<br />
Inne wirusy mogą także być przyczyną biegunek, ale rotawirus występuje<br />
podobnie często zarówno w krajach rozwijających się, jak i w krajach rozwiniętych.<br />
Infekcje zwykle pojawiają się u dzieci między 6. a 18. miesiącem<br />
życia, częściej w chłodnych miesiącach roku. Rozpoznanie może być potwierdzone<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnie na podstawie testu immunoenzymatycznego (ELISA) lub<br />
prostszego i bardziej praktycznego testu aglutynacji lateksowej. Odczynniki<br />
potrzebne do wykonania powyższych badań są komercyjnie dostępne, lecz drogie.<br />
Właściwe ukierunkowanie diagnostyki<br />
<strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j<br />
Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium ściśle współpracujące ze szpitalem lub kliniką w krajach rozwijających<br />
się może szybko zostać obciążone nadmierną liczbą próbek do badań.<br />
W większości przypadków czerwonki bakteryjnej i biegunek wykonanie posiewu<br />
nie jest konieczne do podjęcia efektywnego leczenia, ponieważ pacjenci wymagają<br />
jedynie nawodnienia, a nie antybiotykoterapii. W niektórych przypadkach (np.<br />
50
CZE˛ŚĆ I<br />
pacjenci z durem brzusznym) do podjęcia właściwego leczenia wyniki hodowli są<br />
niezbędne. Problem, jak najlepiej wyk<strong>or</strong>zystać ograniczone możliwości (diagnostyki<br />
<strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j — przyp. tłum.) jest wciąż rozważany.<br />
Często najważniejsze stają się aspekty zdrowia publicznego, stąd lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
jest zobligowane do dostarczania danych dotyczących powszechnie występujących<br />
w danym regionie patogenów i ich wrażliwości na antybiotyki, a także<br />
powinno uczestniczyć w badaniu epidemiologicznym. Konieczna jest ścisła<br />
współpraca klinicystów z lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. Utw<strong>or</strong>zenie przez lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium wartościowej<br />
bazy danych jest możliwe na podstawie systematycznie przeprowadzanych,<br />
randomizowanych badań, szpitalnych lub klinicznych pacjentów z biegunką.<br />
Badanie prop<strong>or</strong>cjonalnej części pacjentów umożliwia ograniczenie liczby<br />
próbek, z jednoczesną pełną diagnostyką każdej z nich. Jeśli badania wykonuje się<br />
u określonych, pojedynczych ch<strong>or</strong>ych (np. u co dwudziestego piątego), wyniki<br />
można wyk<strong>or</strong>zystać do oszacowania częstości występowania infekcji w całej<br />
populacji pacjentów. W szczególnych grupach pacjentów lub o szczególnej p<strong>or</strong>ze<br />
roku, w sytuacji pojawienia się typowego zespołu objawów, lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium może<br />
ukierunkować diagnostykę na określony problem.<br />
Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium podejmuje decyzję o ewentualnym ograniczeniu diagnostyki do<br />
pewnych patogenów jelitowych. Yersinia enterocolitica występuje wyjątkowo<br />
rzadko w regionach tropikalnych. Jeśli nie obserwuje się występowania określonego<br />
patogenu w danym regionie, lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium może zrezygnować z wykonywania<br />
wykrywających go testów. W wyniku lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium powinno uwzględnić<br />
fakt wykrywania tylko określonych patogenów. Jeśli wykonywane są badania<br />
jedynie w kierunku Salmonnella i Shigella, w wyniku nie można napisać ,,brak<br />
patogenów’’. Należy umieścić inf<strong>or</strong>mację: ,,nie wykazano obecności Salmonella<br />
i Shigella spp.’’<br />
Pobieranie i przesyłanie próbek kału<br />
Próbki powinny być pobierane we wczesnym okresie biegunki, ponieważ w tym<br />
czasie liczba patogenów w kale jest najwyższa, <strong>or</strong>az, jeśli to możliwe, przed<br />
rozpoczęciem ewentualnej antybiotykoterapii. Próbkę należy pobrać rano i dostarczyć<br />
jądo lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium do południa, tak by można było wykonać badanie tego<br />
samego dnia. Uf<strong>or</strong>mowany stolec należy odrzucić. Najlepszym materiałem do<br />
badań jest świeży kał. Jeżeli jednak pobranie kału nie jest możliwe lub gdy<br />
transp<strong>or</strong>t materiału do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium jest zbyt długi, można pobrać wymaz<br />
z odbytu.<br />
Procedura pobierania kału do badania<br />
Przygotować dla pacjenta dwie drewniane szpatułki i odpowiedniej wielkości<br />
pojemnik ze szczelnym zamknięciem (np.: czysty szklany kubek, plastikowe lub<br />
pokryte warstwą wosku tekturowe pudełko, specjalny pojemnik z łopatką<br />
przymocowaną do wieczka). Nie wolno używać butelek po lekach.<br />
Poinstruować pacjenta, aby oddał stolec na papier toaletowy lub do basenu,<br />
a następnie przeniósł część do pojemnika za pomocą szpatułek.<br />
Próbka powinna zawierać co najmniej 5 g stolca i fragmenty z widoczną krwią,<br />
śluzem lub ropą, jeśli są obecne w kale. Materiał nie powinien być zanieczyszczony<br />
moczem. Po umieszczeniu próbki pojemnik szczelnie zamknąć.<br />
51
KAŁ<br />
Pacjenta należy poinf<strong>or</strong>mować, aby dostarczył materiał do badania natychmiast<br />
po pobraniu. Jeśli dostarczenie próbki do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium w ciągu 2 godzin nie jest<br />
możliwe, należy niewielką ilość materiału (łącznie ze śluzem, krwią i pasmami<br />
nabłonka, jeśli są obecne) podzielić i umieścić w dwu lub trzech pojemnikach<br />
z podłożem transp<strong>or</strong>towym (Cary-Blair, Stuart lub Amies) lub w 33 mmol/l buf<strong>or</strong>u<br />
fosf<strong>or</strong>anowo-glicerolowego. W przypadku cholery i zakażeń innymi Vibrio spp.,<br />
doskonałym (i wzbogaconym) podłożem transp<strong>or</strong>towym jest alkaliczna woda<br />
peptonowa. Patogeny mogą przetrwać w takich warunkach przez okres do<br />
tygodnia w temperaturze pokojowej, chociaż zalecane jest przechowywanie<br />
takich próbek w chłodziarce.<br />
Procedura pobierania wymazów z odbytu<br />
1. Zwilżyć bawełnianą wymazówkę sterylną wodą. Umieścić za zwieraczem<br />
odbytu, obrócić i wyjąć. Sprawdzić, czy widoczna jest wystarczająca ilość<br />
materiału, jeśli nie, powtórzyć czynność. Liczba wymazów uzależniona jest od<br />
rodzaju prowadzonych badań.<br />
2. Jeśli materiał zostanie zbadany w ciągu 1 – 2 godzin, umieścić wymazówkę<br />
w pustej, sterylnej probówce z zatyczką z waty lub zakrętką. Jeśli wymazówka<br />
musi być przechowywana dłużej niż przez 2 godziny, należy umieścić ją<br />
w podłożu transp<strong>or</strong>towym.<br />
Badanie wizualne próbek kału<br />
1. Obejrzeć próbkę, zwracając uwagę na:<br />
– konsystencję (uf<strong>or</strong>mowany, nieuf<strong>or</strong>mowany, płynny),<br />
– kol<strong>or</strong> (biały, żółty, brązowy lub czarny),<br />
– obecność nietypowych elementów (np. śluz, krew).<br />
2. Umieścić niewielką ilość kału lub wymazu z odbytu razem ze śluzem (jeśli jest<br />
obecny) w kropli 0,05% roztw<strong>or</strong>u błękitu metylenowego na czystym szkiełku<br />
i dokładnie wymieszać.<br />
3. Przykryć szkiełkiem nakrywkowym zabarwioną zawiesinę uważając, aby nie<br />
powstałypęcherzyki powietrza. Poczekać 2 – 3 minuty. Oglądać preparat pod<br />
mikroskopem w dużym powiększeniu (obiektyw × 100).<br />
4. Zwrócić uwagę na komórki jednojądrzaste lub o polim<strong>or</strong>ficznych jądrach;<br />
pominąć zdegenerowane komórki.<br />
Badanie wysięku komórkowego biegunkowego kału może dostarczyć wskazówek<br />
pozwalających na identyfikację czynników wywołujących:<br />
– zlepy leukocytów wielojądrzastych (> 50 komórek w polu widzenia), makrofagi<br />
i erytrocyty są typowe dla zakażeń pałeczkami Shigella;<br />
– mniejsza liczba wielojądrzastych leukocytów(< 20 komórek w polu widzenia)<br />
obecna jest w salmonelozach i w zakażeniach inwazyjnymi szczepami E. coli.<br />
W czerwonce pełzakowej większość komórek jest zdegenerowana (cienie<br />
komórek). W około 50% przypadków biegunki wywołanej przez Campylobacter<br />
spp. obecne są leukocyty i erytrocyty;<br />
– w przypadku cholery, zakażeń wywołanych przez enterokrwotoczne i enteropatogenne<br />
E. coli <strong>or</strong>az biegunek wirusowych obecne są nieliczne leukocyty<br />
(2 – 5 komórek w polu widzenia).<br />
52
CZE˛ŚĆ I<br />
Podłoża transp<strong>or</strong>towo-wzbogacaja˛ce<br />
i posiew próbek kału<br />
Podłoża transp<strong>or</strong>towo-wzbogacające są powszechnie stosowane do izolacji<br />
Salmonella spp. i Vibrio cholerae zkału. W przypadku Salmonella spp. zalecane<br />
są buliony zawierające selenin F lub tetrationian, natomiast dla Vibrio cholerae<br />
stosowana jest alkaliczna woda peptonowa (APW, alkaline peptone water).<br />
Podłoża takie nie są zalecane w hodowli Shigella spp., Campylobacter spp.,<br />
Yersinia enterocolitica i Clostridium difficile.<br />
Procedura posiewu na podłoża wzbogacaja˛ce<br />
1. Przygotować zawiesinę kału zawieszając około 1 g próbki w probówce<br />
zawierającej 1 ml sterylnego fizjologicznego roztw<strong>or</strong>u soli. Jeśli próbka jest<br />
płynna, nie trzeba dodawać roztw<strong>or</strong>u soli. Wymazy z odbytu, świeże lub<br />
w podłożu Cary’ego-Blaira, wytrząsnąć w 1 ml fizjologicznego roztw<strong>or</strong>u soli.<br />
Przed wyrzuceniem wymazówki odcisnąć resztę płynu na ściance probówki.<br />
2. Ezą dodać trzy lub więcej oczek zawiesiny do odpowiedniego podłoża<br />
wzbogacającego.<br />
3. Inkubować bulion z seleninem F przez 18 godzin, APW przez 6 – 8 godzin.<br />
W niektórych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach dwa lub trzy oczka zawiesiny początkowej w APW<br />
są przesiewane do świeżego APW i inkubowane przez kolejne 6 – 8 godzin.<br />
4. Przesiać hodowle z bulionu ezą na płytki z selektywnym i nieselektywnym<br />
podłożem.<br />
V. cholerae szybko rośnie w APW i przez 6 – 8 godzin przerasta inne mikro<strong>or</strong>ganizmy.<br />
Po dłuższej inkubacji, powyżej 8 godzin, pozostałe bakteriemogązdominować<br />
V. cholerae. Szczepy nie-V. cholerae O1 rosną szybciej niż V. cholerae O1 i,<br />
jeśli obecne są jednocześnie dwa serotypy, mogą przerosnąć całą płytkę.<br />
Podłoża do hodowli patogenów jelitowych<br />
Dla Shigella spp., Salmonella spp. i Y. enterocolitica zalecane są podłoża<br />
stosowane do posiewu ogólnego o niskiej selektywności <strong>or</strong>az podłoża ośredniej<br />
lub wysokiej selektywności. Agar MacConkeya z fioletem krystalicznym jest<br />
zalecany jako podłoże podstawowe. W przypadku Y. enterocolitica agar MacConkeya<br />
należy inkubować przez dzień w35°C, a następnie, przez kolejny dzień,<br />
w temperaturze pokojowej (22 – 29°C).<br />
Agar ksylozo-lizyno-deoksycholanowy (XLD) jest rekomendowany jako podłoże<br />
ośredniej lub wysokiej selektywności do izolacji Shigella spp. i Salmonella spp.<br />
Agar deoksycholanowo-cytrynianowy (DCA), agar Hektoen dla pałeczek jelitowych<br />
(HEA) lub agar Salmonella-Shigella (SS agar) mogą być stosowane<br />
alternatywnie. Shigella dysenteriae typ 1, S. sonnei i enteroinwazyjne E. coli nie<br />
rosną dobrze na agarze SS. Jednakże agar SS może być wyk<strong>or</strong>zystany do izolacji<br />
Y. enterocolitica z zastosowaniem zasad izolacji opisanych dla agaru MacConkeya.<br />
Wiele lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów do izolacji Salmonella typhi i innych gatunków<br />
Salmonella stosuje agar siarczanowo-bizmutowy.<br />
Dla Campylobacter spp. stosowanych jest kilka podłoży selektywnych (Blaser,<br />
Butzler, Skirrow), zawierających różne dodatki antybakteryjne. Można również<br />
53
KAŁ<br />
zastosować podstawowy agar z krwią zawierający 5 – 10% krwi baraniej<br />
z dodatkiem cefalosp<strong>or</strong>yny (15 µg/ml), wankomycyny (10 µg/ml), amfoterycyny<br />
B (2 µg/ml) i 0,05% siarczanu żelaza–metadwusiarczanu sodu–pirogronianu<br />
sodu (FBF).<br />
Dla Vibrio spp. konieczne są selektywne podłoża, aczkolwiek wiele szczepów<br />
może rosnąć na agarze MacConkeya. Agar zawierający cytrynian tiosiarczanowy,<br />
sole żółci i sacharozę (TCBS) jest podłożem selektywnym dla V. cholerae O1<br />
i nie-O1 <strong>or</strong>az dla V. parahaemolyticus, ale drogim. Podłoże selektywne,<br />
zawierające telluryn, taurocholan i żelatynę (TTG), nie jest komercyjnie dostępne.<br />
Prostymi, niedrogimi podłożami, które mogą być przygotowywane we własnym<br />
zakresie i stosowane z bardzo dobrym efektem, są: agar z zasadowym ekstraktem<br />
mięsnym (MEA) i zasadowy agar z solami żółci (BSA).<br />
Izolacja Clostridium difficile przed wprowadzeniem agaru cefoksytyno-cykloseryno-fruktozowego<br />
(CCFA) była trudna. W przypadku lecytynazo- i lipazoujemnych<br />
C. difficile zalecane jest stosowanie podłoży agarowych, zawierających<br />
żółtko jaja; inne laseczki występujące w jelicie, takie jak C. perfringens,<br />
C. bifermentans i C. s<strong>or</strong>delli, sąlecytynazododatnie.<br />
Wstępna izolacja<br />
Próbka powinna być badana i hodowana natychmiast po dostarczeniu do<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium, co daje najwyższy wskaźnik izolacji Shigella spp. i Campylobacter<br />
spp. Jeśli nie jest to możliwe, próbka powinna być przechowywana w temperaturze<br />
4°C.<br />
Do posiewu na podłoża o wysokiej selektywności powinna być użyta gęsta<br />
zawiesina kału, a na podłoża o niskiej selektywności — mniej gęsta. W wielu<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach wymaz z odbytu posiewany jest bezpośrednio na podłoża, należy<br />
jednak uważać, aby nie doszło do przerośnięcia płytki.<br />
Procedura posiewu na podłoża<br />
do wstępnej izolacji<br />
1. Posiać ezą na wysoko selektywne podłoża trzy oczka zawiesiny kału, a jedno<br />
na podłoże o niskiej selektywności. Inoculum umieścić centralnie na płytce<br />
agarowej, a następnie rozprowadzić w górę, w dół i w poprzek płytki,<br />
jak zilustrowano na ryc. 6. Procedura ta umożliwia uzyskanie maksymalnej<br />
liczby pojedynczych kolonii. Drobne kolonie pojawią się peryferycznie na<br />
płytce.<br />
2. Po inokulacji inkubować płytki agarowe. W celu izolacji Salmonella, Shigella<br />
i Yersinia spp. <strong>or</strong>az V. cholerae płytki inkubować w cieplarce w warunkach<br />
tlenowych (bez CO 2 )w35°C, w przypadku Campylobacter spp. w 42°C<br />
wśrodowisku mikroaerofilnym z 10% CO 2 ,apłytki z Clostridium difficile<br />
w35°C wśrodowisku beztlenowym.<br />
Warunki inkubacji Campylobacter<br />
Płytki do izolacji Campylobacter spp. powinny być inkubowane w 42 – 43°C<br />
wśrodowisku mikroaerofilnym, zawierającym 5% O 2 , 10% CO 2 i 85% N 2 .<br />
54
CZE˛ŚĆ I<br />
Powyższa temperatura hamuje wzrost naturalnej fl<strong>or</strong>y jelitowej, nie wpływającna<br />
wzrost bakterii z rodzaju Campylobacter. Podczas izolacji gatunków nie tolerujących<br />
podwyższonej temperatury, inkubacja powinna być prowadzona<br />
w35– 37°C.<br />
Ryc. 6. Posiew bakterii na płytkę.<br />
• Odpowiednie warunki wzrostu dla Campylobacter spp. są uzyskiwane na kilka<br />
sposobów. Wybór metody zależy od zakresu i obciążenia pracą danego<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium <strong>or</strong>az relatywnych kosztów.<br />
• Eksykat<strong>or</strong> zapewnia atmosferę zawierającą ok. 17 – 19% O 2<br />
i2– 3% CO 2<br />
. Nie<br />
są to optymalne warunki wzrostu Campylobacter spp. i nie wszystkie szczepy<br />
w nich wyrosną. Według niektórych źródeł inkubacja w 42°C podłoży<br />
z dodatkiem FBP wpływa k<strong>or</strong>zystnie na skuteczność izolacji. Dodatek FBP<br />
inaktywując nadtlenki i nadtlenek wod<strong>or</strong>u poprawia tolerancję tlenu przez<br />
Campylobacter spp. Ujemną stroną metody jest dłuższa inkubacja i zahamowanie<br />
wzrostu niektórych wrażliwych na tlen Campylobacter spp.<br />
• Inna prosta i niedroga metoda wyk<strong>or</strong>zystuje technikę wspólnych hodowli.<br />
Płytki z szybko rosnącymi fakultatywnie beztlenowymi bakteriami inkubowane<br />
są zpłytkami do izolacji Campylobacter spp. w zamkniętym pojemniku lub<br />
plastikowym w<strong>or</strong>eczku. Przy wzroście fakultatywnie beztlenowych bakterii<br />
zawartość tlenu maleje, a CO 2<br />
rośnie. Ujemną stroną metody jest zwykle<br />
dłuższy czas inkubacji potrzebny do wzrostu Campylobacter spp.<br />
• Komercyjnie dostępna jest specjalnie przystosowana do izolacji Campylobacter<br />
spp. saszetka z generat<strong>or</strong>em wod<strong>or</strong>u i CO 2 <strong>or</strong>az katalizat<strong>or</strong>em. Saszetkę<br />
należy umieścić w anaerostacie używając każd<strong>or</strong>azowo przy otwarciu pojemnika<br />
nowej saszetki. Aby uzyskać maksymalną skuteczność izolacji, w słoju nie<br />
należy umieszczać więcej niż sześciu płytek.<br />
• Zestaw do inkubacji w plastikowym w<strong>or</strong>eczku jest także dostępny komercyjnie.<br />
Wskład zestawu wchodzi plastikowy w<strong>or</strong>eczek, za każdym razem opróżniany<br />
dwu- lub trzykrotnie ręcznie bądź za pomocą próżniociągu, a następnie<br />
każd<strong>or</strong>azowo wypełniany 5% O 2 , 10% CO 2 i 85% N 2 .<br />
• System opróżnianego i wypełnianego anaerostatu bez katalizat<strong>or</strong>a. Pojemnik<br />
jest dwukrotnie opróżniany do uzyskania ciśnienia 38 cm (15 mm Hg)<br />
i wypełniany za każdym razem mieszaniną 10% H 2<br />
i 90% N 2<br />
.<br />
55
KAŁ<br />
Wstępna identyfikacja izolowanych szczepów<br />
Identyfikacja odbywa się na podstawie testów zarówno biochemicznych, jak<br />
i serologicznych, których zakres zależy od możliwości lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. Schemat<br />
identyfikacji ważnych bakterii jelitowych przedstawiony jest na ryc. 7a-c.<br />
Na płytce Petriego, zawierającej pierwszy posiew, należy oznaczyć na dnie dobrze<br />
odgraniczone kolonie o typowym wyglądzie. Wybrane kolonie zostaną poddane<br />
dalszej identyfikacji. Jeśli w posiewie widoczne są różne typy kolonii, należy<br />
przeprowadzić identyfikację każdej z nich.<br />
Małe i bezbarwne kolonie niefermentujących laktozy bakterii, takich jak<br />
Salmonella spp. i Shigella spp., rosną na podłożu agarowym MacConkeya, agarze<br />
SS i DCA. Kolonie Proteus spp. mogą być mylone z Salmonella spp. i Shigella<br />
spp., zwłaszcza na podłożu MacConkeya ze względu na ich wygląd, typowy<br />
dla bakterii laktozoujemnych. Fermentujące laktozę mikro<strong>or</strong>ganizmy, takie<br />
jak E. coli i Enterobacter/Klebsiella spp., wytwarzają małe różowe i czerwone<br />
kolonie na podłożu agarowym MacConkeya, DCA i agarze SS. Na agarze<br />
XLD Salmonella spp. i Shigella spp. wytwarzają małe czerwone kolonie,<br />
z czarnym środkiem w przypadku większości szczepów Salmonella. Kolonie<br />
z czarnym centrum mogą tw<strong>or</strong>zyć na tym podłożu również niektóre szczepy<br />
Proteus spp. Na agarze bizmutowo-siarkowym Salmonella typhi wytwarzają<br />
czarne kolonie z metalicznym połyskiem, dobrze widocznym w przypadku<br />
odgraniczonych kolonii. Yersinia enterocolitica rośnie na agarze MacConkeya<br />
i agarze SS w postaci małych, bladych kolonii, najszybszy wzrost następuje<br />
w temperaturze 22 – 29°C.<br />
Salmonella i Shigella spp.<br />
Do wstępnych badań szczepów Salmonella spp. i Shigella spp. zalecane są trzy<br />
różne podłoża:<br />
– bulion z mocznikiem, lekko buf<strong>or</strong>owany (UREA),<br />
– podłoże ruch-indol-lizyna (MIL),<br />
– agar Kliglera (KIA).<br />
Procedura posiewu i odczytu UREA<br />
1. Używając do posiewu ezy zebrać zpłytki 2 – 3 nie fermentujące laktozy<br />
kolonie i przenieść do probówki zawierającej UREA.<br />
2. Inkubować probówki przez 2 – 4 godziny w 35°C i obserwować ewentualną<br />
zmianę zabarwienia na różowe (ureazododatnie). Odrzucić ureazododatnie<br />
probówki.<br />
3. Przesiać materiał z probówek zawierających szczepy ureazoujemne na MIL<br />
i KIA (patrz poniżej) i inkubować wszystkie probówki, łącznie z ureazoujemnymi,<br />
przez noc w 35°C, w warunkach tlenowych.<br />
Procedura posiewu i odczytu MIL i KIA<br />
1. Posiać materiał do podłoża MIL przez nakłucie prostą igłą (ezą) nagłębokość<br />
2 mm od dna probówki. Wyjąć igłę w tej samej linii.<br />
56
CZE˛ŚĆ I<br />
Gram-ujemne pałeczki względnie<br />
beztlenowe fermentuja˛ce cukry<br />
oksydazoujemne<br />
▼<br />
Laktoza<br />
+ –<br />
▼<br />
▼<br />
Siarkowodór<br />
Siarkowodór<br />
+ – + –<br />
Citrobacter<br />
▼ ▼ ▼<br />
freundii Lizyna Lizyna Fenyloalanina<br />
+ – + – + –<br />
▼<br />
▼<br />
▼<br />
▼ ▼ ▼<br />
Ureaza Indol Indol Ornityna Lizyna<br />
+ – + –<br />
+ – + –<br />
+ –<br />
▼<br />
Indol<br />
+ –<br />
Klebsiella<br />
oxytoca<br />
Klebsiella<br />
pneumoniae<br />
▼ ▼ ▼<br />
Indol<br />
+ –<br />
Enterobacter<br />
aerogenes<br />
Escherichia<br />
coli<br />
Citrobacter<br />
koseri<br />
Enterobacter<br />
cloacae<br />
Indol<br />
+ –<br />
Proteus<br />
vulgaris<br />
Proteus<br />
mirabilis<br />
Edwardsiella Ornityna<br />
tarda<br />
+ –<br />
Salmonella<br />
większość serotypów<br />
▼<br />
M<strong>or</strong>ganella<br />
m<strong>or</strong>gani<br />
Salmonella<br />
typhi<br />
Trehaloza<br />
+ –<br />
▼<br />
Providencia Mannitol<br />
stuartii<br />
+ –<br />
Providencia<br />
rettgeri<br />
Serratia<br />
liquifaciens<br />
Ryc. 7a. Schemat wstępnej identyfikacji często występuja˛cych Enterobacteriaceae.<br />
2. Posiać materiał na podłoże KIA nakłuwając słupek agaru prostą igłą<br />
i prowadząc zygzakiem po powierzchni skosu.<br />
3. Opisać wszystkie probówki numerem próbki i inkubować przez noc w temperaturze<br />
35°C.<br />
4. Obserwować probówki UREA w kierunku opóźnionej reakcji rozkładu<br />
mocznika (patrz powyżej). Odrzucić hodowle z reakcją ureazododatnią.<br />
5. Obserwować podłoża MIL w kierunku obecności ruchu, reakcji rozkładu<br />
lizyny i wytwarzania indolu. Ruchliwe mikro<strong>or</strong>ganizmy rozprzestrzenią się<br />
w podłożu poza linię nakłucia i widoczny będzie rozsiany wzrost. Bakterie<br />
niezdolne do ruchu będą rosły jedynie w kanale wkłucia. Na dodatnią reakcję<br />
lizynową wskazuje odczyn zasadowy (kol<strong>or</strong> fioletowy) na dnie podłoża, na<br />
reakcję ujemną odczyn kwaśny (kol<strong>or</strong> żółty) spowodowany jedynie fermentacją<br />
glukozy. Aby wykazać obecność indolu, należy dodać do podłoża 3– 4<br />
krople odczynnika Kovacsa. Czerwony i różowy kol<strong>or</strong> wskazują na reakcję<br />
dodatnią, natomiast kol<strong>or</strong> jasnożółty świadczy o ujemnym wyniku testu.<br />
6. Obserwować podłoże KIA. Wszystkie Enterobacteriaceae fermentują glukozę<br />
z wytw<strong>or</strong>zeniem kwasu i gazu lub tylko kwasu, który jest odpowiedzialny za<br />
żółte zabarwienie podłoża. Powstający gaz powoduje powstanie pęcherzyków<br />
ipęknięć na powierzchni agaru, który, jeśli powstaje duża ilość gazu, może<br />
unieść się w probówce (np. w przypadku Enterobacter spp.). Jeśli równocześnie<br />
fermentacji ulega laktoza, zarówno słupek agarowy, jak i skos stają się żółte<br />
z powodu kwaśnego pH (np. w przypadku E. coli). Jeśli nie zachodzi<br />
fermentacja laktozy (np. Shigella spp. i Salmonella spp.), słupek agaru jest<br />
żółty, a skos pozostaje czerwony. Zaczernienie wzdłuż linii wkłucia lub<br />
w całym agarze wskazuje na obecność siarkowod<strong>or</strong>u. Należy zanotować<br />
rezultaty i przeprowadzić wstępną identyfikację mikro<strong>or</strong>ganizmu, wyk<strong>or</strong>zystując<br />
schemat przedstawiony w tabeli 10 i 11.<br />
▼<br />
Providencia<br />
alcalifaciens<br />
▼<br />
S<strong>or</strong>bitol<br />
+ –<br />
▼<br />
Arabinoza Hafnia<br />
+ – alvei<br />
Ureaza<br />
+ –<br />
▼<br />
Yersinia Ruch<br />
enterocolitica<br />
+ –<br />
▼<br />
Salmonella Ornityna<br />
paratyphi A<br />
Serratia<br />
marcescens<br />
Shigella<br />
sonnei<br />
Shigella<br />
serotyp A, B, C<br />
57
KAŁ<br />
Clostridium<br />
perfringens<br />
Gram-dodatnie tw<strong>or</strong>za˛ce sp<strong>or</strong>y laseczki,<br />
niektóre gatunki nie tw<strong>or</strong>za˛ce sp<strong>or</strong>,<br />
względnie beztlenowe lub<br />
katalazoujemne<br />
+ –<br />
Podwójna strefa hemolizy<br />
Indol<br />
+ – + –<br />
Indol<br />
+ –<br />
Ureaza<br />
+ –<br />
C. s<strong>or</strong>delli Wzrost<br />
mgławicowy<br />
+ –<br />
C. tetani Laktoza<br />
+ –<br />
C. sphenoides C. bifermentans<br />
Ruch<br />
+ –<br />
Charakterystyczna<br />
flu<strong>or</strong>escencja<br />
+ –<br />
Mannitol<br />
+ –<br />
C. ramosum<br />
C. clostridiof<strong>or</strong>me<br />
C. difficili Laktoza<br />
+ –<br />
Wzrost<br />
mgławicowy<br />
Wzrost<br />
mgławicowy<br />
+ – + –<br />
C. septicum C. tertium C. sp<strong>or</strong>ogenes C. novyi typ A<br />
Propionibacterium<br />
Redukcja<br />
acnes<br />
azotanu<br />
+ –<br />
Małe (1µm) przezroczyste<br />
kolonie ziarenko-pałeczek<br />
+ –<br />
Eubacterium<br />
lentum<br />
Ryc. 7b. Schemat wstępnej identyfikacji Gram-dodatnich pałeczek beztlenowych.<br />
Katalaza<br />
15% H 2 O 2<br />
+ –<br />
Redukcja<br />
azotanu<br />
+ –<br />
Actinomyces<br />
viscosus<br />
,,Beztlenowe pałeczki<br />
Gram-dodatnie nie<br />
tw<strong>or</strong>za˛ce sp<strong>or</strong>,<br />
niemożliwe do<br />
zidentyfikowania’’<br />
(obejmuje Lactobacillus,<br />
Bifidobacterium i inne<br />
gatunki Eubacterium)<br />
Actinomyces species<br />
(kolonie ,,zębów<br />
trzonowych’’)<br />
Propionibacterium<br />
species<br />
Szczepy Salmonella są oksydazoujemne, ruchliwe i indoloujemne. Nie hydrolizują<br />
mocznika i — z wyjątkiem S. paratyphi A — wytwarzają dekarboksylazę<br />
lizyny. Na agarze KIA obserwowany jest żółty słupek, czerwony skos, H 2 S i gaz,<br />
z wyjątkiem S. typhi, która nie wytwarza gazu, i większości szczepów S. paratyphi<br />
A, które są H 2 S-ujemne. Jeśli powyższe kryteria są spełnione, zanotować:<br />
,,izolacja Salmonella (identyfikacja wstępna)’’.<br />
Szczepy Shigella są oksydazoujemne, nieruchliwe, nie wytwarzają dekarboksylazy<br />
lizyny i nie hydrolizują mocznika. Na KIA obserwowany jest zasadowy<br />
(czerwony) skos i kwaśny (żółty) słupek, bez H 2 S i bez gazu, z wyjątkiem S. flexnerii<br />
serotyp 6 (warianty Newcastle i Manchester) i S. boydii serotyp 14, które<br />
wytwarzają gaz. Z wyjątkiem S. dysenteriae serotyp 1 bakterie wytwarzają<br />
katalazę. Jeśli powyższe kryteria są spełnione, zanotować: ,,izolacja Shigella<br />
(wstępna identyfikacja)’’.<br />
Yersinia enterocolitica<br />
Wzrost małych, bladych, czy też bezbarwnych koloni na podłożu MacConkeya<br />
lub agarze SS po całonocnej inkubacji może wskazywać na obecność Yersinia<br />
enterocolitica. Typowe kolonie należy posiać na KIA i inkubować w temperaturze<br />
25°C przez noc. Inne kolonie, prawdopodobnie ch<strong>or</strong>obotwórczych szczepów,<br />
posiać na dwa podłoża UREA i dwa podłoża MIL, inkubować równolegle po<br />
jednej z probówek w temperaturze 25°C i w temperaturze 35°C. Typowe szczepy<br />
Yersinia enterocolitica na podłożu KIA zakwaszają słupek, nie ma gazu i H 2<br />
S.<br />
58
CZE˛ŚĆ I<br />
Wzrost na agarze<br />
zżółcia˛ i eskulina˛<br />
+ –<br />
▼<br />
Wrażliwe na kanamycynę (Km)<br />
i wankomycynę (Vm)<br />
▼<br />
Wrażliwe na kanamycynę (Km)<br />
i wankomycynę (Vm)<br />
▼<br />
Km-op<strong>or</strong>ne<br />
Vm-wrażliwe<br />
▼<br />
Km-op<strong>or</strong>ne<br />
Vm-op<strong>or</strong>ne<br />
▼<br />
Km-wrażliwe<br />
Vm-op<strong>or</strong>ne<br />
▼<br />
Km-op<strong>or</strong>ne<br />
Vm-op<strong>or</strong>ne<br />
▼<br />
Km-op<strong>or</strong>ne<br />
Vm-op<strong>or</strong>ne<br />
P<strong>or</strong>phyromonas Prevotella Grupa<br />
▼<br />
Bacteroides fragilis<br />
Kolonie z pigmentem<br />
lub flu<strong>or</strong>yzuja˛ce<br />
na czerwono<br />
+ –<br />
Prevotella<br />
Ureaza<br />
+ –<br />
▼<br />
▼<br />
Grupa<br />
Fusobacterium<br />
m<strong>or</strong>tiferum/varium<br />
Katalaza<br />
Indol<br />
+ – + –<br />
Bilophila<br />
wadsw<strong>or</strong>thia<br />
▼<br />
Bacteroides<br />
ureolyticus<br />
Fusobacterium nucleatum<br />
F. necroph<strong>or</strong>um<br />
inne gatunki Fusobacterium<br />
Jeśli szczep jest ruchliwy i ureazododatni w temperaturze 25°C <strong>or</strong>az nieruchliwy<br />
i słabo ureazododatni lub ureazoujemny w temperaturze 35°C, zanotować:<br />
,,izolacja Yersinia (wstępna identyfikacja)’’.<br />
▼<br />
▼<br />
Kolonie, bardzo małe<br />
przezroczyste<br />
+ –<br />
▼<br />
Nierozpuszczalne<br />
wżółci<br />
+ –<br />
▼<br />
Katalaza<br />
+ –<br />
▼<br />
Bilophila<br />
wadsw<strong>or</strong>thia<br />
Ryc. 7c. Schemat wstępnej identyfikacji Gram-ujemnych pałeczek beztlenowych.<br />
▼<br />
Suterella<br />
wadsw<strong>or</strong>thensis<br />
▼<br />
Campylobacter<br />
species<br />
▼<br />
Fusobacterium<br />
species<br />
WHO 01.50<br />
Vibrio cholerae i V. parahaemolyticus<br />
Szczepy Vibrio rosną na agarze MacConkeya w postaci bladych, nie fermentujących<br />
laktozy kolonii. Na agarze TCBS V. cholerae tw<strong>or</strong>zą średniej wielkości,<br />
wypukłe, gładkie, żółte kolonie, w odróżnieniu od V. parahaemolyticus, których<br />
kolonie są duże, płaskie i niebieskozielone.<br />
Niektóre szczepy V. cholerae, z powodu opóźnionej fermentacji sacharozy, mogą<br />
również na podłożu TCBS tw<strong>or</strong>zyć zielone lub bezbarwne kolonie. Na podłożu<br />
TTGA kolonie są ciemne w centrum, z powodu redukcji tellurynu, <strong>or</strong>az otoczone<br />
strefą zmętnienia, związaną z aktywnością żelatynazy. Na podłożu BSA i MEA<br />
kolonie V. cholerae są bezbarwne, zwykle płaskie i dobrze odgraniczone;<br />
zazwyczaj łatwo je odróżnić od kolonii Enterobacteriaceae w ukośnym oświetleniu<br />
lub podczas badania w świetle dziennym padającym pod kątem. Dla<br />
podejrzanych kolonii należy wykonać test na obecność oksydazy i test śluzowy.<br />
59
KAŁ<br />
Tabela 9. M<strong>or</strong>fologia kolonii powszechnie występuja˛cych bakterii jelitowych na różnicuja˛cych i selektywnych<br />
podłożach<br />
Gatunki<br />
Escherichia coli<br />
Agar<br />
MacConkeya<br />
z fioletem<br />
krystalicznym<br />
Różowoczerwone<br />
Agar XLD Agar SS DCA HEA<br />
Różowoczerwone<br />
zahamowanie<br />
wzrostu<br />
Różowe, otoczone<br />
strefa˛ precypitacji<br />
Shigella spp. Bezbarwne Czerwone Bezbarwne Bezbarwne lub jasnobra˛zowe<br />
Salmonella spp. Bezbarwne Czerwone z czarnym<br />
centrum<br />
lub bez<br />
Enterobacter/<br />
/Klebsiella spp.<br />
Proteus/<br />
/Providencia<br />
spp.<br />
Yersinia<br />
enterocolitica<br />
Różowe, śluzowe<br />
Bezbarwne, zahamowane<br />
pełzanie<br />
Bezbarwne<br />
Żółte, śluzowe<br />
Czerwone, niektóre<br />
Proteus spp. maja˛<br />
czarne centrum<br />
Żółte, nieregularne<br />
Enterococcus spp. Brak wzrostu Brak lub słaby<br />
wzrost<br />
Bezbarwne z czarnym<br />
centrum<br />
lub bez<br />
Różowe, zahamowanie<br />
wzrostu<br />
Bezbarwne, z szaroczarnym<br />
centrum<br />
lub bez<br />
Bezbarwne lub jasnobra˛zowe<br />
z czarnym<br />
centrum lub bez<br />
Duże, bezbarwne lub<br />
jasnobra˛zowe z<br />
czarnym centrum<br />
lub bez<br />
Bezbarwne Bezbarwne Łososiowe<br />
Duże, płaskie, żółte,<br />
nieprzejrzyste<br />
Duże, łososiow<strong>or</strong>óżowe<br />
lub pomarańczowe,<br />
otoczone<br />
strefa˛ precypitacji<br />
Zielone, wilgotne, wypukłe<br />
Niebieskozielone z<br />
czarnym centrum<br />
lub bez<br />
Duże, blade, śluzowe,<br />
z różowym centrum<br />
Duże, łososiowopomarańczowe<br />
Niebieskozielone lub<br />
łososiowe z czarnym<br />
centrum lub<br />
bez<br />
Brak wzrostu Brak lub słaby wzrost Brak lub słaby wzrost<br />
XLD: deoksycholan ksylozo-lizynowy; DCA: cytrynian deoksycholowy; SS: Salmonella-Shigella; HEA: hektoen jelitowy.<br />
Tabela 10. Interpretacja reakcji pałeczek Enterobacteriaceae na agarze żelazowym<br />
Kliglera (KIA)<br />
Reakcja<br />
Interpretacja<br />
Słupek kwaśny (żółty) i skos zasadowy (czerwony)<br />
Tylko fermentacja glukozy<br />
Kwaśne całe podłoże (słupek i skos żółte) Fermentacja glukozy i laktozy<br />
Zasadowe całe podłoże (słupek i skos czerwone)<br />
Brak fermentacji glukozy i laktozy<br />
Pęcherzyki gazu w słupku lub pęknięcia Bakterie wytwarzaja˛ce gaz<br />
w podłożu<br />
Zaczernienie w słupku Wytwarzanie siarkowod<strong>or</strong>u (H 2 S)<br />
Procedura testu na oksydazę<br />
1. Na papierowym filtrze w szalce Petriego umieścić 2 – 3 krople odczynnika do<br />
testu na oksydazę (1% tetrametylo-parafenylenodiamina).<br />
2. Platynową (nie niklowo-chromową) ezą, czystą drewnianą szpatułką lub<br />
wykałaczką zebrać niewielką liczbę świeżych kolonii z agaru MacConkeya.<br />
Rozprowadzić bakterie na nawilżonej części papierowego filtra.<br />
3. O reakcji dodatniej świadczy ciemnofioletowe zabarwienie papierka w ciągu<br />
10 sekund. Spośród Gram-ujemnych pałeczek oksydazododatnie są Vibrio,<br />
Aeromonas, Plesiomonas, Pseudomonas i Alcaligenes; wszystkie Enterobacteriaceae<br />
są oksydazoujemne. Odczynnik do testu na oksydazę powinien być<br />
regularnie testowany za pomocą dodatnich i ujemnych szczepów kontrolnych.<br />
60
CZE˛ŚĆ I<br />
Tabela 11. Wz<strong>or</strong>y typowych reakcji pałeczek Enterobacteriaceae na agarze Kliglera<br />
(KIA)<br />
Reakcja Fermentacja cukru(ów) Gatunek bakterii<br />
Kwaśny słupek 1 Glukoza: kwas i gaz Escherichia coli<br />
Kwaśny skos 1 Laktoza: kwas i gaz Klebsiella<br />
Gaz w słupku<br />
Enterobacter<br />
Brak H 2 S<br />
Citrobacter diversus<br />
Serratia liquefaciens<br />
Kwaśny słupek Glukoza: kwas i gaz Salmonella<br />
Zasadowy skos 2 Laktoza: brak fermentacji Proteus<br />
Gaz w słupku<br />
Citrobacter freundii*<br />
Wytwarzanie H 2 S<br />
Kwaśny słupek Glukoza: tylko kwas Shigella<br />
Zasadowy skos Laktoza: brak fermentacji Yersinia<br />
Brak gazu w słupku<br />
Serratia marcescens*<br />
Brak H 2 S<br />
Providencia stuartii<br />
Providencia rettgeri*<br />
Kwaśny słupek Glukoza: kwas i gaz Salmonella paratyphi A<br />
Zasadowy skos Laktoza: brak fermentacji Hafnia alvei<br />
Gaz w słupku<br />
Serratia marcescens*<br />
Brak H 2 S<br />
M<strong>or</strong>ganella m<strong>or</strong>gani<br />
Obojętny/zasadowy słupek 2 Brak fermentacji cukrów Alcaligenes<br />
Zasadowy skos<br />
Pseudomonas<br />
Brak gazu<br />
Acinetobacter<br />
Brak H 2 S<br />
1<br />
Kwaśne pH powstałe w wyniku rozkładu cukru, obserwowane na podstawie żółtego<br />
zabarwienia podłoża (przyp. tłum.).<br />
2<br />
Zasadowe lub obojętne pH w wyniku braku rozkładu cukru, obserwowane na podstawie<br />
niezmienionego, różowego kol<strong>or</strong>u podłoża (przyp. tłum.).<br />
* Reakcje atypowe.<br />
Procedura testu śluzowego<br />
1. Umieścić na szkiełku kroplę 0,5% roztw<strong>or</strong>u dezoksycholanu sodu i wymieszać<br />
zmałą liczbą kolonii pobranych z podłoża MacConkeya.<br />
2. Wskaźnikiem dodatniej reakcji jest zmiana charakteru zawiesiny w ciągu<br />
60 sekund: z mętnej w śluzowatą; obecność śluzowych włókien może być<br />
wykazana za pomocą ezy, którą zanurza się w zawiesinie i odsuwa od szkiełka.<br />
Niektóre szczepy Aeromonas mogą wykazywać słabą i opóźnioną o około<br />
60 sekund reakcję.<br />
Jeśli powyższe testy są dodatnie, przenieść część kolonii na KIA i po całonocnej<br />
inkubacji obserwować w kierunku obecności żółtego zabarwienia słupka, zasadowego<br />
skosu, braku wytwarzania gazu i H 2 S. Jeśli wystąpią ww. cechy, zanotować:<br />
,,izolacja Vibrio cholerae (wstępna identyfikacja)’’.<br />
Campylobacter jejuni i Campylobacter coli<br />
Płytki Campylobacter należy oglądać po 48 – 72 godzinach inkubacji. Zalecane<br />
jest wykonanie testu na oksydazę, oglądanie preparatu natywnego w ciemnym<br />
polu widzenia lub w mikroskopie fazowo-kontrastowym <strong>or</strong>az preparatu barwionego<br />
metodą Grama. Jeśli mikroskop z ciemnym polem widzenia lub<br />
fazowo-kontrastowy nie jest dostępny, m<strong>or</strong>fologię komórek można określić na<br />
podstawie preparatu barwionego metodą Grama, używając obok fioletu krystalicznego<br />
0,3% fuksyny karbolowej. Campylobacter spp. są oksydazododatnie,<br />
61
KAŁ<br />
wykazują ruch, w preparacie widoczne są jako lekko lub spiralnie zagięte pałeczki<br />
(kształt skrzydeł mewy lub ,,S’’). Jeśli wystąpią ww. cechy, zanotować: ,,izolacja<br />
Campylobacter (wstępna identyfikacja)’’.<br />
Clostridium difficile<br />
Kolonie C. difficile na podłożu CCFA są duże, żółte, ze szklistą podstawą. Na<br />
agarze z krwią wśrodowisku beztlenowym kolonie mogą wykazywać różną<br />
m<strong>or</strong>fologię, dlatego niezbędna jest identyfikacja bakterii na podstawie innych<br />
cech. Typowe kolonie na tym podłożusąszare, nieprzejrzyste, bez cech hemolizy<br />
po 24 – 48 godzinach, tylko niekiedy zielononiebieskie z powodu α-hemolizy.<br />
Po 48 – 72 godzinach inkubacji może pojawić się wyraźne szare zabarwienie<br />
z białym centrum. Z doświadczenia wynika jednak, że mimo różnic w m<strong>or</strong>fologii<br />
kolonii C. difficile jest łatwo rozpoznawany na podstawie charakterystycznego<br />
zapachu, przypominającego odchody końskie. Jeśli kolonie są lecytynazoi<br />
lipazoujemne, a ponadto wykazują żółtozieloną flu<strong>or</strong>escencję wświetle lampy<br />
Wooda, należy zanotować: ,,izolacja Clostridium difficile (wstępna identyfikacja)’’.<br />
Końcowa identyfikacja mikrobiologiczna<br />
Przed wydaniem wyniku należy sprawdzić czystość hodowli i potwierdzić<br />
identyfikację za pomocą dodatkowych testów biochemicznych.<br />
1. Pobrać zpłytki dobrze odgraniczone od innych kolonie i przesiać na bulion<br />
odżywczy w celu wykonania testów biochemicznych, na skos agarowy do<br />
testów serologicznych <strong>or</strong>az na płytkę MacConkeya w celu potwierdzenia<br />
czystości hodowli.<br />
2. Wykonać dodatkowe testy biochemiczne zgodnie z tabelami. Wyniki odczytać<br />
po całonocnej inkubacji i zidentyfikować izolowane szczepy.<br />
Identyfikacja Shigella i Salmonella może niekiedy stanowić problem, ponieważ<br />
niektóre szczepy różnią się wynikami reakcji biochemicznych, a także mogą<br />
wykazywać obecność antygenów wspólnych z innymi Gram-ujemnymi bakteriami.<br />
Nieruchliwe, laktozoujemne, nie wytwarzające gazu szczepy E. coli są<br />
często trudne do odróżnienia od szczepów Shigella, a ponadto identyfikacja może<br />
być skomplikowana w związku z faktem wywoływania czerwonki bakteryjnej<br />
przez niektóre z tych szczepów.<br />
Salmonella<br />
Jeśli wyniki wstępnych testów wskazują na obecność szczepów Salmonella,<br />
należy posiać szczepy na podłoże z <strong>or</strong>nityną, podłoże Simmonsa z cytrynianem,<br />
ONPG i wodę peptydową wzbogaconą mannitolem, ramnozą, trehalozą lub<br />
ksylozą. Obserwować reakcje po całonocnej inkubacji i zidentyfikować szczepy<br />
według schematu przedstawionego w tabeli 12. Jeśli wyniki wskazują na hodowlę<br />
Salmonella, przeprowadzić identyfikację serologiczną.<br />
62
CZE˛ŚĆ I<br />
Tabela 12. Biochemiczne reakcje biotypów Salmonella i innych pałeczek<br />
Tabela 13. Biochemiczne reakcje biotypów Shigella i innych pałeczek<br />
Oksydaza<br />
Ruch<br />
Indol<br />
Lizyna<br />
Ureaza<br />
VP<br />
Cytrynian<br />
Ornityna<br />
Fenyloalanina<br />
ONPG<br />
Sacharoza<br />
Ksyloza<br />
Ruch<br />
mgławicowy<br />
H 2 SKIA<br />
Indol<br />
Lizyna<br />
Ornityna<br />
Cytrynian<br />
ONPG<br />
Ureaza<br />
Mannitol<br />
Trehaloza<br />
Ramnoza<br />
Ksyloza<br />
Salmonella (większość<br />
– – – + + + – – + + + +<br />
serotypów)<br />
S. choleraesuis – d – + + d – – + – + +<br />
S. arizonae – + – + + + + – + + + +<br />
S. typhi – +w – + – – – – + + – +<br />
S. paratyphi A – d– – – + – – – + + + –<br />
Edwardsiella tarda – + + + + – – – – – – –<br />
Citrobacter freundii – + – – – + + d + + + +<br />
Proteus spp. + + –/+ – +/– v – + – + – +<br />
Skróty: +: > 95% dodatnich; d: 26 –74% dodatnich; d–:5–25% dodatnich; –: < 5% dodatnich; v: zmienne wyniki; w: słaba reakcja.<br />
H 2 S/KIA: wytwarzanie siarkowod<strong>or</strong>u na agarze Kliglera; Lizyna: dekarboksylaza lizyny; Ornityna: dekarboksylaza <strong>or</strong>nityny;<br />
Cytrynian: agar cytrynianowy Simmonsa; ONPG: β-galaktozydaza.<br />
Shigella sonnei – – – – – – – + – d+ – –<br />
Shigella, inne gatunki – – d – – – – – – – – –<br />
E. coli, nieaktywne szczepy – – d+ d – – – d– – d d– d<br />
Providencia – + + – v – + – + d– d –<br />
M<strong>or</strong>ganella – d+ + – + – – + d+ d– – –<br />
Hafnia alvei – + – + – d+ d– + – + d– +<br />
Serratia marcescens – + – + d– + + + – + + –<br />
Salmonella paratyphi A – + – – – – – + – – – –<br />
Plesiomonas shigelloides + + + + – – – + – + – –<br />
Skróty: +: > 95% dodatnich; d+: 75 –95% dodatnich; d: 26 –74% dodatnich; d–: 5–25% dodatnich; –: < 5% dodatnich; Lizyna:<br />
dekarboksylaza lizyny; VP: Voges-Proskauera; Cytrynian: agar cytrynianowy Simmonsa; Ornityna: dekarboksylaza <strong>or</strong>nityny;<br />
Fenyloalanina: deaminaza fenyloalaniny; ONPG: β-galaktozydaza.<br />
Tabela 14. Biochemiczne reakcje gatunków i serotypów Shigella<br />
Dekarboksylaza<br />
<strong>or</strong>nityny<br />
Fermentacja:<br />
laktoza/sacharoza<br />
Fermentacja:<br />
mannitol<br />
Katalaza<br />
Glukoza: gaz<br />
Shigella dysenteriae<br />
Serotyp 1 (shigae) – – – – –<br />
Serotyp 2 (schmitzii) – – – + –<br />
Serotypy 3 –10 – – – + –<br />
Shigella flexneri<br />
Serotyp 1 –5, X i Y – – + + –<br />
Serotyp 6 Newcastle – – – + +<br />
Serotyp 6 Manchester – – + + +<br />
Serotyp 6 Boyd 88 – – + + –<br />
Shigella boydii<br />
Serotyp 1 –13, 15 – – – – –<br />
Serotyp 14 – – – – +<br />
Shigella sonnei + + (opóźniona) + + –<br />
63
KAŁ<br />
Shigella<br />
Jeśli wyniki wstępnych testów wskazują na pałeczki Shigella, należy posiać<br />
badany szczep na podłoża z <strong>or</strong>nityną, fenyloalaniną i ONPG <strong>or</strong>az wodę peptonową<br />
z sacharozą i ksylozą. Obserwować reakcje po całonocnej inkubacji i zidentyfikować<br />
izolaty według schematu przedstawionego w tabeli 13. Jeśli wyniki<br />
wskazują na hodowlę Shigella, przeprowadzić identyfikację serologiczną.<br />
Do rodzaju Shigella należą cztery gatunki: S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii<br />
i S. sonnei. Zwykle oznaczane są jako podgrupy, odpowiednio A, B, C i D.<br />
Niektóre serotypy można wstępnie zidentyfikować i podzielić na biotypy na<br />
podstawie reakcji biochemicznych.<br />
Wśród S. dysenteriae (podgrupa A) wyróżnia się 10 serotypów. Serotyp 1 jest<br />
katalazoujemny i wytwarza toksynę Shiga. Pozostałe serotypy są katalazododatnie.<br />
Większość szczepów nie fermentuje mannitolu i laktozy.<br />
Wśród S. flexneri (podgrupa B) wyróżnia się 8 serotypów. Większość szczepów<br />
fermentuje mannitol, nie fermentuje sacharozy ani laktozy. Należący do serotypu<br />
6 szczep Newcastle nie fermentuje mannitolu, ale wytwarza gaz z glukozy;<br />
szczep Manchester wytwarza kwas i gaz z glukozy <strong>or</strong>az mannitolu; szczep<br />
Boyd 88 rozkłada glukozę i mannitol do kwasu, bez wytwarzania gazu.<br />
Wśród S. boydii (podgrupa C) wyróżnia się 15 serotypów. Fermentują one<br />
mannitol, nie fermentują laktozy.<br />
Wśród S. sonnei (podgrupa D) wyróżnia się jeden serotyp, wykazujący dwie fazy<br />
reakcji: I i II. Fermentuje mannitol. Wykazuje dodatnią reakcję ONPG, ale<br />
fermentacja laktozy i sacharozy zachodzi później niż po 24 godzinach (patrz<br />
tabela 14).<br />
Yersinia enterocolitica<br />
Jeśli wyniki wstępnych testów wskazują na obecność szczepów Yersinia, należy<br />
posiać szczep na podłoża z <strong>or</strong>nityną, Voges-Proskauera, ONPG, cytrynianowe<br />
podłoże Simmonsa <strong>or</strong>az wodę peptonową wzbogaconą sacharozą, ramnozą,<br />
melibiozą, s<strong>or</strong>bitolem lub celobiozą. Obserwować reakcje po jednodniowej<br />
inkubacji i zidentyfikować izolaty według schematu przedstawionego w tabeli 15.<br />
Jeśli wyniki wskazują na hodowlę Y. enterocolitica, wydać wynik: ,,Yersinia<br />
enterocolitica’’.<br />
Tabela 15. Biochemiczne reakcje Yersinia enterocolitica i innych niepatogennych gatunków Yersinia<br />
MIL<br />
Ureaza<br />
Ornityna<br />
VP 25°C<br />
Cytrynian<br />
Sacharoza<br />
Ramnoza<br />
Melibioza<br />
S<strong>or</strong>bitol<br />
Celobioza<br />
Y. enterocolitica +/v/– + + v – v – – +* +<br />
Y. frederiksenii +/+/– + + + d + + – + +<br />
Y. intermedia +/+/– + + + + + + + + +<br />
Y. kristensenii +/d/– + + – – – – – + +<br />
Y. pseudotuberculosis +/–/– + – – – – + + – –<br />
Skróty: +: > 95% dodatnich; d: 26 –74% dodatnich; –: < 5% dodatnich; v: zmienny wynik; MIL: podłoże ruch-indol-lizyna; VP 25°C:<br />
inkubacja w 25°C na agarze Voges-Proskauera; Cytrynian: agar cytrynianowy Simmonsa.<br />
* Z wyja˛tkiem biotypu 5.<br />
64
CZE˛ŚĆ I<br />
Vibrio cholerae<br />
Jeśli wyniki wstępnych testów wskazują na obecność szczepów Vibrio, należy<br />
wykonać posiew na podłoże z <strong>or</strong>nityną, agar cytrynianowy Simmonsa <strong>or</strong>az wodę<br />
peptonową z sacharozą i inkubować przez noc. Jeśli jedna z opisanych reakcji jest<br />
ujemna, wykonać posiew na podłoże Voges-Proskauera i przeprowadzić test na<br />
hydrolizę eskuliny, fermentację mannitolu, arabinozy i arbutyny. Obserwować<br />
reakcje po całonocnej inkubacji i zidentyfikować izolaty według schematu<br />
przedstawionego w tabeli 16.<br />
Tabela 16. Reakcje biochemiczne przecinkowców występuja˛cych w kale<br />
Oksydaza<br />
KIA<br />
słupek/skos<br />
MIL<br />
Ornityna<br />
Cytrynian<br />
Sacharoza<br />
Mannitol<br />
Arabinoza<br />
Eskulina<br />
Komentarz<br />
Vibrio cholerae + K/A +/+/+ + + + + – –<br />
V. mimicus + v/A +/+/+ + + – + – –<br />
V. parahaemolyticus + K/A +/+/+ + – – + d+ –<br />
V. fluvialis + K/A +/d/– – + + + + –<br />
V. furnissii + K/AG +/–/– – + + + + –<br />
V. hollisae + K/A +/+/– – – – – + – słaby wzrost<br />
Aeromonas hydrophila + A/AG +/+/+ – d + + + + Arb+/VP+<br />
A. caviae + A/A +/+/– – + + + + d Arb–/VP–<br />
A. veronii biotyp sobria + A/AG +/+/+ – + + + – – Arb–/VP+<br />
Plesiomonas shigelloides + K/A +/+/+ + – – – – + Arb–/VP–<br />
Skróty: +: > 95% dodatnich; d+: 75 –95% dodatnich; d: 26 –74% dodatnich; –: < 5% dodatnich; KIA: agar Kliglera; MIL: podłoże<br />
ruch-indol-lizyna; Ornityna: dekarboksylaza <strong>or</strong>nityny; Eskulina: hydroliza eskuliny; K: odczyn zasadowy; A: odczyn kwaśny; G:<br />
gaz; Arb: fermentacja arbutyny; VP: Voges-Proskauer.<br />
Jeśli dostępna jest swoista surowica anty-Vibrio cholerae serogrupy O1, należy<br />
wykonać szybki test aglutynacji szkiełkowej. W przypadku makroskopowej<br />
aglutynacji, opisać: ,,Vibrio cholerae O1’’. Jeśli surowica nie jest dostępna<br />
lub identyfikacja nie jest pewna, przesłać szczep do referencyjnego lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
Różnicowanie V. cholerae O1 na biotypy klasyczny i El T<strong>or</strong> nie jest niezbędne do<br />
leczenia lub monit<strong>or</strong>owania, powinno jednak zostać przeprowadzone dla niektórych<br />
izolatów (tabela 17).<br />
Tabela 17. Różnice biotypów Vibrio cholerae<br />
Klasyczny<br />
Biotyp<br />
El T<strong>or</strong><br />
Hemaglutynacja Reakcja ujemna, brak wzrostu* Reakcja dodatnia, wzrost*<br />
Polimyksyna B (50 j.) Wrażliwy Op<strong>or</strong>ny<br />
Voges-Proskauer Reakcja ujemna, brak wzrostu* Reakcja dodatnia, wzrost*<br />
Hemoliza Reakcja ujemna, brak wzrostu Zmienne<br />
* Moga˛ wysta˛pić odchylenia od n<strong>or</strong>my.<br />
65
KAŁ<br />
Test hemaglutynacji pośredniej<br />
