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Appunti delle lezioni di MIGLIORAMENTO GENETICO DEGLI ...

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Università degli Stu<strong>di</strong> <strong>di</strong> Sassari - Facoltà <strong>di</strong> Agraria<br />

Corso <strong>di</strong> Laurea in Scienze e Tecnologie Agrarie<br />

<strong>Appunti</strong> <strong>delle</strong> <strong>lezioni</strong> <strong>di</strong><br />

<strong>MIGLIORAMENTO</strong> <strong>GENETICO</strong> <strong>DEGLI</strong><br />

ANIMALI IN PRODUZIONE<br />

ZOOTECNICA<br />

(con appen<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> teoria della regressione e zooeconomia)<br />

Non esiste un modo semplice<br />

per capire una cosa <strong>di</strong>fficile.<br />

Altrimenti non sarebbe <strong>di</strong>fficile!<br />

Giuseppe Pulina<br />

anno accademico 1999-2000


Università degli Stu<strong>di</strong> <strong>di</strong> Sassari – Facoltà <strong>di</strong> Agraria - Corso <strong>di</strong> Laurea in Scienze e Tecnologie Agrarie<br />

Miglioramento genetico degli animali in produzione zootecnica<br />

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INDICE<br />

1. IL <strong>MIGLIORAMENTO</strong> <strong>GENETICO</strong> <strong>DEGLI</strong> ANIMALI IN PRODUZIONE ZOOTECNICA<br />

(CAPPIO-BORLINO A., PULINA G.) ............................................................................................................... 3<br />

1.1 IL SIGNIFICATO DEL <strong>MIGLIORAMENTO</strong> <strong>GENETICO</strong>......................................................................................... 3<br />

1.2 I CARATTERI QUANTITATIVI ....................................................................................................................... 4<br />

1.3 IL <strong>MIGLIORAMENTO</strong> <strong>GENETICO</strong> DEI CARATTERI QUANTITATIVI...................................................................... 7<br />

1.4 L’ECONOMICITÀ DEL <strong>MIGLIORAMENTO</strong> <strong>GENETICO</strong>....................................................................................... 8<br />

1.5 I VALORI ECONOMICI ................................................................................................................................10<br />

2. GLI STRUMENTI DELLA SELEZIONE................................................................................................23<br />

2.1 LA RACCOLTA DEI DATI FENOTIPICI ...........................................................................................................23<br />

2.2 LA DIVULGAZIONE DEL VALORE <strong>GENETICO</strong> DEI CANDIDATI ALLA SELEZIONE ................................................24<br />

3. DESCRIZIONE DELLA POPOLAZIONE PER UN CARATTERE QUANTITATIVO .......................28<br />

3.1 I RAPPORTI FRA FENOTIPO, GENOTIPO ED AMBIENTE...................................................................................28<br />

3.2 I VALORI MEDI .........................................................................................................................................29<br />

3.2.1 La me<strong>di</strong>a della popolazione................................................................................................................29<br />

3.2.2 L'effetto genetico me<strong>di</strong>o......................................................................................................................31<br />

3.2.3 Il valore riproduttivo..........................................................................................................................32<br />

3.2.4 La deviazione <strong>di</strong> dominanza................................................................................................................33<br />

3.2.5 Deviazione <strong>di</strong> interazione ...................................................................................................................34<br />

3.3 LA VARIABILITÀ DI UN CARATTERE QUANTITATIVO. ...................................................................................35<br />

3.3.1 La scomposizione della varianza fenotipica........................................................................................36<br />

3.3.2 La scomposizione della varianza ambientale ......................................................................................37<br />

3.3.3 La varianza ambientale sistematica....................................................................................................43<br />

4. L'EREDITABILITA' ................................................................................................................................45<br />

4.1 IL CONCETTO DI EREDITABILITÀ................................................................................................................45<br />

4.2 LA STIMA DELL'EREDITABILITÀ.................................................................................................................49<br />

4.3 RELAZIONE FRA EREDITABILITÀ E RIPETIBILITÀ..........................................................................................50<br />

4.4 LA CORRELAZIONE GENETICA....................................................................................................................52<br />

5. L’IMPIEGO DELLE INFORMAZIONI FENOTIPICHE PER LA VALUTAZIONE <strong>DEGLI</strong><br />

INDIVIDUI .........................................................................................................................................................54<br />

5.1 LE INFORMAZIONI DEI PARENTI .................................................................................................................54<br />

5.2 L’IMPIEGO DELLE INFORMAZIONI FENOTIPICHE ..........................................................................................56<br />

5.2.1 La selezione in<strong>di</strong>viduale .....................................................................................................................57<br />

5.2.2 La selezione familiare.........................................................................................................................58<br />

5.2.3 Selezione intrafamiliare......................................................................................................................61<br />

5.2.4 La selezione combinata ......................................................................................................................61<br />

6. LA VALUTAZIONE DEL VALORE <strong>GENETICO</strong> DI UN INDIVIDUO................................................62<br />

6.1 L’IMPIEGO DELLE MATRICI PER LA RISOLUZIONE DEI SISTEMI LINEARI..........................................................62<br />

6.2 L’INDICE <strong>GENETICO</strong>..................................................................................................................................66<br />

6.3 I LIMITI DELL’INDICE <strong>GENETICO</strong>................................................................................................................72<br />

6.4 IL METODO BLUP PER LA STIMA DEL VR...................................................................................................74<br />

6.4.1 I fondamenti del metodo BLUP...........................................................................................................77<br />

6.4.2 Le proprietà degli stimatori BLUP .....................................................................................................79<br />

6.4.3 Un modello BLUP semplificato per la valutazione genetica dei maschi (sire model)...........................80<br />

6.5 DAL BLUP ALL’ANIMAL MODEL..............................................................................................................83<br />

6.6 L’INDICE DI PEDIGREE ..............................................................................................................................85<br />

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Miglioramento genetico degli animali in produzione zootecnica<br />

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7. LA RISPOSTA ALLA SELEZIONE ........................................................................................................87<br />

7.1 LA RISPOSTA ALLA SELEZIONE...................................................................................................................87<br />

7.2 L’INTENSITÀ DI SELEZIONE .......................................................................................................................91<br />

7.3 L’INTERVALLO DI GENERAZIONE ...............................................................................................................94<br />

7.4 LA VELOCITÀ DI SELEZIONE E L’INDICE <strong>GENETICO</strong> ......................................................................................95<br />

7.5 GLI EFFETTI DELLA SELEZIONE SULLA VARIANZA........................................................................................98<br />

7.6 ESISTE UN LIMITE ALLA SELEZIONE?........................................................................................................100<br />

8. GLI SCHEMI DI SELEZIONE ..............................................................................................................103<br />

8.1 LA MASSIMIZZAZIONE DEL GUADAGNO <strong>GENETICO</strong> DR ...............................................................................104<br />

8.2 LA DIFFUSIONE DEL GUADAGNO <strong>GENETICO</strong>...............................................................................................104<br />

8.3 LA OTTIMIZZAZIONE NEL CONTINUO <strong>DEGLI</strong> SCHEMI DI SELEZIONE ALTERNATIVI.........................................106<br />

9. QTL E GENI MAGGIORI (MACCIOTTA N.P.P.) ..............................................................................108<br />

9.1 GENI MAGGIORI.....................................................................................................................................108<br />

9.2 MARCATORI GENETICI............................................................................................................................111<br />

9.2.1 Genotipo del locus alotano nei suini.................................................................................................113<br />

9.3 NN.........................................................................................................................................................115<br />

9.3.1 Gene dell’ipertrofia muscolare (doppia coscia) nei bovini da carne .................................................116<br />

9.4 QTL......................................................................................................................................................117<br />

9.5 PROSPETTIVE. ........................................................................................................................................119<br />

10. LE RELAZIONI FRA GLI ANIMALI ..............................................................................................121<br />

10.1 LA RELAZIONE DI PARENTELA .................................................................................................................121<br />

10.2 IL COEFFICIENTE DI PARENTELA R ...........................................................................................................123<br />

10.3 LA CONSANGUINEITÀ..............................................................................................................................124<br />

10.4 L’IMPIEGO DELL’ININCROCIO E DELL’ESINCROCIO IN ZOOTECNICA............................................................125<br />

11. BIBLIOGRAFIA CONSULTATA .....................................................................................................130<br />

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Miglioramento genetico degli animali in produzione zootecnica<br />

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1. IL <strong>MIGLIORAMENTO</strong> <strong>GENETICO</strong> <strong>DEGLI</strong> ANIMALI IN<br />

PRODUZIONE ZOOTECNICA (Cappio-Borlino A., Pulina G.)<br />

1.1 Il significato del miglioramento genetico<br />

Il miglioramento genetico (MG) degli animali zootecnici è la tecnica che consente<br />

l'aumento <strong>delle</strong> prestazioni produttive e riproduttive degli allevamenti attraverso la<br />

valutazione e la conseguente scelta (selezione) dei riproduttori; esso, pertanto, può<br />

essere considerato una <strong>delle</strong> tecniche <strong>di</strong> produzione a <strong>di</strong>sposizione dell'allevatore al<br />

pari dell'alimentazione, della mungitura, della riproduzione, dell'allevamento dei<br />

giovani e della stabulazione. Tuttavia, rispetto a queste, il MG genera incrementi<br />

permanenti della produttività, consentendo il mantenimento dell'impresa zootecnica<br />

all’interno della marginalità economica, ed esula dagli stretti interesse aziendali per<br />

coinvolgere una parte, e a volte l'intero, patrimonio <strong>di</strong> una razza (ad es. nel caso<br />

della Frisona Italiana, la più importante razza bovina italiana, il MG coinvolge quasi<br />

tutta la popolazione). Per questo aspetto generale, il MG è <strong>di</strong> solito riguardato alla<br />

stregua <strong>di</strong> attività <strong>di</strong> pubblico interesse e la sua gestione, soprattutto nella parte<br />

relativa alla valutazione dei riproduttori, è <strong>di</strong> solito controllata dallo Stato.<br />

Il MG in zootecnica si occupa quasi esclusivamente <strong>di</strong> caratteri <strong>di</strong> interesse<br />

economico (produzione <strong>di</strong> latte, contenuto lipi<strong>di</strong>co del latte, ritmo <strong>di</strong> accrescimento<br />

nei giovani, in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> conversione alimentare, numero <strong>di</strong> uova deposte, spessore del<br />

lardo dorsale nei suini, ecc..) che sono espressi in unità <strong>di</strong> misura (cioè in kg, cm,<br />

numero) e sono comunemente in<strong>di</strong>cati come caratteri metrici. Il valore osservato<br />

nel caso che il carattere sia misurato in un singolo in<strong>di</strong>viduo è il valore fenotipico<br />

dell'in<strong>di</strong>viduo (P) e, se i fenotipi dei caratteri metrici si <strong>di</strong>stribuiscono con continuità<br />

(cioè con incrementi <strong>di</strong>fferenziali) nel campo <strong>di</strong> variabilità, il carattere è detto<br />

quantitativo.<br />

Nel caso in cui una parte del fenotipo (per il momento non importa quanta) possa<br />

essere trasmessa alla <strong>di</strong>scendenza, il carattere in esame ha un determinismo<br />

genetico: la branca della genetica che si occupa <strong>di</strong> questi caratteri è la genetica<br />

quantitativa (quantitative genetics).<br />

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1.2 I caratteri quantitativi<br />

Abbiamo detto che i caratteri quantitativi variano con continuità all'interno<br />

dell'intervallo <strong>di</strong> variabilità.<br />

Esempio 1.1 La produzione <strong>di</strong> latte della specie bovina può variare dai 500 agli<br />

oltre 12.000 kg per lattazione (campo <strong>di</strong> variabilità 500-12.000) ed in questo<br />

ambito possono essere trovate produzione interme<strong>di</strong>e per approssimazioni piccole<br />

a piacere (da qualche parte esisteranno sia la vacca Gelsomina che ha prodotto kg<br />

4.559 <strong>di</strong> latte sia la vacca Pomponia che ne ha prodotto 9.443, sia la vacca<br />

Vattelapesca che ha prodotto quantovoletevoi).<br />

Ciò significa che alcuni caratteri, quali ad esempio quelli legati alla riproduzione<br />

(produzione <strong>di</strong> uova nei volatili, numerosità della ni<strong>di</strong>ata nei suini, tasso <strong>di</strong><br />

ovulazione negli ovini, ecc.), non presentando valori interme<strong>di</strong> all'unità (una scrofa<br />

partorisce 10 oppure 11 suinetti, ma non 10,73 suinetti!) non potrebbero essere<br />

considerati quantitativi. Ma, come vedremo in seguito, non è così.<br />

I caratteri quantitativi sono determinati geneticamente da un gran numero <strong>di</strong> loci<br />

(poligeni) poliallelici: ciascun locus contribuisce per una piccola parte (azione<br />

infinitesimale) alla espressione genetica del carattere e la somma (non sempre<br />

algebrica) <strong>di</strong> tali azioni fornisce l'espressione complessiva. Come possiamo legare i<br />

caratteri quantitativi alle conoscenze che abbiamo acquisito nello stu<strong>di</strong>o della<br />

genetica <strong>di</strong> tipo Mendeliano?<br />

Esempio 1.2 Sappiamo che le frequenze genotipiche dei figli <strong>di</strong>pendono dalle<br />

frequenze gametiche dei genitori. Se p e q sono le rispettive frequenze degli alleli<br />

A e a, le frequenze genotipiche possono essere ricavate dalla formula<br />

[1] (pA+qa)2 = p2AA + 2pqAa + q2aa<br />

Nel caso in cui A sia un allele, <strong>di</strong>ciamo, <strong>di</strong> "alta produzione", a sia un allele <strong>di</strong><br />

"bassa produzione", non esista dominanza (Aa = (AA+aa)/2; d=0), la popolazione<br />

sia in equilibrio, p=q=0,5, la frequenza dei genotipi nella popolazione sarà <strong>di</strong> 0,25<br />

AA, 0,50Aa, 0,25aa.<br />

Poniamo che il carattere sia determinato da 3 coppie <strong>di</strong> alleli , dei quali la metà<br />

ad alta espressione (A,B,C) e la metà a bassa espressione (a,b,c), la cui frequenza<br />

relativa sia p e q (pA, pB, pC, qa, qb, qc) e che il contributo ad<strong>di</strong>tivo (cioè non<br />

esista interazione fra alleli né linkage) <strong>di</strong> ciascun allele sia per quelli ad alta<br />

espressione (poniamo nel caso <strong>di</strong> una vacca) A=B=C =1.500 kg <strong>di</strong> latte per<br />

lattazione e per quelli a bassa espressione a=b=c=500 kg <strong>di</strong> latte per lattazione, e<br />

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che nella popolazione pA=pB=pC=0,50, la frequenza dei genotipi ed il loro valore<br />

genetico sarà il seguente:<br />

genotipo valore (kg) frequenza<br />

AABBCC 9.000 0,0156<br />

AABBCc 8.000 0,03125<br />

AABBcc 7.000 0,0156<br />

AABbCC 8.000 0,03125<br />

AABbCc 7.000 0,0625<br />

AABbcc 6.000 0,03125<br />

AAbbCC 7.000 0,0156<br />

AAbbCc 6.000 0,03125<br />

AAbbcc 5.000 0.0156<br />

AaBBCC 8.000 0,03125<br />

AaBBCc 7.000 0,0625<br />

AaBBcc 6.000 0,03125<br />

AaBbCC 7.000 0,0625<br />

AaBbCc 6.000 0,125<br />

AaBbcc 5.000 0,0625<br />

AabbCC 6.000 0,03125<br />

AabbCc 5.000 0,0625<br />

Aabbcc 4.000 0.03125<br />

aaBBCC 7.000 0,0156<br />

aaBBCc 6.000 0,03125<br />

aaBBcc 5.000 0,0156<br />

aaBbCC 6.000 0,03125<br />

genotipo valore (kg) frequenza (continua)<br />

aaBbCc 5.000 0,0625<br />

aaBbcc 4.000 0,03125<br />

aabbCC 5.000 0,0156<br />

aabbCc 4.000 0,03125<br />

aabbcc 3.000 0.0156<br />

Nel complesso si hanno 27 genotipi, ma soltanto 7 espressioni genotipiche la cui<br />

frequenza complessiva è la seguente<br />

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valori frequenza<br />

9.000 0,0156<br />

8.000 0,0937<br />

7.000 0,2343<br />

6.000 0,3125<br />

5.000 0,2343<br />

4.000 0,0937<br />

3.000 0,0156<br />

che riportata in un istogramma <strong>di</strong> frequenza assume questa forma<br />

Y<br />

0 10 20 30 40<br />

3000 4000 5000 6000 7000 8000 9000<br />

All'aumentare del numero <strong>di</strong> alleli, i genotipi possibili aumentano (nella misura <strong>di</strong><br />

3n per cui con 10 coppie <strong>di</strong> alleli si hanno 59.049 genotipi) e la loro <strong>di</strong>stribuzione<br />

si approssima ad una curva normale.<br />

Per quanto riguarda i caratteri legati alla riproduzione, non solo si osserva una<br />

<strong>di</strong>stribuzione <strong>delle</strong> frequenze dei genotipi che si approssima alla <strong>di</strong>stribuzione<br />

normale, ma il fenotipo, per quanto <strong>di</strong>scontinuo, risulta dall’azione ad<strong>di</strong>tiva <strong>di</strong><br />

numerosi geni che, superata una determinata soglia, consentono ai meccanismi<br />

fisiologici dell’animale <strong>di</strong> operare la transizione del carattere dal livello inferiore a<br />

quello superiore; per quessti motivi essi sono assimilati ai caratteri quantitativi.<br />

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L'esempio che abbiamo mostrato è una brutale semplificazione della realtà che, a<br />

livello cromosomico, è fortemente complicata dalla presenza del fenomeno della<br />

dominanza, dell'interazione fra geni, del linkage.<br />

1.3 Il miglioramento genetico dei caratteri quantitativi<br />

Il MG dei caratteri <strong>di</strong> interesse zootecnico si compie in quattro tappe: a) la scelta<br />

degli obiettivi della selezione; b) lo stu<strong>di</strong>o e la descrizione della popolazione oggetto<br />

<strong>di</strong> selezione; c) la valutazione genetica dei riproduttori; d) scelta dei criteri del<br />

miglioramento.<br />

La scelta degli obiettivi della selezione è la definizione, a livello operativo, dei<br />

caratteri sui quali concentrare gli sforzi del MG. Questa definizione deve essere la<br />

più precisa possibile (ad esempio per la produzione del latte: la quantità prodotta<br />

per lattazione, il contenuto lipi<strong>di</strong>co, il contenuto proteico; per la produzione della<br />

carne: i ritmi <strong>di</strong> accrescimento, gli in<strong>di</strong>ci <strong>di</strong> conversione alimentare, la qualità della<br />

carne), perchè deve essere ben chiaro dove si vuole arrivare, e limitata perchè la<br />

ricerca del miglioramento <strong>di</strong> molti caratteri provoca la riduzione del guadagno<br />

ottenibile per ciascuno <strong>di</strong> essi (non è possibile, o almeno è molto <strong>di</strong>fficile,<br />

in<strong>di</strong>viduare animali portatori del migliore genotipo per <strong>di</strong>versi caratteri; giocoforza<br />

dovranno essere scelti animali con un genotipo complesso buono per tutti i caratteri,<br />

ma probabilmente non eccellente per ciascuno <strong>di</strong> essi).<br />

Poiché il MG è un’impresa che coinvolge interessi al <strong>di</strong> sopra <strong>delle</strong> singole realtà<br />

aziendali zootecniche, un volta scelti gli obiettivi e messa in moto la (costosa)<br />

macchina del MG è <strong>di</strong>fficile tornare in<strong>di</strong>etro. Le valutazioni in tal senso non<br />

possono che essere <strong>di</strong> tipo economico: il guadagno produttivo ottenibile con il MG<br />

nell'intera popolazione (cioè il progresso genetico atteso dR) deve contribuire<br />

all'aumento del red<strong>di</strong>to in maniera superiore, o al limite uguale, ai costi sostenuti per<br />

la sua realizzazione. Ciò significa che devono verificarsi tre con<strong>di</strong>zioni: 1) che il<br />

carattere selezionato abbia un buon prezzo <strong>di</strong> mercato (ad es. non è pensabile<br />

selezionare la razza ovina Sarda per la produzione della lana data il basso prezzo<br />

del prodotto) oppure contribuisca significativamente all'aumento del fatturato<br />

aziendale (ad es. il miglioramento della riproducibilità influenza positivamente la<br />

produzione anche negli allevamenti da latte); 2) che gli incrementi ottenibili (dR)<br />

siano <strong>di</strong> una certa entità; 3) che il sistema <strong>di</strong> miglioramento sia compatibile con il<br />

contesto tecnico-culturale <strong>delle</strong> imprese a cui esso è destinato (ad es. non è sempre<br />

vantaggioso applicare ad una specie sistemi <strong>di</strong> miglioramento che hanno dato buoni<br />

risultati in un'altra, come nel caso degli ovini da latte in cui l’adozione degli schemi<br />

utilizzati nei bovini con buon esito non ha fornito i risultati sperati).<br />

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La seconda tappa consiste nella descrizione sintetica della popolazione per il<br />

carattere scelto. Vedremo come ciò è possibile a partire dai fenotipi (P) , dalle<br />

parentele fra gli animali, dall'entità della variabilità dei fenotipi spiegata da quella<br />

dei genotipi (misurata dal coefficiente <strong>di</strong> e<strong>di</strong>tabilità h 2 ), dall'associazione statistica<br />

fra i valori ad<strong>di</strong>tivi dei caratteri prescelti (espressa dal coefficiente <strong>di</strong> correlazione<br />

r A12) e dalla entità con cui le misure ripetute <strong>di</strong> uno stesso animale si rassomigliano<br />

(misurata dals ripetibilità r). E' ovvio che per operare tale descrizione è necessario<br />

possedere un robusto armamentario <strong>di</strong> statistica, che, nelle sue linee genrali, sarà<br />

fornito in appen<strong>di</strong>ce.<br />

La terza tappa è quella dell'impiego dei coefficienti tecnici, assieme alle misurazioni<br />

fenotipiche e ai rapporti <strong>di</strong> parentela fra gli animali, per la stima del valore genetico<br />

ad<strong>di</strong>tivo (valore riproduttivo VR o bree<strong>di</strong>ng value BV) dei genitori potenziali in<br />

base al quale questi potranno essere classificati gli uni rispetto agli altri in una scala<br />

<strong>di</strong> merito. La stima del VR è attuata con il calcolo dei cosiddetti in<strong>di</strong>ci genetici (IG)<br />

con meto<strong>di</strong> statistici a volte molto complessi e con schemi <strong>di</strong> selezione che variano<br />

in funzione <strong>delle</strong> informazioni fenotipiche utilizzate.<br />

La quarta tappa riguarda la strategia <strong>di</strong> miglioramento da adottare (i cosidetti<br />

programmi <strong>di</strong> selezione) che <strong>di</strong>penderà dal progresso genetico atteso E(dR), in cui<br />

E significa espected (cioè valore me<strong>di</strong>o stimato), e dal suo costo. In questa fase<br />

saranno anche valutati meto<strong>di</strong> accessori quali l'incrocio fra razze <strong>di</strong>verse o fra linee<br />

<strong>di</strong>fferenti della stessa razza oppure l'uso della consanguineità.<br />

Queste quattro tappe permettono <strong>di</strong> stimare dal conosciuto, il fenotipo, l'incognito,<br />

il valore genetico ad<strong>di</strong>tivo degli animali can<strong>di</strong>dati alla selezione, al fine <strong>di</strong><br />

mo<strong>di</strong>ficare la frequenza dei caratteri quantitativi della popolazione, e la relativa<br />

espressione produttiva, in un senso ben definito.<br />

1.4 L’economicità del miglioramento genetico<br />

Come già accennato nei paragrafi precedenti, il MG richiede una attuazione<br />

pianificata della pratica selettiva che si articola nei tre momenti fondamentali della<br />

rilevazione dei dati fenotipici e <strong>delle</strong> parentele, della stima del valore genetico dei<br />

riproduttori potenziali e della scelta dei genitori con valore genetico più elevato<br />

quali genitori della generazione successiva.<br />

Per poter mettere a confronto <strong>di</strong>versi schemi <strong>di</strong> selezione, cioè le modalità attraverso<br />

le quali si scelgono i riproduttori, è innanzitutto necessario conoscere le rispettive<br />

capacità <strong>di</strong> produrre guadagno genetico (dR) e la fiducia che deve essere posta in<br />

questo in<strong>di</strong>ce (cfr. capitolo 7). Come tutte le previsioni, infatti, il dR calcolato per<br />

ciascun schema <strong>di</strong> selezione è affetto da una intrinseca incertezza, le cui ragioni<br />

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saranno esposte in seguito. Ciò significa che per ciascun schema esiste una<br />

variabilità <strong>di</strong> risposta che può essere misurata dalla varianza <strong>di</strong> dR, calcolabile<br />

recursivamente facendo girare tutti i parametri dello schema per più volte in un<br />

calcolatore. Il valore me<strong>di</strong>o E(dR) sarà preso come riferimento e la sua varianza<br />

V(dR) fornirà l'in<strong>di</strong>ce dell'atten<strong>di</strong>bilità <strong>di</strong> questo valore. Il calcolo della V(dR) è<br />

possibile anche, in via approssimata e per la selezione massale, con la relazione<br />

suggerita da Hill nel 1977:<br />

[2] V(dR) = 2F ⋅ V(A)<br />

in cui F è il tasso me<strong>di</strong>o <strong>di</strong> consanguineità (cfr. il capitolo 10) e V(A) è la varianza<br />

genetica ad<strong>di</strong>tiva, cioè la quota della variabilità fenotipica totale attribuita all'effetto<br />

ad<strong>di</strong>tivo dei poligeni (cfr. capitolo 3) e ricavabile <strong>di</strong>rettamente dall’ere<strong>di</strong>tabilità (cfr.<br />

capitolo 4).<br />

Poiché all'aumentare della V(dR) aumenta la probabilità <strong>di</strong> ottenere guadagni<br />

genetici molto inferiori al valore atteso, un alto valore della varianza corrisponde sul<br />

versante economico ad un alto coefficiente <strong>di</strong> rischio che si deve associare<br />

all'investimento richiesto per la realizzazione del progetto <strong>di</strong> miglioramento.<br />

Solitamente V(dR) aumenta all'aumentare del guadagno genetico atteso E(dR)<br />

secondo una relazione del tipo quadratico, il che significa che più ci si avvicina al<br />

massimo <strong>di</strong> E(dR) più rapidamente aumenta la varianza e quin<strong>di</strong> il rischio <strong>di</strong><br />

realizzare in pratica un guadagno molto più piccolo del valore atteso.<br />

Poichè il profitto ottenibile con un dato schema <strong>di</strong> selezione U(dR) è legato sia al<br />

guadagno genetico che al quadrato della sua varianza, una funzione economica<br />

<strong>delle</strong> scelte possibili degli operatori avrà la forma:<br />

[3] U(dR) = E(dR) - w(dR)2<br />

dove w è un parametro che misura, in una scala arbitraria, il livello me<strong>di</strong>o <strong>di</strong><br />

avversione al rischio degli operatori in una specifica situazione. Una funzione <strong>di</strong><br />

utilità deve infatti aumentare con il profitto atteso e <strong>di</strong>minuire con l'aumentare del<br />

rischio <strong>di</strong> per<strong>di</strong>ta, ma il peso che si deve attribuire a quest'ultimo <strong>di</strong>pende<br />

dall'atteggiamento degli operatori che può essere favorevole o me<strong>di</strong>amente<br />

in<strong>di</strong>fferente al rischio. D'altro canto, poiché la funzione [3] raggiunge un massimo<br />

relativo per E(dR) =1/(2w), l'insieme dei valori per cui U(dR) mantiene un<br />

significato deve essere limitato all'intervallo fra E(dR) = 0 e E(dR) = 1/(2w). Di<br />

conseguenza occorre minimizzare la probabilità <strong>di</strong> avere E(dR) > 1/(2w) e questa<br />

con<strong>di</strong>zione è sod<strong>di</strong>sfatta se si sceglie il parametro w in modo che 1/(2w) sia uguale<br />

al valore più grande <strong>di</strong> [E(dR) + 2σ(dR)] tra quelli che si ottengono per i <strong>di</strong>versi<br />

schemi <strong>di</strong> selezione alternativi in esame. In questa ipotesi, cioè ponendo:<br />

[4] w = 1/2Max [E(V(dR)) +2σ(dR)]<br />

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Corso <strong>di</strong> Zootecnica Generale e Alimentazione animale - Modulo <strong>di</strong> Zootecnica Generale<br />

Miglioramento genetico degli animali in produzione zootecnica<br />

____________________________________________________________________________________<br />

in cui σ(dR) è la ra<strong>di</strong>ce quadrata della varianza del progresso atteso, il parametro w<br />

si riferisce all'atteggiamento <strong>di</strong> massima avversione al rischio.<br />

Sostituendo questo valore nella relazione [3] si possono calcolare i valori della<br />

funzione <strong>di</strong> utilità relativa ai <strong>di</strong>versi schemi <strong>di</strong> selezione in esame ed in<strong>di</strong>viduare lo<br />

schema specifico, la cui scelta corrisponderà alla decisione più razionale sotto<br />

l'aspetto economico. Evidentemente cambiando il valore <strong>di</strong> w cambia anche la scala<br />

della razionalità economica <strong>delle</strong> scelte possibili con la conseguenza che un sistema<br />

ottimizzato per il guadagno genetico atteso può non godere la preferenza degli<br />

operatori in un clima <strong>di</strong> generale avversione al rischio, ma essere scelto in imprese il<br />

cui atteggiamento favorevole al rischio fa ritenere che un maggior guadagno atteso<br />

compensi la crescita del rischio associato.<br />

Esempio 1.3 Nella selezione della razza bovina Frisona Italiana l'organizzazione<br />

del miglioramento è basata sul cosiddetti schema convenzionale che prevede<br />

l'impiego massiccio dell'inseminazione artificiale, la valutazione dei tori tramite la<br />

prova <strong>di</strong> progenie (cioè con l'impiego <strong>delle</strong> informazioni fenotipiche <strong>delle</strong> figlie), la<br />

selezione <strong>di</strong> un numero relativamente ristretto <strong>di</strong> madri <strong>di</strong> tori. Il valore<br />

riproduttivo dei tori è generalmente molto atten<strong>di</strong>bile, ma è ottenuto a scapito <strong>di</strong><br />

un lungo tempo <strong>di</strong> attesa per l'ottenimento dell'in<strong>di</strong>ce (elevato intervallo fra le<br />

generazioni). Da qualche tempo a questa parte gli allevatori <strong>di</strong> Frisona Italiana<br />

utilizzano sempre più frequentemente come riproduttori i cosiddetti "tori giovani"<br />

per i quali non sono ancora <strong>di</strong>sponibili in<strong>di</strong>ci genetici atten<strong>di</strong>bili, ma che possono<br />

creare un progresso genetico tanto più elevato (o tanto più basso) quanto<br />

maggiore è l'incertezza degli in<strong>di</strong>ci genetici che si possiedono.<br />

