IFCPAR AR (ENGLISH) for CD - cefipra

Centre Franco-Indien pour la Promotion de la Recherche Avancée
CEFIPRA
Science de l'environnement
Projet 3709-1
IDENTIFICATION DE GENES BACTERIENS DE REPONSE AUX METAUX
Durée: Trois ans et six mois (septembre, 2007 à février, 2011)
Le but du projet est l'identification et la caractérisation de gènes
bactériens de résistance aux métaux lourds, et plus
particulièrement au nickel et au cobalt. Bien qu'il y ait eu
plusieurs études sur la toxicité et la résistance aux métaux
lourds de P. putida et P. aeruginosa, il n'existe aucune étude sur
le transport du nickel ou du cobalt chez ces deux espèces. Un
des objectifs majeurs du projet est la compilation d'un
répertoire de gènes de transport des métaux (transportome à
métaux) dans 4 genres différents de Pseudomonas à l'aide
d'outils bioinformatiques. Cet inventaire comparatif nous
servira de base pour identifier des déterminants potentiels de
résistance aux métaux chez les Pseudomonas. Le second
objectif principal fait également appel à une approche
globale, la protéomique, pour identifier des gènes impliqués
dans la réponse bactérienne à la toxicité du nickel ou du cobalt.
La comparaison des niveaux d'expression du contenu total en
protéines (protéome), de P. putida cultivé en présence ou non
de ces deux métaux nous permettra d'identifier des gènes
impliqués de façon spécifique dans les mécanismes de
résistance. Le clonage et l'expression fonctionnelle de gènes de
P. putida et P. aeruginosa identifiés grâce aux analyses
bioinformatiques et protéomiqus seront ensuite effectués. La
caractérisation des transporteurs à Ni ou Co sera approfondie
pour leur utilisation dans la décontamination d'effluents
pollués.
Réalisations
i) Un nouveau transporteur à efflux, mdrH, conférant une
résistance métallique large a été identifié chez P. putida
KT2440 ;
ii) Des souches d'E. coli et Deinococus radiodurans
recombinantes ont été construites pour décontaminer le
60
Co à partir d'effluents de réacteurs nucléaires ;
Dr Agnès Rodrigue
Microbiologie, Adaptation et Pathogénie
UMR5240 CNRS-INSA-UCB
Villeurbanne
Prof. Surya S. Singh
Department of Biochemistry
Osmania University
Hyderabad
iii) L'étude par protéomique faite dans ce projet a permis
d'identifier 292 protéines dont 151 n'avaient jamais été
identifiées auparavant ;
iv) Le gène impliqué dans la synthèse de la pyoverdine est
induit par le nickel mais réprimé par le cobalt chez P. putida;
v) La presence de cobalt ou de nickel induit des proteins
comme la siperoxyde dismutase, la protein de résistance à
l'hydroperoxide, des antioxidant de groupements thiols,
des facteurs de terminaison de la transcription alors que
l'ARN polymérase est réprimée.
Articles de recherche publiés: Deux
Activites de Recherche 2009-10
101