1. Przez wielokrotne odwirowanie przygotować w fizjologicznym roztw<strong>or</strong>ze soli<br />
2,5% zawiesinę kurzych lub bydlęcych krwinek czerwonych.<br />
2. Na szkiełku zaznaczyć ołówkiem kilka pól i ezą nanieść na każde z nich oczko<br />
(3 mm) zawiesiny krwinek czerwonych.<br />
3. W każdej z przygotowanych zawiesin krwinek umieścić niewielką liczbę<br />
bakterii pobranych z agaru lub skosu KIA, dobrze wymieszać.<br />
W przypadku szczepów biotypu El T<strong>or</strong>, aglutynacja pojawia się w ciągu<br />
30 – 60 sekund. Znane szczepy hemaglutynujące (El T<strong>or</strong>) i nie hemaglutynujące<br />
powinny być użyte jako kontrola dla każdej z nowo przygotowanych zawiesin<br />
krwinek. Świeżo izolowane szczepy klasycznych biotypów dają zwykle ujemny<br />
wynik testu, jednak w przypadku starych szczepów lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych wynik ten nie<br />
zawsze jest ujemny.<br />
Test wrażliwości na polimiksynę B<br />
1. Na podłożu Mueller-Hintona lub na agarze z wyciągiem mięsnym rozprowadzić<br />
oczko hodowli szczepów inkubowanej przez noc w wodzie<br />
peptonowej.<br />
2. Umieścić krążek zawierający 50 jednostek polimiksyny B w centrum hodowli.<br />
3. Umieścić płytkę wchłodziarce na 1 godzinę.<br />
4. Inkubować płytkę przez noc w temperaturze 36°C.<br />
Zidentyfikowane szczepy biotypu klasycznego i El T<strong>or</strong> powinny być zawsze<br />
włączane do grupy szczepów kontrolnych. Klasyczne szczepy są wrażliwe na<br />
polimiksynę B, dlatego zawsze obserwuje się wyraźną strefę zahamowania<br />
wzrostu wokół krążka. Szczepy El T<strong>or</strong> są niewrażliwe i strefa zahamowania nie<br />
jest widoczna.<br />
Campylobacter jejuni i Campylobacter coli<br />
W lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach klinicznych dostępnych jest tylko kilka testów do identyfikacji<br />
gatunków i podgatunków Campylobacter. Ze względu na temperaturę wzrostu<br />
Campylobacter spp. można podzielić na dwie grupy: gatunki ciepłolubne, które<br />
rosną w temperaturze 42 – 43°C, i gatunki nieciepłolubne, które rosną w temperaturze<br />
15 – 25°C.<br />
Do gatunków ciepłolubnych należą: Campylobacter jejuni podgatunek jejuni,<br />
C. coli, C. lari, C. upsaliensis i niektóre szczepy C. hyointestinalis. C. lari<br />
i C. hyointestinalis są op<strong>or</strong>ne, natomiast C. jejuni, C. coli i C. upsaliensis są<br />
wrażliwe na kwas nalidyksowy; C. jejuni podgatunek jejuni, C. coli, C. lari są<br />
op<strong>or</strong>ne, natomiast C. hyointestinalis i C. upsaliensis są wrażliwe na cefalotynę.<br />
Różnicowanie między tymi grupami odbywa się na podstawie zdolności do<br />
hydrolizy hipuranu i wytwarzania siarkowod<strong>or</strong>u na agarze Kliglera.<br />
Do gatunków nieciepłolubnych należą: C. jejuni podgatunek doylei, C. fetus<br />
i Arcobacter butzleri. C. jejuni podgatunek doylei nie rośnie w temperaturze 15°C<br />
ani w temperaturze 25°C; C. fetus rośnie dobrze w 25°C, ale nie rośnie w 15°C;<br />
A. butzleri rośnie w obydwu temperaturach. A. butzleri jest op<strong>or</strong>ny na cefalotynę,<br />
a C. jejuni podgatunek doylei i C. fetus są na nią wrażliwe (tabela 18).<br />
66
CZE˛ŚĆ I<br />
Tabela 18. Identyfikacja biochemiczna gatunków Campylobacter izolowanych z kału<br />
Wzrost w temperaturze<br />
15°C 25°C 42°C<br />
H 2 S/KIA<br />
Hydroliza<br />
hipuranu a<br />
Redukcja<br />
azotanu<br />
Wrażliwość<br />
Kwas<br />
nalidyksowy b<br />
Cefalotyna c<br />
Campylobacter jejuni – – + – + + S R<br />
subsp. jejuni<br />
C. jejuni subsp. doylei – – – – d – S S<br />
C. coli – – + + – + S R<br />
C. lari – – + – – + R R<br />
C. upsaliensis – – + – – + S S<br />
C. fetus subsp. fetus – + – – – + R S<br />
C. hyointestinalis – + v + – + R S<br />
Arcobacter butzleri d + + – – – + v R<br />
Skróty: +: > 95% dodatnich; d+: 75 –95% dodatnich; d: 26 –74% dodatnich d–:5–25% dodatnich; –: < 5% dodatnich; v: reakcja<br />
zmienna; S: wrażliwy; R: op<strong>or</strong>ny; H 2 S/KIA: agar Kliglera.<br />
a<br />
Jedynie kol<strong>or</strong> ciemnej purpury jest dowodem na reakcje dodatnia˛.<br />
b<br />
Kra˛żek zawieraja˛cy 30 µg kwasu nalidyksowego.<br />
c<br />
Kra˛żek zawieraja˛cy 30 µg cefalotyny.<br />
d<br />
Katalazoujemne lub słabo dodatnie; agar Kliglera.<br />
Identyfikacja serologiczna<br />
Salmonella<br />
Nazewnictwo i klasyfikacja pałeczek Salmonella kilkakrotnie ulegały zmianom<br />
i nadal poddawane są pod dyskusję. Zgodnie z obecnym nazewnictwem wszystkie<br />
serotypy Salmonella należą do jednego gatunku, który podzielony jest na sześć<br />
podgrup (zwanych także podgatunkami), do których zaliczany jest dawny rodzaj<br />
Arizona. Podgrupa 1 odpowiada typowym pałeczkom Salmonella i obejmuje<br />
m.in.: Salmonella typhi, S. paratyphi A, S. enteritidis, S. typhimurium, S. choleraesuis.<br />
Podgrupa ta obejmuje około 2000 serotypów, które mogą być różnicowane<br />
na podstawie wz<strong>or</strong>u antygenów (antygeny O, H, Vi). Serotypy należące<br />
do podgrupy 1 są nazywane w sposób sugerujący przynależność do rzeczywistych<br />
gatunków: Salmonella podgrupa 1 serotyp typhimurium jest nazywana po prostu<br />
S. typhimurium. Ponad 99% izolowanych od ludzi pałeczek Salmonella należydo<br />
podgrupy 1.<br />
Ważnymi antygenami w serotypowaniu Salmonella są antygeny somatyczne<br />
O i antygeny rzęskowe H. Antygeny O występują zarówno u ruchliwych, jak<br />
i u nieruchliwych szczepów, są odp<strong>or</strong>ne na gotowanie; antygeny H występują<br />
jedynie u ruchliwych pałeczek i są wrażliwe na gotowanie. Większość gatunków<br />
Salmonella wykazuje dwufazową ruchliwość i może wytwarzać dwie f<strong>or</strong>my<br />
antygenów określanych jako antygeny fazy I i II. W obu fazach szczepy mają ten<br />
sam antygen O, lecz różnią się f<strong>or</strong>mą antygenu H. Do identyfikacji serotypu<br />
konieczne jest określenie specyficzności antygenu H obu faz. Nie zawsze jest to<br />
możliwe, dlatego niekiedy, dla potwierdzenia obecności fazy latencji, konieczne<br />
jest jej zahamowanie.<br />
Antygeny O oznaczone są cyframi arabskimi. Antygeny H fazy I oznaczone są<br />
małymi literami rzymskimi, a antygeny H fazy II cyframi arabskimi. Na przykład,<br />
wzór antygenowy S. typhimurium to 1,4,[5],12:i:1,2, gdzie antygeny O to 1,4,5<br />
i 12; antygeny H fazy I to ,,i’’, a fazy II to 1 i 2. Nawiasy oznaczają, że antygen<br />
może być nieobecny, a podkreślenie wskazuje, że antygen związany jest<br />
z lizogenną konwersją wywołaną przez bakteriofagi. Taka zmiana we wz<strong>or</strong>ze<br />
67
KAŁ<br />
antygenów możliwa jest jedynie w obecności bakteriofaga i może stanowić jedyną<br />
różnicę między niektórymi serotypami.<br />
Gatunki Salmonella podzielono na grupy na podstawie obecności określonych<br />
antygenów O. Wspomniany podział jest także określany jako schemat Kauffmanna-White’a.<br />
Duże litery rzymskie określają grupy O. W <strong>or</strong>yginalnym schemacie<br />
grupy oznaczone były literami A, B, C, D i E; stopniowo poszerzono zakres grup<br />
od A do Z, z czterema podgrupami C, trzema D, czterema E i dwiema G. Grupy<br />
O określane są na podstawie obecności następujących antygenów O:<br />
Grupa: A B a C 1 C 2 D E 1 F<br />
Antygen: 2 4;5 6;7 6;8 9 3;10 11<br />
Istnieją inne różnice w strukturze antygenowej: zmiana w wyglądzie kolonii<br />
od gładkich do sz<strong>or</strong>stkich w zależności od obecności lub braku antygenu<br />
Vi. Obecność antygenu Vi hamuje aglutynację w swoistej surowicy anty-O.<br />
Antygen Vi jest zwykle wykrywany w świeżo izolowanych szczepach i szybko<br />
tracony podczas ich przechowywania. Antygen ten jest ważny w identyfikacji<br />
szczepów S. typhi, często nie ulegających aglutynacji w heterogennej surowicy<br />
anty-H.<br />
Procedura identyfikacji antygenu somatycznego O<br />
Bezpośredni test aglutynacji szkiełkowej<br />
1. Przed rozpoczęciem badania umieścić roztwór soli i odczynniki w temperaturze<br />
pokojowej.<br />
2. Umieścić kroplę roztw<strong>or</strong>u soli na czystym szkiełku mikroskopowym.<br />
3. Za pomocą sterylnej ezy pobrać niewielką ilość materiału z hodowli na skosie<br />
agarowym i rozprowadzić w kropli soli uzyskując jednolitą, mętną zawiesinę.<br />
4. Pod lupą lub pod mikroskopem w niewielkim powiększeniu (× 10) obejrzeć<br />
zawiesinę bakterii, aby wykluczyć autoaglutynację zawiesiny w soli.<br />
5. Pobrać ezą 10 µl poliwalentnej surowicy odp<strong>or</strong>nościowej O Salmonella (A-I<br />
i Vi) i umieścić ją na szkiełku tuż obok zawiesiny bakterii.<br />
6. Wymieszać surowicę z zawiesiną bakterii i przechylać szkiełko do przodu i do<br />
tyłu przez 1 minutę. Obserwować tw<strong>or</strong>zenie się grudek oglądając szkiełko<br />
w dobrym świetle. Pojawienie się w tym czasie wyraźnych grudek jest<br />
wynikiem dodatnim.<br />
7. Jeśli wynik jest dodatni, powtórzyć badanie z monowalentną surowicą<br />
odp<strong>or</strong>nościową.<br />
Niektóre pałeczki Salmonella mają antygen powierzchniowy Vi i żywe lub<br />
nieinaktywowane termicznie nie ulegają aglutynacji z surowicą odp<strong>or</strong>nościową<br />
grupy C1 (O:6,7) lub grupy D (O:9). Aby zapobiec otrzymaniu nieprawidłowego<br />
wyniku, w celu usunięcia antygenu Vi, zawiesinę należy podgrzać w gotującej<br />
się wodzie, schłodzić, oddzielić bakterie przez wirowanie, ponownie<br />
zawiesić wświeżym fizjologicznym roztw<strong>or</strong>ze soli i przeprowadzić test z tą<br />
samą surowicą.<br />
a<br />
Wszystkie szczepy Salmonella podgrupy B zawierają antygen 4, tylko niektóre antygen 5.<br />
68
CZE˛ŚĆ I<br />
Biochemiczna identyfikacja:<br />
gatunek Salmonella<br />
Biochemiczna identyfikacja:<br />
Salmonella typhi<br />
Biochemiczna identyfikacja:<br />
Salmonella paratyphi A<br />
Test z poliwalentna˛ surowica˛<br />
anty-Salmonella A-I + Vi<br />
Test z poliwalentna˛ surowica˛ Test z poliwalentna˛ surowica˛<br />
anty-Salmonella A-I + Vi anty-Salmonella A-I + Vi<br />
dodatni<br />
ujemny ujemny<br />
anty-grupa B anty-grupa D<br />
dodatni dodatni<br />
Test z anty-H:b; anty-H:1,2; H:i<br />
dodatni dodatni<br />
wszystkie<br />
ujemne<br />
anty-H:m<br />
ujemny<br />
anty-grupa D<br />
+anty-Vi* anty-grupa A<br />
ujemny<br />
H:b H:1,2 H:i<br />
dodatni dodatni dodatni<br />
obydwa<br />
dodatnie<br />
jeden lub<br />
obydwa ujemne<br />
dodatni<br />
Agar do oceny Agar do oceny Agar do oceny<br />
ruchu ruchu ruchu<br />
z anty-H:b z anty-H:1,2 z anty-H:i<br />
anty-H:d anty-H:a<br />
ujemny<br />
H:1,2 ujemny<br />
Test z anty-H:1,2 Test z anty-H:i Test z anty-H:1,2<br />
H:1,2<br />
dodatni anty-H:b<br />
H:i H:1,2<br />
dodatni dodatni<br />
H:1,2<br />
ujemny<br />
dodatni dodatni dodatni<br />
ujemny D-winian dodatni<br />
dodatni<br />
Salmonella<br />
species<br />
Salmonella<br />
paratyphi B<br />
Salmonella<br />
serotyp<br />
paratyphi B<br />
Salmonella<br />
species<br />
Salmonella<br />
typhimurium<br />
Salmonella<br />
species<br />
Salmonella<br />
enteritidis<br />
Salmonella<br />
species<br />
Salmonella<br />
typhi<br />
Salmonella<br />
species<br />
Salmonella<br />
paratyphi A<br />
Salmonella<br />
species<br />
WHO 01.51<br />
*Jeśli reakcja aglutynacji zachodzi jedynie z surowica˛ anty-Vi, należy zagotować zawiesinę bakterii i powtórzyć badanie z surowica˛ O:D.<br />
Ryc. 8. Identyfikacja serologiczna gatunku Salmonella.<br />
69
KAŁ<br />
Procedura identyfikacji antygenu H<br />
Wstępna identyfikacja antygenu rzęskowego H może być przeprowadzona<br />
w teście bezpośredniej aglutynacji, jak opisano powyżej dla antygenu somatycznego<br />
O. Niekiedy konieczne jest zwiększenie ekspresji ruchu badanych szczepów<br />
przez kilkakrotne kolejne przesiewy na półpłynne podłoża odżywcze (,,swarm<br />
agar’’, patrz niżej). Surowice odp<strong>or</strong>nościowe do wykonania testu z tymi<br />
antygenami są dostępne komercyjnie. Mimo to, jeśli identyfikacja obu faz<br />
rzęskowych jest niezbędna do klasyfikacji, wymagana jest faza zahamowania.<br />
Często konieczna jest także inwersja faz z użyciem przeznaczonych do tego celu<br />
surowic 1 .<br />
1. Przygotować półpłynne podłoża odżywcze zawierające 0,2 – 0,4% agaru.<br />
Umieścić po 1 ml podłoża w probówkach.<br />
2. Zastąpić k<strong>or</strong>ki probówek k<strong>or</strong>kami z waty.<br />
3. Upłynnić agar w gotującej się wodzie i umieścić probówki z płynnym agarem<br />
w łaźni wodnej w temperaturze 45°C na 30 minut.<br />
4. Opisać każdą probówkę numerem próbki i surowicy anty-H (H:b, H:i i H:1,2).<br />
Również probówkę kontrolną.<br />
5. Dodać 10 µl heterogennej surowicy H każdej fazy inwersji do odpowiednich<br />
agarów, delikatnie wstrząsnąć probówki i pozostawić agar do skrzepnięcia<br />
w skosie.<br />
6. Sp<strong>or</strong>ządzić gęstą zawiesinę izolowanych kolonii w roztw<strong>or</strong>ze fizjologicznym<br />
soli, posiać ezą, nakłuwając skos, i inkubować przez noc.<br />
7. Z hodowli uzyskanej na skosie pobrać ezą materiał i rozprowadzić równomiernie<br />
w kropli roztw<strong>or</strong>u fizjologicznego soli.<br />
8. Ezą o objętości 10 µl pobrać kroplę jednej z heterogennych surowic<br />
odp<strong>or</strong>nościowych H i umieścić ją na szkiełku, tuż obok zawiesiny<br />
bakterii.<br />
9. Wymieszać surowicę z zawiesiną bakterii, przechylając szkiełko do przodu<br />
idotyłu przez 1 minutę. Obserwować tw<strong>or</strong>zenie się grudek, oglądając<br />
szkiełko w dobrym świetle. Pojawienie się w tym czasie wyraźnych grudek<br />
świadczy o dodatnim wyniku.<br />
10. Jeśli to konieczne, należy powtórzyć test aglutynacji z innymi heterogennymi<br />
surowicami i zidentyfikować serotyp, wyk<strong>or</strong>zystując schemat przedstawiony<br />
na str. 69.<br />
Salmonella typhi<br />
Dla potwierdzenia identyfikacji biochemicznej należy przeprowadzić testy<br />
z surowicami odp<strong>or</strong>nościowymi Vi, O grupy D (O:D) i H:d. Z powodu obecności<br />
antygenu Vi hodowle aglutynujące w surowicy Vi mogą nie aglutynować<br />
w surowicy O:D. Należy usunąć antygen Vi, podgrzewając zawiesinę w temperaturze<br />
100°C przez 20 minut, i powtórnie przeprowadzić test z surowicą O:D.<br />
Po uzyskaniu aglutynacji w surowicach Vi, O:D i H:d zanotować: ,,Salmonella<br />
typhi’’. Jeśli wynik jest dodatni jedynie w surowicy O:D, zanotować:,,Salmonella,<br />
grupa D’’.<br />
1<br />
Dostępne w Statens Serum Institut, 5 Artillerivej, 2300 Copenhagen S, Denmark.<br />
70
CZE˛ŚĆ I<br />
Salmonella paratyphi A<br />
Dla potwierdzenia identyfikacji biochemicznej należy przeprowadzić test z surowicą<br />
odp<strong>or</strong>nościową Salmonella grupy A. Jeśli wynik jest dodatni, przeprowadzić<br />
test z surowicą H:a i w przypadku uzyskania dodatniego wyniku zanotować:<br />
,,Salmonella paratyphi A’’. Jeśli wynik z surowicą H:a jest ujemny, zanotować:<br />
,,Salmonella grupa A’’. Jeśli nie wykazano ruchu, można rozważyć obecność<br />
S. flexneri typ 6 lub S. boydii typ 13 lub 14 i przeprowadzić test z surowicą<br />
odp<strong>or</strong>nościową Shigella BiD.<br />
Inne serotypy Salmonella<br />
Jeśli wyniki powyżej opisanych testów wskazują na obecność typowych pałeczek<br />
Salmonella, należy przeprowadzić testy z surowicami odp<strong>or</strong>nościowymi Salmonella<br />
O grup A, B, C, D i E.<br />
• Jeśli dodatni wynik wskazuje na grupę B, wykonać test z surowicą H:b, H:i<br />
i H:1,2. Jeśli uzyskamy wynik dodatni z surowicą H:b, identyfikowanym<br />
mikro<strong>or</strong>ganizmem może być S. wien lub S. paratyphi B. S. wien można odróżnić<br />
od S. paratyphii B w odczynie alutynacji z surowicą H:1,w i H:2 (jeśli są<br />
dostępne). S. wien aglutynuje w surowicy H:1,w, a S. paratyphi w H:2.<br />
• Jeśli wynik z surowicą H:i lub H:1,2 jest dodatni, wywołać inwersję fazy<br />
i przeprowadzić test z heterogenną surowicą H. Jeśli wynik jest dodatni,<br />
zanotować:,,S. typhimurium’’. Jeśli wynik jest ujemny, zanotować:,,Salmonella<br />
grupa B’’.<br />
• Jeśli wynik z surowicą C jest dodatni, zanotować: ,,Salmonella grupa C’’.<br />
• Jeśli wynik z surowicą D jest dodatni, przeprowadzić testy z surowicami Vi, H:d<br />
i H:m. Jeśli wynik z surowicą Vi lub H:d jest dodatni, zanotować: ,,Salmonella<br />
typhi’’. Jeśli wynik z surowicą H:m jest dodatni, zanotować: ,,Salmonella<br />
enteritidis’’. Jeśli testy z surowicami Vi, H:d i H:m są ujemne, zanotować:<br />
,,Salmonella grupa D’’.<br />
• Jeśli identyfikacja biochemiczna wskazuje na szczep Salmonella, ale testy ze<br />
wszystkimi surowicami grup O są ujemne, zanotować: ,,Prawdopodobnie<br />
gatunek Salmonella’’ i przesłać do Centralnego Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium Referencyjnego.<br />
Shigella<br />
Pałeczki Shigella można podzielić na serogrupy i serotypy na podstawie<br />
szkiełkowych i probówkowych odczynów aglutynacji ze swoistymi surowicami<br />
odp<strong>or</strong>nościowymi O. Odczyn aglutynacji szkiełkowej zwykle wystarcza, jeśli<br />
wynik badania jest jednoznaczny. Zawiesina antygenu powinna być przygotowana<br />
z nieselektywnego podłoża, np. z agaru odżywczego lub KIA, i uważnie<br />
obserwowana w celu wykluczenia autoaglutynacji przed dodaniem surowicy.<br />
Testy z surowicami odp<strong>or</strong>nościowymi Shigella<br />
grupy A, B, C i D<br />
• Jeśli pojawi się aglutynacja z surowicą grupy A, zanotować: ,,Shigella<br />
dysenteriae’’. Przeprowadzić test z surowicą S. dysenteriae typ 1. Jeśli jest<br />
dodatni, zanotować: ,,S. dysenteriae typ 1’’.<br />
71
KAŁ<br />
• Jeśli pojawi się aglutynacja z surowicą grupy B, zanotować: ,,Shigella<br />
flexneri’’.<br />
• Jeśli pojawi się aglutynacja z surowicą grupy C, zanotować:,,Shigella boydii’’.<br />
• Jeśli pojawi się aglutynacja z surowicą grupy D, zanotować:,,Shigella sonnei’’.<br />
Czasami szczepy Shigella z powodu obecności antygenu K mogą nie ulegać<br />
aglutynacji w homologicznych surowicach. Podgrzanie zawiesiny szczepów<br />
w roztw<strong>or</strong>ze fizjologicznym soli w łaźni wodnej przez 20 minut i ponowne<br />
przeprowadzenie testu może znieść hamujący wpływ antygenu K.<br />
Niektóre Gram-ujemne mikro<strong>or</strong>ganizmy mogą mieć antygeny wspólne ze<br />
szczepami Shigella i dawać fałszywie dodatnie wyniki aglutynacji z surowicami<br />
do typowania Shigella. Dobrze znanym przykładem bakterii dających krzyżową<br />
reakcję są szczepy Plesiomonas shigelloides i Shigella sonnei fazy I <strong>or</strong>az Hafnia<br />
i Shigella flexneri serotyp 4a; najważniejsza jest jednak krzyżowa reakcja<br />
z niektórymi odpowiedzialnymi za biegunkę szczepami E. coli.<br />
Yersinia enterocolitica<br />
Y. enterocolitica ma kilka antygenów somatycznych O, które zostały wyk<strong>or</strong>zystane<br />
do podziału gatunku na 17 serogrup. Większość zakażeń u ludzi w Kanadzie,<br />
Europie i Japonii wywołana jest przez serotyp O3. Infekcje wywołane przez<br />
serotyp O9 opisywano głównie w Skandynawii, infekcje wywołane przez serotyp<br />
O8 występują prawie wyłącznie w USA. Istnieje krzyżowa reakcja serologiczna<br />
między Y. enterocolitica O9 i Brucella spp.<br />
72
Zakażenia górnych dróg<br />
oddechowych<br />
Wprowadzenie<br />
Górne drogi oddechowe obejmują obszar od krtani do nozdrzy, w skład którego<br />
wchodzą: jama ustna, gardło i jama nosowo-gardłowa <strong>or</strong>az przylegające jamy<br />
zatok i ucho środkowe.<br />
Zakażenia występujące w górnych drogach oddechowych, to:<br />
– zapalenie gardła, niekiedy z zapaleniem migdałków, prowadzące do ,,bolesnego<br />
gardła’’,<br />
– zapalenie jamy nosowo-gardłowej,<br />
– zapalenie ucha środkowego,<br />
– zapalenie zatok,<br />
– zapalenie nagłośni.<br />
Spośród wymienionych infekcji zdecydowanie najczęściej występuje zapalenie<br />
gardła; nie leczone zakażenia mogą mieć poważne konsekwencje. W niniejszym<br />
opracowaniu zostanie omówione tylko zapalenie gardła.<br />
Większość przypadków zapalenia gardła ma etiologię wirusową i samoograniczający<br />
się przebieg. Jednakże około 20% infekcji wywołanych jest przez bakterie<br />
i zwykle wymaga leczenia odpowiednimi antybiotykami. Lekarz opierając się<br />
tylko na badaniu fizykalnym rzadko może rozróżnić zakażenie wirusowe<br />
i bakteryjne, dlatego najlepiej, jeśli leczenie jest oparte na wyniku badania<br />
mikrobiologicznego.<br />
Diagnostyka bakteriologiczna zapalenia gardła jest skomplikowana ze względu na<br />
obecność licznej, mieszanej fl<strong>or</strong>y fizjologicznej złożonej z tlenowych i beztlenowych<br />
bakterii. Fl<strong>or</strong>a naturalna przewyższa zwykle liczebnie patogenną, rola<br />
mikrobiologa polega więc na rozróżnieniu komensali od patogenów. Jeśli to<br />
możliwe, w wyniku badania należy uwzględnić tylko bakterie patogenne.<br />
Fl<strong>or</strong>a fizjologiczna gardła<br />
Wskład naturalnej fl<strong>or</strong>y gardła wchodzi tak duża liczba gatunków, że pełna<br />
identyfikacja i uwzględnienie wszystkich w wyniku nie jest konieczne, zwłaszcza<br />
gdy w posiewie zaobserwowano:<br />
• paci<strong>or</strong>kowce zieleniejące (α-hemolizujące) i pneumokoki,<br />
• niepatogenne Neisseria spp.,<br />
• M<strong>or</strong>axella (wcześniej Branhamella) catarrhalis (może być również patogenem<br />
układu oddechowego),<br />
• gronkowce (S. aureus, S. epidermidis),<br />
• dyfteroidy (z wyjątkiem C. diphtheriae),<br />
• Haemophilus spp.,<br />
• drożdże (Candida spp.) w ograniczonej liczbie,<br />
• różne bezwzględnie beztlenowe ziarenkowce Gram-dodatnie, pałeczki Gram-<br />
-ujemne, krętki i f<strong>or</strong>my nitkowate.<br />
73
ZAKAŻENIA GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH<br />
U osób starszych, o obniżonej odp<strong>or</strong>ności lub niedożywionych, zwłaszcza<br />
po antybiotykoterapii, gardło może być skolonizowane przez pałeczki Enterobacteriaceae<br />
(Escherichia coli, Klebsiella spp. i in.) <strong>or</strong>az Gram-ujemne<br />
pałeczki niefermentujące (Acinetobacter spp. i Pseudomonas spp.). Równie<br />
często u takich pacjentów dochodzi do namnażania się w gardle szczepów S.<br />
aureus lub Candida spp. i innych gatunków drożdżopodobnych grzybów.<br />
Wymienione mikro<strong>or</strong>ganizmy mogą wywoływać zapalenie gardła jedynie u pacjentów<br />
w okresie granulocytopenii, zaleca się jednak uwzględnienie w wyniku<br />
inf<strong>or</strong>macji o izolacji takich szczepów, ponieważ ich obecność może wskazywać<br />
na infekcję (czy też ryzyko infekcji) dolnych dróg oddechowych (np.: zapalenie<br />
płuc) lub bakteriemię. Dla kolonizujących gardło mikro<strong>or</strong>ganizmów zwykle nie<br />
nastawia się antybiogramu.<br />
Bakteryjne czynniki zapalenia gardła<br />
Streptococcus pyogenes (grupa A wg Lancefielda) jest z pewnością najczęstszą<br />
przyczyną bakteryjnego zapalenia gardła i migdałków. Zakażenie występuje<br />
najczęściej u małych dzieci (5 – 12 lat). Jeśli zapaleniu gardła towarzyszy<br />
charakterystyczna wysypka, ch<strong>or</strong>obę określa się mianem g<strong>or</strong>ączki płoniczej.<br />
U dzieci podczas paci<strong>or</strong>kowcowej infekcji gardła może dojść do zajęcia jamy<br />
nosowo-gardłowej z towarzyszącą ropną wydzieliną z nosa.<br />
Nie należące do grupy A β-hemolizujące paci<strong>or</strong>kowce (np. grupa B, C i G) rzadko<br />
są przyczyną bakteryjnego zapalenia gardła i ich izolację należy odnotować<br />
w wyniku. Nieodpowiednio leczone infekcje gardła wywołane przez S. pyogenes<br />
mogą mieć konsekwencje w postaci g<strong>or</strong>ączki reumatycznej i — rzadziej<br />
— kłębuszkowego zapalenia nerek. Dokładna identyfikacja i ukierunkowane<br />
leczenie przeciw S. pyogenes mają na celu zapobieganie pojawieniu się g<strong>or</strong>ączki<br />
reumatycznej.<br />
C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae wywołuje błonicę, ch<strong>or</strong>obę występującą endemicznie<br />
w wielu krajach. Tam, gdzie przerwano realizację programów<br />
szczepień, ch<strong>or</strong>oba może przyjąć rozmiary epidemii. Typowy dla C. diphtheriae<br />
przebieg infekcji (z kilkoma wyjątkami) charakteryzuje się obecnością szarawobiałych<br />
nalotów w miejscu zakażenia (gardło, migdałki, nos lub krtań). Błonica<br />
jest ciężką ch<strong>or</strong>obą, w której diagnoza stawiana jest na podstawie objawów.<br />
Lekarz może zlecić dodatkowo wykonanie posiewu w kierunku maczugowców<br />
błonicy.<br />
W niektórych krajach c<strong>or</strong>az częściej rozpoznawane jest gonokokowe zapalenie<br />
gardła, którego częstość występowania staje się p<strong>or</strong>ównywalna do rzeżączkowego<br />
zapalenia szyjki macicy i cewki moczowej. Posiew wymazów z gardła powinien<br />
być wykonywany na wyraźne polecenie lekarza z użyciem właściwego podłoża<br />
selektywnego (zmodyfikowane podłoże Thayer-Martina).<br />
Martwicze, wrzodziejące zapalenie gardła (angina Vincenta) jest rzadkim stanem,<br />
charakteryzującym się występowaniem martwiczych owrzodzeń gardła z tw<strong>or</strong>zeniem<br />
błon rzekomych lub bez błon rzekomych. W miejscu infekcji obecna jest<br />
liczna, bezwzględnie beztlenowa fl<strong>or</strong>a mieszana z przewagą Gram-ujemnych<br />
bakterii nitkowatych i spiralnych, należących głównie do Fusobacterium spp.<br />
i Treponema vincenti. Bakterie te należą do fizjologicznej fl<strong>or</strong>y jamy ustnej,<br />
jednak ich duża liczba widoczna w barwionym metodą Grama preparacie<br />
74
CZE˛ŚĆ I<br />
z wrzodziejących zmian powinna zostać odnotowana jako ,,kompleks wrzecionowcowo-krętkowy’’.<br />
Rozpoznanie mikroskopowe nie wymaga potwierdzenia<br />
w hodowli beztlenowej, która jest trudna i czasochłonna. Obecność kompleksu nie<br />
wyklucza potrzeby poszukiwania innych patogenów, zwłaszcza S. pyogenes.<br />
C. albicans i inne gatunki Candida obecne w niewielkiej liczbie uznawane są za<br />
element fl<strong>or</strong>y fizjologicznej jamy ustnej, jednak w pewnych stanach ch<strong>or</strong>obowych,<br />
np. u niedożywionych wcześniaków, u d<strong>or</strong>osłych z niedob<strong>or</strong>ami odp<strong>or</strong>ności<br />
(np. pacjenci z HIV/AIDS) lub u pacjentów otrzymujących antybiotykoterapię,<br />
ich liczba wzrasta, prowadząc do wystąpienia kandydozy jamy ustnej. Zakażone<br />
powierzchnie — język, migdałki, gardłoibłona śluzowa policzków — mogą być<br />
intensywnie czerwone, pokryte białymi plamkami lub zlewającą się szarobiałą<br />
błoną (pleśniawka). Potwierdzeniem kandydozy jest obecność w preparacie<br />
bezpośrednim barwionym metodą Grama licznych, drożdżopodobnych grzybów,<br />
tw<strong>or</strong>zących niekiedy długie, przypominające grzybnię nici.<br />
Posiewy z górnych dróg oddechowych mogą być przesyłane do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
nie tylko w celu zdiagnozowania infekcji, ale także w celu wykrycia obecności<br />
potencjalnie patogennych szczepów u zdrowych ludzi — ,,nosicieli’’.<br />
Takie badania powinny być wykonywane w ramach dobrze prowadzonego<br />
nadz<strong>or</strong>u epidemiologicznego. W górnych drogach oddechowych występuje<br />
nosicielstwo:<br />
• Staphylococcus aureus. Badania wymazów z nosa pacjentów i personelu<br />
szpitalnego w kierunku nosicielstwa jest zalecane podczas ustalania źródła<br />
zakażenia metycylinoop<strong>or</strong>nym S. aureus (MRSA).<br />
• Neisseria meningitidis. Nawet poza okresem epidemii nosicielstwo meningokoków<br />
może być bardzo częste (20% i więcej). Identyfikacja nosicieli rzadko<br />
jest konieczna i nie ma potrzeby wykonywania badań w tym kierunku przed<br />
zaleceniem profilaktyki antybiotykowej u rodziny i u osób z bliskiego kontaktu<br />
pacjenta z zapaleniem opon mózgowo-rdzeniowych.<br />
• Streptococcus pyogenes. Nosicielstwo niewielkiej liczby tych bakterii może<br />
być powszechne, zwłaszcza wśród dzieci szkolnych (20 – 30%).<br />
• C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae. Wysoki odsetek nosicielstwa występuje w populacjach<br />
nie szczepionych. W takich społecznościach uzasadnione może być<br />
wykonywanie identyfikacji i leczenie nosicielstwa u osób z otoczenia pacjenta<br />
z potwierdzoną błonicą. Nosicielstwo jest rzadkie w krajach, w których<br />
właściwie realizowany jest program szczepień.<br />
Pobieranie i przesyłanie próbek<br />
Najlepiej, jeśli materiał pobierany jest przez lekarza lub przez inną osobę<br />
wykwalifikowaną. Pacjent powinien siedzieć twarzą do źródła światła. Należy<br />
przytrzymać język szpatułką i sterylną wymazówką energicznie pobrać wymaz<br />
z każdego migdałka, z tylnej ściany gardła i z innych zmienionych zapalnie<br />
miejsc (wymazówkę należy wcześniej zwilżyć jałowym fizjologicznym<br />
roztw<strong>or</strong>em soli — przyp. tłum.). Należy uważać, aby nie dotknąć<br />
języka lub błony śluzowej policzków. Najlepiej, jeśli zostaną pobrane po dwa<br />
wymazy z każdego miejsca. Jeden może być wyk<strong>or</strong>zystany do przygotowania<br />
preparatu bezpośredniego, a drugi należy umieścić w szklanej lub plastikowej<br />
probówce i przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. Można także obydwa wymazy przesłać do<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. Jeśli posiew pobranego materiału nie może być wykonany w ciągu<br />
4 godzin, wymazówki należy umieścić w podłożu transp<strong>or</strong>towym (np. Amies lub<br />
Stuart).<br />
75
ZAKAŻENIA GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH<br />
Mikroskopia bezpośrednia<br />
Charakterystyczny dla wrzodziejącego zapalenia gardła (angina Vincenta) kompleks<br />
wrzecionowcowo-krętkowy <strong>or</strong>az grzyby Candida są najlepiej widoczne<br />
w preparacie barwionym metodą Grama, który powinien być wykonany na<br />
zlecenie lekarza. Barwienie metodą Grama jest nieprzydatne w wykrywaniu<br />
paci<strong>or</strong>kowców czy Neisseria spp. Preparat bezpośredni jest także niewystarczająco<br />
specyficzny i czuły w wykrywaniu maczugowca błonicy, chyba że<br />
materiał został pobrany bardzo starannie i zbadany przez doświadczonego<br />
mikrobiologa. Przy braku wskazań klinicznych lub bez zlecenia lekarza nie ma<br />
potrzeby wykonywania preparatów bezpośrednich z gardła.<br />
Hodowla i identyfikacja<br />
Hodowla Streptococcus pyogenes<br />
Natychmiast po dostarczeniu do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium materiał musi zostać posiany<br />
wymazówką na jedną czwartą płytki agarowej z krwią i rozsiany ezą na pozostałą<br />
część płytki. Agar z krwią powinien być przygotowany z podstawowego podłoża<br />
agarowego bez glukozy (lub z małą zawartością glukozy), np. z agaru tryptozowo-<br />
-sojowego (TSA). Kwaśny rozkład glukozy przez S. pyogenes hamuje wytwarzanie<br />
hemolizyn. Do przygotowania podłoży można wyk<strong>or</strong>zystać krew<br />
każdego gatunku (świeżo pobraną) w stężeniu 5%. Płytki należy wypełnić<br />
4 – 5 mm warstwą podłoża. Preferowana jest krew wołowa, ponieważ ulega<br />
hemolizie pod wpływem pewnych komensalnych pałeczek Haemophilus spp. i nie<br />
daje hemolizy w obecności zymogennego wariantu Enterococcus faecalis.<br />
Można poprawić rozpoznawanie β-hemolizujących kolonii i przyspieszyć ich<br />
wstępną identyfikację, umieszczając na płytce w strefie pierwszego posiewu<br />
krążek z kotrimoksazolem (taki, jakiego używa się podczas określania lekowrażliwości)<br />
i specjalny krążek o niskiej zawartości bacytracyny. Ponieważ<br />
S. pyogenes w odróżnieniu od wielu innych bakterii jest op<strong>or</strong>ny na kotrimoksazol,<br />
krążek ułatwia obserwację β-hemolizy. Inkubacja w eksykat<strong>or</strong>ze pozwala na<br />
wykrycie większości β-hemolizujących paci<strong>or</strong>kowców. Prostym sposobem nasilającym<br />
hemolizę jest głębokie, pionowe nakłucie agaru ezą, które przyspiesza<br />
wzrost kolonii pod powierzchnią. Po 18 godzinach i ponownie po 48 godzinach<br />
inkubacji w 35 – 37°C odczytać płytki z krwią, poszukując małych (0,5 – 2 mm)<br />
kolonii, otoczonych stosunkowo dużą strefą wyraźnej hemolizy. Po wykonaniu<br />
preparatu barwionego metodą Grama i potwierdzeniu obecności Gram-dodatnich<br />
ziarenkowców bakterie należy identyfikować w kierunku S. pyogenes. Dla<br />
potrzeb klinicznych wstępna identyfikacja oparta jest na ocenie wrażliwości na<br />
niskie stężenie bacytracyny. W tym celu wyk<strong>or</strong>zystuje się specjalnie przygotowane<br />
krążki różnicujące, zawierające 0,02 – 0,05 IU bacytracyny. Zwykłe krążki<br />
wyk<strong>or</strong>zystywane do antybiogramów zawierają 10 IU i są nieprzydatne do<br />
identyfikacji. Obecność β-hemolizujących paci<strong>or</strong>kowców ze strefą zahamowania<br />
wzrostu wokół krążka świadczy o izolacji S. pyogenes. Jeśli w pierwszym<br />
posiewie hemolizujące kolonie są liczne, obecność lub brak strefy zahamowania<br />
wzrostu są wyraźnie widoczne już na pierwszej posianej płytce zawierającej agar<br />
z krwią. Jeśli kolonie są mniej liczne, należy z pierwszej płytki pobrać jedną lub<br />
dwie kolonie, posiać je na 1 / 5 kolejnej płytki w celu uzyskania ciągłego wzrostu<br />
i na każdym posianym polu umieścić krążek z bacytracyną. Strefy zahamowania<br />
wzrostu należy odczytać po całonocnej inkubacji.<br />
76
CZE˛ŚĆ I<br />
W niektórych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach wstępna identyfikacja potwierdzana jest serologicznie<br />
przez wykazanie obecności specyficznych polisacharydów ściany komórkowej.<br />
Test może być przeprowadzony z użyciem klasycznej metody precypitacji lub<br />
— szybciej — zużyciem komercyjnych przeciwciał w teście szybkiej koaglutynacji<br />
szkiełkowej lub w teście aglutynacji lateksowej. Jeśli istnieje taka<br />
potrzeba, β-hemolizujące paci<strong>or</strong>kowce op<strong>or</strong>ne na bacytracynę można identyfikować<br />
wyk<strong>or</strong>zystując do tego celu proste testy (patrz tabela 19).<br />
Obecność S. pyogenes w posiewie z gardła powinna zostać określona w wyniku<br />
w sposóbpółilościowy (nieliczne, +, ++ lub +++). Masywny wzrost S. pyogenes<br />
na całej powierzchni płytki jest charakterystyczny dla materiałów pobranych od<br />
pacjentów z paci<strong>or</strong>kowcowym zapaleniem gardła. Hodowle od nosicieli wykazują<br />
zwykle wzrost mniej niż 20 kolonii na płytce. Obecność nawet nielicznych kolonii<br />
β-hemolizujących paci<strong>or</strong>kowców powinna zostać potwierdzona i zanotowana.<br />
Tabela 19. Różnicowanie β-hemolizuja˛cych paci<strong>or</strong>kowców<br />
Gatunki S. pyogenes S. agalactiae<br />
E. faecalis<br />
var. zymogenes a<br />
Inne<br />
Grupa Lancefield A B D C, G, F<br />
Hemoliza β β b β β<br />
Strefa wokółróżnicuja˛cego<br />
+ 0 c 0 c 0 d<br />
kra˛żka z bacytracy-<br />
na˛<br />
Agar z żółcia˛ i z eskulina˛ 0 0 + 0<br />
(wzrost i zaczernienie)<br />
Odwrotny test CAMP 0 + 0 0<br />
Wrażliwość na kotrimoksazol<br />
0 0 0 +<br />
e<br />
Test PYR f + 0 + 0<br />
a<br />
b<br />
c<br />
d<br />
e<br />
f<br />
E. faecalis var. zymogenes wykazuja˛ce β-hemolizę tylko na agarze z krwia˛ końska˛.<br />
5% niehemolizuja˛cych.<br />
5% dodatnich.<br />
10% dodatnich.<br />
Kra˛żek jak w teście Kirby-Bauera.<br />
PYR: pirolidonylo-β-naftylamid.<br />
Hodowla C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae<br />
Mimo że maczugowiec błonicy dobrze rośnie na zwykłym agarze z krwią, lepszy<br />
wzrost uzyskuje się przy posiewie na jedno z dwóch specjalnych podłoży:<br />
• Skoagulowana surowica Löfflera lub podłoże jajeczne D<strong>or</strong>seta. Jakkolwiek<br />
nieselektywne, obydwa te podłoża umożliwiają obfity wzrost maczugowca<br />
błonicy po jednodniowej inkubacji. Ponadto m<strong>or</strong>fologia komórek jest bardziej<br />
,,typowa’’: nieregularnie wybarwione, krótkie lub długie, lekko zakrzywione<br />
pałeczki wykazujące metachromatyczne ziarnistości i ułożone w kształt V lub<br />
równoległych palisad. Metachromatyczne ziarnistości są wyraźniej widoczne<br />
po wybarwieniu błękitem metylenowym lub barwieniu Alberta niż po zabarwieniu<br />
metodą Grama.<br />
• Selektywny agar tellurynowy z krwia˛. Podłoże to ułatwia izolację, jeśli<br />
maczugowce są nieliczne, jak np. w przypadku nosicieli. Na tym podłożu<br />
kolonie maczugowców błonicy są szarawe lub czarne, a pełny wzrost pojawia<br />
się po 48 godzinach. Charakterystyczne kolonie, zawierające w preparacie<br />
barwionym metodą Grama pałeczki o m<strong>or</strong>fologii podobnej do maczugowców,<br />
należy przesiać na płytkę z agarem z krwią i określić ich czystość <strong>or</strong>az<br />
77
ZAKAŻENIA GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH<br />
,,typową’’ m<strong>or</strong>fologię. Należy pamiętać, że kolonie C. diphtheriae najczęściej<br />
występującego biotypu mitis, wytwarzają na agarze z krwią wyraźną strefę<br />
β-hemolizy.<br />
Wstępny wynik identyfikacji C. diphtheriae może zostać wydany już na tym<br />
etapie. Wynik ten powinien zostać potwierdzony lub wykluczony za pomocą<br />
prostych testów biochemicznych <strong>or</strong>az przez wykazanie zdolności szczepu do<br />
wytwarzania toksyn. Badanie immunogenności jest wykonywane na świnkach<br />
m<strong>or</strong>skich lub za pomocą testu toksygenności in vitro (próba Eleka) i powinno być<br />
przeprowadzane w centralnych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach, w pozostałych identyfikacja jest<br />
oparta na szybkich testach biochemicznych. C. diphtheriae jest katalazoi<br />
azotanododatni. Nie hydrolizuje mocznika. Z glukozy i maltozy, ogólnie nie<br />
z sacharozy, wytwarza kwas bez gazu. Test fermentacji glukozy może być<br />
przeprowadzony na podłożu Kliglera. Aktywność ureazy można wykryć na<br />
podłożu MIU, a redukcję azotanu na bulionie azotanowym, w ten sam sposób, jak<br />
dla Enterobacteriaceae. Do oceny fermentacji maltozy i sacharozy można użyć<br />
jako bazy wody peptonowej Andrade’a z końcowym 1% stężeniem każdego<br />
wod<strong>or</strong>owęglanu. Wyniki zwykle odczytuje się po 24 godzinach, choć konieczna<br />
może okazać się reinkubacja przez noc. Należy podkreślić, że diagnostyka<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjna ma na celu potwierdzenie klinicznie rozpoznanej błonicy. Nie<br />
należy zwlekać z rozpoczęciem terapii do czasu otrzymania wyników z lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
Więcej inf<strong>or</strong>macji na temat izolacji i identyfikacji C. diphtheriae znaleźć<br />
można w podręczniku Guidelines f<strong>or</strong> lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y diagnosis of diphtheria 1 .<br />
Badanie lekowrażliwości<br />
Rutynowe badanie lekowrażliwości szczepów izolowanych z gardła zazwyczaj<br />
nie jest wymagane, a nawet może okazać się mylące. W większości bakteryjnych<br />
zakażeń gardła czynnikami etiologicznymi są S. pyogenes i C. diphtheriae,<br />
a lekiem z wyb<strong>or</strong>u w antybiotykoterapii są benzylopenicylina i erytromycyna.<br />
W przypadku błonicy wskazane jest również leczenie antytoksyną.<br />
1<br />
Begg N.: Manual f<strong>or</strong> the menagement and control of diphtheria in the European region.<br />
Copenhagen, WHO Regional Office f<strong>or</strong> Europe, 1994.<br />
78
Zakażenia dolnych dróg<br />
oddechowych<br />
Wprowadzenie<br />
Zakażenia dolnych dróg oddechowych występują poniżej poziomu krtani, np.<br />
w tchawicy, oskrzelach lub tkance płucnej (zapalenie tchawicy, zapalenie<br />
oskrzeli, ropień płuca, zapalenie płuc). Czasami w zapaleniu płuc zakażeniem<br />
objęta jest przyległa błona pokrywająca płuca, w konsekwencji pojawia się<br />
zgrubienie opłucnej (zapalenie opłucnej) i płyn w jamie opłucnej (wysięk<br />
opłucnej).<br />
Specyficzną f<strong>or</strong>mą zakażenia dolnych dróg oddechowych jest gruźlica płucna,<br />
która występuje powszechnie w wielu krajach. Pacjent kaszląc może uwalniać<br />
aerozol zawierający prątki gruźlicy (Mycobacterium tuberculosis), które mogą<br />
zostać zainhalowane przez innych ludzi. Taka f<strong>or</strong>ma ch<strong>or</strong>oby (,,czynna’’ gruźlica)<br />
szybko szerzy się z osoby na osobę i dlatego zaliczana jest do niebezpiecznych<br />
ch<strong>or</strong>ób zakaźnych.<br />
Wielu pacjentów z zakażeniem dolnych dróg oddechowych odkrztusza ropną<br />
(zawierającą ropę) wydzielinę, która zwykle ma zielony lub żółtawy kol<strong>or</strong>; taka<br />
plwocina może być posiewana, badana makroskopowo i mikroskopowo.<br />
W niektórych zakażeniach plwociny jest bardzo niewiele lub nie obserwuje się jej<br />
wcale: ch<strong>or</strong>oba legionistów (wywołana przez Legionella pneumophila), zapalenie<br />
płuc wywołane przez Mycoplasma pneumoniae (,,pierwotne atypowe zapalenie<br />
płuc’’) i zapalenie płuc wywołane przez chlamydie. Ch<strong>or</strong>oby te wymagają<br />
specjalnych metod diagnostycznych (serologia, izolacja na specjalnych podłożach)<br />
i nie będą omawiane w niniejszym opracowaniu. Poza gruźlicą płuc (patrz<br />
poniżej) większość badań mikrobiologicznych plwociny dotyczy pacjentów<br />
z infekcjami dróg oddechowych, u których występuje ropna plwocina.<br />
Najczęstsze postacie kliniczne zakażeń<br />
Ostre i przewlekłe zapalenie oskrzeli<br />
U pacjentów z ostrym zapaleniem oskrzeli (rozwijającym się najczęściej po ostrej<br />
infekcji wirusowej, takiej jak typowe przeziębienie czy grypa) zwykle nie<br />
wykonuje się posiewu plwociny, chyba że stan kliniczny pacjenta się nie<br />
poprawia.<br />
Przewlekłe zapalenie oskrzeli jest długotrwającą ch<strong>or</strong>obą upośledzającą funkcję<br />
układu oddechowego, która przebiega z okresowymi zaostrzeniami. Większość<br />
pacjentów codziennie wykrztusza szarą, śluzową plwocinę; w trakcie ch<strong>or</strong>oby<br />
występują epizody pog<strong>or</strong>szenia stanu pacjenta i wykrztuszania wyraźnie ropnej<br />
plwociny. Jest to tak zwane zaostrzenie przewlekłego zapalenia oskrzeli.<br />
W próbkach plwociny często obecne są typowe patogeny układu oddechowego<br />
(Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae lub — rzadziej — M<strong>or</strong>axella<br />
(Branhamella) catarrhalis).<br />
79
ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH<br />
Ropień płuca<br />
Ropień płuca może uf<strong>or</strong>mować się w następstwie aspiracji ciała obcego,<br />
zawartości żołądka lub wydzieliny górnych dróg oddechowych (jama ustna lub<br />
gardło). Ten stan niekiedy jest określany terminem ,,aspiracyjnego zapalenia<br />
płuc’’. Można podjąć próbę hodowli z odkrztuszonej plwociny (która zwykle ma<br />
wyjątkowo brzydki zapach), lecz — jeśli obecny jest ropień (uwidoczniony<br />
w badaniu radiologicznym) — materiałem do badań powinna być zawarta w nim<br />
ropa, którą należy wyk<strong>or</strong>zystać do badania mikroskopowego i posiewu. Niestety<br />
brak jest wytycznych dotyczących sposobu jej uzyskania, choć jedną z możliwości<br />
jest bezpośrednia biopsja i usunięcie ropy. Częstym i ważnym czynnikiem<br />
etiologicznym są bakterie beztlenowe, takie jak Prevotella melaninogenica<br />
(wcześniej Bacteroides melaninogenicus) iPeptostreptococcus spp., pochodzące<br />
z fl<strong>or</strong>y jamy ustnej i gardła. Należy pobrać ropę, dostarczyć do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
i opracować zgodnie ze standardowymi metodami hodowli bakterii beztlenowych<br />
z ropy (patrz str. 104 i str. 117).<br />
Zapalenie płuc <strong>or</strong>az zapalenie oskrzeli i płuc<br />
Ostre płatowe zapalenie płuc zwykle dotyczy pojedynczego płata płuca. Prawie<br />
zawsze wywoływane jest przez S. pneumoniae. Ta postać zapalenia pojawia się<br />
epidemicznie. Przyczyną rzadziej występującej podobnej f<strong>or</strong>my zapalenia płuc<br />
jest Klebsiella pneumoniae.<br />
Klasyczna postać zapalenia płuc rozwija się u niewielu pacjentów zakażonych<br />
S. pneumoniae lub K. pneumoniae, częstszą f<strong>or</strong>mą ch<strong>or</strong>oby jest zapalenie oskrzeli<br />
ipłuc z plamkami naciekowymi i zapalnymi (określanymi jako ,,konsolidacja’’),<br />
rozproszonymi w jednym lub częściej w obu płucach.<br />
Z zapaleniem oskrzeli i płuc związanych jest wiele różnych czynników wirusowych<br />
i bakteryjnych. Poza S. pneumoniae i niekiedy H. influenzae, przyczyną<br />
zapalenia oskrzeli i płuc, zwłaszcza podczas epidemii grypy lub odry, jest<br />
Staphylococcus aureus. Często także stwierdza się obecność Gram-ujemnych<br />
pałeczek (szczególnie E. coli i K. pneumoniae) <strong>or</strong>az Pseudomonas aeruginosa.<br />
Zakażenia te występują powszechnie na oddziałach intensywnej terapii, zwłaszcza<br />
w trakcie stosowania antybiotyków o szerokim spektrum działania lub przy<br />
prowadzeniu wentylacji mechanicznej i są efektem nadmiernego zużycia antybiotyków<br />
<strong>or</strong>az niewłaściwego monit<strong>or</strong>owania wczesnych objawów infekcji<br />
u pacjentów.<br />
W przypadku wystąpienia wysięku w jamie opłucnej płyn należy zbadać<br />
mikroskopowo i wykonać posiew zgodnie z procedurą opisaną dla ropy<br />
i wysięków.<br />
Gruźlica płuc<br />
Plwocina pacjentów z gruźlicą płuc zwykle nie jest wyraźnie ropna, niemniej<br />
ropny charakter nie jest przeciwwskazaniem do jej wyk<strong>or</strong>zystania w diagnostyce<br />
gruźlicy. Wybarwione preparaty (metodą Ziehl-Neelsena) należy obejrzeć w mikroskopie<br />
w celu szybkiej identyfikacji pacjentów z obecnością kwasoop<strong>or</strong>nych<br />
80
CZE˛ŚĆ I<br />
bakterii w plwocinie 1 . Po wykonaniu preparatu plwocina powinna zostać poddana<br />
procedurze dekontaminacji (patrz str. 85) w celu zniszczenia możliwie największej<br />
liczby nieprątkowych drobnoustrojów i zachowania żywych prątków gruźlicy<br />
do posiewu na podłoże Löwensteina-Jensena.<br />
Ponieważ <strong>procedury</strong> bakteriologicznej diagnostyki ropnych infekcji dróg oddechowych,<br />
takich jak zapalenie oskrzeli i zapalenia płuc, zasadniczo różnią się<br />
od procedur stosowanych w gruźlicy, zostaną one omówione oddzielnie. Lekarz<br />
w skierowaniu do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium musi jasno określić kierunek badań:<br />
• bakterie ropotwórcze (H. influenzae, S. pneumoniae i in.),<br />
• prątki gruźlicy (M. tuberculosis),<br />
• obydwa typy bakterii.<br />
Pobieranie próbek plwociny<br />
Pobieranie odpowiednich próbek plwociny jest sztuką samą w sobie i zostało<br />
opisane w innych opracowaniach 2 . Badanie źle pobranej próbki plwociny może<br />
dać fałszywe wyniki z powodu zanieczyszczenia próbki bakteriami wchodzącymi<br />
wskład naturalnej fl<strong>or</strong>y jamy ustnej i gardła; ,,plwocina’’ zawierająca ślinę<br />
i cząstki pożywienia nie powinna być badana.<br />
Próbkę plwociny należy pobrać do sterylnego pojemnika z szerokim wlotem <strong>or</strong>az<br />
z bezpiecznym, szczelnym zamknięciem i niezwłocznie przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
Opóźnione przesłanie plwociny po pobraniu może spowodować przerost próbki<br />
zanieczyszczającymi ją bakteriami i prowadzi do otrzymania mylących wyników<br />
barwienia i hodowli. Z tego powodu nie zaleca się przesyłania próbek do<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium pocztą. Wyjątek stanowią próbki pobrane do badań w kierunku<br />
gruźlicy, które mogą być przesyłane do lokalnych lub regionalnych lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów.<br />
Należy ściśle przestrzegać lokalnych i państwowych przepisów, dotyczących<br />
przesyłania zakaźnego (patogennego) materiału.<br />
Opracowanie plwociny w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
(w zakażeniach niegruźliczych)<br />
Po pobraniu plwocina musi zostać natychmiast opracowana lub umieszczona<br />