1.5 I valori economici<br />

Il concetto <strong>di</strong> economicità del MG esposto nel paragrafo precedente fa riferimento<br />

al giu<strong>di</strong>zio <strong>di</strong> opportunità da formulare nei riguar<strong>di</strong> <strong>di</strong> <strong>di</strong>versi progetti <strong>di</strong> selezione<br />

relativi ad un solo carattere produttivo e tiene conto <strong>di</strong> un aspetto fortemente legato<br />

all’impren<strong>di</strong>tore, la sua avversione o propensione al rischio. Poichè, però, l’obiettivo<br />

della selezione in tutte le specie zootecniche è normalmente orientato al<br />

miglioramento contemporaneo <strong>di</strong> più caratteri produttivi, in questi ultimi anni, anche<br />

alla luce dell’aumentata potenza <strong>di</strong> calcolo <strong>di</strong>sponibile, si è fatto strada il concetto <strong>di</strong><br />

valore economico (assoluto o relativo). La sua determinazione per i caratteri che si<br />

combinano in un obiettivo <strong>di</strong> selezione è infatti essenziale per il calcolo <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>ce<br />

che stima il valore del genotipo aggregato degli animali can<strong>di</strong>dati alla selezione.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Il valore economico <strong>di</strong> un carattere, potenziale obiettivo <strong>di</strong> selezione, è usualmente<br />

definito come la “variazione marginale dell’efficienza del sistema produttivo in<br />

esame, causata dal miglioramento genetico <strong>di</strong> una unità <strong>di</strong> misura del carattere<br />

considerato” (Groen). A questa univocità della definizione concettuale, non<br />

corrisponde però una pari uniformità metodologica nel calcolo effettivo dei valori<br />

economici; al contrario, la letteratura sull’argomento delinea un ventaglio assai<br />

ampio <strong>di</strong> meto<strong>di</strong> <strong>di</strong> calcolo alternativi che si <strong>di</strong>fferenziano per:<br />

1) la definizione della efficienza produttiva, che può essere valutata in termini<br />

economici o in termini biologici;<br />

2) la precisazione dell’interesse al miglioramento genetico da in<strong>di</strong>viduare fra la<br />

massimizzazione del profitto, la riduzione dei costi <strong>di</strong> produzione, l’aumento dei<br />

ricavo per unità <strong>di</strong> investimento, ecc.;<br />

3) l’in<strong>di</strong>viduazione del sistema produttivo, sia per quanto concerne il livello <strong>di</strong><br />

riferimento (singolo animale in produzione, allevamento, intero settore regionale o<br />

nazionale), che in riguardo alla base <strong>di</strong> valutazione (numero costante <strong>di</strong> animali,<br />

fattori <strong>di</strong> produzione costanti, quantità <strong>di</strong> un determinato prodotto costante);<br />

4) infine, la specificazione dell’approccio generale, che può essere <strong>di</strong> tipo empirico,<br />

cioè basato sui soli dati osservativi, oppure <strong>di</strong> tipo normativo, ossia fondato su dati<br />

simulati.<br />

Il metodo <strong>di</strong> calcolo dei valori economici che noi prenderemo come in essame fa<br />

riferimento ad un concetto <strong>di</strong> efficienza produttiva valutata in termini monetari; il<br />

miglioramento genetico si intende finalizzato all’aumento del profitto al livello della<br />

singola azienda-tipo, con un numero limitato e costante <strong>di</strong> animali e senza alcun<br />

vincolo esterno alle produzioni. L’approccio generale è <strong>di</strong> tipo normativo. Questa<br />

scelta è motivata dalla considerazione che il riferimento ai solo dati osservativi (ad<br />

es. prezzi attuali <strong>di</strong> mercato per i prodotti ed i costi attuali per i mezzi i produzione)<br />

vincola i valori economici alla situazione produttiva e allo scenario economico<br />

presenti al momento a cui sono riferiti i calcoli. Il carattere <strong>di</strong> lungo periodo del<br />

miglioramento genetico richiede, invece, una conoscenza della sensibilità dei valori<br />

economici dei caratteri obiettivo della selezione alla variazione <strong>delle</strong> circostanze<br />

produttive e <strong>di</strong> mercato.<br />

Il modello matematico che si mette a punto per ottenere i dati normativi deve<br />

simulare i processi che coinvolgono le variabili e le relazioni fondamentali del<br />

sistema allevamento, costituito dall’intreccio fra fattori <strong>di</strong> produzione, variabili <strong>di</strong><br />

struttura, variabili biologiche e caratteri produttivi. La rappresentazione in termini<br />

matematici <strong>di</strong> un sistema così complesso richiede necessariamente numerose<br />

equazioni che nel loro insieme costituiscono un modello bioeconomico. In soldoni,<br />

il modello bioeconomico è lo strumento in grado <strong>di</strong> simulare il funzionamento<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

dell’intero sistema produttivo aziendale e <strong>di</strong> consentire <strong>di</strong> rispondere alla seguente<br />

domanda: l’aumento produttivo relativo ad un carattere (ad es. 1 kg <strong>di</strong> grasso in più<br />

per lattazione per capo produttivo) comporta (o comporterà) un aumento dei costi <strong>di</strong><br />

produzione (più alimenti <strong>di</strong> migliore qualità, maggiore investimenti colturali,<br />

superiore attenzione alla sanità dell’allevmento, ecc..) tali da compensare l’aumento<br />

del fatturato?<br />

Esempio 1.4 Il modello bioeconomico dell’azienda ovina da latte.<br />

Questo modello è stato sviluppato da noi e si avvale del Software Ovisoft®<br />

(Pulina, STARTRONICS 1998) come base <strong>di</strong> calcolo. Esso si compone della parte<br />

strutturale dell’allevamento e <strong>di</strong> quella economica. Ne <strong>di</strong>amo una dettagliata<br />

descrizione.<br />

a) La <strong>di</strong>namica strutturale del gregge<br />

Il modello simula la struttura del gregge nei <strong>di</strong>versi mesi dell’anno a partire da<br />

una unità gregge fissata ad una consistenza <strong>di</strong> 100 pecore (<strong>di</strong> tutte le età,<br />

compresa la rimonta) più gli arieti occorrenti alla data del 1° settembre, che<br />

convenzionalmente segna l’inizio dell’annata agraria nei paesi del me<strong>di</strong>terraneo.<br />

I parametri strutturali che debbono essere comunicati in ingresso ed in base ai<br />

quali il programma ricostruisce <strong>di</strong>namiche <strong>di</strong>fferenti, sono la fertilità (n. <strong>di</strong> pecore<br />

che partoriscono sul totale), la prolificità (n. <strong>di</strong> nati per ogni parto), la mortalità<br />

neonatale (entro il primo mese <strong>di</strong> vita) e quella <strong>delle</strong> pecore, la quota <strong>di</strong> rimonta<br />

(calcolata sull’unità gregge), il rapporto riproduttivo fra i sessi. La fertilità <strong>delle</strong><br />

pecore pluripare e <strong>di</strong> quelle primipare è fornita separatamente e riferita alle due<br />

stagioni dei parti (autunnale, prevalentemente per le pluripare, e primaverile per<br />

le primipare); la prolificità <strong>di</strong> queste ultime è fissata nel valore <strong>di</strong> 1.00. Il rapporto<br />

riproduttivo fra i sessi, tipicamente dell’or<strong>di</strong>ne <strong>di</strong> 40 pecore per ogni ariete a<br />

causa della concentrazione dei calori in 15-20 giorni in primavera, può essere<br />

variato all’interrno <strong>di</strong> un ampio range <strong>di</strong> valori così da tenere conto anche<br />

dell’eventuale impiego dell’inseminazione artificiale.<br />

Sulla base <strong>delle</strong> informazioni ricevute in ingresso con i valori dei parametri<br />

strutturali, il programma riproduce, per ogni mese dell’anno, la consistenza del<br />

gregge e la sua articolazione nelle categorie: pluripare produttive, primipare<br />

produttive, pluripare improduttive, primipare improduttive, arieti e agnelli<br />

(Tabella 1).<br />

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Table 1 - Dynamic and structure of standard flock.<br />

Month Ewes Maiden Rams Flock*<br />

Productive Improductive<br />

Plur. Prim. Plur. Prim<br />

Jan 68 15 10 5 21 2.5 122.1<br />

Feb 67 15 10 5 21 2.5 120.7<br />

Mar 72 15 5 4 21 2.5 119.1<br />

Apr 72 15 3 21 2.5 113.2<br />

May 72 15 3 20 2.5 112.2<br />

Jun 72 15 3 20 2.5 112.2<br />

Jul 72 15 3 20 2.5 112.2<br />

Aug 72 15 3 20 2.5 112.2<br />

Sep 70 15 10 5 2.5 102.5<br />

Oct 70 15 10 5 2.5 102.5<br />

Nov 69 15 10 5 2.5 102.2<br />

Dec 69 15 10 5 2.5 102.2<br />

* I dati sono arrotondati.<br />

Il modello tiene conto degli elementi fondamentali che caratterizzano la tecnica <strong>di</strong><br />

allevamento della pecora sarda:<br />

- la stagionalità dei parti che, per la gran parte <strong>delle</strong> pluripare, si verificano fra<br />

settembre e <strong>di</strong>cembre e per le primipare e le pluripare che non hanno partorito in<br />

autunno avvengono fra febbraio ed aprile (per semplicità <strong>di</strong> calcolo il modello<br />

contrae il primo periodo al 15 novembre ed il secondo al 1° <strong>di</strong> marzo);<br />

- la localizzazione temporale dello scarto <strong>delle</strong> pluripare improduttive nel mese <strong>di</strong><br />

marzo e dello scarto <strong>delle</strong> pluripare produttive nel mese <strong>di</strong> agosto;<br />

- la <strong>di</strong>stribuzione nel corso dell’anno della mortalità del gregge, tipicamente<br />

dell’or<strong>di</strong>ne del 5%.<br />

b) Le produzioni<br />

I parametri produttivi che debbono essere comunicati in ingresso e che consentono<br />

al modello <strong>di</strong> simulare situazioni produttive <strong>di</strong>fferenti, riguardano: la produzione<br />

me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> latte <strong>delle</strong> pecore primipare in una lattazione e le quantità <strong>di</strong> grasso e <strong>di</strong><br />

proteine prodotte annualmente in me<strong>di</strong>a da ciascun animale in lattazione. Il<br />

programma calcola la produzione annua me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> latte <strong>delle</strong> pluripare tramite un<br />

fattore <strong>di</strong> aggiustamento (1.57) attribuisce una percentuale me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> grasso e <strong>di</strong><br />

proteine alla produzione <strong>delle</strong> due categorie <strong>di</strong> animali. Le produzioni <strong>di</strong> latte (M,<br />

in kg) sono quin<strong>di</strong> espresse in latte normalizzato al 6.5% <strong>di</strong> grasso (F, in %) e<br />

5.8% <strong>di</strong> proteine (P, in %), con la relazione<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

[5] FPCM = M(0.25 + 0.085F + 0.035P)<br />

Il modello simula quin<strong>di</strong>, separatamente per le primipare e per le pluripare, la<br />

produzione giornaliera me<strong>di</strong>a per ciascun mese <strong>di</strong> produzione per mezzo <strong>di</strong><br />

coefficienti <strong>di</strong> produzione relativa (Tabella 2), che riflettono l’andamento della<br />

curva <strong>di</strong> lattazione riportata nella figura successiva.<br />

Table 2 - Correction factors of lactation curve pattern.<br />

Nov Dec Jan Feb Mar Apr May Jun Jul<br />

Prim. 1.00 1.31 1.20 1.00 0.50<br />

Plur. 0.90 1.20 1.10 1.05 1.15 1.20 0.90 0.67 0.55<br />

Figura 1 - Curva <strong>di</strong> lattazione del gregge standard.<br />

milk yield (kg/d)<br />

1,4<br />

1,2<br />

1<br />

0,8<br />

0,6<br />

0,4<br />

0,2<br />

0<br />

n d j f m a m j j<br />

month<br />

La durata della lattazione è fissata in 242 giorni (dal 15 novembre al 15 luglio<br />

successivo) per le pluripare, e a 153 giorni (1° marzo- 31 luglio) per le primipare<br />

e le pluripare con parto primaverile. La forma binomiale della curva <strong>di</strong> lattazione<br />

<strong>delle</strong> pluriapre con parto autunnale tiene conto dell’influenza dei fattori<br />

ambientali, legati principalmente alla <strong>di</strong>sponibilità foraggera, sull’andamento<br />

produzione <strong>di</strong> latte osservabile negli animali allevati con sistemi estensivi o<br />

semiestensivi.<br />

14<br />

plurip<br />

primip


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Il modello fornisce, inoltre, la produzione ven<strong>di</strong>bile me<strong>di</strong>a per pecora presenta e la<br />

produzione complessiva annua del gregge; esso considera inoltre la correzione<br />

per l’eventuale impiego dell’allattamento artificiale degli agnelli considerando da<br />

una parte la maggiore produzione e dall’altra i costi per l’acquisto della farina<br />

lattea (Tabella 3).<br />

Table 3 - Milk and meat production of standard flock as output of model (without artificial<br />

rearing).<br />

Month Milk yield (kg) Lambs to sell<br />

Male Female Total<br />

Nov 0<br />

Dec 835 44 23 67<br />

Jan 2134<br />

Feb 1803<br />

Mar 2186 11 11 22<br />

Apr 2897<br />

May 2335<br />

Jun 1725<br />

Jul 751<br />

Total 14666 55 34 90<br />

Per quanto concerne, infine, la produzione della carne e della lana: la prima si<br />

ottiene moltiplicando il numero degli agnelli ven<strong>di</strong>bili per il peso morto me<strong>di</strong>o (6.4<br />

kg) e sommandovi il prodotto <strong>delle</strong> pecore scartate per il loro peso morto<br />

(proporzionale al peso vivo che un input del modello); la seconda è calcolata dal<br />

prodotto fra il numero degli animali presenti e la produzione unitaria prefissata in<br />

1.5 kg per i maschi e 1.0 kg per le femmine.<br />

c) I fabbisogni energetici e l’ingestione <strong>di</strong> sostanza secca.<br />

Il modello simula il fabbisogno giornaliero me<strong>di</strong>o per ciascun mese dell’anno,<br />

separatamente per le <strong>di</strong>verse categorie <strong>di</strong> animali. Per le femmine in produzione, il<br />

fabbisogno energetico tiene conto del mantenimento, dell’attività <strong>di</strong> pascolamento,<br />

della produzione del latte, della gestazione e, limitatamente alle primipare,<br />

dell’accrescimento. Il modello mantiene costante nel corso dell’anno il peso <strong>delle</strong><br />

pluripare (che deve essere introdotto nel modello) e non considera gli scambi<br />

energetici legati alla mobilizzazione ed al successivo ripristino <strong>delle</strong> riserve<br />

corporee per la <strong>di</strong> gran lunga minore importanza che questi hanno nel bilancio<br />

energetico complessivo della pecora rispetto alla vacca da latte. Il fabbisogno<br />

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energetico giornaliero, relativamente al mese i-mo, è calcolato rispettivamente per<br />

le primipare e le pluripare tramite la relazione [6a] e [6b]:<br />

[6a] ERYi = (0.033LW 0.75 ) kgi kp+ 0.62FPCMi<br />

[6b] ERMi= (0.033LW 0.75 ) kgi + 0.62FPCMi<br />

dove:<br />

ERMi ERYi = fabbisogni me<strong>di</strong> giornalieri <strong>di</strong> energia per pecore primipare e<br />

pluripare al mese i (in Unità Foraggere Latte);<br />

LW = peso corporeo (kg);<br />

FPCMi = produzione <strong>di</strong> latte normalizzato (kg) nel mese i;<br />

kgi = fattore <strong>di</strong> correzione per i fabbisogni <strong>di</strong> pascolamento al mese i (1,3 da<br />

<strong>di</strong>cembre a luglio; 1,1 da agosto ad ottobre; 1,2 in novembre);<br />

kp = fattore <strong>di</strong> correzione per l’accrescimento <strong>delle</strong> primipare (1,2).<br />

L’energia necessaria agli animali in gestazione è calcolata aggiungendo ai<br />

fabbisogni <strong>di</strong> mantenimento, 0,02, 0,09 e 0,18 UFL a partire da 6, 4 e 2 settimane<br />

prima del parto.<br />

L’equazione seguente simula il fabbisogno energetico degli arieti, il cui peso<br />

corporeo è mantenuto anch’esso costante e deve essere fornito come input al<br />

programma:<br />

[7] ERRi= (0.0399LW 0.75 ) kgikm<br />

dove:<br />

ERRi = fabbisogni energetici me<strong>di</strong> giornalieri per gli arieti al mese i (in Unità<br />

Foreggere Latte);<br />

LW = peso corporeo (kg);<br />

kgi = coefficiente <strong>di</strong> correzione al mese i (1,2 da novembre a febbraio; 1,4 da marzo<br />

a luglio e in ottobre; 1,0 da agosto a settembre);<br />

km = fabbisogni energetici per la monta (0,17 UFL/giorno).<br />

Per quanto riguarda, infine, l’energia occorrente per l’allevamento dei giovani<br />

animali da rimonta, essa è prefissata ad un livello costante per i primi tre mesi (<br />

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0,66 UFL al giorno per capo), ed è invece calcolata in base alla relazione [6a] per<br />

il periodo successivo.<br />

A questo punto il modello simula l’ingestione giornaliera me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> sostanza secca<br />

per i <strong>di</strong>versi mesi dell’anno, nell’ipotesi che l’energia assunta con gli alimenti sia<br />

sempre tale da sod<strong>di</strong>sfare i fabbisogni e che la razione abbia la composizione più<br />

economica compatibilmente con l’energia richiesta. Le equazioni impiegate per la<br />

determinazione dell’ingestione rispettivamente della rimonta, <strong>delle</strong> pecore e degli<br />

arieti sono le seguenti :<br />

[8a] ILi = 0.6 + 0.055LW 0.75<br />

[8b] IEi= 0.075 LW 0.75 + 0.60FPCMi<br />

[8c] IRi = 0.065 LW 0.75<br />

dove:<br />

ILi, IEi, IRi, = ingestione me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> sostanza secca (kg) per le agnelle (L), le pecore<br />

(E) e gli arieti ( R) al mese i;<br />

LW = peso corporeo (kg);<br />

FPCMi = produzione me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> latte normalizzato (kg) nel mese i.<br />

Le equazioni [8] non considerano esplicitamente la <strong>di</strong>pendenza dell’ingestione dai<br />

valori relativi <strong>di</strong> ingombro dei foraggi, ma tiene conto implicitamente del fatto che<br />

al crescere del fabbisogno energetico, la composizione della razione deve essere<br />

progressivamente variata nella <strong>di</strong>rezione della maggiore concentrazione<br />

energetica e, quin<strong>di</strong>, <strong>di</strong> minore ingombro.<br />

d) La composizione della razione e l’or<strong>di</strong>namento colturale dell’azienda.<br />

La conoscenza dei fabbisogni energetici e dell’ingestione <strong>di</strong> sostanza secca<br />

consente <strong>di</strong> calcolare la concentrazione energetica della razione giornaliera e per<br />

mese; essa permette cioè <strong>di</strong> simulare la composizione della razione stessa<br />

attraverso la classica relazione:<br />

[9] ECRi = ECFi Xi + ECCi(1-Xi)<br />

dove:<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

ECRi = concentrazione energetica della razione (UFL per kg <strong>di</strong> sostanza secca) al<br />

mese i;<br />

ECFi, ECCi = concentrazione energetica dei foraggi e dei concentrati al mese i;<br />

Xi = quantità relativa <strong>di</strong> foraggi nella razione al mese i.<br />

L’applicazione della [9] richiede che il modello <strong>di</strong> simulazione riceva, fra i<br />

parametri <strong>di</strong> ingresso, anche le informazioni relative a:<br />

- il rapporto fieno/pascolo per ciascun mese dell’anno;<br />

- il rapporto erbaio/pascolo;<br />

- la concentrazione energetica <strong>delle</strong> erbe <strong>di</strong> pascolo naturale e <strong>di</strong> erbaio e quella<br />

del fieno;<br />

- la concentrazione energetica dei concentrati.<br />

Calcolata la quantità complessiva <strong>di</strong> sostanza secca e le quantità relative <strong>di</strong><br />

pascolo, <strong>di</strong> fieno e <strong>di</strong> concentrati necessarie per ciascun mese e per l’intero anno,<br />

a ciascuna categoria <strong>di</strong> animali ed all’unità gregge nel suo complesso, il modello<br />

simula infine l’or<strong>di</strong>namento colturale dell’azienda. Poichè, nelle situazioni tipiche<br />

dell’allevamento degli ovini da latte in ambiente me<strong>di</strong>terranee, le aziende<br />

posseggono la totalità (o a volte più) <strong>delle</strong> superfici necessarie per la produzione<br />

dell’erba e del fieno occorrente, mentre posseggono una quota molto <strong>di</strong>fferente<br />

<strong>delle</strong> superfici da destinare alla coltivazione dei cereali, il modello consente <strong>di</strong><br />

simulare un ampio ventaglio <strong>di</strong> situazioni produttive: dall’estremo dell’azienda che<br />

deve acquistare sul mercato la totalità dei concentrati, all’azienda che è invece in<br />

grado <strong>di</strong> vendere quote rilevanti dei cereali e dei foraggi prodotti.<br />

e) Il calcolo dei valori economici<br />

Definiamo il valore economico <strong>di</strong> un carattere come la variazione marginale del<br />

profitto <strong>di</strong> un’azienda, rapportata al numero degli animali presenti, conseguente<br />

al progresso genetico unitario del carattere considerato. Contro questo metodo <strong>di</strong><br />

calcolo è stato obiettato che un cambiamento della base <strong>di</strong> valutazione del profitto<br />

(ad es. dal singolo animale, all’unità <strong>di</strong> prodotto o all’unità <strong>di</strong> investimento) si<br />

traduce in una variazione non solo dei valori economici assoluti, come è ovvio che<br />

avvenga, ma anche dei valori economici relativi, come invece non dovrebbe<br />

accadere. La ragione <strong>di</strong> tale variabilità, che importa una certa dose <strong>di</strong> ambiguità<br />

nel concetto <strong>di</strong> valore economico, è che la scelta della base <strong>di</strong> valutazione equivale<br />

a vincolare ad un valore costante una <strong>delle</strong> variabili non genetiche <strong>di</strong> cui il<br />

profitto è funzione (il numero degli animali o la quantità <strong>di</strong> prodotto o il capitale<br />

investito, ecc); tanto la scelta della variabile da tenere costante quanto il suo<br />

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valore si rivelano, <strong>di</strong> solito, largamente arbitrari, vale a <strong>di</strong>re privi <strong>di</strong> una<br />

giustificazione teorica.<br />

A parere <strong>di</strong> Dickerson (1970) il superamento della variabilità dei valori economici<br />

al variare della base <strong>di</strong> riferimento è possibile solo se il calcolo viene effettuato<br />

sulla variazione marginale non più <strong>di</strong> una funzione <strong>di</strong> profitto, ma <strong>di</strong> una funzione<br />

<strong>di</strong> efficienza economica , definita come rapporto (anziché <strong>di</strong>fferenza) fra ricavi e<br />

costi <strong>di</strong> produzione. Secondo McArthur (1987) e Amer and Fox (1992), invece, il<br />

calcolo dei valori economici può ancora basarsi su una funzione <strong>di</strong> profitto, ma a<br />

patto che nessuna <strong>delle</strong> variabili non genetiche, da cui il profitto <strong>di</strong>pende, sia<br />

tenuta costante e che invece tutte le variabili siano determinate con un processo <strong>di</strong><br />

ottimizzazione da svilupparsi simultaneamente alla variazione marginale della<br />

potenzialità genetica dei caratteri che interessano. Infine, gli stu<strong>di</strong> <strong>di</strong> Brascamp et<br />

al. (1985) e <strong>di</strong> Smith et al. (1986) <strong>di</strong>mostrano che le <strong>di</strong>fferenze fra i valori<br />

economici calcolati con basi <strong>di</strong> valutazione <strong>di</strong>verse si annullano qualora i vincoli<br />

imposti alla funzione <strong>di</strong> profitto non siano arbitrari, o rispondenti ad una necessità<br />

<strong>di</strong> fatto, ma siano parte integrante dello stesso concetto <strong>di</strong> valore economico. Così,<br />

se il valore economico viene definito come la variazione del profitto determinata<br />

dall’aumento marginale della potenzialità genetica del carattere in esame, una<br />

conseguenza logica è che il calcolo del valore economico debba escludere<br />

qualunque variazione del profitto che abbia un’origine <strong>di</strong>versa, ad esempio che<br />

derivi dalla rimozione <strong>di</strong> specifiche inefficienze <strong>di</strong> management e della tecnica <strong>di</strong><br />

allevamento oppure dal ri<strong>di</strong>mensionamento (rescaling) della consistenza numerica<br />

dell’azienda. Quando si rispettano queste con<strong>di</strong>zioni, i valori economici relativi<br />

calcolati con una funzione <strong>di</strong> profitto non <strong>di</strong>pendono più dalla base <strong>di</strong> valutazione<br />

e coincidono con i valori calcolati con una funzione <strong>di</strong> efficienza economica.<br />

In definitiva, quale che sia la soluzione specifica che si prospetta, ciò che appare<br />

definitivamente appurato è che l’eliminazione <strong>di</strong> ogni ambiguità residua dal<br />

calcolo dei valori economici postula una qualche forma <strong>di</strong> ottimizzazione <strong>delle</strong><br />

variabili non genetiche (strutturali, <strong>di</strong> management, <strong>di</strong> tecnica d’allevamento) da<br />

cui <strong>di</strong>pende il profitto d’azienda. Questa conclusione, sicuramente ben fondata dal<br />

punto <strong>di</strong> vista della teorica economica, non è tuttavia sempre facilmente<br />

applicabile né la sua applicazione si rivela sempre proficua. Infatti nel campo<br />

zootecnico non mancano gli esempi <strong>di</strong> settori produttivi per i quali l’ottimizzazione<br />

della tecnica <strong>di</strong> allevamento, della struttura e del management dell’azienda<br />

delinea una situazione produttiva ipotetica: questa non solo è <strong>di</strong>versa dalle<br />

situazioni or<strong>di</strong>narie (come è lecito attendersi quando si utilizza un modello<br />

normativo o una simulazione matematica) ,ma soprattutto non ha più nessun<br />

contatto con la realtà produttiva e nessuna possibilità <strong>di</strong> influenzarla a breve o<br />

me<strong>di</strong>o termine.<br />

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Il settore degli ovini da latte in ambiente me<strong>di</strong>terraneo è uno <strong>di</strong> questi. La<br />

struttura, il management <strong>delle</strong> aziende, la tecnica <strong>di</strong> allevamento e quella <strong>di</strong><br />

alimentazione presentano una generale situazione <strong>di</strong> inefficienza per lo più dovuta<br />

alla tra<strong>di</strong>zione ed all’inserimento <strong>di</strong> queste realtà economiche in contesti<br />

regionali o nazionali il cui superamento in tempi brevi sarebbe utopistico. Ciò non<br />

toglie che alcuni paesi investono cifre rilevanti per il miglioramento genetico <strong>delle</strong><br />

produzioni per cui è necessario conoscere i valori economici dei caratteri<br />

obiettivo <strong>di</strong> selezione in situazioni produttive compatibili con la rigi<strong>di</strong>tà strutturale<br />

e manageriale del settore.<br />

Il metodo <strong>di</strong> calcolo dei valori economici fondato su una funzione <strong>di</strong> profitto <strong>di</strong><br />

azienda con il vincolo posto dalla costanza della consistenza numerica<br />

dell’allevamento, tiene in debito conto sia dell’interesse prevalente della selezione<br />

nel breve e me<strong>di</strong>o termine (la massimizzazione del red<strong>di</strong>to degli allevatori) che<br />

della rigi<strong>di</strong>tà de ventaglio <strong>di</strong> situazioni produttive possibili in un futuro altrettanto<br />

prossimo.<br />

Il calcolo del profitto P = R - C richiede la conoscenza dei ricavi ( R) e dei costi <strong>di</strong><br />

produzione (C). Nelle aziende <strong>di</strong> ovini da latte i ricavi conseguono alla ven<strong>di</strong>ta del<br />

latte (inteso come carrier), del grasso, <strong>delle</strong> proteine, degli agnelli e <strong>delle</strong> pecore<br />

scartate nonché, eventualmente, dei cereali e dei foraggi prodotti in eccedenza<br />

rispetto ai fabbisogni degli animali, mentre è quasi trascurabile il ritorno<br />

economico della produzione della lana. I costi <strong>di</strong> produzione sono legati in<br />

prevalenza alla coltivazione dei foraggi e dei concentrati (spese per la<br />

concimazione dei pascoli,<br />

per la coltivazione degli erbai e dei cereali, per la raccolta e conservazione del<br />

fieno, ecc..), all’acquisto della quota <strong>di</strong> concentrati che non è prodotta in azienda<br />

e, per i cereali prodotti in azienda, all’acquisto degli integratori minerali e<br />

vitaminici.<br />

Nel linguaggio usuale della teoria dei valori economici - che definisce variabili i<br />

costi proporzionali al numero degli animali presenti in azienda e fissi i costi che<br />

rimangono costanti, o variano in modo <strong>di</strong>scontinuo, al variare della consistenza<br />

numerica dell’allevamento - i costi appena elencati appartengono alla categoria<br />

dei costi variabili. Sono invece fissi i costi dei macchinari, degli impianti, degli<br />

e<strong>di</strong>fici e anche de lavoro. Il modello, infatti, non considera l’acquisto <strong>di</strong><br />

manodopera esterna all’azienda in quanto questa evenienza è abbastanza rara<br />

negli allevamenti ovini del me<strong>di</strong>terraneo nei quali tutto il lavoro è solitamente<br />

fornito dall’allevatore e dalla sua famiglia.<br />

Il suggerimento <strong>di</strong> Visscher et al. (1994) secondo cui nelle aziende zootecniche con<br />

animali alimentati prevalentemente al pascolo, sarebbe opportuno trattare come<br />

fissi i costi <strong>di</strong> alimentazione, non può essere applicato al caso degli ovini da latte:<br />

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infatti, al crescere dei livelli produttivi gli allevatori debbono ricorrere in misura<br />

sempre maggiore all’acquisto <strong>di</strong> alimenti dal mercato. Una nostra indagine,<br />

condotta su 120 allevamenti della Sardegna, ha evidenziato che ciascun aumento<br />

produttivo <strong>di</strong> 1 litro <strong>di</strong> latte munto per pecora presente in allevamento comporta<br />

una maggiore integrazione con concentrati pari a 0.65 kg capo -1 anno -1 (Brandano<br />

et al., 1994).<br />

I sintesi il modello calcola i ricavi con la seguente relazione:<br />

[10] R = N x (pmiMI + pmfMIF + pmpMIP + plmLM + pemEM + pwEW) +<br />

pffFF + pcfCF; (ECU year -1 )<br />

dove :<br />

N = presenza me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> pecore in lattazione;<br />

