Rektor Linda Nielsen Københavns Universitet Nørregade 10 1017 ...

More documents

Recommendations

Info

mikrobiologi, molekylær biologi, økofysiologi, bioinformatik, bio- og nano-teknologi. Der vil i fremtiden blive et stigende behov for forskere der kan krydse faggrænser og kombinere de nyeste teknologiske landvindinger med mere traditionelle metoder. Det her beskrevne kernefelt vil i høj grad kunne medvirke til at uddanne forskere med disse kvalifikationer. Formidling: Kernefeltets forskere præsenterer ofte deres forskning i populærvidenskabelige tidskrifter og i dagspressen. De deltager jævnligt i radio- og tv-udsendelser, samt i formidlingsarrangementer for skole/gymnasie -elever og andre. Flere af kernefeltets forskere er medansøgere på dele af den komm-ende Galathea3 ekspedition (2006-2007), som har fokus på formidling og uddannelse. TF redigerer pt. et bind om ”Havet” til et nyt flerbindsværk om ”Naturen i Danmark”. Værket publiceres af Gyldendal og flere af kernefeltets deltagere har bidraget med kapitler. C.5 Eksterne forskningsindtægter. Kernefeltets medlemmer har i de sidste fem år i gennemsnit skaffet 12 millioner kr pr år til ekstern finansiering af forskningen. Større bevillinger i perioden 2002- 2004: MK: 9.780.000,- (SNF, NASA, EU, Carlsbergfondet, NorFA); MM: 2.850.000, (Carlsbergfondet, Fødevaredirektoratet); RG: 7.300.000,- (SNF, Svensk Forskningsråd, EU); RK: 1.700.000,- (SNF, Carlsbergfondet); SR: 700.000,- (SNF, Miljøstyrelsen); SS: 12.400.000,- (SNF, US Dept. of Energy, EU, Villum Kann Rasmussens Fond) ; TF: 1.410.000,- (SNF, Carlsbergfondet) C.6 Formaliseret internationalt forskningssamarbejde . Kernefeltets forskere har >50 publikationer med internationale kolleger i peroden 2002-2004. Ud over EU-projekter, indgår gruppens medlemmer i projekter financieret af bl.a. forskningsråd i Sverige, Australien, England, Japan og USA. Der er arrangeret internationale forskerkurser financieret af UNESCO og NorForsk/NorFA. Kernefeltets forskere deltager i store internationale forskningsprojekter med bl.a. Japans institut for dybhavsforskning omkring brug af avancerede forskningsskibe og undervandsrobotter, et stort internationalt, canadisk ledet, forskningprogram i Arktis , samt flere forskningsprojekter financieret af US Department of Energy. MK er udpeget som medlem af den teknologiske ekspertgruppe indenfor det store internationale forskningsinitiativ ”Census of Marine Microbes” (se: http://icomm.mbl.edu/) og deltager i et stort NSF-financieret amerikansk projekt (http://www.nsf.gov/od/lpa/news/03/pr03106_ystonemicrobes.htm). Kernefeltets forskere er inviteret med i flere store forskningsinitiativer i forbindelse med ”International Polar Year” 2007-2009. Gruppen har i de sidste fem år haft samarbejde med forskere ved følgende internationale institutioner i Australien: Macquarie Univ., Southern Cross Univ., Univ. of New South Wales, Univ. of Queensland, Univ. of Sydney, Univ. of Technology Sydney; Canada: Univ. of British Columbia; Chile: Univ. of Conception; Estland: Univ. of Tartu; Finland: Finnish Forest Research Inst.; Frankrig: CNRS-Université Lyon, Ecole Normale Superieure, Pau Univ., Univ. of Marseille; Holland: Netherlands Inst. of Ecology, Netherlands Inst. of Sea Research, Technical Univ. Delft; Israel: Hebrew Univ. of Jerusalem; Italien: Univ. of Rome; Japan: Japan Marine Science and Technology Center; Norge: Norges Landbrugsuniv., Univ. of Bergen, Univ. of Oslo, Univ. of Tromsø; Polen: Polish Academy of Sciences; Rusland: Univ. of St. Petersburg; Schweiz: ETH Zürich; Spanien: Univ. of Barcelona; Storbritannien: Aberdeen Univ., Macaulay Inst., Univ. of Dundee, Univ. of Lancaster; Sverige: Karolinska Institutet, Lunds Univ., Univ. of Gothenburg, Univ. of Kalmar, Univ. of Stockholm; Tyskland: Alfred- Wegener