wchłodziarce.<br />
Ocena makroskopowa<br />
Należy odnotować ocenę makroskopową plwociny. Możliwe opisy obejmują:<br />
ropna, zielona<br />
ropna, żółta<br />
śluzowo-ropna (tj. częściowo śluzowa i częściowo ropna)<br />
1<br />
Patrz Manual of basic techniques f<strong>or</strong> a health lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y, 2nd ed. Geneva, W<strong>or</strong>ld Health<br />
Organization, 2003.<br />
2<br />
Specimen collection and transp<strong>or</strong>t f<strong>or</strong> microbiological investigation. Alexandria, WHO Regional<br />
Office f<strong>or</strong> the Eastern Mediterranean, 1995 (WHO Regional Publicatinos, Eastern Mediterranean<br />
Series 8).<br />
Manual of basic techniques f<strong>or</strong> a health lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y, 2nd ed. Geneva W<strong>or</strong>ld Health Organization, 2003.<br />
Technical guide f<strong>or</strong> sputum examination f<strong>or</strong> tuberculosis by direct microscopy. Bulletin of the<br />
International Union Against Tuberculosis and Lung Disease, 4th ed. 1996.<br />
81
ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH<br />
podbarwiona krwią<br />
podbarwiona krwią, z zielonymi kłaczkami<br />
*szara, śluzowa<br />
*szara, spieniona<br />
*biała, śluzowa<br />
*biała, spieniona<br />
*biała, śluzowa z cząstkami pożywienia<br />
*wodnista (tj. obecna tylko ślina)<br />
*wodnista z cząstkami pożywienia<br />
Próbki oznaczone gwiazdkami nie powinny być badane w kierunku zakażeń<br />
niegruźliczych.<br />
Badanie mikroskopowe<br />
Preparat barwiony metodą Grama należy przygotować z próbki ropnej lub<br />
śluzowo-ropnej plwociny.<br />
Jeśli nie obserwuje się śladów ropy (np. w próbce szarej, śluzowej plwociny),<br />
barwienie metodą Grama może wykazać jedynie obecność dużych komórek<br />
nabłonka płaskiego, często pokrytych masą przylegających bakterii. Jest to<br />
wskazówka, że próbka zawiera głównie wydzielinę jamy ustnej lub gardła i nie<br />
powinno się prowadzić hodowli, której wyniki będą niewiarygodne czy też bardzo<br />
mylące. Zaleca się rezygnację z hodowli w przypadku, gdy próbka zawiera mniej<br />
niż 10 neutrofilów wielojądrzastych na 1 komórkę nabłonka 1 .<br />
U wielu pacjentów z ostrą infekcją oddechową (np. zapalenie płuc) i ropną<br />
plwociną natychmiastowe wykonanie preparatu barwionego metodą Grama może<br />
pomóc klinicyście w wyb<strong>or</strong>ze antybiotykoterapii. Możliwe wyniki to:<br />
• Gram-dodatnie dwoinki otoczone pustą przestrzenią z powodu niezabarwionych<br />
otoczek (podejrzenie S. pneumoniae);<br />
• małe Gram-ujemne krótkie pałeczki (prawdopodobnie H. influenzae);<br />
• Gram-ujemne dwoinki, widoczne wewnątrz- i zewnątrzkomórkowo (podejrzenie<br />
M<strong>or</strong>axella catarrhalis);<br />
• Gram-dodatnie ziarenkowce w skupiskach, przypominających grona (podejrzenie<br />
S. aureus);<br />
• Gram-ujemne pałeczki (podejrzenie obecności Enterobacteriaceae lub Pseudomonas<br />
spp.);<br />
• duże Gram-dodatnie drożdżopodobne komórki często z grzybnią (wskazują na<br />
obecność Candida spp.).<br />
Procedury hodowli i interpretacja<br />
Jeśli mikroskopowo próbka przedstawia akceptowalną jakość plwociny, wybrać<br />
fragment ropnego materiału (lub najbardziej przypominającego ropny) używając<br />
sterylnej wymazówki lub ezy i posiać na różne podłoża hodowlane.<br />
1<br />
Heinemann H.S., Radano R.R.: Acceptability and cost savings of selective sputum microbiology in<br />
a community teaching hospital. Journal of Clinical Microbiology, 1979, 10: 567 – 573.<br />
82
CZE˛ŚĆ I<br />
Sugerowany zestaw podłoży obejmuje:<br />
• agar z krwią z rozmazem S. aureus, ułatwiającym satelitarny wzrost H. influenzae<br />
i z krążkiem zawierającym optochinę, umieszczonym w centrum<br />
rozsiewu,<br />
• agar czekoladowy,<br />
• agar MacConkeya.<br />
Płytki z agarem z krwią i z agarem czekoladowym należy inkubować w35– 36°C<br />
w atmosferze wzbogaconej dwutlenkiem węgla (np. eksykat<strong>or</strong>), a płytkę<br />
MacConkeya w powietrzu atmosferycznym.<br />
Jeśli w barwionym preparacie obecne są skupiska Gram-dodatnich ziarenkowców,<br />
przypominające kształtem winogrona, zaleca się wyk<strong>or</strong>zystanie dodatkowo<br />
płytki agarowej z mannitolem (MSA). Obecność Gram-dodatnich drożdżopodobnych<br />
struktur może być wskazaniem do posiewu na podłoże Sabouraud (dla<br />
którego konieczna jest inkubacja przez co najmniej 3 dni w 35 – 37°C). Posiew na<br />
podłoża MSA i Sabouraud nie musi być wykonywany rutynowo dla wszystkich<br />
próbek plwociny.<br />
Posiewy powinny być odczytywane po całonocnej inkubacji (18 godzin),<br />
a reinkubacja przez dodatkowe 24 godziny jest wskazana, jeśli wzrost jest słabszy<br />
niż oczekiwany na podstawie obserwacji mikroskopowych lub gdy obecne są<br />
bardzo drobne kolonie.<br />
Typowe wyniki obserwacji przedstawiono poniżej:<br />
• Płaskie, jasne kolonie z wgłębionymi środkami i strefą zielonej (α-) hemolizy<br />
<strong>or</strong>az strefą zahamowania wzrostu wokół krążka z optochiną mogą wskazywać<br />
na S. pneumoniae. Jeśli odczyt testu z krążkiem z optochiną w pierwszym<br />
posiewie nie jest rozstrzygający, należy powtórzyć test na przesiewie. Nie<br />
można zapominać, że w fizjologicznej fl<strong>or</strong>ze jamy ustnej i gardła występują<br />
inne α-hemolizujące szczepy (wspólnie nazywane paci<strong>or</strong>kowcami zieleniejącymi).<br />
• Drobne, kropelkowe kolonie rosnące na płytce agarowej z krwią w postaci<br />
niehemolizujących kolonii satelitarnych i znacznie większe kolonie na płytce<br />
agaru czekoladowego lub agaru z krwią sugerują obecność H. influenzae.<br />
Kolonie te najczęściej są liczne, zwykle ponad 20 na płytce. Niektóre<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia dla potwierdzenia identyfikacji wykonują testy z czynnikami<br />
wzrostu X i V, które jednak wymagają uważnej kontroli. Serologiczne<br />
typowanie szczepów izolowanych z układu oddechowego najczęściej nie jest<br />
przydatne, ponieważ większość z nich jest ,,sz<strong>or</strong>stka’’ i nie podlega typowaniu.<br />
• Kruche, suche, szarobiałe kolonie na płytkach agaru z krwią lub agaru<br />
czekoladowego, które można przesuwać wcałości za pomocą ezy, mogą<br />
wskazywać na M. catarrhalis. Jeśli istnieje potrzeba, można przeprowadzić<br />
testy rozkładu cukrów (wszystkie wyniki testów ujemne), ale większość<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów ich nie wykonuje. Drobnoustroje M<strong>or</strong>axella są silnie oksydazododatnie,<br />
a wygląd ich kolonii i obraz mikroskopowy są bardzo charakterystyczne.<br />
Jakkolwiek m<strong>or</strong>fologicznie M<strong>or</strong>axella przypomina Neisseria spp., do różnicowania<br />
można użyć testu z trójmaślanem glicerolu, który jest hydrolizowany<br />
przez M<strong>or</strong>axella.<br />
• Średniej wielkości, złotoszare kolonie tw<strong>or</strong>zone są przez S. aureus. Testy<br />
koagulazowy i test fermentacji mannitolu są dodatnie, choć szkiełkowy odczyn<br />
koagulacji (odczyn ,,związanej’’ koagulazy) jest czasami ujemny. Jeśli istnieje<br />
sprzeczność między wyglądem kolonii i testem szkiełkowym, należy przeprowadzić<br />
probówkowy test koagulazy (,,wolna’’ koagulaza).<br />
83
ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH<br />
• Kolonie na agarze MacConkeya sugerują obecność Enterobacteriaceae lub<br />
Pseudomonas spp. lub Acinetobacter spp.<br />
• Białawe, okrągłe, matowe kolonie na agarze z krwią i agarze czekoladowym<br />
mogą wskazywać na Candida albicans, który będzie również rosnąć po 3 – 4<br />
dniach na podłożu Sabouraud.<br />
Warto podkreślić, że pojedyncze kolonie każdego z powyższych <strong>or</strong>ganizmów<br />
pochodzą z fl<strong>or</strong>y naturalnej układu oddechowego lub są wynikiem kolonizacji (np.<br />
bakterie jelitowe, grzyby). Ponieważ nie mają wpływu na postępowanie z pacjentem,<br />
nie należy uwzględniać ich w wyniku lub, jeżeli zostaną uwzględnione,<br />
zaznaczyć, że jest to fl<strong>or</strong>a kolonizująca.<br />
Badanie lekowrażliwości<br />
Badanie lekowrażliwości należy wykonywać tylko dla drobnoustrojów dominujących<br />
w hodowli, natomiast nie ma takiej potrzeby w przypadku szczepów<br />
obecnych w posiewie jedynie w niewielkiej liczbie.<br />
Interpretację niektórych uzyskiwanych wyników przedstawiono w tabeli 20.<br />
Tabela 20. Interpretacja wyników testów wrażliwości dla bakterii o wyższych wymaganiach<br />
odżywczych a<br />
Średnica strefy (mm)<br />
Op<strong>or</strong>ny Średnio wrażliwy Wrażliwy<br />
S. pneumoniae (podłoże Mueller-Hintona<br />
z 5% krwi baraniej, inkubacja<br />
w5%CO 2 )<br />
Oksacylina (1 µg) (dla benzylopenicyliny)<br />
2 19 b — 1 20<br />
Tetracyklina (30 µg) 2 18 19 –22 1 22<br />
Erytromycyna (15 µg) 2 15 16 –20 1 21<br />
Chl<strong>or</strong>amfenikol (30 µg) 2 20 — 1 21<br />
Kotrimoksazol (25 µg) 2 15 16 –18 1 19<br />
M. catarrhalis (podłoże Mueller-Hintona)<br />
Tetracyklina (30 µg) 2 14 15 –18 1 19<br />
Erytromycyna (15 µg) 2 13 14 –22 1 23<br />
Kotrimoksazol (25 µg) 2 10 11 –15 1 16<br />
a<br />
b<br />
National Committee f<strong>or</strong> Clinical Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y Standards (NCCLS). Perf<strong>or</strong>mance standards f<strong>or</strong><br />
antimicrobial susceptibility testing. M100-S8. Vol 18, 1998.<br />
Op<strong>or</strong>ny lub średnio wrażliwy.<br />
W badaniu lekowrażliwości pałeczek Enterobacteriaceae i gronkowców należy<br />
wyk<strong>or</strong>zystać standaryzowaną metodę dyfuzyjno-krążkową (Kirby-Bauera). Wrażliwość<br />
szczepów S. pneumoniae na tetracyklinę, chl<strong>or</strong>amfenikol, erytromycynę<br />
i benzylopenicylinę powinna być oceniana na agarze Mueller-Hintona, wzbogaconym<br />
5% krwią bydlęcą. Można również użyć zwykłego agaru z krwią.<br />
Wrażliwość na benzylopenicylinę lepiej oznaczyć używając krążka zawierającego<br />
1 µg oksacyliny, który wykazuje większą zgodność z wartościami MIC dla<br />
benzylopenicylin; jest również bardziej stabilny. Krążki zawierające benzylopenicylinę<br />
mogą szybko ulegać dezaktywacji w wyższych temperaturach, co powoduje<br />
uzyskanie niewiarygodnych wyników.<br />
84
CZE˛ŚĆ I<br />
Dla szczepów H. influenzae należy określić zdolność wytwarzania β-laktamaz,<br />
np. za pomocą testu z nitrocefiną. Nie wytwarzające β-laktamaz H. influenzae<br />
rzadko wykazują op<strong>or</strong>ność na ampicylinę. W związku z powyższym nie zaleca się<br />
oznaczania wrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową.<br />
Izolaty M. catarrhalis powinny być badane w kierunku wytwarzania β-laktamaz.<br />
Dodatkowo można oznaczyć wrażliwość na tetracyklinę i erytromycynę.<br />
Dla Candida albicans należy ocenić wrażliwość na wszystkie leki przeciwgrzybicze.<br />
Większość lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów przedstawia półilościowe wyniki hodowli bakteryjnych<br />
na podłożach stałych, które można określić jako:<br />
(+) = kilka kolonii<br />
+ = słaby wzrost<br />
++ = średnio intensywny wzrost<br />
+++ = intensywny wzrost.<br />
Hodowla Mycobacterium tuberculosis<br />
Poza przygotowaniem preparatu bezpośredniego barwionego metodą dla bakterii<br />
kwasoop<strong>or</strong>nych, zawsze gdy istnieje kliniczne podejrzenie ch<strong>or</strong>oby, materiał<br />
(zwykle, choć nie zawsze, plwocina) należy posiać w kierunku M. tuberculosis.<br />
Niektórzy pacjenci z podejrzeniem gruźlicy płuc mogą nie odkrztuszać plwociny.<br />
Wytwarzana przez nich niewielka ilość plwociny jest natychmiast połykana.<br />
W takiej sytuacji lekarz powinien pobrać próbkę soku żołądkowego na czczo<br />
(zwykle wcześnie rano) i zneutralizowaną wod<strong>or</strong>owęglanem sodu (100 mg)<br />
przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. Sok żołądkowy należy traktować w ten sam sposób jak<br />
plwocinę. Wykonywanie posiewów w kierunku prątków gruźlicy wszystkich<br />
pobranych próbek plwociny jest drogie i (chociaż pozwala zdiagnozować<br />
pacjentów bez podejrzenia gruźlicy) nie zalecane rutynowo.<br />
Procedura przygotowania próbki do badania<br />
Plwocina pochodząca od pacjentów z infekcją gruźliczą często zawiera fragmenty<br />
tkanki płucnej, które, jeśli są obecne, należy pobrać na posiew. Plwocina gruźlicza<br />
wykrztuszana jest przez jamę ustną i gardło, dlatego zanieczyszczenie próbki fl<strong>or</strong>ą<br />
fizjologiczną gardła jest nieuniknione. Bakterie zanieczyszczające próbkę muszą<br />
zostać zniszczone, aby nie doszło do przerostu podłoża Löwensteina-Jensena.<br />
Procedura przygotowania próbki (zagęszczenie–trawienie–dekontaminacja) obowiązuje<br />
w przypadku każdej próbki pobranej z miejsca występowania fl<strong>or</strong>y<br />
fizjologicznej. Szeroko stosowane są trzy <strong>procedury</strong> z użyciem:<br />
– wod<strong>or</strong>otlenku sodu (NaOH) (Petroff);<br />
– wod<strong>or</strong>otlenku sodu N-acetyl-L-cysteiny (NALC-NaOH);<br />
– Zephiranu i fosf<strong>or</strong>anu trójsodowego.<br />
Procedura z użyciem wod<strong>or</strong>otlenku sodu (Petroff)<br />
Procedura ta pozwala na eliminację zanieczyszczających mikro<strong>or</strong>ganizmów,<br />
a ponadto umożliwia upłynnienie niekiedy śluzowej plwociny. Wod<strong>or</strong>otlenek<br />
85
ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH<br />
sodu jest toksyczny również dla prątków, dlatego w trakcie wykonywania metody<br />
należy upewnić się, że:<br />
– końcowe stężenie NaOH nie przekracza 2%;<br />
– prątki gruźlicze nie są eksponowane na wod<strong>or</strong>otlenek sodu dłużej niż przez<br />
30 minut, wliczając czas wirowania.<br />
1. Wymieszać równe objętości plwociny i 4% wod<strong>or</strong>otlenku sodu 40 g/l<br />
(uprzednio poddanego sterylizacji w autoklawie) w sterylnej, szczelnej,<br />
50-mililitrowej szklanej butelce lub plastikowej stożkowatej probówce wirówkowej.<br />
2. Inkubować w temperaturze pokojowej (25 – 30°C) przez 15 minut, delikatnie<br />
wstrząsać mieszaninę w mechanicznym mieszadle przez 5 minut. W g<strong>or</strong>ącym<br />
klimacie potrzebne może być schłodzenie lub skrócenie czasu reakcji do<br />
10 – 15 minut.<br />
3. Odwirować lub uzupełnić mieszaninę do 50 ml destylowaną wodą lub buf<strong>or</strong>em<br />
fosf<strong>or</strong>anowym (pH 6,8), hamując działanie NaOH.<br />
4. Po 15 minutach odwirować w 3000 g przez 15 minut. Ostrożnie zlać<br />
supernatant do pojemnika wypełnionego odpowiednim środkiem dezynfekującym<br />
(na bazie fenolu lub aldehydu glutarowego). Zneutralizować osad<br />
wkraplając 2 mol/l roztw<strong>or</strong>u HCl zawierającego 2% czerwień fenolową,<br />
połączyć, wstrząsając do chwili, gdy kol<strong>or</strong> zmieni się trwale z czerwonego na<br />
żółty. Alternatywnie: dodać kroplę roztw<strong>or</strong>u wskaźnikowego, a następnie<br />
dodawać po kropli HCl ciągle mieszając.<br />
5. Jeśli posiew na podłoże będzie wykonywany natychmiast, zawiesić zneutralizowany<br />
osad w 1 – 2 ml sterylnego 0,85% NaCl lub sterylnej wody<br />
destylowanej. W innym przypadku zawiesić osad w 1 – 2 ml sterylnej frakcji<br />
V albumin bydlęcych.<br />
Procedura z użyciem wod<strong>or</strong>otlenku sodu<br />
N-acetyl-L-cysteiny<br />
Niższe stężenie NaOH w obecności czynników mukolitycznych, takich jak<br />
N-acetyl-L-cysteina (NALC), jest mniej agresywne wobec prątków gruźlicy.<br />
Zarówno czas inkubacji, jak i temperatura nie mają tak kluczowego znaczenia, jak<br />
w przypadku <strong>procedury</strong> z NaOH. Krótki, nie przekraczający 24 godzin, czas<br />
przechowywania aktywnego roztw<strong>or</strong>u NALC-NaOH wymaga przeprowadzenia<br />
<strong>procedury</strong> w ciągu jednego dnia.<br />
1. Połączyć równe objętości roztw<strong>or</strong>u cytrynianu sodu (29 g dwuwodzianu<br />
cytrynianu sodu na litr wody destylowanej) <strong>or</strong>az 4% wod<strong>or</strong>otlenku sodu<br />
(40 g/l) i autoklawować mieszaninę. Roztwór może być przechowywany<br />
w temperaturze pokojowej.<br />
2. Tuż przed użyciem dodać 0,5 g NALC do 100 ml roztw<strong>or</strong>u zawierającego<br />
NaOH i cytrynian sodu.<br />
3. W zależności od liczby próbek przeznaczonych do dekontaminacji przygotować<br />
2,5 g NALC w 500 ml roztw<strong>or</strong>u NaOH i cytrynianu sodu lub 5 g NALC<br />
w 1000 ml roztw<strong>or</strong>u NaOH i cytrynianu sodu. Odczynniki są przydatne do<br />
badania przez 24 godziny.<br />
4. Do próbki umieszczonej w sterylnej, szczelnej, 50-mililitrowej szklanej<br />
butelce lub plastikowej stożkowej probówce wirówkowej dodać<br />
równą objętość aktywnego roztw<strong>or</strong>u NALC-NaOH. Ostrożnie dokręcić<br />
86
CZE˛ŚĆ I<br />
zakrętkę, odwrócić probówkę i wstrząsać delikatnie, nie dłużej niż 30<br />
sekund.<br />
5. Pozostawić na 15 minut w temperaturze pokojowej (20 – 25°C).<br />
6. Uzupełnić mieszaninę do 50 ml wodą destylowaną lub 67 mmol/l buf<strong>or</strong>em<br />
fosf<strong>or</strong>anowym (pH 6,8) w celu zahamowania działania NaOH. Ostrożnie zlać<br />
supernatant do pojemnika wypełnionego odpowiednim środkiem dezynfekującym<br />
(na bazie fenolu lub aldehydu glutarowego).<br />
7. Jeśli posiew na podłoże będzie wykonywany natychmiast, zawiesić osad<br />
w1– 2 ml sterylnego 0,85% NaCl lub sterylnej wody destylowanej. W innym<br />
przypadku zawiesić osad w 1 – 2 ml sterylnej frakcji V albumin bydlęcych.<br />
Procedura z użyciem fosf<strong>or</strong>anu trójsodowego<br />
Prątki mogą przeżyć mimo przedłużonego poddawania ich tej łagodnej procedurze.<br />
Dlatego czas inkubacji i temperatura nie są restrykcyjne.<br />
1. Przygotować roztwór 1 kg trójfosf<strong>or</strong>anu sodu (Na 3 PO 4·12H 2 O) w 4 litrach<br />
g<strong>or</strong>ącej wody destylowanej, dodać 7,5 ml 17% chl<strong>or</strong>ku benzylidenu (Zephiran),<br />
dobrze wymieszać i przechowywać w temperaturze pokojowej.<br />
2. Wymieszać równe objętości plwociny (do 10 ml) z roztw<strong>or</strong>em Zephiranu<br />
i fosf<strong>or</strong>anu trójsodowego w 50-mililitrowej, sterylnej, szczelnej, szklanej<br />
probówce wirówkowej. Dokręcić zakrętkę i wytrząsać energicznie przez<br />
30 minut.<br />
3. Odstawić mieszaninę na dodatkowe 30 minut.<br />
4. Odwirować w 3000 g przez 15 minut. Ostrożnie zlać supernatant do pojemnika<br />
wypełnionego odpowiednim środkiem dezynfekującym (na bazie fenolu lub<br />
aldehydu glutarowego) i ponownie zawiesić osad w 20 ml neutralizującego<br />
buf<strong>or</strong>u fosf<strong>or</strong>anowego, pH 6,6 1 .<br />
5. Odwirować ponownie w 3000 g przez 15 minut. Zlać supernatant, a osad posiać<br />
na podłoże.<br />
Hodowla<br />
1. Posiać 3 krople (około 0,1 ml) osadu na co najmniej trzy probówki z podłożem<br />
Löwensteina-Jensena lub inne.<br />
2. Sprawdzać regularnie wskaźnik zanieczyszczenia inkubowanych podłoży<br />
i notować liczbę zanieczyszczonych płytek.<br />
Wskaźnik zanieczyszczenia powinien wynosić 3 – 5%. Wyższy wskaźnik (ponad<br />
5%) zanieczyszczonych hodowli na podłożu Löwensteina-Jensena zwykle wskazuje<br />
na niewystarczającą skuteczność <strong>procedury</strong> dekontaminacji. Wskaźnik<br />
zanieczyszczenia < 3% sugeruje, że procedura dekontaminacji została przeprowadzona<br />
zbyt intensywnie i obecne w próbce prątki mogą nie wyrosnąć.<br />
1<br />
Przygotowanie neutralizującego buf<strong>or</strong>u fosf<strong>or</strong>anowego 67 mmol/l.<br />
Roztwór podstawowy:<br />
A. Rozpuścić 9,47 g nieuwodnionego fosf<strong>or</strong>anu sodu w 1 litrze wody destylowanej.<br />
B. Rozpuścić 9,07 g nieuwodnionego fosf<strong>or</strong>anu potasu w 1 litrze wody destylowanej.<br />
Dla buf<strong>or</strong>u o pH 6,8: zmieszać 50 ml roztw<strong>or</strong>u podstawowego A z 50 ml roztw<strong>or</strong>u podstawowego<br />
B.<br />
Dla buf<strong>or</strong>u o pH 6,6: zmieszać 37,5 ml roztw<strong>or</strong>u podstawowego A z 62,5 ml roztw<strong>or</strong>u<br />
podstawowego B.<br />
Sprawdzić pH. Jeśli potrzeba, dodać roztw<strong>or</strong>u A, aby podnieść pH, lub roztw<strong>or</strong>u B, aby<br />
obniżyć pH.<br />
87
ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH<br />
Interpretacja hodowli M. tuberculosis<br />
Probówki z podłożem Löwensteina-Jensena powinny być inkubowane przez<br />
2 – 3 dni w 35 – 37°C w pozycji poziomej, z odkręconą opół obrotu nakrętką.<br />
Następnie hodowle należy inkubować w temperaturze 37°C przez 6 tygodni<br />
i obserwować wzrost w cotygodniowych odstępach czasu. Podczas tej kilkutygodniowej<br />
obserwacji każdy pojawiający się wzrost bakterii powinien zostać<br />
odnotowany. Przygotować preparat barwiony metodą Ziehl-Neelsena. Jeśli<br />
mikro<strong>or</strong>ganizmy nie są kwasoop<strong>or</strong>nymi bakteriami, hodowlę można uznać za<br />
zanieczyszczoną.<br />
Typowe ludzkie szczepy Mycobacterium tuberculosis mają ,,sz<strong>or</strong>stkie, twarde<br />
ipłowożółte’’ kolonie, czasem widoczne już po 2 – 3 tygodniach inkubacji (rzadko<br />
wcześniej). Kolonie szczepów bydlęcych (M. bovis) są zwykle gładkie<br />
i białawokremowe. Inne, zwykle niepatogenne gatunki mykobakterii mogą rosnąć<br />
szybciej (niekiedy już po kilku dniach), wytwarzając — lub nie — pigmenty<br />
(czerwony, żółty lub pomarańczowy). Jeśli szczep tw<strong>or</strong>zy kolonie o typowym<br />
wyglądzie i barwienie Ziehl-Neelsena preparatu z hodowli potwierdza obecność<br />
kwasoop<strong>or</strong>nych prątków, w wyniku należy podać: ,,Mycobacterium spp., prawdopodobnie<br />
M. tuberculosis’’; izolaty należy przesłać do referencyjnego lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
krajowego lub lokalnego w celu potwierdzenia identyfikacji i oznaczenia<br />
lekowrażliwości izolowanych szczepów.<br />
<strong>Podstawowe</strong> zasady bezpieczeństwa<br />
Z plwociną należy zawsze postępować bardzo uważnie i używać szczelnych<br />
pojemników na próbki. Jest to bardzo ważne, zwłaszcza gdy konieczne jest<br />
przesłanie próbek pocztą. Zaleca się, aby wszystkie <strong>procedury</strong> postępowania<br />
z plwociną (nawet jeśli na skierowaniu nie ma inf<strong>or</strong>macji o gruźlicy) były<br />
przeprowadzane w bakteriologicznie bezpiecznych warunkach. Zaleca się, aby<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium przeprowadzające badania próbek prawdopodobnie zawierających<br />
prątki gruźlicy spełniało wymagania bezpieczeństwa biologicznego przynajmniej<br />
na poziomie 2 1 .<br />
Szczególną uwagę należy zachować podczas otwierania, zamykania i wstrząsania<br />
butelek <strong>or</strong>az podczas wirowania materiału. Tw<strong>or</strong>zenie skażonego aerozolu może<br />
być niebezpieczne dla personelu, dlatego należy przestrzegać właściwych<br />
procedur medycyny pracy 2 .<br />
Pocztowy transp<strong>or</strong>t hodowli M. tuberculosis do referencyjnego lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
krajowego wymaga szczególnej ostrożności z powodu ryzyka ewentualnego<br />
wypadku lub uszkodzenia pojemnika. Należy używać jedynie pojemników<br />
i materiałów wysyłkowych uznanych za bezpieczne i dostosowanych do wymagań<br />
poczty.<br />
1<br />
Manual of basic techniques f<strong>or</strong> a health lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y, 2nd ed. Geneva, W<strong>or</strong>ld Health Organization,<br />
2003.<br />
2<br />
Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y services in tuberculosis control Part I: Organization and management. Geneva, W<strong>or</strong>ld<br />
Health Organization, 1998 (niepublikowane dokumenty WHO/TB/98.258).<br />
88
CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH<br />
Ch<strong>or</strong>oby przenoszone droga˛<br />
kontaktów seksualnych<br />
Wprowadzenie<br />
W ciągu ostatnich dwudziestu lat ogromnie wzrosła liczba drobnoustrojów<br />
przenoszonych drogą kontaktów seksualnych <strong>or</strong>az związanych z nimi objawów<br />
klinicznych. W tabeli 21 wymienione zostały wybrane mikro<strong>or</strong>ganizmy przenoszone<br />
drogą płciową i wywoływane przez nie ch<strong>or</strong>oby. Diagnostyka niektórych<br />
z nich stanowi ważne wyzwanie dla klinicznego lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium mikrobiologicznego.<br />
Diagnostyka lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjna jest istotnym elementem w postępowaniu<br />
z pacjentem, w kontroli takich ch<strong>or</strong>ób, jak rzeżączka czy kiła, i ma znaczenie nie<br />
tylko dla pacjenta, ale także dla jego partnera seksualnego.<br />
W rozdziale zostanie krótko przedstawiona identyfikacja najczęściej pojawiających<br />
się mikro<strong>or</strong>ganizmów przenoszonych drogą seksualną, występujących<br />
Tabela 21. Wybrane mikro<strong>or</strong>ganizmy przenoszone droga˛ płciowa˛ i towarzysza˛ce im<br />
objawy<br />
Czynnik etiologiczny<br />
Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae<br />
Chlamydia trachomatis<br />
(serotypy D –K)<br />
Chlamydia trachomatis<br />
(serotypy L 1 ,L 2 ,L 3 )<br />
Treponema pallidum<br />
Haemophilus ducreyi<br />
Calymmatobacterium<br />
granulomatis<br />
Mobiluncus spp.<br />
Ludzki (alfa) wirus opryszczki<br />
(HSV1 i HSV2)<br />
Wirus cytomegalii (CMV)<br />
Ludzki Papillomavirus<br />
(HPV)<br />
Ludzki wirus nabytego<br />
niedob<strong>or</strong>u odp<strong>or</strong>ności<br />
(HIV)<br />
Wirus zapalenia wa˛troby<br />
typu B (HBV)<br />
Gardnerella vaginalis<br />
Candida albicans<br />
Objaw<br />
Zapalenie gruczołu przedsionkowego większego (Bartholina),<br />
zapalenie szyjki macicy, zapalenie kosmówkowo-owodniowe,<br />
zapalenie spojówek, uogólniona infekcja gonokokowa<br />
(zapalenie stawów, skóry, pochewek ścięgnistych), zapalenie<br />
endometrium, zapalenie naja˛drzy, bezpłodność, zapalenie<br />
gardła, przedpokwitaniowe zapalenie pochwy, zapalenie t<strong>or</strong>ebki<br />
wa˛troby, zapalenie odbytu, zapalenie prostaty, zapalenie<br />
jajowodów, zapalenie cewki moczowej<br />
Zapalenie gruczołu przedsionkowego większego (Bartholina),<br />
zapalenie szyjki macicy, zapalenie spojówek u now<strong>or</strong>odków,<br />
zapalenie endometrium, zapalenie naja˛drzy, zapalenie płuc<br />
u now<strong>or</strong>odków, bezpłodność, zapalenie ucha środkowego<br />
uniemowla˛t, zapalenie narza˛dów miednicy, zapalenie t<strong>or</strong>ebki<br />
wa˛troby, przedpokwitaniowe zapalenie pochwy, zapalenie<br />
odbytu, zespółReitera, zapalenie jajowodów, zapalenie cewki<br />
moczowej<br />
Ziarniniak weneryczny<br />
Kiła<br />
Wrzód miękki<br />
Ziarniniak pachwinowy (donovanosis)<br />
Bakteryjna waginoza<br />
Opryszczka narza˛dów płciowych <strong>or</strong>az warg i jamy ustnej,<br />
zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, opryszczka now<strong>or</strong>odków,<br />
zapalenie odbytu<br />
Zakażenie wrodzone<br />
Rak szyjki macicy, kłykciny wirusowe<br />
Zespół nabytego niedob<strong>or</strong>u odp<strong>or</strong>ności (AIDS) <strong>or</strong>az ch<strong>or</strong>oby<br />
towarzysza˛ce AIDS<br />
Wirusowe zapalenie wa˛troby typu B<br />
Zapalenie cewki moczowej, zapalenie pochwy<br />
Zapalenie żołędzi i napletka, zapalenie sromu i pochwy<br />
89
CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH<br />
w próbkach pochodzących z żeńskich i męskich dróg moczowo-płciowych.<br />
Czynniki wirusowe i bakteryjne, takie jak: Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma<br />
hominis i Mobiluncus spp., nie zostaną tu omówione. W celu uzyskania<br />
bardziej szczegółowych inf<strong>or</strong>macji, odsyłamy czytelnika do odnośnych publikacji<br />
WHO 1 .<br />
Zapalenie cewki moczowej u mężczyzn<br />
Zapalenie cewki moczowej u mężczyzn klinicznie charakteryzuje się wydzieliną<br />
z cewki i/lub zaburzeniami w oddawaniu moczu, często jednak występują<br />
bezobjawowe infekcje wywołane przez Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae lub Chlamydia<br />
trachomatis. Nieleczone gonokokowe lub chlamydialne zapalenie cewki moczowej<br />
może rozwinąć się w zapalenie najądrzy. U homoseksualnych mężczyzn<br />
mogą występować infekcje odbytu i jamy ustnej wywołane przez N. gon<strong>or</strong>rhoeae<br />
i C. trachomatis.<br />
W celu ustalenia postępowania z pacjentem zapalenia cewki moczowej powinny<br />
być podzielone na gonokokowe i niegonokokowe (NGU). Blisko połowa<br />
przypadków NGU wywołana jest przez C. trachomatis, jednak etiologia większości<br />
nawracających zakażeń nie została wpełni wyjaśniona. Zgodnie z badaniami<br />
przyczyną zapalenia cewki moczowej może być zakażenie Ureaplasma urealyticum,<br />
aw1– 3% przypadków NGU Trichomonas vaginalis. Notowano również<br />
infekcje wywołane przez ludzki Herpesvirus. Czynniki bakteryjne, takie jak:<br />
gronkowce, pałeczki Enterobacteriaceae, Acinetobacter spp. i Pseudomonas spp.,<br />
mogą być izolowane z cewki zdrowych mężczyzn, lecz nie udowodniono ich<br />
udziału w zapaleniu cewki moczowej.<br />
Badanie próbki w kierunku obecności C. trachomatis nie jest przedmiotem<br />
niniejszego opracowania. Poza izolacją na hodowlach komórkowych bardziej<br />
dostępne stały się ostatnio niehodowlane metody wykrywania chlamydii za<br />
pomocą testów immunoenzymatycznych, immunoflu<strong>or</strong>escencji i amplifikacji<br />
kwasu nukleinowego (PCR). Powyższe metody nadal są zbyt drogie.<br />
Pobieranie i transp<strong>or</strong>t próbek<br />
W celu pobrania do badania wydzieliny z cewki moczowej należy wprowadzić do<br />
cewki wymazówkę omałej średnicy lub sterylną ezę bakteryjną i przed jej<br />
wyciągnięciem delikatnie przekręcić. Ropną wydzielinę można pobrać bezpośrednio<br />
na wymazówkę lub ezę do posiewu. Ważny jest rodzaj użytej wymazówki.<br />
Do hodowli N. gon<strong>or</strong>rhoeae zalecana jest wymazówka bawełniana z węglem<br />
aktywnym lub z alginianem wapnia, a także wymazówka z dakronu. Jeśli do<br />
pobierania materiału te specjalne, przygotowywane komercyjnie, wymazówki nie<br />
są dostępne i użyto zwykłych wymazówek z waty, próbkę należy natychmiast<br />
posiać. W przypadku zapalenia cewki moczowej masaż prostaty nie zwiększa<br />
odstetka izolacji gonokoków lub chlamydii.<br />
Wymazy odbytnicze należy pobrać wymazówką wprowadzając jądo kanału<br />
odbytu na głębokość 4 – 5 cm. Próbki z tylnej ściany gardła i krypt migdałków<br />
należy pobrać wymazówką i natychmiast posiać.<br />
1<br />
Van Dyck E., Meheus A.Z., Piot P.: Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y diagnosis of sexually transmitted diseases. Geneva,<br />
W<strong>or</strong>ld Health Organization, 1999.<br />
90
CZE˛ŚĆ I<br />
Najlepiej, jeśli próbki w kierunku obecności N. gon<strong>or</strong>rhoeae posiewane są na<br />
podłoże hodowlane bezpośrednio po pobraniu. Posiane płytki należy umieścić<br />
w eksykat<strong>or</strong>ze lub w atmosferze zawierającej 5 – 10% dwutlenku węgla, o wysokiej<br />
wilgotności. Jeśli natychmiastowy posiew i inkubacja są niemożliwe, należy<br />
użyć podłoża transp<strong>or</strong>towego, takiego jak Amies lub Stuart. Czas transp<strong>or</strong>tu<br />
powinien być możliwie najkrótszy, maksymalnie do 12 godzin, w temperaturze<br />
otoczenia do 30°C. Należy unikać schłodzenia.<br />
Badanie bezpośrednie i interpretacja<br />
W większości badań wykazano, że obecność czterech lub więcej wielojądrzastych<br />
(PMN) leukocytów w polu widzenia w immersji olejowej zdecydowanie wskazuje<br />
na zapalenie cewki moczowej u mężczyzn. Opisane kryterium jest szczególnie<br />
użyteczne dla lekarza, który musi podjąć decyzję o rozpoczęciu leczenia pacjenta<br />
ze słabo nasilonymi objawami.<br />
W większości przypadków rzeżączki u kobiet wydzielina jest ropna, a w rozmazie<br />
z cewki moczowej widoczne są liczne wielojądrzaste leukocyty (> 10 w polu<br />
widzenia w immersji olejowej). Jakkolwiek nie zawsze jest tak w przypadku<br />
NGU, które daje mniej nasiloną reakcję zapalną. Rozmazy z więcej niż 4 PMN<br />
leukocytami w polu widzenia i bez wewnątrzkomórkowych Gram-ujemnych<br />
dwoinek wskazują na NGU.<br />
Cienką warstwę materiału należy nanieść wymazówką na szkiełko podstawowe,<br />
preparat utrwalić temperaturą i wybarwić błękitem metylenowym lub metodą<br />
Grama. Obecność Gram-ujemnych wewnątrzkomórkowych dwoinek w wielojądrzastych<br />
leukocytach w preparacie bezpośrednim z cewki moczowej wskazuje na<br />
rzeżączkę.<br />
Nie zaleca się wykonywania barwionych metodą Grama preparatów z próbek<br />
pobranych z cewki moczowej u kobiet bez objawów zakażenia, ze ślepych<br />
wymazów odbytniczych lub z próbek z jamy ustnej. Jednakże badanie mikroskopowe<br />
ropnego materiału otrzymanego w anoskopii ma wysoką wartość<br />
diagnostyczną.<br />
Hodowla Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae<br />
Posiane płytki z modyfikowanym podłożem agarowym Thayer-Martina (MTM) 1<br />
(lub agarem New Y<strong>or</strong>k City (NYC)) 2 należy inkubować w35°C w wilgotnej<br />
1<br />
Modyfikowany agar Thayer-Martina przygotowuje się przez dodanie w 50°C mieszaniny antybiotyków<br />
i IsoVitaleX lub równoważnego suplementu do agaru czekoladowego przygotowanego<br />
z agaru GC lub agaru Columbia, stanowiącego podstawowe podłoże. Komercyjnie dostępna z wielu<br />
źródeł jest mieszanina zawierająca 3 lub 4 antybiotyki; mieszanina VCN zawiera wankomycynę,<br />
kolistynę i nystatynę: VCNT zawiera również trimetoprim.<br />
Końcowe stężenie antybiotyków w przygotowanym podłożu:<br />
– wankomycyna: 3 µg/ml – nystatyna: 12,5 IU/ml<br />
– kolistyna: 7,5 µg/ml – mleczan trimetoprimu: 5 µg/ml<br />
2<br />
Modyfikowane podłoże New Y<strong>or</strong>k City przygotowuje się przez dodanie do 500 ml bazowego<br />
sterylnego agaru GC schłodzonego do 50°C następujących dodatków:<br />
– 50 ml krwi końskiej lizowanej przez dodanie 5 ml/l saponiny,<br />
– sterylny autolizat drożdżowy,<br />
– zestaw antybiotyków zawierający: wankomycynę, kolistynę, amfoterycynę i trimetoprim.<br />
Składniki dostępne są komercyjnie z Oxoid Ltd. Wade Rd, Basingstoke, Hants RG24 8PW, England.<br />
91
CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH<br />
atmosferze wzbogaconej dwutlenkiem węgla (eksykat<strong>or</strong>) i obserwować codziennie<br />
przez dwa dni. Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia przeprowadzające dużą liczbę badań próbek<br />
w kierunku N. gon<strong>or</strong>rhoeae, poza selektywnym MTM, stosują często nieselektywny<br />
agar czekoladowy wzbogacony dodatkiem IsoVitaleX lub innym, ponieważ<br />
3 – 10% gonokoków może wykazywać wrażliwość na stężenia wankomycyny<br />
użyte w podłożu selektywnym.<br />
Kolonie gonokoków po 24 godzinach mogą być jeszcze niewidoczne. Pojawiają<br />
się po 48 godzinach jako szare lub białe, nieprzezroczyste, uniesione i opalizujące<br />
kolonie różnych rozmiarów i m<strong>or</strong>fologii.<br />
Identyfikacja Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae<br />
Wstępna identyfikacja N. gon<strong>or</strong>rhoeae izolowanych z materiałów pobranych<br />
z dróg moczowo-płciowych oparta jest na dodatniej reakcji oksydazowej<br />
i obecności Gram-ujemnych dwoinek widocznych w preparacie barwionym<br />
metodą Grama. W celu potwierdzenia identyfikacji można przeprowadzić testy<br />
rozkładu węglowodanów lub inne, stosując metody i podłoża omówione szczegółowo<br />
w innych opracowaniach 1 .<br />
Badanie wrażliwości na antybiotyki<br />
Istnieje geograficzne zróżnicowanie wrażliwości N. gon<strong>or</strong>rhoeae na benzylopenicylinę.<br />
W niektórych regionach, takich jak Afryka podsaharyjska czy południowo-wschodnia<br />
Azja, większość szczepów gonokokowych wykazuje zdolność<br />
do produkcji β-laktamaz. Przenoszona chromosomalnie, niezwiązana z wytwarzaniem<br />
β-laktamaz op<strong>or</strong>ność na benzylopenicylinę staje się c<strong>or</strong>az częstsza<br />
w wielu krajach. Metoda dyfuzji krążkowej nie jest jednak przydatna do<br />
wykrywania takich szczepów.<br />
Na obszarach, gdzie w zakażeniach gonokokowych stosowane są benzylopenicylina,<br />
ampicylina i amoksycylina, szczepy N. gon<strong>or</strong>rhoeae (szczególnie w razie<br />
niepowodzenia terapii) powinny być rutynowo badane w kierunku wytwarzania<br />
β-laktamaz jednym z zalecanych testów, takich jak test z nitrocefiną 2 . Do testu<br />
z nitrocefiną należy wmałej probówce przygotować gęstą zawiesinę z kilku<br />
kolonii i 0,2 ml fizjologicznego roztw<strong>or</strong>u soli; następnie do zawiesiny dodać<br />
0,025 ml nitrocefiny, mieszać przez minutę. Szybka zmiana kol<strong>or</strong>u z żółtego na<br />
różowy lub czerwony jest dowodem na wytwarzanie β-laktamazy przez badany<br />
szczep.<br />
Rutynowe badanie wrażliwości N. gon<strong>or</strong>rhoeae na antybiotyki metodą dyfuzyjno-<br />
-krążkową nie jest zalecane.<br />
1<br />
Van Dyck E., Meheus A.Z., Piot P.: Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y diagnosis of sexually transmitted diseases. Geneva,<br />
W<strong>or</strong>ld Health Organization, 1999.<br />
2<br />
Odczynnik Nitrocefin jest dostępny w firmie Oxoid Ltd, Wade Road, Basingstoke, Hants RG24<br />
8PW, England; zawiera 1 mg nitrocefiny (SR112) i fiolkę rozpuszczalnika (SR112A). Test<br />
probówkowy może być zastąpiony testem krążkowym z użyciem krążka nasyconego nitrocefiną<br />
(krążek cefinazowy dostępny z BD Diagnostic Systems, 7 Loveton Circle, Sparks, MD 21152,<br />
USA).<br />
92
CZE˛ŚĆ I<br />
Próbki z żeńskich narza˛dów płciowych<br />
Fl<strong>or</strong>a pochwy kobiety przed menopauzą składa się głównie z laseczek kwasu<br />
mlekowego i różnych fakultatywnie tlenowych i beztlenowych bakterii.<br />
Nieprawidłowa wydzielina z pochwy może być wynikiem:<br />
– zapalenia pochwy: Gardnerella vaginalis, Candida albicans;<br />
– bakteryjnej waginozy: przerost bakterii beztlenowych i Mobiluncus spp.;<br />
– zapalenia szyjki macicy: Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae, Chlamydia trachomatis.<br />
Inne bakterie, takie jak Enterobacteriaceae, nie są udowodnioną przyczyną<br />
zapalenia pochwy. Zapalenie pochwy u dziewczynek przed okresem pokwitania<br />
może być wywołane przez N. gon<strong>or</strong>rhoeae lub C. trachomatis.<br />
Bakteryjna waginoza (niespecyficzne zapalenie pochwy) jest stanem charakteryzującym<br />
się obfitą, brzydko pachnącą wydzieliną, z towarzyszącym znaczącym<br />
wzrostem Mobiluncus spp. i różnych bezwzględnych beztlenowców <strong>or</strong>az<br />
spadkiem liczby pochwowych laseczek kwasu mlekowego. Minimalnym warunkiem<br />
rozpoznania bakteryjnej waginozy jest obecność co najmniej trzech<br />
z następujących objawów: nieprawidłowa wydzielina z pochwy, pH pochwy<br />
> 4,5, komórki wskaźnikowe (komórki nabłonkowe z tak licznie przylegającymi<br />
bakteriami, że niewidoczne stają się obrysy komórki) i rybi, aminopodobny<br />
zapach po dodaniu do wydzieliny pochwowej kropli 10% wod<strong>or</strong>otlenku potasu.<br />
Zapalenie cewki moczowej może być wywołane także przez N. gon<strong>or</strong>rhoeae<br />
i C. trachomatis.<br />
Zakażenia wstępujące N. gon<strong>or</strong>rhoeae, C. trachomatis, beztlenowymi i względnie<br />
beztlenowymi bakteriami mogą powodować zapalenie narządów miednicy<br />
(pelvic inflammat<strong>or</strong>y disease — PID) i w konsekwencji niemożność donoszenia<br />
ciąży lub ciążę pozamaciczną.<br />
Bakteryjne zakażenia narządów płciowych podczas ciąży, w tym zakażenia<br />
N. gon<strong>or</strong>rhoeae i C. trachomatis, mogą być przyczyną powikłań, takich jak:<br />
przedwczesny p<strong>or</strong>ód, przedwczesne pęknięcie pęcherza płodowego, zapalenie<br />
błon płodowych, pop<strong>or</strong>odowe zapalenie błony śluzowej macicy u matki i zapalenie<br />
spojówek, zapalenie płuc <strong>or</strong>az zespół zakażenia owodni u now<strong>or</strong>odka.<br />
Na specjalne zlecenie materiały pobrane z szyjki macicy i pochwy można<br />
posiewać w kierunku S. aureus (zespół szoku toksycznego), S. agalactiae<br />
(paci<strong>or</strong>kowiec grupy B, zakażenia now<strong>or</strong>odków), Listeria monocytogenes (zakażenia<br />
now<strong>or</strong>odków) i Clostridium spp. (p<strong>or</strong>onienie septyczne).<br />
Jakkolwiek infekcje C. trachomatis i ludzkim Herpesvirus są powszechne, ich<br />
diagnostyka lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjna wymaga drogiego sprzętu <strong>or</strong>az odczynników i nie<br />
będzie tutaj omawiana.<br />
Pobieranie i transp<strong>or</strong>t próbek<br />
Wszystkie próbki powinny być pobierane podczas badania we wziernikach.<br />
Wziernik przed użyciem można zwilżyć ciepłą jałową wodą, nie można natomiast<br />
używać antyseptyków i kremów do badania ginekologicznego, ponieważ mogą<br />
one działać letalnie na gonokoki.<br />
93
CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH<br />
Do badania w kierunku obecności drożdży, G. vaginalis i bakteryjnej waginozy<br />
próbki wydzieliny pochwowej można pobrać wymazówką z tylnego sklepienia<br />
pochwy. Próbki do hodowli gonokoków i chlamydii powinny być pobrane z błony<br />
śluzowej szyjki macicy. Po założeniu wzierników bawełnianą wymazówką należy<br />
usunąć czop śluzowy. Wymazówkę do pobierania materiału (patrz str. 90) należy<br />
wprowadzić do kanału szyki macicy i obracać przez co najmniej 10 sekund przed<br />
wyciągnięciem.<br />
Próbki z cewki moczowej, odbytu i z jamy ustnej pobiera się w podobny sposób<br />
jak u mężczyzn.<br />
W każdym przypadku zapalenia narządów miednicy (PID) należy pobrać<br />
przynajmniej próbki z szyjki macicy w kierunku N. gon<strong>or</strong>rhoeae. Pobieranie<br />
materiału z jajowodu jest bardziej wiarygodne, ale w większości regionów<br />
najlepszą dostępną próbką jest aspirat z zagłębienia odbytniczo-macicznego<br />
(jamy Douglasa).<br />
U dzieci z ciężkim now<strong>or</strong>odkowym zapaleniem spojówek należy wymazówką lub<br />
ezą pobrać wydzielinę z w<strong>or</strong>ka spojówkowego.<br />
Z wyjątkiem próbek badanych w kierunku C. trachomatis, do transp<strong>or</strong>tu<br />
wymazów z szyjki i pochwy najbardziej odpowiednie są podłoża transp<strong>or</strong>towe<br />
Amies i Stuart.<br />
Badanie bezpośrednie i interpretacja<br />
Bezpośrednie badanie wydzieliny z pochwy jest metodą z wyb<strong>or</strong>u w diagnostyce<br />
zapalenia pochwy, lecz mniej przydatną w diagnostyce zapalenia szyjki<br />
macicy.<br />
Preparat bezpośredni przygotowywany jest na szkiełku podstawowym, na którym<br />
w fizjologicznym roztw<strong>or</strong>ze soli umieszcza się próbkę materiału pobranego<br />
z pochwy, a następnie nakrywa szkiełkiem nakrywkowym. Zapewnia to rozdzielenie<br />
komórek, które w innym przypadku mogą sklejać się w grudki. Preparat<br />
należy oglądać pod powiększeniem × 400 poszukując typowych ruchliwych<br />
T. vaginalis, pączkujących drożdży i komórek wskaźnikowych (,,clue cells’’).<br />
C. albicans może tw<strong>or</strong>zyć pseudogrzybnie, obserwowane niekiedy w materiale<br />
z pochwy. Komórki wskaźnikowe są obecne u większości kobiet z bakteryjną<br />
waginozą. Ziarnisty lub brudny wygląd cytoplazmy komórek nabłonkowych jest<br />
mniej obiektywnym kryterium niż utrata granic komórki. Badanie mikroskopowe<br />
preparatów bezpośrednich z szyjki macicy nie jest zalecane.<br />
W diagnostyce bakteryjnej waginozy metodą z wyb<strong>or</strong>u jest przygotowanie preparatów<br />
barwionych metodą Grama. Preparat należy wykonać delikatnie przetaczając<br />
wymazówkę po szkiełku podstawowym. Prawidłowy rozmaz z pochwy<br />
zawiera głównie laseczki kwasu mlekowego (duże, Gram-dodatnie) <strong>or</strong>az mniej<br />
niż 5 leukocytów w polu widzenia. W rozmazach pochodzących od kobiet z waginozą<br />
bakteryjną obserwuje się pokryte małymi Gram-ujemnymi pałeczkami<br />
komórki wskaźnikowe (,,clue cells’’) <strong>or</strong>az mieszaną fl<strong>or</strong>ę: liczne małe Gram-<br />
-ujemne i Gram-zmienne pałeczki, ziarenko-pałeczki, często także Gram-ujemne<br />
zakrzywione pałeczki, nie stwierdza się natomiast większych, Gram-dodatnich<br />
laseczek. W polu widzenia widoczne są jedynie nieliczne (< 5) leukocyty. Obraz<br />
ten jest czułym i swoistym wskaźnikiem bakteryjnej waginozy.<br />
94
CZE˛ŚĆ I<br />
Duża liczba leukocytów (> 10 komórek w polu widzenia) w bezpośrednim<br />
preparacie z pochwy barwionym metodą Grama wskazuje na rzęsistkowicę lub<br />
zapalenie szyjki macicy.<br />
Barwienie Grama nie jest szczególnie przydatne w diagnostyce zakażeń gonokokowych<br />
u kobiet. Badanie oparte na poszukiwaniu Gram-ujemnych wewnątrzkomórkowo<br />
zlokalizowanych dwoinek w barwionych metodą Grama preparatach<br />
bezpośrednich z szyjki macicy ma czułość 50 – 70% i swoistość 50 – 90%, co<br />
wskazuje na niewielką wartość tej metody diagnostycznej w populacji o niskiej<br />
częstości występowania rzeżączki. Obecność Gram-ujemnych wewnątrzkomórkowych<br />
dwoinek widocznych w preparatach z szyjki macicy powinna zostać<br />
odnotowana bez określenia, że sąto N. gon<strong>or</strong>rhoeae lub gonokoki. Można w ten<br />
sposób uniknąć nadinterpretacji rozmazów z szyjki macicy, które często zawierają<br />
Gram-ujemne ziarenko-pałeczki <strong>or</strong>az dwubiegunowo zabarwione pałeczki.<br />
Głównym celem wykonywania preparatów bezpośrednich z szyjki macicy jest<br />
potwierdzenie rozpoznania śluzowo-ropnego zapalenia szyjki macicy: obecność<br />
więcej niż 10 wielojądrzastych leukocytów w polu widzenia wskazuje na rozpoznanie<br />
zakażenia, wywołanego zwykle przez N. gon<strong>or</strong>rhoeae i/lub C. trachomatis.<br />
Badanie preparatów bezpośrednich ze spojówek barwionych metodą Grama jest<br />
czułą i swoista metodą diagnostyczną rzeżączkowego zapalenia spojówek.<br />
Obecność wewnątrzkomórkowych Gram-ujemnych dwoinek potwierdza rozpoznanie.<br />
Hodowla<br />
Próbki z szyjki macicy, odbytu, cewki moczowej, spojówek i z zagłębienia<br />
odbytniczo-macicznego mogą być posiewane w kierunku N. gon<strong>or</strong>rhoeae metodą<br />
opisaną na str. 91, 92. Badanie próbek należy rozpocząć natychmiast po ich<br />
dostarczeniu do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium lub — k<strong>or</strong>zystniej — jeszcze w klinice. U kobiet,<br />
w odróżnieniu od mężczyzn, posiewy mają kluczowe znaczenie w diagnostyce<br />
infekcji gonokokowych. Czułość pojedynczego posiewu u kobiet wynosi<br />
80 – 90%. Jest mniejsza w przypadku próbek pobranych w okresie okołop<strong>or</strong>odowym.<br />
W diagnostyce bakteryjnej waginozy nie zaleca się prowadzenia hodowli w kierunku<br />
G. vaginalis lub beztlenowców, ponieważ są one wykrywane u 20 – 40%<br />
kobiet bez infekcji pochwy. Obecność G. vaginalis w wydzielinie z pochwy nie<br />
jest wystarczającym wskazaniem do leczenia; leczone powinny być tylko<br />
pacjentki spełniające wszystkie kryteria diagnostyczne bakteryjnej waginozy.<br />
W p<strong>or</strong>ównaniu z badaniem mikroskopowym hodowla zwiększa wykrywalność<br />
C. albicans o50– 100%. Ponieważ posiew w kierunku Candida jest dodatni nawet<br />
przy niewielkiej liczbie grzybów, która może występować u10– 30% kobiet bez<br />
objawów zapalenia pochwy, tylko obfity wzrost C. albicans stanowi dowód<br />
kandydiazy pochwy. W związku z tym nie zaleca się rutynowego prowadzenia<br />
hodowli. Podobnie, poza preparatem bezpośrednim nie zaleca się posiewu<br />
w kierunku G. vaginalis, który najczęściej wykrywa jedynie bezobjawowe<br />
nosicielstwo.<br />
95
CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH<br />