MI = llivello <strong>di</strong> produzione del latte (kg pecora -1 anno -1 )<br />

pmi = prezzo base del latte (EURO kg -1 )<br />

MIF = produzione <strong>di</strong> grasso (kg pecora -1 anno -1 ) calcolata come <strong>di</strong>fferenza<br />

giornaliera rispetto alla percentuale <strong>di</strong> riferimento <strong>di</strong> 6,5;<br />

pmf = premio/penalizzazione per il grasso (EURO);<br />

MIP = produzione <strong>di</strong> proteine (kg pecora -1 anno -1 ) calcolata come <strong>di</strong>fferenza<br />

giornaliera rispetto alla percentuale <strong>di</strong> riferimento <strong>di</strong> 5,8;<br />

pmp= milk protein bonus or penalty (ECU)<br />

LM = lamb meat production (kg ewe -1 year -1 )<br />

plm = lamb meat price (ECU kg -1 )<br />

EM = meat from <strong>di</strong>sposed animals (kg ewe -1 year -1 )<br />

pem = price of <strong>di</strong>sposed animals (ECU kg -1 )<br />

EW = wool production (kg ewe -1 year -1 )<br />

pw = price of wool (ECU kg -1 )<br />

FF, CF = amount of roughages and cereals grown on the farm and sold (kg year -1 )<br />

pff, pcf = price of roughages and of cereals on the market (ECU kg -1 )<br />

Allo stesso modo, i costi <strong>di</strong> produzione sono calcolati con la relazione:<br />

[11] C = N x (pcCM + piIM) + pfFP + pcpCP + plfLF + N⋅VCC + FCF; (ECU year 1 )<br />

dove:<br />

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N = number of average presence lactating ewes;<br />

CM = concentrate purchased from the market (kg ewe year -1 )<br />

pc = price of concentrate (ECU kg -1 )<br />

IM = vitamine and minerals premix purchased from the market (kg ewe year -1 )<br />

pi = price of vitamine and minerals (ECU kg -1 )<br />

FP, CP= amount of roughages and cereals grown on the farm (kg year -1 )<br />

pf, pcp = production costs of roughages and of cereals grown on the farm (ECU kg -1 )<br />

LF = amount of labour supplied y the farmer (hours)<br />

plf = price of labour (ECU hour -1 )<br />

VCC = Other variable costs (ECU ewe year -1 )<br />

FCF = Other fixed costs (ECU kg -1 ).<br />

Dalle equazioni [10] e [11] deriva facilmente la relazione per il calcolo del valore<br />

economico dei caratteri produttivi fondamentali: quantità <strong>di</strong> late, <strong>di</strong> grasso e <strong>di</strong><br />

proteina. Riferito al singolo animale e all’intervallo temporale <strong>di</strong> un anno, il<br />

valore economico (EV) è infatti dato dalla:<br />

[8] EV = [pmiδ(MI) + pmfδ(MIF) + pmpδ(MIP)] - [pcδ(CM) + piδ(IM) -<br />

pfδ(FP) - pcpδ(CP)]<br />

in cui il simbolo δ in<strong>di</strong>ca la variazione da una situazione <strong>di</strong> riferimento alla<br />

situazione che consegue alla variazione marginale del valore genetico del<br />

carattere considerato. L [8] definisce la forma generale della relazione per il<br />

calcolo del valore economico dei caratteri legati alla produzione del latte, nella<br />

ipotesi <strong>di</strong> un numero imitato e costante <strong>di</strong> animali ed in base alla scelta <strong>di</strong><br />

massimizzazione del profitto <strong>di</strong> azienda quale interesse fondamentale al<br />

miglioramento genetico. La sua applicazione concreta alla determinazione del<br />

valore economico <strong>di</strong> ciascun carattere specifico richiede l’ipotesi aggiuntiva che il<br />

valore genetico del carattere in esame possa essere variato senza che varino i<br />

livelli produttivi degli altri caratteri.<br />

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2. GLI STRUMENTI DELLA SELEZIONE<br />

La stima del valore riproduttivo (VR) degli animali scelti (selezionati) quali genitori<br />

della generazione successiva si basa sui fenotipi degli animali stessi e dei loro<br />

parenti. La base per effettuare tale stima, perciò, è la raccolta sistematica <strong>delle</strong><br />

produzioni (controlli funzionali), degli eventi (nascite, morti) e dei rapporti <strong>di</strong><br />

parentela fra gli animali interessati alla selezione.<br />

2.1 La raccolta dei dati fenotipici<br />

La raccolta <strong>di</strong> tutte le informazioni <strong>di</strong> base utilizzate per la selezione è affidata, in<br />

Italia (ma analoghe strutture sono presenti anche all'estero), alle associazioni degli<br />

allevatori, poste sotto il controllo del Ministero per le Risorse Agricole (e per questo<br />

compito finanziate dallo Stato) per il carattere <strong>di</strong> pubblica utilità del MG, riunite<br />

nell'Associazione Italiana Allevatori (AIA) con sede in Roma.<br />

Gli allevatori <strong>di</strong> ciascuna specie sono organizzati autonomamente in associazioni (ad<br />

es. associazione nazionale suini ANAS) che possono essere sud<strong>di</strong>vise per razza,<br />

come nei bovini (Associazione Frisona Italiana ANAFI, Associazione Nazionale<br />

Allevatori della Razza Bruna ANARB, Associazione Allevatori Razza Bovina<br />

Piemontese ANABORAPI) oppure essere interspecifiche, come per gli ovini ed i<br />

caprini (Associazione Nazionale della Pastorizia ASSONAPA).<br />

Queste associazioni, attraverso i loro organi <strong>di</strong>rettivi (normalmente le commissioni<br />

tecniche centrali), decidono gli obiettivi e le modalità della selezione, raccolgono le<br />

informazioni provenienti dagli allevamenti, calcolano il valore riproduttivo degli<br />

in<strong>di</strong>vidui can<strong>di</strong>dati alla selezione con meto<strong>di</strong> <strong>di</strong>fferenti a seconda dello schema <strong>di</strong><br />

selezione adottato, pubblicano i risultati ed aggiornano i parametri della popolazione<br />

relativamente ai caratteri oggetto della selezione (me<strong>di</strong>e, varianze, ere<strong>di</strong>tabilità,<br />

ecc.). Esse sono normalmente fornite <strong>di</strong> un ufficio stu<strong>di</strong> che valuta, tra le altre cose,<br />

il progresso genetico ottenuto e che cura la pubblicazione <strong>di</strong> notiziari o <strong>di</strong> riviste<br />

vere e proprie (ad es. l'ANAFI pubblica Bianco e Nero, l'ASSONAPA pubblica<br />

l'Allevatore <strong>di</strong> Ovini e Caprini, ecc.).<br />

L'AIA è organizzata perifericamente attraverso le Associazioni Provinciali degli<br />

Allevatori (APA) che sono strutturate al loro interno in sezioni <strong>di</strong> specie o <strong>di</strong> razza<br />

in funzione <strong>delle</strong> principali specie e razze allevate nell'ambito territoriale <strong>di</strong> propria<br />

competenza. Le APA, i cui organi <strong>di</strong>rettivi sono eletti dagli allevatori iscritti, curano<br />

la raccolta dei dati aziendali attraverso: a) i controlli funzionali, per i dati produttivi;<br />

b) la registrazione degli eventi per i dati riproduttivi e quelli relativi alla riforma<br />

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(scarto) degli animali; c) la valutazione morfologica, operata da esperti<br />

punteggiatori, alle età tipiche dell'animale; d) la trascrizione <strong>delle</strong> parentele note e<br />

<strong>delle</strong> genealogie. Esse, inoltre, custo<strong>di</strong>scono il libro genealogico in cui sono iscritti<br />

gli animali in selezione e dal quale è possibile risalire agli ascendenti per ciascun<br />

animale presente. Poiché l'organizzazione dei Libri Genealogici (o dei cosiddetti<br />

Registri <strong>di</strong> Razza nel caso in cui questi non siano stati istituiti) varia fra specie e,<br />

qualora esistano, fra razza all'interno della stessa specie, non la trattiamo in questa<br />

sede, ma riman<strong>di</strong>amo alle informazioni più puntuali ed aggiornate facilmente<br />

reperibili presso ciascuna sede APA. Infine, i dati fenotipici e le altre informazioni,<br />

pretrattati e ripuliti da eventuali errori in sede periferica, sono inviati alle<br />

Associazioni centrali.<br />

Le APA <strong>di</strong> quasi tutte le regioni italiane sono consorziate a costituire l'Associazione<br />

Regionale Allevatori a cui, <strong>di</strong> norma, spetta il compito <strong>di</strong> armonizzare le azioni<br />

svolte in sede provinciale con la politica agraria <strong>delle</strong> Regioni alle quali, come è<br />

noto, è delegato il maggior onere degli interventi nel settore agricolo. Molte ARA,<br />

fra cui quella della Sardegna, sono dotate <strong>di</strong> un corpo <strong>di</strong> tecnici (Agronomi<br />

Zootecnici) e <strong>di</strong> me<strong>di</strong>ci Veterinari che fornisce un servizio <strong>di</strong> assistenza tecnica alle<br />

aziende zootecniche in base a precisi piani concordati in sede regionale con gli<br />

Assessorati per l'Agricoltura.<br />

2.2 La <strong>di</strong>vulgazione del valore genetico dei can<strong>di</strong>dati alla selezione<br />

La <strong>di</strong>vulgazione <strong>delle</strong> valutazioni genetiche, operata sui principi e con le tecniche<br />

che impareremo nei successivi capitoli, avviene <strong>di</strong> solito semestralmente per opera<br />

<strong>delle</strong> varie organizzazioni responsabili per la selezione. A titolo <strong>di</strong> esempio, e per la<br />

maggiore importanza che questo settore riveste per l'economia italiana, esaminiamo<br />

il caso della specie bovina e dell'in<strong>di</strong>rizzo produttivo "Produzione del latte".<br />

Attualmente sono <strong>di</strong>sponibili le valutazioni anche nei siti internet <strong>delle</strong> varie<br />

organizzazioni.<br />

Le due più importanti razza bovine da latte allevate in Italia sono la Frisona Italiana<br />

(FI) e la Bruna (RB); le loro associazioni <strong>di</strong> razza pubblicano le valutazioni<br />

genetiche per i tori in volumetti (Cosa Valgono per la FI e Conoscere i Tori per la<br />

RB), completi <strong>di</strong> tutti i dati relativi ai caratteri oggetto <strong>di</strong> selezione, <strong>delle</strong> statistiche<br />

della popolazione obiettivo e della scala <strong>di</strong> merito dei tori, e per le vacche in<br />

quaderni comprendenti però soltanto le migliori vacche dalle quali saranno<br />

selezionati i tori da impiegarsi per la inseminazione artificiale (IA).<br />

Gli allevatori (ed i tecnici) hanno pertanto ogni 6 mesi una serie <strong>di</strong> informazioni sul<br />

valore genetico degli animali selezionati (cioè scelti perché risultati non peggioratori<br />

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per la maggior parte dei caratteri considerati) che essi possono utilizzare per<br />

pianificare il tipo <strong>di</strong> animali (cioè la genetica) desiderati per la generazione<br />

successiva. Questa scelta è <strong>di</strong> fatto orientata da ragioni <strong>di</strong> or<strong>di</strong>ne economico (il<br />

costo della dose <strong>di</strong> seme, che <strong>di</strong>pende dal valore del riproduttore e dalla<br />

<strong>di</strong>sponibilità; l'atten<strong>di</strong>bilità dell'in<strong>di</strong>ce), tecnico (miglioramento <strong>di</strong> alcuni caratteri,<br />

come ad es. l'attacco anteriore della mammella, la percentuale <strong>di</strong> grasso nel latte,<br />

ecc.) e genetico (livello <strong>di</strong> consanguineità raggiunto nell'allevamento).<br />

Se si prende in esame il volumetto Conoscere i Tori del luglio 1995, alla pagina 69 è<br />

pubblicata la scheda riassuntiva della valutazione genetica per 4 tori (Allegato 1); i<br />

valori riportati sono espressi come deviazione dalla me<strong>di</strong>a della popolazione (base<br />

genetica). Esaminiamo il toro DAL e ve<strong>di</strong>amo subito che il seme è importato dalla<br />

Germania, che è nato il 1° marzo del 1980, che è stato pubblicato la prima volta nel<br />

1992, che è un miglioratore per il latte <strong>di</strong> 156 kg, del grasso <strong>di</strong> 12 kg (+0,10%),<br />

<strong>delle</strong> proteine <strong>di</strong> 12 kg (+0,13%), dell'in<strong>di</strong>ce totale economico <strong>di</strong> +499 che lo<br />

colloca fra il miglior 12% della popolazione (rank), che è stato provato su 213 figlie<br />

<strong>di</strong>stribuite in 193 allevamenti (163 figlie effettive), che l'atten<strong>di</strong>bilità è del 94%.<br />

Ve<strong>di</strong>amo ancora che la produzione me<strong>di</strong>a <strong>delle</strong> figlie, espressa in equivalente vacca<br />

adulta (EVM), è stata <strong>di</strong> 6211 kg con il 3,96% <strong>di</strong> grasso ed è riportata anche l'età<br />

me<strong>di</strong>a al parto. Nel riquadro <strong>di</strong> destra del box sono riportate le informazioni relative<br />

alla morfologia, espresse come valore genetico del toro in unità <strong>di</strong> deviazione<br />

standard. Come si vede la scheda è zeppa <strong>di</strong> informazioni, ma come sono state<br />

ottenute? Guar<strong>di</strong>amo le note pubblicate dalla pagina 2 alla pagina 5 (riportate<br />

nell'Allegato 2) e pren<strong>di</strong>amo confidenza con la terminologia: la spiegazione <strong>di</strong><br />

ciascun termine sarà chiara in seguito.<br />

La prima informazione importante è il metodo <strong>di</strong> calcolo degli in<strong>di</strong>ci genetici tori<br />

(IGT) : quelli per la produzione e per la morfologia sono stati elaborati con il<br />

BLUP-ANIMAL MODEL (BLUP = best linear unbiased pre<strong>di</strong>ction cioè il<br />

Migliore Pre<strong>di</strong>tore Lineare non Distorto) mentre quelli per l'attitu<strong>di</strong>ne alla<br />

mungitura sono stati elaborati con l'algoritmo BLUP-SIRE MODEL.<br />

Gli in<strong>di</strong>ci produttivi sono stati composti, me<strong>di</strong>ante l'impiego dei coefficienti <strong>di</strong><br />

ponderazione, in un In<strong>di</strong>ce Tecnico Economico (ITE) che riassume il miglioramento<br />

economico atteso dalla <strong>di</strong>scendenza del toro.<br />

La guida avverte, comunque, che i dati pubblicati esprimono le <strong>di</strong>fferenze fra i tori<br />

per cui è importante la classifica <strong>di</strong> essi, e la <strong>di</strong>fferenza fra loro, piuttosto che il<br />

valore assoluto.<br />

La sezione A esamina i vantaggi del modello statistico utilizzato per il calcolo del<br />

IGT dei caratteri produttivi obiettivo della selezione, le modalità della sua<br />

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applicazione, il preaggiustamento dei dati, i coefficienti <strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tabilità utilizzati e<br />

l'accuratezza ottenuta. In tale parte notiamo che:<br />

1) i dati elaborati sono numerosi; per ogni ciclo <strong>di</strong> valutazione, infatti, la matrice<br />

BLUP comprende centinaia <strong>di</strong> migliaia (per la Frisona Italiana, milioni) <strong>di</strong> equazioni<br />

lineari relative ciascuna alla produzione <strong>di</strong> una vacca controllata. Come vedremo<br />

tutte le equazioni sono fra loro collegate dalle informazioni sui rapporti <strong>di</strong> parentela<br />

fra gli animali considerati per il calcolo;<br />

2) i dati produttivi, rilevati con tecniche capaci <strong>di</strong> far risparmiare tempo e denaro<br />

(A4, A6, AT), sono preaggiustati in modo tale da riferirli ad equivalente vacca<br />

adulta (EVM);<br />

3) l'ere<strong>di</strong>tabilità dei caratteri considerati, stimata a parte su tutta la popolazione<br />

Bruna italiana con meto<strong>di</strong>ca REML (REstricted Maximum Likelihood = algoritmo<br />

<strong>di</strong> stima basato sulla Massima Verosimiglianza Ristretta), è piuttosto bassa e<br />

abbastanza simile (0,26-0,29) e che la ripetibilità (cioè la correlazione fra le<br />

produzioni ripetute del singolo animale) è posta pari a 0,50;<br />

4) L'ITE tiene conto non solo <strong>delle</strong> produzioni e della morfologia, ma anche del tipo<br />

<strong>di</strong> variante genetica della k-caseina posseduta dal toro (questa frazione caseinica è<br />

infatti connessa con le proprietà casearie del latte: tipo AA bassa attitu<strong>di</strong>ne alla<br />

caseificazione, tipo AB me<strong>di</strong>a attitu<strong>di</strong>ne, tipo BB alta attitu<strong>di</strong>ne) .<br />

I tori sono poi classificati in base al rank i cui valori limite sono riportati in apposito<br />

riquadro. Il riquadro sottostante riporta, invece, la me<strong>di</strong>a degli IGT e <strong>delle</strong> altre<br />

informazioni ottenute con la valutazione, il campo <strong>di</strong> variabilità e la varianza sotto<br />

forma <strong>di</strong> deviazione standard.<br />

La sezione B esamina i caratteri morfologici oggetto della selezione e la<br />

metodologia adottata per la loro rilevazione e valutazione genetica. La rilevazione<br />

avviene secondo uno schema detto "valutazione lineare", che tenta <strong>di</strong> rendere<br />

oggettiva attraverso una classificazione a base <strong>di</strong> punteggi la valutazione<br />

morfologica <strong>di</strong> un animale. Lo schema impiegato per spiegare le tendenze espresse<br />

dagli in<strong>di</strong>ci è pubblicato nelle prime pagine della guida (Allegato 3).<br />

La sezione C, infine, riporta la definizione del carattere "attitu<strong>di</strong>ne alla mungitura"<br />

ed i meto<strong>di</strong> per la sua valutazione genetica: in questo caso è impiegato un modello<br />

BLUP più semplice, che ripartisce le informazioni filiali all'interno dei soli tori<br />

padri.<br />

Per quanto riguarda le vacche, il quaderno ANARB del luglio 1995 (In<strong>di</strong>ce genetico<br />

vacche madri <strong>di</strong> tori per la FA) riporta il miglior 1% (rank > 0,99) <strong>delle</strong> vacche<br />

in<strong>di</strong>cizzate or<strong>di</strong>nate per ITE; nel "giro <strong>di</strong> valutazione" pubblicato sono presenti 1238<br />

vacche che sod<strong>di</strong>sfano i requisiti per <strong>di</strong>ventare le madri dei tori che saranno destinati<br />

alla IA. Se pren<strong>di</strong>amo in esame le vacche riportate alla pagina 69 (Allegato 4),<br />

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ve<strong>di</strong>amo che la n. d'or<strong>di</strong>ne 1242 (Laika) è registrata in provincia <strong>di</strong> Bolzano, che ha<br />

solo 2 contemporanee ed 1 lattazione e per questo motivo l'atten<strong>di</strong>bilità degli in<strong>di</strong>ci<br />

è bassa (0,48), che il suo ITE è <strong>di</strong> + 663, che è miglioratrice per il latte <strong>di</strong> 590 kg,<br />

peggioratrice per la percentuale <strong>di</strong> grasso ma non per la quantità totale prodotta,<br />

ecc.<br />

Le modalità della rilevazione dei dati e del calcolo degli in<strong>di</strong>ci sono, anche per le<br />

vacche, riportate nella premessa del quaderno (Allegato 5) e devono essere lette<br />

nello stesso modo che per i tori.<br />

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3. DESCRIZIONE DELLA POPOLAZIONE PER UN CARATTERE<br />

QUANTITATIVO<br />

3.1 I rapporti fra fenotipo, genotipo ed ambiente<br />

Lo stu<strong>di</strong>o <strong>di</strong> un carattere quantitativo in una popolazione animale si basa sulla<br />

misurazione dei valori fenotipici e sulla stima <strong>di</strong> quanta parte della variabilità<br />

osservata è <strong>di</strong> origine genetica e perciò può essere trasmessa alla generazione<br />

successiva. Innanzitutto occorre che il valore fenotipico del carattere misurato sia<br />

ripartito nelle due componenti attribuibili all'azione del genotipo ed a quella<br />

dell'ambiente.<br />

Il genotipo è quel particolare assortimento <strong>di</strong> geni posseduto da un determinato<br />

in<strong>di</strong>viduo e l'ambiente è l'insieme <strong>di</strong> circostanze non-genetiche in grado <strong>di</strong><br />

influenzare l'espressione del carattere. Le due componenti, allora, possono essere<br />

associate ad<strong>di</strong>tivamente nel senso che l'espressione fenotipica è la somma del<br />

genotipo e <strong>delle</strong> deviazioni casuali che l'ambiente esercita sul carattere in esame;<br />

questo concetto può essere espresso in simboli come:<br />

[1] P = G + e<br />

che rappresenta l'equazione fondamentale della genetica quantitativa, in cui P è il<br />

fenotipo, G è il valore genotipico ed e è la deviazione che l'ambiente esercita<br />

sull'espressione del carattere. Poiché le deviazioni ambientali calcolate su tutta la<br />

popolazione animale sono <strong>di</strong>stribuite normalmente e, in quanto casuali, la loro<br />

somma è zero, la me<strong>di</strong>a del valore fenotipico è uguale alla me<strong>di</strong>a del valore<br />

genotipico; in altri termini per una popolazione animale abbastanza numerosa, il<br />

fenotipo me<strong>di</strong>o è uguale al genotipo me<strong>di</strong>o (P=G).<br />

Il valore genetico può, perciò, essere espresso come la somma della me<strong>di</strong>a <strong>di</strong><br />

popolazione (μ) e della deviazione genetica da essa (g), per cui la [1] <strong>di</strong>venta:<br />

[2] P = μ + g + e<br />

secondo la quale la somma <strong>delle</strong> deviazioni genetiche della popolazione è uguale a<br />

zero.<br />

Se anche il fenotipo è espresso in forma <strong>di</strong> deviazione dalla me<strong>di</strong>a della popolazione<br />

(P = μ + p), per cui anche la somma <strong>delle</strong> p è uguale a zero, la [2] <strong>di</strong>venta:<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

[3] p = g + e<br />

Riassumendo, per un determinato carattere quantitativo, il valore fenotipico me<strong>di</strong>o<br />

esprime il valore genotipico me<strong>di</strong>o della popolazione animale, mentre la sua<br />

variabilità è la somma della variabilità attribuita al genotipo e <strong>di</strong> quella attribuita<br />

all'ambiente. Il calcolo <strong>di</strong> queste 3 quantità, della relazione fra loro e della relazione<br />

fra animali per la quantità g, rappresentano, in soldoni, le principali informazioni da<br />

trarre ai fini del miglioramento genetico dalla popolazione animale.<br />

3.2 I valori me<strong>di</strong><br />

Lo stu<strong>di</strong>o dei valori genetici me<strong>di</strong> si basa sulla comprensione dei meccanismi che<br />

attribuiscono un determinato valore alla me<strong>di</strong>a della popolazione, al valore me<strong>di</strong>o <strong>di</strong><br />

un gene ed al valore genotipico espresso nelle sue componenti ad<strong>di</strong>tiva, <strong>di</strong><br />

dominanza e <strong>di</strong> interazione (epistasia).<br />

3.2.1 La me<strong>di</strong>a della popolazione<br />

La me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> un carattere quantitativo in una popolazione è influenzata dalla<br />

frequenza dei geni. Per comprendere a pieno questo concetto, consideriamo per<br />

semplicità un solo locus con 2 alleli A e a il cui valore genotipico sia arbitrariamente<br />

+d per AA e -d per aa:<br />

genotipo aa Aa AA<br />

__⏐_____________⏐_____⏐______<br />

valore genotipico -d ⏐0 h +d<br />

Il punto zero della scala corrisponde al valore interme<strong>di</strong>o fra gli omozigoti ed il<br />

valore h dell'eterozigote <strong>di</strong>pende dal grado <strong>di</strong> dominanza interme<strong>di</strong>a (h=0, in<br />

assenza <strong>di</strong> dominanza; se A è dominante su a, h>0; in caso contrario h⏐d⏐).<br />

Se la frequenza <strong>di</strong> A nella popolazione è p e quella <strong>di</strong> a è q (p+q=1), le frequenza<br />

genotipiche della popolazione ed il relativo valore genotipico saranno:<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Genotipo frequenza valore freq. x valore<br />

AA p2 +d p2d<br />

Aa 2pq h 2pqh<br />

aa q2 -d -q2d<br />

la cui somma è:<br />

p2d - q2d + 2pqh = d(p+q)(p-q) + 2pqh =<br />

[4] d(p-q) + 2pqh = M<br />

che rappresenta la me<strong>di</strong>a della popolazione M.<br />

Esempio 3.1 Nella specie bovina, consideriamo arbitrariamente il carattere<br />

produzione <strong>di</strong> latte controllato da un solo locus biallelico A e a, i cui valori<br />

genotipici assoluti , espressi in kg <strong>di</strong> latte per lattazione, siano aa=5000 kg , Aa =<br />

8000 kg e AA = 9000kg; lo zero arbitrario è fissato in 7000 kg [(9000+5000)/2] ed<br />

i valori genotipici relativi sono -d = -2000, h = 1000, +d = 2000. La me<strong>di</strong>a della<br />

popolazione , calcolata con la [4] per p = 0,1 e q = 0,9 è:<br />

2000 x (0,1-0,9) + 2 x 0,1x 0,9 x 1000 = -1420<br />

ed è variabile con il variare <strong>delle</strong> frequenze secondo il prospetto:<br />

p (A) q(a) M valore assoluto<br />

0,1 0,9 -1420 5580<br />

0,3 0,7 -380 6620<br />

0,5 0,5 500 7500<br />

0,7 0,3 1220 8220<br />

0,9 0,1 1780 8780<br />

Se il gene è costituito da <strong>di</strong>fferenti loci che contribuiscono al valore genotipico come<br />

somma del contributo separato del singolo locus, la me<strong>di</strong>a della popolazione è la<br />

sommatoria degli effetti separati secondo la relazione:<br />

[5] M = Σd(p-q) + 2Σpqh<br />

Esempio 3.2 Consideriamo gli effetti genetici separati dei genotipi ottenuti dagli<br />

alleli A, a e B,b, sempre espressi in kg <strong>di</strong> latte per lattazione:<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

AA = d A = 500; Aa = h A = 100; aa = -d A= -500<br />

BB = d B = 70; Bb = h B = -15; bb= -d B = -70<br />

La me<strong>di</strong>a della popolazione in funzione della frequenza genica è la seguente:<br />

p(A,B) q(a,b) contr. A contr. B Totale<br />

0,1/0,9 0,9/0,1 -310 53,3 -256,7<br />

0,5/0,5 0,5/0,5 50 -3,7 46,3<br />

0,9/0,1 0,1/0,9 416 -57,4 358,6<br />

3.2.2 L'effetto genetico me<strong>di</strong>o<br />

La conoscenza della modalità con cui la me<strong>di</strong>a della popolazione è legata con la<br />

frequenza dei geni che la costituiscono non è sufficiente se non si tiene conto che<br />

gli animali non trasmettono alla <strong>di</strong>scendenza il genotipo, ma soltanto i propri geni<br />

per cui il genotipo è ricreato ex novo in ciascuna generazione. Occorre perciò una<br />

nuova misura per riferirsi ai geni e non ai genotipi che sono trasmessi: il valore<br />

genetico me<strong>di</strong>o (VGM) che <strong>di</strong>pende sia dal valore genotipico (d,h) che dalla<br />

frequenza dei geni. Il VGM rappresenta l'effetto genetico me<strong>di</strong>o, cioè la<br />

superiorità (o l'inferiorità) me<strong>di</strong>a che un in<strong>di</strong>viduo è capace <strong>di</strong> trasmettere alla<br />

<strong>di</strong>scendenza; esso può essere definito, nell'ipotesi <strong>di</strong> accoppiamento casuale, come<br />

l'effetto me<strong>di</strong>o <strong>di</strong> un determinato gene (allele) cioè la deviazione me<strong>di</strong>a dalla me<strong>di</strong>a<br />

della popolazione (M) <strong>di</strong> in<strong>di</strong>vidui che ricevono quel gene da un genitore mentre<br />

l'altro deriva casualmente dalla popolazione.<br />

Esempio 3.3 Poniamo il caso degli alleli A e a. L'effetto me<strong>di</strong>o del gene A (dati gli<br />

effetti genotipici AA =d; Aa =h; aa =-d) è dato dalla probabilità che esso ha <strong>di</strong><br />

incontrare l'altro allele nella popolazione:<br />

A -><br />

p(A) = p(AA) = pd<br />

q(a) = q(Aa) = qh<br />

per cui pd + qh è il valore me<strong>di</strong>o dei genotipi prodotti; il valore me<strong>di</strong>o del gene è<br />

calcolato sottraendo la me<strong>di</strong>a della popolazione (d(p-q) + 2pqh) e ricordando che<br />

(1-p=q) per ottenere (lascio a voi il <strong>di</strong>vertimento) q[d+h(q-p)] che è detto a1; con<br />

lo stesso ragionamento si può calcolare l'effetto me<strong>di</strong>o per a ,a2 che risulta -<br />

p([d+h(q-p)].<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Se poniamo la <strong>di</strong>fferenza fra gli effetti me<strong>di</strong> <strong>di</strong> A e a, che rappresenta l'effetto<br />

statistico me<strong>di</strong>o <strong>di</strong> sostituzione <strong>di</strong> A ad a, a = a1 - a2 = d+h(q-p), gli effetti me<strong>di</strong><br />

possono essere calcolati come qa per A, e -pa per a.<br />

Se consideriamo i dati dell'esempio 3.3, il valore riproduttivo, già depurato della<br />

me<strong>di</strong>a della popolazione all'origine, è per <strong>di</strong>verse frequenze:<br />

p(A) q(a) a a1 a2<br />

0,1 0,9 2800 2520 -280<br />

0,5 0,5 2000 1000 -1000<br />

0,9 0,1 1200 120 -1080<br />

3.2.3 Il valore riproduttivo<br />

Come è noto i genitori trasmettono ai figli i geni e non i genotipi per cui il valore<br />

me<strong>di</strong>o dei loro geni è dato dalla me<strong>di</strong>a del valore genotipico della progenie. Il<br />

valore <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo, giu<strong>di</strong>cato in base al valore me<strong>di</strong>o della propria progenie, è<br />

detto valore riproduttivo (VR) o Bree<strong>di</strong>ng value (BV). Mentre l'effetto me<strong>di</strong>o <strong>di</strong> un<br />

gene è <strong>di</strong>fficilmente calcolabile, il VR <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo lo è sulla base del valore<br />

genotipico me<strong>di</strong>o della progenie (espresso in termini <strong>di</strong> deviazione dalla me<strong>di</strong>a della<br />

popolazione) se l'in<strong>di</strong>viduo è accoppiato casualmente. In questo caso il VR è il<br />

doppio del valore misurato nella progenie in quanto soltanto la metà dei geni<br />

dell'in<strong>di</strong>viduo (cioè della sua deviazione rispetto alla me<strong>di</strong>a della popolazione) sono<br />

stati trasmessi alla progenie ( la deviazione degli altri riproduttori con i quali il<br />

soggetto è stato accoppiato è uguale a zero, essendo stati estratti casualmente dalla<br />

popolazione).<br />

Il valore riproduttivo, relativo all'esempio del paragrafo precedente riguardante un<br />

carattere quantitativo controllato da un locus biallelico A e a, può essere stimato<br />

sulla base del doppio del valore me<strong>di</strong>o dei geni che possiede:<br />

