RAPPORT FINAL - Fischnetz

Dysfonctionnements consécutifs au niveau régional :
⋅ Comme celle de l’ichtyocénose, la qualité benthique des cours d’eau jurassiens
est en permanence déficitaire. En outre, l’analyse des données historiques sur
le benthos corroborent celles réalisées à partir des poissons : les références
des années’70 se sont dégradées, consécutivement à une dégradation de leur
qualité environnementale, tandis que les égouts à ciel ouvert décrits à la même
époque ont retrouvé, suite à la mise en place de l’épuration, une faune
benthique digne de ce nom, sans toutefois être recolonisés par les espèces les
plus sensibles. En conséquence et contrairement à certaines idées
développées par Fischnetz notamment, le peuplement benthique semble
évoluer parallèlement au peuplement pisciaire et non être le facteur limitant au
développement des populations de poissons consommatrices. Ainsi, il est
illusoire de considérer le peuplement benthique comme un facteur
responsable à la banalisation biologique constatée.
Dysfonctionnements consécutifs au niveau local :
⋅ La présence de la Maladie Rénale Proliférative(MRP-PKD) en aval de l’Allaine
et de la Birse, couplée au réchauffement thermique mis en évidence, explique
sans doute en partie les déficits de salmonidés observés sur les parties basales
de ces cours d’eau. La bioaccumulation de métaux dans la chair des truites est
en outre préoccupante non seulement d’un point de vue environnemental mais
également au niveau de la santé publique. En conséquence et bien que nous
considérons que l’état de santé d’une population est consécutive à la qualité de
son environnement, la réalisation d’analyses complémentaires devrait être
prioritaire et permettre certainement de préciser l’importance locale du
paramètre sanitaire sur la banalisation biologique constatée.
⋅ L’anéantissement quasi total de la reproduction de la truite de l’Allaine,
consécutif à la présence de toxiques dans le substrat de frayère et à l’arrivée
de crues de modelage durant la période d’incubation, est épisodique et localisé.
Les densités de juvéniles déterminées indiquent, en effet, qu’il ne semble avoir
eu cours que sur l’Allaine elle-même et que durant l’hiver 2001-02. En
conséquence, malgré l’absence de données comparables sur les autres
cours d’eau et avec d’autres espèces, la reproduction ainsi que le
recrutement apparaissent comme des facteurs locaux et passagers
susceptibles de n’expliquer que très partiellement la banalisation
biologique constatée.
Causes principales des dysfonctionnements :
⋅ Comme au niveau national et européen, les principales causes élucidées
à ces diverses perturbations mises en évidences sont d’origines
industrielles, agricoles et urbaines (fig53). Si le réchauffement thermique
semble trouver son origine dans les excès de pompage, l’incision du lit, les
rejets urbains et l’évolution climatique, il apparaît que l’agriculture, les réseaux
routiers et ferroviaires ainsi que le développement urbain ont joué et jouent
encore un rôle primordial sur la dégradation de la qualité des eaux et de la
morphologie des rivières jurassiennes. En parallèle, l’industrie peut également
être considérée comme une source de pollution importante des eaux de
surfaces du Canton du Jura.
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