Próbki z owrzodzeń narza˛dów płciowych<br />
Owrzodzenia narządówpłciowych są częstym problemem w wielu rozwijających<br />
się krajach. Ich diagnostyka i leczenie są wyzwaniem zarówno dla lekarzy, jak<br />
i dla lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. Powszechne są infekcje mieszane. Zmiany owrzodzeniowe<br />
narządów płciowych mogą być wywołane przez różne czynniki przenoszone<br />
drogą kontaktów seksualnych:<br />
– ludzki Herpesvirus,<br />
– Treponema pallidum,<br />
– Haemophilus ducreyi,<br />
– Calymmatobacterium granulomatis, wywołujący ziarniniaka pachwiny (donovanosis),<br />
– Chlamydia trachomatis serotypy L 1 ,L 2 ,L 3 .<br />
W wielu rozwijających się krajach wirus opryszczki jest najczęstszą przyczyną<br />
owrzodzeń narządów płciowych i zagrażających życiu powikłań u pacjentów<br />
z niedob<strong>or</strong>ami odp<strong>or</strong>nościowymi <strong>or</strong>az u now<strong>or</strong>odków kobiet z infekcją. Diagnostyka<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjna zakażenia nie będzie tu omawiana.<br />
Kiła jest wciąż najpoważniejszą ch<strong>or</strong>obą weneryczną, która może prowadzić do<br />
ciężkich późnych następstw <strong>or</strong>az kiły wrodzonej. Mimo że testy serologiczne<br />
odgrywają ważną rolę w diagnostyce wszystkich stadiów kiły, w tym miejscu<br />
zostanie omówione tylko badanie w ciemnym polu widzenia. Techniki i interpretacja<br />
testów serologicznych w diagnostyce kiły zostały szczegółowo przedstawione<br />
w innych opracowaniach 1 .<br />
Wrzód miękki jest główną postacią owrzodzeń narządów płciowych w wielu<br />
rozwijających się regionach. Objawy kliniczne obejmują bolesne, ropne owrzodzenie(a),<br />
z towarzyszącym bolesnym, często ropnym, zapalnym obrzękiem<br />
pachwinowych węzłów chłonnych. Nie obserwowano występowania późnych<br />
konsekwencji zakażenia. Kliniczne różnicowanie z innymi owrzodzeniami<br />
narządówpłciowych jest trudne. Wrzód miękki zwiększa ryzyko zakażenia HIV.<br />
Ziarniniak pachwiny charakteryzuje się żywoczerwonym, ziarniniakowym<br />
owrzodzeniem narządów płciowych. Obrzęk zapalny węzłów chłonnych jest<br />
rzadki.<br />
Chlamydiowy ziarniniak limfatyczny charakteryzuje się pachwinową i/lub udową<br />
limfadenopatią i rzadziej obecnością małych, samoistnie gojących się owrzodzeń.<br />
Diagnostyka oparta jest na testach serologicznych i izolacji C. trachomatis<br />
serotypów L 1 ,L 2 ,L 3 .<br />
Pobieranie próbek<br />
Treponema pallidum: Nałożyć rękawiczki chirurgiczne. Ścisnąć owrzodzenie<br />
między dwoma palcami i, używając gazików, oczyścić powierzchnię zmiany<br />
roztw<strong>or</strong>em fizjologicznym soli. Obecne strupki usunąć. Zetrzeć pierwsze krople<br />
krwi (jeśli się pojawią) i dotykając czystym szkiełkiem podstawowym powierzchni<br />
zmiany pobrać próbkę surowiczego wysięku. Natychmiast nałożyć na kroplę<br />
1<br />
Van Dyck E., Meheus A.Z., Piot P.: Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y diagnosis of sexually transmitted disease. Geneva,<br />
W<strong>or</strong>ld Health Organization, 1999.<br />
96
CZE˛ŚĆ I<br />
wysięku czyste szkiełko nakrywkowe. Alternatywnie próbka może być pobrana ze<br />
zmiany lub powiększonego węzła chłonnego za pomocą sterylnej igły i strzykawki.<br />
Preparat powinien być niezwłocznie odczytany w ciemnym polu widzenia<br />
przez doświadczonego mikrobiologa.<br />
Haemophilus ducreyi: Próbkę należy pobrać wymazówką z podstawy owrzodzenia<br />
i posiać bezpośrednio na podłoże. Materiał można również uzyskać z powiększonych<br />
zapalnie węzłów chłonnych pachwinowych, lecz wyhodowanie<br />
H. ducreyi z takiego materiału jest mniej prawdopodobne. Przydatność podłoży<br />
transp<strong>or</strong>towych dla H. ducreyi nie została dostatecznie oceniona.<br />
Przy podejrzeniu ziarniniaka pachwiny należy wykonać biopsję tkanki leżącej pod<br />
powierzchnią aktywnie ziarninującej zmiany. Przygotować świeże preparaty ze<br />
zmiażdżonych fragmentów materiału biopsyjnego. Alternatywnie jeden z preparatów<br />
może zawierać zeskrobiny z powierzchni zmiany.<br />
Badanie bezpośrednie<br />
Wykazanie krętków w materiale ze zmiany jest metodą z wyb<strong>or</strong>u w diagnostyce<br />
kiły pierwotnej. Mimo iż T. pallidum można wybarwić (np. azotanem srebra), ze<br />
względu na większą czułość i swoistość zalecana jest mikroskopia w ciemnym<br />
polu widzenia. Do badania potrzebny jest mikroskop wyposażony w dobre źródło<br />
światła i kondens<strong>or</strong>. Kondens<strong>or</strong> ciemnego pola widzenia przesłania padające<br />
prosto promienie światła, przepuszczając jedynie promienie peryferyczne (odbijane<br />
przez takie obiekty, jak krętki).<br />
Należy umieścić kilka kropel olejku immersyjnego na kondens<strong>or</strong>ze mikroskopu<br />
z ciemnym polem widzenia. Obniżyć nieco kondens<strong>or</strong>, tak by poziom olejku był<br />
poniżej podstawy. Umieścić szkiełko pod mikroskopem i podnosić kondens<strong>or</strong> do<br />
chwili uzyskania dobrego kontaktu między olejkiem i spodem szkiełka. Unikać<br />
utw<strong>or</strong>zenia się pęcherzyków powietrza w olejku.<br />
Ryc. 9. Obraz T. pallidum pod mikroskopem w ciemnym polu widzenia.<br />
97
CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH<br />
Do uzyskania obrazu użyć obiektywu o najmniejszym powiększeniu (× 10).<br />
Regulując pokrętłem kondens<strong>or</strong>a, skierować światło centralnie na pole i ustawić<br />
ostrość podnosząc i obniżając kondens<strong>or</strong> do momentu uzyskania najmniejszej<br />
średnicy światła. Jeśli to konieczne, ponownie ustawić światło w centrum.<br />
Następnie, używając obiektywu × 40, ustawić ostrość i uważnie oglądać preparat.<br />
Kontrast będzie lepszy przy mikroskopowaniu w ciemności. Unikać jasnego<br />
światła dziennego.<br />
T. pallidum jest biały, świecący na ciemnym tle (ryc. 9). Jego identyfikacji<br />
dokonuje się na podstawie typowej m<strong>or</strong>fologii, rozmiaru i ruchliwości. Jest<br />
cienkim (0,25 – 0,3 µm) mikro<strong>or</strong>ganizmem, długości 6 – 16 µm, z 8 – 14 regularnymi,<br />
ściśle skręconymi, wyraźnymi spiralami. Wykazuje szybkie, raczej<br />
gwałtowne ruchy. Stosunkowo wolno obraca się wzdłuż długiej osi (jak<br />
k<strong>or</strong>kociąg). Rotacji towarzyszy intensywne zginanie (skręcanie). Można zaobserwować<br />
wydłużanie i skracanie komórki (przypominającej elastyczną, rozprężającą<br />
się spiralę). W skomplikowanych skrętach mogą pojawiać się zniekształcenia.<br />
Jeżeli mikro<strong>or</strong>ganizm przylega lub jest otoczony przez cięższy obiekt, w wyniku<br />
nasilonych ruchów dochodzi do odkształcenia zwojów. Inne niekiłowe krętki<br />
mogą być luźno skręcone, cienkie i nieregularne; p<strong>or</strong>uszają się inaczej (nie jak<br />
k<strong>or</strong>kociąg), ruchem bardziej wijącym, z zaznaczonym zgięciem i częstą relaksacją<br />
skrętów.<br />
Wykazanie krętków z charakterystyczną dla T. pallidum m<strong>or</strong>fologią i ruchem<br />
stanowi potwierdzenie rozpoznania pierwszo- i drug<strong>or</strong>zędowej kiły. Pacjenci<br />
z pierwotną zmianą kiłową, z dodatnim wynikiem badania w ciemnym polu<br />
widzenia mogą być seronegatywni. Zwykle do serokonwersji dochodzi w ciągu<br />
kilku tygodni.<br />
Niepowodzenie w wykazaniu drobnoustrojów nie wyklucza kiły. Ujemne wyniki<br />
mogą świadczyć o tym, że:<br />
• Obecna była niewystarczająca liczba drobnoustrojów (pojedyncze badanie<br />
w ciemnym polu widzenia ma czułość nie większą niż 50%).<br />
• Pacjent otrzymał już antybiotyki.<br />
• Zmiana ulega naturalnemu wygojeniu.<br />
• Zmiana nie była owrzodzeniem kiłowym.<br />
Niezależnie od wyników badania w ciemnym polu widzenia zawsze należy pobrać<br />
krew do badań serologicznych.<br />
W diagnostyce ziarniniaka pachwiny w utrwalonych acetonem preparatach<br />
wybarwionych metodą Giemsy wewnątrz histiocytów widoczne są typowe,<br />
otoczkowe laseczki. Diagnostyka tej ch<strong>or</strong>oby opisana jest szczegółowo w innych<br />
źródłach 1 .<br />
W diagnostyce wrzodu miękkiego nie zaleca się barwienia rozmazów metodą<br />
Grama, ponieważ zarówno czułość, jak i specyficzność wynoszą mniej niż 50%.<br />
W diagnostyce chlamydiowego ziarniniaka limfatycznego nie zaleca się stosowania<br />
barwienia metodą Giemsy. Materiał z owrzodzenia powinien być także badany<br />
w ciemnym polu widzenia w kierunku T. pallidum.<br />
1<br />
Van Dyck E., Meheus A.Z., Piot P.: Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y diagnosis of sexually transmitted diseases. Geneva,<br />
W<strong>or</strong>ld Health Organization, 1999.<br />
98
CZE˛ŚĆ I<br />
Hodowla<br />
Z owrzodzeń narządów płciowych niekiedy izolowane są gonokoki, ale ich<br />
znaczenie w takich próbkach jest niejasne. Poza H. ducreyi nie udowodniono, aby<br />
inny gatunek bakterii — zarówno względnie tlenowy, jak i bezwzględnie<br />
beztlenowy — wywoływał owrzodzenia narządów płciowych.<br />
Próbki, które mają zostać zbadane w kierunku H. ducrei, należy posiać bezpośrednio<br />
na wybiórcze, wzbogacone podłoże agarowe 1 . Podłoże użyte do posiewu<br />
musi być świeże (do tygodnia od przygotowania). Płytki należy inkubować<br />
w33– 35°C w eksykat<strong>or</strong>ze ze zwilżoną ligniną na dnie. Po 48 – 72 godzinach<br />
inkubacji pojawiają się małe, nieśluzowe, żółtoszare, półprzezroczyste lub<br />
przezroczyste kolonie, które nienaruszone można przesuwać po powierzchni<br />
płytki. Czułość pojedynczej hodowli w izolacji H. ducreyi wynosi 70 – 80%.<br />
Wstępna diagnoza H. ducreyi może być przeprowadzona na podstawie m<strong>or</strong>fologii<br />
kolonii na podłożu selektywnym i wykazania małych, Gram-ujemnych pleom<strong>or</strong>ficznych<br />
ziarenko-pałeczek, często w pojedynczych łańcuchach (paci<strong>or</strong>ki),<br />
równoległych łańcuchach (,,ławica ryb’’) lub w skupiskach. Mimo że wzrost<br />
H. ducreyi jest zależny od heminy, większość klinicznych izolatów nie rośnie na<br />
podłożach wykrywających zależność wzrostu od czynników X i V. Obecnie<br />
prawie wszystkie szczepy izolowane w krajach rozwijających się wytwarzają<br />
β-laktamazy.<br />
1<br />
Agar Mueller-Hintona wzbogacony 5% sterylną krwią końską podgrzaną do 75°C, 1% IsoVitaleX<br />
i 3 g/ml wankomycyny.<br />
99
Ropne wydzieliny, rany i ropnie<br />
Wprowadzenie<br />
Jednym z najczęściej obserwowanych objawów ch<strong>or</strong>ób zakaźnych jest wytwarzanie<br />
ropnej (czasami surowiczo-ropnej) wydzieliny powstającej w wyniku<br />
inwazji bakterii do tkanki, narządu lub jamy ciała. Zakażenia te mogą być<br />
stosunkowo łagodne (nieszkodliwy ,,pryszcz’’) lub wywoływać liczne ropnie<br />
zlokalizowane w jednym lub wielu miejscach. Wysięk składa się z białych<br />
krwinek, głównie wielojądrzastych leukocytów, zakażających drobnoustrojów<br />
<strong>or</strong>az mieszaniny płynu ustrojowego i fibryny. W niektórych sytuacjach wysięk<br />
może być widoczny jako warstwa na powierzchni narządu, na przykład na<br />
powierzchni mózgu w bakteryjnym zapaleniu opon mózgowo-rdzeniowych.<br />
W innych przypadkach wysięk może być otoczony warstwą włóknika i siecią<br />
komórek tkanki (np. czyrak mnogi lub podskórny ,,czyrak’’), a niekiedy związany<br />
jest z otwartą raną, z której wycieka gęsty płyn lub ropa.<br />
Zarówno anatomiczna lokalizacja wysięku, jak i mikro<strong>or</strong>ganizmy związane<br />
z wymienionymi infekcjami mogą się znacznie różnić. Wpływ na tw<strong>or</strong>zenie<br />
wysięku mogą mieć wszystkie bakterie wchodzące w skład fl<strong>or</strong>y fizjologicznej,<br />
a także grzyby, szczególnie te, które mają zdolność namnażania się w tkankach.<br />
W infekcjach wirusowych rzadko dochodzi do powstania ropnej wydzieliny.<br />
Mikrobiolog powinien, uwzględniając różn<strong>or</strong>odną lokalizację i etiologię ropnych<br />
zakażeń, przeprowadzić właściwe badania makroskopowe i mikroskopowe<br />
z posiewem na odpowiednie podłoża, które umożliwią izolację najważniejszych<br />
patogennych drobnoustrojów. Możliwie najszybciej po uzyskaniu czystych<br />
hodowli należy przeprowadzić identyfikację <strong>or</strong>az określić wrażliwość na antybiotyki.<br />
Współpraca między klinicystą i mikrobiologiem ma zasadnicze znaczenie<br />
w diagnostyce i leczeniu pacjentów z ropnymi zakażeniami. Mikrobiolog musi<br />
współpracować z lekarzem, zapewniając właściwe pobieranie próbek i szybki<br />
transp<strong>or</strong>t do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium w celu natychmiastowego i właściwego prowadzenia<br />
badań.<br />
Postacie kliniczne i najczęstsze czynniki<br />
etiologiczne<br />
Próbki chirurgiczne<br />
Próbki chirurgiczne mogą być uzyskane przez nakłucie zlokalizowanego ropnia<br />
lub w innej procedurze chirurgicznej. Chirurg powinien pobrać kilka małych<br />
reprezentatywnych próbek z tkanki i każdego ropnego wysięku. Jeśli to możliwe,<br />
należy unikać wymazów. Materiał powinien być pobrany za pomocą igły<br />
i strzykawki. Jeśli konieczne jest użycie wymazówki, należy pobrać możliwie<br />
dużo wysięku i w odpowiednich pojemnikach przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. W chwili<br />
otrzymania próbki lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium musi, uwzględniając dostarczone inf<strong>or</strong>macje,<br />
zaplanować hodowlę drobnoustrojów prawdopodobnie obecnych w danej próbce.<br />
100
CZE˛ŚĆ I<br />
Poniżej przedstawiono kilka przykładów stanów klinicznych i drobnoustrojów<br />
obecnych w różnych typach próbek chirurgicznych:<br />
• Jama otrzewnej zawiera prawdopodobnie Gram-ujemne bakterie jelitowe,<br />
Gram-ujemne pałeczki beztlenowe (Bacteroides fragilis) i laseczki.<br />
• Ot<strong>or</strong>biony ropień może zawierać każdy typ drobnoustrojów, jeden lub kilka<br />
gatunków: Gram-dodatnie ziarenkowce i Gram-ujemne laseczki są izolowane<br />
najczęściej. W zależności od lokalizacji należy również uwzględnić bakterie<br />
beztlenowe i pełzaki.<br />
• Węzły chłonne często włączone są w infekcje układowe. Są powiększone,<br />
często dość twarde i gromadzą ropny wysięk. Jeśli węzeł jest chełboczący,<br />
zawarty płyn może zostać zaaspirowany przez lekarza. Biopsje węzłów<br />
chłonnych i aspiraty pobrane od dzieci należy hodować w kierunku Mycobacterium<br />
tuberculosis i innych prątków. Poza hodowlą w kierunku gronkowców,<br />
ziarenkowców i Gram-ujemnych bakterii jelitowych węzły chłonne stanowią<br />
dobry materiał do diagnostyki układowych i podskórnych grzybic (histoplazmoza,<br />
sp<strong>or</strong>otrychoza).<br />
• Skóra i tkanka podskórna są pierwotnym miejscem powstawania ropni<br />
i zakażeń ran. Zgodnie z ogólną zasadą, ropnie podskórne wywoływane są przez<br />
gronkowce. Otwarte, sączące się zmiany skórne często występują w zakażeniach<br />
β-hemolizującymi paci<strong>or</strong>kowcami i/lub gronkowcami, jak np. w liszajcu.<br />
Innym rodzajem zmian skórnych, powstających często w wyniku zakażeń<br />
szpitalnych, wymagających interwencji chirurgicznej, są owrzodzenia odleżynowe<br />
i odleżyny. Bakterie, które są komensalami skóry lub wchodzą<br />
w skład fl<strong>or</strong>y jelitowej, mogą namnażać się w zewnętrznych warstwach<br />
owrzodzenia i są odpowiedzialne za nieprzyjemny zapach i wygląd. Najczęściej<br />
izolowanymi drobnoustrojami z biopsji tkanki są laseczki; można je również<br />
obserwować w posiewach z powierzchownego wysięku. Nie zawsze możliwa<br />
jest ocena udziału tych drobnoustrojów w powstawaniu owrzodzenia odleżynowego,<br />
ale warunkiem zagojenia się rany jest utrzymywanie czystego<br />
i suchego owrzodzenia bez bakterii. Czasami drobnoustroje z odleżyny mogą<br />
przenikać do krwi, wywołując poważne powikłania.<br />
• Oparzenia, szczególnie drugiego i trzeciego stopnia, sprzyjają infekcjom<br />
wywołanym przez różne gatunki bakterii. Bardzo ważne jest dokładne<br />
chirurgiczne opracowanie rany przeprowadzone przed pobraniem materiału do<br />
hodowli. Najczęściej izolowane bakterie to gronkowce i Pseudomonas aeruginosa.<br />
• Wysięki. Czasami surowiczy lub ropny płyn może być pobrany z jamy ciała,<br />
która n<strong>or</strong>malnie zawiera niewielką ilość sterylnego płynu, np. w<strong>or</strong>ek osierdziowy,<br />
jama opłucnej, kaletka lub staw. Aspiracja igłowa w aseptycznych<br />
warunkach dostarczy lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium materiału, z którego można wyizolować<br />
i zidentyfikować zakażający mikro<strong>or</strong>ganizm. Zazwyczaj przyczyną zakażenia<br />
są bakterie, mogą występować również grzyby i wirusy. Infekcje wywołane są<br />
najczęściej przez jeden gatunek, ale pojawiają się także mieszane tlenowo-<br />
-beztlenowe zakażenia. Z aspiratów z jamy opłucnej można uzyskać pneumokoki,<br />
paci<strong>or</strong>kowce, H. influenzae, beztlenowe paci<strong>or</strong>kowce lub beztlenowe<br />
Gram-ujemne pałeczki (Prevotella i P<strong>or</strong>phyromonas) <strong>or</strong>az M. tuberculosis.<br />
Rany penetruja˛ce<br />
Każde uszkodzenie spowodowane przedmiotem, który przebija skórę, zawiera<br />
prawdopodobnie mieszaninę mikro<strong>or</strong>ganizmów; drobnoustroje należą głównie do<br />
fl<strong>or</strong>y skóry lub naturalnej fl<strong>or</strong>y mikrobiologicznej gleby i wody. Rany penetrujące<br />
101
ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE<br />
z uszkodzeniem jelit stanowią jeszcze poważniejsze zagrożenie, ponieważ<br />
w infekcji może współuczestniczyć fl<strong>or</strong>a jelitowa.<br />
Rany penetruja˛ce i cięte mogą być spowodowane ostrymi i tępymi narzędziami.<br />
Powstają często z użyciem metalu, szkła, drewna itp., w sposób przypadkowy lub<br />
umyślny (np. dźgnięcie nożem lub rany postrzałowe). Tężec rozwijający się<br />
w wyniku rany penetrującej jest dla nieszczepionych osób ch<strong>or</strong>obą zagrażającą<br />
życiu. Botulizm przyranny może pozostać nie rozpoznany, jeśli lekarz i mikrobiolog<br />
nie są świadomi takiej możliwości. Tężec i botulizm są rozpoznawane na<br />
podstawie objawów klinicznych, a <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong> potwierdzenie powinno być<br />
przeprowadzone przez centralne lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium referencyjne. Ludzie pracujący ze<br />
zwierzętami lub produktami zwierzęcymi są narażeni na zakażenie sp<strong>or</strong>ami<br />
Bacillus anthracis, które mogą wniknąć przez małe rany lub uszkodzenia skóry,<br />
wytwarzając typową dla wąglika postać czarnej krosty. Występujący także<br />
w glebie Clostridium perfringens może wniknąć do rany penetrującej i wywołać<br />
zg<strong>or</strong>zel gazową.<br />
Zadrapania i ugryzienia przez zwierzęta występują często zarówno w obszarach<br />
miejskich, jak i wiejskich. Ugryzienia mogą pochodzić od domowych, hodowlanych<br />
lub dzikich zwierząt. W pierwszej kolejności i niezwłocznie należy<br />
rozpatrzyć wściekliznę. Po wykluczeniu tej możliwości należy rozważyć inne<br />
czynniki etiologiczne. Diagnostyka wścieklizny jest zbyt specjalistyczna, aby<br />
została omówiona w tym opracowaniu 1 .<br />
Jama ustna zwierząt zawiera heterogenną fl<strong>or</strong>ę, wskład której wchodzą tlenowe<br />
i beztlenowe bakterie, grzyby, pierwotniaki i wirusy. Infekcje z powodu<br />
ugryzienia lub zadrapania wywołane są zwykle przez bakterie. Klasycznym<br />
przykładem jest zakażenie Pasteurella multocida, które często towarzyszy<br />
ugryzieniom przez psa lub kota, gdy rana nie została właściwie oczyszczona<br />
i leczona. Ugryzienia przez człowieka mogą niekiedy wywoływać poważne<br />
mieszane zakażenia tlenowymi i beztlenowymi bakteriami.<br />
Szpitalne zakażenia ran<br />
Jednym z głównych założeń w opiece i leczeniu hospitalizowanych pacjentów jest<br />
zasada nieszkodzenia (,,primum non nocere’’ — przyp. tłum.) w przebiegu<br />
diagnozowania i terapii. Niestety 5 – 10% hospitalizowanych pacjentów nabywa<br />
infekcje w szpitalu. Zakażenia szpitalne generują koszty, zwykle można ich<br />
uniknąć lub znacznie ograniczyć ich występowanie. Wiele nabytych w szpitalu<br />
infekcji pojawia się na oddziałach chirurgicznych. Współczynnik pooperacyjnych<br />
zakażeń ran różni się w zależności od szpitala, a w obrębie szpitala wydaje się<br />
wyższy u pacjentów poddanych operacjom jamy brzusznej, klatki piersiowej lub<br />
zabiegom <strong>or</strong>topedycznym. Zakażenia ran chirurgicznych mogą pojawiać się<br />
krótko po zabiegu lub kilka dni później. Zakażenie może być ograniczone do<br />
miejsca przecięcia lub obejmować całe miejsce operowane. Głównym czynnikiem<br />
etiologicznym zakażeń jest Staphylococcus aureus (zwykle op<strong>or</strong>ny na<br />
benzylopenicylinę, a obecnie również metycylinoop<strong>or</strong>ny), przed E. coli i innymi<br />
bakteriami jelitowymi. Beztlenowe bakterie z jelita grubego pacjenta mogą<br />
zakazić operowane miejsca, wywołując ciężką mieszaną infekcję, dość często<br />
występującą w szpitalach, w których opieka nad ranami pooperacyjnymi<br />
1<br />
Meslin F.-X., Kaplan M.M., Koprowski H. (eds.): Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y techniques in rabies, 4th ed. Geneva,<br />
W<strong>or</strong>ld Health Organization, 1996.<br />
102
CZE˛ŚĆ I<br />
i programy profilaktyki zakażeń są słabo rozwinięte. Bacteroides fragilis<br />
i rzadziej Clostridium perfringens mogą przeniknąć do krwi, stając się przyczyną<br />
uogólnionego, często śmiertelnego zakażenia pooperacyjnego.<br />
Po zabiegu stomatologicznym lub chirurgicznym w obrębie jamy ustnej może<br />
rozwinąć się rzadka infekcja, w której kanał przetoki prowadzi od wewnątrz na<br />
powierzchnię skóry twarzy lub szyi, a wydzielina zawiera ,,siarkowe’’ ziarna<br />
promienicy.<br />
Pobieranie i transp<strong>or</strong>t próbek<br />
Nie jest możliwe w tym miejscu szczegółowe opisanie <strong>procedury</strong> pobierania<br />
próbek z każdego typu rany, ropnia itd. Wydaje się oczywiste, że to zadanie<br />
wymaga bliskiej współpracy między lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium i lekarzem. W wielu<br />
przypadkach istnieje tylko jedna możliwość pobrania próbki; zazwyczaj<br />
nie ma możliwości pobrania kolejnych. Z tego powodu pobieranie,<br />
transp<strong>or</strong>t i przechowywanie próbek mają największe znaczenie i wymagają<br />
ścisłego przestrzegania zaleceń. Możliwie najszybciej po pobraniu próbkę<br />
należy przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium, gdzie powinna zostać natychmiast opracowana.<br />
Po wstępnym badaniu i założeniu hodowli pozostałą część materiału<br />
należy odpowiednio opisać i zachować w warunkach schłodzenia do chwili<br />
uzyskania pewności, że nie ma potrzeby wykonania dodatkowych testów<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych.<br />
Ropień<br />
Jeśli zostanie wykryty ropień lub mnogie ropnie, lekarz prowadzący lub<br />
chirurg i mikrobiolog powinni skonsultować się w sprawie dalszego postępowania.<br />
Technika pobierania ropy i fragmentów ściany ropnia jest procedurą<br />
chirurgiczną. Do pobrania możliwie największej objętości materiału ropnego<br />
należyużyć igły i strzykawki, a następnie przenieść aseptycznie pobrany materiał<br />
do sterylnego pojemnika. Jeśli taki pojemnik nie jest dostępny, próbkę należy<br />
zatrzymać w strzykawce z zatkniętą igłą icałą strzykawkę przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
(metoda ta nie jest obecnie polecana z powodu ryzyka ekspozycji na<br />
zakażenie — przyp. tłum.). Materiał powinien natychmiast zostać poddany<br />
obróbce w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium; zarówno hodowle tlenowe jak i beztlenowe można<br />
założyć z jednej próbki.<br />
Ze względu na potencjalną konieczność śródoperacyjnego pobrania próbki<br />
w czasie zabiegów, w których przypadkowo stwierdza się obecność jednego lub<br />
więcej ot<strong>or</strong>bionych ropni w narządach, klatce piersiowej, jamie brzusznej lub<br />
miednicy, w sterylnym chirurgicznym wyposażeniu powinny znaleźć się zestawy<br />
do pobierania materiału. Za dostarczenie odpowiednich zestawów odpowiedzialne<br />
jest lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium. W przypadku obecności obfitej ropy należy unikać<br />
pobierania próbek wymazówką.Użycie wymazówek uzasadnione jest do pobierania<br />
bardzo małych ilości ropy lub z miejsc wymagających zachowania ostrożności,<br />
np. z oka. Gdy dostarczone zostaną fragmenty tkanek ze ścian ropnia, technik<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjny powinien zmiażdżyć tkankę, używając jako rozpuszczalnika niewielkiej<br />
ilość sterylnego bulionu lub rozdrobnić tkankę na bardzo małe kawałki<br />
używając sterylnych nożyczek. Należy przygotować hodowle tlenowe i beztlenowe<br />
w sposób opisany na str. 107.<br />
103
ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE<br />
Zakażone skaleczenia, rany dra˛ża˛ce,<br />
rany pooperacyjne, oparzenia<br />
i owrzodzenia odleżynowe<br />
Nie można sf<strong>or</strong>mułować standardowej <strong>procedury</strong> pobierania próbek. Należy<br />
jednak przestrzegać pewnych podstawowych zasad otrzymywania możliwie<br />
najlepszych próbek do badań lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych. Po starannym oczyszczeniu<br />
miejsca chirurg powinien odnaleźć zbi<strong>or</strong>nik ropy, martwicze tkanki, rozpoznać<br />
obecność gazu (trzeszczenie) lub inne nieprawidłowe objawy. Fragmenty zajętych<br />
tkanek, które zostaną użyte do hodowli, powinny zostać pobrane na sterylną<br />
gazę. Ropę lub inny wysięk należy pobrać starannie i umieścić w sterylnej<br />
probówce. W razie potrzeby można użyć wymazówek.<br />
Kanały przetoki lub rany drenuja˛ce<br />
węzłów chłonnych<br />
Jeśli przetoki lub węzły chłonne wykazują objawy samoistnego drenowania,<br />
należy, używając sterylnej pipety Pasteura wyposażonej w gumowy balonik,<br />
starannie pobrać materiał i umieścić go w sterylnej probówce. Jeśli wydzielina nie<br />
jest widoczna, chirurg powinien pobrać ropny materiał za pomocą strzykawki<br />
iigły. Wymazówki należy stosować tylko wtedy, gdy nie są dostępne pipety<br />
Pasteura.<br />
Wysięki<br />
Nieprawidłowe zbieranie się płynu w jamie ciała, takiej jak jama opłucnej, staw<br />
lub przestrzeń otrzewnowa, wymaga interwencji chirurgicznej z aspiracją<br />
nagromadzonego materiału do sterylnego pojemnika, a następnie dostarczenia go<br />
do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium w celu wykonania badania mikrobiologicznego i cytologicznego.<br />
W przypadku ciągłego gromadzenia się ropy należy założyć otwarty dren,<br />
konieczny do aseptycznego pobrania płynu, w celu wykonania posiewu i innych<br />
badań.<br />
Ocena makroskopowa<br />
Próbki ropy lub wydzieliny z rany pobrane na wymazówki są trudne do oceny<br />
makroskopowej, szczególnie gdy zostały zanurzone w podłożu transp<strong>or</strong>towym.<br />
Kol<strong>or</strong>, konsystencja i zapach próbek ropy, otrzymanych w strzykawce lub<br />
w sterylnym pojemniku, powinny być oceniane uważnie przez doświadczonego<br />
mikrobiologa.<br />
Kol<strong>or</strong><br />
Ropa może mieć kol<strong>or</strong> od zielonożółtego do brązowoczerwonego. Czerwony<br />
kol<strong>or</strong> spowodowany jest domieszką krwi lub hemoglobiny. Aspirat z pierwotnego<br />
ropnia wątroby wywołanego pełzakiem ma galaretowatą konsystencję i barwę od<br />
żółtobrązowej do ciemnobrązowej. Ropa z ran pooperacyjnych lub urazowych<br />
104
CZE˛ŚĆ I<br />
(oparzeń) może mieć zabarwienie niebieskozielone z powodu obecności piocyjaniny,<br />
wytwarzanej przez Pseudomonas aeruginosa.<br />
Konsystencja<br />
Konsystencja może być różna: od mętnego do bardzo gęstego i lepkiego<br />
płynu. Wysięki aspirowane ze stawów, jamy opłucnej lub w<strong>or</strong>ka osierdziowego<br />
są zwykle płynne, z możliwą gradacją od surowiczego wysięku do typowej<br />
ropy.<br />
Ropa <strong>or</strong>ganizująca się w drenowanym kanale przetoki na szyi powinna zostać<br />
zbadana w kierunku obecności małych żółtych ziaren ,,siarkowych’’, które są<br />
skupiskami promieniowców Actinomyces israelii. Obecność siarkowych ziaren<br />
wskazuje na promienicę szyjno-twarzową. Małe różnokol<strong>or</strong>owe ziarenka (białe,<br />
czarne, czerwone lub brązowe) są typowe dla mycetoma, ziarniniakowych guzów,<br />
które zwykle są zlokalizowane na kończynach dolnych (np. stopa madurska)<br />
i charakteryzują się licznymi ropniami i przetokami. Kol<strong>or</strong>owe ziarenka odpowiadają<br />
zarówno nitkowatym bakteriom, jak i grzybni.<br />
Ropa z gruźliczych ,,ropni zimnych’’ (ze skąpymi objawami zapalenia) p<strong>or</strong>ównywana<br />
jest z miękkim serem i nazywana ,,serowaciejącą’’ lub ,,serowatą ropą’’.<br />
Zapach<br />
Nieprzyjemny zapach jest jedną z cech charakterystycznych dla beztlenowych lub<br />
mieszanych tlenowo-beztlenowych zakażeń, ale w pewnych okolicznościach<br />
może nie występować. Wstępna ocena na podstawie zapachu i m<strong>or</strong>fologii<br />
komórek w preparacie barwionym metodą Grama powinna być niezwłocznie<br />
przedstawiona klinicyście w celu ułatwienia empirycznego wyb<strong>or</strong>u właściwego<br />
antybiotyku. Jest ona także pomocna w podjęciu decyzji o konieczności hodowli<br />
beztlenowej.<br />
Badanie mikroskopowe<br />
Z każdej próbki należy wykonać i obejrzeć preparat barwiony metodą Grama.<br />
W niektórych przypadkach lub na polecenie lekarza należy przygotować preparat<br />
bezpośredni barwiony metodą Ziehl-Neelsena.<br />
Barwienie preparatów metoda˛ Grama<br />
Za pomocą ezy nanieść na czyste szkiełko podstawowe najbardziej ropną część<br />
próbki. Jeśli dostępny jest tylko wymaz, szkiełko należy najpierw wysterylizować<br />
w ogniu nad palnikiem Bunsena i pozostawić do wystygnięcia. Bawełnianą<br />
wymazówkę należy delikatnie przetoczyć po powierzchni szkiełka, bez pocierania<br />
lub nadmiernego wyciskania. Pozostawić szkiełko do wyschnięcia na<br />
powietrzu lub umieścić w cieplarce. Utrwalić przez ogrzanie, wybarwić i oglądać<br />
preparat w immersji (obiektyw × 100). Poszukiwać starannie i odnotować<br />
obecność i liczbę (używając znaków +):<br />
– wielojądrzastych granulocytów (komórki ropy);<br />
105
ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE<br />
– Gram-dodatnich ziarenkowców ułożonych w skupiska, sugerujących gronkowce;<br />
– Gram-dodatnich ziarenkowców włańcuchach, sugerujących paci<strong>or</strong>kowce lub<br />
enterokoki;<br />
– Gram-ujemnych pałeczek podobnych do pałeczki okrężnicy (Escherichia coli,<br />
Klebsiella etc.), innych Enterobacteriaceae (Proteus, Serratia etc.), niefermentujących<br />
pałeczek (Pseudomonas spp.) lub bezwzględnych beztlenowców<br />
(Bacteroides spp.);<br />
– dużych prostych Gram-dodatnich pałeczek z kwadratowymi biegunami, sugerujących<br />
Clostridium perfringens, główną przyczynę zg<strong>or</strong>zeli gazowej lub<br />
Bacillus anthracis, przyczynę wąglika;<br />
– gęstej i wielokształtnej mieszaniny bakterii, zawierającej paci<strong>or</strong>kowce, Gram-<br />
-dodatnie i Gram-ujemne pałeczki o różnym kształcie, również wrzecionowce;<br />
taki obraz sugeruje ,,mieszaną fl<strong>or</strong>ę beztlenową’’, którą tak należy opisać;<br />
– Candida lub innych komórek grzybów, które widoczne są jako owalne, Gram-<br />
-dodatnie, pączkujące komórki, często tw<strong>or</strong>zące rozgałęzione pseudogrzybnie.<br />
Ziarenka siarki z promienicy (aktynomykozy) i ziarenka grzybni należy rozdrobnić,<br />
wybarwić metodą Grama i poszukiwać Gram-dodatnich cienkich rozgałęzień<br />
i fragmentów nici.<br />
Mikroskopia bezpośrednia<br />
Zgodnie z zaleceniem lub gdy prawdopodobne jest grzybicze lub pasożytnicze<br />
zakażenie, należy przygotować niebarwiony preparat. Jeśli ropa jest gęsta, oczko<br />
ezy zmieszać z fizjologicznym roztw<strong>or</strong>em soli. Podczas badania w kierunku<br />
grzybów do rozjaśnienia próbki użyć kropli 10% wod<strong>or</strong>otlenku potasu. Nałożyć<br />
szkiełko nakrywkowe i w powiększeniu obiektywu × 10 – × 40 poszukiwać<br />
zwłaszcza:<br />
– aktywnie ruchomych pełzaków w aspiracie z ropnia wątroby;<br />
– komórek grzybów drożdżopodobnych Histoplasma capsulatum (łącznie z afrykańską<br />
odmianą var. duboisii), Blastomyces dermatitidis (w regionach<br />
endemicznych), Candida spp.;<br />
– grzybni i filamentacyjnych f<strong>or</strong>m bakterii w rozdrobnionych ziarenkach ze<br />
zmian w stopie madurskiej;<br />
– pasożytów, takich jak mikrofilarie, skoleksów i haczyków Echinococcus, jaj<br />
Schistosoma, Fasciola lub Paragonimus.<br />
Barwienie kwasoop<strong>or</strong>ne (Ziehl-Neelsena)<br />
Barwienie Ziehl-Neelsena powinno być wykonywane na zlecenie lekarza.<br />
Przygotowanie barwionego w ten sposób preparatu zaleca się także, gdy w ropie<br />
nie są widoczne bakterie lub gdy w barwieniu metodą Grama obserwuje się<br />
,,maczugowcowe’’,słabo Gram-dodatnie pałeczki. Obecność prątków gruźlicy<br />
należy podejrzewać zwłaszcza w ropnym wysięku z jamy opłucnej, stawów, ropni<br />
kości lub węzłów chłonnych. Niegruźlicze (tak zwane atypowe) kwasoop<strong>or</strong>ne<br />
prątki znajdowane są także w ropniach pośladków, w miejscu głębokiej iniekcji<br />
domięśniowej. Takie ropnie wywołane są często przez szybko rosnące prątki<br />
należące do grupy Mycobacterium f<strong>or</strong>tuitum-chelonei. W tropikach wydzielina<br />
zeskrobana z podstawy martwiczego owrzodzenia skóry zlokalizowanego na<br />
nodze lub ramieniu może wykazywać obecność wolno rosnących prątków<br />
106
CZE˛ŚĆ I<br />
kwasoop<strong>or</strong>nych M. ulcerans (owrzodzenie Buruli). M. marinum jest innym<br />
gruźliczopodobnym prątkiem, który może być izolowany z przewlekłych,<br />
wrzodziejących zmian guzkowych na rękach, ramionach i innych eksponowanych<br />
powierzchniach skóry u pływaków i rybaków.<br />
Hodowla<br />
Jeśli w badaniu mikroskopowym widoczne są bakterie lub grzyby, materiał należy<br />
posiać na odpowiednie podłoża. Niezależnie od wyników badania mikroskopowego,<br />
wszystkie próbki ropy lub wysięków powinny być posiewane na co<br />
najmniej trzy podłoża hodowlane:<br />
– agar z krwią do izolacji gronkowców i paci<strong>or</strong>kowców;<br />
– agar MacConkeya do izolacji Gram-ujemnych pałeczek;<br />
– podłoże płynne, które może posłużyć jako podłoże wzbogacone zarówno dla<br />
tlenowców, jak i beztlenowców, np. podłoże tioglikolanowe lub bulion<br />
z wyciągiem mięsnym.<br />
Objętość inoculum powinna być uzależniona od wyniku badania mikroskopowego<br />
i waha się od jednego oczka ezy do kilku kropel. Jeśli w barwieniu metodą Grama<br />
widoczne są liczne mikro<strong>or</strong>ganizmy, próbka powinna przed posianiem zostać<br />
rozcieńczona w małej ilości sterylnego podłoża płynnego. Jeśli do posiewu<br />
używana jest wymazówka, materiał należy nanieść na niewielki obszar płytki,<br />
a następnie rozsiać ezą na pozostałej powierzchni. Jeśli wymazówka jest sucha<br />
należy jąnajpierw zwilżyć małą ilością sterylnego bulionu lub fizjologicznego<br />
roztw<strong>or</strong>u soli. W każdym przypadku technika posiewu powinna umożliwić<br />
uzyskanie pojedynczych kolonii do identyfikacji i antybiogramu.<br />
Przed posiewem płytkę zawierającą agar z krwią należy suszyć w cieplarce przez<br />
20 minut, minimalizując w ten sposób ryzyko przerośnięcia przez rozprzestrzeniający<br />
się Proteus spp. Posiane płytki powinny być inkubowane w 35°C<br />
w eksykat<strong>or</strong>ze. Rutynowo podłoża należy inkubować dwa dni i obserwować<br />
codziennie wzrost. Jeśli prowadzona jest hodowla mikro<strong>or</strong>ganizmów o wysokich<br />
wymaganiach odżywczych, konieczna będzie dłuższa inkubacja (1 – 2 tygodnie<br />
lub więcej). Jeśli wzrost pojawia się na podłożu płynnym, należy wykonać<br />
preparat barwiony metodą Grama i hodowle przesiać na odpowiednie podłoża. Na<br />
zlecenie lub jeśli na taką konieczność wskazuje wynik badania mikroskopowego,<br />
można zastosować specjalne dodatkowe podłoża hodowlane:<br />
• Jeśli uwidoczniono gronkowce, pomocny w uzyskaniu czystego wzrostu<br />
i wstępnego rozróżnienia między S. aureus i innymi ziarenkowcami jest agar<br />
z mannitolem.<br />
• Jeśli zaobserwowano paci<strong>or</strong>kowce, ich identyfikacja może być przyspieszona<br />
przez umieszczenie na linii pierwszego posiewu różnicującego krążka z bacytracyną.<br />
• Jeśli zaobserwowano drożdże lub grzyby, próbka powinna być także wsiana do<br />
dwóch probówek z agarem Sabouraud, jedna do inkubacji w 35°C, druga<br />
w temperaturze pokojowej, obydwie obserwowane przez miesiąc (do izolacji<br />
Candida spp. wystarczy agar z krwią).<br />
• Jeśli w preparacie barwionym metodą Ziehl-Neelsena uwidoczniono kwasoop<strong>or</strong>ne<br />
prątki, materiał należy posiać do 3 probówek z podłożem Löwensteina-<br />
-Jensena. Próbkę zawierającą również niekwasoop<strong>or</strong>ne prątki przed posiewem<br />
należy dekontaminować. Szybko rosnące bakterie, takie jak M. f<strong>or</strong>tuitum,<br />
mogą ginąć w procesie dekontaminacji; wyrastają one na agarze z krwią<br />
i agarze MacConkeya w ciągu 3 – 7 dni. Rozgałęzione, nitkowate, częściowo<br />
107
ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE<br />
kwasoop<strong>or</strong>ne pałeczki w ropie z jamy opłucnej lub z ropnia mózgu, które<br />
wyrastają na agarze z krwią w ciągu kilku dni, to prawdopodobnie Nocardia<br />
asteroides.<br />
• Ropa od pacjentów z zapaleniem stawów, zapaleniem opłucnej, zapaleniem kości<br />
lub tkanki podskórnej, zwłaszcza od dzieci do 5 roku życia, powinna być także<br />
posiana na płytkę z agarem czekoladowym w celu wykrycia H. influenzae.<br />
• Hodowla w ściśle beztlenowych warunkach jest istotna, gdy w preparacie<br />
barwionym metodą Grama obecna jest mieszana fl<strong>or</strong>a beztlenowa lub gdy<br />
próbka charakteryzuje się typowym zgniłym zapachem. Hodowla na agarze<br />
z krwią w warunkach beztlenowych jest konieczna do uzyskania wzrostu<br />
Actinomyces. Posiew w kierunku beztlenowców prowadzony jest również na<br />
zlecenie klinicysty, który podejrzewa zg<strong>or</strong>zel gazową. Metody diagnostyki<br />
w zakażeniach bakteriami beztlenowymi opisano na str. 113 – 118.<br />
Identyfikacja<br />
Z wyjątkiem zanieczyszczeń ze środowiska lub ze skóry (takich jak Staphylococcus<br />
epidermidis) wszystkie drobnoustroje izolowane z ran, ropy lub wysięków<br />
powinny być traktowane jako znaczące i należy je zidentyfikować. Pełna<br />
identyfikacja nie zawsze jest konieczna, zwłaszcza w przypadku fl<strong>or</strong>y mieszanej.<br />
Bakterie i grzyby izolowane z ropy i wysięków mogą należeć do prawie każdej<br />
grupy lub gatunku. Zostaną tu podane tylko zasady identyfikacji gronkowców,<br />
często związanych z procesami ropnymi (ropotwórczych) i dwóch innych<br />
patogenów, Pasteurella multocida i Bacillus anthracis, rzadko izolowanych z ran<br />
lub zakażeń skóry, ale bardzo istotnych ze względu na sposób postępowania<br />
z pacjentem. W standardowych podręcznikach mikrobiologii klinicznej można<br />
znaleźć pełny opis metod identyfikacji. W każdym przypadku pierwszym etapem<br />
powinno być uważne badanie dobrze odgraniczonych kolonii, pobranie pojedynczej<br />
kolonii każdego typu, przygotowanie preparatu barwionego metodą Grama<br />
i obserwacja mikro<strong>or</strong>ganizmów pod mikroskopem.<br />
Gronkowce<br />
Gronkowce są bakteriami najczęściej związanymi z wytwarzaniem ropy. Rosną<br />
dobrze w warunkach tlenowych na agarze z krwią ipocałonocnej inkubacji<br />
wytwarzają nieprzezroczyste białe lub kremowe kolonie o średnicy 1 – 2 mm. Jako<br />
jedyne rosną na podłożu z dużym stężeniem soli, takim jak MSA. Mogą być<br />
różnicowane z paci<strong>or</strong>kowcami na podstawie m<strong>or</strong>fologii i zdolności wytwarzania<br />
katalazy. Wytwarzanie katalazy można wykazać przez dodanie kropli 3%<br />
nadtlenku wod<strong>or</strong>u do kolonii umieszczonych na czystym szkiełku. Pojawienie się<br />
pęcherzyków tlenu jest wskaźnikiem produkcji katalazy.<br />
Dla potrzeb klinicznych gronkowce można podzielić na takie, które wytwarzają<br />
koagulazę, i takie, które jej nie wytwarzają. Koagulazododatnie gronkowce należą<br />
do S. aureus, gatunku o największym znaczeniu klinicznym. Spośród wielu<br />
koagulazoujemnych szczepów zostaną tu omówione tylko dwa — S. epidermidis<br />
i S. saprophyticus.<br />
Mimo że S. aureus należy do komensalnej fl<strong>or</strong>y mikrobiologicznej nosa (40%<br />
zdrowych d<strong>or</strong>osłych to nosiciele), skóry i przewodu pokarmowego, szczepy tego<br />
108
CZE˛ŚĆ I<br />
gatunku są odpowiedzialne za liszajec, czyraki, ropnie, zakażenia ran, zakażenia<br />
owrzodzeń i oparzeń, zapalenie szpiku, zapalenie gruczołu sutkowego (ropień<br />
piersi), ropniak opłucnej, ropne zapalenie mięśnia, zespół szoku toksycznego<br />
i inne typy ropnych zakażeń.<br />
S. epidermidis jest również częstym komensalem skóry, nosa i innych błon<br />
śluzowych, wykazuje niską ch<strong>or</strong>obotwórczość. Jednakże jego obecność w ropie<br />
nie zawsze powinna być lekceważona i uznawana za zanieczyszczenie ze skóry.<br />
Mimo niskiej infekcyjności S. epidermidis może wywoływać zakażenia skórne<br />
w miejscu wprowadzenia cewnika założonego na stałe, wenflonu lub innych ciał<br />
obcych. Zakażenia S. epidermidis, uciążliwe zwłaszcza w kardiochirurgii i w chirurgii<br />
<strong>or</strong>topedycznej, związane są z wszczepianiem protez (sztuczne zastawki<br />
serca lub protezy bioder).<br />
S. saprophyticus jest częstą przyczyną zakażeń dróg moczowych u młodych<br />
kobiet, zajmując w niektórych populacjach drugą pozycję po E. coli.<br />
Cechy różnicujące trzy główne gatunki Staphylococcus podane są w tabeli 22.<br />
Schemat wstępnej identyfikacji gronkowców przedstawiono na rycinie 10.<br />
Gram-dodatnie ziarenkowce<br />
w nieregularnych skupiskach<br />
nie wykazuja˛ce ruchu, nie tw<strong>or</strong>za˛ce sp<strong>or</strong>,<br />
tlenowe lub względnie beztlenowe,<br />
katalazododatnie, zwykle oksydazoujemne,<br />
fermentuja˛ce cukry<br />
▼<br />
Koagulaza<br />
+ –<br />
Staphylococcus<br />
aureus<br />
Kwas<br />
▼<br />
Agar z trehaloza˛,<br />
mannitolem<br />
i fosfataza˛<br />
▼<br />
Fosfataza<br />
alkaliczna<br />
+ –<br />
Staphylococcus<br />
schleiferi<br />
▼<br />
Op<strong>or</strong>ne na<br />
nowobiocynę<br />
Bez kwasu<br />
Staphylococcus<br />
epidermidis<br />
+ –<br />
Staphylococcus<br />
saprophyticus<br />
▼<br />
Dekarboksylaza<br />
<strong>or</strong>nityny<br />
– +<br />
Ureaza<br />
– +<br />
Hemoliza<br />
– +<br />
▼<br />
Staphylococcus<br />
warneri/hominis<br />
▼<br />
Staphylococcus<br />
lugdunensis<br />
Staphylococcus<br />
koagulazoujemne<br />
Staphylococcus<br />
haemolyticus<br />
Ryc. 10. Schemat wstępnej identyfikacji gatunku Staphylococcus.<br />
109
ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE<br />
Tabela 22. Różnicowanie klinicznie ważnych szczepów Staphylococcus<br />
S. aureus S. epidermidis S. saprophyticus<br />
Wytwarzanie koagulazy Tak Nie Nie<br />
Rozkład mannitolu Kwaśny (żółty) Obojętny (czerwony)<br />
Kwaśny (żółty)<br />
Pigmentacja kolonii a Szare, kremowe Białe<br />
Białe<br />
lub żółte<br />
Wrażliwość in vitro na nowobiocynę<br />
Wrażliwy Wrażliwy Op<strong>or</strong>ny b<br />
Agar z DNaza˛ Tak Nie Nie<br />
a<br />
Występuja˛ wyja˛tki.<br />
b<br />
Strefa zahamowania mniejsza niż 16 mm, w standaryzowanym teście dyfuzyjno-kra˛żkowym<br />
z 5-mikrogramowym kra˛żkiem.<br />
Ze względu na znaczenie testu koagulazowego w identyfikacji S. aureus, został on<br />
tutaj szczegółowo opisany. Koagulaza jest enzymem powodującym krzepnięcie<br />
osocza krwi. Gronkowcowa koagulaza występuje w dwóch f<strong>or</strong>mach: związanej<br />
koagulazy lub inaczej czynnika aglutynującego (clumping fact<strong>or</strong>), który wykrywany<br />
jest w teście szkiełkowym, <strong>or</strong>az wolnej koagulazy, wykrywanej w teście<br />
probówkowym.<br />
• Test szkiełkowy. Na czystym szkiełku utw<strong>or</strong>zyć zawiesinę z jednej lub kilku<br />
kolonii gronkowców i kropli fizjologicznego roztw<strong>or</strong>u soli. Zawiesina powinna<br />
być dość gęsta. Zanurzyć czystą ezę w osoczu i użyć jej do wymieszania osocza<br />
z zawiesiną bakterii. Obserwować tw<strong>or</strong>zenie się kłaczków przez 10 sekund.<br />
Fałszywie ujemne wyniki testu szkiełkowego pojawiają się w przypadku około<br />
10% szczepów S. aureus. Jeśli test szkiełkowy jest ujemny dla izolatu, który<br />
wydaje się patogenny na innej podstawie (pigment, inf<strong>or</strong>macje kliniczne),<br />
należy zbadać szczep w teście probówkowym.<br />
• Test probówkowy. Umieścić kilka kropel (0,5 ml) osocza w sterylnej probówce<br />
12 × 75 mm i dodać dwie krople czystej hodowli w bulionie. Zawiesinę<br />
o p<strong>or</strong>ównywalnej gęstości można także przygotować bezpośrednio z kolonii<br />
pobranych z agaru z krwią. Inkubować probówki w 35°C przez 4 – 18 godzin,<br />
a następnie obserwować obecność skrzepu.<br />
Osocze używane w teście koagulazowym może być świeżym ludzkim lub<br />
króliczym osoczem z kwasem etylenodiaminotetraoctowym (EDTA). Powinno<br />
być przechowywane w niewielkich p<strong>or</strong>cjach (1 ml) w chłodziarce, a jego przydatność<br />
należy kontrolować równolegle z hodowlami S. aureus i S. epidermidis.<br />
Pasteurella multocida<br />
Pasteurella multocida to Gram-ujemne pałeczki najczęściej odpowiedzialne za<br />
ciężkie zakażenia u ludzi, występujące po ugryzieniach przez zwierzęta. Bakteria<br />
ta jest komensalem wchodzącym w skład n<strong>or</strong>malnej fl<strong>or</strong>y jamy ustnej wielu<br />
zwierząt. Rany po ugryzieniach zakażone P. multocida mogą dawać objawy<br />
rozległego zapalenia tkanki podskórnej, które może przebiegać z zajęciem<br />
stawów. Opisywano także zapalenia szpiku, bakteriemie, a nawet zapalenia opon<br />
mózgowo-rdzeniowych.<br />
P. multocida powinna być poszukiwana zwłaszcza w wydzielinie z ran powstałych<br />
po ugryzieniu przez zwierzę. Jest bardzo małą, Gram-ujemną, nieruchliwą<br />
ziarenko-pałeczką. Rośnie dobrze na agarze z krwią w35°C, ale wzrost ulega<br />
całkowitemu zahamowaniu w obecności soli żółciowych, zawartych w podłożach<br />
110
CZE˛ŚĆ I<br />
selektywnych do hodowli bakterii jelitowych, np. agar MacConkeya. Po całonocnej<br />
inkubacji kolonie na agarze z krwią są małe, niehemolizujące, półprzezroczyste<br />
i śluzowe (dzięki obecności otoczki w f<strong>or</strong>mie wirulentnej).<br />
Biochemiczna identyfikacja oparta jest na następujących cechach:<br />
– fermentacja glukozy bez gazu; P. multocida rośnie na agarze Kliglera<br />
z zakwaszeniem słupka;<br />
– test oksydazowy jest słabo dodatni;<br />
– test na wytwarzanie katalazy dodatni;<br />
– redukcja azotanu do azotynu (0,1% azotan potasu w bulionie odżywczym);<br />
– test na wytwarzanie ureazy ujemny;<br />
– wytwarzanie indolu — test w bulionie tryptozowo-sojowym (TSB) lub MIU po<br />
48 godzinach inkubacji;<br />
– wysoka wrażliwość na benzylopenicylinę w krążkowym teście wrażliwości.<br />
Bacillus anthracis<br />
Do rodzaju Bacillus należą liczne gatunki tlenowych, tw<strong>or</strong>zących sp<strong>or</strong>y, Gram-<br />
-dodatnich laseczek, powszechnie występujących w glebie. Gatunek B. anthracis<br />
wywołuje ważne dla zdrowia publicznego zakażenia skóry. Inne gatunki<br />
izolowane z ran lub ropy są zwykle zanieczyszczeniem lub w większości<br />