Genotipo Valore riproduttivo<br />

AA 2α1 = 2qα<br />

Aa α1 + α2 =(q-p)α<br />

aa 2α2 =-2pα<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Esempio 3.4 Calcoliamo il VR <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo utilizzando i dati dell'esempio 3.3.<br />

q M AA Aa aa<br />

0,3 1220 960 -640 -2240<br />

0,6 80 2640 440 -1760<br />

0,9 -1420 5040 2240 -560<br />

Il VR è anche in<strong>di</strong>cato come valore genotipico ad<strong>di</strong>tivo (A), o più semplicemente<br />

valore ad<strong>di</strong>tivo, e rappresenta la porzione del genotipo che esprime il carattere in<br />

forma ad<strong>di</strong>tiva. Se un animale ha una progenie numerosa, i figli avranno un <strong>di</strong>verso<br />

VR in funzione dell'allele che hanno ricevuto dai genitori. Il valore me<strong>di</strong>o della<br />

progenie sarà perciò la semisomma del VR paterno (At) e <strong>di</strong> quello materno (Am) e<br />

sarà uguale al fenotipo me<strong>di</strong>o; in simboli:<br />

_ _<br />

[6] Pf = Af = 1/2(At + Am)<br />

3.2.4 La deviazione <strong>di</strong> dominanza<br />

Il valore riproduttivo è una parte del valore genotipico (G) <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo; la<br />

restante parte è la deviazione <strong>di</strong> dominanza, se esiste. Nel caso dei due alleli presi<br />

ad esempio in precedenza, la deviazione <strong>di</strong> dominanza deriva dal risultato che si<br />

ottiene quando i due alleli sono presi assieme: se questo è la me<strong>di</strong>a dei singoli<br />

effetti, non c'è deviazione <strong>di</strong> dominanza e pertanto il valore genetico ad<strong>di</strong>tivo A è<br />

uguale a quello complessivo G; altrimenti esiste una interazione fra gli alleli e G è<br />

<strong>di</strong>verso da A, per cui:<br />

[7] G = A + D<br />

cioè il valore genotipico <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduò è dato dalla somma del suo valore ad<strong>di</strong>tivo<br />

e della deviazione <strong>di</strong> dominanza (D).<br />

Esempio 3.5 Ripren<strong>di</strong>amo ora il valore genotipico dell'esempio 3.1 in cui AA =<br />

9000 kg, Aa = 8000 kg e aa = 5000 kg; in questo esempio l'eterozigote presentava<br />

un valore genotipico superiore alla me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> quelli dei due genotipi omozigoti, per<br />

cui la dominanza era stata in<strong>di</strong>cata con h=1000. Calcoliamo ora le tre quantità<br />

G, A e D nell'ipotesi <strong>di</strong> una frequenza <strong>di</strong> a q=0,3; la me<strong>di</strong>a della popolazione M,<br />

calcolata secondo la [4] è <strong>di</strong> kg 8220; il VR (valore ad<strong>di</strong>tivo) è già stato calcolato<br />

ed è riportato nella tabella dell'esempio 3.4 (si noti che la me<strong>di</strong>a. calcolata coma<br />

scostamento dal punto zero arbitrario 7000, è 1220 coincidente con gli attuali<br />

8220 kg):<br />

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AA Aa aa<br />

frequenza 0,49 0,42 0,09<br />

G 780 -220 -3220<br />

A 960 -640 -2240<br />

D -180 420 -980<br />

Anche la deviazione <strong>di</strong> dominanza, perciò , <strong>di</strong>pende dalla frequenza: la sua stima<br />

può essere effettuata <strong>di</strong>rettamente in base al valore <strong>di</strong> h secondo le relazioni<br />

AA Aa aa<br />

frequenze p 2 2pq q 2<br />

valori assegnati d h -d<br />

Deviazione <strong>di</strong> dominanza -2q 2h 2pqh -2p 2h<br />

3.2.5 Deviazione <strong>di</strong> interazione<br />

Quando pren<strong>di</strong>amo in esame un singolo locus, il valore genotipico è formato<br />

soltanto dal valore ad<strong>di</strong>tivo (A) e dalla deviazione <strong>di</strong> dominanza (D). Qualora,<br />

invece, si prendano in esame più loci, il valore genotipico può contenere una<br />

deviazione ad<strong>di</strong>zionale imputabile alla combinazione non ad<strong>di</strong>tiva dei geni<br />

(epistasi). Se G A è il valore genotipico imputabile ad un locus e G B quello <strong>di</strong> un<br />

secondo locus, il valore genotipico imputabile ad entrambi è:<br />

[7] G = G A +G B + I AB<br />

I loci possono essere più <strong>di</strong> due ed interagire fra loro in maniera complessa. Tutte le<br />

deviazioni dovute all'interazione fra loci sono cumulate nella frazione I, per cui il<br />

valore genotipico <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo <strong>di</strong>venta:<br />

[8] G = A + D + I<br />

Esempio 3.6 Se il valore ad<strong>di</strong>tivo, espresso sempre come deviazione dalla me<strong>di</strong>a<br />

della popolazione, <strong>di</strong> G A è <strong>di</strong> 416 e quello <strong>di</strong> G B è <strong>di</strong> - 57,35, con un valore<br />

complessivo <strong>di</strong> G = 392,3, la deviazione <strong>di</strong> interazione I è uguale a 33,65.<br />

Anche la deviazione <strong>di</strong> interazione è, in me<strong>di</strong>a, uguale a zero per cui si conferma<br />

che il fenotipo me<strong>di</strong>o è uguale al genotipo me<strong>di</strong>o; essa non è solo una proprietà dei<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

genotipi che interagiscono, ma <strong>di</strong>pende dalle frequenze geniche nella popolazione.<br />

Essendo però la sua stima a partire dalle frequenze molto complessa, è preferibile<br />

calcolarla come <strong>di</strong>fferenza fra G, A e D.<br />

3.3 La variabilità <strong>di</strong> un carattere quantitativo.<br />

Come accennato nel primo paragrafo <strong>di</strong> questo capitolo, le deviazioni fenotipiche<br />

dalla me<strong>di</strong>a della popolazione p possono essere ripartite nelle loro componenti<br />

genetica g ed ambientale e; il loro stu<strong>di</strong>o è possibile con l'ausilio dello strumento<br />

dell'analisi della varianza per cui la varianza fenotipica totale (Vp) può essere<br />

scomposta nella varianza genetica (Vg) ed in quella ambientale (Ve), secondo la<br />

relazione:<br />

[9] Vp = Vg + Ve<br />

Poiché le deviazioni genotipiche possono essere a loro volta scomposte in<br />

deviazioni genotipiche ad<strong>di</strong>tive (a), deviazioni genotipiche <strong>di</strong> dominanza (d) e<br />

deviazioni genotipiche <strong>di</strong> interazione genetica (i) per ciascuna <strong>delle</strong> quali può essere<br />

calcolata la relativa varianza, la varianza fenotipica (Vp) può essere scomposta in 4<br />

componenti:<br />

[10] Vp = Va + Vd + Vi + Ve<br />

Questa relazione assume che non sussista interazione fra genotipo ed ambiente; in<br />

caso contrario alla [9] andrebbe sommata la quantità 2COV(g/e), dove COV =<br />

covarianza. Interazione genotipo/ambiente significa che l’espressione genotipica <strong>di</strong><br />

un carattere quantitativo non è in<strong>di</strong>fferente rispetto all’ambiente <strong>di</strong> allevamento. In<br />

altre parole, l’affetto del genotipo e dell’ambiente su quel carattere non è<br />

esclusivamente <strong>di</strong> tipo ad<strong>di</strong>tivo. Questo fenomeno, nella terminologia zootecnica del<br />

passato, è stato chiamato "norma <strong>di</strong> reazione". Poiché, però, l'interazione <strong>di</strong>pende<br />

dall'ambiente in cui l'animale è allevato, i suoi effetti possono essere ricompresi in<br />

quelli dell'ambiente, per cui la quantità 2COV(g/e) è posta uguale a zero.<br />

Similmente l'interazione genetica (epistasi) è ricompresa nelle deviazioni genetiche<br />

non ad<strong>di</strong>tive in<strong>di</strong>cate, per como<strong>di</strong>tà, come deviazioni <strong>di</strong> dominanza per cui Vi =0.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

3.3.1 La scomposizione della varianza fenotipica<br />

La ripartizione della varianza nei suoi componenti ci aiuta a capire l'importanza<br />

relativa sull'espressione fenotipica del genotipo e dell'ambiente. Essa può essere<br />

effettuata più semplicemente se si parte dalla considerazione che la quota della<br />

variabilità comune che si osserva fra animali parenti è sicuramente <strong>di</strong> origine<br />

genetica: la sua determinazione è perciò possibile con le tecniche della correlazione<br />

e della regressione.<br />

In zootecnica è importante la determinazione della varianza ad<strong>di</strong>tiva V(A) <strong>di</strong> un<br />

determinato carattere in quanto se essa è bassa nella popolazione, le <strong>di</strong>fferenze che<br />

si osservano fra gli in<strong>di</strong>vidui che la costituiscono non saranno trasmesse alla<br />

progenie: il miglioramento <strong>di</strong> questo carattere ottenibile con l’azione <strong>di</strong> selezione in<br />

questa popolazione sarà allora molto lento. Al contrario un carattere con una V(A)<br />

elevata sarà generalmente suscettibile <strong>di</strong> un miglioramento rapido.<br />

Per calcolare la varianza ad<strong>di</strong>tiva occorre, innanzitutto, basarsi sulla rassomiglianza<br />

fra le produzioni <strong>di</strong> animali parenti, cioè sulla covarianza <strong>di</strong> un numero elevato <strong>di</strong><br />

osservazioni. Supponiamo <strong>di</strong> avere un certo numero <strong>di</strong> coppie <strong>di</strong> osservazioni<br />

fenotipiche P e P' e che ciascuna coppia sia costituita da animali che abbiano lo<br />

stesso grado <strong>di</strong> parentela (padre/figlio, mezze sorelle, ecc.); avremo che:<br />

[11] COV (PP') = COV (A+d+e, A'+d'+e')<br />

dove A, d e e sono rispettivamente il valore genetico ad<strong>di</strong>tivo, le deviazioni<br />

genetiche <strong>di</strong> dominanza e le deviazioni ambientali.<br />

Se sviluppiamo l'equazione [11], ricordando che COV (xx) = V(x) e supponendo<br />

COV (ee') = 0 (in quanto fattori casuali derivanti dall’ipotesi che gli effetti<br />

ambientali siano in<strong>di</strong>pendenti), otteniamo:<br />

[12] COV (PP') = COV(AA’) + COV (dd’) + COV (ee’) = V(A) + V(d)<br />

Se consideriamo coppie <strong>di</strong> dati appartenenti a un genitore e ad un figlio (ad esempio<br />

la produzione <strong>di</strong> latte <strong>di</strong> una pecora e <strong>di</strong> una sua figlia), e se l'altro genitore è stato<br />

scelto a caso dalla popolazione (per cui in me<strong>di</strong>a la sua deviazione genetica è nulla)<br />

la [12] <strong>di</strong>venta:<br />

[13] COV (PP') = 1/2 V(A)<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

in quanto il genitore trasmette solo la metà del suo valore ad<strong>di</strong>tivo ai figli e, come<br />

visto in precedenza, non trasmette la frazione <strong>di</strong> dominanza (V(d) =0). In generale<br />

possiamo <strong>di</strong>re, allora, che la covarianza fra coppie <strong>di</strong> fenotipi che hanno la stessa<br />

parentela fra loro, è uguale alla varianza genetica ad<strong>di</strong>tiva ridotta del coefficiente <strong>di</strong><br />

parentela (ve<strong>di</strong> capitolo 10):<br />

[14] COV (PxPy) = RyxV(A)<br />

Con tale relazione siamo ora in grado <strong>di</strong> stimare la varianza ad<strong>di</strong>tiva, cioè quella<br />

parte della varianza fenotipica che più ci interessa.. Nel caso della relazione [13]<br />

una stima della varianza ad<strong>di</strong>tiva (attenzione, si tratta <strong>di</strong> una stima in quanto è<br />

effettuata su un campione della popolazione) calcolata su coppie madri/figlie, è la<br />

seguente:<br />

V(A) = 2COV (PP')<br />

Esempio 3.7 Consideriamo un campione casuale costituito dalla lattazione<br />

completa <strong>di</strong> 10 coppie <strong>di</strong> madri/figlie estratto dalla popolazione <strong>di</strong> pecore <strong>di</strong> razza<br />

Sarda<br />

Madri Figlie<br />

1 178 165<br />

2 190 201<br />

3 143 165<br />

4 159 155<br />

5 180 171<br />

6 176 199<br />

7 150 144<br />

8 192 198<br />

9 165 173<br />

10 172 155<br />

Calcoliamo ora la covarianza (Σxy - ΣxΣy/n)/(n-1) che è uguale a 237,4 kg 2<br />

;<br />

poiché Ryx = 1/2, una stima della varianza genetica ad<strong>di</strong>tiva è = 2x237,4 = 474,8.<br />

3.3.2 La scomposizione della varianza ambientale<br />

La variabilità ambientale può essere a sua volta ripartita in almeno 3 componenti: a)<br />

quella agente permanentemente sull'animale in tutti i suoi cicli produttivi; b) quella<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

agente sull'animale per un solo ciclo produttivo; c) quella agente su tutti gli animali<br />

in maniera sistematica.<br />

Definiamo innanzitutto cosa inten<strong>di</strong>amo per ciclo produttivo e con quali criteri gli<br />

animali possono essere considerati appartenenti allo stesso ciclo produttivo.<br />

I cicli produttivi possono essere contemporanei o sincroni oppure possono avere<br />

inizio e durata <strong>di</strong>versi.<br />

I cicli produttivi sincroni sono tipici degli allevamenti la cui produzione è funzione<br />

<strong>di</strong> fattori ambientali: è questo il caso degli allevamenti bra<strong>di</strong> e semi-bra<strong>di</strong> <strong>delle</strong><br />

regioni me<strong>di</strong>terranee, in cui il parto degli animali avviene nel periodo invernale in<br />

modo da poter <strong>di</strong>sporre, durante la lattazione, <strong>di</strong> risorse foraggiere <strong>di</strong> buona qualità .<br />

In questo caso, evidentemente, non ci si pone il problema della contemporaneità dei<br />

cicli produttivi. Invece negli allevamenti bovini da latte la situazione è <strong>di</strong> norma<br />

<strong>di</strong>versa: per mantenere più costante possibile la produzione <strong>di</strong> latte aziendale, si<br />

tende a far partorire le bovine durante tutto l'arco dell'anno. In questo caso i cicli<br />

produttivi tendono ad essere sfalsati e si rende necessario definire i limiti temporali<br />

che consentono <strong>di</strong> attribuire più animali a cicli produttivi contemporanei. E' questo<br />

un aspetto <strong>di</strong> fondamentale importanza in quanto il calcolo del valore riproduttivo<br />

(VR) <strong>di</strong> un animale richiede il confronto del suo valore fenotipico (o <strong>di</strong> quello dei<br />

parenti) con quello <strong>di</strong> altri animali che abbiano prodotto in un ambiente il più<br />

possibile omogeneo.<br />

In realtà, nella scelta dell'intervallo <strong>di</strong> tempo è necessario tenere conto della<br />

grandezza dell'allevamento e <strong>delle</strong> variazioni ambientali stagionali: grosse<br />

<strong>di</strong>mensioni e variazioni repentine consigliano intervalli <strong>di</strong> tempo limitati. Nel caso<br />

dei bovini può essere valido adottare intervalli fissi <strong>di</strong> 12 mesi (sono considerati<br />

contemporanei tutti gli animali che hanno partorito in un anno solare) o intervalli<br />

mobili sempre <strong>di</strong> 12 mesi (sono considerati contemporanei gli animali che hanno<br />

partorito 6 mesi prima e 6 mesi dopo la vacca considerata); è opportuno, comunque,<br />

che gli intervalli non siano superiori all'interparto tipico della specie (12 mesi per i<br />

bovini e per le pecore a parto annuale; 6 mesi per i suini).<br />

Per quanto riguarda le deviazioni ambientali permanenti, queste possono essere<br />

misurate se si prendono in considerazione misure fenotipiche ripetute sul singolo<br />

animale. Le misure possono essere ripetute nel tempo e nello spazio: il primo caso è<br />

quello tipico della produzione <strong>di</strong> latte in cui le misure possono essere ottenute in<br />

lattazioni successive; il secondo caso è più comune nelle piante, in cui possono<br />

essere misurate le caratteristiche morfologiche <strong>di</strong> molti frutti per ciascuna pianta, ma<br />

possono essere riferite a <strong>di</strong>verse parti dell'animale, come ad esempio la misurazione<br />

<strong>delle</strong> caratteristiche della lana prelevata da <strong>di</strong>fferenti parti del corpo. Le misure<br />

ripetute sullo stesso in<strong>di</strong>viduo <strong>di</strong> norma sono variabili e la relativa varianza è <strong>di</strong><br />

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____________________________________________________________________________________<br />

origine esclusivamente ambientale, causata in particolare da <strong>di</strong>fferenze temporanee<br />

dell'ambiente che ha agito fra performances successive (deviazioni ambientali<br />

temporanee). Se si considera un set <strong>di</strong> dati comprendente più misure ripetute su<br />

più in<strong>di</strong>vidui (ad esempio 3 lattazioni <strong>di</strong> 7 pecore) e si ripartisce la varianza<br />

fenotipica totale (Vp) nella quota fra pecore ed entro pecore, la prima misura le<br />

<strong>di</strong>fferenze fra in<strong>di</strong>vidui dovute a cause genetiche ed ambientali, mentre la seconda<br />

misura soltanto variazioni ambientali temporanee. La variabilità fenotipica può<br />

allora essere scomposta in variabilità genetica (Vg), in variabilità dell'ambiente che<br />

agisce in permanenza sull'animale (Vep) ed in variabilità dell'ambiente che ha agito<br />

temporaneamente sull'animale (Vet):<br />

[15] Vp = Vg + Vep + Vet<br />

Se consideriamo "coppie <strong>di</strong> misure ripetute" (ad esempio la 2a e la 3a lattazione<br />

<strong>delle</strong> nostre pecore) , il coefficiente <strong>di</strong> correlazione r calcolato su <strong>di</strong> queste sarebbe<br />

uguale ad 1 se gli animali non fossero influenzati da con<strong>di</strong>zioni ambientali che<br />

agiscono nei <strong>di</strong>versi cicli produttivi: r rappresenta, pertanto, la quota della<br />

variabilità che è comune per le due misurazioni ed è chiamato ripetibilità (ve<strong>di</strong><br />

anche il capitolo 4):<br />

[16] r = [Vg + Vep]/V(P)<br />

In altri termini la ripetibilità misura la fiducia che può essere posta nelle<br />

performances successive <strong>di</strong> un animale, conosciuta una misurazione fenotipica.<br />

Esempio 3.8 Consideriamo produzione complessiva <strong>di</strong> latte (non corretta,<br />

vedremo dopo cosa significa) <strong>di</strong> 7 madri (A...G) <strong>di</strong> arieti <strong>di</strong> razza Sarda (dati<br />

ricavati dal registro Saccai 1996)<br />

Lattazione A B C D E F G<br />

3 232 332 243 345 171 271 314<br />

4 242 356 210 351 233 236 270<br />

5 361 365 269 401 197 237 293<br />

L'analisi della varianza, condotta in questo caso particolare con procedura REML<br />

(la REML è una procedura <strong>di</strong> analisi della varianza attualmente <strong>di</strong>sponibile nei più<br />

<strong>di</strong>ffusi pacchetti statistici per computer; l’acronimo sta per Estimated Maximum<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Likelyhood che significa Stima <strong>di</strong> Massima Verosimiglianza Ristretta. Prendete<br />

questo come un atto <strong>di</strong> fede; per gli scettici consiglio <strong>di</strong> controllare le procedure<br />

da Draper e Smith) per la stima <strong>delle</strong> sue componenti, ha dato i seguenti risultati:<br />

FONTE G.<strong>di</strong>L. SS MS E(MS)<br />

tra pecore 6 70194 11699 3460<br />

entro pecore 14 19690 1406 1318<br />

totale 20 89884 4778<br />

In questo riquadro <strong>di</strong> analisi della varianza SS è la somma dei quadrati (Sum of<br />

Squares) e E(MS) è la varianza stimata con la procedura REML.<br />

L'incidenza della variabilità fra pecore (cioè la quota genetica più varianza<br />

ambientale permanente) è del 72,4% ; la ripetibilità, calcolata invece come<br />

correlazione fra coppie <strong>di</strong> misure, ha dato i seguenti risultati:<br />

r (3a-4a) = 0,772<br />

r (4a-5a) = 0,714<br />

r (3a-5a) = 0,710<br />

che in me<strong>di</strong>a è 0,734, molto vicino al valore trovato con l'analisi della varianza.<br />

Come evidenziato dall'esempio, la ripetibilità varia leggermente in funzione del<br />

metodo impiegato per la sua stima in quanto una parte non controllabile della Vep<br />

viene inclusa nel calcolo.<br />

I valori della ripetibilità per i principali caratteri <strong>di</strong> interesse zootecnico sono<br />

riportati nella tabella seguente (da Grasselli).<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Bovini da carne<br />

- peso alla nascita 0,20-0,30<br />

- peso a 3 mesi 0,40<br />

- peso allo svezzamento 0,30-0,55<br />

- peso a 1 anno 0,25<br />

Ovini<br />

- tasso <strong>di</strong> ovulazione 0,60-0,80<br />

- nati per parto 0,30-0,40<br />

- produzione <strong>di</strong> latte 0,50<br />

Suini<br />

- suinetti per parto 0,07-0,20<br />

- suinetti svezzati 0,09-0,10<br />

- peso alla nascita 0,18-0,24<br />

- durata dell'estro 0,34<br />

Bovini da latte<br />

- latte 305 gg (EVM) 0,40-0,60<br />

- grasso 305 gg (EVM) 0,40-0,50<br />

- grasso % 0,45-0,70<br />

- velocità <strong>di</strong> mungitura 0,80<br />

- interparto 0,10-0,20<br />

- fecondazioni per concepimento 0,05-0,13<br />

La ripetibilità ci consente <strong>di</strong> stimare la componente ambientale temporanea che può<br />

essere espressa, in termini percentuali, come complemento ad 1 <strong>di</strong> r secondo la<br />

relazione:<br />

[17] 1 - r = Vet/V(P)<br />

Un aspetto pratico relativo alla ripetibilità è che la sua conoscenza ci in<strong>di</strong>ca il<br />

guadagno in accuratezza ottenibile con misurazioni multiple. Se la ripetibilità è<br />

alta, il guadagno atteso è basso; viceversa con ripetibilità bassa mi aspetto una<br />

altrettanto alta influenza dell'ambiente temporaneo sulle performaces future<br />

dell'animale per cui il guadagno in accuratezza che ottengo con misure multiple è<br />

elevato. Ma come il guadagno in accuratezza è legato alla ripetibilità? Supponiamo<br />

<strong>di</strong> considerare la me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> n misure ripetute su un animale; la varianza dei fenotipi<br />

me<strong>di</strong> così calcolati V(Pn) sarà composta dalla Vg, dalla Vep e da 1/n Vet, cioè la<br />

varianza totale sarà ridotta (per effetto <strong>delle</strong> misure ripetute) dell'entità <strong>delle</strong> misure<br />

ripetute secondo la relazione:<br />

[18] V(Pn) = Vg + Vep + [1/n]Vet<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Nel caso <strong>di</strong> una sola misurazione, la [18] è uguale alla [15], ma con l'aumento <strong>delle</strong><br />

misurazioni la varianza dell'ambiente temporaneo si riduce, fino a <strong>di</strong>ventare molto<br />

piccola nel caso (teorico) <strong>di</strong> un altissimo numero <strong>di</strong> misure ripetute. Se consideriamo<br />

le equazioni [16] e [17], moltiplichiamo e <strong>di</strong>vi<strong>di</strong>amo ciascun membro a destra<br />

dell’equazione per V(P) e successivamente sostituiamo i valori nella [18],<br />

otteniamo:<br />

V(Pn) = {[Vg + Vep]/V(P) + Vet/[nV(P)] } V(P) ;<br />

V(Pn) = {r + (1-r)/n}V(P);<br />

[19] V(Pn)/V(P) = {1 + r[n-1]}/n<br />

che rappresenta il guadagno in accuratezza ottenibile in base alla ripetibilità ed al<br />

numero <strong>di</strong> misurazioni ripetute. Il grafico seguente riporta il guadagno in<br />

accuratezza ottenibile con misure ripetute per <strong>di</strong>fferenti livelli <strong>di</strong> ripetibilità.<br />

accuratezza<br />

0,9<br />

0,8<br />

0,7<br />

0,6<br />

0,5<br />

0,4<br />

0,3<br />

0,2<br />

0,1<br />

0<br />

Guadagno in accuratezza in funzione <strong>di</strong> r<br />

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10<br />

misure<br />

Nei programmi <strong>di</strong> miglioramento genetico degli animali zootecnici, l'impiego<br />

dell'accuratezza è utile per ridurre la variabilità temporanea ed aumentare, cioè, la<br />

quota <strong>di</strong> varianza spiegata dal genotipo. Come vedremo in seguito (paragrafo 4.4),<br />

l'uso <strong>di</strong> r consente <strong>di</strong> migliorare la stima dell’ere<strong>di</strong>tabilità, cioè della quota della<br />

variabilità fenotipica che è trasmessa alla <strong>di</strong>scendenza.<br />

42<br />

0,1<br />

0,5<br />

0,75<br />

0,25


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3.3.3 La varianza ambientale sistematica<br />

Come accennato nel paragrafo precedente, le deviazioni ambientali possono essere<br />

casuali (con <strong>di</strong>stribuzione normale e me<strong>di</strong>a zero) oppure sistematiche (con me<strong>di</strong>a<br />

nota). Queste ultime possono essere stimate caso per caso ed i dati fenotipici<br />

possono essere "ripuliti" dal loro effetto.<br />

Nel caso della vacca da latte, le principali deviazioni sistematiche sono: a) l'età al<br />

parto; b) la stagione <strong>di</strong> parto; c) i giorni <strong>di</strong> asciutta; d) l'intervallo parto<br />

concepimento; e) la durata della lattazione; f) il numero <strong>di</strong> mungiture.<br />

La produzione <strong>di</strong> latte cresce al crescere dell'or<strong>di</strong>ne <strong>di</strong> parto (primipare,<br />

secon<strong>di</strong>pare, terzipare, ecc..) fino ad arrivare al massimo in bovine <strong>di</strong> 5 anni <strong>di</strong> età<br />

che è ritenuta l'età <strong>di</strong> riferimento (età adulta).<br />

La produzione è maggiore per le bovine che partoriscono a fine inverno e che<br />

incontrano la primavera nella fase iniziale della curva <strong>di</strong> lattazione in quanto, nella<br />

bella stagione, si ha un effetto sinergico positivo del clima e del fotoperiodo che si<br />

ripercuotono sul quadro ormonale e su quello comportamentale degli animali.<br />

I giorni <strong>di</strong> asciutta influenzano positivamente la produzione, fino al 60° giorno al <strong>di</strong><br />

là del quale non si hanno miglioramenti: ciò è dovuto alla necessità della mammella<br />

<strong>di</strong> ricostituire il tessuto secretivo da una lattazione alla successiva ed alle esigenze<br />

della vacca <strong>di</strong> orientare il metabolismo <strong>di</strong> fine gestazione verso la nutrizione del<br />

feto.<br />

L'intervallo parto-concepimento influenza la produzione nel senso che se è<br />

eccessivamente breve questa è depressa.<br />

La durata della lattazione standard nella vacca da latte è fissata in 305 giorni (nella<br />

pecora in 210 giorni) ; lattazioni <strong>di</strong> durata superiore sono troncate al 305° giorno,<br />

mentre quelle <strong>di</strong> durata inferiore (ma che raggiungono il minimo in<strong>di</strong>cato dalle<br />

associazioni degli allevatori) sono "proiettate" fino al 305° giorno.<br />

Il numero <strong>di</strong> mungiture, infine, influenza la produzione in quanto l'introduzione <strong>di</strong><br />

una terza mungitura provoca incrementi <strong>di</strong> circa il 20% e quella <strong>di</strong> una quarta<br />

ulteriori incrementi del 10% (negli ovini non è stato osservato, con gli attuali livelli<br />

produttivi, nessun miglioramento rispetto alle due mungiture). La riduzione <strong>delle</strong><br />

mungiture giornaliere da 2 ad 1, invece, limita la produzione nelle due specie.<br />

Conosciuta l'entità <strong>delle</strong> deviazioni ambientali sistematiche per la specie e la razza<br />

che ci interessano, il confronto fra i fenotipi degli animali è possibile solo se questi<br />

sono corretti per mezzo <strong>di</strong> coefficienti che tengano conto dei principali fattori che<br />

agiscono sul carattere considerato. Nel caso della vacca da latte, le produzioni sono<br />

aggiustate e riferite all'animale adulto (EVM = equivalente vacca adulta; M =<br />

matura, cattiva traduzione dell'inglese mature = adulto), al parto invernale<br />

(convenzionalmente in gennaio), alla durata convenzionale <strong>di</strong> lattazione <strong>di</strong> 305<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

giorni ed a 2 mungiture giornaliere. I relativi coefficienti sono calcolati dalle<br />

associazioni <strong>di</strong> razza ed inseriti nella stima dei fenotipi corretti.<br />

Le correzioni per gli effetti sistematici sono attualmente in fase <strong>di</strong> profonda critica<br />

da parte del mondo scientifico e si va sempre più imponendo l’idea che sia il caso <strong>di</strong><br />

considerare il fenotipo non corretto sotto forma <strong>di</strong> singolo rilievo (test day). La<br />

produzione <strong>di</strong> latte <strong>di</strong> una vacca risulta in tal modo rappresentato dall’insieme <strong>delle</strong><br />

informazioni <strong>di</strong>sponibili e non su una produzione totale stimata sui pochi dati a<br />

<strong>di</strong>sposizione (controlli funzionali).<br />

Questo problema dei controlli giornalieri e dell’attribuzione della loro variabilità è<br />

<strong>di</strong>ventato particolarmente attuale con la <strong>di</strong>ffusione degli strumenti <strong>di</strong> misurazione<br />

automatica <strong>delle</strong> produzioni (flussometri montati nelle macchine <strong>di</strong> mungitura) e con<br />

l’archiviazione <strong>di</strong> questa imponente mole <strong>di</strong> dati nell’elaboratore centrale<br />

dell’azienda.<br />

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4. L'EREDITABILITA'<br />

L'ere<strong>di</strong>tabilità è una <strong>delle</strong> principali proprietà <strong>di</strong> un carattere metrico in quanto<br />

esprime il grado <strong>di</strong> rassomiglianza fra parenti sulla base della proporzione della<br />

varianza fenotipica totale attribuibile al genotipo. Essa è specifica <strong>di</strong> una<br />

determinata popolazione e per un determinato carattere ed il suo coefficiente ha due<br />

impieghi specifici nel miglioramento genetico: quello relativo alla stima del valore<br />

genetico ad<strong>di</strong>tivo (a espresso in termini <strong>di</strong> deviazione genetica dalla me<strong>di</strong>a della<br />

popolazione) dei riproduttori ai fini della selezione (scelta) e quello della previsione,<br />

sulla base della strategia <strong>di</strong> miglioramento adottata, del progresso genetico atteso<br />

nella popolazione.<br />

4.1 Il concetto <strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tabilità<br />

Per capire il concetto <strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tabilità dobbiamo fare mente locale su alcuni aspetti<br />

generali legati alla genetica quantitativa e seguire alcuni passaggi:<br />

1) il valore genetico <strong>di</strong> un animale per un determinato carattere quantitativo è<br />

inconoscibile <strong>di</strong>rettamente a partire dal fenotipo;<br />

2) possiamo stimare il VG a partire dalla popolazione a cui l’animale appartiene<br />

