Rektor Linda Nielsen Københavns Universitet Nørregade 10 1017 ...

More documents

Recommendations

Info

A. Beskrivelse af kernefeltet: A.1 Institutionens navn: Institut for Molekylær Biologi og Fysiologi A.2 Kontaktperson: Roger A. Garrett A.3 Tlf.: 3532 2010 A.4 E-mail: garrett@mermaid.molbio.ku.dk A.5 Kernefeltets navn: Fra genomstruktur til cellefunktion Spirende kernefelt ( ): Nuværende kernefelt (X) A.6 Fagligt fokus: Genomstruktur , genomstabilitet, genekspression og cellefunktion analyseret i model organismer. A.7 Forskerskoler m.v. Forskerskole for Molekylærbiologi og Fysiologi A.8 Myndighedsopgaver og –beredskab: ingen B. Kernefeltets omfang: B.1 Antal videnskabelige medarbejdere (gerne fordelt på stillingskategorier): Professorer – 6. Lektorer - 9. Adjunkter – 3. Forskningsråds stipendiater – 3 (1 Skou stipendiat, 2 Steno stipendiaterne) B.2 Antal ph.d. studerende 16 interne på denne del af instituttet Budget 18 VIP a 500.000 9.000.000 16 ph.d. a 400.000 6.400.000 10 Laborant a 300.000 3.000.000 Drift fra institut ca 1.000.000 Externe bevillinger pr år ca 30.000.000 I alt ca 49.400.000 C. Begrundelse for valg af kernefelt: I disse år høstes frugterne af mange års indsats indenfor molekylærbiologisk forskning. Ved hjælp af molekylærgenetiske teknikker kan vi nu målrettet forstå cellulære processer ned i den mindste detalje. Dette har ikke blot ført til en eksplosion i den grundvidenskabelige forståelse af livsprocesserne, men er også en væsentlig forudsætning for Danmarks mange bioteknologiske virksomheder. Forskningsmiljøet omkring vores kernefelt har i stor udstrækning bidraget til denne udvikling gennem cutting-edge molekylærbiogisk forskning samt – ikke mindst – uddannelse af et stort antal højt kvalficerede kandidater til erhvervslivet. Vi står nu på trappen til næste niveau i udforskningen af livsprocesserne hvor kendskabet til genomsekvenser åbner en række nye perspektiver. I kraft af vores valg af forskningsemner og modelsystemer er vores kernefelt særdeles godt rustet til at løfte denne opgave. Sekventering af hele genomer er en forholdsvis ny udvikling som har gjort det muligt at kortlægge og forstå, de mange komplekse processer som foregår både indenfor og udenfor en celle i en bestemt organisme. En konsekvens af denne udvikling er at man for nylig har opdaget, at genomer er meget mere komplekse og dynamiske end man havde troet før. Et genom er ikke bare en stabil skabelon som hovedsageligt koder for proteiner men er et dynamisk molekyle som kan ændre sig på mange måder, blandt andet ved omstrukturering og ved optagelse af DNA fra andre celler eller ekstrakromosomale elementer (vira, plasmider o.lign,) via forskellige mekanismer hvoraf nogle stadigvæk er ukendte. En af de vigtigste opdagelser som er kommet fra genomanalyser, er at en betydelig del af alle genomer koder for funktionelle RNA molekyler, som ikke er translateret til proteiner. Disse Dok-id. 354956
RNA’er, som inkluderer familier af anti-sense RNA, micro RNA, interference RNA og ribozymer, har vigtige roller i at regulere genomstabilitet og ekspression. En styrke af vores kernefelt er at vi har ekspertise med en del forskellige model organismer, som dækker bredden af evolution, fra bakterier, igennem archaea til lavere og højere eukaryoter. Dvs. man kan undersøge de cellulære processer i bakterie r, archaea og lavere eukaryoter og ekstrapolere til, og bedre forstå, de mere komplekse systemer i højere eukaryoter. Derudover kan vi undersøge de processer som er specifikke for enkelte modelorganismer fra livets domæner d.v.s. bakterie r, archaea, og eukaryoter (gær, drosophila, planter og dyr) separat. Kernefeltets viden indenfor forståelsen af de cellulære processer er internationalt særdeles respekteret og mange af feltets forskere blev i efteråret 2004 bedømt særdeles positivt af instituttets advisory board (Nobelprismodtager Paul Nurse; en af Sveriges førende Cancerforskere, Carl Henrik Heldin; Chair of Microbiology Department, Tufts University, Boston Cathrine Squires samt seniorforsker, NOVO-Nordisk, Lars Thim). Til sidst har vi en række tekniske ekspertiser og faciliteter som er afgørende for successen af vores forskning. Vores genom sekventerings-faciliteter med robotter of sekvenatorer