Rôle de la protéine associée au nucléoïde Fis dans le contrôle de la ...

More documents

Recommendations

Info

Introduction bibliographique métabolisme cellulaire. La pectine peut donc être utilisée comme source de carbone pour la croissance d’E. chrysanthemi. La localisation cellulaire de PelN, PehN, PehK, PnlG et PnlH n’est pas encore connue. L’activité enzymatique de PelN, PehK, PnlG, PnlH n’a pas encore été démontrée. III.C.1.2.a Les pectine estérases Les pectine estérases hydrolysent les groupements méthyles et acétyles de la pectine. Ces enzymes, en diminuant les estérifications présentes dans la pectine, donnent naissance au polygalacturonate (PGA) qui est un substrat plus facilement accessible aux principales pectine dépolymérases produites par E. chrysanthemi. Les pectine méthyl-estérases (Pem) clivent les méthylations de la pectine au niveau des régions d’homogalacturonanes, libérant du méthanol et du PGA. Les pectine acétyl-estérases (Pae) hydrolysent les groupes O-acétyle des homogalacturonanes et libèrent de l’acide acétique et du PGA. E. chrysanthemi 3937 synthétise deux pectine méthyl-estérases, PemA sécrétée et PemB qui est ancrée dans la membrane externe (Laurent et al., 1993; Shevchik et al., 1996), et deux pectine acétylestérases, PaeY sécrétée et PaeX localisée dans le périplasme (Shevchik et Hugouvieux- Cotte-Pattat, 1997, 2003) (Figure 25). O-CH 3 O-CH 3 O CO OH O O CO OH O COOH COOH O O COCH O OH O 3 O O COOH O OH O COOH O OH O COOH OH O O OH OH O COCH 3 OH OH OH OH pectin methylesterase pectate lyase acetylesterase PelE PemB PelD PemA PelC PelB PaeY PaeX PelA Figure 25 : Production de deux pectine méthyl-estérases et de deux pectine acétyl-estérases ches Erwinia chrysanthemi 3937. Electrofocalisation d’extraits d’Erwinia suivie de révélation 80
Introduction bibliographique enzymatique spécifique. L’action des pectate lyases, principales dépolymérases, est également représentée et utilisée comme marqueur de pI. III.C.1.2.b Les dépolymérases En ce qui concerne les dépolymérases, on distingue deux types d’activités selon le mode de clivage de la liaison glycosidique. D’une part, les pectate lyases qui clivent les liaisons glycosidiques par β-élimination en enlevant un proton et créant une insaturation à l’extrémité non réductrice du polymère. D’autre part, les polygalacturonases qui clivent la liaison glycosidique par un mécanisme d’hydrolyse en incorporant une molécule d’eau par une catalyse acide. Les dépolymérases se distinguent également par leur mode d’attaque du substrat (endo : clivage aléatoire à l’intérieur de la chaîne peptidique ou exo : clivage à partir d’une extrémité de la chaîne de pectine) et par leur substrat préférentiel (degré de méthylation, longueur des polymères…) (Figure 26). O-CH 3 O-CH 3 COOH COOH CO CO COOH O O O O O O COCH 3 O OH O OH O OH O OH OH OH OH OH OH OH COCH 3 COCH 3 souche sauvage mutant ∆ pel PelE PelI PelD PelC PelB PelL PehX, PehW, PehV PelX PelW PelA (cc x 1 x 30) Figure 26 : Production de dépolymérases chez Erwinia chrysanthemi 3937. Electrofocalisation d’extraits d’Erwinia suivie de révélation enzymatique spécifique. Le récent séquençage du génome de la souche 3937 d’E. chrysanthemi (Glasner et al., en préparation) a prédit l’existence de deux pectine lyases potentielles (PnlG et PnlH), onze pectate lyases (PelA, PelB, PelC, PelD, PelE, PelI, PelL, PelN, PelW, PelX, PelZ), cinq 81
Page 1:
N° d’ordre : 2007-ISAL-0116 Ann
Page 4 and 5:
SOMMAIRE Remerciements ____________
Page 6 and 7:
Remerciements Je remercie Monsieur
Page 8 and 9:
Liste des figures et tableaux Figur