mikro<strong>or</strong>ganizmami op<strong>or</strong>tunistycznymi.<br />
B. anthracis jest znaczącym patogenem bydła, owiec, kóz i innych domowych<br />
zwierząt. Zakażenie występuje także u dzikich zwierząt. Wąglik może zakażać<br />
człowieka, a przypadki infekcji występują zwłaszcza w Afryce i Azji u osób<br />
pracujących i żyjących w bliskim kontakcie z żywym inwentarzem. Do zakażenia<br />
ludzi może dojść również przez produkty odzwierzęce, zawierające sp<strong>or</strong>y<br />
wąglika, takie jak: wełna, skóry, futro i kości.<br />
Najczęstszą postacią zakażenia ludzi jest wąglik skórny, z którego może rozwinąć<br />
się sepsa i zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych. Sp<strong>or</strong>y przechodzą przez<br />
uszkodzoną skórę i wytwarzają zmianę pęcherzykową z martwiczym centrum,<br />
otoczoną przez rozległy obrzęk (,,czarna krosta’’). W preparatach sp<strong>or</strong>ządzonych<br />
zpłynu pęcherzykowego widoczne są duże Gram-dodatnie, kwadratowo zakończone,<br />
otoczkowe pałeczki bez sp<strong>or</strong>.<br />
B. anthracis rośnie w warunkach tlenowych. Na agarze z krwią wytwarza duże,<br />
płaskie, szarawe kolonie, do 5 mm średnicy, o nieregularnych brzegach i sz<strong>or</strong>stkiej,<br />
przypominającej kłębowisko nici strukturze powierzchni (głowa Meduzy).<br />
Na tym etapie ważne jest różnicowanie wysoce patogennych B. anthracis od<br />
ogólnie niech<strong>or</strong>obotwórczych gatunków saprofitycznych.<br />
Wstępne różnicowanie powinno być oparte na takich cechach, jak: brak hemolizy,<br />
wrażliwość na benzylopenicylinę <strong>or</strong>az brak ruchu u B. anthracis. Saprofityczne<br />
gatunki Bacillus wykazują ruch i są silnie hemolityczne. Powyższe<br />
trzy cechy mogą stanowić podstawę wstępnej identyfikacji. W celu przeprowadzenia<br />
ostatecznej identyfikacji czyste hodowle izolatów należy przesłać<br />
niezwłocznie do centralnego lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium weterynaryjnego lub innego referencyjnego<br />
ośrodka.<br />
B. anthracis jest wysoce zakaźnym drobnoustrojem, z tego względu próbki<br />
i hodowle powinny być przesyłane ze szczególnym zachowaniem zasad ostrożności,<br />
aby uniknąć skażenia środowiska i zakażeń personelu <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>go.<br />
111
ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE<br />
Badanie lekowrażliwości<br />
Zastosowanie antybiotyków w leczeniu pacjentów z ranami, ropniami lub<br />
wysiękami nie zawsze jest konieczne. Odpowiednie chirurgiczne nacięcie, drenaż<br />
i opracowanie rany są najczęściej ważniejsze niż antybiotykoterapia.<br />
Wynik antybiogramu powinien być dostępny w ciągu 48 godzin od otrzymania<br />
próbki.<br />
Rutynowo badanie lekowrażliwości nie powinno być wykonywane dla bakterii<br />
o znanej wrażliwości, takich jak paci<strong>or</strong>kowce, Pasteurella i Actinomyces, które<br />
w większości są wrażliwe na benzylopenicyliny.<br />
W przypadku Enterobacteriaceae, niefermentujących Gram-ujemnych pałeczek<br />
i gronkowców, lekowrażliwość należy określić z zastosowaniem testu dyfuzyjno-<br />
-krążkowego dla aktualnie zalecanych antybiotyków. Wrażliwość na nowe<br />
i drogie antybiotyki powinna być oznaczana (lub rap<strong>or</strong>towana) tylko na specjalne<br />
zlecenie lub gdy szczep wykazuje op<strong>or</strong>ność na inne leki przeciwbakteryjne.<br />
Problem stanowi lekoop<strong>or</strong>ność, zarówno S. aureus, jak i S. epidermidis. Ponad<br />
80% szczepów, także pozaszpitalnych, wytwarza β-laktamazy i wykazuje<br />
op<strong>or</strong>ność na benzylopenicylinę i ampicylinę. Zakażenia wywołane przez szczepy<br />
op<strong>or</strong>ne na benzylopenicylinę są często leczone stabilnymi wobec β-laktamaz<br />
penicylinami z grupy metycyliny (oksacylina, kloksacylina itp.). W antybiogramie<br />
zalecane jest użycie krążka z oksacyliną (1 µg). Krążki z oksacyliną są<br />
stabilne i skutecznie wykrywają op<strong>or</strong>ność na całą grupę (szczepy op<strong>or</strong>ne na<br />
wszystkie antybiotyki β-laktamowe określane są jako oksacylino- lub metycylinoop<strong>or</strong>ne,<br />
tzw. MR — przyp. tłum.). Op<strong>or</strong>ność ma często charakter heterogenny, np.<br />
obejmuje tylko część populacji bakterii. Niejedn<strong>or</strong>odna op<strong>or</strong>ność gronkowców<br />
jest łatwiej identyfikowana w niskich temperaturach, z tego powodu temperatura<br />
inkubacji nie powinna przekraczać 35°C. Szczepy o heterogennej op<strong>or</strong>ności<br />
w strefie zahamowania wzrostu wokół krążka, wykazują mgławicowy wzrost lub<br />
tw<strong>or</strong>zą liczne drobne kolonie, które często bywają traktowane jako zanieczyszczenie.<br />
Jeśli pojawia się taki wzrost, konieczne jest przygotowanie preparatu<br />
barwionego metodą Grama w celu wykluczenia zanieczyszczenia.<br />
Heteroop<strong>or</strong>ne szczepy są klinicznie op<strong>or</strong>ne na wszystkie antybiotyki β-laktamowe,<br />
w tym penicyliny, cefalosp<strong>or</strong>yny i karbapenemy. Z tego powodu dla<br />
gronkowców nie należy oznaczać wrażliwości na cefalosp<strong>or</strong>yny. Istnieje także<br />
pełna krzyżowa op<strong>or</strong>ność między benzylopenicyliną i ampicyliną. Nie należy<br />
więc określać wrażliwości gronkowców na ampicylinę.<br />
112
Zakażenia bakteriami beztlenowymi<br />
Wprowadzenie<br />
W niniejszym opracowaniu opisane są bakterie beztlenowe i najczęściej wywoływane<br />
przez nie infekcje. Zakażenia beztlenowcami mogą dotyczyć praktycznie<br />
każdej tkanki i mogą być zlokalizowane w każdym miejscu, jeśli zaistnieją<br />
odpowiednie warunki.<br />
Większość zakażeń bakteriami beztlenowymi wywołana jest przez endogenne<br />
szczepy, które w stanie zdrowia wchodzą w skład n<strong>or</strong>malnej fl<strong>or</strong>y ciała,<br />
wywołując infekcje w przypadku zakłócenia równowagi w ilościowym składzie<br />
fl<strong>or</strong>y fizjologicznej lub w wyniku przemieszczenia się bakterii do innego<br />
regionu anatomicznego. Egzogenne bakterie beztlenowe, najczęściej Clostridium<br />
tetani, C. botulinum, rzadziej C. perfringens <strong>or</strong>az inne gatunki laseczek,<br />
mogą zakażać rany i są przyczyną odpowiednio tężca, botulizmu<br />
przyrannego lub zg<strong>or</strong>zeli gazowej. Ropień, który może być zlokalizowany<br />
praktycznie w każdym narządzie, bakteriemia, zapalenie jamy otrzewnej, ropniak<br />
opłucnej, zapalenie tkanki podskórnej i zapalenie wyrostka robaczkowego to<br />
tylko kilka przykładów ch<strong>or</strong>ób, w których bardzo ważną rolę odgrywają bakterie<br />
beztlenowe. W związku z powyższym, ważne jest, aby mikrobiolog wiedział,<br />
kiedy i jak należy prowadzić hodowle w kierunku bakterii beztlenowych<br />
z określonej próbki klinicznej.<br />
Podział bakterii ze względu na wymagania<br />
tlenowe<br />
Być może zbyt uproszczony, lecz dobrze funkcjonujący podział bakterii o znaczeniu<br />
klinicznym oparty jest na wymaganiach tlenowych i wyróżnia:<br />
• Bezwzględnie tlenowe bakterie wymagające do uzyskania energii tlenu gazowego;<br />
nie rosną przy braku tlenu. Przykładami bezwzględnych tlenowców są:<br />
Micrococcus spp. i Nocardia asteroides.<br />
• Bezwzględnie beztlenowe bakterie prowadzące przemiany metaboliczne<br />
bez udziału tlenu, który dla wielu z nich jest toksyczny. Energię uzyskują<br />
w reakcjach fermentacji, z wytw<strong>or</strong>zeniem cuchnących produktów<br />
końcowych. Przykładami mikro<strong>or</strong>ganizmów należących do tej grupy są<br />
takie bakterie beztlenowe, jak Bacteroides fragilis i Peptostreptococcus<br />
magnus.<br />
• Względnie beztlenowe bakterie, które do wzrostu i wytwarzania energii nie<br />
wymagają bezwzględnie tlenu; mogą zarówno wyk<strong>or</strong>zystywać tlen, jak i rosnąć<br />
w warunkach beztlenowych. Są najbardziej rozpowszechnione, zwykle adaptują<br />
się do środowiska, uzyskując energię potrzebną do wzrostu i namnażania<br />
najbardziej efektywnym sposobem. Przykładami względnie beztlenowych<br />
bakterii są E. coli i S. aureus.<br />
Oprócz wyżej wymienionych istnieją bakterie mikroaerofilne, które najlepiej<br />
rosną w atmosferze z obniżonym stężeniem tlenu. Przykładem bakterii mikroaerofilnej<br />
jest Campylobacter jejuni.<br />
113
ZAKAŻENIA BAKTERIAMI BEZTLENOWYMI<br />
Diagnostyka zakażeń bakteriami<br />
beztlenowymi<br />
Za blisko 80% diagnozowanych zakażeń beztlenowych odpowiedzialne są cztery<br />
największe grupy beztlenowców. Należą do nich: Bacteroides, Prevotella<br />
i P<strong>or</strong>phyromonas spp., Peptostreptococcus spp. <strong>or</strong>az Clostridium spp. Najczęściej<br />
spotykane gatunki z każdego rodzaju to: Bacteroides fragilis, Peptostreptococcus<br />
magnus i Clostridium perfringens. Specyficzne metody izolacji i identyfikacji<br />
tych trzech rodzajów i gatunków powinny służyć jako model izolacji i wstępnej<br />
identyfikacji innych klinicznie ważnych bakterii beztlenowych.<br />
Pobieranie próbek i transp<strong>or</strong>t do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
Procedury pobierania materiału zostały opisane we wcześniejszych rozdziałach.<br />
Ponieważ beztlenowce są bardzo wrażliwe na tlen atmosferyczny i wysychanie,<br />
przy pobieraniu próbek należy unikać stosowania zwykłych wymazówek. Próbki<br />
do hodowli beztlenowców należy uważnie pobierać z miejsca aktywnej infekcji.<br />
W niektórych przypadkach może być konieczna pomoc chirurga. Dotyczy to<br />
szczególnie aspiracji ropy, pobierania tkanek i/lub próbek ropy z zakażonych ran,<br />
ropniaków lub drążących ropni.<br />
Próbkę należy umieścić w sterylnym, szczelnie zamkniętym pojemniku lub, jeśli<br />
to niemożliwe, niezwłocznie przesłać do lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium cały zaaspirowany materiał<br />
w strzykawce, z igłą osłoniętą zatyczką lub gumowym k<strong>or</strong>kiem.<br />
Przygotowanie warunków beztlenowych<br />
do inkubacji hodowli<br />
Istnieją różne metody wytwarzania środowiska beztlenowego. Jedną z nich, prostą<br />
i niedrogą, jest użycie anaerostatu z cienkiego szkła lub poliwęglanu o objętości<br />
2,5 – 3,5 litrów, wyposażonego w nieprzepuszczającą powietrza pokrywę, którą<br />
można łatwo usunąć czy wymienić. Powłożeniu płytek Petriego w anaerostacie<br />
należy umieścić komercyjnie dostępne, jedn<strong>or</strong>azowe saszetki wytwarzające<br />
beztlenową atmosferę i zamknąć pokrywę. Jedn<strong>or</strong>azowe saszetki wytwarzające<br />
warunki beztlenowe mają f<strong>or</strong>mę płaskich, zapieczętowanych kopert, które po<br />
dodaniu wody (lub bez — przyp. tłum.) uwalniają wodór i dwutlenek węgla.<br />
Opisane zestawy wymagają katalizat<strong>or</strong>a palladowego przytwierdzonego do spodu<br />
pokrywy słoja. Podczas używania katalizat<strong>or</strong> ulega inaktywacji i wymaga<br />
wymiany w regularnych, zalecanych przez producenta odstępach czasu. Jedn<strong>or</strong>azowe<br />
paski wskaźnikowe redox, które w warunkach beztlenowych zmieniają<br />
kol<strong>or</strong> z niebieskiego (lub czerwonego) na bezbarwny, są szeroko dostępne<br />
komercyjnie.<br />
Probówki z płynnym podłożem do hodowli bakterii beztlenowych, takim jak<br />
podłoże tioglikolanowe lub bulion z wyciągiem mięsnym, nie muszą być<br />
inkubowane w beztlenowych warunkach, ponieważ wchodzące w ich skład<br />
substancje wytwarzają środowisko beztlenowe. Jeśli objętość podłoża jest<br />
wystarczająca (10 – 12 ml w probówce o standardowej średnicy 15 mm) i jest ono<br />
świeżo przygotowane, warunki beztlenowe uzyskuje się w dolnej części probówki.<br />
Nie zużyte w dniu przygotowania podłoża powinny być zregenerowane przez<br />
114
CZE˛ŚĆ I<br />
15-minutowe ogrzewanie w łaźni wodnej probówek z poluzowaną zakrętką,<br />
w celu wyeliminowania rozpuszczonego tlenu; po ogrzaniu należy dokręcić<br />
nakrętkę i pozostawić do wystygnięcia.<br />
Podłoża do hodowli bakterii beztlenowych<br />
Hodowle w kierunku bakterii beztlenowych powinny być prowadzone na zlecenie<br />
lekarza, jeśli próbka ma cuchnący zapach lub jeśli wyniki barwienia metodą<br />
Grama sugerują obecność beztlenowych mikro<strong>or</strong>ganizmów, np.: obecność mieszanej,<br />
polim<strong>or</strong>ficznej fl<strong>or</strong>y Gram-dodatnich <strong>or</strong>az Gram-ujemnych pałeczek<br />
i ziarenkowców, obecność Gram-ujemnych wrzecionowców lub kwadratowo<br />
zakończonych cienkich Gram-dodatnich laseczek, które mogą wskazywać na<br />
Clostridium.<br />
Badań w kierunku bakterii beztlenowych rutynowo nie należy wykonywać<br />
w przypadku próbek moczu, wydzielin z narządów płciowych, kału lub odkrztuszonej<br />
plwociny. Obecność bakterii beztlenowych w tych próbkach wskazuje<br />
na zanieczyszczenie komensalną fl<strong>or</strong>ą fizjologiczną, właściwą dla miejsca<br />
pochodzenia próbki. Klinicyści powinni zostać poinf<strong>or</strong>mowani, że próbki<br />
zawierające fl<strong>or</strong>ę fizjologiczną nie nadają się do hodowli beztlenowych, z wyjątkiem<br />
ważnych wskazań klinicznych.<br />
Zwykły agar z krwią jest dobrym podłożem stałym do izolacji najważniejszych<br />
patogenów beztlenowych. Dla bardziej wymagających gatunków zalecany jest<br />
agar z krwią wzbogacony w czynniki wzrostu (hemina i menadion). Takie podłoża<br />
są komercyjnie dostępne jako agar beztlenowy Wilkins-Chalgrena.<br />
Bakterie beztlenowe często są częścią złożonej mikrofl<strong>or</strong>y zawierającej także<br />
drobnoustroje tlenowe, stąd należy przygotować selektywny agar do hodowli<br />
beztlenowców, dodając jeden lub więcej specyficznych czynników hamujących<br />
wzrost bakterii tlenowych. Na przykład dodanie aminoglikozydu (neomycyna,<br />
kanamycyna) w końcowym stężeniu 50 µg/ml hamuje wzrost większości<br />
tlenowych i względnie beztlenowych bakterii. Roztwór aminoglikozydu przygotowywany<br />
jest przez rozpuszczenie 500 mg w 100 ml wody destylowanej. Na<br />
100 ml podłoża agarowego do hodowli beztlenowców, po ostudzeniu do 56°C,<br />
należy dodać aseptycznie 5 ml odwłóknionej krwi i 1 ml roztw<strong>or</strong>u antybiotyku.<br />
Dobrze wymieszać i rozlać po 15 – 18 ml do sterylnych płytek Petriego. Płytki<br />
powinny zostać jak najszybciej zużyte lub przechowywane w chłodziarce,<br />
najlepiej w plastikowym w<strong>or</strong>eczku lub rękawie.<br />
Procedury posiewu i izolacji<br />
Przy podejrzeniu zakażenia bakteriami beztlenowymi próbki należy niezwłocznie<br />
posiać na jedno z poniższych podłoży:<br />
– agar do hodowli beztlenowców do inkubacji w anaerostacie;<br />
– agar do hodowli beztlenowców do inkubacji w eksykat<strong>or</strong>ze;<br />
– agar MacConkeya;<br />
– podłoże płynne do hodowli beztlenowców (z tioglikolanem lub wyciągiem<br />
mięsnym).<br />
Hodowle w kierunku bakterii tlenowych należy zakładać zgodnie z obowiązującą<br />
procedurą, arównoległe posiewy tlenowe materiału przeglądać po 24 i 48 godzi-<br />
115
ZAKAŻENIA BAKTERIAMI BEZTLENOWYMI<br />
nach inkubacji. Na niewielką powierzchnię płytki z podłożem dla bakterii<br />
beztlenowych nałożyć badany materiał i rozsiać go za pomocą ezy. Płytki należy<br />
umieścić w anaerostacie i odczytać po 48 godzinach inkubacji. Jeśli wzrost nie jest<br />
wystarczający, konieczna jest dalsza inkubacja przez 24 – 48 godzin. Hodowle na<br />
podłożach płynnych należy zakładać posiewając dużą objętość materiału za<br />
pomocą pipety Pasteura, tak by rozprowadzić inoculum wcałym podłożu.<br />
Po 48 godzinach należy skontrolować wzrost na agarze z krwią do hodowli<br />
beztlenowców i p<strong>or</strong>ównać ze wzrostem obserwowanym na podłożach do hodowli<br />
tlenowych. Z każdego typu kolonii należy wykonać preparat barwiony metodą<br />
Grama. Obserwowane w preparacie bakterie o tej samej m<strong>or</strong>fologii, które rosną<br />
zarówno na agarze tlenowym, jak i beztlenowym, to prawdopodobnie względne<br />
beztlenowce. Kolonie, które pojawiają się na agarze tylko w warunkach<br />
beztlenowych, to przypuszczalnie beztlenowce, które należy przesiać na dwa<br />
podłoża agarowe z krwią, jedno do inkubacji w anaerostacie, drugie w eksykat<strong>or</strong>ze.<br />
Jeżeli wzrost pojawi się tylko na podłożu inkubowanym w anaerostacie,<br />
prowadzić identyfikację czystej kolonii w kierunku bakterii beztlenowych.<br />
Jeśli obserwuje się wzrost w głębokich warstwach podłoża płynnego do hodowli<br />
beztlenowców, konieczny jest posiew na podłoża agarowe dla bakterii tlenowych<br />
i beztlenowych, z którymi należy postępować podobnie, jak w przypadku<br />
pierwszego posiewu. Jeżeli do podłoża płynnego wsiano dużą objętość ropy,<br />
wynik hodowli może być dodatni, przy jednoczesnym ujemnym wyniku posiewu<br />
na podłożach stałych.<br />
Identyfikacja klinicznie ważnych beztlenowców<br />
Grupa Bacteroides fragilis<br />
Grupa obejmuje kilka spokrewnionych gatunków należących do fizjologicznej<br />
fl<strong>or</strong>y jelit i pochwy. Często są one odpowiedzialne za mieszane zakażenia<br />
w obrębie jamy brzusznej i miednicy, mogą również wywoływać bakteriemię.<br />
B. fragilis jest nieruchliwą Gram-ujemną pałeczką, często wykazującą polim<strong>or</strong>fizm,<br />
która rośnie szybko na agarze do hodowli beztlenowców. Po 48 godzinach<br />
pojawiają się średniej wielkości (do 3 mm średnicy), półprzezroczyste, szarobiałe,<br />
niehemolizujące kolonie. Szybkiej identyfikacji można dokonać na podstawie<br />
testu z żółcią. Czysta kolonia badanego drobnoustroju posiewana jest głęboko do<br />
dwóch probówek z płynnym podłożem tioglikolanowym, z których jedna zawiera<br />
20% (2 ml w 10 ml) sterylnej żółci wołowej. Po 24 godzinach należy p<strong>or</strong>ównać<br />
wzrost w obu probówkach: wzrost B. fragilis jest wyraźnie stymulowany<br />
w bulionie z dodatkiem żółci.<br />
Clostridium perfringens<br />
Rodzaj Clostridium obejmuje wiele gatunków Gram-dodatnich, wytwarzających<br />
sp<strong>or</strong>y laseczek; niektóre z nich należą do n<strong>or</strong>malnej fl<strong>or</strong>y przewodu pokarmowego,<br />
inne występują w kurzu i glebie. Gatunkiem o największym znaczeniu<br />
klinicznym jest C. perfringens. Bakteria ta związana jest ze zg<strong>or</strong>zelą gazową,<br />
możerównież wywoływać bakteriemię lub inne poważne infekcje. W przeciwieństwie<br />
do pozostałych gatunków C. perfringens nie wykazuje zdolności ruchu i nie<br />
wytwarza sp<strong>or</strong> w zakażonych tkankach lub młodych hodowlach.<br />
116
CZE˛ŚĆ I<br />
C. perfringens rośnie szybko na płynnym podłożu do hodowli beztlenowców,<br />
wytwarzając duże ilości gazu. Na agarze beztlenowym po 48 godzinach<br />
obserwowane są średniej wielkości (2 – 3 mm) kolonie. Większość szczepów<br />
wytwarza podwójną strefę hemolizy: wewnętrzną strefę całkowitej hemolizy<br />
i zewnętrzną strefę hemolizy częściowej.<br />
Szybka identyfikacja jest możliwa na podstawie wyniku odwrotnego testu<br />
CAMP 1 , który przeprowadza się w poniżej opisany sposób (patrz ryc. 11) 2 :<br />
1. Przygotować płytkę z podłożem agarowym z dodatkiem 5% przepłukanej<br />
trisem krwi baraniej.<br />
2. Nałożyć czystą hodowlę Streptococcus agalactiae wzdłuż średnicy płytki.<br />
Posiać badaną hodowlę Clostridium prostopadle do linii posiewu S. agalactiae,<br />
nie dotykając jej.<br />
3. Inkubować w anaerostacie przez 24 godziny.<br />
C. perfringens tw<strong>or</strong>zy w miejscu skrzyżowania posiewów strefę widocznej<br />
hemolizy, kształtem przypominającą strzałę. Laseczki ujemne w odwrotnym<br />
teście CAMP mogą zostać opisane jako ,,Clostridium spp. nie-C. perfringens’’.<br />
Ryc. 11. Odwrotny test CAMP.<br />
Peptostreptococcus<br />
Niektóre gatunki bezwzględnie beztlenowych Gram-dodatnich ziarenkowców<br />
należą do komensalnej fl<strong>or</strong>y układu oddechowego, pokarmowego i moczowo-<br />
-płciowego. Wywołują, zwykle wraz z innymi tlenowymi i beztlenowymi<br />
bakteriami, ropnie, zakażenia ran, a nawet bakteriemię. Wzrost beztlenowych<br />
1<br />
Odwrotny test CAMP: nazwa pochodzi od nazwisk Christy, Adkins i Munch-Peterson, którzy<br />
pierwsi opisali tę reakcję u paci<strong>or</strong>kowców grupy B.<br />
2<br />
Hansen M.V., Elliot L.P.: New presumptive identification test f<strong>or</strong> Clostridium perfringens: reverse<br />
CAMP test. Journal of Clinical Microbiology, 1980, 12: 617 – 619.<br />
117
ZAKAŻENIA BAKTERIAMI BEZTLENOWYMI<br />
ziarenkowców na podłożach lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych zwykle jest wolniejszy niż wzrost<br />
Bacteroides i Clostridium, a kolonie na agarze z krwią pojawiają się nie wcześniej<br />
niż po 48 godzinach inkubacji.<br />
W rutynowej diagnostyce zakażeń beztlenowcami identyfikacja gatunków nie jest<br />
konieczna. Gram-dodatnie ziarenkowce, które nie rosną w warunkach tlenowych,<br />
a na agarze z krwią dla bakterii beztlenowych wytwarzają niewielkie, wypukłe,<br />
białe kolonie, mogą być z dużym prawdopodobieństwem uznane za Peptostreptococcus<br />
spp.<br />
Badanie wrażliwości na antybiotyki<br />
Antybiogram dla bakterii beztlenowych nie powinien być wykonywany rutynowo,<br />
ze względu na brak wiarygodności metody dyfuzyjno-krążkowej.<br />
Większość zakażeń wywołana jest przez wrażliwe na penicylinę bakterie,<br />
z wyjątkiem infekcji wywodzących się z przewodu pokarmowego lub pochwy.<br />
W zakażeniach takich zazwyczaj obecne są Bacteroides fragilis, które wytwarzając<br />
β-laktamazy są op<strong>or</strong>ne na penicyliny i większość cefalosp<strong>or</strong>yn. Lekiem<br />
z wyb<strong>or</strong>u w tych infekcjach jest klindamycyna, metronidazol lub chl<strong>or</strong>amfenikol.<br />
Aminoglikozydy i chinolony nie wykazują aktywności wobec beztlenowców, lecz<br />
mogą być stosowane z powodu aktywności wobec bakterii tlenowych, które<br />
często występują w zakażeniach mieszanych.<br />
118
Oznaczanie wrażliwości<br />
na antybiotyki<br />
Wprowadzenie<br />
W Genewie podczas spotkania z<strong>or</strong>ganizowanego w 1977 r. przez WHO 1<br />
wyrażono niepokój dotyczący obserwowanego na świecie narastania op<strong>or</strong>ności na<br />
antybiotyki, związanej z często nieograniczonym wzrostem stosowania antybiotyków<br />
zarówno u ludzi, jak i zwierząt. W ostatnich latach lekoop<strong>or</strong>ne bakterie<br />
były przyczyną kilku poważnych epidemii zakażeń o dużej śmiertelności.<br />
Doprowadziło to do potrzeby wprowadzenia krajowych i międzynarodowych<br />
programów kontroli monit<strong>or</strong>ujących antybiotykoop<strong>or</strong>ność bakterii na podstawie<br />
oceny lekowrażliwości z zastosowaniem wiarygodnych metod, które pozwoliłyby<br />
uzyskać p<strong>or</strong>ównywalne dane. Dostępność mikrobiologicznych i epidemiologicznych<br />
danych ułatwi klinicyście wybór możliwie najlepszego preparatu przeciwbakteryjnego<br />
w leczeniu zakażeń.<br />
Aby założenia te były skuteczne, należy odpowiednią, powtarzalną metodą<br />
przeprowadzić oznaczenia lekowrażliwości, której wyniki powinny mieć bezpośrednie<br />
zastosowanie kliniczne. Najwyższym kryterium wiarygodności każdej<br />
metody oznaczania wrażliwości jest k<strong>or</strong>elacja wyniku z odpowiedzią pacjenta na<br />
leczenie przeciwbakteryjne.<br />
Na spotkaniu WHO ustalono, że ze względu na prostotę i powtarzalność, zarówno<br />
dla celów klinicznych, jak i w monit<strong>or</strong>owaniu, zalecana jest zmodyfikowana<br />
metoda dyfuzyjno-krążkowa Kirby-Bauera 2 , dla której wymagania zostały ustalone<br />
przez WHO w 1976 r. Metoda jest szczególnie zalecana dla bakterii należących<br />
do rodziny Enterobacteriaceae, lecz może być stosowana również w przypadku<br />
wszystkich szybko rosnących patogenów. Metoda ta została także przystosowana<br />
dla najważniejszych klinicznie bakterii o wyższych wymaganiach odżywczych,<br />
z wyjątkiem ścisłych beztlenowców i mykobakterii. Jest rekomendowana,<br />
ponieważ poszczególne elementy testu są możliwe do wykonania przez pracowników<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium 3 .<br />
<strong>Podstawowe</strong> zasady oznaczania<br />
lekowrażliwości<br />
Testy wrażliwości na antybiotyki określają zdolność czynnika przeciwbakteryjnego<br />
do zahamowania wzrostu bakterii in vitro. Zdolność tę można oznaczyć<br />
zarówno metodą rozcieńczeń, jak i metodą dyfuzyjną.<br />
1<br />
Surveillance f<strong>or</strong> the prevention and control of health hazards due to antibiotic-resistant<br />
enterobacteria. Geneva, W<strong>or</strong>ld Health Organization, 1978 (WHO Technical Rep<strong>or</strong>t Series, No. 624).<br />
2<br />
WHO Expert Committee on Biological Standardization. Twenty-eighth rep<strong>or</strong>t. Geneva, W<strong>or</strong>ld<br />
Health Organization, 1977 (WHO Technical Rep<strong>or</strong>t Series, No. 610).<br />
3<br />
Metodą p<strong>or</strong>ównywalną do metody Kirby-Bauera, opartą na tych samych zasadach i wymaganiach<br />
kontroli jakości, jest metoda NEO-SENSITABS, produced ROSCO Diagnostica, Taastrup, Dania.<br />
W metodzie zamiast bibułowych krążków stosowane są 9-milimetrowe oznaczone kol<strong>or</strong>em tabletki<br />
przeciwbakteryjne. F<strong>or</strong>ma tabletek gwarantuje wyjątkową stabilność antybiotyku z okresem przechowywania<br />
do czterech lat, nawet w temperaturze pokojowej. Zwiększona stabilność jest bardzo ważna<br />
dla lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów w krajach tropikalnych.<br />
119
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
Test rozcieńczeń<br />
Rozcieńczenia antybiotyku do ilościowej oceny aktywności przeciwbakteryjnej<br />
można przygotować w bulionie lub podłożu agarowym, które następnie inkubuje<br />
się z badanym mikro<strong>or</strong>ganizmem. Najniższe stężenie preparatu, które po<br />
całonocnej inkubacji hamuje wzrost szczepu, określa się jako minimalne stężenie<br />
hamujące (MIC — minimum inhibit<strong>or</strong>y concentration). Wartość MIC p<strong>or</strong>ównuje<br />
się następnie ze znanym stężeniem leku, jakie osiągane jest w surowicy i innych<br />
płynach ustrojowych, aby ocenić przypuszczalną odpowiedź kliniczną.<br />
Test dyfuzji<br />
Bibułowe krążki nasączone określoną ilością antybiotyku umieszcza się na<br />
podłożu agarowym z równomiernie posianym badanym drobnoustrojem. Gradient<br />
stężenia antybiotyku tw<strong>or</strong>zy się przez dyfuzję z krążka, a powstała strefa<br />
zahamowania wokół krążka k<strong>or</strong>eluje, wśród innych czynników, z wrażliwością<br />
szczepu.<br />
Istnieje prawie liniowa zależność pomiędzy log MIC, mierzonym w teście<br />
rozcieńczeń, iśrednicą strefy zahamowania w teście dyfuzyjnym. Linię regresji<br />
wyrażającą tę zależność można uzyskać badając dużą liczbę szczepów równocześnie<br />
dwoma metodami (patrz ryc. 12 i 13).<br />
Kliniczna definicja terminów ,,op<strong>or</strong>ny’’<br />
i ,,wrażliwy’’<br />
Wynik badania wrażliwości w f<strong>or</strong>mie przedstawianej lekarzowi kwalifikuje<br />
mikro<strong>or</strong>ganizm do jednej z dwóch lub więcej kateg<strong>or</strong>ii wrażliwości. Najprostszy<br />
system składa się jedynie z dwóch kateg<strong>or</strong>ii: wrażliwy i op<strong>or</strong>ny. Klasyfikacja,<br />
35<br />
30<br />
25<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
20<br />
15<br />
10<br />
6<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
••<br />
0,03 0,06 0,12 0,25 0,5 1 2 4 8 16 32 64<br />
MIC (µg/ml)<br />
WHO 90961<br />
Ryc. 12. Graficzna prezentacja k<strong>or</strong>elacji między wartościa˛ log 2 MIC i strefa˛ zahamowania<br />
wzrostu uzyskiwana˛ w metodzie dyfuzyjnej z użyciem kra˛żków zawieraja˛cych jedno,<br />
określone stężenie antybiotyku.<br />
120
CZE˛ŚĆ I<br />
mimo że ze względów statystycznych i epidemiologicznych posiada wiele zalet,<br />
jest zbyt sztywna dla klinicysty. Dlatego często przyjmuje się klasyfikację trzech<br />
kateg<strong>or</strong>ii. Metoda Kirby-Bauera i jej modyfikacja uwzględniają trzy kateg<strong>or</strong>ie<br />
wrażliwości i ważne jest, aby zarówno lekarz, jak i pracownik lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
rozumieli ich dokładne definicje i znaczenie kliniczne.<br />
Średnice<br />
graniczne<br />
S<br />
I<br />
R<br />
1<br />
● 27<br />
● 14<br />
Średnica strefy<br />
(mm)<br />
1<br />
35<br />
30<br />
— — — — — — — — — — — — —<br />
25<br />
20<br />
15<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
10<br />
6<br />
— — — — — — — — — — — — — — — — — —<br />
S – susceptible/wrażliwy<br />
I – intermediate/średnio wrażliwy<br />
R – resistant/op<strong>or</strong>ny<br />
0,03 0,06 0,12 0,25 0,5 1 2 4 8 16 32 64<br />
▲<br />
▲<br />
S I R MIC (µg/ml)<br />
— — — — — — —<br />
WHO 90962<br />
Ryc. 13. Interpretacja wielkości stref (wrażliwy, średnio wrażliwy, op<strong>or</strong>ny) w odniesieniu<br />
do wartości MIC.<br />
• Wrażliwy. Mikro<strong>or</strong>ganizm określany jest jako ,,wrażliwy’’ na antybiotyk, jeśli<br />
odpowiedź kliniczna na leczenie danym antybiotykiem, stosowanym w zalecanych<br />
dawkach, jest prawdopodobna.<br />
• Średnio wrażliwy dotyczy dwóch sytuacji. Określa szczepy o ,,umiarkowanej<br />
wrażliwości’’ na antybiotyk, który może być zastosowany w leczeniu w większej<br />
dawce (np. β-laktam) z powodu niskiej toksyczności lub koncentracji<br />
w ognisku zakażenia (np. mocz). Klasyfikacja odnosi się również do szczepów<br />
wykazujących ,,średnią wrażliwość’’ na bardziej toksyczne antybiotyki (np.<br />
aminoglikozydy), które nie mogą być zastosowane w wyższych dawkach. W tej<br />
sytuacji pośrednia kateg<strong>or</strong>ia stanowi strefę buf<strong>or</strong>ową między wrażliwością<br />
i op<strong>or</strong>nością.<br />
Podobnie jak większość klinicystów nie jest świadoma, mimo klinicznego<br />
znaczenia, subtelnej różnicy między średnią i umiarkowaną wrażliwością,<br />
wiele lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów w obydwu sytuacjach używa określenia ,,średnia’’.<br />
• Op<strong>or</strong>ny. Ten termin wskazuje, że niezależnie od zastosowanej dawki i lokalizacji<br />
infekcji, oczekiwany jest brak odpowiedzi klinicznej na dany antybiotyk.<br />
W pewnych sytuacjach, na przykład w badaniu odpowiedzi gronkowców na<br />
benzylopenicylinę, istnieją tylko kateg<strong>or</strong>ie ,,wrażliwy’’ i ,,op<strong>or</strong>ny’’ (odpowiadające<br />
zdolności do wytwarzania β-laktamaz).<br />
Najlepsza decyzja o użyciu określonego antybiotyku i stosowanego dawkowania<br />
zależy nie tylko od wyników antybiogramu, ale również od jego interpretacji<br />
przez lekarza. Należy wziąć pod uwagę także inne czynniki, takie jak właściwości<br />
ch<strong>or</strong>obotwórcze mikro<strong>or</strong>ganizmu, działania uboczne i farmakokinetyczne właściwości<br />
leku, jego przenikanie do różnych obszarów ciała <strong>or</strong>az status immunologiczny<br />
pacjenta.<br />
121
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
Wskazania do rutynowego oznaczania<br />
lekowrażliwości<br />
Antybiogram w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium klinicznym może zostać wykonany w dwóch celach:<br />
• aby ukierunkować lekarza w wyb<strong>or</strong>ze najlepszego leku przeciwbakteryjnego<br />
indywidualnie dla pacjenta;<br />
• aby gromadzić inf<strong>or</strong>macje epidemiologiczne o op<strong>or</strong>ności mikro<strong>or</strong>ganizmów<br />
o istotnym znaczeniu dla zdrowia publicznego.<br />
Antybiogram jako wskazówka<br />
do leczenia<br />
Antybiogramy nigdy nie powinny być wykonywane dla zanieczyszczających<br />
próbkę lub komensalnych mikro<strong>or</strong>ganizmów, należących do fl<strong>or</strong>y fizjologicznej,<br />
<strong>or</strong>az innych, nie mających związku z procesem zakażenia. Na przykład obecność<br />
Escherichia coli w moczu w liczbie mniejszej od znaczącej nie jest uważana za<br />
przyczynę infekcji i wykonanie antybiogramu byłoby bezcelowe lub wręcz<br />
mylące.<br />
Antybiogramy powinny być wykonywane tylko z czystych hodowli mikro<strong>or</strong>ganizmów<br />
prawdopodobnie wywołujących zakażenie.<br />
Rutynowe badanie wrażliwości nie jest wskazane w następujących sytuacjach:<br />
• Jeśli drobnoustrój należy do gatunku z przewidywalną wrażliwością na<br />
określony lek. Tak jest w przypadku Streptococcus pyogenes i Neisseria<br />
meningitidis, które nadal wykazują wrażliwość na benzylopenicylinę. (Jakkolwiek<br />
ostatnio przedstawiono w rap<strong>or</strong>tach sp<strong>or</strong>adyczne pojawianie się benzylopenicylinoop<strong>or</strong>nych<br />
meningokoków.) Podobnie jest w przypadku paci<strong>or</strong>kowcówkałowych<br />
(enterokoków), które poza kilkoma wyjątkami (Enterococcus<br />
faecium — przyp. tłum.)sąwrażliwe na ampicylinę. Jeśli na podstawie cech<br />
klinicznych podejrzewa się op<strong>or</strong>ność tych mikro<strong>or</strong>ganizmów, szczepy należy<br />
przesłać do referencyjnego lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium.<br />
• Jeśli drobnoustrój wymaga wzbogaconego podłoża, np. Haemophilus influenzae<br />
i Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae. Przy braku ścisłego przestrzegania właściwej<br />
techniki wykonania antybiogramu test dyfuzyjno-krążkowy może dawać<br />
niewiarygodne rezultaty. Pojawienie się wytwarzających β-laktamazy wariantów<br />
wyżej wymienionych szczepów spowodowało konieczność wprowadzenia<br />
specjalnych testów, takich jak wykrywający β-laktamazy in vitro test opisany<br />
na stronie 92. Za monit<strong>or</strong>owanie wrażliwości pneumokoków, gonokoków<br />
i Haemophilus odpowiadają regionalne i centralne lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia. W razie<br />
wystąpienia problemu op<strong>or</strong>ności szczepów należy ostrzec lokalne lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia<br />
i dostarczyć instrukcje dotyczące właściwych w tej sytuacji metod badania<br />
lekowrażliwości i alternatywnych schematów leczenia.<br />
• Niepowikłane zakażenia wywołane przez Salmonella (inne niż S. typhi lub<br />
S. paratyphi). Leczenie przeciwbakteryjne takich infekcji nie jest uzasadnione,<br />
nawet z zastosowaniem antybiotyków wykazujących aktywność in vitro.<br />
Istnieje wiele dowodów przemawiających za brakiem klinicznych k<strong>or</strong>zyści<br />
leczenia niepowikłanego zapalenia żołądkowo-jelitowego wywołanego przez<br />
pałeczki Salmonella (a w praktyce większości ch<strong>or</strong>ób biegunkowych o niejasnej<br />
etiologii). Paradoksalnie, stosowanie antybiotyków może wydłużyć wydalanie<br />
i rozprzestrzenianie się tych bakterii, a także prowadzić do selekcji<br />
szczepów op<strong>or</strong>nych.<br />
122
CZE˛ŚĆ I<br />
Antybiogram jako narzędzie badań<br />
epidemiologicznych<br />
Rutynowe określanie wrażliwości większości patogenów (S. typhi, pałeczki<br />
Shigella) jest istotnym elementem programu kontroli zakażeń układu pokarmowego.<br />
Badania te dostarczają lekarzowi inf<strong>or</strong>macji o pojawieniu się op<strong>or</strong>nych<br />
szczepów (S. typhi op<strong>or</strong>na na chl<strong>or</strong>amfenikol, pałeczki Shigella op<strong>or</strong>ne na<br />
kotrimoksazol i ampicylinę) <strong>or</strong>az o ewentualnej potrzebie modyfikacji schematu<br />
standardowego leczenia. Mimo że antybiogramy dla niedurowych serotypów<br />
pałeczek Salmonella, odpowiedzialnych za zakażenia jelitowe, nie mają znaczenia<br />
w leczeniu pacjenta, pojawienie się wielolekoop<strong>or</strong>nych szczepów jest<br />
ostrzeżeniem dla lekarzy przed nadmiernym lub niewłaściwym stosowaniem<br />
leków przeciwbakteryjnych. Stała kontrola i analiza antybiogramów jest doskonałym<br />
źródłem inf<strong>or</strong>macji o występowaniu op<strong>or</strong>nych gronkowców i Gram-<br />
-ujemnych pałeczek, które mogą być odpowiedzialne za krzyżowe zakażenia<br />
szpitalne. Okresowe rap<strong>or</strong>towanie wz<strong>or</strong>ów op<strong>or</strong>ności izolowanych szczepów<br />
stanowi nieocenioną pomoc w prowadzeniu właściwej polityki antybiotykowej<br />
w szpitalu, opartej na ograniczeniu i/lub rotacji ratujących życie leków, takich jak<br />
aminoglikozydy i cefalosp<strong>or</strong>yny.<br />
Wybór leków do oznaczania lekowrażliwości<br />
w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach klinicznych<br />
Wybór leków używanych w rutynowym antybiogramie dokonywany jest na<br />
podstawie spektrum przeciwbakteryjnego leku, jego właściwości farmakokinetycznych,<br />
toksyczności, skuteczności i dostępności, a także kosztów zarówno dla<br />
pacjenta, jak i dla społeczeństwa. Spośród wielu preparatów przeciwbakteryjnych<br />
stosowanych w leczeniu jedynie niewielka część starannie dobranych leków<br />
powinna być wyk<strong>or</strong>zystywana w oznaczaniu wrażliwości.<br />
W tabeli 23 wymienione zostały antybiotyki stosowane w różnych sytuacjach<br />
klinicznych. Leki podzielono na dwie grupy. Grupa pierwsza to leki dostępne<br />
w większości szpitali, które powinny być uwzględnione w antybiogramie dla<br />
Tabela 23. <strong>Podstawowe</strong> zestawy antybiotyków do rutynowego oznaczania wrażliwości a<br />
Grupa 1<br />
Leki pierwszego rzutu<br />
Grupa 2<br />
Leki uzupełniaja˛ce<br />
Staphylococcus<br />
Układ<br />
pokarmowy<br />
Enterobacteriaceae<br />
Mocz<br />
Krew i tkanki<br />
Pseudomonas<br />
aeruginosa<br />
Benzylopenicylina Ampicylina Sulfonamid Ampicylina Piperacylina<br />
Oksacylina Chl<strong>or</strong>amfenikol Trimetoprim Chl<strong>or</strong>amfenikol Gentamycyna<br />
Erytromycyna Kotrimoksazol Kotrimoksazol Kotrimoksazol Tobramycyna<br />
Tetracyklina Kwas nalidyksowy Ampicylina Tetracyklina<br />
Chl<strong>or</strong>amfenikol Tetracyklina Nitrofurantoina Cefalotyna<br />
Kwas nalidyksowy Gentamycyna<br />
Tetracyklina Amoksycylina/<br />
/kwas klawulanowy<br />
b<br />
Gentamycyna N<strong>or</strong>floksacyna N<strong>or</strong>floksacyna Cefuroksym Amikacyna<br />
Amikacyna Chl<strong>or</strong>amfenikol Ceftriakson Ciprofloksacyna<br />
Kotrimoksazol Gentamycyna Ciprofloksacyna Ceftazydym<br />
Klindamycyna<br />
Amoksycylina/ Piperacylina<br />
Nitrofurantoina<br />
/kwas klawulanowy<br />
Amikacyna<br />
b<br />
a<br />
b<br />
Inf<strong>or</strong>macje o poszczególnych antybiotykach sa˛ umieszczone w tekście.<br />
Amoksycylina z kwasem klawulanowym (inhibit<strong>or</strong> β-laktamaz).<br />
123
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
każdego izolowanego szczepu 1 . Testy dla leków z drugiej grupy powinny być<br />
wykonywane jedynie na specjalne zlecenie lekarza, gdy izolowany patogen jest<br />
op<strong>or</strong>ny na leki pierwszego rzutu lub gdy inne powody (alergia na lek lub jego<br />
niedostępność) uzasadniają takie badanie. Wiele antybiotyków o dobrej aktywności<br />
klinicznej zostało pominiętych w tabeli, lecz należy podkreślić, że ich<br />
zastosowanie jest rzadko konieczne w leczeniu zakażonych pacjentów. Wyjątkowo,<br />
jeśli istnieją szczególne wskazania znane lekarzowi lub jeśli dostępne są<br />
nowe i lepsze leki, do leczenia można włączyć jeden lub więcej leków<br />
dodatkowych. Wskazana jest aktualizacja inf<strong>or</strong>macji zawartych w tabeli we<br />
współpracy z personelem klinicznym. W antybiogramach wyk<strong>or</strong>zystuje się<br />
niekiedy tylko jeden lek reprezentujący całą grupę, co może być przyczyną<br />
niep<strong>or</strong>ozumień w sytuacji, gdy klinicyści nie są tego świadomi. Wynik antybiogramu<br />
dla reprezentatywnego antybiotyku można odnieść do wszystkich lub do<br />
większości przedstawicieli danej grupy. W niektórych krajach poważne utrudnienia<br />
wynikają z faktu, że lekarze znają tylko handlowe nazwy leków, bez nazw<br />
międzynarodowych. Należy położyć nacisk na inf<strong>or</strong>mowanie personelu medycznego<br />
o nazwach niehandlowych antybiotyków i zachęcać do ich stosowania 2 .<br />
1. Krążek z benzylopenicylina˛ stosowany jest do określania wrażliwości na<br />
wszystkie β-laktamazowrażliwe penicyliny (takie jak doustna fenoksymetylopenicylina<br />
i fenetycylina). W zakażeniach wywołanych przez gronkowce<br />
wytwarzające β-laktamazy powinno się stosować β-laktamazoop<strong>or</strong>ne penicyliny<br />
lub inny antybiotyk, np. erytromycynę.<br />
2. Krążek z oksacylina˛ jest reprezentatywny dla całej grupy β-laktamazoop<strong>or</strong>nych<br />
penicylin (wliczając metycylinę, nafcylinę, kloksacylinę, dikloksacylinę<br />
i flukloksacylinę). Istnieją dowody kliniczne na krzyżową op<strong>or</strong>ność<br />
między metycyliną i grupą cefalosp<strong>or</strong>yn. Dlatego niepotrzebne i mylące jest<br />
włączenie cefalotyny do antybiogramu dla gronkowców. Op<strong>or</strong>ność na<br />
metycylinę i pozostałe leki tej grupy ma często heterogenny charakter, np.<br />
większość komórek może być wpełni wrażliwa i tw<strong>or</strong>zyć szeroką strefę<br />
zahamowania, podczas gdy część populacji rośnie w strefie zahamowania<br />
w postaci drobnych kolonii. Ten typ op<strong>or</strong>ności jest lepiej wykrywany<br />
w temperaturze 35°C 3 lub przy przedłużonym czasie inkubacji. Poważną<br />
wadą metycyliny, jako antybiotyku reprezentatywnego dla całej grupy, jest<br />
jej duża niestabilność, nawet w prawidłowych warunkach przechowywania.<br />
W standardowej metodzie dyfuzyjnej preferuje się stosowanie krążka<br />
z oksacyliną, która jest bardziej trwała. Krążki z kloksacyliną i dikloksacyliną<br />
nie są stosowane, ponieważ mogą nie wykrywać heteroop<strong>or</strong>nych szczepów.<br />
3. Wynik badania wrażliwości na tetracyklinę można odnieść do chl<strong>or</strong>otetracykliny,<br />
oksytetracykliny <strong>or</strong>az innych przedstawicieli tej grupy. Jednak większość<br />
op<strong>or</strong>nych na tetracyklinę gronkowców zachowuje wrażliwość na<br />
minocyklinę. Krążki z minocykliną mogą więc być przydatne w oznaczaniu<br />
wrażliwości wieloop<strong>or</strong>nych szczepów gronkowców.<br />
4. Wynik badania wrażliwości na chl<strong>or</strong>amfenikol można odnieść do tiamfenikolu,<br />
pochodnego leku o p<strong>or</strong>ównywalnym spektrum przeciwbakteryjnym,<br />
ale bez znanego ryzyka niedokrwistości aplastycznej.<br />
1<br />
W Polsce dobór krążków do wykonania antybiogramu powinien być oparty na rekomendacjach<br />
opracowanych przez Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów (przyp.<br />
tłum.).<br />
2<br />
International Nonproprietary Names (INN) f<strong>or</strong> Pharmaceutical Substances. Cumulative list No. 9.<br />
Geneva, W<strong>or</strong>ld Health Organization, 1996.<br />
3<br />
Sahm D.F. et al.: Current concepts and approaches to antimicrobial agent susceptibility testing. In:<br />
Cumitech 25, Washington, DC, American Society f<strong>or</strong> Microbiology, 1988.<br />
124
CZE˛ŚĆ I<br />
5. W antybiogramie stosowany jest tylko jeden przedstawiciel sulfonamidów<br />
(sulfafurazol).<br />
6. Krążek z kotrimoksazolem zawiera kombinację trimetoprimu i sulfonamidu<br />
(sulfametoksazol). Dwa składniki tego synergistycznego połączenia mają<br />
podobne właściwości farmakokinetyczne i generalnie działają jak jeden lek.<br />
7. Ampicylina jest przedstawicielem grupy penicylin o szerokim spektrum<br />
działania, wykazujących aktywność wobec wielu Gram-ujemnych bakterii.<br />
Ponieważ jest wrażliwa na β-laktamazy, nie powinna być stosowana<br />
w określaniu lekowrażliwości gronkowców. Ogólnie, wynik wrażliwości na<br />
ampicylinę odnosi się również do innych przedstawicieli grupy: amoksycyliny,<br />
piwampicyliny, talampicyliny itp. (choć amoksycylina jest dwukrotnie<br />
bardziej aktywna wobec pałeczek Salmonella iopołowę mniej<br />
aktywna wobec pałeczek Shigella i H. influenzea).<br />
8. Rutynowo należy określać wrażliwość jedynie na cefalotynę, ponieważ<br />
wynik jest reprezentatywny dla innych cefalosp<strong>or</strong>yn pierwszej generacji<br />
(cefaleksyna, cefradyna, cefal<strong>or</strong>ydyna, cefazolina, cefapiryna). Ze względu<br />
na dostępność cefalosp<strong>or</strong>yn drugiej i trzeciej generacji <strong>or</strong>az ich pochodnych<br />
(cefamycyny) o rozszerzonym spektrum, w wybranych przypadkach może<br />
być uzasadnione użycie krążków z antybiotykami tej grupy (cefoksytyna,<br />
cefamandol, cefuroksym, cefotaksym, ceftriakson). Wrażliwość na cefalosp<strong>or</strong>yny<br />
stosowane w ciężkich zakażeniach gronkowcowych można określić<br />
na podstawie wyników badania wrażliwości na oksacylinę, o czym wspomniano<br />
już powyżej w punkcie 2.<br />
9. Erytromycyna jest wyk<strong>or</strong>zystywana do oceny wrażliwości także na inne<br />
makrolidy (oleandomycyna, spiramycyna).<br />
10. Aminoglikozydy tw<strong>or</strong>zą grupę chemicznie podobnych leków obejmujących<br />
streptomycynę, gentamycynę, kanamycynę, netylmycynę i tobramycynę. Ich<br />
spektra przeciwbakteryjne nie zawsze są na tyle podobne, aby można było<br />
założyć istnienie krzyżowej op<strong>or</strong>ności, ale wobec wrażliwych patogenów leki<br />
te wykazują identyczną skuteczność. W licznych badaniach p<strong>or</strong>ównywano<br />
nefrotoksyczność i ototoksyczność gentamycyny, netylmycyny i tobramycyny,<br />
ale nie uzyskano ostatecznych dowodów, świadczących o mniejszej<br />
toksyczności którejkolwiek z nich. Zaleca się, aby każde lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium<br />
wybrało jeden lek do podstawowego antybiogramu. Pozostałe antybiotyki<br />
należy zachować w rezerwie do leczenia pacjentów z zakażeniami wywołanymi<br />
przez op<strong>or</strong>ne drobnoustroje.<br />
11. Stosowanie nitrofurantoiny ograniczone jest do leczenia zakażeń układu<br />
moczowego i wrażliwość na ten lek nie powinna być oznaczana dla szczepów<br />
pochodzących z innych materiałów niż mocz.<br />
Tabela 24 zawiera wartości graniczne średnic stref zahamowania wzrostu dla<br />
szczepów kontrolnych.<br />
Zmodyfikowana metoda Kirby-Bauera<br />
Metoda dyfuzyjno-krążkowa, po raz pierwszy opisana w 1966 r. 1 , jest dobrze<br />
wystandaryzowaną i wysoko cenioną metodą. Oficjalne instytucje zaleciły ją,<br />
z niewielkimi modyfikacjami, jako referencyjną metodę, która może być<br />
rutynowo stosowana w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach klinicznych.<br />
1<br />
Bauer A.W. et al.: Antibiotic susceptibility testing by a standardized single disc method. American<br />
Journal of Clinical Pathology, 1966; 45: 493 – 496.<br />
125
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
Tabela 24. Strefy zahamowania wzrostu dla szczepów kontrolnych a<br />
a<br />
b<br />
c<br />
Antybiotyk<br />
Zawartość<br />
w kra˛żku<br />
Średnica strefy zahamowania (mm)<br />
S. aureus<br />
(ATCC 25923)<br />
E. coli<br />
(ATCC 25922)<br />
P. aeruginosa<br />
(ATCC 27853)<br />
Amikacyna 30 µg 20–26 19 –26 18 –26<br />
Amoksycylina/kwas 20/10 µg 28–36 19 –25 —<br />
klawulanowy b<br />
Ampicylina 10 µg 27–35 16 –22 —<br />
Benzylopenicylina 10 µg 26–37 — —<br />
Cefalotyna 30 µg 29–37 15 –21 —<br />
Cefalozyna 30 µg 29–35 23 –29 —<br />
Ceftazydym 30 µg 16–20 25 –32 22 –29<br />
Cefotaksym 30 µg 25–31 29 –35 18 –22<br />
Ceftriakson 30 µg 22–28 29 –35 17 –23<br />
Cefuroksym 30 µg 27–35 20 –26 —<br />
Chl<strong>or</strong>amfenikol 30 µg 19–26 21 –27 —<br />
Ciprofloksacyna 5 µg 22–30 30 –40 25 –33<br />
Klindamycyna 2 µg 24–30 — —<br />
Kotrimoksazol 25 µg 24–32 24 –32 —<br />
Erytromycyna 15 µg 22–30 — —<br />
Gentamycyna 10 µg 19–27 19 –26 16 –21<br />