er de eneste i Danmark og de er allerede blevet brugt til at sekventere 3 hele genomer af mikroorganismer og 4 andre er næsten færdige. Derudover er de blevet brugt til at sekventere flere nyopdagede vira og plasmider. Bioinformatik underbygger alle genom-baserede projekter og er blevet til et vigtigt værktøj for alle forskere både teoretikere og eksperimentelle. Bioinformatikgruppen er specielt stærk forsknings- og undervisningsmæssigt og dens indflydelse er udbredt indenfor kernefeltet. Derudover er der eksterne kontakter med mikroarray faciliteter til analyse af RNA transkripter fra hele genomet for model organismer såsom Sulfolobus (Uppsala Universitet), gær (Sanger Institut, Hinxton, UK) m.fl. De modelorganismer vi arbejder med er følgende : bakterier både cyano- og enterobakterier, archaea: euryarchaeote Haloferax og crenarchaeote Sulfolobus , lavere eukaryoter: Schizosaccharomyces pombe og Saccharomyces cerevisiae, Drosophila , C. elegans, højere eukaryoter: cellekulturer fra bla mus og menneske samt hele dyr, mus og planter, Arabidopsis. C.1 Publicering. Angiv antal peer review-publikationer over de seneste 3 år (2002-2004): 88 C.2 Citationer. Angiv gns. antal citationer per artikel 29,1 (9618 cit af 331 artikler udgivet i perioden 1994-2004). C.3 Erhvervsmæssig betydning. Angiv omfanget af samarbejde med private virksomheder, herunder antal patenter i de seneste 3 år: Der er angivet 2 samarbejdsprojekter med private virksomheder i perioden. Der er udtaget 4 patenter eller patent ansøgninger. Samarbejde inden for kernefeltet, hvor der findes skriftlige aftaler med: Der er indgået skriftlige aftaler med cirka 6 parter. De fleste forskere har haft løbende forskningssamarbejder med biotek virksomheder, både de større firmaer (Novozymes, Royal Greenland, Arla Foods m. fl.) med mindre firmaer (DLF-Trifolium) og med Bioteknologisk Institut, Hørsholm. Endeligt et et mindre firma, Aresa-biodetection A/S, inden for området landmine biodetection stiftet af studerende og kandidater fra instituttet. Derudover er der en del samarbejde med internationale firmaer igennem EU støttet projekter og igennem EU-Kina samarbejde hvor alle har underskrevet enten EU kontrakter eller ”Consortium Agreements” . C.4 Samfundsmæssig betydning. Beskriv kernefeltets betydning for det omgivende samfund,
Page 1 and 2: DET NATURVIDENSKABELIGE FAKULTET K
Page 3 and 4: Bilag 1 Kernefelter i dansk forskni
Page 5 and 6: Bilag 2 til Danmarks Forskningspoli
Page 7 and 8: 00100). Et af gruppens medlemmer va
Page 9 and 10: periode): 2002-2004: 3.2 citationer
Page 13 and 14: Grønland, ændringer af Grønlands
Page 15 and 16: B.1 Antal videnskabelige medarbejde
Page 19 and 20: QUANTOP - Danmarks Grundforskningfo
Page 21: subject of active investigation, in
Page 29 and 30: A. Beskrivelse af kernefeltet: A.1
Page 31 and 32: C.6 Formaliseret internationalt for
Page 33 and 34: B. Kernefeltets omfang: B.1 Antal v
Page 35 and 36: C.6 Formaliseret internationalt for
Page 37 and 38: A.7 Forskerskoler m.v. : Under fors
Page 41: som forplantning og aldring. C.5 Ek
Page 44 and 45: kernefelt under det større etabler
Page 48 and 49: A. Beskrivelse af kernefeltet: A.1
Page 50 and 51: Biologi, har i perioden 2002-2004 f
Page 52 and 53: Perspektivet er, at man ved denne s
Page 56 and 57: (Deutsche Forschungsgemeinschaft) -
Page 58 and 59: FRL er en af de internationa lt fø
Page 62 and 63: Den matematisk/numeriske forskning,
Page 64 and 65: B.2 Antal ph.d.er: 12 B.3 Samlet bu
Page 68 and 69: Gruppen har aktivt forskningssamarb
Page 70 and 71: B. Kernefeltets omfang: B.1 Antal v
Page 72 and 73:
Bilag 2 til Danmarks Forskningspoli
Page 74 and 75:
Page 76 and 77:
Page 78 and 79:
A. Beskrivelse af kernefeltet: A.1
Page 80 and 81:
Ialt 12 udenlandske forskere har ti
Page 82 and 83:
etydeligt arbejde. Således er 5 ka
Page 84 and 85:
B.2 Antal ph.d.-stude rende: 3 (200
Page 87 and 88:
Page 89 and 90:
C.3 Erhvervsmæssig betydning. Angi
Page 91 and 92:
Page 93 and 94:
computer-modeller i stand til at do
Page 95:
(2) DMI, samarbejde omkring ”Effe
Page 98 and 99:
Page 100:
Forskningsfeltet yder også bistand
show all

Rektor Linda Nielsen Københavns Universitet Nørregade 10 1017 ...

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?