(popolazione <strong>di</strong> riferimento), ma per fare ciò dobbiamo conoscere quale è la<br />

relazione che lega il fenotipo (conosciuto) con il genotipo (sconosciuto);<br />

3) dobbiamo pertanto stu<strong>di</strong>are questa relazione nella popolazione <strong>di</strong> riferimento e<br />

per fare ciò impieghiamo la tecnica dell’analisi della regressione.<br />

Una breve <strong>di</strong>gressione è obbligatoria!<br />

La possibilità <strong>di</strong> stimare una quantità sconosciuta in base ad una conosciuta (ad<br />

esempio il peso sconosciuto <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo in base alla sua altezza), riposa sulla<br />

esistenza sia <strong>di</strong> una relazione fra le variabili che ci interessano, sia sulla <strong>di</strong>pendenza<br />

della prima (che normalmente chiamiamo y) dalla seconda(che normalmente<br />

chimiamo x o variabile in<strong>di</strong>pendente). La relazione che lega le due variabili deve,<br />

però, essere nota e per questo occorre effettuare una serie <strong>di</strong> misure <strong>delle</strong> due<br />

variabili che mi interessano (ad esempio <strong>di</strong> peso e <strong>di</strong> altezza) in un campione<br />

rappresentativo della popolazione target. Una volta rilevati, i dati sono collocati su<br />

un piano cartesiano e con la tecnica della regressione è calcolata la relazione<br />

matematica che li lega che, nel caso della regressione lineare, è rappresentata dal<br />

coefficiente angolare della retta.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

ECCO! L’ere<strong>di</strong>tabilità <strong>di</strong> un carattere altro non è che questa relazione che connette<br />

valori conosciuti (i fenotipi) con valori sconosciuti (i genotipi) <strong>di</strong> in<strong>di</strong>vidui della<br />

popolazione.<br />

Ammettiamo <strong>di</strong> possedere, per un determinato carattere quantitativo, le coppie <strong>di</strong><br />

dati del VG e del fenotipo <strong>di</strong> un campione <strong>di</strong> in<strong>di</strong>vidui rappresentativo <strong>di</strong> una certa<br />

popolazione (le tecniche che si impiegano per questa stima sono riportate più<br />

avanti). Queste coppie <strong>di</strong> dati sono espresse come deviazioni fenotipiche p e<br />

genotipiche a dalla me<strong>di</strong>a della popolazione. Se esiste un legame fra le variabili<br />

(cioè se la correlazione fra loro è significativamente <strong>di</strong>versa da zero) significa che<br />

l’espressione fenotipica <strong>di</strong>pende dal genotipo e la pendenza della retta <strong>di</strong><br />

regressione (il coefficiente angolare) mi in<strong>di</strong>ca in quale quantità tale relazione è<br />

espressa. La retta che interpola i dati passa, ovviamente, per l’origine in quanto il<br />

genotipo me<strong>di</strong>o è uguale al fenotipo me<strong>di</strong>o. Calcolo così la regressione ricordando<br />

che il coefficiente angolare <strong>di</strong> una retta (b) è stimato dalla relazione:<br />

[1] b = COV(y,x)/V(x) = COV (a,p)/V(p)<br />

Sappiamo anche che p = a + e, per cui COV(a, a+e) = V(a) + COV(a, e). Ma<br />

abbiamo pregiu<strong>di</strong>zialmente posto che l’interazione fra genotipo e ambiente è uguale<br />

a zero, per cui COV(a, e) = 0 e la formula è ridotta alla:<br />

[2] b = V(a)/V(p)<br />

che è la formula canonica dell’ere<strong>di</strong>tabilità. In altre parole, possiamo esprimere<br />

l'ere<strong>di</strong>tabilità come un rapporto fra varianze e fornire la definizione:<br />

l'ere<strong>di</strong>tabilità <strong>di</strong> un carattere (h 2) rappresenta la proporzione della varianza <strong>delle</strong><br />

produzioni che è <strong>di</strong> natura genetica ad<strong>di</strong>tiva e stima l’incremento (o il decremento)<br />

me<strong>di</strong>o del valore genotipico <strong>di</strong> u determinato carattere al variare <strong>di</strong> una unità del<br />

velore fenotipico.<br />

L'ere<strong>di</strong>tabilità è compresa fra 0 ed 1. Il valore limite 1 corrisponde ad esempio ad un<br />

carattere per il quale tutte le variazioni osservate tra i fenotipi dei genitori sono<br />

interamente trasmissibili alla progenie. In realtà l' h 2 è raramente superiore a 0,7 e,<br />

normalmente, è considerata bassa se inferiore a 0,2, me<strong>di</strong>a se compresa fra 0,2 e 0,4<br />

ed alta se superiore a 0,4.<br />

I coefficienti <strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tabilità per alcuni caratteri <strong>di</strong> interesse zootecnico sono riportati<br />

<strong>di</strong> seguito (da Grasselli e Rossi).<br />

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Specie e carattere h 2<br />

Bovini da carne<br />

- peso alla nascita 0,20-0,30<br />

- peso a 3 mesi 0,30<br />

- peso allo svezzamento 0,20-0,50<br />

Suini<br />

- numero suinetti per parto 0,15<br />

- suinetti svezzati 0,07<br />

- spessore lardo dorsale 0,45-0,75<br />

- in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> conversione alimentare 0,20-0,50<br />

- resa alla macellazione 0,25-0,40<br />

Ovini<br />

- numero agnelli per parto 0-0,20<br />

- peso alla nascita 0,10-0,30<br />

- peso allo svezzamento 0,10-0,30<br />

- peso vello 0,30-0,40<br />

Bovini da latte<br />

- produzione (EVM-305-2x) 0,25-0,40<br />

- grasso % 0,45-0,60<br />

- proteine % 0,50<br />

- velocità <strong>di</strong> mungitura 0,20-0,35<br />

- interparto 0-0,15<br />

- classificazione morfologica 0,20-0,30<br />

Quale è l’accuratezza <strong>di</strong> questa stima?<br />

L’entità del legame fra le due variabili (a e p) può essere espresso me<strong>di</strong>ante il<br />

coefficiente <strong>di</strong> correlazione (r) che, come ricorderete, è calcolato dalla formula:<br />

[3] r = COV(a, p)/(σa σp)<br />

dove σ ind<strong>di</strong>ca la deviazione standard (la ra<strong>di</strong>ce quadrata della varianza).<br />

Se il valore <strong>di</strong> r è molto alto (vicino all’unità) l’accuratezza della stima <strong>di</strong> a e<br />

partire da p è molto buona; viceversa se r è basso, questa stima è scadente.<br />

Se sviluppo la [3], ricordando che COV(a,p) = V(a), ottengo che:<br />

[4] r = V(a)/ (σa σp) = σa/σp = h<br />

per cui l’accuratezza è la ra<strong>di</strong>ce quadrata dell’ere<strong>di</strong>tabilità.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Esempio 4.1 Consideriamo una popolazione <strong>di</strong> vacche <strong>di</strong> razza Frisona Italiana<br />

della quale siano state stimate le seguenti statistiche:<br />

fenotipo me<strong>di</strong>o = kg 7890; deviazione standard fenotipica (σP) = kg 1200;<br />

deviazione standard genotipica ( σA) = kg 600. Le relative varianze risultano <strong>di</strong><br />

kg 2 1440000 per il fenotipo e kg 2 360000 per il genotipo. L'ere<strong>di</strong>tabilità è allora<br />

pari a 360000/1440000 = 0,25 o il 25%.<br />

L'ere<strong>di</strong>tabilità , intesa come regressione fra deviazione del valore riproduttivo e<br />

deviazione fenotipica, ci consente <strong>di</strong> stimare (statisticamente) il VR <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo<br />

E(VR), dove E = expected value (valore atteso), con la relazione:<br />

[5] E(VR) = h2 P (oppure b(a,p)P)<br />

in cui la ere<strong>di</strong>tabilità (espressa sia come rapporto d<strong>di</strong> varianze che come coefficiente<br />

<strong>di</strong> regressione) rappresenta la "fiducia" che possiamo attribuire al fenotipo come<br />

guida all’in<strong>di</strong>viduazione del valore genetico dell'in<strong>di</strong>viduo. Questa relazione, per<br />

quanto semplice, rappresenta una <strong>delle</strong> formule più importanti della genetica<br />

quantitativa perché mette in relazione il conoscibile (il fenotipo) con l'inconoscibile<br />

(il genotipo) attraverso una relazione (l'ere<strong>di</strong>tabilità) il cui valore è legato al<br />

carattere considerato ed alla popolazione <strong>di</strong> origine dell'in<strong>di</strong>viduo esaminato.<br />

L'ere<strong>di</strong>tabilità non è una proprietà intrinseca del carattere quantitativo, ma <strong>di</strong>pende<br />

dalla popolazione, dalle con<strong>di</strong>zioni ambientali in cui gli in<strong>di</strong>vidui sono stati allevati<br />

e dalle modalità con cui i fenotipi sono stati rilevati. La popolazione infatti influenza<br />

la frequenza genica da cui <strong>di</strong>pende la me<strong>di</strong>a e la varianza genetica del carattere; la<br />

varianza genetica, pertanto, può <strong>di</strong>fferire da una popolazione all'altra. L'ambiente<br />

influenza l'ere<strong>di</strong>tabilità nel senso che se il coefficiente è misurato in un ambiente<br />

uniforme esso è maggiore <strong>di</strong> quanto non risulterebbe se misurato in un ambiente<br />

variabile (ad esempio animali mantenuti in ambiente controllato sperimentalmente<br />

rispetto ad animali allevati in aziende commerciali). Infine, il coefficiente <strong>di</strong><br />

ere<strong>di</strong>tabilità calcolato su animali per i quali sia <strong>di</strong>sponibile una sola misurazione<br />

fenotipica è <strong>di</strong>fferente da quello calcolato sulla me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> più produzioni per il quale<br />

l'influenza dell'ambiente temporaneo (et) è ridotta secondo la relazione illustrata nel<br />

capitolo 3. Per queste ragione dobbiamo ricordare che l'ere<strong>di</strong>tabilità <strong>di</strong> un<br />

carattere quantitativo non è un valore costante, ma è specifico per una<br />

determinata popolazione animale allevata in quelle particolari con<strong>di</strong>zioni.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

4.2 La stima dell'ere<strong>di</strong>tabilità<br />

I meto<strong>di</strong> per la stima dell'ere<strong>di</strong>tabilità sono in genere complessi e la loro trattazione<br />

particolareggiata esula dagli scopi <strong>di</strong> queste note. In generale essi sono basati sulla<br />

misurazione <strong>di</strong> fenotipi <strong>di</strong> <strong>di</strong>verse migliaia <strong>di</strong> animali legati fra loro a due a due dallo<br />

stesso grado <strong>di</strong> parentela.<br />

I due principali meto<strong>di</strong> impiegati per la stima <strong>di</strong> questo parametro sono l’analisi<br />

della varianza fra gruppi <strong>di</strong> mezzi fratelli e la regressione fra parenti.<br />

Il primo metodo si basa sull’analisi della varianza con l’impiego <strong>di</strong> un modello<br />

lineare che comprende, oltre la me<strong>di</strong>a della popolazione (μ), l’effetto residuo (e) che<br />

esprime l’entità degli effetti ambientali casuali, gli effetti paterni (At) e quelli<br />

materni (Am):<br />

[6] y = μ + At + Am + e<br />

la cui stima <strong>delle</strong> varianze è possibile sulla base della covarianza tra fratelli (F) e<br />

mezzi fratelli (MF) come segue:<br />

V(At) = COV (MF); V(Am) = COV(F) - COV(MF)<br />

in quanto (in assenza <strong>di</strong> una quota <strong>di</strong> ambiente comune, come vedremo meglio in<br />

seguito) la variabilità comune dei mezzi fratelli stima la quota <strong>di</strong> varianza <strong>di</strong> origine<br />

paterna, mentre quella materna è stimata dalla <strong>di</strong>fferenza fra covarianza tra fratelli<br />

pieni e mezzi fratelli.<br />

Una volta stimate le varianze, ricordando che i mezzi fratelli hanno in comune 1/4<br />

della varianza genetica ad<strong>di</strong>tiva V(A) (ricor<strong>di</strong>amo che dalla [6] del capitolo 3 si ha<br />

che Af = ½ (At + Am) per cui V(Af) = 1/4V(At) + 1/4V(Am) + esc, dove esc =<br />

effetto <strong>di</strong> segregazione casuale, cioè la quota della variabilità apportata dal crossing<br />

over), è possibile calcolare il valore <strong>di</strong> h 2 con la formula:<br />

[7] h 2 = 4V(At)/ [V(At)+V(Am)+V(e)]<br />

Esempio 4.2 (tratto da Minvielle) Consideriamo l’incremento ponderale me<strong>di</strong>o<br />

giornaliero dalla nascita a 90 kg <strong>di</strong> peso <strong>di</strong> suini <strong>di</strong> razza Duroc; i dati sono<br />

relativi a 122 padri, a 1099 madri e a 8540 suini.<br />

Con l’impiego della procedura REML dell’analisi gerarchica (cioè le madri sono<br />

classificate entro i padri) della varianza si ottiene:<br />

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Fonte G <strong>di</strong> L Varianza Stima <strong>di</strong> V Componente <strong>di</strong> V<br />

Padri (t) 121 0,009961 V(e)+7V(Am)+70V(At) V(At)=0,0000992<br />

Madri (entro t) 1098 0,003011 V(e)+7V(Am) V(Am)=0,000321<br />

Residuo 7320 0,000765 V(e) V(e)=0,000765<br />

Una volta ottenuta le componenti della varianza, la stima <strong>di</strong> h 2 si ottiene secondo<br />

la [7]<br />

h 2 = 4* 0,0000992 / (0,000765+0,000321+0,0000992) = 0,334<br />

Il secondo metodo si basa sulla regressione calcolata su migliaia <strong>di</strong> dati accoppiati<br />

relativi ad animali aventi fra <strong>di</strong> loro lo stesso grado <strong>di</strong> parentela (ad es. coppie<br />

madri/figlia). In questo caso la stima dell’ere<strong>di</strong>tabilità si basa sulla relazione:<br />

[8] h 2 = bP1P2/R12<br />

in cui bP1P2 è il coefficiente <strong>di</strong> regressione fra i fenotipi dei parenti considerati e R12<br />

stima la quota genetica comune fra parenti (1/2 fra madre e figlia; 1/4 fra mezzi<br />

fratelli; ecc.). Nel caso <strong>di</strong> coppie madre/figlia, h 2 = 2 bP1P2 .<br />

Esempio 4.3 Consideriamo un migliaio <strong>di</strong> coppie <strong>di</strong> misure <strong>di</strong> produzione <strong>di</strong> latte<br />

<strong>di</strong> pecore <strong>di</strong> razza Sarda, corrette per le deviazioni ambientali sistematiche e<br />

riferite alla me<strong>di</strong>a della popolazione (deviazioni). Inseriamo i dati nel computer e<br />

calcoliamo la regressione y=a+bx; il termine a non risulta significativamente<br />

<strong>di</strong>verso da zero, come era lecito attendersi in quanto entrambe le deviazioni,<br />

genotipiche e fenotipiche, sono riferite alla me<strong>di</strong>a della popolazione; il termine b è<br />

risultato uguale a 0,147 ed è significativamente <strong>di</strong>verso da zero. L’ere<strong>di</strong>tabilità<br />

stimata su questo set <strong>di</strong> dati è allora, secondo la [8]:<br />

h 2 = 2*0,147 = 0,294<br />

4.3 Relazione fra ere<strong>di</strong>tabilità e ripetibilità<br />

Ricor<strong>di</strong>amo alcuni concetti espressi nel capitolo precedente sulla ripetibilità. Se<br />

invece <strong>di</strong> un solo dato fenotipico ottenuto per ciascun animale per un determinato<br />

carattere quantitativo ne abbiamo <strong>di</strong> più (n. misurazioni per soggetto), la<br />

variabilità fenotipica <strong>di</strong> misure ripetute V(pn) tende a ridursi in quanto:<br />

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V(p) = V(a) + V(ep) + V(et)<br />

V(pn) = V(a) + V(ep)<br />

Infatti, se scompongo la variabilità totale <strong>di</strong> misurazioni fenotipiche ripetute <strong>di</strong><br />

animali <strong>di</strong> una popolazione V(p) nelle sue componenti tra animali e entro animali<br />

(che misura quanta parte della variabilità è dovuta alle <strong>di</strong>fferenze fra le misure<br />

ripetute e quanta parte è da attribuire agli animali), nel seguente modo:<br />

Varianza totale = V(p)<br />

Varianza entro animale = V(et)<br />

Varianza tra animali = V(a) + V(ep)<br />

Ottengo che la variabilità <strong>delle</strong> misure ripetute è ascrivibile alla varianza tra animali,<br />

cioè al loro valore genetico e alle cause ambientali permanenti.<br />

La ripetibilità è data dal rapporto:<br />

[9] rip = V(pn)/V(p)<br />

con 1 ≥ rip ≥ h 2 ≥ 0. Questo significa che se l’ambiente permanente è nullo (V(ep) =<br />

0), la ripetibilità è uguale all’ere<strong>di</strong>tabilità (tutte le <strong>di</strong>fferenze osservate fra gli animali<br />

sono <strong>di</strong> origine genetica).<br />

La ripetibilità esprime la fiducia che ripongo su misurazioni ripetute. Se la<br />

ripetibilità<br />

<strong>di</strong> un carattere è alta, mi occorrono poche misure per avere una buona stima del<br />

valore fenotipico <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo; viceversa se è bassa, me ne occorreranno molte.<br />

Consideriamo ora coppie <strong>di</strong> dati rappresentanti le deviazioni genetiche ad<strong>di</strong>tive (a) e<br />

fenotipiche ripetute (pn) derivanti da animali <strong>di</strong> una data popolazione.<br />

In questo caso, analogamente a quanto visto in precedenza, possiamo stimare il<br />

valore genetico <strong>di</strong> un animale sulla base della relazione:<br />

[10] E(a) = b(a, pn) pn<br />

Il coefficiente <strong>di</strong> regressione può essere ottenuto dalla relazione<br />

[11] b(a, pn) = V(a)/V(pn)<br />

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Sappiamo però dalla [9] che V(pn) = rip V(p), cioè che la varianza <strong>di</strong> n. fenotipi<br />

ripetuti è uguale alla ripetibilità per la varianza fenotipica totale, per cui sostituendo<br />

ottengo:<br />

[12] b(a, pn) = V(a)/ (rip V(p)) = (1/rip) h 2<br />

Le conseguenze della [12] sono che se la ripetibilità è uguale a 1 (non ci sono<br />

<strong>di</strong>fferenze fra le misure ripetute sullo stesso animale) pn = p e b(a, pn) = b(a, p) = h 2 ;<br />

ma anche che se rip = h 2 , b(a, pn) = 1 che significa che la stima del genotipo (E(a)) a<br />

partire da pn è perfetta (ovvero le <strong>di</strong>fferenze osservate fra gli animali sono tutte <strong>di</strong><br />

origine genetica, V(ep)=0).<br />

Per concludere, quale è l’accuratezza <strong>di</strong> queste stime effettuate su misure ripetute<br />

piuttosto che su singole misure per animale?<br />

Anche in questo caso utilizziamo la correlazione fra a e pn:<br />

[13] r = COV(a, pn)/(σa σpn) = σa /σpn = σa /(√rip σp) = (1/√rip) h<br />

Cosa significa? Che se la ripetibilità è alta (vicina all’unità), l’accuratezza nella<br />

stima del valore genetico <strong>di</strong> un animale non migliora <strong>di</strong> molto ripetendo le misure<br />

(ottima cosa perchè si risparmia tempo e denaro), ma se la ripetibilità si riduce<br />

(tende cioè all’h 2 ), per avere una buona stima del genotipo mi occorrono molte<br />

misurazioni.<br />

4.4 La correlazione genetica<br />

Anche se non rientra strettamente nell’argomento dell’ere<strong>di</strong>tabilità, facciamo un<br />

accenno alla correlazione genetica rA fra due (o più) caratteri quantitativi. Se due<br />

caratteri <strong>di</strong>versi, come la produzione <strong>di</strong> latte ed il contenuto in proteine, sono<br />

associati geneticamente, cioè il valore ad<strong>di</strong>tivo del primo non è statisticamente<br />

in<strong>di</strong>pendente dal secondo, i due caratteri sono geneticamente correlati. La<br />

correlazione può essere positiva o negativa, bassa, me<strong>di</strong>a o forte. La sua conoscenza<br />

è <strong>di</strong> grande importanza in quanto, nella scelta degli obiettivi della selezione, il non<br />

tenerne conto (cioè considerare i caratteri selezionati in<strong>di</strong>pendenti fra <strong>di</strong> loro e non<br />

legati ad altre caratteristiche produttive o riproduttive <strong>di</strong> interesse economico, ma<br />

non oggetto <strong>di</strong> selezione <strong>di</strong>retta) può portare ad effetti <strong>di</strong> “trascinamento” a volte<br />

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indesiderati: quando un carattere è oggetto <strong>di</strong> selezione bisogna tener conto degli<br />

effetti che l’azione selettiva crea sui caratteri ad esso collegati. La correlazione<br />

genetica, inoltre, è necessaria per elaborare una strategia <strong>di</strong> miglioramento <strong>di</strong> più<br />

caratteri simultaneamente.<br />

La tabella seguente, tratta da Pirchner, riporta alcuni valore d rA :<br />

Specie caratteri correlati rA %<br />

Bovini produzione latte % grasso -7 a -70<br />

% proteine -10 a -50<br />

% grasso % proteine 40 a 70<br />

accrescimento giornaliero % carne carcassa -5 a -50<br />

Ovini peso corporeo peso vello -10 a 0<br />

Suini accrescimento giornaliero in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> conversione 50 a 100<br />

lardo dorsale -25 a 30<br />

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5. L’IMPIEGO DELLE INFORMAZIONI FENOTIPICHE PER LA<br />

VALUTAZIONE <strong>DEGLI</strong> INDIVIDUI<br />

La scelta degli in<strong>di</strong>vidui da destinare alla riproduzione si basa sulla stima del loro<br />

valore riproduttivo che può derivare da informazioni fenotipiche <strong>di</strong>rette integrate,<br />

oppure no, da informazioni rilevate sui parenti. I meto<strong>di</strong> <strong>di</strong> selezione sono, perciò,<br />

intimamente legati con le modalità <strong>di</strong> valutazione degli in<strong>di</strong>vidui e, pertanto, noi<br />

tratteremo prima la provenienza della informazioni fenotipiche e dopo il loro<br />

impiego per la stima del valore genotipico degli animali.<br />

5.1 Le informazioni dei parenti<br />

Se la scelta dei migliori riproduttori fosse limitata agli in<strong>di</strong>vidui che presentano il<br />

miglior fenotipo, non staremo qui a romperci l’anima con la statistica!! La stima del<br />

valore riproduttivo basata sui soli dati fenotipici del soggetto in esame ci obbliga a<br />

ricorrere alla analisi statistica per l’ottenimento dei parametri della popolazione a<br />

cui l’in<strong>di</strong>viduo appartiene (l’ere<strong>di</strong>tabilità, la ripetibilità, ecc.), ma questo metodo<br />

non è sempre sufficiente ad operare al meglio la scelta, anche se è da preferirsi<br />

qualora i meto<strong>di</strong> alternativi non presentino inequivocabili vantaggi <strong>di</strong> or<strong>di</strong>ne pratico<br />

ed economico.<br />

Già dai tempi dei romani agli allevatori era sorto il dubbio che avrebbero scelto<br />

meglio i riproduttori se avessero tenuto d’occhio i loro parenti, soprattutto i<br />

<strong>di</strong>scendenti (Columella, libro settimo, 3.1-4). Poiché noi valutiamo gli animali al<br />

fine <strong>di</strong> ottenere il massimo vantaggio economico nella generazione successiva o, il<br />

ché è lo stesso, per raggiungere quanto più celermente possibile gli obiettivi <strong>di</strong><br />

selezione prefissati, <strong>di</strong>venta <strong>di</strong> primaria importanza la stima la più corretta possibile<br />

del loro VR: dobbiamo, infatti, attribuire a ciascun soggetto can<strong>di</strong>dato alla<br />

selezione la sua scheda <strong>di</strong> valutazione (una sorta <strong>di</strong> “pagella” <strong>di</strong> merito) cercando <strong>di</strong><br />

commettere meno errori possibile. E’ chiaro, a questo punto, che tutte le<br />

informazioni <strong>di</strong>sponibili, anche quelle derivanti dai parenti, sono utili oppure, come<br />

nel caso dei caratteri manifesti in un solo sesso come quello della produzione del<br />

latte, ad<strong>di</strong>rittura in<strong>di</strong>spensabili .<br />

Nel miglioramento genetico, le informazioni ottenute dai parenti sono utili in due<br />

casi: a) qualora i caratteri oggetto <strong>di</strong> selezione siano a bassa ere<strong>di</strong>tabilità per cui il<br />

fenotipo dell’in<strong>di</strong>viduo è una cattiva guida all’in<strong>di</strong>viduazione del suo genotipo; b)<br />

quando il carattere oggetto <strong>di</strong> selezione comporti un guadagno, o una per<strong>di</strong>ta,<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

economico e pertanto è in<strong>di</strong>spensabile perseguire l’ottimizzazione della stima del<br />

VR.<br />

L’impiego <strong>delle</strong> informazioni derivanti dai parenti è lecito anche per parentele<br />

lontane (ve<strong>di</strong> capitolo 10), ma la loro importanza decresce tanto più basso è il grado<br />

<strong>di</strong> parentela; sebbene le modalità <strong>di</strong> valutazione attualmente impiegate fanno ricorso<br />

a tutte le informazioni parentali ed in<strong>di</strong>viduali <strong>di</strong>sponibili, può essere utile in pratica<br />

<strong>di</strong>fferenziare quelle ottenute come me<strong>di</strong>a fenotipica <strong>di</strong> una famiglia e quelle che<br />

<strong>di</strong>stinguono gli in<strong>di</strong>vidui dentro la famiglia. In particolare, è molto utile la<br />

<strong>di</strong>stinzione fra le informazioni fenotipiche dell’in<strong>di</strong>viduo e quelle della sua progenie.<br />

Esempio 5.1 Poniamo (lavorando parecchio <strong>di</strong> fantasia..) che la nostra ipotetica<br />

popolazione sia costituita da 16 pecorelle da latte, sud<strong>di</strong>vise in 4 famiglie <strong>di</strong> mezze<br />

sorelle (le famiglie possono essere costituite con qualsiasi grado <strong>di</strong> parentela, ma<br />

quelle tra fratelli pieni e mezzi fratelli sono più utili in quanto sono in grado <strong>di</strong><br />

spiegare una quota <strong>di</strong> variabilità genetica comune molto alta) i cui fenotipi,<br />

derivanti da una o da più lattazioni ed espressi in kg <strong>di</strong> latte totale, sono riportati<br />

nella tabella seguente:<br />

In<strong>di</strong>vidui FAMIGLIE<br />

A B C D<br />

1 178 150 201 137<br />

2 196 143 179 175<br />

3 155 122 195 149<br />

4 163 161 217 163<br />

me<strong>di</strong>a familiare 173 144 198 156<br />

Me<strong>di</strong>a totale 167,75<br />

Il nostro problema ora è: quali in<strong>di</strong>vidui selezionare? Quelli migliori in assoluto?<br />

Quelli migliori relativamente al fenotipo della famiglia? Quelli appartenenti alla<br />

famiglia migliore?<br />

Il quesito posto nell’esempio (a cui risponderemo subito) si riassume nella domanda:<br />

in quanta considerazione dobbiamo tenere le informazioni familiari nella selezione<br />

degli in<strong>di</strong>vidui?<br />

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5.2 L’impiego <strong>delle</strong> informazioni fenotipiche<br />

Il valore fenotipico <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo, espresso come deviazione dalla me<strong>di</strong>a della<br />

popolazione, può essere scomposto in due parti: la deviazione della me<strong>di</strong>a familiare<br />

dalla me<strong>di</strong>a della popolazione (Pf); la deviazione del fenotipo dell’in<strong>di</strong>viduo dalla<br />

me<strong>di</strong>a familiare (Pw), per cui:<br />

[1] P = Pf + Pw<br />

Esempio 5.1 (continua) Se assumiamo la me<strong>di</strong>a della popolazione pari a kg 167,75<br />

(che in realtà è la me<strong>di</strong>a dei 16 dati dell’esempio), la deviazione fenotipica della<br />

pecorella A1 (178 - 167,75 = 10,25) potrà essere scomposta in: 10,25 = 5,25 + 5.<br />

A seconda dell’importanza accordata a ciascuna della due componenti informative<br />

possiamo classificare le modalità con cui si può svolgere la selezione nel modo<br />

seguente:<br />

a) selezione in<strong>di</strong>viduale, qualora gli in<strong>di</strong>vidui siano selezionati in base ai soli valori<br />

in<strong>di</strong>viduali per cui le due componenti sono considerate con peso uguale;<br />

b) selezione familiare, nel caso in cui gli in<strong>di</strong>vidui siano selezionati soltanto sulla<br />

base <strong>delle</strong> me<strong>di</strong>e familiari per cui la componente <strong>delle</strong> deviazioni entro famiglia Pw<br />

è considerata uguale a zero;<br />

c) selezione intra-familiare, quando gli in<strong>di</strong>vidui sono selezionati sulla base <strong>delle</strong><br />

sole deviazioni intra-familiari per cui la componente della deviazione familiare Pf è<br />

considerata nulla.<br />

Oltre a questi tre semplici criteri, noi possiamo operare la selezione attribuendo alle<br />

due componenti Pf e Pw un peso <strong>di</strong>verso, scelto in modo da utilizzare al meglio la<br />

fonte informativa a cui ciascuna <strong>di</strong> esse si riferisce, ed ottenere in questo modo il<br />

criterio della selezione combinata o dell’in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> selezione, che può essere, in<br />

realtà, considerato l’unico criterio <strong>di</strong> selezione, essendone i tipi elencati in<br />

precedenza soltanto dei casi particolari in cui il peso <strong>delle</strong> componenti <strong>delle</strong><br />

informazioni tra ed entro famiglie assumono il valore limite <strong>di</strong> 1 e 0 (tipi b e c)<br />

oppure <strong>di</strong> 0,5 (tipo a).<br />

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Esempio 5.2 Consideriamo i dati dell’esempio precedente ed esprimiamoli in<br />

forma <strong>di</strong> deviazione della me<strong>di</strong>a:<br />

In<strong>di</strong>vidui FAMIGLIE<br />

Pw A Pw B Pw C Pw D<br />

1 5 6 3 -19<br />

2 23 -1 -19 19<br />

3 -18 -22 - 3 - 7<br />

4 -10 17 19 7<br />

Pf 5,25 -23,75 30,25 -11,75<br />

Me<strong>di</strong>a totale 167,75<br />

Poniamo <strong>di</strong> dover selezionare 4 in<strong>di</strong>vidui con uno dei tre criteri:<br />

a) con la selezione in<strong>di</strong>viduale scegliamo le 4 migliori pecore con i seguenti<br />

fenotipi in<strong>di</strong>viduali C4 P = 19+30,25 = 49,25<br />

C1 P= 33,25<br />

A2 P = 28,25<br />

C3 P = 27,25<br />

b) con la selezione familiare scegliamo le 4 pecore della migliore famiglia che è la<br />