Page 10 and 11:
Résultats non publiés : Figure R1
Page 12 and 13:
GA n : oligogalacturonides saturés
Page 14 and 15:
Résumé Rôle de la protéine asso
Page 16 and 17:
Introduction bibliographique INTROD
Page 18 and 19:
Introduction bibliographique en év
Page 20 and 21:
Introduction bibliographique Gènes
Page 22 and 23:
Introduction bibliographique Le mod
Page 24 and 25:
Introduction bibliographique cas de
Page 26 and 27:
Introduction bibliographique plan s
Page 28 and 29:
Introduction bibliographique al., 1
Page 30 and 31: Introduction bibliographique Cette
Page 32 and 33: Introduction bibliographique IC Ré
Page 34 and 35: Introduction bibliographique Parmi
Page 36 and 37: Introduction bibliographique 2001))
Page 38 and 39: Introduction bibliographique II.A.1
Page 40 and 41: Introduction bibliographique L’é
Page 42 and 43: Introduction bibliographique d’AR
Page 46 and 47: Introduction bibliographique Famill
Page 50 and 51: Introduction bibliographique des ac
Page 52 and 53: Introduction bibliographique Figure
Page 54 and 55: Introduction bibliographique Le chr
Page 56 and 57: Introduction bibliographique topolo
Page 58 and 59: Introduction bibliographique Un asp
Page 60 and 61: Introduction bibliographique péné
Page 64 and 65: Introduction bibliographique indép
Page 66 and 67: Introduction bibliographique Figure
Page 70 and 71: Introduction bibliographique Diminu
Page 72 and 73: Introduction bibliographique La com
Page 74 and 75: Introduction bibliographique IIIC L
Page 76 and 77: Introduction bibliographique chrysa
Page 78 and 79: Introduction bibliographique B : La
Page 82 and 83: Introduction bibliographique polyga
Page 84 and 85: Introduction bibliographique III.C.
Page 86 and 87: Introduction bibliographique princi
Page 88 and 89: Introduction bibliographique par vo
Page 90 and 91: Introduction bibliographique Sauvag
Page 92 and 93: Introduction bibliographique 1997;
Page 94 and 95: Introduction bibliographique 1998;
Page 96 and 97: Introduction bibliographique Le ré
Page 98 and 99: Résultats 1 er article RESULTATS I
Page 100 and 101: Résultats 1 er article The DNA nuc
Page 102 and 103: Résultats 1 er article 102
Page 130 and 131:
Résultats 1 er article 130
Page 132 and 133:
Résultats 2 ème article II 2 eme
Page 134 and 135:
Résultats 2 ème article Integrati
Page 136 and 137:
Résultats 2 ème article 136
Page 138 and 139:
Page 140 and 141:
Page 142 and 143:
Page 144 and 145:
Page 146 and 147:
Page 148 and 149:
Page 150 and 151:
Page 152 and 153:
Page 154 and 155:
Page 156 and 157:
Page 158 and 159:
Page 160 and 161:
Page 162 and 163:
Page 164 and 165:
Page 166 and 167:
Résultats Résultats non publiés
Page 168 and 169:
Page 170 and 171:
Page 172 and 173:
Page 174 and 175:
Conclusion et perspectives CONCLUSI
Page 176 and 177:
Conclusion et perspectives Figure D
Page 178 and 179:
Conclusion et perspectives réseau,
Page 180 and 181:
Conclusion et perspectives sera por
Page 182 and 183:
Références bibliographiques Beaul
Page 184 and 185:
Références bibliographiques Croin
Page 186 and 187:
Références bibliographiques Falco
Page 188 and 189:
Références bibliographiques Hengg
Page 190 and 191:
Références bibliographiques strep
Page 192 and 193:
Références bibliographiques Merri
Page 194 and 195:
Références bibliographiques Persm
Page 196 and 197:
Références bibliographiques chrys
Page 198 and 199:
Références bibliographiques Thoma
Page 200:
THESE SOUTENUE DEVANT L'INSTITUT NA
show all

Rôle de la protéine associée au nucléoïde Fis dans le contrôle de la ...

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?