Kwas nalidyksowy 30 µg — 22 –28 —<br />
Nitrofurantoina 300 µg 18–22 20 –25 —<br />
N<strong>or</strong>floksacyna 10 µg 17–28 28 –35 22 –29<br />
Oksacylina 1 µg 18–24 — —<br />
Piperacylina 100 µg — 24 –30 25 –33<br />
Sulfonamid c 300 µg 24–34 15 –23 —<br />
Tetracyklina 30 µg 24–30 18 –25 —<br />
Tobramycyna 10 µg 19–29 18 –26 19 –25<br />
Trimetoprim 5 µg 19–26 21 –28 —<br />
Wankomycyna 30 µg 17–21 — —<br />
National Committee f<strong>or</strong> Clinical Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y Standards. Perf<strong>or</strong>mance standards f<strong>or</strong> antimicrobial<br />
disc susceptibility tests. 6 th ed. Vol. 21 No 1 (M2-A7 i M7-A5) i 11 th inf<strong>or</strong>mational<br />
supplement 2001 (M100-S11).<br />
Amoksycylina z kwasem klawulanowym (inhibit<strong>or</strong> β-laktamaz).<br />
Sulfizoksazol.<br />
Odczynniki<br />
Agar Mueller-Hintona<br />
1. Przygotować agar Mueller-Hintona z postaci sproszkowanej, zgodnie z zaleceniem<br />
producenta. Podłoża powinny być przygotowane w sposób, który<br />
umożliwi uzyskanie odpowiednich stref zahamowania dla szczepów kontrolnych<br />
(patrz tabela 24). Ważne jest, aby nie przegrzać podłoża.<br />
2. Schłodzić podłożedo45– 50°C i rozlać na płytki. Wypełnić do poziomu około<br />
4 mm. Płytka o średnicy 9 cm zawiera około 25 ml podłoża.<br />
3. Gdy agar stężeje, płytki do natychmiastowego użycia suszyć przez 10 – 30 minut<br />
w35°C, umieszczając jewcieplarcedogóry dnem, z uchylonymi wieczkami.<br />
4. Nie wyk<strong>or</strong>zystane płytki można przechowywać wchłodziarce, w szczelnie<br />
zamkniętych plastikowych w<strong>or</strong>eczkach. Płytki mogą być przechowywane<br />
w ten sposób przez 2 tygodnie.<br />
W celu uzyskania wiarygodnych stref zahamowania wzrostu, do badania lekowrażliwości<br />
na sulfonamidy i kotrimoksazol należy użyć agaru Mueller-Hintona,<br />
zawierającego niskie stężenia inhibit<strong>or</strong>ów tymidyny i tyminy. Z tego względu<br />
każda nowa partia agaru Mueller-Hintona musi zostać przetestowana z użyciem<br />
126
CZE˛ŚĆ I<br />
szczepu kontrolnego Enterococcus faecalis (ATCC 29212 lub 33186) <strong>or</strong>az krążka<br />
z kotrimoksazolem. O odpowiedniej jakości podłoży świadczy wyraźna, 20-<br />
-milimetrowa lub większa, strefa zahamowania, co ważne — bez mglistego<br />
wzrostu i drobnych kolonii.<br />
Kra˛żki z antybiotykami<br />
Można używać wszystkich dostępnych komercyjnie krążków o właściwej<br />
średnicy i stężeniu leku. Zapasy krążków należy przechowywać w –20°C;<br />
odpowiednia jest także zamrażarka chłodziarki. Mały podręczny zestaw krążków<br />
można przechowywać wchłodziarce do miesiąca. Po wyjęciu z chłodziarki<br />
pojemniki należy pozostawić w temperaturze pokojowej na około 1 godziny (do<br />
wyrównania temperatur). Taka procedura zmniejsza skraplanie pary, pojawiającej<br />
się w wyniku kontaktu ciepłego powietrza z powierzchnią zimnego pojemnika.<br />
Jeśli używa się dyspensera krążków, należy przechowywać go w chłodziarce ze<br />
szczelnie domkniętą pokrywą. Przed otwarciem dyspenser również powinien<br />
zostać ogrzany do temperatury pokojowej.<br />
Wz<strong>or</strong>zec zmętnienia<br />
Przygotować wz<strong>or</strong>zec zmętnienia (gęstości zawiesiny — przyp. tłum.) wlewając<br />
0,6 ml 1% (10 g/l) roztw<strong>or</strong>u dwuwodzianu chl<strong>or</strong>ku baru do 100-mililitrowego<br />
kalibrowanego cylindra i wypełnić do 100 ml 1% (10 ml/l) kwasem siarkowym.<br />
Roztwór wz<strong>or</strong>cowego zmętnienia należy umieścić w identycznej probówce, jak<br />
probówki z bulionem. Wz<strong>or</strong>zec może być przechowywany w ciemności,<br />
w temperaturze pokojowej przez 6 miesięcy, pod warunkiem, że jest zamknięty<br />
w sposób uniemożliwiający parowanie.<br />
Wymazówki<br />
Przygotowuje się zapas bawełnianych wymazówek na drewnianych patyczkach.<br />
Wymazówki sterylizuje się w autoklawie lub w sterylizat<strong>or</strong>ach na suche g<strong>or</strong>ące<br />
powietrze, umieszczając je w puszkach, probówkach lub opakowane w papier.<br />
Procedura<br />
Aby przygotować inoculum z hodowli na podłożu stałym, należy zebrać ezą<br />
3 – 5 kolonii badanego mikro<strong>or</strong>ganizmu o tym samym wyglądzie.<br />
127
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
Przenieść do probówki z fizjologicznym roztw<strong>or</strong>em soli.<br />
Jeśli inoculum przygotowywane jest z czystej hodowli, należy w ten sam sposób<br />
w roztw<strong>or</strong>ze fizjologicznym soli zawiesić ezą materiał pobrany ze zlewnego<br />
wzrostu.<br />
P<strong>or</strong>ównać probówkę ze wz<strong>or</strong>cem zmętnienia i dostosować gęstość badanej<br />
zawiesiny do wz<strong>or</strong>ca, dodając więcej bakterii lub więcej fizjologicznego roztw<strong>or</strong>u<br />
soli.<br />
Właściwa gęstość inoculum jest konieczna do uzyskania zlewnej lub prawie<br />
zlewnej murawy wzrostu.<br />
Badany szczep posiać na płytki, zanurzając sterylną wymazówkę w inoculum.<br />
Usunąć nadmiar zawiesiny, obracając i przyciskając wymazówkę mocno do<br />
ścianki probówki powyżej poziomu płynu.<br />
128
CZE˛ŚĆ I<br />
Zawiesinę trzykrotnie rozprowadzić dokładnie na całej powierzchni podłoża,<br />
przekręcając płytkę za każdym razem o 60°. Na koniec przesunąć wymazówkę<br />
wzdłuż brzegów powierzchni agaru. Pozostawić na kilka minut do wyschnięcia<br />
w temperaturze pokojowej, z zamkniętym wieczkiem.<br />
Krążki z antybiotykami można umieścić na posianej płytce za pomocą sterylnej<br />
pęsety. Zastosowanie szablonu (ryc. 15) ułatwia równomierne rozmieszczenie<br />
krążków.<br />
Do umieszczenia krążków z antybiotykami na posianej płytce można również<br />
użyć sterylnej igły z zatyczką.<br />
129
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
Alternatywnie, do nałożenia na posianą płytkę krążków z antybiotykami można<br />
użyć dyspensera.<br />
Maksymalnie na płytce o średnicy 9 – 10 cm można umieścić siedem krążków.<br />
Sześć krążków można rozmieścić równomiernie w jednakowej odległości, około<br />
15 mm od brzegu płytki, a jeden krążek nałożyć w centrum płytki. Każdy krążek<br />
należy delikatnie przycisnąć, zapewniając równomierny kontakt z podłożem.<br />
Płytki powinny być w ciągu 30 minut umieszczone w cieplarce w 35°C. Temperatura<br />
powyżej 35°C zaburza wyniki wrażliwości na oksacylinę/metycylinę.<br />
Nie inkubować w atmosferze dwutlenku węgla.<br />
Po całonocnej inkubacji należy zmierzyć średnicę każdej strefy (wliczając<br />
średnicę krążka) i zanotować odczyt (w mm). Interpretować wyniki zgodnie<br />
z wartościami przedstawionymi w tabeli 25.<br />
Pomiar stref może być wykonany za pomocą linijki przyłożonej do dna płytki, bez<br />
jej otwierania.<br />
130
CZE˛ŚĆ I<br />
Jeśli płytka nie jest przezroczysta, pomiaru można dokonać za pomocą suwmiarki.<br />
Wyniki badania lekowrażliwości można odczytać posługując się szablonem<br />
(ryc. 14).<br />
131
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
Tabela 25. Interpretacja stref zahamowania wzrostu w zmodyfikowanej metodzie<br />
Kirby-Bauera a dla bakterii szybko rosna˛cych<br />
Antybiotyk<br />
Zawartość<br />
w kra˛żku<br />
Średnica strefy zahamowania (mm)<br />
Op<strong>or</strong>ny<br />
Średnio<br />
wrażliwy<br />
Wrażliwy<br />
Amikacyna 30 µg < 14 15 –16 > 17<br />
Amoksycylina/kwas klawulanowy<br />
20/10 µg < 13 14 –17 > 18<br />
b<br />
Ampicylina dla:<br />
– Enterobacteriaceae 10 µg < 13 14 –16 > 17<br />
– enterokoki 10 µg < 16 — > 17<br />
Benzylopenicylina dla:<br />
– gronkowce 10 IU < 28 — > 29<br />
– enterokoki 10 IU < 14 — > 15<br />
Cefalotyna 30 µg < 14 15 –17 > 18<br />
Cefalozyna 30 µg < 14 15 –17 > 18<br />
Cefotaksym 30 µg < 14 15 –22 > 23<br />
Ceftazydym 30 µg < 14 15 –17 > 18<br />
Ceftriakson 30 µg < 13 14 –20 > 21<br />
Cefuroksym sodium, cefamandol<br />
30 µg < 14 15 –17 > 18<br />
Chl<strong>or</strong>amfenikol 30 µg < 12 13 –17 > 18<br />
Ciprofloksacyna 5 µg < 15 16 –20 > 21<br />
Klindamycyna 2 µg < 14 15 –20 1 21<br />
Kotrimoksazol 25 µg < 10 11 –15 1 16<br />
Erytromycyna 15 µg < 13 14 –22 > 23<br />
Gentamycyna 10 µg < 12 13 –14 > 15<br />
Kwas nalidyksowy c 30 µg < 13 14 –18 1 19<br />
Nitrofurantoina c 300 µg < 14 15 –16 > 17<br />
N<strong>or</strong>floksacyna c 10 µg < 12 13 –16 > 17<br />
Oksacylina 1 µg < 10 10 –12 > 13<br />
Piperacylina dla:<br />
– P. aeruginosa 100 µg < 17 — > 18<br />
– inne pałeczki Gram-ujemne<br />
100 µg < 17 18 –20 > 21<br />
Sulfonamid c, d 300 µg < 12 13 –16 > 17<br />
Tetracyklina 30 µg < 14 15 –18 > 19<br />
Tobramycyna 10 µg < 12 13 –14 > 15<br />
Trimetoprim c 5 µg < 10 11 –15 1 16<br />
Wankomycyna dla:<br />
– gronkowce 30 µg — — > 15<br />
– enterokoki 30 µg < 14 15 –16 > 17<br />
a<br />
National Committee f<strong>or</strong> Clinical Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y Standards. Perf<strong>or</strong>mance standards f<strong>or</strong> antimicrobial<br />
disc susceptibility tests.6 th ed., Vol. 21, No 1 (M2-A7 i M7-A5) Wayne, PA, NCCLS i 11 th<br />
inf<strong>or</strong>mational supplement 2001 (M100-S11).<br />
b<br />
Amoksycylina z kwasem klawulanowym (inhibit<strong>or</strong> β-laktamaz).<br />
c<br />
Używane tylko do badania patogenów wyizolowanych z dróg moczowych i niektórych<br />
szczepów jelitowych.<br />
d<br />
Sulfizoksazol.<br />
132
CZE˛ŚĆ I<br />
Kra˛żek<br />
z antybiotykiem<br />
▲<br />
▲<br />
▲<br />
Strefa wewnętrzna:<br />
szczep op<strong>or</strong>ny<br />
Strefa czarna:<br />
średnia wrażliwość<br />
Ryc. 14. Szablon do określania wrażliwości.<br />
▼<br />
Strefa zewnętrzna:<br />
szczep wrażliwy<br />
WHO 91127<br />
Granicę strefy zahamowania ustala się gołym okiem w miejscu, gdzie rozpoczyna<br />
się widoczny wzrost; istnieją jednak trzy wyjątki:<br />
• W przypadku sulfonamidów i kotrimoksazolu w strefie zahamowania pojawia<br />
się słaby wzrost; nie należy go brać pod uwagę.<br />
• W przypadku określania wrażliwości β-laktamazododatnich gronkowców na<br />
benzylopenicyliny brzegi strefy zahamowania są wyraźnie widoczne i uniesione;<br />
łatwo uznać je za dodatni wynik testu, podczas gdy niezależnie od<br />
rozmiaru strefy zahamowania szczep należy opisać jako op<strong>or</strong>ny.<br />
• Pewne gatunki Proteus mogą wokół niektórych krążków z antybiotykami<br />
wytwarzać, w wyraźnie ograniczonej strefie zahamowania, cienką warstwę<br />
wzrostu mgławicowego, którego nie należy brać pod uwagę.<br />
Interpretacja wielkości stref zahamowania<br />
Stosowanie wz<strong>or</strong>nika. Dla każdego antybiotyku należy przygotować oddzielny<br />
wz<strong>or</strong>nik (patrz ryc. 14). Wynik można odczytać z jednoczesną interpretacją<br />
— wrażliwy, op<strong>or</strong>ny lub średnio wrażliwy: ,,wrażliwy’’, jeśli granica strefy<br />
wykracza poza czarny pierścień; ,,op<strong>or</strong>ny’’, jeśli nie obserwuje się strefy lub gdy<br />
jej granica mieści się w polu białego pierścienia; ,,średnio wrażliwy’’, jeśli granica<br />
strefy zahamowania leży w obrębie czarnego pierścienia.<br />
Stosowanie linijki. Wyniki pomiarów stref zahamowania w mm należy interpretować<br />
zgodnie z granicznymi średnicami przedstawionymi w tabeli 25.<br />
Bezpośrednie a pośrednie oznaczanie<br />
lekowrażliwości<br />
W opisanej powyżej metodzie inoculum przygotowywane jest z pierwotnej płytki<br />
hodowlanej lub z czystych hodowli. Jest to tak zwany pośredni test lekowrażliwości.<br />
W przypadkach, gdy niezbędny jest szybki wynik, zamiast standardowego<br />
inoculum można wyk<strong>or</strong>zystać badany materiał, np. mocz, dodatnie posiewy z krwi<br />
lub wymazy ropy. W przypadku moczu należy najpierw zbadać pod mikroskopem<br />
osad, oceniając obecność dowodów infekcji, np. obecność granulocytów i/lub<br />
drobnoustrojów. Następnie można wyk<strong>or</strong>zystać mocz jako inoculum w metodzie<br />
standardowej. Jeśli barwienie Grama inkubowanych hodowli z krwi, wykazujących<br />
wzrost bakterii, lub wymazów z ropy potwierdzi obecność dużej liczby<br />
mikro<strong>or</strong>ganizmów jednego typu, materiały te mogą zostać użyte jako bezpośrednie<br />
inoculum.Jesttotzw.bezpośredni test lekowrażliwości; zaletą testu bezpośredniego<br />
jest szybsze o 24 godziny uzyskanie wyniku. Główną wadę stanowi brak<br />
właściwego przygotowania inoculum. Jeśli na płytkach pojawi się zbyt słaby lub<br />
zbyt intensywny wzrost lub gdy obecne są mieszane hodowle, należy bardzo<br />
uważnie interpretować wyniki i powtórzyć test używając czystych hodowli.<br />
133
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
Czynniki techniczne wpływaja˛ce na wielkość<br />
strefy zahamowania w metodzie<br />
dyfuzyjno-kra˛żkowej<br />
Gęstość inoculum<br />
W przypadku zbyt małej gęstości inoculum uzyskana strefa zahamowania,<br />
niezależnie od wrażliwości mikro<strong>or</strong>ganizmu, będzie większa. Z tego powodu<br />
op<strong>or</strong>ne szczepy mogą zostać opisane jako wrażliwe. W odwrotnej sytuacji, zbyt<br />
dużej gęstości inoculum, wielkość uzyskanej strefy będzie mniejsza i szczepy<br />
wrażliwe mogą zostać opisane jako op<strong>or</strong>ne. Zwykle najlepsze wyniki uzyskuje się<br />
przygotowując inoculum warunkujące prawie zlewny wzrost.<br />
Czas nałożenia kra˛żków<br />
Na posianych płytkach, pozostawionych w temperaturze pokojowej dłużej niż<br />
podano w procedurze, przed nałożeniem krążków dochodzi do namnażania<br />
szczepów. W rezultacie średnica strefy zahamowania jest mniejsza i szczepy<br />
wrażliwe mogą zostać opisane jako op<strong>or</strong>ne.<br />
Temperatura inkubacji<br />
W celu otrzymania optymalnego wzrostu podłoża z antybiogramem należy<br />
inkubować w35°C. Jeśli temperatura jest niższa, wydłuża się czas inkubacji,<br />
a uzyskane strefy są większe. W przypadku badania wrażliwości heterogennie<br />
op<strong>or</strong>nych szczepów Staphylococcus aureus na metycylinę (oksacylinę) część<br />
op<strong>or</strong>ną populacji wykrywa się w35°C. W wyższych temperaturach cała hodowla<br />
wykazuje wrażliwość. W temperaturze 35°C i niższej w strefie zahamowania<br />
rosną op<strong>or</strong>ne kolonie. Opisane kolonie są lepiej widoczne, jeśli przed odczytem<br />
płytkę pozostawi się na kilka godzin w temperaturze pokojowej. Należy zawsze<br />
zidentyfikować ten typ kolonii, wykluczając zanieczyszczenie.<br />
Czas inkubacji<br />
Większość metod uwzględnia 16 – 18-godzinny okres inkubacji. Jakkolwiek<br />
w wyjątkowych sytuacjach wstępny wynik może zostać przygotowany po<br />
6 godzinach. Nie jest to metoda zalecana i w każdym przypadku wyniki należy<br />
potwierdzić po odpowiednim czasie inkubacji.<br />
Rozmiar płytek, grubość warstwy podłoża<br />
agarowego i rozmieszczenie kra˛żków<br />
z antybiotykami<br />
Testy wrażliwości przeprowadza się zwykle na płytkach o średnicy 9 – 10 cm,<br />
umieszczając nie więcej niż 6 – 7 krążków na każdej z nich. W przypadku badania<br />
wrażliwości na większą liczbę antybiotyków zaleca się użycie dwóch płytek lub<br />
134
CZE˛ŚĆ I<br />
jednej o średnicy 14 cm. Na bardzo cienkich podłożach może wytwarzać się<br />
większa strefa zahamowania; odwrotnie dzieje się w przypadku zbyt grubych<br />
podłoży. Właściwe rozmieszczenie krążków zapobiega nakładaniu się stref<br />
zahamowania lub powstawaniu zniekształceń przy brzegach płytki (patrz ryc. 15).<br />
WHO 86961<br />
Ryc. 15. Szablon do równomiernego nakładania kra˛żków napłytkę średnicy 90 mm.<br />
Stężenie antybiotyków w kra˛żkach<br />
Średnica strefy zahamowania zależy od zawartości antybiotyku w krążku.<br />
Zmniejszeniu aktywności leku w źle przechowywanym krążku towarzyszy<br />
odpowiednie zmniejszenie wielkości strefy zahamowania.<br />
Skład podłoża<br />
Podłożewpływa na wielkość strefy, decydując o stopniu wzrostu, współczynniku<br />
dyfuzji i aktywności leku. Ważne jest stosowanie podłoży odpowiednich dla danej<br />
metody.<br />
Możliwość uzyskania różnych warunków badania lekowrażliwości, wpływających<br />
na średnicę strefy, jasno przemawia za potrzebą standaryzacji metody<br />
dyfuzyjno-krążkowej. Jedynie przestrzeganie ustalonych parametrów metody<br />
umożliwia uzyskanie wartościowych wyników. Nieprawidłowości zaburzające<br />
przebieg badania mogą prowadzić do przedstawienia lekarzowi rażąco błędnych<br />
wyników.<br />
Precyzja i dokładność metody powinny być monit<strong>or</strong>owane za pomocą ustalonego,<br />
opisanego poniżej programu kontroli jakości. W ten sposób możliwa jest szybka<br />
identyfikacja i k<strong>or</strong>ekta błędów.<br />
135
OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI<br />
Kontrola jakości<br />
Potrzeba kontroli jakości testu<br />
lekowrażliwości<br />
Na końcowy wynik testu dyfuzyjno-krążkowego wpływa duża liczba zmiennych.<br />
Niektóre z nich, takie jak gęstość inoculum i temperatura inkubacji, łatwo<br />
kontrolować, jednak lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium rzadko znany jest dokładny skład podłoża<br />
komercyjnego lub różnice w jakości kolejnych serii. Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium nie może<br />
również odpowiadać za zawartość antybiotyków w krążkach. Wyniki testów<br />
muszą być ciągle monit<strong>or</strong>owane w programie kontroli jakości, który należy<br />
traktować jako element <strong>procedury</strong>.<br />
Precyzja i dokładność metody powinny być kontrolowane przez równoległe<br />
wykonywanie testów dla szczepu kontrolnego o znanej lekowrażliwości. Szczepy<br />
kontrolne i badane drobnoustroje podlegają tej samej procedurze. Uzyskane dla<br />
mikro<strong>or</strong>ganizmów kontrolnych wielkości stref powinny odpowiadać wartościom<br />
przedstawionym w tabeli 24. Powtarzające się uzyskiwanie wyników, które nie<br />
mieszczą się w określonym zakresie, jest przypuszczalnie efektem błędu<br />
technicznego lub użycia niewłaściwych odczynników. Należy sprawdzić każdy<br />
odczynnik i etap testu, odnaleźć i wyeliminować błąd.<br />
Standardowa procedura kontroli jakości<br />
Program kontroli jakości polega na równoległym prowadzeniu oznaczania<br />
wrażliwości dla szczepów kontrolnych i badanych. Kontrole należy przeprowadzać<br />
co tydzień lub dla co piątej serii badań i — dodatkowo — przy każdej<br />
nowej partii agaru Mueller-Hintona lub krążków.<br />
Standardowe szczepy do kontroli jakości<br />
Staphylococcus aureus (ATCC 25923)<br />
Escherichia coli (ATCC 25922)<br />
Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853)<br />
Powyższe szczepy można uzyskać z państwowych kolekcji szczepów. Są także<br />
dostępne komercyjnie w f<strong>or</strong>mie liofilizowanej uzyskanej z czystych hodowli.<br />
Hodowle szczepów wz<strong>or</strong>cowych do codziennego użytku powinny być prowadzone<br />
na skosach lub agarze odżywczym (zalecany jest agar tryptozowo-sojowy)<br />
i przechowywane w chłodziarce. Co 2 tygodnie należy przesiewać hodowle na<br />
świeże skosy.<br />
Przygotowanie inoculum<br />
Hodowle można zakładać na każdym podłożu płynnym i inkubować do chwili<br />
zmętnienia bulionu. Z każdego podłożapłynnego należy przesiać szczep na płytkę<br />
agarową i inkubować przez noc. Następnie pobrać pojedyncze kolonie i przeprowadzić<br />
badanie wrażliwości w sposób opisany na stronach 127 – 130.<br />
136
CZE˛ŚĆ I<br />
25<br />
24<br />
23<br />
22<br />
21<br />
20<br />
19<br />
18<br />
17<br />
16<br />
15<br />
14<br />
13<br />
12<br />
11<br />
10<br />
Data<br />
X<br />
X X X X<br />
X X<br />
X<br />
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10111213141516171819 202122232425262728293031<br />
Ryc. 16. Karta kontroli jakości antybiogramów.<br />
WHO 91093<br />
▲<br />
Akceptowalna<br />
średnica<br />
▼<br />
Nakładanie kra˛żków z antybiotykami<br />
Po posianiu inoculum na płytki, w sposób opisany na str. 129, nałożyć<br />
odpowiednie krążki na płytkę. Wybrane krążki dla każdego szczepu kontrolnego<br />
zostały wymienione w tabeli 24.<br />
Odczytywanie wyników<br />
Po 16 – 18 godzinach inkubacji należy zmierzyć linijką średnice stref zahamowania<br />
i zapisać, łącznie z datą badania, na specjalnej karcie kontroli jakości. Zapis<br />
powinien być prowadzony dla każdej kombinacji szczep-krążek. Karta zawiera<br />
diagram wielkości stref w milimetrach, z zaznaczonym zakresem wartości<br />
prawidłowych. Przykład takiej karty przedstawiono na ryc. 16. Jeśli wyniki<br />
systematycznie wykraczają poza dopuszczalne granice, należy podjąć działania,<br />
które poprawią jakość badania.<br />
Istotne odchylenia wyników, których nie można wyjaśnić technicznymi błędami<br />
w procedurze, mogą wskazywać na zanieczyszczenie, nagłą zmianę wrażliwości<br />
lub zmianę właściwości szczepu kontrolnego. Należy wówczas uzyskać z wiarygodnego<br />
źródła świeży szczep wz<strong>or</strong>cowy.<br />
137
Badania serologiczne<br />
Wprowadzenie<br />
Odczyny serologicznie, w przeciwieństwie do posiewów i badań mikrobiologicznych,<br />
wykrywając w próbkach klinicznych antygeny bakteryjne lub przeciwciała<br />
powstałe w odpowiedzi na nie, dostarczają jedynie pośrednich dowodów<br />
zakażenia. Testy te, ze względu na wysoką swoistość i czułość,sąobecnie szeroko<br />
stosowane w mikrobiologii.<br />
W odpowiedzi na pierwotne zakażenie patogennym drobnoustrojem większość<br />
pacjentów wytwarza zarówno przeciwciała IgM, jak i IgG. Po kilku tygodniach<br />
dominującą klasą przeciwciał stają się IgG i w konsekwencji tylko IgG pozostają<br />
w surowicy pacjenta. Kolejna infekcja wywołana przez ten sam patogen wywołuje<br />
odpowiedź z wytw<strong>or</strong>zeniem przeciwciał IgG. Ponieważ komórki wytwarzające<br />
przeciwciała zachowują pamięć immunologiczną, odpowiedź taka, w p<strong>or</strong>ównaniu<br />
z odpowiedzią pierwotną, jest zwykle szybsza i bardziej nasilona; jest to tak zwana<br />
odpowiedź wtórna.<br />
Poziom przeciwciał najczęściej oznaczany jest przez ,,miareczkowanie’’. Diagnostyczne<br />
miano jest największym rozcieńczeniem surowicy pacjenta, przy<br />
którym wykrywalne są jeszcze przeciwciała. Na przykład, jeśli przeciwciała<br />
wykrywane są w rozcieńczeniu 1:1024 i nie wyższym, miano surowicy wynosi<br />
1024. Surowica pobrana w ostrym okresie infekcji, przy podejrzeniu pierwotnego<br />
zakażenia, nosi nazwę surowicy fazy ostrej; surowica pobrana w czasie rekonwalescencji,<br />
zwykle 2 tygodnie później, nosi nazwę surowicy ozdrowieńca.<br />
Reakcja na antygen pojawia się niezależnie od okresu zakażenia, choć jej typ<br />
może być różny. Obecność przeciwciał IgG w pojedynczej próbce surowicy może<br />
wskazywać na ekspozycję w przeszłości, nie pozwala więc na rozpoznanie<br />
świeżej infekcji. Niekiedy antygen stymuluje również powstawanie przeciwciał<br />
reagujących krzyżowo z innymi antygenami. Ze względu na brak swoistości<br />
takich przeciwciał, badanie jednej próbki surowicy może prowadzić do niewłaściwej<br />
interpretacji wyników. W większości testów serologicznych należy wykonać,<br />
najlepiej jednocześnie, badanie surowicy pobranej w ostrym okresie ch<strong>or</strong>oby<br />
i surowicy ozdrowieńca; zapobiega to ewentualnym różnicom wynikającym<br />
z warunków przeprowadzania badania. Wzrost miana przeciwciał o dwa dwukrotne<br />
rozcieńczenia (np. z rozcieńczenia 1:8 do 1:32) świadczy zwykle o świeżym<br />
zakażeniu. Jest to tak zwany czterokrotny wzrost miana. Badanie pojedynczej<br />
próbki surowicy może być przydatne tylko w niektórych przypadkach, np.<br />
w diagnostyce zakażenia Mycoplasma pneumoniae, gdy wysokie miana lub<br />
obecność przeciwciał IgM wskazują na świeżą infekcję. Typ reakcji antygen-<br />
-przeciwciało zależy od rodzaju antygenu.<br />
Metody kontroli jakości<br />
Wiarygodność i spójność wyników badań serologicznych całkowicie zależą od<br />
metod kontroli jakości, przeprowadzanej przed, podczas i po każdym teście.<br />
Środki kontroli jakości są niezmiernie istotne ze względu na fałszywie dodatnie<br />
ifałszywie ujemne wyniki, które mogą istotnie wpływać na decyzje lekarza,<br />
dotyczące leczenia pacjenta. Na jakość badań serologicznych wpływa wiele<br />
138
CZE˛ŚĆ I<br />
czynników, do których zaliczane są: doświadczenie personelu <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>go,<br />
jakość zestawów i wyposażenie, jakość próbek, kontrole stosowane w testach <strong>or</strong>az<br />
interpretacja i wydawanie wyników. Po wykonaniu testu, należy wyrzucić zużyte<br />
materiały do pojemnika wypełnionego środkiem dezynfekującym, umyć i zdezynfekować<br />
ręce <strong>or</strong>az powierzchnię blatu.<br />
Wyposażenie<br />
Do wyposażenia lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium serologicznego należą: łaźnie wodne, cieplarki,<br />
chłodziarki, zamrażarki, pH-metry, wagi, wirówki, mikroskopy i wytrząsarki.<br />
Monit<strong>or</strong>ing i rutynowe przeglądy sprzętu są istotnym elementem programu<br />
zapewnienia jakości. Należy przestrzegać stałego serwisowania sprzętu z okresowymi<br />
przeglądami i ewentualną kalibracją lub naprawą. Dla każdego urządzenia<br />
należy prowadzić zapis dat przeglądu, serwisu i naprawy.<br />
Łaźnia wodna poza czasem jej wyk<strong>or</strong>zystania powinna być pozostawiana pusta,<br />
co miesiąc suszona i czyszczona. Temperaturę łaźni wodnej należy starannie<br />
kontrolować, nie dopuszczając do zmian większych niż ± 1°C; konieczny jest<br />
codzienny pomiar i zapis temperatury, również w trakcie działania. Wskazane jest<br />
stosowanie pokrywy, która zapobiega chłodzeniu powierzchni wody. Mieszaninę<br />
antygenu i przeciwciał można inkubować dopiero po uzyskaniu wymaganej<br />
temperatury i utrzymaniu jej co najmniej przez godzinę. Poziom wody powinien<br />
odpowiadać poziomowi płynu w umieszczonych w łaźni probówkach lub kolbach.<br />
Mikroskopy mają największe znaczenie przy wykonywaniu testu VDRL (Venereal<br />
Disease Research Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y, VDRL) <strong>or</strong>az testu immunoflu<strong>or</strong>escencji krętków<br />
w modyfikacji abs<strong>or</strong>pcyjnej (FTA-Abs) i muszą być utrzymywane w możliwie<br />
najlepszym stanie. Po użyciu okular, obiektyw i kondensat<strong>or</strong> mikroskopu należy<br />
przetrzeć miękką szmatką, usuwając resztki olejku i zanieczyszczenia. Nieużywany<br />
mikroskop przechowuje się pod przykryciem, zabezpieczony przed wilgocią.<br />
Intensywność lampy rtęciowej w mikroskopie flu<strong>or</strong>escencyjnym należy sprawdzać<br />
regularnie z użyciem światłomierza.<br />
Należy kontrolować działanie wytrząsarek do testów VDRL <strong>or</strong>az szybkiego testu<br />
do wykrywania reagin w osoczu (RPR) i k<strong>or</strong>ygować wszelkie zmiany, które mogą<br />
mieć niek<strong>or</strong>zystny wpływ na reakcję aglutynacji. Mechaniczna wytrząsarka<br />
powinna być regularnie oliwiona.<br />
Materiały<br />
Szklane naczynia i igły używane w testach serologicznych muszą spełniać<br />
określone parametry.<br />
Nie należy k<strong>or</strong>zystać z uszczerbionych lub p<strong>or</strong>ysowanych naczyń, płytek<br />
i szkiełek. Użycie brudnych lub niewłaściwie oczyszczonych szklanych naczyń,<br />
które mogą zawierać <strong>or</strong>ganiczne zanieczyszczenia, jest główną przyczyną<br />
fałszywych wyników. Przy stanowisku przeznaczonym do mycia należy umieścić<br />
pisemne instrukcje. Główne etapy mycia powinny obejmować: wstępne płukanie,<br />
mycie właściwym detergentem lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnym, płukanie wodą z kranu, a następnie<br />
wodą destylowaną, suszenie; należy upewnić się,że detergent został usunięty.<br />
139
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
Wszystkie pipety należy zanurzyć w detergencie tak, aby roztwór wniknął do<br />
wewnątrz. Płukać pod bieżącą wodą co najmniej 30 minut, a następnie w wodzie<br />
destylowanej. Szklane płytki używane do odczynów VDRL muszą zostać<br />
starannie oczyszczone z pozostałości detergentu i resztek olejku. Należy unikać<br />
przedłużonego moczenia w detergencie ze względu na możliwość uszkodzenia<br />
pierścieni ceramicznych na płytkach. Szklane płytki z pierścieniami z parafiny<br />
powinny być czyszczone z użyciem właściwych rozpuszczalników <strong>or</strong>ganicznych<br />
(np. benzyny).<br />
W odczynie RPR i VDRL do przygotowywania i rozcieńczania antygenu<br />
wyk<strong>or</strong>zystuje się igły kalibrowane. W zestawie do odczynu RPR znajduje się<br />
igła, którą należy sprawdzić przed użyciem, określając liczbę kropli/ml. Prawidłowo<br />
funkcjonująca 20-podziałkowa igła powinna dozować 90 kropli/ml. Nie<br />
należy stosować igieł działających niewłaściwie. Po użyciu umyć wodą destylowaną.<br />
Do testu VDRL przygotować dwie igły, odłamując czubki za pomocą<br />
szczypiec. Sprawdzić igłę określając liczbę kropli/ml: 18-podziałkowa igła<br />
powinna dozować 60 kropli/ml, a 21 – 22-podziałkowa 100 kropli/ml. Każdą<br />
nieprawidłowo działającą igłę należy odrzucić lub wyregulować, dociskając lub<br />
zwalniając koniec. Po użyciu umyć w wodzie destylowanej, 70% etanolu<br />
i acetonie.<br />
Odczynniki<br />
Związki chemiczne stosowane w serologii muszą mieć jakość odczynników<br />
i spełniać kryteria określonej <strong>procedury</strong>. Muszą być przechowywane zgodnie<br />
z zaleceniami producenta.<br />
Do przygotowania odczynników powinna być używana wysokiej jakości woda<br />
destylowana o pH 7,0. Należy przechowywać ją w odpowiednio opisanym z datą,<br />
ciepłoodp<strong>or</strong>nym szklanym naczyniu lub plastikowej butli ze szczelnie domkniętą<br />
zakrętką.<br />
Fizjologiczny roztwór soli jest używany sam lub jako roztwór buf<strong>or</strong>owany, na<br />
przykład buf<strong>or</strong>em fosf<strong>or</strong>anowym. W wilgotnym klimacie, w celu usunięcia wody,<br />
chl<strong>or</strong>ek sodu należy suszyć g<strong>or</strong>ącym powietrzem w 160 – 180°C przez 30 minut.<br />
Sól rozpuścić w wodzie destylowanej lub demineralizowanej i przechowywać<br />
w ciepłoodp<strong>or</strong>nym, odpowiednio opisanym z datą szklanym naczyniu lub<br />
plastikowej butli, ze szczelnie zamkniętą zakrętką. Przed użyciem buf<strong>or</strong>u<br />
oznaczyć jego pH.<br />
Surowice zawierające makroskopowo widoczne cząsteczki należy odwirować<br />
w 3000 g przez 10 minut i do testów użyć supernatantu. Osocze z hemolizą lub<br />
zanieczyszczone nie powinno być użyte. Inaktywowaną surowicę do testów<br />
należy przygotować, ogrzewającw56°C przez 30 minut. Jeśli nie zostanie zużyta<br />
w ciągu 4 godzin od inaktywacji, należy jąponownie inaktywować, ogrzewając<br />
w 56°C przez 10 minut. Wszystkie surowice przed użyciem pozostawić<br />
w temperaturze pokojowej.<br />
W rozdziale zostaną szczegółowo omówione niektóre testy serologiczne najczęściej<br />
wykonywane w lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach medycznych. Należą do nich testy do<br />
diagnostyki kiły, test Wrighta do diagnostyki brucelozy i test wykrywający<br />
antystreptolizynę O do diagnostyki późnych powikłań po zakażeniach paci<strong>or</strong>kowcowych.<br />
140
CZE˛ŚĆ I<br />
Każdy opis <strong>procedury</strong> odnosi się do badań wykonywanych z użyciem komercyjnych<br />
zestawów do przeprowadzania testów. Gotowe zestawy są wytwarzane przez<br />
wielu producentów, zawierają w opakowaniu szczegółowe instrukcje, które przed<br />
użyciem należy uważnie przeczytać.<br />
Reakcje serologiczne<br />
Odczyn kłaczkuja˛cy i precypitacji<br />
W odczynie kłaczkującym, w wyniku reakcji rozpuszczonego antygenu z przeciwciałami,<br />
powstaje precypitat, który można oglądać zarówno pod mikroskopem,<br />
jak i gołym okiem. Po zmieszaniu odczynników prawie natychmiast<br />
pojawia się wstępne wiązanie antygenu przez przeciwciała. Dalsze f<strong>or</strong>mowanie<br />
większych, widocznych kłaczków wymaga godziny lub dłuższego czasu i jest<br />
zależne od temperatury. Reakcja zachodzi szybciej w strefie ,,równoważnej’’,<br />
optymalnego stosunku antygen-przeciwciało. Probówka z najszybciej tw<strong>or</strong>zącym<br />
się precypitatem jest dobrym wskaźnikiem równoważności. Najszerzej stosowanymi<br />
odczynami kłaczkującymi są testy VDRL i RPR. Obydwa wyk<strong>or</strong>zystywane<br />
w diagnostyce kiły (wywołanej przez Treponema pallidum) i innych zakażeń<br />
krętkowych.<br />
Odczyn kłaczkujący dostarcza jakościowego dowodu reakcji antygen-przeciwciało,<br />
ale nie wskazuje, czy obecna jest jedna, czy kilka reakcji antygen-<br />
-przeciwciało. Jeśli jednak test przeprowadzany jest na półpłynnym żelu, ze<br />
względu na różną zdolność do dyfuzji i współczynniki migracji antygenów,<br />
można reakcje te rozróżnić.<br />
Odczyn aglutynacji<br />
W odczynie aglutynacji reagent, którym może być antygen lub przeciwciało,<br />
jest osadzony lub zaabs<strong>or</strong>bowany na mikrocząsteczce. Nośnikami reagentów<br />
mogą być różne cząsteczki, np. lateks, żelatyna, mikrogranulki, bakterie lub<br />
krwinki czerwone. Technika ta nosi również nazwę biernej aglutynacji. Jeśli<br />
nośnikiem są erytrocyty, technikę określa się mianem hemaglutynacji biernej,<br />
jeżeli są to komórki gronkowca, technika nosi nazwę koaglutynacji. Po dodaniu<br />
swoistej surowicy odp<strong>or</strong>nościowej komórki lub inne cząstki tw<strong>or</strong>zą sieć połączeń<br />
i w rezultacie aglutynat z wyraźnym supernatantem. Używając surowicy<br />
o znanej swoistości można przeprowadzać identyfikację nieznanych mikro<strong>or</strong>ganizmów<br />
lub ich antygenów. Test można wykonać na szkiełku i odczytać<br />
wynik makroskopowo lub pod mikroskopem w małym powiększeniu. Odczyn<br />
aglutynacji wyk<strong>or</strong>zystuje się także do oceny miana aglutynin przeciwbakteryjnych<br />
w surowicy pacjentów z nieznaną ch<strong>or</strong>obą. Wzrost miana podczas<br />
trwania ch<strong>or</strong>oby przemawia jednoznacznie za związkiem przyczynowo-<br />
-skutkowym.<br />
Aglutynacja szybciej zachodzi w wyższych temperaturach (35 – 56°C) i przy<br />
ruchu (np. wstrząsanie, mieszanie lub wirowanie), które ułatwiają kontakt między<br />
antygenem i przeciwciałem. Proces aglutynacji wymaga obecności soli. Potencjalnie<br />
poważny problem stanowi prozona: zahamowanie reakcji serologicznej<br />
wskutek nadmiaru antygenu lub przeciwciał. Prozona daje fałszywie ujemny<br />
wynik testu; tego błędu można jednak uniknąć badając seryjne rozcieńczenia<br />
surowicy.<br />
141
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
Powszechnie stosowany test aglutynacji wyk<strong>or</strong>zystuje Staphylococcus aureus,<br />
zawierający na swojej powierzchni białko A. Jest to białko wiążące fragment Fc<br />
przeciwciał IgG. Gronkowce opłaszczone przeciwciałami IgG w obecności<br />
swoistego antygenu dają wyraźnie widoczną aglutynację. Odczyn stosowany jest<br />
głównie do identyfikacji drobnoustrojów hodowanych z próbek klinicznych lub<br />
do wykrywania antygenów bakteryjnych w płynach ustrojowych zakażonych<br />
pacjentów (płyn mózgowo-rdzeniowy w przypadku zapalenia opon mózgowo-<br />
-rdzeniowych).<br />
Odczyny aglutynacji wyk<strong>or</strong>zystywane są do wykrywania wirusa Epsteina-Barr<br />
(mononukleoza zakaźna), rotawirusów, różyczki <strong>or</strong>az antygenów bakteryjnych<br />
(m.in. Haemophilus i Streptococcus A i B).<br />
Odczyn immunoflu<strong>or</strong>escencji<br />
W odczynach immunoflu<strong>or</strong>escencji immun<strong>or</strong>eagent (antygen lub przeciwciało)<br />
znakowany jest barwnikiem flu<strong>or</strong>escencyjnym, na przykład flu<strong>or</strong>esceiną lub<br />
rodaminą, a reakcja antygenu z przeciwciałem wykrywana jest w mikroskopie<br />
flu<strong>or</strong>escencyjnym. W odczynie immunoflu<strong>or</strong>escencji bezpośredniej do wykrycia<br />
obecności specyficznego antygenu wyk<strong>or</strong>zystuje się znaczone flu<strong>or</strong>esceiną<br />
przeciwciała. Odczyny są przydatne w szybkiej identyfikacji Chlamydia trachomatis,<br />
C. psittaci, Rickettsia spp., Streptococcus pyogenes, B<strong>or</strong>detella pertussis,<br />
C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae, Legionella pneumophila i innych drobnoustrojów<br />
izolowanych z próbek klinicznych.<br />
W odczynie immunoflu<strong>or</strong>escencji pośredniej (indirect flu<strong>or</strong>escent antibody<br />
— IFA) wykonuje się badania seryjnych rozcieńczeń surowicy pacjenta ze<br />
specyficznym antygenem, a dla uwidocznienia reakcji dodaje się znakowane<br />
flu<strong>or</strong>esceiną przeciwciała przeciw ludzkim immunoglobulinom IgG lub IgM. Na<br />
przykład, w serodiagnostyce kiły, szkiełko z ads<strong>or</strong>bowanym antygenem Treponema<br />
pallidum zanurza się w surowicy pacjenta i spłukuje. Następnie na szkiełku<br />
umieszcza się znakowane flu<strong>or</strong>esceiną przeciwciała przeciw ludzkim immunoglobulinom,<br />
spłukuje i preparat ogląda się w mikroskopie flu<strong>or</strong>escencyjnym. Jeśli<br />
surowica pacjenta zawiera specyficzne przeciwciała przeciw Treponema pallidum,<br />
widoczne są jasno flu<strong>or</strong>yzujące krętki. Przy braku specyficznych przeciwciał<br />
przeciwkrętkowych w surowicy pacjenta krętki nie świecą. Test IFA może<br />
być również wyk<strong>or</strong>zystywany do identyfikacji innych bakterii, na przykład<br />
prątków gruźlicy, a z powodu większej liczby znakowanych flu<strong>or</strong>esceiną<br />
przeciwciał łączących się z antygenem stanowi często czulszą metodę niż test<br />
immunoflu<strong>or</strong>escencji bezpośredniej.<br />
Odczyny serologiczne w diagnostyce kiły<br />
Odczyny serologiczne wykonywane w diagnostyce kiły to testy krętkowe<br />
i niekrętkowe. Do odczynów niekrętkowych należą: VDRL i RPR. Użyty w nich<br />
antygen przygotowywany jest z antygenów niekrętkowych, takich jak kardiolipina-lecytyna<br />
i wykrywa podobne do przeciwciał reaginy, które są obecne<br />
w surowicy wielu pacjentów zkiłą, ale mogą także występować w surowicy<br />
pacjentów z innymi ostrymi i przewlekłymi sch<strong>or</strong>zeniami. Testy są praktyczne,<br />
niedrogie i powtarzalne, mimo że nie całkiem swoiste. Mogą potwierdzać<br />
rozpoznanie wczesno- lub późnoobjawowej kiły lub być podstawą rozpoznania<br />
142
CZE˛ŚĆ I<br />
kiły późnej. Są lepsze niż odczyny krętkowe w monit<strong>or</strong>owaniu pacjentów po<br />
leczeniu. VDRL jest skutecznym narzędziem w badaniach epidemiologicznych<br />
kiły i innych ch<strong>or</strong>ób krętkowych.<br />
Odczyny z antygenami Treponema pallidum wykrywają swoiste przeciwciała,<br />
powstające w odpowiedzi na zakażenie kiłą. Sąwyk<strong>or</strong>zystywane do potwierdzenia<br />
dodatnich wyników testów niekrętkowych. Odczyn immunoflu<strong>or</strong>escencji<br />
krętków w modyfikacji abs<strong>or</strong>pcyjnej (FTA-Abs) i odczyn hemaglutynacji<br />
Treponema pallidum (TPHA) są wysoce swoiste i czułe, ale nie różnicują<br />
przebytych i aktywnych zakażeń kiły; nie można ich stosować w ocenie wyników<br />
leczenia.<br />
Odczyn VDRL<br />
W odczynie wyk<strong>or</strong>zystuje się cząsteczki cholesterolu opłaszczone kompleksem<br />
kardiolipina-lecytyna. Inaktywowaną surowicę lub płyn mózgowo-rdzeniowy<br />
wytrząsa się na wytrząsarce z zawiesiną antygenu VDRL przez podany okres. Jeśli<br />
reaginy są obecne w badanym płynie, obserwuje się mikroflokulację.<br />
Odczyn VDRL jest wysoko dodatni we wczesnej kile. Po skutecznym leczeniu<br />
miano stopniowa spada i zwykle w ciągu 1 – 2 lat odczyn staje się ujemny.<br />
Wpóźnej fazie ch<strong>or</strong>oby przez wiele lat, nawet po skutecznym leczeniu, surowica<br />
może wykazywać dodatnie reakcje o niskim mianie (np. 1:8 lub mniejszym).<br />
Reaktywność może spontanicznie zanikać u20– 30% nieleczonych pacjentów<br />
w fazie latentnej ch<strong>or</strong>oby, a nawet częściej w późnej fazie kiły.<br />
Fałszywie dodatnie wyniki obserwuje się z powodu podobieństwa antygenu<br />
VDRL do tkanek gospodarza. Fałszywe wyniki mogą występować u osób<br />
zdrowych, jakkolwiek często związane są z określonymi ch<strong>or</strong>obami lub przebytym<br />
szczepieniem. Fałszywie dodatnie reakcje, najczęściej o niskim mianie (1:8<br />
lub mniej), obserwowane są u osób z wirusowymi i bakteryjnymi zakażeniami<br />
(atypowe zapalenie płuc, ch<strong>or</strong>oba papuzia, mononukleoza zakaźna i zapalenie<br />
wątroby), podczas ciąży lub po niedawnym szczepieniu. Utrzymujące się<br />
fałszywie dodatnie wyniki, zwykle o dużym mianie, związane są z obecnością<br />
autoprzeciwciał (czynnik reumatoidalny), występują u pacjentów z trądem,<br />
gruźlicą, zaburzeniami odp<strong>or</strong>ności (np. toczeń rumieniowaty, kolagenozy, ch<strong>or</strong>oby<br />
reumatyczne, zespół Sjögrena, dysgammaglobulinemia), rzadziej u osób<br />
z malarią lub uzależnionych od heroiny. Dodatni i słabo dodatni wynik odczynu<br />
VDRL nie powinien być traktowany jako ostateczny dowód kiły, podobnie jak<br />
pojedynczy ujemny wynik nie wyklucza rozpoznania. Dla każdej słabo dodatniej<br />
i dodatniej próbki, przy braku klinicznych objawówkiły, należy wykonać badania<br />
zużyciem odczynów krętkowych FTA-Abs lub TPHA.<br />
Materiały i odczynniki zawarte w zestawie<br />
do odczynu VDRL<br />
Buf<strong>or</strong>owany fizjologiczny roztwór soli<br />
Zestaw kontrolnych surowic (ujemna, słabo dodatnia, dodatnia)<br />
Antygen VDRL<br />
143
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
Dodatkowe materiały i odczynniki<br />
potrzebne do odczynu VDRL<br />
Alkohol absolutny i aceton<br />
Szkiełko do aglutynacji o wymiarach około5× 7,5 cm z zagłębieniami o średnicy<br />
16 mm i głębokości 1,75 mm do badania płynu mózgowo-rdzeniowego<br />
Odpowiednia liczba fiolek<br />
Woda destylowana lub dejonizowana<br />
Szklane płytki z 12 parafinowymi lub ceramicznymi pierścieniami o średnicy<br />
około 14 mm do badania surowicy<br />
Kom<strong>or</strong>a wilgotna<br />
Igły podskórne bez skosu: 18-podziałkowe do badań surowicy i 21- lub<br />
22-podziałkowe do badań płynu mózgowo-rdzeniowego<br />
Stoper<br />
Mikroskop świetlny o powiększeniu × 10 okular i × 10 obiektyw<br />
Wytrząsarka o ruchu kolistym o średnicy 2 cm, szybkości 180 obr./min,<br />
w ustawieniu poziomym, z automatycznym pomiarem czasu<br />
pH-metr<br />
Pipety serologiczne: 5,0 ml, 1,0 ml i 0,2 ml<br />
Sterylne roztw<strong>or</strong>y soli (0,85% i 10%)<br />
Strzykawka typu Luer, 1 lub 2 ml<br />
Butelka z zawiesiną antygenu VDRL, 30-ml, okrągła, zamykana szklanym<br />
k<strong>or</strong>kiem, z wąskim wlotem, o średnicy około 35 mm, z płaskim dnem<br />
Łaźnia wodna (56°C)<br />
Przygotowanie antygenu VDRL<br />
i surowicy kontrolnej<br />
Antygen VDRL jest alkoholowym roztw<strong>or</strong>em lipidów (kardiolipiny i lecytyny)<br />
i cholesterolu. Są to substancje nierozpuszczalne w wodzie. Przygotować świeżą<br />
zawiesinę w dniu użycia, ponieważ antygen VDRL jest niestabilny. Zawartość<br />
ampułki z antygenem rozlać do fiolek do przechowywania. Upewnić się,że fiolki<br />
są szczelnie zamknięte i przechowywać w ciemności w 15 – 30°C. Wyjmować<br />
antygen według potrzeb.<br />
Po otwarciu butelkę z buf<strong>or</strong>owanym roztw<strong>or</strong>em soli przechowywać wchłodziarce.<br />
Nie używać, jeśli pojawi się zmętnienie.<br />
Do kontrolnej surowicy dolać 3 ml destylowanej lub dejonizowanej wody.<br />
Nadwyżkę przygotowanych na dany dzień rozpuszczonych surowic podzielić na<br />
odpowiednią liczbę p<strong>or</strong>cji (dzienne zapotrzebowanie) i przechowywać w temperaturze<br />
–20°C do miesiąca. Nie zamrażać ponownie po rozmrożeniu. Surowice,<br />
przeznaczone do wyk<strong>or</strong>zystania w ciągu dnia, przechowywać wchłodziarce<br />
w2– 8°C.<br />
Przygotowanie zawiesiny antygenu VDRL<br />
1. Ogrzać antygen i buf<strong>or</strong>owany roztwór soli do temperatury pokojowej.<br />
Sprawdzić pH buf<strong>or</strong>owanego roztw<strong>or</strong>u soli, wartość nie powinna przekraczać<br />
pH 6,0 ± 0,1.<br />
2. Do butelki z zawiesiną antygenu dodać pipetą 0,4 ml buf<strong>or</strong>owanego roztw<strong>or</strong>u<br />
soli i delikatnie przechylić naczynie, rozprowadzając warstwę płynu na dnie.<br />
144
CZE˛ŚĆ I<br />
3. Za pomocą 1-mililitrowej kalibrowanej pipety odmierzyć 0,5 ml roztw<strong>or</strong>u<br />
antygenu i dodać w opisany poniżej sposób:<br />
• Trzymać pipetę w 1 / 3 wysokości butelki. Nie dotykać roztw<strong>or</strong>u soli.<br />
• Mieszając ręcznie ruchem kolistym o średnicy około 5 cm, dodawać po<br />
kropli antygenu.<br />
• Wkraplać antygen w ten sposób przez około 6 sekund, a następnie dodać<br />
pozostały antygen z pipety.<br />
• Mieszać jeszcze przez 10 sekund.<br />
4. Dodać 4,1 ml buf<strong>or</strong>owanego roztw<strong>or</strong>u soli, wlewając gopościankach butelki.<br />
5. Zamknąć butelkę szklanym k<strong>or</strong>kiem i wstrząsać wgórę iwdół około 30 razy<br />
przez 10 sekund.<br />
6. Pozostawić zawiesinę antygenu na co najmniej 10 minut. Wstrząsnąć<br />
delikatnie przed użyciem. Zawiesinę należy wyk<strong>or</strong>zystać w ciągu 8 godzin.<br />
7. W przypadku badania płynu mózgowo-rdzeniowego rozcieńczyć antygen 10%<br />
roztw<strong>or</strong>em soli w stosunku 1:2. Wstrząsać butelkę delikatnie przez 10 sekund,<br />
pozostawić na co najmniej 5 minut i użyć najpóźniej w ciągu 2 godzin.<br />
Jakościowy odczyn VDRL<br />
1. Za pomocą 1,0-mililitrowej pipety kilkakrotnie wymieszać, a następnie<br />
umieścić 0,05 ml inaktywowanej surowicy we wgłębieniu szklanej płytki<br />
VDRL.<br />
2. Rozprowadzić surowicę okrężnymi ruchami końcówki pipety, tak by pokryła<br />
całą wewnętrzną powierzchnię parafinowego lub ceramicznego wgłębienia.<br />
Jedynie użycie czystych płytek umożliwia równomierne rozprowadzenie<br />
surowicy.<br />
3. Trzymając poziomo strzykawkę z 18-podziałkową igłą, do surowicy dodać<br />
uważnie 1 kroplę antygenu (1/60 ml). Nie dotykać surowicy igłą.<br />
4. Płytki w kom<strong>or</strong>ze wilgotnej wstawić na 4 minuty do wytrząsarki. Jeśli<br />
wytrząsarka nie jest dostępna, płytki kołysać ręcznie, ciągłym ruchem kolistym<br />
przez 4 minuty.<br />
5. Natychmiast po wymieszaniu ocenić preparat pod mikroskopem w powiększeniu<br />
× 10 okular i × 10 obiektyw.<br />
6. Odczytać reakcje w poniższy sposób:<br />
Średnie i duże grudki<br />
R — Reactive/Dodatnia<br />
Drobne grudki<br />
W — Weakly reactive/Słabo dodatnia<br />
Brak grudek lub bardzo słaby ślad N — Non-reactive/Ujemna<br />
Surowica słabo dodatnia lub wykazująca śladowy odczyn, ze względu na<br />
obserwowane niekiedy reakcje prozony, powinna zostać powtórnie zbadana<br />
w teście półilościowym.<br />
Półilościowy odczyn VDRL<br />
1. Przygotować serie podwójnych rozcieńczeń inaktywowanej surowicy w 0,85%<br />
NaCl (1:2, 1:4, 1:8, 1:16, 1:32).<br />
2. Dla każdego rozcieńczenia surowicy przeprowadzić badanie jakościowe.<br />
3. Zapisać wyniki i zgodnie z poniższymi przykładami określić najwyższe<br />
dodatnie rozcieńczenie surowicy (nie słabo dodatnie):<br />
4. W przypadku dodatnich wyników obserwowanych w rozcieńczeniu 1:32<br />
przygotować kolejne podwójne rozcieńczenia w 0,85% NaCl (1:64, 1:128<br />
i 1:256) i przeprowadzić ponownie badanie jakościowe.<br />
145
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
Surowica<br />
nierozcieńczona<br />
Rozcieńczenie<br />
1:2 1:4 1:8 1:16 1:32<br />
Wynik<br />
W N N N N N Słabo dodatni, bez rozcieńczenia<br />
R W N N N N Dodatni, bez rozcieńczenia<br />
R R W N N N Dodatni, rozcieńczenie 1:2<br />
R R R W N N Dodatni, rozcieńczenie 1:4<br />