C con deviazione fenotipica <strong>di</strong> 30,25;<br />

c) con la selezione intrafamiliare scegliamo le 4 migliori deviazioni dentro le<br />

famiglie che sono A2 P = 23<br />

D2 P =19<br />

C4 P = 19<br />

B4 P= 17<br />

5.2.1 La selezione in<strong>di</strong>viduale<br />

Gli in<strong>di</strong>vidui sono selezionati soltanto in funzione del loro valore fenotipico e questo<br />

metodo rappresenta il più semplice e, a volte, anche il più economico metodo <strong>di</strong><br />

miglioramento genetico. Il termine <strong>di</strong> selezione in<strong>di</strong>viduale è a volte sostituito con<br />

quello <strong>di</strong> selezione massale, anche se a stretto rigore essa consiste nella scelta <strong>di</strong><br />

in<strong>di</strong>vidui che sono poi fatti riprodurre in massa, senza il controllo e la registrazione<br />

degli accoppiamenti. La selezione massale in senso stretto è, ancora oggi,<br />

largamente applicata nell’allevamento ovino in cui, una volta in<strong>di</strong>viduate, le migliori<br />

produttrici sono fatte accoppiare a caso con gli arieti del gregge.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Oltre che alla semplicità, la selezione in<strong>di</strong>viduale deve il suo successo al breve<br />

intervallo fra le generazioni ottenibile in forza <strong>di</strong> una valutazione precoce del VR<br />

dei can<strong>di</strong>dati alla riproduzione: questo vantaggio, per i caratteri ad elevata<br />

ere<strong>di</strong>tabilità in cui tale metodo <strong>di</strong> selezione è particolarmente consigliabile,<br />

compensa la minore atten<strong>di</strong>bilità della stima del VR rispetto a quanto ottenibile con<br />

altri meto<strong>di</strong>.<br />

Una applicazione particolare del metodo <strong>di</strong> selezione in<strong>di</strong>viduale è il performance<br />

test o prova attitu<strong>di</strong>nale che consiste nel mantenere i can<strong>di</strong>dati alla selezione in<br />

con<strong>di</strong>zioni ambientali il più possibile uniformi in modo tale da ridurne le deviazioni<br />

sull’espressione del carattere. La prova, tipica per il carattere produzione della<br />

carne ed adottata principalmente per la valutazione dei maschi, si svolge in<br />

“stazioni <strong>di</strong> prova” in cui i giovani animali (vitelli, arietini) sono posti precocemente<br />

al fine <strong>di</strong> ridurre al minimo l’influenza dell’ambiente permanente (V(ep) = min.).<br />

Le con<strong>di</strong>zioni <strong>di</strong> allevamento e <strong>di</strong> ricovero adottate sono mantenute omogenee sino<br />

al momento considerato tecnicamente interessante ai fini della valutazione del<br />

fenotipo (ad es. sino a 100 giorni <strong>di</strong> età per la selezione dell’agnellone leggero; sino<br />

ai 12 mesi per quella del vitellone, ecc.). Sugli animali sono rilevati perio<strong>di</strong>camente<br />

tutti i dati fenotipici (accrescimenti, in<strong>di</strong>ci <strong>di</strong> conversione alimentare, misure<br />

morfologiche) interessanti per la definizione del carattere in vita; quelli relativi,<br />

invece, alle rese alla macellazione ed alla qualità della carne, non potendo essere<br />

rilevabili che post mortem, sono attinti da animali parenti dei can<strong>di</strong>dati alla<br />

selezione. I migliori soggetti della prova (cioè gli animali con le migliori<br />

performances) sono selezionati per la riproduzione ad una età inferiore a quella in<br />

cui inizia la carriera riproduttiva con il vantaggio <strong>di</strong> ridurre l’intervallo <strong>di</strong><br />

generazione a cui si è accennato precedentemente.<br />

Per ciascun soggetto i dati provenienti da queste prove possono essere integrati<br />

successivamente con quelli derivanti dalla progenie a sua volta sottoposta a<br />

performance test , per i caratteri produttivi, e da quelli derivanti dalle femmine<br />

accoppiate con i maschi selezionati per il carattere “facilità <strong>di</strong> parto”.<br />

5.2.2 La selezione familiare<br />

Gli in<strong>di</strong>vidui sono selezionati soltanto in funzione del valore fenotipico me<strong>di</strong>o della<br />

famiglia a cui appartengono, il che equivale a <strong>di</strong>re che le <strong>di</strong>fferenze in<strong>di</strong>viduali<br />

intrafamiliari non sono tenute in conto. Questo metodo si basa sull’assunto che, in<br />

famiglie sufficientemente numerose, il fenotipo me<strong>di</strong>o familiare è una buona stima<br />

del valore genotipico degli in<strong>di</strong>vidui che le compongono. Ai fini pratici sono<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

considerate famiglie i raggruppamenti parentali <strong>di</strong> fratelli pieni o <strong>di</strong> mezzi fratelli<br />

essendo gli altri gra<strong>di</strong> <strong>di</strong> parentela troppo <strong>di</strong>stanti per l’ottenimento <strong>di</strong> buone stime.<br />

Il metodo della selezione familiare, in<strong>di</strong>spensabile per i caratteri manifesti in un solo<br />

sesso (produzione <strong>di</strong> latte, produzione <strong>di</strong> uova, tasso <strong>di</strong> ovulazione, ecc.), è<br />

preferibile nel caso dei caratteri a bassa ere<strong>di</strong>tabilità in quanto la me<strong>di</strong>a familiare<br />

tende a cancellare le deviazioni in<strong>di</strong>viduali ed il vantaggio ottenibile è tanto<br />

maggiore quanto più forti sono le deviazioni ambientali (cioè, ancora, quando<br />

l’ere<strong>di</strong>tabilità è bassa). Poiché queste deviazioni , nella componente “tra famiglie”<br />

dell’analisi della varianza, in me<strong>di</strong>a sono nulle, il metodo non è applicabile qualora<br />

sussista un ambiente comune tra i componenti della famiglia, cioè qualora la<br />

deviazione “tra famiglie” abbia anche una componente ambientale. Un altro<br />

requisito necessario è quello della numerosità in quanto maggiore è l’ampiezza del<br />

gruppo famigliare considerato più vicina sarà la me<strong>di</strong>a dei fenotipi al reale valore<br />

genotipico familiare.<br />

Nel caso della selezione per un carattere non manifesto in un sesso, che<br />

normalmente è quello maschile, le varianti del metodo <strong>di</strong> selezione familiare sono<br />

<strong>di</strong>stinte, in funzione dei parenti da cui sono attinte le informazioni, nei tre tipi<br />

seguenti: a) selezione sugli ascendenti o genealogica o pe<strong>di</strong>gree test; b) selezione<br />

sui collaterali o sib selection; c) selezione sui <strong>di</strong>scendenti o prova <strong>di</strong> progenie o<br />

progeny testing.<br />

La selezione sugli ascendenti utilizza le informazioni dei genitori, dei nonni e dei<br />

bisnonni; è ovvio che le prime peseranno il doppio <strong>delle</strong> seconde e le seconde il<br />

doppio <strong>delle</strong> terze.<br />

In questo tipo <strong>di</strong> selezione la scelta dell’in<strong>di</strong>viduo, cioè la valutazione del suo<br />

genotipo, avviene sulla base dei dati degli ascendenti reperibili negli archivi dei<br />

“Libri genealogici” e che sono sintetizzati nei cosiddetti “certificati genealogici”. In<br />

questi documenti sono riportati gli ascendenti (matricola, nome) ed il loro valore<br />

fenotipico (oppure, nel migliore dei casi, la stima del loro VR). Qualora in tali<br />

certificati siano riportati i “nu<strong>di</strong>” fenotipi (i fenotipi e non le loro deviazioni rispetto<br />

alla me<strong>di</strong>a corretti oppure no per le deviazioni sistematiche), le informazioni<br />

<strong>di</strong>sponibili sono del tutto inadeguate a stimare il potenziale genetico dell’in<strong>di</strong>viduo<br />

can<strong>di</strong>dato all selezione. Rossi <strong>di</strong>ce che, “tali documenti, possono rappresentare al<br />

massimo un blasone dei soggetti” i quali sono considerati dal senso comune<br />

selezionati per il solo motivo <strong>di</strong> essere iscritti al libro genealogico, cioè per il fatto<br />

<strong>di</strong> essere nati in selezione. A questo proposito è bene rimarcare che la selezione non<br />

consiste nella “semplice scrittura notarile” dell’appartenenza <strong>di</strong> un animale ad una<br />

famiglia (<strong>di</strong> sangue blu) iscritta ad un libro (come nel caso dei nobili), ma nella<br />

valutazione, più rapida ed accurata possibile, del suo valore riproduttivo.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Nel caso in cui nel certificato siano riportate le stime del VR degli ascendenti,<br />

queste informazioni rappresentano una fonte importante per la valutazione in quanto<br />

la stima del VR del can<strong>di</strong>dato alla selezione è <strong>di</strong>sponibile in tempi brevi e perciò<br />

avremo una notevole <strong>di</strong>minuzione dell’intervallo fra le generazioni. Tale<br />

proce<strong>di</strong>mento è noto come in<strong>di</strong>ce pe<strong>di</strong>grèe ed il suo calcolo e la sua atten<strong>di</strong>bilità<br />

saranno trattati nel capitolo 6.<br />

La selezione sui collaterali ha, rispetto quella sugli ascendenti, il vantaggio <strong>di</strong> poter<br />

<strong>di</strong>sporre <strong>di</strong> un maggior numero <strong>di</strong> informazioni in quanto i collaterali (fratelli, mezzi<br />

fratelli, cugini, ecc.) sono abbastanza numerosi. Essa è impiegata nel caso in cui il<br />

carattere non sia misurabile sull’in<strong>di</strong>viduo o per la non espressione (citiamo sempre<br />

il carattere produzione <strong>di</strong> latte nei maschi) oppure qualora l’acquisizione del<br />

fenotipo comporti la soppressione dell’in<strong>di</strong>viduo come nel caso della qualità della<br />

carne (in realtà alcuni aspetti <strong>di</strong> questo carattere sono rilevabili in vivo con la<br />

biopsia, per le analisi del tessuto muscolare, o con l’ecografia per lo spessore del<br />

lardo dorsale nei suini). Questo metodo <strong>di</strong> selezione è particolarmente adatto per le<br />

specie prolifiche, come i suini, i conigli e le avicole, ma può <strong>di</strong>ventare molto<br />

interessante anche nel caso <strong>delle</strong> specie unipare, quali i bovini, nel caso <strong>di</strong> impiego<br />

<strong>di</strong> tecniche riproduttive particolari quali il trapianto embrionario o embryo transfer.<br />

Un esempio applicativo interessante è quello relativo alla scelta dei giovani arieti<br />

<strong>delle</strong> razze da latte sulla base della produzione <strong>delle</strong> mezze sorelle: i primi dati <strong>di</strong><br />

lattazione <strong>di</strong> questi animali sono, infatti, <strong>di</strong>sponibili a 14-17 mesi <strong>di</strong> età e possono<br />

consentire una valutazione comparativa degli arieti entro il gregge (purchè in<br />

assenza <strong>di</strong> trattamenti preferenziali <strong>delle</strong> primipare).<br />

La selezione sui <strong>di</strong>scendenti consiste nella scelta <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo sulla base del<br />

valore fenotipico <strong>delle</strong> figlie; questo metodo è conosciuto come prova <strong>di</strong> progenie<br />

o progeny testing ed è stato largamente impiegato nel recente passato nella<br />

selezione dei tori <strong>delle</strong> razze da latte.<br />

L’interesse principale della prove <strong>di</strong> progenie risiede nell’elevata accuratezza che<br />

esso consente <strong>di</strong> raggiungere nella stima del VR per effetto dell’elevato numero <strong>di</strong><br />

figlie (il fenotipo me<strong>di</strong>o stima molto bene il VR del padre) che è possibile ottenere<br />

da un maschio con l’impiego della inseminazione artificiale (IA). Il successo <strong>di</strong><br />

questo metodo <strong>di</strong> selezione, praticamente l’unico applicato nel miglioramento<br />

genetico <strong>delle</strong> razze da latte nei bovini per oltre 30 anni, deriva dalla <strong>di</strong>ffusione<br />

della pratica della IA dovuta all’affidabilità della tecnica anche se praticata<br />

dall’allevatore.<br />

Tuttavia la prova <strong>di</strong> progenie presenta due importanti <strong>di</strong>fetti che ne hanno alla fine<br />

decretato l’abbandono: l’eccessiva lunghezza dell’intervallo <strong>di</strong> generazione e la<br />

confusione fra le generazioni dovuta alla loro sovrapposizione. Riguardo al primo<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

problema, un animale può essere considerato testato (provato) soltanto dopo che le<br />

proprie figlie abbiano concluso almeno la prima lattazione, il che significa che per<br />

un toro possono essere <strong>di</strong>sponibili i primi fenotipi <strong>delle</strong> figlie a 5,5-6 anni (primi<br />

salti a 18 mesi; 9 mesi <strong>di</strong> gestazione <strong>delle</strong> madri <strong>di</strong> vacche; 28 mesi al primo parto;<br />

almeno 6 mesi <strong>di</strong> lattazione; 3 mesi per l’elaborazione dei dati = 64 mesi).<br />

Relativamente al secondo problema, sorge il dubbio su quale generazione sia<br />

oggetto <strong>di</strong> selezione: quella parentale o quella filiale? La generazione sulla quale<br />

sono state effettuate le misure fenotipiche è pronta per essere selezionata, ma le<br />

stesse misure dovrebbero servire per la selezione della generazione parentale:<br />

entrambi genitori e figli sono infatti utilizzati come riproduttori.<br />

5.2.3 Selezione intrafamiliare<br />

Consiste nella scelta degli in<strong>di</strong>vidui sulla base della deviazione dalla me<strong>di</strong>a della<br />

famiglia <strong>di</strong> appartenenza, il che pone questo metodo agli antipo<strong>di</strong> della selezione<br />

familiare. Il peso della me<strong>di</strong>a familiare è infatti nullo e i migliori genotipi sono quelli<br />

che deviano maggiormente (in positivo ovviamente) entro la famiglia. La selezione<br />

intrafamiliare è particolarmente adatta alle situazioni in cui assume grande<br />

importanza l’ambiente comune , come ad esempio l’ambiente della ni<strong>di</strong>ata. Un<br />

esempio applicativo del metodo intrafamiliare è quello del carattere incremento<br />

ponderale nei suini; in questo caso i suinetti vivono tutti nello stesso ambiente<br />

comune rappresentato dalla produzione <strong>di</strong> latte della scrofa.<br />

5.2.4 La selezione combinata<br />

Questo metodo consiste nell’utilizzazione combinata <strong>di</strong> tutte le informazioni<br />

<strong>di</strong>sponibili ; esso consente, in tal modo, un aumento della atten<strong>di</strong>bilità della stima<br />

dei genotipi e, attualmente, rappresenta la modalità <strong>di</strong> selezione maggiormente<br />

utilizzata. I sistemi <strong>di</strong> valutazione del VR attualmente impiegati, quale l’in<strong>di</strong>ce<br />

genetico IG ed il BLUP, non sono altro che <strong>delle</strong> modalità <strong>di</strong> stima applicati ad un<br />

metodo <strong>di</strong> selezione combinata. Il capitolo che segue sarà de<strong>di</strong>cato all’esame <strong>di</strong><br />

come queste informazioni entrano a far parte <strong>delle</strong> modalità <strong>di</strong> attribuzione della<br />

“pagella” <strong>di</strong> merito genetico in base alla quale deci<strong>di</strong>amo se l’animale a cui essa è<br />

riferita debba oppure no entrare fra quelli che daranno origine alla successiva<br />

generazione.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

6. LA VALUTAZIONE DEL VALORE <strong>GENETICO</strong> DI UN<br />

INDIVIDUO<br />

Uno dei principali scopi del miglioramento genetico degli animali in produzione<br />

zootecnica è quello <strong>di</strong> in<strong>di</strong>viduare i migliori genotipi da preservare per la creazione<br />

della generazione successiva. I sistemi attualmente impiegati per questo scopo<br />

utilizzano la maggior quantità <strong>di</strong> informazioni <strong>di</strong>sponibili e le combinano all’interno<br />

<strong>di</strong> un in<strong>di</strong>ce genetico (IG) o <strong>di</strong> selezione.<br />

L’ IG può essere definito, secondo Falconer, come la migliore pre<strong>di</strong>zione lineare<br />

(Best Linear Pre<strong>di</strong>ction) del valore riproduttivo (BV = bree<strong>di</strong>ng value) <strong>di</strong> un<br />

in<strong>di</strong>viduo e esso prende la forma <strong>di</strong> una regressione multipla del BV su tutte le<br />

sorgenti <strong>di</strong> informazione.<br />

La costruzione <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>ce non è in genere un proce<strong>di</strong>mento semplice se si devono<br />

utilizzare più <strong>di</strong> due fonti <strong>di</strong> informazione; si fa ricorso, perciò, all’impiego<br />

dell’algebra dei sistemi lineari che, per la soluzione dei sistemi <strong>di</strong> equazioni fa uso<br />

del calcolo matriciale.<br />

6.1 L’impiego <strong>delle</strong> matrici per la risoluzione dei sistemi lineari<br />

Daremo qui soltanto alcuni brevi accenni ai sistemi lineari e riman<strong>di</strong>amo un<br />

approfon<strong>di</strong>mento ai testi <strong>di</strong> matematica e <strong>di</strong> statistica.<br />

Ricor<strong>di</strong>amo che un sistema lineare è un insieme <strong>di</strong> equazioni lineari (o linearizzabili)<br />

legate fra loro da comunanza <strong>di</strong> una o più variabili in<strong>di</strong>pendenti. La soluzione dei<br />

sistemi <strong>di</strong> equazioni in cui le variabili in<strong>di</strong>pendenti sono le incognite ricorre all’uso<br />

del calcolo matriciale.<br />

Nel caso <strong>di</strong> un sistema non omogeneo del tipo<br />

ax1 + bx2 + cx3 = b1<br />

dx1 + ex2 + fx3 = b2<br />

gx1 + hx2 + ix3 = b3<br />

la sua scrittura in termini matriciali è la seguente<br />

Ax = b<br />

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in cui<br />

a b c x1 b1<br />

A = d e f x = x2 b = b2<br />

g h i x3 b3<br />

La soluzione del sistema, se esiste, è una e una sola ed è data dalla relazione<br />

x = A -1 b<br />

in cui A -1 è l’inversa della matrice dei coefficienti, per cui il sistema ammette<br />

soluzione solo se questa matrice è invertibile.<br />

Ad esempio, il sistema<br />

è scrivibile nella forma<br />

ed ammette questa soluzione<br />

3x1 + 12x2 + 5x3 = 150<br />

11x1 + 7x2 + 9x3 = 185<br />

5x1 + 11x2 + 6x3 = 163<br />

3 12 5 x1 150<br />

11 7 9 * x2 = 185<br />

5 11 6 x3 163<br />

-8,142 -2,428 10,429 150 26,71<br />

A -1 b = -3 -1 4 * 185 = 16 = x<br />

12,286 3,857 -15,857 163 24,43<br />

Analogamente alla soluzione dei sistemi <strong>di</strong> equazioni lineari, l’algebra matriciale<br />

può essere impiegata nella regressione lineare semplice o multipla.<br />

Pren<strong>di</strong>amo il caso <strong>di</strong> un insieme <strong>di</strong> dati sui quali deve essere calcolata una equazione<br />

<strong>di</strong> regressione del tipo<br />

[1] y = b1x1 + b2x2 + ...+ bnxn<br />

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In questo caso, rispetto al precedente, le incognite del sistema sono i coefficienti per<br />

cui la soluzione attesa è quella che riesce a trovare il loro miglior valore. La tecnica<br />

dell’analisi della regressione multipla richiede che i dati (costituiti da punti noti <strong>delle</strong><br />

variabili in<strong>di</strong>pendenti x) siano organizzati in forma <strong>di</strong> matrice X e quelli relativi alla<br />

variabile <strong>di</strong>pendente organizzati sotto forma <strong>di</strong> vettore y, la cui lunghezza è uguale<br />

alla numerosità del campione preso in considerazione. L’insieme <strong>delle</strong> informazioni<br />

organizzate in forma matriciale prende allora la forma<br />

[2] y = Xb<br />

e, dalla teoria della regressione, sappiamo che il valore atteso della variabile<br />

in<strong>di</strong>pendente E(y) può essere espresso nel modo seguente<br />

[3] E(y) = Xb + e<br />

in cui e è il vettore degli errori casuali con me<strong>di</strong>a zero (E(ε) = 0) e deviazione<br />

standard σ 2 .<br />

La soluzione è ottenibile con il metodo dei minimi quadrati, cioè minimizzando la<br />

<strong>di</strong>stanza quadratica <strong>di</strong> ciascun punto in<strong>di</strong>viduato dai dati <strong>delle</strong> variabili in<strong>di</strong>pendenti<br />

da quello giacente sulla regressione (semplificando, il metodo cerca la migliore<br />

funzione che interpreti i dati e lo fa riducendo al minimo la somma, elevata al<br />

quadrato, <strong>delle</strong> <strong>di</strong>stanze <strong>di</strong> ciascun punto sperimentale da quello che giace<br />

sull’equazione). L’algoritmo risolutivo è detto equazione normale dei minimi<br />

quadrati e prende la forma<br />

[4] b = (X’X) -1 X’y<br />

in cui X’ è la trasposta della matrice <strong>delle</strong> variabili in<strong>di</strong>pendenti e il simbolo -1 in<strong>di</strong>ca<br />

l’inversa della matrice che si ottiene dal prodotto della matrice originaria per la sua<br />

trasposta. Ovviamente questi calcoli devono essere compiuti con un computer, ma<br />

fortunatamente, rispetto solo pochi anni or sono in cui era <strong>di</strong>fficile invertire matrici<br />

<strong>di</strong> <strong>di</strong>mensione anche limitata (ad es. una 4x4), oggi è possibile compiere facilmente<br />

queste operazioni anche con l’ausilio <strong>di</strong> un foglio elettronico in un computer.<br />

Esempio 6.1 Poniamo <strong>di</strong> dover calcolare la relazione che lega il valore energetico<br />

del latte ovino, espresso in Mcal per kg, al suo contenuto lipi<strong>di</strong>co e proteico, al<br />

fine <strong>di</strong> determinare l’equazione che ci consenta <strong>di</strong> ricavare le formule <strong>di</strong><br />

normalizzazione (il latte normalizzato LN è un latte che ha un predefinito<br />

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contenuto in grasso ed in proteine; il suo calcolo consente <strong>di</strong> rimuovere l’errore<br />

sistematico sulla produzione costituito dal <strong>di</strong>fferente contenuto in grasso e<br />

proteine). Sperimentalmente si determina il valore energetico (bruciando<br />

completamente il latte in una bomba calorimetrica) ed i contenuti in grasso ed in<br />

proteine <strong>di</strong> un campione rappresentativo <strong>di</strong> latte. Poniamo <strong>di</strong> avere avuto a<br />

<strong>di</strong>sposizione 10 campioni <strong>di</strong> latte <strong>delle</strong> nostre pecorelle e avere effettuato le<br />

determinazioni in laboratorio che ci hanno fornito i seguenti risultati<br />

calorimetria (y) grasso % (x1) proteine % (x2) E(y)Mcal/kg*<br />

1,044 6,12 5,13 1,026<br />

1,162 5,98 5,10 1,089<br />

1,113 7,23 6,01 1,207<br />

1,089 5,56 5,44 1,017<br />

1,289 7,93 6,34 1,296<br />

0,874 4,13 5,20 0,882<br />

1,137 6,55 5,90 1,143<br />

1,166 6,91 5,77 1,156<br />

1,129 6,32 5,98 1,134<br />

1,278 8,11 6,29 1,305<br />

*per questa colonna ve<strong>di</strong> oltre<br />

L’equazione che dobbiamo trovare è y = b1x1 + b2x2 e la matrice X è<br />

rappresentata dalle prime due colonne dei contenuti in grasso ed in proteina ed il<br />

vettore <strong>delle</strong> y è rappresentato dalle calorimetrie. Con l’impiego <strong>delle</strong> funzioni <strong>di</strong><br />

un foglio elettronico, inizialmente trasponiamo la matrice X e successivamente la<br />

moltiplichiamo per la sua forma originaria (ricordandoci che nel calcolo<br />

matriciale il senso della moltiplicazione è obbligato da sinistra a destra) ottenendo<br />

la matrice<br />

X’X = 445,67 379,71<br />

379,71 328,78<br />

che, come si vede, è simmetrica, cioè gli elementi omologhi hanno lo stesso valore,<br />

in quanto essa esprime la somma dei quadrati <strong>delle</strong> variabili nella <strong>di</strong>agonale<br />

maggiore e la somma del loro prodotto negli altri elementi.<br />

Successivamente si calcola l’inversa<br />

(X’X) -1 = 0,14476 -0,1672<br />

-0,1672 0,1963<br />

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e si moltiplica per il prodotto X’y = 75,428<br />

64,828<br />

ottenendo la soluzione desiderata<br />

b = 0,076 (b1)<br />

0,109 (b2)<br />

per cui l’equazione che meglio interpreta il fenomeno stu<strong>di</strong>ato è la seguente<br />

y = 0,076x1 + 0,109x2<br />

Se applichiamo questa equazione ai valori del grasso e <strong>delle</strong> proteine ottenuti<br />

sperimentalmente, troviamo il valore atteso della y E(y) che <strong>di</strong>fferirà dal dato<br />

sperimentale <strong>di</strong> una quantità ε che rappresenta l’errore del modello statistico<br />

applicato. Il risultato è riportato nella tabella dei dati.<br />

6.2 L’in<strong>di</strong>ce genetico<br />

L’IG rappresenta la migliore stima del valore genetico <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo in funzione<br />

<strong>delle</strong> informazioni utilizzate per il suo calcolo. Il caso più semplice è quello in cui<br />

posse<strong>di</strong>amo una sola informazione fenotipica corretta (P) dell’animale che vogliamo<br />

valutare, espressa come deviazione corretta della me<strong>di</strong>a dalla popolazione per il<br />

carattere esaminato. In questo caso la stima del VR può essere effettuata con la<br />

relazione (analoga alla [5] del capitolo 4)<br />

[5] IG = b ⋅ P<br />

in cui il coefficiente b rappresenta l’ere<strong>di</strong>tabilità h 2 . In effetti questa equazione,<br />

utilizzabile per schemi <strong>di</strong> selezione in<strong>di</strong>viduale, ci <strong>di</strong>ce che in assenza <strong>di</strong> altre<br />

informazioni gli in<strong>di</strong>vidui can<strong>di</strong>dati alla se<strong>lezioni</strong> possono essere classificati in base<br />

al solo merito produttivo (con l’assunzione che h 2 sia lo stesso) e che il più<br />

probabile VR <strong>di</strong> ciascuno <strong>di</strong> loro è la frazione me<strong>di</strong>amente ere<strong>di</strong>tabile del fenotipo.<br />

Esempio 6.2 Consideriamo il caso <strong>di</strong> 5 vitelloni dei quali uno solo debba essere<br />

destinato alla riproduzione. Gli accrescimenti me<strong>di</strong> giornalieri (in kg) registrati in<br />

tutto il periodo <strong>di</strong> ingrassamento sono stati i seguenti: 1,56; 1,72; 1,34; 1,43; 1,86.<br />

L’ere<strong>di</strong>tabilità me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> questo carattere è stata stimata in 0,56. L’animale che è<br />

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scelto è l’ultimo ed il suo più probabile VR = 1,86 x 0,56 = 1,04 che rappresenta<br />

anche l’IG del toro.<br />

Dalla relazione [3] riportata nel capitolo 4 sappiamo che il valore <strong>di</strong> “b” può essere<br />

calcolato con il seguente rapporto b = COV (A,P)/V(P), per cui è valida<br />

l’equazione:<br />

[6] V(P)b = COV(A,P)<br />

Poniamo ora <strong>di</strong> <strong>di</strong>sporre <strong>di</strong> un insieme <strong>di</strong> informazioni fenotipiche (P) derivanti da<br />

parenti dell’in<strong>di</strong>viduo can<strong>di</strong>dato alla selezione, espresse sempre come deviazione<br />

corretta dalla me<strong>di</strong>a della popolazione, che possono anche non comprendere il<br />

fenotipo in<strong>di</strong>viduale come nel caso della valutazione <strong>di</strong> un carattere manifesto in un<br />

solo sesso. In questo caso l’IG prende la forma:<br />

[7] IG = b1P1 + b2P2 + ...+ bnPn<br />

in cui “b” rappresenta il fattore <strong>di</strong> ponderazione <strong>delle</strong> informazioni derivanti dai<br />

parenti. Calcolare l’IG significa trovare il miglior pre<strong>di</strong>tore lineare sulla base <strong>delle</strong><br />

informazioni <strong>di</strong>sponibili, cioè trovare la migliore correlazione fra il valore genetico<br />

ad<strong>di</strong>tivo dell’in<strong>di</strong>viduo “A” ed il suo in<strong>di</strong>ce “I” rAI; in altri termini si tratta <strong>di</strong><br />

minimizzare la somma degli scarti quadratici fra questi due valori Σ(I - A) 2 che può<br />

essere ottenuto con l’applicazione dell’equazione normale illustrata nel paragrafo<br />

precedente.<br />

La tecnica <strong>di</strong> risoluzione, che tiene conto della numerosità della fonte <strong>di</strong> ciascuna<br />

informazione e dell’ere<strong>di</strong>tabilità del carattere oggetto <strong>di</strong> selezione, porta al calcolo<br />

<strong>di</strong> un set <strong>di</strong> equazioni lineari che, secondo Pagnacco, possono essere espresse nel<br />

modo seguente:<br />

[8] V(P1) COV(P1P2) ...... COV(P1Pn) b1 COV(P1A)<br />

COV(P2P1) V(P2) ........COV(P2Pn) b2 COV(P2A)<br />

..................... ....... ........ ............ .... = ..........<br />

COV(PnP1) COV(PnP2) ....... V(Pn) bn COV(PnA)<br />

che, se chiamiamo la prima matrice P, il secondo vettore b ed il terzo vettore t,<br />

può essere scritta come:<br />

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[8bis] Pb = t<br />

che è analoga concettualmente alla relazione [6] e la cui soluzione è data dalla<br />