Inst., Inst. of Inland Water Research, Justus-Liebig Univ., Max-Planck Inst. for Marine Microbiology, Max Planck Inst. for Terrestrial Microbiology, Univ. of Hamburg, Univ. of Kaiserslautern, Univ. of Oldenburg, Univ. of Regensburg, Univ. of Würzburg; USA: Carnegie Inst., Harvard Medical School, Michigan State Univ., Montana State Univ., Rutgers Univ., Stanford Univ., The Inst. for Genomic Research, Univ. of California Berkeley, Univ. of North Carolina, Univ. of Washington, Wesleyan Univ.; Østrig: Technical Univ. Graz. C.7 Øvrige forhold af betydning for identificering af kernefeltet: En intensivering af samarbejdet mellem de 3 grupper i det skitserede kernefelt vil danne et særdeles stærkt forskningskonsortie , der efter en økonomisk oprustning kan konkurrere bredt med de mest produktive udenlandske forskningsenheder inden for mikrobiel økologi og genomøkologi, hvor udvalgte organismers genomer eller den totale genpulje fra et miljø ligger til grund for den økologiske analyse. Kernefeltet samler en bred ekspertise indenfor mikrobiel stofomsætning, økofysiologi, traditionel og molekylær mikrobiologi. En sådan samlet konfiguration er ny, også i international sammenhæng, hvor området oftest domineres af store grupper af molekylære mikro-biologer. Dele af kernefeltet falder ind under satsningsområdet BioCampus på Københavns Universitet. 3
Bilag 2 til Danmarks Forskningspolitiske Råds høringsbrev om kernefelter i dansk forskning – Skabelon til beskrivelse af og begrundelse for udpegning af kernefelter For så vidt angår besvarelserne under punkt C, bedes de udformet på grundlag af den nærmere beskrivelse af indikatorerne i bilag 1. A. Beskrivelse af kernefeltet: A.1 Institutionens navn: Biologisk Institut A.2 Kontaktperson: Professor Cornelis Grimmelikhuijzen A.3 Tlf.: 35 32 12 27 A.4 E-mail: cgrimmelikhuijzen@bi.ku.dk A.5 Kernefeltets navn: Funktionel og Evolutionær Genomforskning (Functional and Evolutionary Genomics) Spirende kernefelt (kryds her): X Nuværende kernefelt (kryds her): A.6 Fagligt fokus: Det faglige fokus er på de funktionelle, komparative og evolutionære aspekter af genomforskning. Functionel og Komparativ Genomforskning I de sidste 5 år er genomerne fra et stort antal organismer blevet sekventeret, bl.a. fra mange forskellige bakterier, protozoer, planter (Arabidopsis, ris), slime molds (Dictyostelium), gær, nematoder, seks forskellige insekter, søpindsvin, fisk (zebrafisk), rotte, mus, hund, forskellige aber og mennesket. Efter menneskets genom er blevet færdigsekventeret, kom der store mængder sekventerinskapacitet fri på de forskellige sekventeringscentre i USA (bl.a. Baylors College of Medicine, Houston, www.hgsc.bcm.tmc.edu/projects/). Derfor kan amerikanske forskningskonsortier nu ansøge hos NIH for at få støtte til sekventering af deres forskellige modelorganismer. Specielt de organismer, som har en ”strategisk” position indenfor organismernes fylogenetiske træ, bliver udvalgt af NIH. NIH og andre store amerikanske fonde mener nemlig, at det komparative (sammenlignende) aspekt af genomforskningen vil føre til en meget bedre forståelse af menneskets genom og vil bidrage meget med at interpretere det (http://www.genome.gov/page.cfm?pageID=12511858). Vi er meget enige deri, men selvfølgelig får vi med denne sammenligning af genomer også en bedre forståelse af alle de andre genomer, som nu er blevet sekventeret. Funktionel og komparativ genomforskning er derfor meget fastforgrenet med hinanden. Vores arbejdsgruppe (Cornelis Grimmelikhuijsen/Frank Hauser) er førende indenfor insektgenomics i Skandinavien. På verdensplan er vi førende inden for området genomforskning af insekternes G protein-koblede receptorer (GPCRs) og deres ligander (neuropeptider, proteinhormoner, biogene aminer). Vi er officielle konsortium-medlemmer