W W R R W N Dodatni, rozcieńczenie 1:8<br />
N (sz<strong>or</strong>stki) W R R R N Dodatni, rozcieńczenie 1:16<br />
W — Weakly reactive/reakcja słabo dodatnia<br />
R — Reactive/reakcja dodatnia<br />
N — Non-reactive/reakcja ujemna<br />
Odczyn RPR<br />
Zawiesina antygenu w teście RPR zawiera cząsteczki węgla pozwalające na<br />
makroskopowe uwidocznienie odczynu kłaczkującego. Główne różnice w stosunku<br />
do odczynu VDRL dotyczą użycia utrwalonego antygenu, kartoników zamiast<br />
płytek, możliwości wykonania badania zarówno z surowicą, jak i z osoczem, bez<br />
konieczności inaktywacji surowicy. Potrzebna jest niewielka ilość próbki, można<br />
użyć również osocza z krwi włośniczkowej. Testu RPR nie stosuje się do badania<br />
płynu mózgowo-rdzeniowego.<br />
W odczynie RPR antygen jest gotowy do użycia. Nie wymaga wcześniejszego<br />
przygotowania czy rozcieńczenia. Termin ważności nieotwartego, przechowywanego<br />
w chłodziarce antygenu, wynosi jeden rok. Otwarty, przechowywany<br />
wchłodziarce w plastikowym dozowniku, utrzymuje swoją aktywność przez<br />
3 miesiące. Test RPR jest nieco bardziej czuły, prostszy i szybszy niż test VDRL.<br />
Fałszywie dodatnie wyniki uzyskuje się nieznacznie częściej niż w odczynie<br />
VDRL. Niektóre zestawy do testów wymagają użycia wytrząsarki do wymieszania<br />
reagentów, podczas gdy w innych można wymieszać je ręcznie.<br />
Materiały i odczynniki zawarte w zestawie<br />
do odczynu RPR<br />
Igła dozująca 60 kropli/ml zawiesiny antygenu<br />
Surowice kontrolne, dodatnia i ujemna<br />
Jedn<strong>or</strong>azowe zakraplacze do odmierzenia 50 µl surowicy lub osocza<br />
Kartoniki RPR pokryte warstwą plastiku, każdy z dwoma rzędami po pięć<br />
dołeczków<br />
Gotowa zawiesina antygenu RPR<br />
Mieszadełka<br />
Dodatkowe materiały i odczynniki<br />
potrzebne do odczynu RPR<br />
Jedn<strong>or</strong>azowy zakraplacz<br />
Dermatograf<br />
Kom<strong>or</strong>a wilgotna<br />
Wytrząsarka o ruchach kolistych o średnicy 2 cm, szybkości 180 obr./min,<br />
w ustawieniu poziomym, z automatycznym pomiarem czasu<br />
Sterylny roztwór NaCl (0,85%)<br />
146
CZE˛ŚĆ I<br />
Jakościowy odczyn RPR<br />
1. Wyjąć zestaw odczynników z lodówki i pozostawić do ogrzania do temperatury<br />
pokojowej.<br />
2. Przygotować surowicę kontrolną, dodając wskazaną objętość wody destylowanej.<br />
3. Opisać każdy dołeczek na kartoniku RPR lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnym numerem badania,<br />
pozostawiając miejsce dla dodatniej, słabo dodatniej i ujemnej surowicy<br />
kontrolnej.<br />
4. Za pomocą jedn<strong>or</strong>azowego zakraplacza umieścić 50 µl surowicy lub osocza<br />
w odpowiednim dołeczku. Dla każdej próbki użyć nowego zakraplacza.<br />
5. Delikatnie wstrząsnąć zawiesiną antygenu i do każdego dołeczka, dozującą<br />
igłą z zestawu, dodać bezkontaktowo kroplę antygenu. Ostrożnie wymieszać<br />
zawiesinę antygenu z surowicą. Dla każdej próbki użyć nowego mieszadełka.<br />
Dokładnie rozprowadzić.<br />
6. Kartoniki w kom<strong>or</strong>ze wilgotnej wstawić na 8 minut na wytrząsarkę. Jeśli<br />
wytrząsarka nie jest dostępna, kartoniki kołysać ręcznie, ciągłym ruchem<br />
kolistym przez 2 minuty, następnie umieścić na 6 minut w wilgotnej kom<strong>or</strong>ze<br />
zawierającej zwilżoną bibułę lub inny materiał. Wyjąć kartonik i obracać przez<br />
chwilę, do uzyskania końcowego wyniku. Uważać, aby nie zmieszać próbek ze<br />
sobą.<br />
7. Po zdjęciu z wytrząsarki obejrzeć kartoniki w dobrym świetle. Dodatnia<br />
surowica kontrolna powinna wykazywać wyraźnie widoczną reakcję. Ujemna<br />
surowica kontrolna nie wykazuje reakcji. Krótkie obracanie i przechylanie<br />
kartonika w rękach może pomóc w zróżnicowaniu słabo dodatnich i ujemnych<br />
próbek.<br />
8. Zapisać wynik badania:<br />
• Małe lub duże kłaczkowate skupiska: dodatni.<br />
• Jednolite zmętnienie zawiesiny cząsteczek: ujemny.<br />
9. Przygotować seryjne rozcieńczenia każdej dodatniej surowicy w celu oznaczenia<br />
miana.<br />
Półilościowy odczyn RPR<br />
1. Wyjąć zestaw odczynników z lodówki i pozostawić do ogrzania do<br />
temperatury pokojowej.<br />
2. Opisać rząd 5 dołeczków na kartoniku RPR lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnym numerem<br />
badania.<br />
3. Za pomocą jedn<strong>or</strong>azowego zakraplacza dodać do każdego dołeczka po<br />
1 kropli roztw<strong>or</strong>u NaCl (0,85%). Nie rozprowadzać.<br />
4. Za pomocą nowego zakraplacza nanieść 1 kroplę próbki surowicy do<br />
pierwszego dołeczka. Wymieszać zakraplaczem (zaciągając i wypuszczając<br />
zawartość 5 – 6-krotnie; unikać tw<strong>or</strong>zenia się pęcherzyków).<br />
5. Przenieść 50 µl mieszaniny (rozcieńczenie 1:2) do następnego dołeczka.<br />
Wymieszać. Powtórzyć całą czynność do piątego dołeczka włącznie (rozcieńczenie<br />
1:32). Usunąć 50 µl mieszaniny z ostatniego rozcieńczenia.<br />
6. Rozprowadzić przygotowane próbki w dołeczkach, rozpoczynając<br />
od najwyższego rozcieńczenia. Dla każdej próbki użyć nowego mieszadełka.<br />
7. Za pomocą dozującej igły dodać bezkontaktowo do każdego dołeczka<br />
1 kroplę delikatnie wstrząśniętego antygenu. Ostrożnie wymieszać zawiesinę<br />
antygenu z surowicą. Dokładnie rozprowadzić. Do każdej próbki użyć<br />
nowego mieszadełka.<br />
147
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
8. Kartoniki w kom<strong>or</strong>ze wilgotnej wstawić na 8 minut na wytrząsarkę. Jeśli<br />
wytrząsarka nie jest dostępna, kartoniki kołysać ręcznie, ciągłym ruchem<br />
kolistym przez 2 minuty, następnie umieścić na 6 minut w wilgotnej kom<strong>or</strong>ze<br />
zawierającej mokrą bibułkę lub inny materiał. Wyjąć kartonik i obracać przez<br />
chwilę, do uzyskania końcowego wyniku. Uważać, aby nie zmieszać próbek<br />
ze sobą.<br />
9. Po zdjęciu z wytrząsarki obejrzeć kartoniki w dobrym świetle. Najwyższe<br />
rozcieńczenie z widoczną makroskopowo reakcją jest mianem próbki.<br />
10. Jeśli próbka jest dodatnia przy 1:32, należy wykonać dodatkowe serie<br />
rozcieńczeń. Przygotować roztwór 1:16 z NaCl (0,85%), a następnie<br />
w opisany wyżej sposób rozcieńczyć surowicę.<br />
Odczyn immunoflu<strong>or</strong>escencji krętków<br />
w modyfikacji abs<strong>or</strong>pcyjnej<br />
(FTA-Abs)<br />
W teście FTA-Abs wyk<strong>or</strong>zystuje się utrwalony acetonem na szkiełku antygen<br />
Treponema pallidum (szczep Nicholsa). Można również użyć zawieszonych<br />
w roztw<strong>or</strong>ze soli liofilizowanych komórek T. pallidum. Inaktywowaną surowicę<br />
pacjenta inkubuje się z krętkami Reitera, wiążącymi niespecyficzne przeciwciała<br />
krętkowe. Po abs<strong>or</strong>pcji surowicę umieszcza się na szkiełku. Specyficzne<br />
przeciwciała z surowicy wiążą się na powierzchni komórek krętków. Po spłukaniu<br />
dodaje się koniugatu znakowanych flu<strong>or</strong>escencyjnie (izotiocyjanian flu<strong>or</strong>esceiny)<br />
przeciwciał przeciw ludzkim immunoglobulinom. Koniugat zostanie związany<br />
przez przeciwciała obecne na powierzchni krętków i uwidoczniony w mikroskopie<br />
flu<strong>or</strong>escencyjnym.<br />
Dodatni odczyn pojawia się trzy tygodnie po zakażeniu i utrzymuje się<br />
u nieleczonych pacjentów Może być także obserwowany kilka lat po skutecznym<br />
leczeniu we wczesnej fazie i przetrwać u ch<strong>or</strong>ych, u których terapię wprowadzono<br />
dopiero w późnej fazie ch<strong>or</strong>oby. Dodatni wynik testu z dużym prawdopodobieństwem<br />
wskazuje na zakażenie kiłą. Fałszywie ujemne wyniki uzyskuje się<br />
wyjątkowo rzadko i związane są prawdopodobnie ze złą jakością antygenu.<br />
Fałszywie dodatnie wyniki mogą być efektem obniżonej jakości odczynników,<br />
a w rezultacie niedostatecznej eliminacji nieswoistych przeciwciał w procesie<br />
abs<strong>or</strong>pcji. Fałszywie dodatnie wyniki obserwowano również u pacjentów z marskością<br />
wątroby, zapaleniem żołędzi, kolagenozą, opryszczką narządów płciowych,<br />
toczniem rumieniowatym i bardzo rzadko u kobiet w ciąży <strong>or</strong>az u zdrowych<br />
osób z nieznanych przyczyn.<br />
Wykazano krzyżową reakcję między T. pallidum i B<strong>or</strong>relia burgd<strong>or</strong>feri (ch<strong>or</strong>oba<br />
z Lyme). Próbki z nieprop<strong>or</strong>cjonalnie wysokim mianem w teście FTA-Abs,<br />
w p<strong>or</strong>ównaniu z innymi serologicznymi testami kiłowymi, powinny zostać<br />
przebadane w kierunku obecności przeciwciał przeciw B<strong>or</strong>relia.<br />
Główną zaletą odczynu FTA-Abs jest jego wysoka swoistość i czułość <strong>or</strong>az<br />
wczesna reaktywność. Wyniki są wiarygodne i mogą być decydujące w wątpliwych<br />
przypadkach. Test FTA-Abs jest jednak czasochłonny i drogi; wymaga<br />
dobrego wyszkolenia personelu przeprowadzającego badanie i odczytującego<br />
wyniki. Powinien więc być traktowany jako test potwierdzenia w przypadkach<br />
niepewnej diagnozy.<br />
148
CZE˛ŚĆ I<br />
Materiały i odczynniki zawarte w zestawie<br />
do odczynu FTA-Abs<br />
Roztwór buf<strong>or</strong>u<br />
Surowice kontrolne, dodatnia i ujemna<br />
Przeciwciała przeciw ludzkim immunoglobulinom znakowane flu<strong>or</strong>esceiną (koniugat)<br />
Liofilizowany ekstrakt krętków Reitera (s<strong>or</strong>bent)<br />
T. pallidum utrwalone na szkiełkach<br />
Dodatkowe materiały i odczynniki<br />
potrzebne do odczynu FTA-Abs<br />
Szkiełka nakrywkowe<br />
Mikroskop flu<strong>or</strong>escencyjny z UV iluminacją (× 40 obiektyw)<br />
Podłoże utrwalające<br />
Buf<strong>or</strong>owana sól, pH 7,2 (PBS)<br />
Tween 80 (2%)-PBS<br />
Odczyn FTA-Abs<br />
1. Wyjąć zestaw odczynników z lodówki i pozostawić do ogrzania do<br />
temperatury pokojowej.<br />
2. Pozostawić wymaganą liczbę szkiełek przez 15 minut do ogrzania do<br />
temperatury pokojowej.<br />
3. Zmieszać 50 µl surowicy badanej z 0,2 ml s<strong>or</strong>bentu. Równolegle rozcieńczyć<br />
dodatnią i ujemną surowicę kontrolną: 1:5 z roztw<strong>or</strong>em buf<strong>or</strong>u i 1:5<br />
z s<strong>or</strong>bentem.<br />
4. Na jedno szkiełko z krętkami nałożyć 10 µl roztw<strong>or</strong>u buf<strong>or</strong>u (kontrola<br />
koniugatu), na drugie 10 µl s<strong>or</strong>bentu (kontrola s<strong>or</strong>bentu).<br />
5. Na każde kolejne szkiełko nałożyć 10 µl odpowiedniego rozcieńczenia<br />
surowicy badanej lub kontrolnej.<br />
6. Umieścić szkiełka w wilgotnej kom<strong>or</strong>ze na 30 minut w 37°C. Zanurzyć<br />
preparaty na 5 minut w roztw<strong>or</strong>ze Tween-PBS. Czynność powtórzyć.Spłukać<br />
wodą destylowaną, odsączyć i zostawić do wyschnięcia w pojemniku na<br />
preparaty.<br />
7. Nałożyć na wszystkie szkiełka po 10 µl przeciwciał przeciw immunoglobulinom<br />
ludzkim rozcieńczonych zgodnie z zaleceniami producenta<br />
w buf<strong>or</strong>ze.<br />
8. Umieścić szkiełka w wilgotnej kom<strong>or</strong>ze na 30 minut w 37°C. Zanurzyć<br />
preparaty na 5 minut w roztw<strong>or</strong>ze Tween-PBS. Czynność powtórzyć.Spłukać<br />
wodą destylowaną, odsączyć i zostawić do wyschnięcia w pojemniku na<br />
preparaty.<br />
9. Na każde szkiełko nałożyć 2 krople podłoża utrwalającego i szkiełko<br />
nakrywkowe.<br />
10. Sprawdzić, czy koniugat, abs<strong>or</strong>bent i ujemna surowica kontrolna nie<br />
wykazują flu<strong>or</strong>escencji:<br />
• Brak flu<strong>or</strong>escencji lub lekko zielonkawe krętki: reakcja ujemna.<br />
• Różny stopień zielonej flu<strong>or</strong>escencji: reakcja dodatnia.<br />
149
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
Flu<strong>or</strong>escencję można stopniować:<br />
Ujemna 0<br />
Graniczna 1+, 2+, 3+<br />
Dodatnia 4+<br />
Reakcja 2+ i większa wskazuje na zakażenie T. pallidum.<br />
Wykrywanie aglutynin w g<strong>or</strong>a˛czce<br />
Lekarz, który leczy pacjenta z g<strong>or</strong>ączką o nieustalonej przyczynie, często<br />
zleca wykonanie serii badań serologicznych, wspólnie określanych nazwą<br />
odczynów aglutynacyjnych w g<strong>or</strong>ączce, w celu potwierdzenia zakażeń wywołanych<br />
przez Brucella (odczyn Wrighta), Salmonella typhi (odczyn Widala)<br />
i niektóre riketsje (odczyn Weila-Felixa). Odczyny wykrywają przeciwciała<br />
aglutynujące skierowane przeciw somatycznemu antygenowi O i/lub rzęskowemu<br />
antygenowi H poszukiwanych drobnoustrojów lub, w przypadku odczynu<br />
Weila-Felixa, krzyżowo reagujące z antygenem somatycznym dwóch szczepów<br />
Proteus vulgaris.<br />
Odczyny Widala i Weila-Felixa, ze względu na znaczną liczbę technicznych<br />
i interpretacyjnych problemów, nie są obecnie zalecane do badań przesiewowych.<br />
Ujemna reakcja nie wyklucza aktywnego zakażenia, ponieważ zakażenie może<br />
być w fazie inkubacji, w której pacjent nie wytwarza jeszcze wykrywalnej liczby<br />
przeciwciał. Zjawisko prozony także daje ujemne reakcje; zapobieganiu efektowi<br />
prozony służy stosowanie seryjnych rozcieńczeń surowicy. Dodatnia reakcja<br />
z danym antygenem może okazać się niediagnostyczna ze względu na wykazywany<br />
podczas ch<strong>or</strong>oby wzrost wytwarzania heterologicznych aglutynin. Takie<br />
reakcje noszą nazwę nieswoistej odpowiedzi wtórnej, w której w odpowiedzi na<br />
stymulację antygenową pacjent wytwarza nieswoiste aglutyniny. Diagnostyka<br />
serologiczna oparta jedynie na stwierdzeniu wysokiego miana przeciwciał nie jest<br />
pewna i tylko serokonwersja z czterokrotnym wzrostem miana przeciwciał<br />
w seryjnych rozcieńczeniach powinna być traktowana jako dowód świeżego<br />
zakażenia.<br />
Większość pacjentów z ostrą brucelozą pod koniec drugiego tygodnia zakażenia<br />
wykazuje miano aglutynin 1:320 i wyższe. Nawet rok po leczeniu u 20%<br />
pacjentów nadal występują znaczące miana aglutynin Brucella. Wysokie miana<br />
obserwowano są również u pacjentów zakażonych Francisella tularensis i Yersinia<br />
enterocolitica, u niedawno szczepionych na brucelozę i cholerę lub<br />
badanych testem skórnym z brucelerginą. Obserwowano je również u pracowników<br />
rzeźni.<br />
Ponieważ hodowle krwi przez wiele tygodni mogą nie wykazywać obecności<br />
drobnoustrojów, określenie miana aglutynin Brucella może stanowić<br />
wstępną diagnozę ostrej brucelozy. Izolacja bakterii, zazwyczaj z krwi, dostarcza<br />
ostatecznych dowodów zakażenia. Przy podejrzeniu ch<strong>or</strong>oby i ujemnym<br />
wyniku posiewu krwi, w celu potwierdzenia zakażenia, można<br />
przeprowadzić hodowlę szpiku kostnego pobranego z mostka. Pacjent ze<br />
zlokalizowaną brucelozą może nie g<strong>or</strong>ączkować i nie wykazywać znaczącego<br />
miana aglutynin Brucella. W tych przypadkach ch<strong>or</strong>obę podejrzewa się na<br />
podstawie danych epidemiologicznych i obecności zwapniałych węzłów chłonnych<br />
w badaniach radiologicznych. Diagnozę należy jednak potwierdzić w hodowli<br />
krwi.<br />
150
CZE˛ŚĆ I<br />
Szybki test szkiełkowy jest testem przesiewowym, przeznaczonym do wykrywania<br />
aglutynin, podczas gdy test probówkowy jest testem potwierdzającym,<br />
który służy do ilościowej oceny aglutynin. Każdy dodatni wynik otrzymany<br />
w teście szkiełkowym należy potwierdzić w teście probówkowym.<br />
Materiały i odczynniki zawarte w zestawie<br />
do wykrywania aglutynin w brucelozie<br />
Zawiesina antygenu (B. ab<strong>or</strong>tus, B. melitensis) w butelce z zakraplaczem<br />
Ujemna surowica kontrolna<br />
Dodatnia surowica kontrolna<br />
Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do wykrywania<br />
aglutynin w brucelozie<br />
Aplikat<strong>or</strong> patyczków<br />
Szklana płytka<br />
Dermatograf<br />
Pipety, 50 – 1000 µl<br />
Linijka<br />
Sterylny roztwór NaCl (0,85%)<br />
Probówki i stojak na probówki<br />
Stoper<br />
Łaźnia wodna z kontrolowaną temperaturą<br />
Test szkiełkowy do wykrywania aglutynin w brucelozie<br />
Preferowany w p<strong>or</strong>ównaniu z testem probówkowym jako mniej skomplikowany.<br />
1. Próbka surowicy musi być czysta, bez widocznych resztek tłuszczowych. Nie<br />
powinna wykazywać hemolizy ani być zanieczyszczona przez bakterie. Nie<br />
może być inaktywowana przez podgrzewanie, ponieważ w ten sposób<br />
zniszczone zostałyby niektóre termolabilne aglutyniny.<br />
2. Przygotować szklaną płytkę, rysując za pomocą dermatografu i linijki dwa<br />
rzędy 2,5-centymetrowych kratek. Każdy rząd zawierający 5 kratek wystarcza<br />
na przeprowadzenie badania antygenu z rozcieńczeniami surowicy do 1:320.<br />
3. Za pomocą 0,2-mililitrowej pipety nanieść 0,08, 0,04, 0,02, 0,01 i 0,005 ml<br />
surowicy w rzędzie kratek.<br />
4. Do każdej surowicy dodać 1 kroplę właściwej dla testu szkiełkowego<br />
zawiesiny dobrze wymieszanego antygenu.<br />
5. Zaczynając od najwyższego rozcieńczenia wymieszać patyczkiem mieszaninę<br />
surowica-antygen. Końcowe rozcieńczenia są zależne od rozcieńczeń w makroskopowym<br />
odczynie probówkowym i wynoszą odpowiednio 1:20, 1:40,<br />
1:80, 1:160 i 1:320.<br />
6. Trzymającpłytkęw obu dłoniach delikatnie wymieszać, wykonując15–20kolistych<br />
ruchów. Oglądać mieszaninę w dobrym świetle przez 1 minutę,<br />
poszukując śladów aglutynacji. Reakcje pojawiające się później mogą być<br />
związane z wysychaniem reagentów na szkiełku i powinny być potwierdzone<br />
wteście probówkowym.<br />
151
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
7. Odczytać wyniki w poniższy sposób:<br />
Całkowita aglutynacja 4+<br />
Około 75% zaglutynowanych komórek 3+<br />
Około 50% zaglutynowanych komórek 2+<br />
Około 25% zaglutynowanych komórek 1+<br />
Śladowa lub brak aglutynacji –<br />
Probówkowy test wykrywaja˛cy aglutyniny w brucelozie<br />
Przygotować seryjne rozcieńczenia surowicy i surowicę kontrolną w poniżej<br />
przedstawiony sposób:<br />
1. Dla każdej badanej surowicy umieścić po 8 probówek w stojaku.<br />
2. Do pierwszej probówki w każdym rzędzie dodać pipetą 1,9 ml NaCl (0,85%),<br />
do kolejnych po 0,5 ml.<br />
3. Do probówki z 1,9 ml NaCl dodać 0,1 ml surowicy.<br />
4. Dobrze wymieszać pipetą i przenieść 0,5 ml roztw<strong>or</strong>u do probówki drugiej.<br />
Dokładnie wymieszać.<br />
5. Do kolejnych probówek w rzędzie, łącznie z siódmą, dodać 1 kroplę<br />
rozcieńczonej surowicy. Wymieszać dokładnie. Z probówki 7. po wymieszaniu<br />
usunąć 0,5 ml roztw<strong>or</strong>u. Probówka 8. jest kontrolą antygenu.<br />
6. Do każdej z 8 probówek dodać 0,5 ml odpowiedniego antygenu. Wstrząsnąć<br />
statywem, mieszając antygen z surowicą. Kolejne rozcieńczenia wynoszą<br />
odpowiednio od 1:20 do 1:1280.<br />
7. Inkubować w łaźni wodnej w 37°C przez 48 godz., zgodnie z zaleceniami<br />
producenta.<br />
8. Oceniać makroskopowo obecność aglutynacji w probówkach przez 1 minutę<br />
w dobrym świetle na ciemnym tle. Przy odczycie nie wstrząsać probówek.<br />
Dodatnia reakcja wykazuje widoczną aglutynację (granulację); ujemna reakcja<br />
wykazuje zmętnienie zawiesiny bez aglutynacji. Najwyższe rozcieńczenie<br />
wykazujące aglutynację jest mianem surowicy.<br />
Odrzucić antygen, który nie aglutynuje z dodatnią surowicą kontrolną lub<br />
aglutynuje z ujemną surowicą kontrolną.<br />
Aglutynację można obserwować w surowicy zdrowych osób, stąd pojedyncze<br />
surowice o mianie niższym niż 1:80 mają nieznaczną wartość.Fałszywie dodatnie<br />
wyniki otrzymuje się także u pacjentów zakażonych Francisella tularensis lub<br />
u szczepionych przeciw Vibrio cholerae. Za pomocą tego testu nie można<br />
zróżnicować infekcji wywołanych B. ab<strong>or</strong>tus i B. melitensis.<br />
Odczyn ASO<br />
Zakażenia paci<strong>or</strong>kowcowe są częste i przeciwciała przeciw paci<strong>or</strong>kowcom<br />
występują w dużym odsetku populacji. β-hemolizujące paci<strong>or</strong>kowce grupy A<br />
wytwarzają dwie hemolizyny: wrażliwą na tlen streptolizynę O i tlenowo-stabilną<br />
streptolizynę S. Jedynie zredukowana (nieutleniona) streptolizyna O jest immunogenna<br />
i wyk<strong>or</strong>zystywana w odczynie. Reakcja oparta jest na wytwarzaniu przez<br />
pacjenta zakażonego Streptococcus pyogenes (grupa paci<strong>or</strong>kowców A) przeciwciał<br />
hamujących aktywność hemolityczną streptolizyny O. Przeciwciała zwykle<br />
utrzymują się długo, stąd pojedyncze stwierdzenie podwyższonego miana nie<br />
świadczy o aktywnej infekcji. Jedynie w przypadku czterokrotnego wzrostu miana<br />
przeciwciał w kolejnych próbkach, pobranych w 10 – 14-dniowym odstępie,<br />
152
CZE˛ŚĆ I<br />
należy rozważyć obecność świeżego zakażenia. Test najczęściej wyk<strong>or</strong>zystywany<br />
jest w diagnostyce g<strong>or</strong>ączki reumatycznej, ostrego kłębuszkowego zapalenia<br />
nerek i innych ch<strong>or</strong>ób popaci<strong>or</strong>kowcowych.<br />
Dostępne są dwa typy komercyjnych zestawów do odczynu antystreptolizyny O:<br />
• Test lateksowej aglutynacji szkiełkowej ASO używany w badaniach przesiewowych<br />
do identyfikacji podwyższonych mian ASO (200 IU i wyższych)<br />
w surowicy.<br />
• Test probówkowy ASO jest odczynem zahamowania hemolizy, wyk<strong>or</strong>zystywanym<br />
do określenia miana surowic dodatnich w teście lateksowo-szkiełkowym.<br />
Miano poniżej 50 IU nie potwierdza rozpoznania ostrej g<strong>or</strong>ączki<br />
reumatycznej.<br />
Materiały i odczynniki zawarte w zestawie<br />
do lateksowego testu szkiełkowego ASO<br />
Jedn<strong>or</strong>azowe kartoniki, każdy z 6 dołeczkami<br />
Jedn<strong>or</strong>azowy zakraplacz<br />
Dodatnia surowica kontrolna<br />
Uczulony odczynnik lateksowy (ze streptolizyną O)<br />
Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do lateksowego<br />
testu szkiełkowego ASO<br />
Aplikat<strong>or</strong> patyczków<br />
Lateksowy test aglutynacji szkiełkowej ASO<br />
1. Rozcieńczyć surowicę 1:20.<br />
2. Umieścić 1kroplęroztw<strong>or</strong>u surowicy w dołeczku na jedn<strong>or</strong>azowym kartoniku.<br />
3. Nowym zakraplaczem dodać 1 kroplę uczulonego odczynnika lateksowego.<br />
4. Patyczkiem wymieszać 2 krople i rozprowadzić je w dołeczku.<br />
5. Przez 2 minuty obserwować obecność aglutynacji.<br />
Dodatnia reakcja manifestuje się drobnym kłaczkowaniem (aglutynacją) w ciągu<br />
2 minut.<br />
Ujemna reakcja nie wykazuje aglutynacji.<br />
Jeśli aglutynacja pojawi się w ciągu 2 minut, miano surowicy należy określić<br />
w teście probówkowym antystreptolizyny O.<br />
Materiały i odczynniki zawarte w zestawie do testu<br />
probówkowego ASO<br />
Dodatnia surowica kontrolna<br />
Zredukowany antygen streptolizyny O (suchy preparat)<br />
Erytrocyty baranie<br />
Standardowe przeciwciała przeciw streptolizynie O (suchy preparat, 20 IU/butelka)<br />
Buf<strong>or</strong> do streptolizyny O (25 × koncentrat roztw<strong>or</strong>u)<br />
153
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do testu<br />
probówkowego ASO<br />
Woda destylowana<br />
Pipety (1 ml, 2 ml)<br />
Probówki<br />
Łaźnia wodna<br />
Test probówkowy ASO<br />
1. Rozpuścić zredukowany antygen streptolizyny O (suchy preparat) w odpowiedniej<br />
objętości wody destylowanej (w opisanej butelce), przygotowując<br />
roztwór o stężeniu 2 IU w 1 ml. Roztwór nie zawiera konserwantów i musi<br />
zostać wyk<strong>or</strong>zystany w ciągu 6 godzin.<br />
2. Rozpuścić standardową antystreptolizynę O (suchy preparat, 20 IU/butelka)<br />
w 10 ml buf<strong>or</strong>u streptolizyny O. Roztwór można przechowywać przez<br />
6 miesięcy w 4°C, pod warunkiem, że nie uległ kontaminacji.<br />
3. Przed użyciem rozcieńczyć buf<strong>or</strong> streptolizyny O (25 × koncentrat) w 480 ml<br />
wody destylowanej. Rozcieńczony buf<strong>or</strong> nie wyk<strong>or</strong>zystany w ciągu tygodnia<br />
należy wyrzucić.<br />
4. 1 ml erytrocytów baranich wypłukać trzykrotnie w buf<strong>or</strong>ze streptolizyny<br />
O i odwirować, zebrać pipetą supernatant. Dodając buf<strong>or</strong>u streptolizyny O<br />
uzyskać 8% zawiesinę komórek.<br />
5. Odczynniki i surowicę pozostawić do ogrzania do temperatury pokojowej.<br />
6. Przygotować w probówce rozcieńczenie surowicy pacjenta 1:10 (0,1 ml<br />
surowicy + 0,9 ml buf<strong>or</strong>u streptolizyny O). Przygotować dwa wyjściowe<br />
roztw<strong>or</strong>y z rozcieńczenia 1:10 w poniżej przedstawiony sposób:<br />
Surowica Buf<strong>or</strong> Rozcieńczenie<br />
0,2 ml (1:10) 1,8 ml 1:100<br />
1,0 ml (1:100) 0,5 ml 1:150<br />
7. Przygotować następujące serie rozcieńczeń buf<strong>or</strong>u streptolizyny O dla<br />
każdego z wyjściowych roztw<strong>or</strong>ów:<br />
Probówka Surowica Buf<strong>or</strong> Rozcieńczenie<br />
Zredukowana<br />
streptolizyna O<br />
1 0,2 ml (1:10) 0,8 ml 1:50 0,5 ml<br />
2 0,5 ml (1:100) 0,5 ml 1:200 0,5 ml<br />
3 0,5 ml (1:200) 0,5 ml 1:400 0,5 ml<br />
4 0,5 ml (1:400) 0,5 ml 1:800 0,5 ml<br />
5 0,5 ml (1:150) 0,5 ml 1:300 0,5 ml<br />
6 0,5 ml (1:300) 0,5 ml 1:600 0,5 ml<br />
7 0 1,5 ml — 0<br />
8 0 1,0 ml — 0,5 ml<br />
8. Up<strong>or</strong>ządkować probówki według wzrastających rozcieńczeń: 1:50, 1:200,<br />
1:300, 1:400, 1:600, 1:800.<br />
9. Do probówki kontrolnej 7. dodać 1,5 ml buf<strong>or</strong>u, do probówki kontrolnej 8.<br />
dodać 1 ml buf<strong>or</strong>u.<br />
10. Do wszystkich probówek, z wyjątkiem kontrolnej 7., dodać 0,5 ml roztw<strong>or</strong>u<br />
zredukowanej streptolizyny O.<br />
154
CZE˛ŚĆ I<br />
11. Wymieszać ichłodzić w4°C przez dwie godziny, umożliwiając przebieg<br />
reakcji antygen-przeciwciało.<br />
12. Do wszystkich probówek, włączając kontrolne probówki 7. i 8., dodać 0,5 ml<br />
8% zawiesiny erytrocytów, wymieszać i inkubować w łaźni wodnej w 37°C<br />
przez 30 minut.<br />
13. Odwirować probówki w 1000 g przez 2 minuty i obserwować hemolizę.<br />
W kontrolnej probówce 7. nie powinna zachodzić hemoliza, w kontrolnej<br />
probówce 8. powinna zajść całkowita hemoliza.<br />
14. Miano ASO to najwyższe rozcieńczenie nie wykazujące hemolizy:<br />
• Jeśli we wszystkich probówkach zachodzi hemoliza, wynik opisać ,,miano<br />
ASO poniżej 200 IU’’.<br />
• Jeśli w probówkach o wyższym rozcieńczeniu nie zachodzi hemoliza,<br />
zanotować wynik ,,ASO dodatnie z mianem’’.<br />
Wykrywanie antygenów bakteryjnych<br />
Lateksowy test aglutynacji i test koaglutynacji, wykrywające antygeny bakteryjne,<br />
stosowane są do identyfikacji mikro<strong>or</strong>ganizmów i ich antygenów w hodowlach<br />
lub w próbkach klinicznych. W teście aglutynacji lateksowej<br />
cząsteczki polimerów wyk<strong>or</strong>zystuje się jako nośnik fazy stałej; w teście<br />
koaglutynacji nośnikiem fazy stałej są erytrocyty. Za pomocą testu lateksowego<br />
można wykryć antygeny polisacharydowe bakterii wywołujących zapalenie opon<br />
mózgowo-rdzeniowych, w tym Haemophilus influenzae (tyb b), S. pneumoniae<br />
(omniwalentny), N. meningitidis (grupa A, B, C, Y i W135), E. coli (typ K1)<br />
i S. agalactiae (grupa B). Testy aglutynacji lateksowej są przydatne do<br />
identyfikacji paci<strong>or</strong>kowców z grup Lancefield A, B, C, D, F i G. Odczyny<br />
lateksowe można wyk<strong>or</strong>zystać w jakościowym teście aglutynacji szkiełkowej<br />
i w ilościowym teście aglutynacji probówkowej <strong>or</strong>az w typowaniu grup<br />
Streptococcus A-D, N. meningitidis, H. influenzae, Salmonella, Shigella, Vibrio<br />
cholerae itp.<br />
Do wykrycia antygenów polisacharydowych w próbkach klinicznych niezbędny<br />
jest progowy poziom antygenu. Jeśli w preparacie barwionym metodą Grama<br />
widoczne są drobnoustroje, zwykle, choć nie w każdym przypadku, przekroczony<br />
jest poziom progowy. W płynie mózgowo-rdzeniowym pacjentów z zakażeniem<br />
N. meningitidis wykrywana jest znacznie mniejsza liczba bakterii niż w zakażeniach<br />
wywołanych innymi typami Neisseria spp., dlatego rzadziej osiągany jest<br />
progowy poziom antygenów polisacharydowych.<br />
Kilka serogrup N. meningitidis może wywoływać zapalenie opon mózgowo-<br />
-rdzeniowych. Serogrupy A, C, Y i W135 mają stabilny antygen, który można<br />
wykazać za pomocą pojedynczego poliwalentnego odczynnika, podczas gdy<br />
antygen grupy B jest stosunkowo niestabilny i w związku z tym trudniej<br />
wykrywalny. Nie można go zróżnicować z polisacharydowym antygenem K1<br />
E. coli, która wśród E. coli jest głównym czynnikiem wywołującym zapalenie<br />
opon mózgowo-rdzeniowych u now<strong>or</strong>odków. Wykazanie w preparatach barwionych<br />
metodą Grama obecności Gram-ujemnych dwoinek sugeruje N. meningitidis<br />
grupy B, obecność Gram-ujemnych pałeczek wskazuje na E. coli.<br />
W niektórych testach, polisacharydowe antygeny z drobnoustrojów uzyskiwane<br />
są przed badaniem. Pozyskiwanie antygenów przeprowadza się chemicznie lub<br />
enzymatycznie.<br />
155
BADANIA SEROLOGICZNE<br />
Do wykrywania antygenów służą cztery różne testy:<br />
• W teście aglutynacji szkiełkowej antygen opłaszczony jest na cząsteczkach<br />
lateksu lub swoiste przeciwciała związane są na komórkach gronkowców.<br />
Reagenty miesza się ręcznie ciągłym ruchem kolistym przez 1 – 2 minuty<br />
i makroskopowo obserwuje reakcję aglutynacji.<br />
• W testach ELISA roztwór próbki i antygenu najpierw przepuszczany jest przez<br />
błonę opłaszczoną przeciwciałami (zwykle monoklonalnymi). Następnie błonę<br />
umieszcza się w roztw<strong>or</strong>ze zawierającym kolejne (monoklonalne) przeciwciała<br />
związane z enzymem. Obecność kompleksu antygen-przeciwciało z enzymem<br />
wykrywa się w reakcji z barwnym substratem dodanym do roztw<strong>or</strong>u.<br />
• W ,,złotym’’ teście immunologicznym roztwór próbki i antygenu dyfunduje na<br />
błonie, którą następnie się ogląda.<br />
• W optycznym teście immunologicznym, przeciwciała związane są z silikonową<br />
płytką o odblaskowych właściwościach. Reakcja antygenu ze specyficznym<br />
przeciwciałem powoduje zmianę w warstwie powierzchownej płytki i widoczną<br />
różnicę refleksu światła.<br />
Procedury odczynów aglutynacji lateksowej<br />
i koaglutynacji<br />
1. Dla zwia˛zanych antygenów komórkowych: używając standardowej ezy przenieść<br />
czyste kolonie do kropli soli na szkiełku, uważnie wymieszać do<br />
uzyskania lekko opalizującej zawiesiny. Obecność aglutynacji zwykle wskazuje<br />
na szczepy sz<strong>or</strong>stkie (R — ang. rough); szczepy gładkie (S — ang.<br />
smooth) nie wykazują aglutynacji w soli. W takim przypadku należy dodać<br />
odczynniki i przejść do punktu 4.<br />
Dla ekstrahowanych antygenów: używając standardowej ezy przenieść dobrze<br />
izolowane kolonie do probówki zawierającej roztwór ekstraktu, uzyskać<br />
zawiesinę. Inkubować zawiesinę w35°C lub zgodnie z zaleceniami producenta.<br />
Dla próbek klinicznych (płyn mózgowo-rdzeniowy, mocz): podgrzać próbkę do<br />
temperatury wrzenia lub według zaleceń producenta. Schłodzić i odwirować<br />
w 2000 g przez 5 – 10 minut.<br />
2. Umieścić na płytce 1 kroplę nośników opłaszczonych przeciwciałami.<br />
3. Umieścić obok 1 kroplę zawiesiny antygenu.<br />
4. Wymieszać 2 krople i rozprowadzić w kratce.<br />
5. Przechylać szkiełko ręcznie, wykonując ciągłe okrężne ruchy przez 1 minutę.<br />
Uważać, aby mieszanina nie rozlała się poza granicę kratki.<br />
6. Po określonym przez producenta czasie obejrzeć szkiełko i sprawdzić, czy<br />
obecna jest aglutynacja. Dla uzyskania lepszej widoczności trzymać szkiełko<br />
blisko źródła światła i oglądać na ciemnym tle.<br />
7. Jako wynik dodatni uznaje się obecność aglutynacji w mieszaninie antygenu<br />
i przeciwciał, np. zawiesina wykazuje aglutynację lub grudki. Aglutynacja jest<br />
najlepiej widoczna przy delikatnym przechylaniu szkiełka, tak aby płyn<br />
spływał wzdłuż dolnej granicy kratki.<br />
156
Część II<br />
Najważniejsze podłoża<br />
i odczynniki<br />
157
Wprowadzenie<br />
Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium, wyk<strong>or</strong>zystując zaledwie niewielką ilość materiału diagnostycznego,<br />
może zidentyfikować czynnik etiologiczny zakażenia, co ma istotny wpływ<br />
na leczenie pacjenta. W większości rozwijających się krajów działalność<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium bakteriologicznego jest ograniczona niedob<strong>or</strong>em podłoży hodowlanych<br />
i podstawowych odczynników, których imp<strong>or</strong>t jest bardzo kosztowny.<br />
Podobnie jak w przypadku leków, przeprowadzając racjonalną selekcję, można<br />
zredukować liczbę koniecznych do zakupienia podłoży i odczynników. Dodatkowo,<br />
niektóre proste podłoża i odczynniki można wytwarzać lub przygotowywać<br />
na miejscu. Zastosowanie się do tych dwóch wskazówek pozwoli znacznie<br />
ograniczyć koszty, a także poprawi dostępność materiałów lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjnych<br />
niezbędnych do diagnostyk i badań epidemiologicznych.<br />
Rozdział został przygotowany w taki sposób, aby umożliwić kierownikom<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów podjęcie właściwych decyzji o przeznaczeniu środków finansowych<br />
na zakup najważniejszych podłoży i odczynników. Składa się z dwóch części,<br />
z których każda zawiera wiele zestawień.<br />
158
Patogeny, podłoża i odczynniki<br />
diagnostyczne<br />
Spodziewane patogeny<br />
Patogeny wymieniono uwzględniając:<br />
– częstość izolacji,<br />
– znaczenie kliniczne,<br />
– ciężkość ch<strong>or</strong>oby,<br />
– prawdopodobieństwo wywołania epidemii,<br />
– współczynnik koszt–k<strong>or</strong>zyść dla izolacji i/lub identyfikacji.<br />
Wykaz nie jest przeznaczony do bezwarunkowego przestrzegania i może różnić<br />
się w różnych krajach czy lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach, zależnie od charakteru lokalnie<br />
występujących ch<strong>or</strong>ób, kompetencji lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium <strong>or</strong>az dostępnych środków.<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
o nadrzędnym znaczeniu<br />
Uwzględniając pewien stopień elastyczności przyjęto poniższą gradację podłoży<br />
i odczynników diagnostycznych:<br />
Stopień 1: Wysoko pri<strong>or</strong>ytetowe<br />
Stopień 2: Średnio pri<strong>or</strong>ytetowe<br />
Stopień 3: Nisko pri<strong>or</strong>ytetowe<br />
Pri<strong>or</strong>ytet podłoży i odczynników zależy od znaczenia patogenów, do izolacji<br />
i identyfikacji których służą. Istnieją jednak wyjątki. Jeśli podłoże jest szeroko<br />
stosowane do hodowli wielu patogenów, może zostać ocenione wyżej niż podłoże<br />
przeznaczone do izolacji tylko jednego z nich.<br />
Stopień 1: Podłoża i odczynniki o wysokim pri<strong>or</strong>ytecie, które powinny być<br />
dostępne we wszystkich lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iach przeprowadzających ogólną diagnostykę<br />
bakteriologiczną. Najczęściej są przeznaczone do ogólnego użytku, proste do<br />
przygotowania i stanowią nieliczną grupę.<br />
Stopień 2: Podłoża i odczynniki o średnim pri<strong>or</strong>ytecie są stosowane dodatkowo,<br />
w uzupełniającej diagnostyce <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j i przydatne w badaniach epidemiologicznych;<br />
mogą nie mieć istotnego bezpośredniego wpływu na leczenie pacjenta,<br />
np. surowice odp<strong>or</strong>nościowe do identyfikacji serogrup meningokoków.<br />
Stopień 3: Podłoża i odczynniki o niskim pri<strong>or</strong>ytecie bardzo rzadko mają<br />
znaczenie w leczeniu pacjenta, natomiast są przydatne w edukacji, pracach<br />
naukowych i dodatkowych badaniach prowadzonych przez lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia referencyjne.<br />
Ta kateg<strong>or</strong>ia odnosi się do podłoży i odczynników diagnostycznych<br />
o niek<strong>or</strong>zystnym współczynniku koszt:efekt, które są zbyt drogie do stosowania<br />
ogólnego lub wyk<strong>or</strong>zystywane do izolacji i identyfikacji rzadko pojawiających<br />
się, trudnych do izolacji drobnoustrojów.<br />
Poniżej wymieniono patogeny, podłoża i odczynniki diagnostyczne stosowane<br />
w diagnostyce <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>j z uwzględnieniem sugerowanego pri<strong>or</strong>ytetu. Sto-<br />
159
PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE<br />
pień ważności należy przystosować dla każdego lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium, uwzględniając<br />
warunki lokalne.<br />
Krew<br />
Spodziewane patogeny<br />
Bacteroides fragilis<br />
Brucella<br />
Burkholderia pseudomallei<br />
Candida albicans i Cryptococcus neof<strong>or</strong>mans<br />
Haemophilus influenzae<br />
Neisseria meningitidis<br />
Pałeczki niefermentujące, inne niż Pseudomonas aeruginosa<br />
Inne Enterobacteriaceae<br />
Pseudomonas aeruginosa<br />
Salmonella typhi i nie-typhi<br />
Staphylococcus aureus<br />
Paci<strong>or</strong>kowce (S. pyogenes, S. pneumoniae, paci<strong>or</strong>kowce zieleniejące)<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
Podłoża płynne do hodowli krwi<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Bulion tryptozowo-sojowy (TSB) może zostać zastąpiony innym<br />
wzbogaconym bulionem, np. bulionem z wyciągiem mózgowo-<br />
-sercowym, każdy z dodatkiem polianetolosulfonianu sodu (SPS),<br />
0,25 g/l 1<br />
Bulion do hodowli beztlenowców z krwi: podłożepłynne tioglikolanowe,<br />
bulion Schaedlera lub bulion beztlenowy Wilkins-Chalgrena 2<br />
Podłoża do izolacji<br />
Przesiew na agar z krwią, agar czekoladowy i agar MacConkeya 1<br />
Odczynniki diagnostyczne<br />
Krążek z bacytracyną 1<br />
Plazma do koagulazy 1<br />
Odczynnik do wykrywania β-laktamazy 1<br />
Krążek z optochiną 1<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy 1<br />
Aglutynujące surowice odp<strong>or</strong>nościowe Salmonella 1<br />
Czynniki V i XV 2<br />
Surowica odp<strong>or</strong>nościowa Haemophilus influenzae typ b 3<br />
Surowica odp<strong>or</strong>nościowa Neisseria meningitidis (poliwalentna i swoista<br />
dla grup A, B, C) 3<br />
160
CZE˛ŚĆ II<br />
Płyn mózgowo-rdzeniowy<br />
Spodziewane patogeny<br />
Cryptococcus neof<strong>or</strong>mans<br />
Enterobacteriaceae<br />
Haemophilus influenzae<br />
Listeria monocytogenes<br />
Mycobacterium tuberculosis<br />
Neisseria meningitidis<br />
Streptococcus agalactiae<br />
Streptococcus pneumoniae<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
Podłoża do izolacji<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Agar z krwią (z posianym Staphylococcus) 1<br />
Agar czekoladowy 1<br />
Agar MacConkeya 1<br />
Podłoże Löwensteina-Jensena 2<br />
Agar Sabouraud 2<br />
Odczynniki diagnostyczne<br />
Tusz chiński 1<br />
Odczynnik do wykrywania β-laktamazy 1<br />
Krążek z optochiną 1<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy 1<br />
Czynniki V i XV 2<br />
Surowica odp<strong>or</strong>nościowa Haemophilus influenzae typ b 3<br />
Surowica odp<strong>or</strong>nościowa Neisseria meningitidis (poliwalentna i swoista<br />
dla grup A, B, C) 3<br />
Szybkie testy diagnostyczne<br />
Zestaw testów do szybkiego wykrywania bakterii wywołujących<br />
zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych 3<br />
Mocz<br />
Spodziewane patogeny<br />
Candida albicans<br />
Enterokoki<br />
Escherichia coli<br />
Mycobacterium tuberculosis<br />
161
PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE<br />
Inne Enterobacteriaceae<br />
Inne gronkowce<br />
Pseudomonas i inne niefermentujące pałeczki<br />
Staphylococcus saprophyticus<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
Podłoża do izolacji i podłoża ilościowe<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Agar z krwią 1<br />
Agar brolacynowy (może być zastąpiony agarem z fioletem krystalicznym<br />
i laktozą, agarem MacConkeya, agarem bez fioletu krystalicznego<br />
lub agarem eozynowym z błękitem metylenowym) 1<br />
Agar CLED 1<br />
Podłoża do identyfikacji<br />
i odczynniki diagnostyczne<br />
β-glukuronidaza (PGUA) do identyfikacji E. coli 1<br />
Dla Gram-ujemnych pałeczek:<br />
agar Kliglera (KIA) 1<br />
odczynnik Kovacsa do wykrywania indolu 1<br />
podłoże ruch-indol-ureaza (MIU) 1<br />
odczynnik do wykrywania oksydazy 1<br />
podłoże płynne z lizyną (Möller) 2<br />
test ONPG 2<br />
podłoże Simmonsa z cytrynianem 2<br />
Dla gronkowców i enterokoków:<br />
test na obecność katalazy (H 2 O 2 ) 1<br />
plazma do wykrywania koagulazy 1<br />
agar z żółcią i eskuliną (dla enterokoków) 2<br />
krążek z nowobiocyną (5 µg) różnicujący koagulazo-ujemne gronkowce<br />
3<br />
Kał<br />
Spodziewane patogeny<br />
Aeromonas i Plesiomonas<br />
Campylobacter spp.<br />
Escherichia coli (enteropatogenne, enterotoksyczne, enteroinwazyjne i enterokrwotoczne)<br />
Salmonellae spp. nie-typhi i Edwardsiella<br />
Salmonella typhi i S. paratyphi<br />
Shigella<br />
Vibrio cholerae serogrupa O1, przecinkowce nie wywołujące cholery<br />
Yersinia enterocolitica<br />
162
CZE˛ŚĆ II<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
Podłoża transp<strong>or</strong>towe<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Podłoże Cary’ego-Blaira (dla wszystkich patogenów) 1<br />
Buf<strong>or</strong>owany roztwór soli i glicerolu (nie dla Vibrio lub Campylobacter) 2<br />
Podłoża selektywne<br />
Bulion seleninowy F 1<br />
Zasadowa woda peptonowa 2<br />
Podłoża do izolacji<br />
Agar cytrynianowo-deoksycholowy (może być zastąpiony agarem<br />
Salmonella-Shigella, agarem ksylozo-lizyno-deoksycholanowym<br />
(XLD)) 1<br />
Agar MacConkeya (z fioletem krystalicznym) 1<br />
Agar TCBS 1<br />
Podłoże Campylobacter: podstawowy agar Columbia lub inny agar<br />
z krwią zawierający lizat krwi i dodatek antybiotyku lub podłoże<br />
podstawowe na bazie aktywnego węgla 2<br />
Podłoża do wstępnej hodowli<br />
i odczynniki diagnostyczne<br />
Agar Kliglera (KIA) (dla patogenów jelitowych może być zastąpiony<br />
trójcukrowym agarem żelazowym, TSI) 1<br />
Odczynnik Kovacsa do wykrywania indolu 1<br />
Podłoże ruch-indol-ureaza (MIU) (można zastąpić podłożem do wykrywania<br />
ruchu + bulion peptonowy z mocznikiem) 1<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy 1<br />
Podłoża selektywne i odczynniki diagnostyczne<br />
Woda peptonowa (lub podstawowy bulion z czerwienią fenolową) 2<br />
Podłoże płynne z lizyną (Möller) 2<br />
Test ONPG 2<br />
Podłoże Simmonsa z cytrynianem 2<br />
Krążek z czynnikiem wibriostatycznym O:129 2<br />
Surowice do aglutynacji<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Salmonella: poliwalentna surowica anty-O (A-I i Vi) 1<br />
surowice anty-O: O:2 (A), O:4 (B), O:9 (D), Vi 2<br />
surowiceanty-H:H:a,H:b,H:d,H:i,H:m,H:2 3<br />
surowice anty-H fazy inwersji: H:b, H:i, H:1,2 3<br />
163
PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE<br />
Shigella:<br />
poliwalentne surowice: anty-dysenteriae, anty-flexneri,<br />
anty-boydii, anty-sonnei 1<br />
surowica anty-dysenteriae typ 1 (Shiga) 1<br />
Vibrio cholerae: poliwalentna surowica anty-O1 1<br />
surowica anty-B (Ogawa), anty-C (Inaba),<br />
anty-O:139 3<br />
Haemophilus influenzae surowica typowa anty-b 3<br />
Neisseria meningitidis poliwalentna 3<br />
surowice grupowe anty-A, anty-B, anty-C 3<br />
Górne drogi oddechowe<br />
Spodziewane patogeny<br />
Candida albicans (jama ustna)<br />
C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae (gardło i nos)<br />
Haemophilus influenzae (ucho i zatoki)<br />
M<strong>or</strong>axella catarrhalis (ucho i zatoki)<br />
Neisseria meningitidis<br />
Pseudomonas<br />
Staphyloccoccus aureus (ucho i zatoki)<br />
Streptococcus pneumoniae (ucho i zatoki)<br />
Streptococcus pyogenes (grupa A, gardło)<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
Podłoża do izolacji<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Agar z krwią (przygotowany na bazie bez glukozy) 1<br />
Agar czekoladowy 2<br />
Podłoże Löfflera z surowicą lub podłoże jajeczne D<strong>or</strong>seta 2<br />
Agar z krwią i tellurynem 2<br />
Zmodyfikowane podłoże Thayer-Martina dla gonokoków i meningokoków<br />
3<br />
Odczynniki diagnostyczne<br />
Krążek z bacytracyną 1<br />
Odczynniki do katalazy i koagulazy 1<br />
Krążek z optochiną 1<br />
Podłoża do rozkładu cukrów dla Neisseria spp. 2<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy 2<br />
Czynniki X i XV (krążek lub pasek) 2<br />
Trójmaślan glicerylu (trójbutyryna) 3<br />
Szybkie testy diagnostyczne<br />
Zestawy do identyfikacji serogrup paci<strong>or</strong>kowców β-hemolizujących 3<br />
164
CZE˛ŚĆ II<br />
Dolne drogi oddechowe<br />
Spodziewane patogeny<br />
Candida albicans<br />
Enterobacteriaceae<br />
Haemophilus influenzae<br />
Klebsiella pneumoniae<br />
M<strong>or</strong>axella catarrhalis<br />
Mycobacterium tuberculosis<br />
Staphylococcus aureus<br />
Streptococcus pneumoniae<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
Podłoża do izolacji<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Agar z krwią 1<br />
Agar czekoladowy 1<br />
Agar MacConkeya 1<br />
Podłoże Löwensteina-Jensena 2<br />
Agar Sabouraud 3<br />
Selektywny agar z krwią dla Haemophilus (bacytracyna lub wankomycyna)<br />
3<br />
Odczynniki diagnostyczne<br />
Krążek z optochiną 1<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy 2<br />
Czynniki X i XV (krążek lub pasek) 2<br />
Trójmaślan glicerylu (trójbutyryna) 3<br />
Próbki z układu moczowo-płciowego<br />
do diagnostyki ch<strong>or</strong>ób przenoszonych droga˛<br />
kontaktów seksualnych<br />
Spodziewane patogeny<br />
Candida albicans (badanie mikroskopowe)<br />
Chlamydia trachomatis<br />
Gardnerella vaginalis (badanie mikroskopowe) 1<br />
Haemophilus ducreyi<br />
Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae<br />
Treponema pallidum (mikroskopia w ciemnym polu)<br />
1<br />
Gardnerella vaginalis nie jest patogenem, lecz drobnoustrojem wskaźnikowym bakteryjnej<br />
waginozy.<br />
165
PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
Podłoża transp<strong>or</strong>towe<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Podłoża transp<strong>or</strong>towe Amiesa lub Stuarta 1<br />
Podłoża do izolacji<br />
Zmodyfikowane podłoże Thayer-Martina (MTM) lub podłoże New<br />
Y<strong>or</strong>k City (NYC) 1<br />
czekoladowy agar Mueller-Hintona z krwią końską + wankomycyna<br />
+ IsoVitaleX dla H. ducreyi 3<br />
Odczynniki do identyfikacji<br />
Test nitrocefinowy lub inne testy do wykrywania β-laktamaz 1<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy 1<br />
Ropa i wysięki<br />
Spodziewane patogeny<br />
Bacillus anthracis<br />
Bacteroides i inne bezwzględne beztlenowce<br />
Clostridium perfringens<br />
Enterobacteriaceae<br />
Mycobacterium tuberculosis, M. ulcerans<br />
Inne Mycobacterium spp.<br />
Pasteurella multocida<br />
Pseudomonas i inne pałeczki niefermentujące<br />
Staphylococcus aureus<br />
Streptococcus pyogenes<br />
Streptococcus (inne gatunki)<br />
Podłoża i odczynniki diagnostyczne<br />
Podłoża do izolacji<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Agar z krwią 1<br />
Agar MacConkeya 1<br />
Agar z mannitolem 2<br />
Płynne podłoże tioglikolanowe (z indykat<strong>or</strong>em) (może być zastąpione<br />
podłożem z wyciągiem mięsnym, bulionem Schaedlera lub bulionem<br />
Wilkins-Chalgrena) 2<br />
Bulion tryptozowo-sojowy (TSB) 2<br />
166
CZE˛ŚĆ II<br />
Odczynniki diagnostyczne<br />
Test na katalazę (H 2 O 2 ) 1<br />
Osocze do wykrywania koagulazy 1<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy 1<br />
Generat<strong>or</strong> wod<strong>or</strong>u do anaerostatu 2<br />
Lista rekomendowanych podłoży<br />