[8 tris] b = P -1 t<br />

Tale soluzione rappresenta il vettore dei coefficienti in grado <strong>di</strong> pesare le<br />

informazioni degli animali imparentati con il can<strong>di</strong>dato alla selezione.<br />

La risoluzione del sistema <strong>di</strong> equazioni richiede il calcolo dei valori <strong>delle</strong> varianze e<br />

<strong>delle</strong> covarianze che riportiamo secondo lo schema <strong>di</strong> Pagnacco che semplifica<br />

quello originale <strong>di</strong> Van Vleck; per effettuare i conti devono essere noti i dati relativi<br />

alla varianza fenotipica del carattere nella popolazione (σ 2 P), all’ere<strong>di</strong>tabilità del<br />

carattere (h 2 ), alla sua ripetibilità ( r) ed ai rapporti <strong>di</strong> parentela interna ed esterna<br />

(cioè fra gli animali e fra loro ed il can<strong>di</strong>dato alla selezione) che legano gli animali<br />

da cui derivano i dati e l’animale considerato.<br />

Per il calcolo <strong>delle</strong> varianze, cioè dei termini della <strong>di</strong>agonale principale, possiamo<br />

avere 3 casi:<br />

1) abbiamo a <strong>di</strong>sposizione la me<strong>di</strong>a aggiustata <strong>di</strong> un solo fenotipo; la varianza è data<br />

da<br />

[9] V(Pi) = σ 2 P<br />

2) <strong>di</strong>sponiamo della me<strong>di</strong>a aggiustata <strong>di</strong> n produzioni misurate sull’in<strong>di</strong>viduo i; la<br />

varianza è calcolabile con<br />

[10] V(Pi) = [1+(n-1)r]/n ⋅ σ 2 P<br />

in cui r è la ripetibilità del carattere; questa relazione è uguale alla [19] del capitolo<br />

3;<br />

3) i dati fenotipici si riferiscono alla me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> p produzioni in<strong>di</strong>viduali misurate su<br />

altrettanti animali che abbiano fra loro uguale relazione <strong>di</strong> parentela (ad es. tutte<br />

mezze sorelle, cioè figlie dello stesso padre e <strong>di</strong> madri <strong>di</strong>verse) ed uguale parentela<br />

con l’in<strong>di</strong>viduo da in<strong>di</strong>cizzare; la varianza è calcolabile con la formula<br />

[11] V(Pi) = [1+ (p-1)Rjjh 2 ]/p ⋅ σ 2 P<br />

in cui Rjj è il coefficiente ad<strong>di</strong>tivo <strong>di</strong> parentela, calcolato come sarà illustrato nel<br />

capitolo 10.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Per il calcolo <strong>delle</strong> covarianze fra i fenotipi degli animali i e j (che è sempre<br />

presente in quanto se gli in<strong>di</strong>vidui sono parenti le loro performances si assomigliano,<br />

cioè covariano) può essere impiegata la relazione<br />

[12] COV(PiPj) = Rij h 2 σ 2 P<br />

che esprime l’entità della riduzione della variabilità genetica della popolazione (h 2 ⋅<br />

σ 2 P = σ 2 G) dovuta al grado <strong>di</strong> parentela (Rij) esistente fra gli animali.<br />

Analogamente la covarianza fra il fenotipo aggiustato dell’in<strong>di</strong>viduo i e il valore<br />

ad<strong>di</strong>tivo A del can<strong>di</strong>dato alla selezione t può essere calcolata con la relazione<br />

[13] COV (Pi, At) = Rit h 2 σ 2 P<br />

che esprime la riduzione della variabilità genetica totale dovuta alla parentela fra il<br />

can<strong>di</strong>dato alla selezione e l’in<strong>di</strong>viduo da cui sono stati ottenuti i dati fenotipici.<br />

Se riportiamo le varianze e le covarianze calcolate in questo modo nell’equazione<br />

matriciale [8] notiamo che il termine σ 2 P compare in entrambi i membri per cui può<br />

essere eliminato; il calcolo è perciò semplificato in quanto è in<strong>di</strong>pendente dal valore<br />

della varianza fenotipica..<br />

Esempio 6.3 Poniamo <strong>di</strong> voler calcolare l’IG per il carattere produzione latte <strong>di</strong> un<br />

ariete <strong>di</strong> razza Sarda che è presente nell’allevamento <strong>di</strong> zio Pasquale e per il quale<br />

<strong>di</strong>sponiamo <strong>di</strong> un insieme <strong>di</strong> informazioni relative al fenotipo della madre<br />

dell’ariete stesso e <strong>di</strong> 40 sue figlie, fra loro mezze sorelle. Perché il calcolo sia<br />

corretto e fornisca risultati atten<strong>di</strong>bili, dobbiamo stu<strong>di</strong>are un piano degli<br />

accoppiamenti che comporti che le pecore accoppiate con l’ariete non siano<br />

parenti fra loro e che rappresentino un campione me<strong>di</strong>o del valore genetico della<br />

popolazione.<br />

La produzione me<strong>di</strong>a aggiustata <strong>delle</strong> 3 lattazioni <strong>di</strong>sponibili della madre<br />

dell’ariete (PM), espressa come scostamento dalla me<strong>di</strong>a della popolazione, è <strong>di</strong><br />

+30kg; quella (PF) <strong>delle</strong> 40 figlie è <strong>di</strong> 21 kg; l’ere<strong>di</strong>tabilità del carattere è <strong>di</strong> 0,29<br />

e la sua ripetibilità è <strong>di</strong> 0,50. L’equazione [7] per il calcolo dell’IG può essere<br />

scritta:<br />

IG = b1(+30) + b2(+21)<br />

Per ottenere la soluzione [8tris] devo calcolare le varianze e le covarianze.<br />

La varianza fenotipica <strong>delle</strong> produzioni della madre la possiamo stimare con la<br />

relazione [10] depurata del valore σ 2 P come detto in precedenza<br />

V(PM) = [1+(n-1)r]/n = [1+(3-1)0,5]/3 =0,667<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Quella dei fenotipi <strong>delle</strong> figlie la calcoliamo invece con la relazione [11] in cui il<br />

coefficiente <strong>di</strong> parentela fra mezze sorelle è 0,25<br />

V(PF) = [1+ (p-1)RFFh 2 ]/p = [1+ (40-1)0,25⋅0,29]/40 = 0,0957<br />

La covarianza fra PM e PF la calcoliamo con la relazione [12], ricordando che la<br />

parentela fra nonne e nipoti è uguale a 0,25<br />

COV(PMPF) = Rij h 2 = 0,25 ⋅ 0,29 = 0,0725<br />

Le covarianze al secondo termine sono calcolate con la [13] tenendo conto che<br />

l’ariete è imparentato tanto con la madre che con le figlie con un coefficiente dello<br />

0,50<br />

COV (PM;F, At) = RM;F, t h 2 = 0,50 ⋅ 0,29 = 0,145<br />

A questo punto possiamo riorganizzare i valori entro le matrici della relazione [8]<br />

0,667 0,0725 b1 0,145<br />

0,0725 0,0957 b2 = 0,145<br />

La inversa P -1 è la seguente<br />

1,6046 -1,2377<br />

-1,237 11,3870<br />

che moltiplicata per il vettore t da il risultato atteso<br />

b = 0,0574<br />

1,4716<br />

L’IG del nostro ariete è allora<br />

IG = 0,0574(+30) + 1,4716(+21) = 32,627<br />

L’IG calcolato su <strong>di</strong>fferenti arieti ci mette in con<strong>di</strong>zione <strong>di</strong> attribuire loro una sorta<br />

<strong>di</strong> pagella che ci consente <strong>di</strong> classificarli in una graduatoria <strong>di</strong> merito dalla quale<br />

attingere per la scelta (selezione) dei migliori riproduttori.<br />

Non ci sarà sfuggito, però a questo punto, che il solo valore dell’IG non è sufficiente<br />

per garantire la qualità “genetica” dell’animale can<strong>di</strong>dato alla selezione. Infatti, se<br />

l’IG è stato ottenuto da poche misurazioni fenotipiche effettuate su parenti lontani<br />

(es. nonna paterna e materna) il suo valore informativo è inferiore a quello <strong>di</strong> un IG<br />

ottenuto da molte informazioni ricavate da parenti stretti (es figlie). La misura della<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

qualità <strong>di</strong> un IG è detta accuratezza e si esprime come coefficiente <strong>di</strong> correlazione<br />

fra il valore dell’in<strong>di</strong>ce genetico I e quello del reale, ma sconosciuto, valore<br />

ad<strong>di</strong>tivo A rIA. L’accuratezza <strong>di</strong> un IG ci fornisce le informazioni necessarie per<br />

confrontare fra loro <strong>di</strong>versi in<strong>di</strong>ci e perciò ci fornisce una misura della loro<br />

affidabilità.<br />

Nel caso più semplice, quello cioè in cui l’in<strong>di</strong>ce sia stato ottenuto da informazioni<br />

fenotipiche relative all’in<strong>di</strong>viduo can<strong>di</strong>dato alla selezione, l’accuratezza è la<br />

correlazione fra valori fenotipici e genotipici e pertanto può essere espressa come<br />

[14] rIA = √h 2 = h<br />

cioè la ra<strong>di</strong>ce quadrata dell’ere<strong>di</strong>tabilità.<br />

Esempio 6.2 (continua) La accuratezza dell’in<strong>di</strong>ce calcolato per il nostro vitellone<br />

è √0,56 = 0,748<br />

Nel caso in cui l’in<strong>di</strong>ce sia stato ricavato da più informazioni, la sua accuratezza<br />

può essere calcolata con la relazione <strong>di</strong> Ronninger e Van Vleck<br />

[15] rIA = √(b1R1t + b2R2t + .. + bnRnt)<br />

che corrisponde all’equazione [14], ma in cui l’ere<strong>di</strong>tabilità è corretta per la<br />

numerosità <strong>delle</strong> informazioni (coefficiente b dell’equazione [7]) e ponderata per il<br />

grado <strong>di</strong> parentela Rit fra l’in<strong>di</strong>viduo t e i suoi parenti i .<br />

Esempio 6.3 (continua) L’accuratezza dell’IG calcolato per l’ariete <strong>di</strong> zio<br />

Pasquale è ottenuta dalla relazione<br />

rIA = √( 0,05743*0,5 + 1,4716*0,5) = 0,8744<br />

E’ ovvio che tanto maggiori sono le informazioni <strong>di</strong>sponibili tanto maggiore è il<br />

valore dell’accuratezza il cui limite, per informazioni infinite, è <strong>di</strong> 1. Questo limite è<br />

raggiungibile dai maschi la cui progenie può essere costituita da decine <strong>di</strong> migliaia<br />

<strong>di</strong> figlie come nel caso dei tori sottoposti a prova <strong>di</strong> progenie ed il cui seme è stato<br />

<strong>di</strong>stribuito con l’impiego dell’inseminazione strumentale. Tuttavia, la soluzione<br />

prospettata per il calcolo dell’IG in questo paragrafo presuppone che non sussista<br />

correlazione ambientale fra i fenotipi misurati nei parenti del can<strong>di</strong>dato alla<br />

selezione, cioè che gli ambienti in cui gli animali sono mantenuti siano in<strong>di</strong>pendenti.<br />

Ciò è ottenibile, nello schema <strong>di</strong> selezione familiare del progeny testing, attraverso<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

la <strong>di</strong>stribuzione a caso <strong>delle</strong> figlie del can<strong>di</strong>dato alla selezione in più allevamenti:<br />

tanto maggiore sarà questa <strong>di</strong>stribuzione tanto migliore sarà l’accuratezza.<br />

A titolo <strong>di</strong> esempio riportiamo da Van Vleck la tabella relativa all’aumento teorico<br />

dell’accuratezza ottenibile da p informazioni filiali nel caso in cui esse siano<br />

in<strong>di</strong>pendenti oppure in cui sussista una covarianza dovuta all’ambiente comune (c)<br />

<strong>di</strong> 1/16<br />

numero figlie (p) accuratezza c =0 accuratezza c=1/16<br />

1 0,25 0,25<br />

3 0,41 0,39<br />

10 0,62 0,54<br />

20 0,76 0,61<br />

50 0,88 0,66<br />

100 0,93 0,69<br />

1000 0,99 0,70<br />

∞ 1,00 0,71<br />

Un ultimo aspetto riguarda il limite <strong>di</strong> accuratezza ottenibile in una femmina: anche<br />

nel caso <strong>di</strong> un carattere manifesto in un solo sesso, come la produzione <strong>di</strong> latte, il<br />

limitato numero <strong>di</strong> figlie (massimo 2,5 nei bovini nell’ipotesi <strong>di</strong> una carriera<br />

riproduttiva me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> 5 parti) comporta una basso contributo all’informazione<br />

ottenibile <strong>di</strong>rettamente dall’animale, per cui il limite teorico, nel caso della<br />

produzione <strong>di</strong> latte la cui ere<strong>di</strong>tabilità sia <strong>di</strong> 0,25, non supera il valore <strong>di</strong> 0,67.<br />

6.3 I limiti dell’in<strong>di</strong>ce genetico<br />

Il principale problema nel calcolo dell’in<strong>di</strong>ce genetico è quello legato alla correzione<br />

dei fenotipi degli animali parenti del soggetto can<strong>di</strong>dato alla selezione. In genere<br />

non si considera la me<strong>di</strong>a generale della popolazione, in quanto costituita dalla<br />

sovrapposizione <strong>di</strong> numerose generazioni, ma quella <strong>di</strong> soggetti della stessa età che<br />

abbiano prodotto in ambienti simili: questi animali prendono il nome <strong>di</strong><br />

contemporanei.<br />

Il caso più comune, che ha riguardato il calcolo dell’IG dei tori <strong>di</strong> razze da latte e<br />

che ha trovato negli anni passati un larghissimo impiego, utilizza un metodo che si<br />

fonda sul confronto della produzione <strong>delle</strong> figlie del toro da valutare con la me<strong>di</strong>a<br />

dei controlli <strong>delle</strong> contemporanee (metodo del confronto contemporaneo). Il<br />

fenotipo <strong>delle</strong> figlie è corretto per le deviazioni sistematiche (intervallo parto<br />

concepimento, durata della lattazione, numero <strong>delle</strong> mungiture, ve<strong>di</strong> par. 3.2.) ed è<br />

calcolato come <strong>di</strong>fferenza con quello <strong>delle</strong> contemporanee presenti nello stesso<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

allevamento e che abbiano partorito da due mesi prima a due mesi dopo le figlie del<br />

toro in esame.<br />

L’impiego <strong>di</strong> questo metodo ha fornito risultati <strong>di</strong>screti, soprattutto nelle prime<br />

generazioni a cui è stato applicato, laddove è stato tenuto conto e sono state corrette<br />

le più importanti fonti <strong>di</strong> errore rappresentate: a) dall’età sulla capacità produttiva<br />

<strong>delle</strong> bovine; b) dalle <strong>di</strong>fferenze ambientali <strong>di</strong>stribuite sistematicamente tra gruppi <strong>di</strong><br />

<strong>di</strong>scendenti quando questi siano tenuti in allevamenti <strong>di</strong>versi o per <strong>di</strong>versi perio<strong>di</strong> <strong>di</strong><br />

tempo; c) dalla possibilità che le vacche controllate costituiscano un gruppo<br />

selezionato geneticamente <strong>di</strong>verso dalla me<strong>di</strong>a dell’allevamento. Nel caso degli<br />

schemi <strong>di</strong> selezione adottati per gli ovini da latte in Italia fino al 1991, ed in<br />

particolare nel caso della razza Sarda, il limitato numero <strong>di</strong> figlie richieste per<br />

considerare un ariete provato, la concentrazione <strong>delle</strong> figlie in uno stesso<br />

allevamento per la bassa efficienza della inseminazione strumentale nella specie, la<br />

non considerazione dell’età <strong>delle</strong> pecore hanno rappresentato i maggiori vincoli<br />

insiti nello schema <strong>di</strong> selezione adottato che hanno decretato il fallimento del<br />

miglioramento genetico per almeno un quin<strong>di</strong>cennio.<br />

Tuttavia, anche qualora tali correzioni siano apportate, il metodo del confronto<br />

contemporaneo per il calcolo dell’IG mostra un insieme <strong>di</strong> <strong>di</strong>fetti il cui effetto è più<br />

evidente man mano che, con il procedere della selezione per generazioni successive,<br />

si evidenzia una variazione sensibile della base genetica a cui i singoli valori devono<br />

essere riferiti. In particolare tali limiti sono importanti relativamente:<br />

a) alla <strong>di</strong>minuzione dell’accuratezza dell’IG derivante dal fatto che il confronto<br />

<strong>di</strong>retto è sviluppato rispetto ad un livello genetico me<strong>di</strong>o <strong>delle</strong> contemporanee e non<br />

considera le <strong>di</strong>fferenze tra i <strong>di</strong>versi allevamenti;<br />

b) alla <strong>di</strong>fficoltà <strong>di</strong> tenere conto <strong>delle</strong> eventuali relazioni <strong>di</strong> parentela che possono<br />

sussistere tra gli animali da valutare e le vacche a cui sono accoppiati, cioè <strong>di</strong><br />

valutare correttamente l’andamento della base genetica nelle successive generazioni<br />

e l’effetto <strong>delle</strong> migliorate tecniche <strong>di</strong> allevamento sul carattere in esame;<br />

c) alla <strong>di</strong>fficoltà <strong>di</strong> quantificare i trends genetici ed ambientali (è un po' il famoso<br />

cane che si morde la coda)..<br />

In generale possiamo affermare che se tutti i fattori ambientali fissi fossero<br />

conosciuti in anticipo, il calcolo dell’IG con l’algoritmo [7] sarebbe non <strong>di</strong>storto, ma<br />

ciò è praticamente impossibile perché si tratta <strong>di</strong> ripulire i dati da tali effetti senza<br />

conoscerne la reale consistenza.<br />

Il superamento <strong>di</strong> tali limiti è stato reso possibile nei primi anni ‘60 dallo sviluppo,<br />

inizialmente teorico e successivamente pratico operato dalla scuola <strong>di</strong> genetica della<br />

Cornell University coor<strong>di</strong>nata da Henderson, <strong>di</strong> un metodo <strong>di</strong> stima simultaneo degli<br />

effetti fissi (allevamento, anno, stagione) e <strong>di</strong> quelli casuali (valori genetici)<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

denominato BLUP (Best Linear Unbiased Pre<strong>di</strong>ction cioè il migliore metodo <strong>di</strong><br />

previsione lineare non <strong>di</strong>storto) .<br />

6.4 Il metodo BLUP per la stima del VR<br />

Come abbiamo visto nel paragrafo 2 <strong>di</strong> questo capitolo, il modello <strong>di</strong> previsione<br />

impiegato per la stima dell’IG è <strong>di</strong> tipo lineare ed è semplificabile nel modo<br />

seguente<br />

[16] yjk = Pjk - μ = Aj + ejk<br />

che significa che i dati produttivi grezzi della progenie del j-mo animale sono<br />

perfettamente corretti per gli effetti sistematici relativi all’ambiente <strong>di</strong> allevamento<br />

(oltreché per quelli elencati nel paragrafo 3.3.3.) cioè per μ: i valori fenotipici<br />

corretti (yjk) sono allora funzione soltanto del contributo genetico ad<strong>di</strong>tivo paterno<br />

(nel caso della valutazione dei maschi) Aj e dell’errore ejk.<br />

Poiché, però, la correzione sistematica dei fenotipi e la valutazione in<strong>di</strong>pendente dei<br />

valori genetici incontrano i limiti illustrati nel paragrafo precedente, il modello<br />

lineare proposto da Henderson tenta <strong>di</strong> stimare simultaneamente gli effetti fissi,<br />

rappresentati dai fattori legati all’ambiente ed alla base genetica dell’allevamento,<br />

da quelli casuali costituiti dal valore genetico degli animali e dall’errore statistico. Il<br />

modello [16], arricchito del fattore fisso relativo all’allevamento (m = mandria),<br />

<strong>di</strong>venta<br />

[17] yijk = Pijk - μ‘ = mi + Aj + eijk<br />

che significa che l’effetto m dell’i-mo allevamento non può essere eliminato<br />

preliminarmente all’analisi dei dati grezzi; questi ultimi possono essere corretti solo<br />

per quei fattori sistematici μ‘ (ad esempio, numero <strong>di</strong> mungiture, lunghezza della<br />

lattazione, ecc..) la cui previsione sia certa.<br />

Un primo esempio <strong>di</strong> stima simultanea degli effetti fissi e <strong>di</strong> quelli casuali l’abbiamo<br />

incontrata nel capitolo 3 (ve<strong>di</strong> esempio 3.8), quando abbiamo scomposto la varianza<br />

fenotipica nelle sue componenti. In quel caso il modello statistico impiegato è stato<br />

un modello misto <strong>di</strong> analisi della varianza; il BLUP è un caso, molto potente e<br />

dotato <strong>di</strong> particolari proprietà, <strong>di</strong> modello misto (comprendente cioè effetti fissi ed<br />

effetti casuali) <strong>di</strong> analisi della varianza (ANOVA = ANalisys Of VAriance)<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Ricor<strong>di</strong>amo qui brevemente che i modelli lineari impiegati in analisi della varianza<br />

possono essere risolti, con l’ausilio <strong>delle</strong> matrici, con il metodo dei minimi quadrati<br />

in cui la matrice <strong>delle</strong> variabili in<strong>di</strong>pendenti è costituita <strong>di</strong> 0 e 1 ed è detta matrice <strong>di</strong><br />

incidenza o matrice del <strong>di</strong>segno sperimentale. Nel caso <strong>di</strong> una ANOVA ad un solo<br />

fattore, il modello lineare è<br />

[18] yij = μ + tj + εij<br />

che tradotto in termini matriciali <strong>di</strong>venta<br />

[19] Y = Xt + e<br />

L’equazione normale <strong>di</strong> soluzione è la [4] t = (X’X) -1 X’y che stima il vettore degli<br />

effetti fissi, per cui l’equazione [18], nel caso <strong>di</strong> 3 livelli del fattore t, può essere<br />

scritta<br />

[19bis] Y = m + t1X1 + t2X2 + t3X3 + e<br />

Esempio 6.4 Supponiamo <strong>di</strong> avere effettuato una sperimentazione con 16<br />

pecorelle, <strong>di</strong>vise in 3 gruppi ai quali abbiamo somministrato una razione con dosi<br />

crescenti <strong>di</strong> concentrati ed abbiamo ottenuto i seguenti risultati produttivi (latte in<br />

g per capo al giorno)<br />

gruppo t1 = 300 g/capo gruppo t2 = 600 g/capo gruppo t3 = 900 g/capo<br />

1215 1267 1567<br />

1344 1435 1498<br />

1267 1347 1655<br />

1189 1543 1577<br />

1322 1669<br />

1399<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

I dati possono essere trascritti nel modello [19] nel seguente modo:<br />

Y m X1 X2 X3 t e<br />

1215 1 1 0 0 t1 1<br />

1344 1 1 0 0 t2 1<br />

1267 1 1 0 0 t3 1<br />

1189 1 1 0 0 1<br />

1267 1 0 1 0 1<br />

1435 1 0 1 0 1<br />

1347 1 0 1 0 + 1<br />

1543 1 0 1 0 1<br />

1322 1 0 1 0 1<br />

1567 1 0 0 1 1<br />

1498 1 0 0 1 1<br />

1655 1 0 0 1 1<br />

1577 1 0 0 1 1<br />

1669 1 0 0 1 1<br />

1399 1 0 0 1 1<br />

e la soluzione è possibile solo se si impiega un artificio per rendere invertibile la<br />

matrice X’X che è singolare; essa rappresenta la matrice <strong>delle</strong> numerosità dei dati<br />

sperimentali in ciascun livello del fattore<br />

X’X = 15 4 5 6<br />

4 4 0 0<br />

5 0 5 0<br />

6 0 0 6<br />

una tecnica impiegabile per rendere la matrice invertibile è quella <strong>di</strong> eliminare la<br />

prima riga e colonna, considerando cioè la me<strong>di</strong>a <strong>delle</strong> y = 0; il vettore <strong>delle</strong><br />

soluzioni allora <strong>di</strong>venta (ricordando che la matrice X non ha la prima riga e la<br />

prima colonna)<br />

t’ = [(X’X) -1 X’Y]’ = 1253 1382 1560<br />

poiché la me<strong>di</strong>a generale è 1419, gli effetti reali dei fattori sono<br />

t°’ = -166 37 141<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

che rappresentano gli effetti <strong>delle</strong> tre <strong>di</strong>verse razioni sulla produzione <strong>di</strong> latte,<br />

relativizzate sulla me<strong>di</strong>a generale.<br />

La soluzione prospettata da Henderson per la stima simultanea degli effetti fissi e <strong>di</strong><br />

quelli casuali introduce, nel metodo dei minimi quadrati, un fattore <strong>di</strong> correzione<br />

rappresentato dal rapporto fra la varianza residua e quella del fattore casuale (che<br />

nel nostro caso è il valore genetico dell’animale da stimare). Per capire meglio il<br />

metodo, occorre però che impariamo alcuni fondamenti del BLUP circoscritti sue<br />

alle applicazioni in genetica quantitativa.<br />

6.4.1 I fondamenti del metodo BLUP<br />

Il BLUP è un metodo <strong>di</strong> calcolo (e non <strong>di</strong> selezione) che impiega le informazioni<br />

derivanti da uno schema selettivo che, in origine, era ascrivibile all’interno dei<br />

meto<strong>di</strong> <strong>di</strong> selezione familiare me<strong>di</strong>ante prova <strong>di</strong> progenie. Con il BLUP la stima dei<br />

valori genetici dei riproduttori è condotta sulla base del confronto fra la produzione<br />

me<strong>di</strong>a <strong>delle</strong> figlie e quella <strong>delle</strong> contemporanee figlie <strong>di</strong> altri riproduttori nel<br />

medesimo allevamento. Le <strong>di</strong>fferenze con il confronto contemporaneo si colgono<br />

subito se si analizza lo schema <strong>di</strong> Danell in cui a ciascun asterisco corrisponde una<br />

figlia in produzione<br />

Padre Allevamento<br />

1 2 3 4 .......<br />

A * *<br />

B * *<br />

C * *<br />

D * *<br />

.<br />

.<br />

Con il BLUP le figlie dell’animale A nell’allevamento 1 sono confrontate con quelle<br />

dell’animale D il quale, però, avendo figlie anche nell’allevamento 3, può essere<br />

confrontato anche con il padre C, per cui anche A e C risultano confrontati fra loro,<br />

anche se in<strong>di</strong>rettamente, per il tramite del padre D. Con strutture più ampie, quali<br />

quelle che si riscontrano normalmente nella realtà operativa, ciascun animale può<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

essere confrontato <strong>di</strong>rettamente o in<strong>di</strong>rettamente con gli altri; i padri che consentono<br />

questi collegamenti sono detti animali ponte (tori ponte nel caso dei bovini).<br />

Ogni confronto è effettuato rispetto ad un livello specifico e non rispetto al livello<br />

genetico me<strong>di</strong>o dei <strong>di</strong>versi allevamenti, per cui il BLUP consente <strong>di</strong> correggere la<br />

<strong>di</strong>storsione dovuta alle eventuali <strong>di</strong>fferenze genetiche fra gli allevamenti.<br />

Affinché il confronto sia possibile è necessario che la struttura dei dati da elaborare<br />

sia tale da presentare una certa sovrapposizione fra gli allevamenti nell’impiego dei<br />

padri. In ciascun allevamento, inoltre, devono essere presenti almeno due figlie <strong>di</strong><br />

due padri <strong>di</strong>versi, per cui gli animali più anziani, che hanno figlie <strong>di</strong>stribuite in molti<br />

allevamenti, fungono <strong>di</strong> fatto, da ponte per quelli più giovani le cui figlie sono<br />

presenti in pochi allevamenti.<br />

Il modello lineare misto [17] può essere scritto in forma matriciale nel modo<br />

seguente<br />

[20] Y = Xb + Zu + e<br />

in cui Y è il vettore <strong>delle</strong> osservazioni (fenotipi corretti <strong>delle</strong> figlie), b è il vettore<br />

degli effetti fissi (variazioni sistematiche dovute all’anno, alla stagione del parto ed<br />

all’allevamento detti effetti HYS = herd, year, season), u è il vettore degli effetti<br />

casuali (il VR dei padri) ed e rappresenta il vettore degli errori (cioè degli effetti non<br />

spiegati dal modello). X e Z sono matrici <strong>di</strong> incidenza (costituite da 1 e 0) che<br />

mostrano la provenienza dei dati.<br />

Per esaminare la forma esplicita <strong>delle</strong> equazioni [20] facciamo riferimento allo<br />

schema <strong>di</strong> Danell in cui la produzione filiale è yij , presente nell’i-mo allevamento e<br />

figlia del j-mo padre<br />

Y = X b + Z u + e<br />

y11 1 0 0 0 b1 1 0 0 0 u1 e11<br />

y12 1 0 0 0 b2 0 1 0 0 u2 e12<br />

y22 0 1 0 0 b3 0 1 0 0 u3 e22<br />

y24 0 1 0 0 b4 0 0 0 1 u4 e24<br />

y33 0 0 1 0 0 0 1 0 e33<br />

y34 0 0 1 0 0 0 0 1 e34<br />

y41 0 0 0 1 1 0 0 0 e41<br />

y43 0 0 0 1 0 0 1 0<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Dato il vettore Y il problema è quello <strong>di</strong> stimare i vettori b e u in modo da rendere<br />

minima la <strong>di</strong>fferenza fra i valori <strong>delle</strong> y calcolati con il modello lineare con quelli<br />

realmente osservati. Solitamente si assume che gli effetti casuali ed i termini <strong>di</strong><br />

errore abbiano me<strong>di</strong>a zero , che non siano correlati e che abbiano le seguenti matrici<br />

<strong>di</strong> varianza<br />

[21] V(u) = E(u’u) = G ; V(e) = E(e’e) = R<br />

in quanto la trasposta (u’ , e’) moltiplicata per la matrice originaria fornisce la<br />

somma dei quadrati.<br />

Il sistema <strong>di</strong> equazioni proposto da Henderson capace <strong>di</strong> stimare simultaneamente<br />

gli effetti fissi e quelli casuali è il seguente<br />

[22] X’R -1 X X’ R -1 Z b* X’ R -1 Y<br />

=<br />

Z’ R -1 X Z’ R -1 Z+G -1 u* Z’ R -1 Y<br />

dove gli asterischi in<strong>di</strong>cano le stime dei vettori b ed u ottenute con questo metodo.<br />

6.4.2 Le proprietà degli stimatori BLUP<br />

Gli stimatori ottenuti con il modello [22] godono <strong>delle</strong> seguenti importanti proprietà:<br />

a) le previsioni relative agli effetti casuali - come i valori genetici dei padri - sono<br />

non <strong>di</strong>storte (unbiased), così come sono non <strong>di</strong>storte le stime degli effetti fissi;<br />

b) la varianza degli stimatori è minima e, poiché non esiste altro metodo che<br />

produca varianza minore dei parametri, tali stimatori sono i migliori (the best) fra<br />

tutti gli stimatori lineari;<br />

c) la correlazione fra i valori stimati e quelli reali è massima.<br />

Tuttavia, il metodo BLUP richiede una equazione per ciascun livello dei ciascun<br />

fattore considerato e ciò, nei problemi concreti <strong>di</strong> selezione dei migliori riproduttori,<br />

può significare la necessità <strong>di</strong> trattare <strong>di</strong>verse migliaia <strong>di</strong> equazioni in altrettante<br />

incognite. In questi casi è in<strong>di</strong>spensabile il ricorso a vari algoritmi semplificatori<br />

quali l’assorbimento <strong>di</strong> equazioni, l’iterazione e l’or<strong>di</strong>namento.<br />

