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RAPPORT FINAL - Fischnetz

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IV-2 : Evolution des peuplements pisciaires dans le Canton du Jura<br />

Contexte :<br />

Contrairement à l’approche de <strong>Fischnetz</strong>, notre analyse n’a pas été appliquée qu’à la truite,<br />

mais à l’ensemble de l’ichtyocénose en place dans les cours d’eau jurassiens. La<br />

méthodologie d’interprétation choisie par le groupe de travail est basée sur le principe de<br />

zonation longitudinale des cours d’eau, précisé par Verneaux[15, 16], et qui peut se résumer<br />

de la manière suivante : «Toute portion morphologiquement homogène d'un cours d'eau<br />

peut être rangée dans un des 10 types écologiques qui se succèdent le long d'un modèle<br />

longitudinal abstrait, allant de la source à l'estuaire ». Chacun de ces types écologiques qui,<br />

contrairement à ceux définis par Huet [17] ne se suivent pas forcément d’une manière<br />

linéaire, est associé à un "biocénotype", ou groupe d'espèces dont l'abondance est<br />

proportionnelle à leur affinité pour ce type considéré. La composition optimale (référentiel<br />

indicatif) du peuplement associé à chaque site appartenant à un type écologique<br />

donné peut ainsi être prédite, puis comparée au peuplement effectivement observé<br />

ainsi qu’à son évolution [18,19, 20].<br />

Afin de préciser l’évolution réelle des peuplements en place, plus de 100 pêches électriques<br />

exhaustives ont du être réalisées dans les cours d’eau jurassiens entre 1998 et 2004. Les<br />

résultats obtenus, transformés en cote d’abondance par espèce intégrant leur densité<br />

numérique et pondérale [20] ont été comparés aux données historiques exploitables<br />

actuellement en notre possession [14, 15, 21]. Cette démarche a non seulement permis de<br />

préciser l’évolution des peuplements pisciaires de chaque cours d’eau étudié, mais<br />

également d’orienter la recherche des causes des carences observées.<br />

Le détail de la démarche et des techniques utilisées peuvent être consultées dans différentes<br />

publications (18, 19, 20) et figurent en abrégé dans divers rapports thématiques (cf.§IV-3).<br />

Les notions de référentiel et de niveaux typologiques étant peu utilisées en Suisse, elles sont<br />

brièvement décrites ci-après.<br />

Dans le présent document, une diagnose piscicole globale par secteur de cours d’eau<br />

(amont,médian,aval) a été préférée à une approche détaillée par site d’analyse. Les données<br />

utilisées, notamment pour le calcul du type théorique et du référentiel indicatif ainsi que<br />

l’ensemble des résultats bruts de nos recherches figurent en annexe.<br />

16

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