i odczynników diagnostycznych<br />
dla lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>iów mikrobiologicznych<br />
ośrednim poziomie referencyjności<br />
Podłoża hodowlane<br />
Podłoże rekomendowane<br />
Alternatywne<br />
Stopień<br />
referencyjności<br />
Agar z żółcia˛ i eskulina˛ 1<br />
Agar z krwia˛(patrz agar tryptozowo-<br />
-sojowy) 1<br />
Agar z brolacyna˛<br />
Agar z laktoza˛i fioletem krystalicznym,<br />
agar CLED 1<br />
Żelazowy agar Kliglera (KIA) 1<br />
Podłoże Löfflera z surowica˛ Podłoże jajeczne D<strong>or</strong>seta 1<br />
Podłoże Löwensteina-Jensena 1<br />
Agar MacConkeya (z fioletem krystalicznym)<br />
Eozynowy agar z błękitem metylenowym<br />
1<br />
Agar MacConkeya (bez fioletu krystalicznego)<br />
1<br />
Podłoże ruch-indol-ureaza (MIU) Podłoże do wykrywania ruchu<br />
+ bulion ureazowy + woda peptonowa<br />
(tryptonowa) 1<br />
Agar Mueller-Hintona 1<br />
Dekstrozowy agar Sabouraud 1<br />
Deoksycholanowy agar cytrynianowy Agar Salmonella-Shigella (SS) 1<br />
Agar tryptozowo-sojowy (TSA) Agar Columbia 1<br />
Bulion tryptozowo-sojowy (TSB) Bulion mózgowo-sercowy 1<br />
TCBS 1<br />
Podłoże transp<strong>or</strong>towe (Amies) Podłoże transp<strong>or</strong>towe (Stuarta lub<br />
Cary’ego-Blaira) 1<br />
Woda peptonowa Andrade Czerwony bulion fenolowy 2<br />
Bulion z dekarboksylaza˛ (Möller) 2<br />
Agar z mannitolem (MSA) 2<br />
Bulion z selenitem F 2<br />
Agar cytrynianowy Simmonsa 2<br />
Podłoże tioglikolanowe<br />
Bulion Schaedlera, bulion do hodowli<br />
beztlenowców Wilkensa-<br />
-Chalgrena, podłoże z wycia˛giem<br />
mięsnym 2<br />
Agar z DNaza˛ 3<br />
167
PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE<br />
Inhibit<strong>or</strong>y i antybiotyki<br />
stosowane jako dodatek do podłoży<br />
lub odczynnik<br />
Chl<strong>or</strong>amfenikol (do izolacji grzybów) 1<br />
Antybiotyki dodawane do podłoża dla gonokoków: wankomycyna,<br />
kolistyna, nystatyna (trimetoprim): VCN (VCNT) 1<br />
Dodatek antybiotyków do podłoża dla Campylobacter 2<br />
Roztwór tellurynu (do izolacji C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae) 2<br />
Bacytracyna (do izolacji Haemophilus spp.) 3<br />
Wankomycyna (do izolacji Haemophilus ducreyi lub H. influenzae) 3<br />
Dodatki wzbogacaja˛ce podłoża<br />
IsoVitaleX (Polyvitex, Vitox, suplement B, suplement VX, suplement<br />
CVA) 2<br />
Polianetosulfonian sodu (SPS) 3<br />
Kra˛żki, tabletki lub paski<br />
Krążek z bacytracyną 1<br />
Krążek z nitrocefiną (Cefinaza) lub odczynnik 1<br />
Test ONPG 1<br />
Krążek z optochiną 1<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy 1<br />
PGUA (β-glukuronidaza) 1<br />
Czynniki V i XV 2<br />
Krążek z nowobiocyną (5 µg) 3<br />
Test PYR 3<br />
Trójmaślan glicerylu (trójbutyryna) 3<br />
Krążek z czynnikiem wibriostatycznym O:129 3<br />
Zestawy diagnostyczne<br />
Zastaw do szybkiej serodiagnostyki bakterii wywołujących zapalenie<br />
opon mózgowo-rdzeniowych 3<br />
Zestaw do identyfikacji serogrup paci<strong>or</strong>kowców hemolizujących 3<br />
Inne odczynniki diagnostyczne<br />
Skala z siarczanem baru (dla metody Kirby-Bauera) (skala MacFarlanda<br />
— przyp. tłum.) 1<br />
Zestaw do barwienia metodą Grama 1<br />
Nadtlenek wod<strong>or</strong>u (H 2 O 2 ) (katalaza) 1<br />
Odczynnik Kovacsa (do indolu) 1<br />
Odczynnik do wykrywania oksydazy (dimetyl-p-fenylenodiamina) 1<br />
Osocze (do testu na koagulazę i testu filamentacji) 1<br />
Zestaw do barwienia metodą Ziehl-Neelsena 1<br />
168
CZE˛ŚĆ II<br />
Buf<strong>or</strong>owany fizjologiczny roztwór soli z glicerolem (do transp<strong>or</strong>tu<br />
kału) 2<br />
Węglowodany: glukoza, laktoza, maltoza, mannitol, sacharoza 2<br />
Generat<strong>or</strong> wod<strong>or</strong>u do anaerostatu 2<br />
Tusz chiński (do wykrywania otoczek) 2<br />
Lizyna (do wykrywania dekarboksylazy) 2<br />
Kra˛żki do oznaczania lekowrażliwości<br />
Lista ważnych antybiotyków wg WHO (2002)<br />
amoksycylina<br />
ampicylina<br />
benzylopenicylina<br />
chl<strong>or</strong>amfenikol<br />
ciprofloksacyna<br />
kotrimoksazol (sulfametoksazol-trimetoprim)<br />
kloksacylina<br />
erytromycyna<br />
gentamycyna<br />
kanamycyna<br />
kwas nalidyksowy<br />
nitrofurantoina<br />
sulfonamid<br />
tetracyklina (lub doksycyklina)<br />
trimetoprim<br />
Lista antybiotyków rezerwowych<br />
amoksycylina/kwas klawulanowy<br />
amikacyna<br />
cefalotyna<br />
cefazolina<br />
cefotaksym<br />
ceftazydym<br />
ceftriakson<br />
cefuroksym<br />
ciprofloksacyna i inne flu<strong>or</strong>ochinolony<br />
klindamycyna<br />
piperacylina<br />
wankomycyna<br />
Surowice do aglutynacji<br />
Pri<strong>or</strong>ytet<br />
Salmonella: poliwalentna surowica anty-O (A-I i Vi) 1<br />
surowice anty-O: O:2 (A), O:4 (B), O:9 (D), Vi 2<br />
surowice anty-H: H:a, H:b, H:d, H:i, H:m, H:2 3<br />
surowice anty-H fazy inwersji: H:b, H:i, H:1,2 3<br />
169
PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE<br />
Shigella:<br />
poliwalentne surowice anty-dysenteriae, anty-flexneri,<br />
anty-boydii, anty-sonnei 1<br />
surowica anty-dysenteriae typ 1 (Shiga) 1<br />
Vibrio cholerae: poliwalentna surowica anty-Ol 1<br />
surowica anty-B (Ogawa), anty-C (Inaba),<br />
anty-O:139 3<br />
Haemophilus influenzae: surowica typowa anty-b 3<br />
Neisseria meningitidis: poliwalentna 3<br />
surowice grupowe anty-A, anty-B, anty-C 3<br />
170
Wybrana literatura uzupełniaja˛ca<br />
August M.J. et al.: Quality control and quality assurance practices in clinical microbiology.<br />
Cumitech, 1990, 3A: 1– 14.<br />
Basics of quality assurance f<strong>or</strong> intermediate and peripheral lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ies, 2nd ed.<br />
Alexandria, WHO Regional Office f<strong>or</strong> the Eastern Mediterranean, 2000.<br />
Baron E.J., Finegold S.M.: Diagnostic microbiology, 8th ed. St Louis, MO, The C.V.<br />
Mosby Company, 1990.<br />
Blazevic D.J. et al.: Practical quality control procedures f<strong>or</strong> the clinical microbiology<br />
lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y. Cumitech, 1976, 3: 1– 12.<br />
Cheesbrough M.: Medical lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>y manual f<strong>or</strong> tropical countries. Vol. II: Microbiology.<br />
London, Tropical Health Technology/Butterw<strong>or</strong>ths, 1989.<br />
Collins C.H., Lyne P.M.: Microbiological methods, 5th ed. London, Butterw<strong>or</strong>ths, 1985.<br />
Gillies R.P., Paul J.: Bacteriology illustrated. Edinburgh, Churchill Livingstone, 1983.<br />
Howard B.J. et al.: Clinical and pathogenic microbiology. St Louis, MO, The C.V. Mosby<br />
Company, 1987.<br />
Koneman E.W.: Col<strong>or</strong> atlas and textbook of diagnostic microbiology, 5th ed. Philadelphia,<br />
Lippincott, 1997.<br />
Miller J.M.: Quality control in microbiology. Atlanta, GA, Centers f<strong>or</strong> Disease Control and<br />
Prevention, 1987.<br />
Miller J.M., Wentw<strong>or</strong>th B.B.: Methods f<strong>or</strong> quality control in diagnostic microbiology.<br />
Washington, DC, American Public Health Association, 1985.<br />
Montefi<strong>or</strong>e D.G. et al.: Tropical microbiology. Edinburgh, Churchill Livingstone, 1984.<br />
Murray P. et al.: Manual of clinical microbiology, 8th ed. Washington, DC, American<br />
Society f<strong>or</strong> Microbiology, 2003.<br />
Stokes E.J. et al.: Quality control. In: Clinical bacteriology, 7th ed. London, Edward<br />
Arnold, 1993.<br />
Turk D.C. et al.: A sh<strong>or</strong>t textbook of medical microbiology. London, Hodder & Stoughton,<br />
1983.<br />
Summanen P. et al.: Wadsw<strong>or</strong>th anaerobic bacteriology manual. Belmont, CA, Star<br />
Publishing Company, 1993.<br />
171
Sk<strong>or</strong>owidz<br />
Acinetobacter lwofii 20 – 22<br />
– spp., obraz hodowli 83<br />
– w wydzielinie z cewki moczowej u mężczyzn<br />
90<br />
Actinomyces israelii 105<br />
Aerobacter butzleri, identyfikacja biochemiczna<br />
67<br />
Aeromonas 162<br />
– caviae, biochemiczne reakcje 65<br />
––wywoływane zakażenia 49<br />
– hydrophila, biochemiczne reakcje 65<br />
––wywoływane zakażenia 49<br />
– sobria, wywoływane zakażenia 49<br />
– veroni, biochemiczne reakcje 65<br />
– wstępna identyfikacja 61<br />
Agar cefoksytyno-cykloseryno-fruktozowy<br />
(CCFA), podłoże do hodowli patogenów<br />
jelitowych 54<br />
– cysteinowo-tryptozowy (CTA), przechowywanie<br />
szczepów długoterminowe 26<br />
– cytrynianowy Simmonsa 21<br />
– czekoladowy 21<br />
––podłoże dla płynu mózgowo-rdzeniowego<br />
38<br />
– deoksycholanowo-cytrynianowy (DCA),<br />
podłoże do hodowli patogenów jelitowych<br />
53<br />
– Hektoen (HEA), podłoże do hodowli<br />
patogenów jelitowych 53<br />
– Kliglera (KIA) 22<br />
––procedura posiewu i odczytu 56 – 58<br />
––reakcje typowe Enterobacteriaceae 61<br />
– ksylozo-lizyno-deoksycholanowy<br />
(XLD), podłoże do hodowli patogenów<br />
jelitowych 53<br />
– MacConkeya, podłoże do hodowli patogenów<br />
jelitowych 53<br />
––podłoże dla płynu mózgowo-rdzeniowego<br />
38<br />
––z fioletem krystalicznym 21<br />
– Mueller-Hintona 21, 126<br />
– Salmonella-Shigella (SS agar) 21<br />
––podłoże do hodowli patogenów jelitowych<br />
53<br />
– siarczanowo-bizmutowy, podłoże do hodowli<br />
patogenów jelitowych 53<br />
– Tayer-Martina 21, 90, 91<br />
– tellurynowy z krwią selektywny 77<br />
– z cytrynianem deoksycholanu 21<br />
––tiosiarczanowym, solami żółci i sacharozą<br />
(TCBS), podłoże do hodowli patogenów<br />
jelitowych 53<br />
– z krwią 21<br />
––podłoże dla płynu mózgowo-rdzeniowego<br />
38<br />
Agar, z mannitolem 21<br />
– z solami żółci (BSA), podłoże do hodowli<br />
patogenów jelitowych 54<br />
––i cytrynianem tiosiarczanowym 21<br />
– z zasadowym ekstraktem mięsnym<br />
(MEA), podłoże do hodowli patogenów<br />
jelitowych 54<br />
– zżółcią i eskuliną 21<br />
– żelazowy trójcukrowy – patrz Agar Kliglera<br />
Aglutynacja lateksowa, <strong>procedury</strong><br />
156<br />
– surowice 169<br />
Aglutyniny, wykrywanie w g<strong>or</strong>ączce 150<br />
AIDS – patrz Zespół nabytego niedob<strong>or</strong>u<br />
odp<strong>or</strong>ności<br />
Ameby, poszukiwanie w płynie mózgowo-<br />
-rdzeniowym 37<br />
Amikacyna 123, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Aminoglikozydy 125<br />
Amoksycylina 92, 123, 125, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Ampicylina 92, 123, 125, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Anaerostat, kontrola jakości 18<br />
Angina Vincenta 74<br />
Antybiogram – patrz też Lekowrażliwość<br />
– jako narzędzie badań epidemiologicznych<br />
123<br />
– jako wskazówka do leczenia 122<br />
– karta kontroli jakości 137<br />
– w hodowli z krwi 34<br />
Antybiotyki do rutynowego oznaczania<br />
wrażliwości 123<br />
– jako dodatek do podłoży 168<br />
– krążki 127<br />
– lista rezerwowych 169<br />
– określanie wrażliwości, szablon 133<br />
– oznaczanie lekowrażliwości 24, 118,<br />
119, 127, 133<br />
– stężenie w krążkach 135<br />
– strefy zahamowania wzrostu 126, 132,<br />
133<br />
– ważne wg WHO 169<br />
Antygen(y) bakteryjne, wykrywanie 155<br />
– do diagnostyki 23<br />
– H, procedura identyfikacji 70<br />
– somatyczny O, procedura identyfikacji<br />
68<br />
– VDRL, przygotowanie 144, 145<br />
Antykoagulant 32<br />
Arcobacter butzleri, wywoływane zakażenia<br />
50<br />
Autoklaw, kontrola jakości 18<br />
172
SKOROWIDZ<br />
Bacillus anthracis 102, 111, 166<br />
Bacteroides 166<br />
– fragilis 20, 21, 101, 113, 160<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––a zakażenia szpitalne 103<br />
––identyfikacja 116, 118<br />
– melaninogenicus – patrz Prevotella melaninogenica<br />
Bacytracyna 168<br />
Badanie(a) bakteriologiczne 29<br />
––rodzaje gwarancji jakości 13<br />
––zapewnienie jakości 12<br />
– mikrobiologiczne 14, 15<br />
– serologiczne 138<br />
––metody kontroli jakości 138<br />
––wyposażenie lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium 139<br />
Bakterie beztlenowe 20<br />
––diagnostyka zakażeń 114<br />
––identyfikacja 116<br />
––podłoża do hodowli 115<br />
––posiew i izolacja 115<br />
––przechowywanie długoterminowe 26<br />
––wrażliwość na antybiotyki 118<br />
––zakażenia 113<br />
– Gram-ujemne kwasoop<strong>or</strong>ne 20<br />
– jelitowe, m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
––wstępna identyfikacja izolowanych<br />
szczepów 56<br />
– kwasoop<strong>or</strong>ne, barwienie metodą Ziehl-<br />
-Neelsena 38<br />
– mikroaerofilne 113<br />
– podział ze względu na wymagania tlenowe<br />
113<br />
Bakteriemia 30, 113<br />
– przyczyny 31<br />
Barwienie kwasoop<strong>or</strong>ne (Ziehl-Neelsena)<br />
106<br />
––test jakości 23<br />
– metodą Grama 105<br />
–––test jakości 23<br />
Barwniki 22<br />
Benzylopenicylina 84, 123, 124, 126, 169<br />
– działanie na Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae 92<br />
– stefy zahamowania wzrostu 132, 133<br />
Białko, stężenie w poszczególnych typach<br />
zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
38<br />
Biegunki, czynniki etiologiczne 48<br />
– w zakażeniach HIV/AIDS 48<br />
Błonica 74<br />
B<strong>or</strong>detella pertussis 142<br />
B<strong>or</strong>relia burgd<strong>or</strong>feri 148<br />
Botulizm przyranny 102, 113<br />
Brucella 160<br />
– spp. a bakteriemia i fungemia 31<br />
– wykrywanie aglutynin 150<br />
Bruceloza, miano aglutynin 150<br />
– wykrywanie aglutynin, test probówkowy<br />
152<br />
Bruceloza, miano aglutynin, test szkiełkowy<br />
151<br />
– zestaw do wykrywania aglutynin 151<br />
BSA – patrz Agar z solami żółci<br />
Bulion azotanowy 21<br />
– do posiewu z krwi 32<br />
– malonianowy 21<br />
– Schaedlera 160<br />
– seleninowy 21<br />
– tioglikolanowy 21<br />
– tryptozowo-sojowy (TSB), 32, 160<br />
––wybór podłoża dla płynu mózgowo-<br />
-rdzeniowego 38<br />
– Wilkins-Chalgrena 160<br />
– z mocznikiem, lekko buf<strong>or</strong>owany<br />
(UREA), procedura posiewu i odczytu 56<br />
– z wyciągiem mózgowo-sercowym 160<br />
Burkholderia pseudomallei 160<br />
––jako przyczyna bakteriemii i fungemii<br />
31<br />
Butelki z podłożem do posiewu krwi 32<br />
Calymmatobacterium granulomatis 96<br />
––objawy zakażenia 89<br />
Campylobacter coli, identyfikacja biochemiczna<br />
67<br />
––identyfikacja końcowa 66<br />
–––wstępna 61<br />
––wywoływane zakażenia 50<br />
– fetus, identyfikacja biochemiczna 67<br />
– hyointestinalis, identyfikacja biochemiczna<br />
67<br />
– jejuni 113<br />
––identyfikacja biochemiczna 67<br />
–––końcowa 66<br />
–––wstępna 61<br />
––wywoływane zakażenia 50<br />
– lari, identyfikacja biochemiczna 67<br />
– spp. 162<br />
––badanie wizualne próbek kału 52<br />
––wybór podłoża 18<br />
– upsaliensis, identyfikacja biochemiczna<br />
67<br />
– warunki inkubacji 54<br />
Candida albicans 20, 21, 95, 160, 161, 165<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––a zapalenie pochwy 93<br />
––lekowrażliwość 85<br />
––objawy zakażenia 89<br />
––obraz hodowli 83<br />
– a zapalenie gardła 75<br />
CCFA – patrz Agar cefoksytyno-cykloseryno-fruktozowy<br />
Cefaleksyna 125<br />
Cefal<strong>or</strong>ydyna 125<br />
Cefalotyna 123 – 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Cefalozyna 126<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
173
SKOROWIDZ<br />
Cefamandol 125<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Cefamycyna 125<br />
Cefapiryna 125<br />
Cefazolina 125, 169<br />
Cefoksytyna 125<br />
Cefotaksym 125, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Cefradyna 125<br />
Ceftazydym 123, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Ceftriakson 123, 125, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Cefuroksym 123, 125, 126, 169<br />
– sodium, strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Cewka moczowa u mężczyzn, zapalenie 90<br />
Chlamydia psittaci 142<br />
– trachomatis 89, 96, 165<br />
––a odczyn immunoflu<strong>or</strong>escencji 142<br />
––a zapalenie cewki moczowej u mężczyzn<br />
90<br />
–––pochwy u dziewczynek 93<br />
–––szyjki macicy 93, 95<br />
––zakażenie w ciąży 93<br />
–––objawy 89<br />
– wykrywanie 90<br />
Chl<strong>or</strong>amfenikol 84, 118, 123, 124, 126,<br />
168, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Chl<strong>or</strong>ek sodu 140<br />
– żelaza/deaminaza fenyloalaniny 21<br />
Chłodziarka, kontrola jakości 18<br />
Cholera 49<br />
– badanie wizualne próbek kału 52<br />
Ch<strong>or</strong>oba(y) legionistów 79<br />
– z Lyme 148<br />
– przenoszone drogą kontaktów seksualnych,<br />
89<br />
––próbki do diagnostyki 165<br />
––spodziewane patogeny 165<br />
Cieplarka, kontrola jakości 18<br />
Ciprofloksacyna 123, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Citrobacter freundi 22<br />
––biochemiczne reakcje 63<br />
– spp. a zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
Clostridium botulinum 113<br />
– difficile, wstępna identyfikacja 61<br />
––wywoływane zakażenia 50<br />
– perfringens 20, 102, 113, 166<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––a zakażenia szpitalne 102<br />
––identyfikacja 116<br />
– spp. 93<br />
– tetani 113<br />
C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae 74, 142<br />
––hodowla 77<br />
––nosicielstwo 75<br />
Cryptococcus neof<strong>or</strong>mans 160, 161<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––a zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
––posiew 39<br />
––poszukiwanie w płynie mózgowo-<br />
-rdzeniowym 37<br />
CTA – patrz Agar cysteinowo-tryptozowy<br />
Czas inkubacji a wielkość strefy zahamowania<br />
134<br />
Czerwień metylowa/Voges-Proskauer 21<br />
Czerwonka pełzakowa, badanie wizualne<br />
próbek kału 52<br />
Czynnik V, test jakości 23<br />
– XV, test jakości 23<br />
DCA – patrz Agar deoksycholanowo-cytrynianowy<br />
Deaminaza fenyloalaniny/chl<strong>or</strong>ek żelaza 21<br />
Dekarboksylaza lizyny 21<br />
– <strong>or</strong>nityny 21<br />
Dezynfekcja skóry w miejscu wkłucia 31<br />
Diagnostyka mikrobiologiczna, etapy 14<br />
Dihydrolaza argininy 21<br />
Dikloksacylina 124<br />
Doksycyklina 169<br />
Drogi oddechowe dolne, spodziewane patogeny<br />
165<br />
––górne, spodziewane patogeny 164<br />
–––zakażenia 73<br />
Edwardsiella tarda, biochemiczne reakcje<br />
63<br />
Enterobacter cloacae 20<br />
– spp. a bakteriemia i fungemia 31<br />
– m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
– wstępna identyfikacja 56<br />
Enterobacteriaceae 20, 160, 161, 162, 166<br />
– lekowrażliwość 84, 123<br />
– na agarze żelazowym Kliglera (KIA) 60,<br />
61<br />
– obraz hodowli 84<br />
– przechowywanie długoterminowe 25<br />
– wstępna identyfikacja 39, 57, 59<br />
– wybór podłoża 17<br />
– w wydzielinie z cewki moczowej u mężczyzn<br />
90<br />
– zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
Enterococcus faecalis 20, 21<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––szczep kontrolny 127<br />
– faecium 122<br />
– spp., m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
Enterokoki 161<br />
Erytromycyna 84, 123, 124 – 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Escherichia coli 20 – 22, 113, 161, 162<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
174
SKOROWIDZ<br />
Escherichia coli, a zakażenia szpitalne 102<br />
––a zapalenie oskrzeli 80<br />
–––opon mózgowo-rdzeniowych 36<br />
––badanie wizualne próbek kału 52<br />
––biochemiczne reakcje 63<br />
––m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
––strefy zahamowania wzrostu 126<br />
––szczepy standardowe do kontroli jakości<br />
136<br />
––test β-glukuronidazowy do szybkiej<br />
identyfikacji 47<br />
––w moczu 122<br />
––wstępna identyfikacja 56<br />
––wykrywanie antygenów 155<br />
––wywoływane zakażenia 49<br />
Fenetycylina 124<br />
Fenoksymetylopenicylina 124<br />
Fermentacja dekstrozy bez oleju 21<br />
Flukloksacylina 124<br />
Francisella tularensis 152<br />
––miano aglutynin 150<br />
Fungemia 30<br />
– przyczyny 31<br />
Gardło, fl<strong>or</strong>a fizjologiczna 73<br />
– pobieranie materiału do badań 75<br />
– przesyłanie materiału do badań 75<br />
– zapalenie, czynniki bakteryjne 74<br />
Gardnerella vaginalis 95, 165<br />
––objawy zakażenia 89<br />
––zapalenie pochwy 93<br />
Gentamycyna 123, 125, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Glicerol, przechowywanie szczepów długoterminowe<br />
25<br />
Glukoza, stężenie w poszczególnych typach<br />
zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
38<br />
β-Glukuronidaza (PGUA), test jakości 23<br />
Gonokoki, przechowywanie szczepówkrótkoterminowe<br />
26<br />
– zapalenie gardła 74<br />
G<strong>or</strong>ączka, wykrywanie aglutynin 150<br />
Gronkowce 101<br />
– identyfikacja 108<br />
– przechowywanie długoterminowe 25<br />
– wrażliwość na benzylopenicyliny 133<br />
– w wydzielinie z cewki moczowej u mężczyzn<br />
90<br />
Gruźlica płuc 79, 80<br />
Grzyby 20<br />
Haemophilus 142<br />
– ducreyi 96, 165<br />
––hodowla 98, 99<br />
––objawy zakażenia 89<br />
––pobieranie próbki 97<br />
Haemophilus influenzae 21, 108, 122, 160,<br />
161<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––a zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
–––oskrzeli 79, 80<br />
–––płuc 80<br />
––lekowrażliwość 85<br />
––obraz hodowli 83<br />
––surowice do aglutynacji 164, 170<br />
––typ b 20<br />
––w aspiratach z jamy opłucnej 101<br />
––wstępna identyfikacja 39<br />
––wykrywanie antygenów 155<br />
– parainfluenzae 20<br />
– przechowywanie szczepów krótkoterminowe<br />
26<br />
Hafnia alvei, biochemiczne reakcje 63<br />
HBV – patrz Wirus zapalenia wątroby<br />
typu B<br />
HEA – patrz Agar Hektoen<br />
Herpesvirus 96<br />
– a zapalenie cewki moczowej u mężczyzn<br />
90<br />
HIV/AIDS – patrz Zespół nabytego niedob<strong>or</strong>u<br />
odp<strong>or</strong>ności<br />
Hodowla(e) 28<br />
– C<strong>or</strong>ynebacterium diphtheriae 77<br />
– Mycobacterium tuberculosis 85, 87<br />
– Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae 91, 92, 95<br />
– patogenów jelitowych, podłoża 53<br />
– płynu mózgowo-rdzeniowego, wybór<br />
podłoża 38<br />
– podłoża 17, 159<br />
– Streptococcus pyogenes 76<br />
– warunki beztlenowe 114<br />
– z krwi 31, 33<br />
Identyfikacja antygenu H 70<br />
––somatycznego O 68<br />
– Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae 92<br />
– serologiczna Yersinia enterocolitica 72<br />
––Salmonella 67, 69<br />
–––paratyphi A 70<br />
–––typhi 70<br />
––Shigella 71<br />
Indol (woda peptonowa) 21<br />
Inhibit<strong>or</strong>y jako dodatek do podłoży 168<br />
Inoculum, gęstość a wielkość strefy zahamowania<br />
134<br />
– przygotowanie 137<br />
Interpretacja wyników badań, jakość 13<br />
Jama otrzewnej, drobnoustroje 101<br />
– zapalenie 113<br />
Kał 48<br />
– badanie wizualne próbek 52<br />
––wstępna izolacja 54<br />
175
SKOROWIDZ<br />
Kał, identyfikacja biochemiczna gatunków<br />
Campylobacter 67<br />
––końcowa mikrobiologiczna izolowanych<br />
szczepów 62<br />
–––serologiczna izolowanych szczepów<br />
67<br />
––wstępna izolowanych szczepów 56<br />
– izolacja bakterii wstępna 54<br />
– pobieranie próbek do badania 51<br />
– podłoża transp<strong>or</strong>towo-wzbogacające 53<br />
– posiew próbek 53<br />
– przesyłanie próbek do badania 51<br />
– spodziewane patogeny 162<br />
Kanamycyna 125, 169<br />
Kandydiaza pochwy 95<br />
Katalaza, test jakości 23<br />
KIA – patrz Agar Kliglera<br />
Kiła 96<br />
– diagnostyka, odczyny serologiczne 142<br />
– odczyn VDRL 143<br />
Klebsiella pneumoniae 20, 21<br />
––a zapalenie oskrzeli 80<br />
––a zapalenie płuc 80<br />
– spp. a bakteriemia i fungemia 31<br />
––m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
––wstępna identyfikacja 56<br />
Klindamycyna 118, 123, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Kloksacylina 124, 169<br />
Koaglutynacja, <strong>procedury</strong> 156<br />
Kolistyna 168<br />
Kontakty seksualne, przenoszone ch<strong>or</strong>oby<br />
89<br />
Kontrola jakości sprzętu 18<br />
––standardowa procedura 136<br />
––standardowe szczepy 136<br />
––wewnętrzna 16<br />
––zestaw szczepów 20<br />
––zewnętrzna 27<br />
Kotrimoksazol 84, 123, 125, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Krążek z bacytracyną, test jakości 23<br />
– z optochiną, test jakości 23<br />
– z tellurydem, test jakości 23<br />
Krążki 168<br />
– czas nałożenia a wielkość strefy zahamowania<br />
134<br />
– do oznaczania lekowrażliwości 169<br />
– z antybiotykami 127, 135<br />
––nakładanie na płytkę 137<br />
Krew 30<br />
– antybiogram 34<br />
– butelki z podłożem do posiewu 32<br />
– objętość próbki 31<br />
– pobieranie próbek 31<br />
– podłoża do posiewu 32<br />
––płynne do hodowli 160<br />
– prowadzenie hodowli 33<br />
– spodziewane patogeny 160<br />
Krew, zakażenie a wrażliwość antybiotyków<br />
123<br />
Krętki Reitera 148<br />
– odczyn immunoflu<strong>or</strong>escencji w modyfikacji<br />
abs<strong>or</strong>pcyjnej (FTA-Abs) 148<br />
Kryteria jakości w mikrobiologii 14<br />
Kwas klawulanowy 123, 126, 169<br />
––strefy zahamowania wzrostu 132<br />
– nalidyksowy 123, 126, 169<br />
––strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ia referencyjne 27<br />
Lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>ium mikrobiologiczne, zapewnienie<br />
jakości badań 13<br />
– wyposażenie do badań serologicznych<br />
139<br />
Legionella pneumophila 142<br />
––metody badań 79<br />
Lekowrażliwość bakterii wyhodowanych<br />
z plwociny 84<br />
– krążki do oznaczania 169<br />
– oznaczanie na antybiotyki 133<br />
––w moczu 47<br />
––wpłynie mózgowo-rdzeniowym 40<br />
– szczepów izolowanych z gardła 78<br />
Leukocytoza w poszczególnych typach<br />
zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
38<br />
Listeria monocytogenes 93, 161<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––a zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
––wstępna identyfikacja 39<br />
Łaźnia wodna 139<br />
––kontrola jakości 18<br />
MEA – patrz Agar z zasadowym ekstraktem<br />
mięsnym<br />
Meningokoki, przechowywanie szczepów<br />
krótkoterminowe 26<br />
Metoda dyfuzyjno-krążkowa – patrz Metoda<br />
Kirby-Bauera<br />
Metoda Grama, test jakości barwienia 23<br />
Metoda Kirby-Bauera 119, 120<br />
––czynniki techniczne 134<br />
––zmodyfikowana 125<br />
–––interpretacja stref zahamowania<br />
wzrostu 132<br />
– NEO-SENSITABS 119<br />
Metronidazol 118<br />
Metycylina 124<br />
– badanie wrażliwości Staphylococcus aureus<br />
134<br />
Micrococcus spp. 113<br />
Mikrobiologia, kryteria jakości 14<br />
Mikro<strong>or</strong>ganizmy Gram-dodatnie jako przyczyna<br />
bakteriemii 31<br />
––––fungemii 31<br />
176
SKOROWIDZ<br />
Mikro<strong>or</strong>ganizmy Gram-ujemne jako przyczyna<br />
bakteriemii 31<br />
––––fungemii 31<br />
Mikroskop, kontrola jakości 18<br />
Mikroskopy 139<br />
MIL – patrz Podłoże ruch-indol-lizyna<br />
Minocyklina 124<br />
Mobiluncus spp. a zapalenie pochwy 93<br />
––objawy zakażenia 89<br />
Mocz, badanie przesiewowe 43<br />
––zużyciem kalibrowanej ezy 44<br />
–––pasków bibułowych 44<br />
– hodowla i interpretacja 43<br />
– identyfikacja drobnoustrojów 47<br />
– metody badań przesiewowych 43<br />
– oznaczanie lekowrażliwości 47<br />
– pobieranie materiału do badania, 41, 42<br />
––u niemowląt i dzieci 43<br />
– posiew ilościowy i wstępna identyfikacja<br />
44<br />
–––interpretacja wyników 46<br />
– spodziewane patogeny 161<br />
– zakażenie a wrażliwość antybiotyków<br />
123<br />
Mononukleoza zakaźna 142<br />
M<strong>or</strong>axella catarrhalis 20<br />
––lekowrażliwość 84<br />
––obraz hodowli 83<br />
––zapalenie oskrzeli 79<br />
M<strong>or</strong>ganella, biochemiczne reakcje 63<br />
Mycobacterium f<strong>or</strong>tuitum 107<br />
– f<strong>or</strong>tuitum-chelonei 106<br />
– marinum 107<br />
– spp. 166<br />
– tuberculosis 101, 161, 166<br />
––jako przyczyna zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
––hodowla 85, 87<br />
–––interpretacja 88<br />
–––zasady bezpieczeństwa 88<br />
– ulcerans 107, 166<br />
Mycoplasma pneumoniae 138<br />
––metody badań 79<br />
Naegleria fowleri, poszukiwanie w płynie<br />
mózgowo-rdzeniowym 37<br />
Nafcylina 124<br />
Narządy płciowe żeńskie, pobieranie próbek<br />
93<br />
–––transp<strong>or</strong>t próbek 93<br />
––owrzodzenia 96<br />
–––pobieranie próbek 96<br />
Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae 20, 21, 122, 165<br />
––a zapalenie cewki moczowej u mężczyzn<br />
90<br />
–––pochwy u dziewczynek 93, 95<br />
–––szyjki macicy 93<br />
––badanie wrażliwości na antybiotyki 92<br />
––hodowla 91, 92, 95<br />
Neisseria gon<strong>or</strong>rhoeae, identyfikacja 92<br />
––zakażenia, objawy 89<br />
–––w ciąży 93<br />
– meningitidis 20, 21, 122, 160, 161<br />
––nosicielstwo 75<br />
––przyczyną bakteriemii i fungemii 31<br />
–––zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
––surowice do aglutynacji 164, 170<br />
––wstępna identyfikacja 39<br />
––wykrywanie antygenów 155<br />
– przechowywanie szczepów długoterminowe<br />
26<br />
Netylmycyna 125<br />
Niemowlęta, zapalenie opon mózgowo-<br />
-rdzeniowych, przyczyny 36<br />
o-Nitrofenylo-β-D-galaktopiranozyd 23<br />
Nitrofurantoina 123, 125, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Nocardia asteroides 108, 113<br />
N<strong>or</strong>floksacyna 123<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
NYC – patrz Podłoże New Y<strong>or</strong>k City<br />
Nystatyna 168<br />
Odczyn aglutynacji 141<br />
– ASO 152<br />
– FTA-Abs 149<br />
– immunoflu<strong>or</strong>escencji 142<br />
––krętków w modyfikacji abs<strong>or</strong>pcyjnej<br />
(FTA-Abs) 148<br />
– kłaczkujący 141<br />
– precypitacji 141<br />
– RPR 142, 146 – 148<br />
––jakościowy 147<br />
––półilościowy 147<br />
Odczyn VDRL 142 – 146<br />
––półilościowy 145<br />
– Weila-Felixa 150<br />
– Widala 150<br />
– Wrighta 150<br />
Odczynnik Nitrocefin 92<br />
Odczynniki 22, 126<br />
– diagnostyczne 159, 168<br />
––do hodowli płynu mózgowo-rdzeniowego<br />
161, 162<br />
–––próbek z układu moczowo-płciowego<br />
166<br />
–––z dolnych dróg oddechowych 165<br />
–––zgórnych dróg oddechowych 164<br />
––do kału 163<br />
––w hodowli krwi 160<br />
–––ropy 167<br />
– do badań serologicznych 140<br />
– testy jakości 23<br />
Odczyny aglutynacji lateksowej, <strong>procedury</strong><br />
156<br />
– serologiczne 138<br />
––w diagnostyce kiły 142<br />
177
SKOROWIDZ<br />
Odleżyny, owrzodzenia, pobieranie próbek<br />
104<br />
Oksacylina 84, 123, 124, 126<br />
– badanie wrażliwości Staphylococcus aureus<br />
134<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Oksydaza, test jakości 23<br />
Oleandomycyna 125<br />
Olej mineralny, przechowywanie szczepów<br />
długoterminowe 25<br />
ONPG – patrz o-Nitrofenylo-β-D-galaktopiranozyd<br />
Oparzenia, drobnoustroje 101<br />
– pobieranie próbek 104<br />
Opony mózgowo-rdzeniowe, przyczyny<br />
zapalenia 36<br />
Oskrzela, zapalenie 80<br />
Osocze do koagulazy, test jakości 23<br />
Owrzodzenia narządówpłciowych, badanie<br />
bezpośrednie próbki 97<br />
–––hodowla 98<br />
–––pobieranie próbek 96<br />
– odleżynowe, pobieranie próbek 104<br />
– Buruli 107<br />
Paci<strong>or</strong>kowce 160<br />
– α-hemolizujące jako przyczyna bakteriemii<br />
i fungemii 31<br />
– β-hemolizujące, różnicowanie 77<br />
– przechowywanie szczepów 26<br />
– w aspiratach z jamy opłucnej 101<br />
– zieleniejące 160<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
Pałeczki beztlenowe Gram-dodatnie, wstępna<br />
identyfikacja 58<br />
––Gram-ujemne, wstępna identyfikacja<br />
59<br />
– Gram-ujemne 20<br />
Papilomavirus, objawy zakażenia 89<br />
Paski 168<br />
– bibułowe do badania moczu 44<br />
Pasteurella multocida 102, 110, 166<br />
Patogeny 159<br />
– jelitowe, podłoża do hodowli 53<br />
Peptostreptococcus, identyfikacja 117<br />
– magnus 113<br />
– spp. a ropień płuca 80<br />
––jako przyczyna bakteriemii i fungemii<br />
31<br />
PGUA – patrz β-Glukuronidaza<br />
Piperacylina 123, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Piwampicylina 125<br />
Plesiomonas 162<br />
– shigelloides, biochemiczne reakcje 63,<br />
65<br />
Plwocina, badanie mikroskopowe 82<br />
– hodowla i interpretacja 82<br />
– ocena makroskopowa 81<br />
Plwocina, pobieranie próbek 81<br />
– podłoża do hodowli 83<br />
– ropna, badania 79<br />
Płuca, gruźlica 80<br />
– zapalenie 80<br />
Płyn mózgowo-rdzeniowy, badanie mikroskopowe<br />
37<br />
––barwienie preparatów metodą Grama<br />
37<br />
––cechy w zapaleniu opon 38<br />
––ocena makroskopowa 37<br />
––oznaczanie lekowrażliwości 40<br />
––pobieranie 36<br />
––spodziewane patogeny 161<br />
––transp<strong>or</strong>t próbek 36<br />
Płytka hodowlana, sposób posiewu bakterii<br />
45<br />
Pneumokoki w aspiratach z jamy opłucnej<br />
101<br />
Podłoża do hodowli 17, 159<br />
––bakterii beztlenowych 115<br />
––kału 163<br />
––płynu mózgowo-rdzeniowego 161<br />
––z plwociny 83<br />
– do identyfikacji w hodowli płynu mózgowo-rdzeniowego<br />
162<br />
– do izolacji w hodowli krwi 160<br />
–––płynu mózgowo-rdzeniowego 162<br />
–––próbek z układu moczowo-płciowego<br />
166<br />
–––ropy 166<br />
–––z dolnych dróg oddechowych 165<br />
–––zgórnych dróg oddechowych 164<br />
– do posiewu krwi 32<br />
– gotowe, przechowywanie 20<br />
– hodowlane, dodatki wzbogacające 168<br />
––rekomendowane 167<br />
– płynne do hodowli krwi 160<br />
– przygotowywane, kontrola jakości 20<br />
– testy kontrolne 21<br />
– z wyciągiem mięsnym, przechowywanie<br />
długoterminowe bakterii beztlenowych<br />
26<br />
Podłoże agarowe Thayer-Martina modyfikowane<br />
21, 90, 91<br />
– jajeczne D<strong>or</strong>seta 77<br />
– New Y<strong>or</strong>k City 91<br />
– ruch-indol-lizyna, procedura posiewu<br />
i odczytu 56, 57<br />
– suche, zamawianie i przechowywanie 18<br />
– tioglikolonowe płynne 160<br />
– z mocznikiem 22<br />
– z tellurynem, taurocholanem i żelatyną<br />
(TTG) dla patogenów jelitowych 54<br />
– przygotowanie 20<br />
– skład a wielkość strefy zahamowania<br />
134, 135<br />
P<strong>or</strong>phromonas w aspiratach z jamy opłucnej<br />
101<br />
178
SKOROWIDZ<br />
Prevotella melaninogenica a ropień płuca<br />
80<br />
– w aspiratach z jamy opłucnej 101<br />
Proteus mirabilis 20 – 22<br />
– spp. a bakteriemia i fungemia 31<br />
––biochemiczne reakcje 63<br />
––wstępna identyfikacja 56<br />
Proteus, m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
– strefy zahamowania wzrostu 133<br />
– vulgaris 150<br />
Providencia, biochemiczne reakcje 63<br />
– spp. 60<br />
Przecinkowce w kale, reakcje biochemiczne<br />
65<br />
Przeciwciała, oznaczanie 138<br />
Przetoki, pobiernie próbek 104<br />
Pseudobakteriemia, przyczyny 32<br />
Pseudomonas 162, 166<br />
– aeruginosa 20, 21, 101, 160<br />
––a zapalenie oskrzeli 80<br />
–––płuc 80<br />
––przyczyną bakteriemii i fungemii 31<br />
––stefy zahamowania wzrostu 126<br />
––szczepy standardowe do kontroli jakości<br />
136<br />
––wrażliwość na antybiotyki 123<br />
– jako przyczyna bakteriemii i fungemii 31<br />
– obraz hodowli 83<br />
– spp. w wydzielinie z cewki moczowej<br />
umężczyzn 90<br />
Rany 100<br />
– cięte 102<br />
– drążące, pobieranie próbek 104<br />
– drenujące węzłówchłonnych, pobieranie<br />
próbek 104<br />
– penetrujące 101, 102<br />
– pooperacyjne, pobieranie próbek 104<br />
– próbki chirurgiczne 100<br />
– zakażenia szpitalne 102<br />
Reakcje serologiczne 141<br />
Rickettsia spp. 142<br />
Riketsje, wykrywanie aglutynin 150<br />
Ropa, odczynniki diagnostyczne 167<br />
– podłoża do izolacji 166<br />
– spodziewane patogeny 166<br />
Ropień(nie) 100, 113<br />
– ot<strong>or</strong>biony, drobnoustroje 101<br />
– płuca 80<br />
– próbki chirurgiczne 100<br />
– pobieranie i transp<strong>or</strong>t próbek 103<br />
Ropniak opłucnej 113<br />
Rotawirusy 142<br />
– wywoływane zakażenia 50<br />
Salmonella 122, 160, 162<br />
– arizonae, biochemiczne reakcje 63<br />
– biochemiczne reakcje 63<br />
– choleraesuis, biochemiczne reakcje 63<br />
Salmonella, identyfikacja końcowa 62<br />
––serologiczna 67, 68<br />
–––wstępna 58<br />
– paratyphi A, biochemiczne reakcje 63<br />
––identyfikacja serologiczna 71<br />
– spp., identyfikacja 56<br />
––m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
––przyczyną bakteriemii i fungemii 31<br />
–––zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
– surowice do aglutynacji 163, 169<br />
– typhi, biochemiczne reakcje 63<br />
––identyfikacja serologiczna 70<br />
––przyczyną bakteriemii i fungemii 31<br />
––wstępna identyfikacja 56<br />
––wykrywanie aglutynin 150<br />
– typhimurium 20<br />
– wykrywanie antygenów 155<br />
– wywoływane zakażenia 48<br />
Salmonelozy, badanie wizualne próbek kału<br />
52<br />
Schemat Kauffmanna-White’a 68<br />
Sepsa 30<br />
Serratia marcescens 20, 21<br />
––biochemiczne reakcje 63<br />
Shigella 162<br />
– badanie wizualne próbek kału 52<br />
– boydii 72<br />
––biochemiczne reakcje 63, 64<br />
– dysenteriae 71<br />
––biochemiczne reakcje 63, 64<br />
– flexneri 20 – 22, 72<br />
––biochemiczne reakcje 63, 64<br />
– identyfikacja końcowa 65<br />
––serologiczna 71<br />
––wstępna 58<br />
– paratyphi 162<br />
– reakcje biochemiczne 63<br />
– sonnei 72<br />
––biochemiczne reakcje 63, 64<br />
– spp., m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
––wstępna identyfikacja 56<br />
– surowice do aglutynacji 164, 170<br />
– typhi 162<br />
– typhimurium 21, 22<br />
– wykrywanie antygenów 155<br />
– wywoływane zakażenia 49<br />
Skaleczenia zakażone, pobieranie próbek<br />
104<br />
Skóra, drobnoustroje 101<br />
Spiramycyna 125<br />
Sprzęt lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjny, dbałość 17<br />
––kontrola jakości 18<br />
SS agar – patrz Agar Salmonella-Shigella<br />
Staphylococcus agalactiae 20, 93<br />
– aureus 20, 21, 93, 107 – 110, 113, 142,<br />
160, 166<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––a zakażenia szpitalne 102<br />
179
SKOROWIDZ<br />
Staphylococcus aureus, a zapalenie oskrzeli<br />
80<br />
–––płuc 80<br />
––badanie wrażliwości na metycylinę<br />
134<br />
––––na oksacylinę 134<br />
––lekoop<strong>or</strong>ność 112<br />
––nosicielstwo 75<br />
––obraz hodowli 83<br />
––stefy zahamowania wzrostu 126<br />
––szczepy standardowe do kontroli jakości<br />
136<br />
– epidermidis 20, 21, 108 – 110<br />
––lekoop<strong>or</strong>ność 112<br />
––przyczyną bakteriemii i fungemii 31<br />
– mitis 20<br />
– pneumoniae 20<br />
– pyogenes 20<br />
– różnicowanie szczepów 110<br />
– saprophyticus 108 – 110, 162<br />
––spp. przyczyną zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
– wrażliwość na antybiotyki 123<br />
– wstępna identyfikacja 109<br />
Sterylizat<strong>or</strong> szkła, kontrola jakości 18<br />
Strefy zahamowania wzrostu, odczytywanie<br />
wyników 137<br />
Streptococcus 142, 166<br />
– agalactiae 161<br />
––przyczyną bakteriemii i fungemii 31<br />
–––zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych<br />
36<br />
––wstępna identyfikacja 39<br />
––wykrywanie antygenów 155<br />
– α-hemolizujący 21<br />
– pneumoniae 21, 160, 161<br />
––a bakteriemia i fungemia 31<br />
––a zapalenie oskrzeli 79<br />
–––opon mózgowo-rdzeniowych 36<br />
–––płuc 80<br />
––lekowrażliwość 84, 85<br />
––obraz hodowli 83<br />
––wykrywanie antygenów 155<br />
––wstępna identyfikacja 39<br />
– pyogenes 21, 122, 142, 160, 166<br />
––hodowla 76<br />
––nosicielstwo 7<br />
––odczyn ASO 152<br />
––przyczyną bakteriemii i fungemii 31<br />
–––zapalenia gardła 74<br />
Streptomycyna 125<br />
Sulfafurazol 125<br />
Sulfametoksazol 125, 169<br />
Sulfizoksazol 126<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Sulfonamidy 123, 125, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132, 133<br />
Surowica(e) 28, 140<br />
– do aglutynacji 169<br />
Surowica(e), do aglutynacji w kale 163<br />
– Loefflera 77<br />
– odp<strong>or</strong>nościowe do diagnostyki 23<br />
Szczepy izolowane z gardła, badanie lekowrażliwości<br />
78<br />
– kontrolne, pozyskiwanie 24<br />
––przechowywanie długoterminowe 25<br />
–––krótkoterminowe 26<br />
– standardowe do kontroli jakości 136<br />
Szyjka macicy, zapalenie 93<br />
Tabletki 168<br />
Talampicylina 125<br />
TCBS – patrz Agar z cytrynianem tiosiarczanowym,<br />
solami żółci i sacharozą<br />
Temperatura inkubacji a wielkość strefy<br />
zahamowania 134<br />
Termin ,,op<strong>or</strong>ny’’, definicja 120<br />
– ,,wrażliwy’’, definicja 120<br />
Test(y) aglutyncji lateksowy ASO, probówkowy<br />
153, 154<br />
––––szkiełkowy 153, 156<br />
––szkiełkowej 155<br />
–––bezpośredni 68<br />
– CAMP odwrotny 117<br />
– czułość diagnostyczna 16<br />
– dyfuzji 120<br />
– ELISA 155, 156<br />
– FTA-Abs – patrz Odczyn immunoflu<strong>or</strong>escencji<br />
krętków w modyfikacji abs<strong>or</strong>pcyjnej<br />
– β-glukuronidazowy do identyfikacji<br />
E. coli 47<br />
– hemaglutynacji pośredniej 66<br />
– IFA (indirect flu<strong>or</strong>escent antibody)<br />
– patrz Odczyn immunoflu<strong>or</strong>escencji<br />
– kontrolne dla podłoży 21<br />
– <strong>lab<strong>or</strong>at<strong>or</strong>yjne</strong>, gwarancja jakości 13<br />
––kontrola jakości 13<br />
––ocena jakości 14<br />
––wiarygodność 12<br />
– lekowrażliwości, kontrola jakości 136<br />
– na oksydazę, procedura 60<br />
– optyczny immunologiczny 156<br />
– probówkowy do wykrywania aglutynin<br />
w brucelozie 152<br />
– rozcieńczeń 120<br />
– RPR 141<br />
– szkiełkowy do wykrywania aglutynin<br />
w brucelozie 151<br />
– szybkie do hodowli płynu mózgowo-<br />
-rdzeniowego 161<br />
–––zgórnych dróg oddechowych 164<br />
– śluzowy, procedura 61<br />
– VDRL 141<br />
– wrażliwości na polimiksynę B66<br />
– z nitrocefiną 92<br />
– z surowicami odp<strong>or</strong>nościowymi Shigella<br />
71<br />
180
SKOROWIDZ<br />
Test(y), swoistość diagnostyczna 16<br />
– ,,złoty’’ immunologiczny 156<br />
Tetracyklina 84, 123, 124, 126, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Tężec 113<br />
– a rana penetrująca 102<br />
Tiamfenikol 124<br />
Tkanka(i) podskórna, drobnoustroje 101<br />
––zapalenie 113<br />
– zakażenie a wrażliwość antybiotyków<br />
123<br />
Tobramycyna 123, 125, 126<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Treponema pallidum 96, 141, 142, 148, 165<br />
––badanie bezpośrednie 97, 98<br />
––objawy zakażenia 89<br />
––pobieranie próbki 96<br />
Trichomonas vaginalis a zapalenie cewki<br />
moczowej u mężczyzn 90<br />
Trimetoprim 123, 125, 126, 168, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Trypanosoma, poszukiwanie w płynie mózgowo-rdzeniowym<br />
37<br />
TSB – patrz Bulion tryptozowo-sojowy<br />
TTG – patrz Podłoże z tellurynem, taurocholanem<br />
i żelatyną<br />
Ugryzienia przez zwierzęta 102<br />
Układ moczowo-płciowy, próbki do diagnostyki<br />
ch<strong>or</strong>ób przenoszonych drogą<br />
kontaktów seksualnych 165<br />
– pokarmowy, zakażenie a wrażliwość antybiotyków<br />
123<br />
UREA – patrz Bulion z mocznikiem, lekko<br />
buf<strong>or</strong>owany<br />
Ureaplasma urealyticum a zapalenie cewki<br />
moczowej u mężczyzn 90<br />
Utlenianie dekstrozy bez oleju 21<br />
Vibrio cholerae 20, 162<br />
––biochemiczne reakcje 65<br />
––biotypy, różnice 65<br />
––identyfikacja końcowa 65<br />
–––wstępna 59, 61<br />
––posiew kału 53<br />
––surowice do aglutynacji 164, 170<br />
––wykrywanie antygenów 155<br />
––wywoływane zakażenia 49<br />
– fluvialis, biochemiczne reakcje 65<br />
––wywoływane zakażenia 49<br />
– furnissii, biochemiczne reakcje 65<br />
– hollisae, biochemiczne reakcje 65<br />
––wywoływane zakażenia 49<br />
– mimicus, biochemiczne reakcje 65<br />
––wywoływane zakażenia 49<br />
– parahaemolyticus, wstępna identyfikacja<br />
59<br />
––wywoływane zakażenia 49<br />
– spp. 21<br />
Vibrioparahaemolyticus, biochemiczne reakcje<br />
65<br />
Voges-Proskauer – patrz Czerwień metylowa/Voges-Proskauer<br />
Waginoza bakteryjna 93<br />
Wankomycyna 126, 168, 169<br />
– strefy zahamowania wzrostu 132<br />
Węzły chłonne, drobnoustroje 101<br />
Wirówka, kontrola jakości 18<br />
Wirus cytomegalii, objawy zakażenia<br />
89<br />
– Epsteina-Barr 142<br />
– HIV – patrz Wirus nabytego niedob<strong>or</strong>u<br />
odp<strong>or</strong>ności<br />
– nabytego niedob<strong>or</strong>u odp<strong>or</strong>ności, objawy<br />
zakażenia 89<br />
– opryszczki 96<br />
––a zapalenie cewki moczowej u mężczyzn<br />
90<br />
––objawy zakażenia 89<br />
– różyczki 142<br />
– zapalenia wątroby typu B, objawy zakażenia<br />
89<br />
Woda peptonowa (indol) 21<br />
Wrzód miękki 96<br />
Wstrząsarki 139<br />
Wścieklizna 102<br />
Wydzielina(y) ropne 100<br />
––badanie lekowrażliwości 112<br />
–––mikroskopowe105<br />
––hodowla 107<br />
––identyfikacja drobnoustrojów 108<br />
––ocena makroskopowa 104, 105<br />
– z cewki moczowej u mężczyzn, transp<strong>or</strong>t<br />
próbek 90<br />
––badanie bezpośrednie i interpretacja<br />
91<br />
––pobieranie 90<br />
– z pochwy, badanie bezpośrednie i interpretacja<br />
94<br />
––hodowla 95<br />
––nieprawidłowa, przyczyny 93<br />
Wykrywanie antygenów bakteryjnych<br />
155<br />
Wymaz z odbytu, pobieranie 52<br />
Wymazówki 127<br />
Wyrostek robaczkowy, zapalenie 113<br />
Wysięk(i), drobnoustroje 101<br />
– komórkowy biegunkowego kału, badanie<br />
52<br />
– pobieranie próbek 104<br />
– ropny 100<br />
––próbki chirurgiczne 100<br />
– spodziewane patogeny 166<br />
Wz<strong>or</strong>zec zmętnienia 127<br />
XLD – patrz Agar ksylozo-lizyno-deoksycholanowy<br />
181
SKOROWIDZ<br />
Yersinia enterocolitica 20, 21, 162<br />
––biochemiczne reakcje 64<br />
––identyfikacja końcowa 64<br />
–––serologiczna 72<br />
–––wstępna 56, 58<br />
––miano aglutynin 150<br />
––m<strong>or</strong>fologia kolonii 60<br />
– wywoływane zakażenia 50, 51<br />
– frederiksenii, biochemiczne reakcje 64<br />
– intermedia, biochemiczne reakcje 64<br />
– kristensenii, biochemiczne reakcje 64<br />
– pseudotuberculosis, biochemiczne reakcje<br />
64<br />
Zadrapania przez zwierzęta 102<br />
Zakażenia bakteriami beztlenowymi 113,<br />
114<br />
– dróg oddechowych dolnych 79<br />
–––górnych 73<br />
––––hodowla i identyfikacja 76<br />
––––mikroskopia bezpośrednia 76<br />
– ran szpitalne 102<br />
Zapalenie cewki moczowej u kobiet 93<br />
–––umężczyzn 90<br />
– gardła, czynniki bakteryjne 74<br />
––gonokokowe 74<br />
––martwicze, wrzodziejące 74<br />
Zapalenie, jamy otrzewnej 113<br />
– narządów miednicy u kobiet 93, 94<br />
– opon mózgowo-rdzeniowych, cechy płynu<br />
38<br />
–––gruźlicze, posiew 38<br />
––przyczyny 36<br />
––typy 38<br />
– oskrzeli i płuc 80<br />
––ostre 79<br />
––przewlekłe 79<br />
– płuc 80<br />
––pierwotne atypowe 79<br />
––wywołane przez chlamydie 79<br />
– pochwy 93<br />
––niespecyficzne – patrz Waginoza<br />
– szyjki macicy 93<br />
– tkanki podskórnej 113<br />
– wyrostka robaczkowego 113<br />
Zespół nabytego niedob<strong>or</strong>u odp<strong>or</strong>ności,<br />
biegunki 48<br />
Zestawy diagnostyczne 168<br />
Zg<strong>or</strong>zel gazowa 113<br />
Ziarenkowce Gram-dodatnie 20<br />
Ziarniniak pachwiny 96<br />
––pobieranie próbki 97<br />
Żelatynaza 21<br />
182