Rôle de la protéine associée au nucléoïde Fis dans le contrôle de la ...

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Remerciements Je remercie Monsieur Carlos Blanco et Monsieur Claude Gutierrez qui ont accepté avec cordialité d’être les rapporteurs de ce travail. J’exprime également tous mes remerciements à Madame Marie-Andrée Mandrand-Berthelot, Monsieur Hafid Abaibou et Monsieur Philippe Lejeune pour avoir accepté d’examiner ce travail. Je tiens à exprimer ma sincère reconnaissance à William Nasser pour son encadrement exemplaire durant cette thèse. Tu m’as donné une formation aussi bien scientifique qu’humaine d’une qualité remarquable. Je n’espérais pas acquérir un tel bagage pour la suite de la route. Bien sur je n’ai pas tout retenu mais peut être j’aurais appris, entre autre, à devenir un peu plus patient… Je tiens à remercier Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat pour m’avoir accueilli dans le laboratoire de Microbiologie, Adaptation et Pathogénie et pour avoir su être disponible pour toutes les questions liées à la vie dans le laboratoire. Mes remerciements vont également à Sylvie Reverchon, notamment pour répondre à certaines questions propres à la thématique « Régulation génique » de l’équipe « Erwinia ». Je remercie chaleureusement Vladimir Shevchik pour sa sympathie et pour nous avoir permis d’utiliser le mutant fliC d’Erwinia chrysanthemi avant publication. La saveur de ces quatre années aurait été bien différente sans la bonne humeur de Guy Condemine. Merci pour les multiples relectures des différents textes et articles, et pour avoir répondu à toutes les questions, aussi bien scientifiques que saugrenues. Je tiens également à remercier Agnès Rodrigue ainsi que Françoise Meier et Corinne Dorel pour les discussions au fil des repas. A mi-parcours de la thèse a eu lieu le comité de pilotage. J’en remercie les membres, Hans Geiselmann, Florence Wisniewski-Dyé, Marie-Andrée Mandrand-Berthelot et William Nasser, qui ont eu un effet significatif sur le bon déroulement de la fin de thèse. En particulier, je tiens à exprimer ma gratitude à Marie-Andrée Mandrand-Berthelot qui a suivi avec gentillesse ce travail. Mes remerciements amicaux vont à Georgi Muskhelishvili, Claudia Burau, Marcel Geertz, Michael Berger, Ramesh Mavathur et Sebastian Maurer de la Jacobs University of Bremen, Allemagne. Outre le matériel biologique fourni tel que la protéine Fis d’Escherichia coli, les discussions scientifiques et les compétences techniques acquises au cours de ce séjour, l’ambiance chaleureuse de l’équipe a fortement contribué au bon déroulement de cette expérience nordique. Ce séjour a été possible grâce aux participations financières de l’IFR41 "Ecologie Génétique Évolution" ainsi que de la Région Rhône-Alpes dans le cadre d’un projet Eurodoc. Je remercie les étudiants du laboratoire, qui, reprenant des phrases incontournables («c’est possible ça?»), ont été de bons collègues: Greg, Albert, Nasrin, Fred, Thierry (comment trouver un bon resto à Naples ?), Yann, Safia, Aleksandra, Claire, Nan, Zhengwei, Mathilde, Camille, Sophie et Camille qui a participé à ce travail. A mon tour de remercier Sandra Castang, l’amie du sud-ouest, pour nos pauses philosophiques. Je remercie également les étudiants du laboratoire d’écologie microbienne : Mickaël, Aymeric, Denis, Joël, Arnault, Hervé, Marina, Sandrine,… 6
Je remercie l’ensemble du personnel technique pour le support précieux fourni mais également pour leur bonne humeur et leurs conversations : Yvette Alfaro, Véronique Utzinger, Jean-Michel Prost, Sonia Diasparra, Christine Berger, Sandra Mebarki, Zagik Mouton-Kosem, Julie Frontier, Camille Villard et Julien Wawrzyniak. Je remercie avec toute ma sympathie Géraldine Effantin qui m’a fait sourire plus d’une fois. Je remercie amicalement Mickaël Boyer entre autre pour nous avoir facilité la normalisation des expériences de RT-PCR quantitative. De même, Francesca Damiola et Laurette Morlé m’ont aidé à débuter dans cette technique. Je suis redevable de Messieurs Falkow et Dorman pour m’avoir fait parvenir rapidement certains articles scientifiques utiles pour la rédaction de ce manuscrit. Ce travail a été facilité par la qualité des services administratifs de l’INSA, évitant ainsi une perte de temps dans le travail de recherche. Je tiens également à souligner le travail précieux effectué par l’Association Bernard Grégory, notamment à travers la formation « Nouveau Chapitre de la Thèse », qui prépare à l’après-thèse. Je remercie également Pauline Lautier pour m’avoir permis de rédiger ce manuscrit dans de bonnes conditions informatiques. Je tiens également à exprimer toute ma reconnaissance au professeur Paul Ritzenthaler de l’université de Toulouse, ainsi que son équipe, en particulier Pascal Lebourgeois, pour m’avoir guidé avec gentillesse et clairvoyance dans ce choix lyonnais. Je remercie l’ensemble de ma famille et belle famille, ainsi que Matthieu et Guillaume pour m’avoir soutenu dans tous les moments et pour me montrer qu’Erwinia n’est pas le seul être vivant. Enfin, Déborah, je t’exprime mon entière reconnaissance, tu es une des personnes ayant le plus contribué à la réussite de ce travail. Merci d’avoir accepté de quitter ton sudouest natal pour participer à mes côtés à cette expérience lyonnaise. 7
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