RAPPORT FINAL - Fischnetz

⋅ En période estivale, les cours d’eau jurassiens, à l’image du reste de la Suisse,
ont eu tendance à se réchauffer durant ces 30 dernières années. Cette
évolution semble toutefois être plus effective sur les stations éloignées des
sources et des exsurgences karstiques les plus importantes. Le réchauffement
climatique tout comme les pompages excessifs d’eau potable, la mise en place
de l’épuration, l’uniformisation des surfaces agricoles, l’évolution de
l’aménagement du bassin versant, l’incision du lit des rivières sont autant de
facteurs de nature à influencer la température des eaux de surface qu’il
conviendrait de circonscrire et de hiérarchiser en poursuivant les investigations
initiées dans la présente étude. Cependant, le vieillissement typologique
résultant de cette élévation thermique peut être considéré comme un des
trois principaux facteurs conduisant à la banalisation biologique
constatée.
⋅ La gestion halieutique appliquée sur les cours d’eau jurassiens est responsable
de divers mélanges génétiques et est certainement à l’origine de la propagation
de germes pathogènes préjudiciables aux populations souches des cours
d’eau. Toutefois, l’impact très relatif de la pêche sur les peuplements naturels
de poissons, la faible efficacité des repeuplements et la présence limitée de
germes pathogènes indiquent que la gestion halieutique peut être
considérée comme un facteur secondaire de la banalisation biologique
constatée.
Dysfonctionnements fondamentaux au niveau local :
⋅ Si l’impact de la turbidité permanente des eaux de l’Allaine sur le
développement de la faune et de la flore en place ne fait aucun doute,
l’absence de recherches quantitatives ne permet malheureusement pas
d’estimer l’importance relative du phénomène de colmatage qui en résulte en
fonction des dysfonctionnements parallèles mis en évidence. Des analyses
complémentaires devraient être réalisées sur l’ensemble des cours d’eau
jurassiens ; ils permettraient certainement de déterminer l'ampleur de
l’impact, vraisemblablement lié au transfert de toxiques, des apports en
sédiments fins sur la banalisation biologique constatée.
⋅ La perturbation du régime hydrologique sur plus de la moitié du linéaire des
cours d’eau Sorne, Birse et Doubs par la production d’hydroélectricité est
assurément un facteur perturbant le développement de la faune en place. Une
étude à l’image de celles réalisées actuellement sur le Doubs franco-suisse
devrait être initiée, afin de mieux intégrer ces ouvrages aux cours d’eau en
limitant leurs impacts sur les biocénoses aquatiques. Cependant, excepté sur
la Birse à Courrendlin, l’ancienneté du fonctionnement des barrages
hydroélectriques contraste avec la banalisation biologique récente
constatée.
⋅ L’effet négatif des oiseaux piscivores peut ne pas être négligeable au niveau
local. En effet, il peut même devenir préoccupant, essentiellement dans le cas
de tronçons de cours d’eau où la productivité est altérée par une dégradation
du milieu. En raison, de la mauvaise qualité actuelle de nos cours d’eau, un
effarouchement, de ces oiseaux, voire une limitation de leur nombre, nous
paraît nécessaire, en particulier aux endroits critiques, dont une partie doit
encore être déterminée. Il faut toutefois admettre qu’une appréciation
cohérente de l’effet réel des oiseaux piscivores sur la banalisation
biologique constatée mérite des recherches plus approfondies que celles
auxquelles nous avons procédé dans le cadre de cette étude.
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