Rektor Linda Nielsen Københavns Universitet Nørregade 10 1017 ...

RNA’er, som inkluderer familier af anti-sense RNA, micro RNA, interference RNA og
ribozymer, har vigtige roller i at regulere genomstabilitet og ekspression.
En styrke af vores kernefelt er at vi har ekspertise med en del forskellige model organismer, som
dækker bredden af evolution, fra bakterier, igennem archaea til lavere og højere eukaryoter. Dvs.
man kan undersøge de cellulære processer i bakterie r, archaea og lavere eukaryoter og
ekstrapolere til, og bedre forstå, de mere komplekse systemer i højere eukaryoter. Derudover kan
vi undersøge de processer som er specifikke for enkelte modelorganismer fra livets domæner
d.v.s. bakterie r, archaea, og eukaryoter (gær, drosophila, planter og dyr) separat.
Kernefeltets viden indenfor forståelsen af de cellulære processer er internationalt særdeles
respekteret og mange af feltets forskere blev i efteråret 2004 bedømt særdeles positivt af
instituttets advisory board (Nobelprismodtager Paul Nurse; en af Sveriges førende
Cancerforskere, Carl Henrik Heldin; Chair of Microbiology Department, Tufts University, Boston
Cathrine Squires samt seniorforsker, NOVO-Nordisk, Lars Thim).
Til sidst har vi en række tekniske ekspertiser og faciliteter som er afgørende for successen af
vores forskning. Vores genom sekventerings-faciliteter med robotter of sekvenatorer er de eneste i
Danmark og de er allerede blevet brugt til at sekventere 3 hele genomer af mikroorganismer og 4
andre er næsten færdige. Derudover er de blevet brugt til at sekventere flere nyopdagede vira og
plasmider. Bioinformatik underbygger alle genom-baserede projekter og er blevet til et vigtigt
værktøj for alle forskere både teoretikere og eksperimentelle. Bioinformatikgruppen er specielt
stærk forsknings- og undervisningsmæssigt og dens indflydelse er udbredt indenfor kernefeltet.
Derudover er der eksterne kontakter med mikroarray faciliteter til analyse af RNA transkripter fra
hele genomet for model organismer såsom Sulfolobus (Uppsala Universitet), gær (Sanger
Institut, Hinxton, UK) m.fl.
De modelorganismer vi arbejder med er følgende : bakterier både cyano- og enterobakterier,
archaea: euryarchaeote Haloferax og crenarchaeote Sulfolobus , lavere eukaryoter:
Schizosaccharomyces pombe og Saccharomyces cerevisiae, Drosophila , C. elegans, højere
eukaryoter: cellekulturer fra bla mus og menneske samt hele dyr, mus og planter, Arabidopsis.
C.1 Publicering. Angiv antal peer review-publikationer over de seneste 3 år (2002-2004): 88
C.2 Citationer. Angiv gns. antal citationer per artikel
29,1 (9618 cit af 331 artikler udgivet i perioden 1994-2004).
C.3 Erhvervsmæssig betydning. Angiv omfanget af samarbejde med private virksomheder,
herunder antal patenter i de seneste 3 år:
Der er angivet 2 samarbejdsprojekter med private virksomheder i perioden.
Der er udtaget 4 patenter eller patent ansøgninger.
Samarbejde inden for kernefeltet, hvor der findes skriftlige aftaler med:
Der er indgået skriftlige aftaler med cirka 6 parter.
De fleste forskere har haft løbende forskningssamarbejder med biotek virksomheder, både
de større firmaer (Novozymes, Royal Greenland, Arla Foods m. fl.) med mindre firmaer
(DLF-Trifolium) og med Bioteknologisk Institut, Hørsholm. Endeligt et et mindre firma,
Aresa-biodetection A/S, inden for området landmine biodetection stiftet af studerende og
kandidater fra instituttet.
Derudover er der en del samarbejde med internationale firmaer igennem EU støttet projekter
og igennem EU-Kina samarbejde hvor alle har underskrevet enten EU
kontrakter eller ”Consortium Agreements” .
C.4 Samfundsmæssig betydning. Beskriv kernefeltets betydning for det omgivende samfund,