Rôle de la protéine associée au nucléoïde Fis dans le contrôle de la ...

Introduction bibliographique
Un aspect important conditionnant le rôle des NAPs est la variation de leurs
concentrations cellulaires. En effet, elles sont produites à différents niveaux de la croissance
bactérienne. Ainsi, Fis est synthétisée à un niveau très élevé en début de phase exponentielle
de croissance (Figure 16), puis sa concentration diminue rapidement (Ali-Azam et al., 1999).
Au contraire, IHF est à forte concentration dans les cellules entrant en phase stationnaire de
croissance alors que la concentration d’H-NS est à peu près constante au cours de la
croissance (Free et Dorman, 1995). La situation avec HU est plus complexe dans la mesure où
la composition de ses deux sous unités varie avec la croissance. In fine, le taux de HU
diminue en phase stationnaire (Balandina et al., 2001). Ces variations de concentrations
introduisent une dynamique dans la composition en NAP du nucléoïde, permettant une
régulation de l’expression des gènes.
Ainsi le chromosome bactérien qui a un degré d’enroulement relativement important
durant la phase exponentielle de croissance, adopte une structure plus relâchée à l’entrée de la
phase stationnaire. Parallèlement, le facteur σ 70 qui transcrit de manière efficace de l’ADN
surenroulé, est remplacé par le facteur σ S , qui a une préférence pour l’ADN relâché de
manière à adapter l’expression génique.
L’organisation topologique des différents promoteurs d’un génome dépend
effectivement de l’état d’enroulement local qui est fixé à la fois par les activités des
topoisomérases et de la gyrase mais aussi de la dynamique de fixation des protéines associées
au nucléoïde. Le rôle de ces protéines dans l’expression des différents promoteurs reste
toutefois assez peu étudié. H-NS est la protéine dont le mécanisme d’action a été le plus
intensivement étudié. Cette protéine est capable de réduire fortement l’expression génique en
formant des structures nucléo-protéiques étendues comme observé au niveau du promoteur
virF (Falconi et al., 1998).
58