RAPPORT FINAL - Fischnetz

Conclusion :
Au stade actuel de nos connaissances, l’ensemble du linéaire de l’Allaine se présente
comme moyennement à fortement colmaté, notamment sur l’aval (fig30). Il apparaît
également que la qualité morphologique du cours d’eau joue un rôle primordial sur le degré
de colmatage : plus elle est perturbée, plus le colmatage est fort. Malgré l’hétérogénéité des
données à disposition, nous observons que cette rivière présente une turbidité
permanente proportionnellement corrélée avec son débit(fig31,32 & cf.[14]). Il ressort en
outre clairement que l’Allaine médiane est celle qui subit les plus forts apports en
matériaux (fig31,32).
Selon nos analyses réalisées en parallèle, le colmatage de l’Allaine, surtout en aval de
Porrentruy, est un phénomène multifactoriel. Selon Gobat et al [13], les sédiments
subaquatiques s’enrichissent progressivement de matériaux de quatre origines différentes :
⋅ Des matériaux provenant de l’altération générale des roches calcaires. Bien visible à
l’aval immédiat des résurgences karstiques, ce phénomène représente un apport
naturel de matériaux en cours depuis des millénaires et pouvant expliquer en partie la
turbidité permanente des eaux de surfaces du cours d’eau [13].
⋅ Des matériaux provenant des terres agricoles de la plaine d’Alle-Cornol (fig33 &
cf.[13]). Ces dernières années, les remaniements parcellaires et le développement de
la céréaliculture (fig34,35) couplés à la construction d’un réseau de drainages et de
dessertes(tab9) performant ont du favoriser l’érosion des sols à fragilité naturelle
assez grande[13] de cette région.
⋅ Des matériaux provenant des bassins de décantation de la place d’arme de
Bure(tab8). Un problème de gestion plutôt que de conception des bassins de
décantations semble être à l’origine de cet apport qui intervient dès Porrentruy [13,14].
⋅ Des matériaux provenant de l’érosion des sols alluviaux de la plaine de l’Allaine
en aval de Porrentruy. Cet abrasement des berges ou export par des crues
inondantes doit sans doute être encouragée par les diverses dégradations
morphologiques subies par le cours d’eau[11,16]. En outre, l’augmentation de
l’imperméabilisation des sols et le développement du réseau routier à l’inverse de
l’accroissement des surfaces forestières(tab9) doivent également avoir eu un effet sur
le pouvoir du régime hydrologique à éroder les berges et le lit de la rivière.
Enfin, les diverses « pollutions grises » récurrentes des chantiers de la transjuranne
(tab17 & cf.[14]) mises également en évidence sur la Birse et la Sorne à différentes reprises,
ainsi que l’anomalie climatique mise en évidence par Biotec et Hydronat[14] amplifient ce
phénomène de colmatage qui ne semble toutefois pas être limitant à la reproduction
des truites[12] mais qui est fortement suspecté comme facteur de transfert de
substances toxiques[1,8,11,15] ; la matrice particulière des végétaux analysés jouant le
rôle de filtre à particules adsorbés de substances nocives (pesticides notamment) (tab10).
L’extrapolation à d’autre cours d’eau et une analyse quantitative seraient
fondamentales à la hiérarchisation des ces différents apports et permettraient sans
doute d’édicter des recommandations claires afin de réduire ce phénomène de colmatage qui
bride le potentiel biologique de l’Allaine et de ses affluents et qui est sans doute préjudiciable
à la fertilité des sols ajoulots.
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