Rôle de la protéine associée au nucléoïde Fis dans le contrôle de la ...

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Introduction bibliographique Diminution de la croissance Densité cellulaire Faible température Forte osmolarité Absence de source de carbone Température haute pH acide Transcription Traduction σS Protéolyse rpoS ARNm Enzyme core ARN polymérase Expression des gènes: de la réponse générale au stress de virulence Figure 20 : Régulation du niveau cellulaire de σ S en fonction des stimuli extérieurs chez la bactérie Escherichia coli (Hengge-Aronis, 2000b). Stimulus extérieur activateur Stimulus extérieur répresseur La transcription du gène rpoS se fait via un promoteur majeur de type σ 70 . Durant la phase exponentielle de croissance, chez E. coli, le gène rpoS est significativement transcrit et le niveau de transcription augmente d’un facteur trois à quatre lors de l’entrée en phase stationnaire (Takayanagi et al., 1994). Ce contrôle transcriptionnel implique essentiellement des métabolites s’accumulant en phase stationnaire (le guanosine-3’ 5’bispyrophosphate (ppGpp), l’adénosine monophosphate cyclique (AMPc) et le polyphosphate). Les mécanismes d’actions de ces métabolites demeurent non élucidés. Toutefois, la régulation transcriptionnelle influe peu sur la concentration cellulaire de σ S chez E. coli ; c’est par contre le niveau de régulation principal dans le genre Pseudomonas où la transcription du gène rpoS est fortement activée en phase stationnaire de croissance (Fujita et al., 1994). Chez E. coli, il y a une quasi absence du facteur σ S durant la phase exponentielle de croissance, malgré l’existence d’une transcription effective du gène rpoS, laissant présager une régulation post-transcriptionnelle. L’utilisation de différentes approches expérimentales a montré que la traduction des transcrits rpoS est activée par les divers stimuli qui modulent la concentration cellulaire de σ S (Figure 20) (Lange et Hengge-Aronis, 1994). L’augmentation de l’efficacité de la traduction implique une interaction entre les ARNms rpoS et différentes protéines régulatrices d’ARNs (Hfq, RprA, DsrA, la protéine NAP HU), rendant leurs 70
Introduction bibliographique séquences de Shine et Dalgarno plus accessibles aux ARNs ribosomaux. Les régulateurs DsrA et RprA seraient impliqués dans l’induction de la traduction de rpoS par le froid et le stress osmotique, respectivement (Majdalani et al., 2002; Repoila et Gottesman, 2001). En plus de ces systèmes d’activation, deux mécanismes de répression impliquant la protéine NAP H-NS et le régulateur OxyS ont également été mis en évidence ; H-NS et OxyS antagonisent l’action de HU et Hfq, respectivement (Hengge-Aronis, 2000b). Le facteur σ S est soumis à une forte protéolyse lors de la phase exponentielle de croissance. Cette dégradation requiert deux partenaires : la protéase ClpXP et le régulateur RssB (Muffler et al., 1996; Schweder et al., 1996). Un modèle du fonctionnement de la protéolyse a été proposé par Hengge-Aronis (Hengge-Aronis, 2000b): sous sa forme phosphorylée, RssB se lie à σ S , le complexe est reconnu par ClpXP et σ S est dégradé. Les mécanismes de signalisation contrôlant la phosphorylation de RssB sont inconnus. Il apparaît donc que σ S est un facteur de transcription de la réponse générale au stress plutôt qu’un régulateur spécifique de la phase stationnaire de croissance. La régulation du niveau cellulaire de σ S est donc essentiellement régie par des contrôles post-transcriptionnels chez E. coli et transcriptionnels chez les Pseudomonas. Cette différence de contrôle pourrait être lié au fait que σ S a un rôle relativement limité dans la réponse générale au stress chez Pseudomonas. III Erwinia chrysan hemi, t une bactérie phytopathogène IIIA Taxonomie des Erwiniae Le genre Erwinia, nommé d’après le phytobactériologiste Erwin F. Smith, a été fondé en 1920 pour réunir les bactéries phytopathogènes à Gram négatif, en forme de bacille, anaérobies facultatives et mobiles (Winslow et al., 1920). Les Erwiniae appartiennent à la famille des Enterobacteriaceae, elle-même incluse dans le phylum des protéobactéries. Pendant de nombreuses années, une classification proposée par Dye et basée sur des critères de virulence a largement été adoptée (Dye, 1968, 1969a, b, c). Elle subdivisait le genre Erwinia en 4 groupes : les Erwiniae provoquant une nécrose, les Erwiniae pectinolytiques, les Erwiniae à pigment jaune et les Erwiniae atypiques. 71
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