af Honey Bee Genome Project og Tribolium castaneum Genome Project. Vores opgave i disse consortier er at annotere og funktionelt (eksperimentelt) karakterisere alle neurohormon-GPCRs i de to insekter. Vi arbejder også med bananfluen Drosophila melanogaster, silkesommerfuglen Bombyx mori og malariamyggen Anopheles gambiae (alle tre insekter er blevet sekventeret indenfor de sidste år). Vores næste mål er at bruge vores erfaring med insektgenomforskning til at interpretere genomerne af to cnidarier (Hydra magnipappilata, en hydrozoa, og Nematostella vectensis, en anthozoa). Igen har NIH bevilget store summer penge til at sekventere disse to cnidarier, fordi cnidarier fylogenetisk set har en meget strategisk position (meget basalt indenfor metazoa, lige før opsplittelsen af protostomia og deuterostomia). Fordi cnidarier har det mest primitive nervesystem i dyreriget, vil en sammenligning af cnidariernes genomer med insekternes og pattedyrenes genomer fortælle os meget om nervesystemets evolution. Det samme gælder for ”body plans” og deres evolutionære udvikling (fra radiært symmetriske til bilaterale dyr). Komparativ og Evolutionær Genomforskning En sammenligning af menneskets genom med abernes (f.eks. fra chimpanse) vil føre til opdagelser af de gener, som karakteriserer mennesker (intelligens, bevidsthed, etc.). Dette er Rasmus Nielsens forskningsområde. Desuden bruger han bioinformatiske metoder i kombination med de forskellige sekventerede genomer til bedre at forstå dyrernes evolution og evolutionen af selve DNA. Eske Willerslev bruger genomforskning til bedre at kunne analysere ”fossilt DNA”. Disse analyser gør det muligt at bestemme dyrepopulationer og økosystemer flere hundredtusind år tilbage i tiden. Også undersøges muligheden for at udvinde fossilt menneske-DNA direkte fra arkæologiske sedimentære aflejringer, hvor knoglefund mangler. Disse undersøgelser vil give en bedre forståelse af Dok-id. 354956
Page 1 and 2: DET NATURVIDENSKABELIGE FAKULTET K
Page 3 and 4: Bilag 1 Kernefelter i dansk forskni
Page 5 and 6: Bilag 2 til Danmarks Forskningspoli
Page 7 and 8: 00100). Et af gruppens medlemmer va
Page 9 and 10: periode): 2002-2004: 3.2 citationer
Page 13 and 14: Grønland, ændringer af Grønlands
Page 15 and 16: B.1 Antal videnskabelige medarbejde
Page 19 and 20: QUANTOP - Danmarks Grundforskningfo
Page 21 and 22: subject of active investigation, in
Page 23 and 24: RNA’er, som inkluderer familier a
Page 29 and 30: A. Beskrivelse af kernefeltet: A.1
Page 31 and 32: C.6 Formaliseret internationalt for
Page 33 and 34: B. Kernefeltets omfang: B.1 Antal v
Page 35 and 36: C.6 Formaliseret internationalt for
Page 37: A.7 Forskerskoler m.v. : Under fors
Page 41: som forplantning og aldring. C.5 Ek
Page 44 and 45: kernefelt under det større etabler
Page 50 and 51: Biologi, har i perioden 2002-2004 f
Page 52 and 53: Perspektivet er, at man ved denne s
Page 56 and 57: (Deutsche Forschungsgemeinschaft) -
Page 58 and 59: FRL er en af de internationa lt fø
Page 62 and 63: Den matematisk/numeriske forskning,
Page 64 and 65: B.2 Antal ph.d.er: 12 B.3 Samlet bu
Page 68 and 69: Gruppen har aktivt forskningssamarb
Page 70 and 71: B. Kernefeltets omfang: B.1 Antal v
Page 80 and 81: Ialt 12 udenlandske forskere har ti
Page 82 and 83: etydeligt arbejde. Således er 5 ka
Page 84 and 85: B.2 Antal ph.d.-stude rende: 3 (200
Page 89 and 90:
C.3 Erhvervsmæssig betydning. Angi
Page 91 and 92:
Bilag 2 til Danmarks Forskningspoli
Page 93 and 94:
computer-modeller i stand til at do
Page 95:
(2) DMI, samarbejde omkring ”Effe
Page 98 and 99:
Bilag 2 til Danmarks Forskningspoli
Page 100:
Forskningsfeltet yder også bistand
show all

Rektor Linda Nielsen Københavns Universitet Nørregade 10 1017 ...

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?