79


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____________________________________________________________________________________<br />

6.4.3 Un modello BLUP semplificato per la valutazione genetica dei maschi (sire<br />

model)<br />

Il modello più semplice <strong>di</strong> BLUP è il cosidetto SIRE-MODEL attualmente<br />

impiegato nella valutazione dei tori per i caratteri legati alla morfologia (ve<strong>di</strong><br />

capitolo 2). Concettualmente questo modello è definibile con la formula del tipo:<br />

Y = M + A + E<br />

in cui Y è il carattere ptoduttivo considerato, M è un effetto fisso (normalmente<br />

allevamento - anno - stagione), A è l’effetto casuale del toro (cioè esattamente la<br />

stima del VR che stiamo cercando) ed E è l’errore. In questo caso nelle equazioni<br />

Henderson [22] la matrice R = V(e) è <strong>di</strong>agonale del tipo Iσ 2 e (cioè è una matrice<br />

che contiene nella <strong>di</strong>agonale principale le varianze dell’errore) e la matrice G è<br />

anch’essa <strong>di</strong>agonale del tipo Iσ 2 u . Entrambi i membri della [22] possono essere<br />

<strong>di</strong>visi per R -1 e l’equazione matriciale <strong>di</strong> Henderson <strong>di</strong>venta<br />

(matrice H) (t) (D)<br />

[23] X’X X’Z b* X’Y<br />

=<br />

Z’X Z’Z + (σ 2 e/σ 2 u)I u* Z’Y<br />

Queste equazioni si risolvono facilmente con il proce<strong>di</strong>mento della [19] qualora sia<br />

noto il rapporto tra la varianza <strong>di</strong> errore e quella dei valori genetici. Questo rapporto<br />

può essere stimato empiricamente, tenendo conto che la varianza fenotipica V(y) del<br />

modello [16] <strong>di</strong>pende esclusivamente dal contributo della varianza genetica ad<strong>di</strong>tiva<br />

V(A) e da quella dell’errore V(e) cioè V(y) = V(u) + V(e), nel seguente modo:<br />

1) sappiamo che V(u) = 1/4 V(A) per cui V(u) = 1/4 h 2 V(y);<br />

2) poiché V(e) = V(y) - V(u) la V(e) = (1 - 1/4 h 2 ) V(y);<br />

3) il rapporto cercato <strong>di</strong>venta allora (4-h 2 )/h 2 che nel caso in cui l’ere<strong>di</strong>tabilità sia <strong>di</strong><br />

0,25 prende il valore <strong>di</strong> 15.<br />

Esempio 6.5 Applichiamo ora il sire model ad un (limitato) esempio concreto.<br />

Poniamo <strong>di</strong> dover valutare il VR <strong>di</strong> 3 arieti (Gaspare G, Melchiorre M e<br />

Baldassarre B) che hanno avuto figlie negli allevamenti <strong>di</strong> zio Pasquale<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

(allevamento A), <strong>di</strong> padrino Giacomo (allevamento B) e <strong>di</strong> compare Salvatore<br />

(allevamento C), secondo lo schema seguente<br />

Ariete Allevamento<br />

A B C<br />

G * *<br />

M * *<br />

B *<br />

le quali, in prima lattazione, hanno fatto registrare le seguenti produzioni totali in<br />

kg:<br />

Ariete Allevamento Produzione<br />

Gaspare zio Pasquale 178<br />

190<br />

175<br />

Gaspare padrino Giacomo 150<br />

163<br />

171<br />

Melchiorre padrino Giacomo 201<br />

213<br />

190<br />

183<br />

Melchiorre compare Salvatore 178<br />

193<br />

Baldassarre compare Salvatore 144<br />

159<br />

149<br />

Ora dobbiamo or<strong>di</strong>nare i dati secondo lo schema <strong>di</strong> Danell<br />

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Corso <strong>di</strong> Zootecnica Generale e Alimentazione animale - Modulo <strong>di</strong> Zootecnica Generale<br />

Miglioramento genetico degli animali in produzione zootecnica<br />

____________________________________________________________________________________<br />

Y = X b + Z u<br />

A B C G M B<br />

178 1 0 0 b1 1 0 0 u1<br />

190 1 0 0 b2 1 0 0 u2<br />

175 1 0 0 b3 1 0 0 u3<br />

150 0 1 0 1 0 0<br />

163 0 1 0 1 0 0<br />

171 0 1 0 1 0 0<br />

201 0 1 0 0 1 0<br />

213 0 1 0 0 1 0<br />

190 0 1 0 0 1 0<br />

183 0 1 0 0 1 0<br />

178 0 0 1 0 1 0<br />

193 0 0 1 0 1 0<br />

144 0 0 1 0 0 1<br />

159 0 0 1 0 0 1<br />

149 0 0 1 0 0 1<br />

Le matrici da impiegare per la costruzione del sistema <strong>di</strong> Henderson sono:<br />

X’X = 3 0 0;X’Z = 3 0 0; Z’Z = 6 0 0; Z’X = 3 3 0;X’Y = 4710; Z’Y= 24743<br />

0 7 0 3 4 0 0 6 0 0 4 2 16610 28492<br />

0 0 5 0 2 3 0 3 0 0 0 3 7787 9607<br />

e, tenuto conto che consideriamo un h 2 pari a 0,29, la matrice Z’Z avrà sommati<br />

nella sua <strong>di</strong>agonale principale il valore 12,7931 che rappresenta il rapporto fra le<br />

varianze <strong>di</strong> errore e genetica. Il sistema <strong>di</strong> equazioni potrà ora essere scritto<br />

secondo la [23]<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

H t D<br />

3 0 0 3 0 0 b1 4710<br />

0 7 0 3 4 0 b2 16610<br />

0 0 5 0 2 3 b3 7787<br />

0 0 5 18,79 0 0 u1 24743<br />

0 4 2 0 18,79 0 u 2 28492<br />

0 0 3 0 0 15,79 u3 9607<br />

La soluzione cercata è t = (H’H) -1 H’D che da i risultati seguenti:<br />

b1 = 184,48; b2 = 179,66; b3= 163,70; u1 = -3,481; u2 = 5,96; u3 = -2,476.<br />

Quel che ci interessa, in questo caso, è la <strong>di</strong>fferenza fra il VR stimato degli arieti e<br />

se poniamo quella <strong>di</strong> Gaspare = 0, il VR <strong>di</strong> Melchiorre è <strong>di</strong> + 9,8 e quello <strong>di</strong><br />

Baldassarre è <strong>di</strong> +1,365. A questo punto possiamo or<strong>di</strong>nare gli arieti per merito<br />

proclamare il vincitore:<br />

1° classificato Melchiorre; 2° classificato Baldassarre; 3° classificato Gaspare<br />

(cioè sbattuto fuori all’esame nel caso della selezione <strong>di</strong> soli 2 animali !!).<br />

Una interessante verifica della flessibilità del metodo BLUP riguarda la semplicità<br />

con cui le equazioni <strong>di</strong> Henderson, ed in particolare il modello semplificato [23],<br />

possono essere adattati in modo da tenere conto dell’eventuale presenza <strong>di</strong> rapporti<br />

<strong>di</strong> parentela tra gli animali in prova. Ciò è possibile con l’inserimento nei calcoli <strong>di</strong><br />

una matrice <strong>di</strong> parentela che tende a ridurre l’entità della varianza genetica calcolata<br />

con le procedure viste in precedenza. In questa sede non approfon<strong>di</strong>remo il<br />

problema <strong>delle</strong> parentele, ma se siete interessati potrete trovare utili informazioni sul<br />

capitolo <strong>di</strong> Ronningen e Van Vleck del libro e<strong>di</strong>to da Chapman (cfr la bibliografia).<br />

6.5 Dal BLUP all’Animal Model<br />

Il sistema <strong>di</strong> calcolo BLUP, impiegato nella valutazione genetica dei tori <strong>di</strong> razza<br />

Frisona Italiana fino al 1988 e adottato anche dalle altre razze da latte (Bruna e<br />

Pezzata Rossa) con varie mo<strong>di</strong>ficazioni, è stato utilizzato anche per la stima del VR<br />

<strong>delle</strong> vacche le quali sono state così classificate su scala nazionale.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Un ulteriore sviluppo dei meto<strong>di</strong> <strong>di</strong> calcolo è avvenuto con l’adozione del modello<br />

animale, generalmente conosciuto come Animal Model.<br />

E’ chiamata animal model una procedura <strong>di</strong> tipo BLUP che consente <strong>di</strong> valutare<br />

contemporaneamente i tori e le vacche appartenenti ad una popolazione comune.<br />

Le tecniche <strong>di</strong> calcolo per la risoluzione <strong>di</strong> un modello animale sono molto<br />

sofisticate e richiedono l’uso <strong>di</strong> computer con elevata potenza <strong>di</strong> elaborazione dal<br />

momento che il sistema <strong>di</strong> equazioni da risolvere è <strong>di</strong> un or<strong>di</strong>ne superiore al numero<br />

dei dati utilizzati.<br />

Concettualmente l’Animal Model è la logica evoluzione dei modelli misti in quanto<br />

deriva dalla fusione dei meto<strong>di</strong> usati per la valutazione separata dei maschi e <strong>delle</strong><br />

femmine; in esso infatti i valori genetici <strong>di</strong> tutti gli animali della popolazione sono<br />

inclusi e stimati simultaneamente.<br />

Questo modello è stato adottato inizialmente dalla Frisona Italiana (1989) e<br />

successivamente dalle altre razze bovine da latte ed anche, recentemente, dalla<br />

razza ovina Sarda.<br />

Prima <strong>di</strong> effettuare il calcolo, i dati fenotipici derivanti dai controlli funzionali sono<br />

aggiustati per i soliti fattori <strong>di</strong> variabilità ambientale conosciuta (età al parto, numero<br />

<strong>di</strong> mungiture, lunghezza della lattazione) ed, una volta resi confrontabili, possono<br />

essere elaborati in un modello del tipo:<br />

[24] Y = M + P + A + E<br />

dove Y rappresenta la produzione (kg <strong>di</strong> latte, <strong>di</strong> grasso, ecc..), M è la me<strong>di</strong>a del<br />

gruppo <strong>di</strong> management specifica <strong>di</strong> un dato allevamento (la cui funzione è quella <strong>di</strong><br />

confrontare una femmina con le sue contemporanee che hanno prodotto nelle stesse<br />

con<strong>di</strong>zioni ambientali), P rappresenta l’effetto dell’ambiente permanente animale, A<br />

è l’effetto del genotipo <strong>delle</strong> vacche, E è la somma <strong>di</strong> tutti gli effetti non specificati<br />

dal modello e rappresenta la quota <strong>di</strong> Y che il modello non è in grado <strong>di</strong> spiegare.<br />

La caratteristica più rilevante del modello consiste nel fatto che i maschi non<br />

entrano <strong>di</strong>rettamente nel modello, ma attraverso una enorme matrice <strong>di</strong> parentela che<br />

contiene tutte le parentele conosciute e che consente <strong>di</strong> collegare i valori genetici <strong>di</strong><br />

tutti gli animali della popolazione. Tramite questa struttura un animale è collegato<br />

<strong>di</strong>rettamente ai suoi genitori ed agli eventuali figli così che il suo in<strong>di</strong>ce viene<br />

corretto per i loro in<strong>di</strong>ci e viceversa. Poiché anche loro sono collegati ai genitori ed<br />

ai figli in un enorme albero genealogico, l’in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> un animale è corretto anche per i<br />

più lontani parenti.<br />

In sintesi, un maschio ed una femmina risultano valutati, oltre che sulla base <strong>delle</strong><br />

proprie lattazioni (ovviamente le sole vacche), anche sulle lattazioni <strong>delle</strong> figlie, su<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

quelle della madre, su quelle <strong>delle</strong> sorelle ed eventualmente su quelle <strong>delle</strong> nipoti.<br />

La considerazione simultanea <strong>di</strong> tutte le relazioni <strong>di</strong> parentela produce infine anche<br />

vantaggi notevoli in relazione all’accuratezza con cui possono essere stimati i valori<br />

genetici <strong>delle</strong> potenziali madri <strong>di</strong> tori.<br />

Attualmente, nella valutazione del VR dei bovini da latte, il modello utilizzato usa<br />

tre categorie <strong>di</strong> informazioni:<br />

1) quelle relative all’animale che si intende valutare;<br />

2) quelle relative alla me<strong>di</strong>a dell’in<strong>di</strong>ce genetico dei genitori;<br />

3) quelle relative ai figli dell’animale can<strong>di</strong>dato.<br />

Ad esempio, nel calcolo dell’in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> una vacca al 3° parto sono considerati: la<br />

me<strong>di</strong>a corretta <strong>delle</strong> sue 3 lattazioni; la me<strong>di</strong>a degli in<strong>di</strong>ci genetici dei genitori che<br />

veicolano tutte le altre informazioni sugli ascendenti; la produzione dell’eventuale<br />

figlia del primo parto. L’in<strong>di</strong>ce genetico <strong>di</strong> un toro è invece stimato con le sole<br />

informazioni degli ascendenti e <strong>delle</strong> figlie; quello <strong>di</strong> un torello soltanto con le<br />

informazioni degli ascendenti: in questo caso l’in<strong>di</strong>ce prende il nome <strong>di</strong> in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong><br />

pe<strong>di</strong>gree.<br />

Un aspetto molto importante è che la parte <strong>delle</strong> informazioni <strong>delle</strong> figlie è corretta<br />

per l’in<strong>di</strong>ce me<strong>di</strong>o degli accoppiamenti, cioè per il valore genetico me<strong>di</strong>o <strong>delle</strong><br />

femmine con cui il maschio da valutare è stato accoppiato.<br />

6.6 L’in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> pe<strong>di</strong>gree<br />

La <strong>di</strong>sponibilità <strong>di</strong> in<strong>di</strong>ci genetici calcolati con grande accuratezza per i maschi e<br />

con la massima accuratezzza possibile per le femmine, nel caso <strong>di</strong> caratteri manifesti<br />

in un solo sesso come la porduzione del latte, ci consente <strong>di</strong> utilizzare queste<br />

informazioni per stimare il valore genetico <strong>di</strong> un animale can<strong>di</strong>dato alla selezione.<br />

L’in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> pe<strong>di</strong>gree (IP) si ottiene dalla semisomma degli in<strong>di</strong>ci BLUP-animal<br />

model del padre e della madre:<br />

[25] IP = ½ (IGpadre + IGmadre)<br />

Nel caso in cui non fossero <strong>di</strong>sponibili in<strong>di</strong>ci materni, questa informazione può<br />

essere convenientemente sostituita da quella del padre materno secondo la<br />

relazione:<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

[26] IP = ½ IGpadre + ¼ IGpadre della madre<br />

La precisione <strong>di</strong> questa stima non è elevatissima e si aggira sul 50%;<br />

consideriamo però che tale valutazione può essere fatta precocemente, molto<br />

prima cioè che il carattere possa manifestarsi e che consente così <strong>di</strong><br />

preselezionare in<strong>di</strong>vidui (can<strong>di</strong>dati) da aviare successivamente alla selezione vera<br />

a propria. L’in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> pe<strong>di</strong>gree è, infine, <strong>di</strong> grande utilità per gli impren<strong>di</strong>tori che<br />

sono orientati verso l’applicazione <strong>di</strong> schemi <strong>di</strong> selezione giovanile per i quali la<br />

per<strong>di</strong>ta <strong>di</strong> precisione nella stima del valore genetico <strong>di</strong> un animale è compensato<br />

dalla notevole riduzione dell’intervallo fra le generazioni.<br />

Questi argomenti saranno approfon<strong>di</strong>ti nel capitolo 7 in cui vedremo che la velocità<br />

<strong>di</strong> selezione è funzione dell’accuratezza nella valutazione genetica e del tempo che<br />

ci impieghiamo per ottenere questa valutazione.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

7. LA RISPOSTA ALLA SELEZIONE<br />

Una volta che abbiamo valutato i riproduttori e li abbiamo scelti secondo criteri <strong>di</strong><br />

selezione precisi, dobbiamo cimentarci con il più importante passaggio <strong>di</strong> qualsiasi<br />

attività economica: la previsione della risposta ottenibile con un determinato<br />

progetto selettivo e la verifica a posteriori dei risultati raggiunti. Allo scopo il<br />

miglioramento genetico impiega il parametro della risposta alla selezione che<br />

comprende un insieme <strong>di</strong> modelli matematici per la valutazione del grado <strong>di</strong><br />

efficacia <strong>di</strong> un determinato schema <strong>di</strong> selezione.<br />

La risposta alla selezione misura il guadagno (o la per<strong>di</strong>ta) cumulativo realizzato per<br />

un determinato carattere quantitativo a seguito della selezione <strong>di</strong>rezionale (=<br />

mo<strong>di</strong>fica del valore me<strong>di</strong>o del carattere quantitativo da una generazione all’altra)<br />

degli animali. In realtà ciò che noi osserviamo è lo spostamento della me<strong>di</strong>a della<br />

popolazione in ragione del cambiamento <strong>di</strong> frequenza dei geni dovuto alla<br />

preferenza <strong>di</strong> alcuni a scapito <strong>di</strong> altri.<br />

In zootecnica la selezione artificiale è il più importante agente del miglioramento<br />

genetico, ma altre due cause naturali sono attive nel determinare la variazione <strong>delle</strong><br />

frequenze geniche: le <strong>di</strong>fferenze <strong>di</strong> fertilità fra gli in<strong>di</strong>vidui selezionati e le <strong>di</strong>fferenze<br />

<strong>di</strong> sopravvivenza fra gli in<strong>di</strong>vidui <strong>delle</strong> <strong>di</strong>verse generazioni. Tali cause ,<br />

assolutamente importanti nel campo della selezione naturale e note con il termine <strong>di</strong><br />

fitness, sono <strong>di</strong> solito trascurate in quella artificiale i cui modelli <strong>di</strong> riferimento<br />

assumono uguale fertilità ed uguale sopravvivenza degli in<strong>di</strong>vidui <strong>delle</strong> generazioni<br />

che si succedono.<br />

7.1 La risposta alla selezione<br />

La risposta alla selezione <strong>di</strong> un carattere quantitativo, anche detta progresso<br />

genetico ( R), misura lo spostamento della me<strong>di</strong>a della popolazione per effetto della<br />

selezione, secondo la relazione:<br />

[1] R = s h 2<br />

in cui s è il <strong>di</strong>fferenziale <strong>di</strong> selezione, cioè la <strong>di</strong>fferenza fra il fenotipo me<strong>di</strong>o del<br />

gruppo selezionato e la me<strong>di</strong>a della popolazione (Figura 1), e h 2 l’ere<strong>di</strong>tabilità.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Prima <strong>di</strong> spiegare il significato della relazione occorre delimitarne gli ambiti <strong>di</strong><br />

applicabilità. La [1] è valida per un modello <strong>di</strong> popolazione in cui:<br />

a) il fenotipo me<strong>di</strong>o è uguale al genotipo me<strong>di</strong>o cioè non vi è dominanza o epistasi;<br />

b) la sola forza che agisce sulla popolazione è la selezione;<br />

c) la selezione è effettuata per troncatura <strong>di</strong> una <strong>di</strong>stribuzione normale , cioè una<br />

soglia fissa separa i riproduttori selezionati dagli animali eliminati dalla selezione<br />

(Figura 2);<br />

d) gli accoppiamenti nel gruppo selezionato sono casuali;<br />

e) ogni generazione sostituisce completamente la precedente per cui non si hanno<br />

sovrapposizioni.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Figura 1 - Il <strong>di</strong>fferenziale selettivo è la <strong>di</strong>fferenza fra la me<strong>di</strong>a della<br />

popolazione “m” e quella del gruppo selezionato “m1”.<br />

frequenza<br />

0,006<br />

0,005<br />

0,004<br />

0,003<br />

0,002<br />

0,001<br />

0<br />

50<br />

65<br />

80<br />

95<br />

110<br />

125<br />

140<br />

Distribuzione dei fenotipi<br />

155<br />

170<br />

185<br />

89<br />

200<br />

Latte<br />

<strong>di</strong>ff.sel.<br />

m m1<br />

Figura 2 - La troncatura della <strong>di</strong>stribuzione normale dei fenotipi dovuta<br />

alla selezione del gruppo plusvariante<br />

frequenza<br />

0,006<br />

0,005<br />

0,004<br />

0,003<br />

0,002<br />

0,001<br />

0<br />

50<br />

65<br />

80<br />

95<br />

110<br />

125<br />

140<br />

215<br />

230<br />

245<br />

Distribuzione dei fenotipi<br />

155<br />

170<br />

185<br />

200<br />

Latte<br />

<strong>di</strong>ff.sel.<br />

260<br />

275<br />

290<br />

m m1<br />

215<br />

230<br />

245<br />

260<br />

275<br />

290<br />

305<br />

305<br />

320<br />

punto <strong>di</strong><br />

troncatura<br />

Ovviamente le popolazioni zootecniche reali sono più o meno vicine a questa<br />

popolazione ideale; i casi pratici possono però essere trattati come un adattamento<br />

<strong>di</strong> quelli teorici.<br />

320<br />

335<br />

335<br />

350<br />

350


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Ritornando alla relazione [1], essa è stata dedotta dall’osservazione che, se<br />

accoppiamo una popolazione a random ed osserviamo le coppie <strong>di</strong> dati <strong>delle</strong><br />

deviazioni parentali (ΔPp), espresse come me<strong>di</strong>a <strong>delle</strong> deviazioni paterne e materne,<br />

e <strong>di</strong> quelle filiali (ΔPf), espresse come me<strong>di</strong>a della progenie, dalla me<strong>di</strong>a dei<br />

fenotipi della popolazione, l’equazione della retta <strong>di</strong> regressione è data dalla (Figura<br />

3):<br />

[2] ΔPf = b ΔPp<br />

Figura 3 - Regressione fra deviazioni fenotipiche parentali e filiali.<br />

ΔPf<br />

Questa relazione è analoga alla precedente in quanto, se pren<strong>di</strong>amo in esame il<br />

gruppo plusvariante <strong>di</strong> fenotipi parentali ed i relativi fenotipi della progenie, la<br />

me<strong>di</strong>a <strong>delle</strong> deviazioni <strong>di</strong> entrambi altro non è che il <strong>di</strong>fferenziale selettivo, per il<br />

primo (s = ΔPp) , e la risposta alla selezione per il secondo (R = ΔPf); il coefficiente<br />

<strong>di</strong> regressione b misura invece l’ere<strong>di</strong>tabilità, come visto nel capitolo 4.<br />

Esempio 7.1 Consideriamo la popolazione <strong>di</strong> pecore <strong>di</strong> razza Sarda la cui me<strong>di</strong>a<br />

produttiva sia <strong>di</strong> 185 kg per lattazione e la deviazione standard fenotipica sia <strong>di</strong> 71<br />

kg (dati <strong>di</strong> Sanna et al., 1995). Poniamo che la me<strong>di</strong>a fenotipica del gruppo<br />

selezionato sia <strong>di</strong> kg 250 e che l‘ere<strong>di</strong>tabilità sia del 27%; la risposta alla<br />

selezione attesa nella generazione successiva è allora:<br />

R = (250-185) * 0,27 = 17,6 kg <strong>di</strong> latte<br />

90<br />

ΔPP


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cioè la me<strong>di</strong>a produttiva della generazione successiva sarà<br />

μ = 185 + 17,6 = 202,6 kg<br />

7.2 L’intensità <strong>di</strong> selezione<br />

Il <strong>di</strong>fferenziale selettivo s non è l’unico parametro in grado <strong>di</strong> fornire una misura<br />

della pressione <strong>di</strong> selezione. Di solito si preferisce impiegare l’intensità <strong>di</strong> selezione<br />

i che rappresenta il <strong>di</strong>fferenziale selettivo standar<strong>di</strong>zzato, cioè:<br />

[3] i = s/σp<br />

Questa relazione introduce il concetto <strong>di</strong> standar<strong>di</strong>zzazione: qualsiasi <strong>di</strong>stribuzione<br />

normale può essere trasformata in una <strong>di</strong>stribuzione standar<strong>di</strong>zzata (variabile z), che<br />

per definizione è una <strong>di</strong>stribuzione gaussiana con me<strong>di</strong>a zero e deviazione standard<br />

1, me<strong>di</strong>ante la <strong>di</strong>visione <strong>di</strong> ciascuno scarto (variante - me<strong>di</strong>a) per la deviazione<br />

standard. La funzione prende allora la forma:<br />

[4] z = 1/√π exp(-z 2 /2)<br />

che rende molto più semplice, come vedremo meglio in seguito, il calcolo <strong>delle</strong> aree<br />

sottese dalla <strong>di</strong>stribuzione. La standar<strong>di</strong>zzazione permette inoltre <strong>di</strong> comparare gli<br />

sforzi compiuti con la selezione per due caratteri <strong>di</strong>fferenti.<br />

Esempio 7.2 Consideriamo l’esempio precedente in cui la razza ovina Sarda è<br />

stata caratterizzata da una produzione <strong>di</strong> latte <strong>di</strong> 185 kg e da una deviazione<br />

standard fenotipica <strong>di</strong> 71 kg; poniamo che essa sia selezionata oltre che per la<br />

quantità <strong>di</strong> latte prodotto anche per il contenuto lipi<strong>di</strong>co <strong>di</strong> questo e che i valori<br />

fenotipici della me<strong>di</strong>a e della deviazione standard siano 6,7% e 1,2%. Se il<br />

gruppo degli animali selezionati ha una me<strong>di</strong>a fenotipica <strong>di</strong> 250 kg <strong>di</strong> latte<br />

prodotto e <strong>di</strong> 6,8% <strong>di</strong> grasso, si può facilmente verificare che l’intensità <strong>di</strong><br />

selezione applicata ai due caratteri è <strong>di</strong>versa:<br />

Carattere sp s i<br />

Produzione latte 71 kg 65 kg 0,92<br />

Grasso 1,2% 0,1% 0,08<br />

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L’intensità <strong>di</strong> selezione è in<strong>di</strong>ce a<strong>di</strong>mensionale in quanto deriva da un rapporto fra<br />

due entità (il <strong>di</strong>fferenziale selettivo e la deviazione standard fenotipica) espresse<br />

nella stessa unità <strong>di</strong> misura. La sua utilità risiede, soprattutto, nella semplice<br />

relazione che esiste fra i e la percentuale (p) degli animali che sono riservati come<br />

riproduttori (tasso <strong>di</strong> selezione):<br />

[5] i = z/p<br />

dove z è l’or<strong>di</strong>nata ottenibile dalla funzione [4] che corrisponde al punto <strong>di</strong><br />

troncatura della figura 2. L’intensità <strong>di</strong> selezione può essere fissata in due mo<strong>di</strong>:<br />

a) si stabilisce il livello fenotipico minimo al <strong>di</strong> sopra del quale tutti gli animali sono<br />

avviati alla riproduzione (ad es. 210 kg <strong>di</strong> latte nel nostro esempio) ed in tal modo si<br />

ottiene la percentuale della popolazione da far riprodurre;<br />

b) si stabilisce la quota della popolazione che deve essere messa in riproduzione e,<br />

in tal modo, si ottiene la soglia al <strong>di</strong> sopra della quale operare la selezione. Nella<br />

pratica si opera quasi esclusivamente nel secondo modo in quanto l’intensità <strong>di</strong><br />

selezione è <strong>di</strong> solito vincolata alla <strong>di</strong>mensione della quota <strong>di</strong> rimonta che, nel caso<br />

<strong>delle</strong> femmine, è legata alla carriera produttiva e, nel caso dei maschi, è legata alla<br />

carriera riproduttiva e alla modalità <strong>di</strong> riproduzione.<br />

Esempio 7.3 Negli ovini da latte la durata me<strong>di</strong>a della carriera produttiva è <strong>di</strong> 5<br />

anni per cui, se vogliamo mantenere la consistenza del gregge inalterata nel<br />

tempo, dobbiamo immettere ogni anno nel gregge il 20% degli effettivi. Questa<br />

entità si chiama quota <strong>di</strong> rimonta e si calcola come il reciproco della durata della<br />

carriera produttiva (1/5 negli ovini e nella vacca da latte). Poiché, allora, devo<br />

avere <strong>di</strong>sponibili il 20% <strong>di</strong> giovani femmine da inserire nel gregge ogni anno,<br />

quante madri dovranno essere annualmente impegnate a “produrre” la nuova<br />

generazione? Il conto, grossomodo, si fa nel modo seguente:<br />

a) si considera la fertilità, cioè il numero <strong>delle</strong> femmine che partorisce in un anno,<br />

poniamo nel caso degli ovini il 90%;<br />

b) si considera la prolificità, cioè il numero <strong>di</strong> nati per ciascun parto, poniamo<br />

1,25;<br />

c) si moltiplica (a)x(b) e si ottiene la fecon<strong>di</strong>tà, cioè il numero <strong>di</strong> nati per anno per<br />

femmina che, nel nostro caso, è <strong>di</strong> 1,125;<br />

d) tenendo conto che il rapporto dei sessi alla nascita è del 50% e che dalla<br />

nascita all’immissione nel gregge a 10 mesi <strong>di</strong> età (saccaie) si hanno per<strong>di</strong>te del<br />

10%, si calcola allora il numero <strong>di</strong> pecore che daranno origine alla rimonta:<br />

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(20 x 1,1)/0,5 x 1/1,125 = 39,1%, circa 40 pecore ogni 100 componenti<br />

l’allevamento.<br />

Nel caso dei maschi, oltre alla carriera riproduttiva, che negli arieti è <strong>di</strong> circa 3<br />

anni, dobbiamo tenere conto del rapporto dei sessi alla riproduzione. Il calcolo si<br />

opera nel seguente modo:<br />

a) prima si stabilisce la quota <strong>di</strong> rimonta maschile, che nel nostro caso è del 33%<br />

(1/3 anni);<br />

b) poi si identifica il metodo <strong>di</strong> riproduzione da adottare;<br />

c) nel caso della monta naturale poniamo un rapporto maschi/femmine 1/50 (2%)<br />

ed in caso <strong>di</strong> inseminazione artificiale con seme fresco poniamo che esso sia <strong>di</strong><br />

1/250 (0,4%);<br />

d) si calcola poi il numero <strong>di</strong> maschi da allevare per anno come prodotto <strong>di</strong> (a) x<br />

(c) e, come per le femmine, si trova la percentuale <strong>di</strong> madri <strong>di</strong> ariete che nel caso<br />

della monta con uno scarto del 20% dalla nascita alla riproduzione, è:<br />

(2 x 0,33 x 1,2)/0,5 x 1/1,125 = 1,41%, circa 1,5 pecore ogni 100<br />

componenti l’allevamento.<br />

Questo esempio mostra come la pressione <strong>di</strong> selezione <strong>delle</strong> madri nella via<br />

maschile sia <strong>di</strong> gran lunga maggiore per effetto del rapporto riproduttivo fra i sessi.<br />

In altre parole, mentre per la produzione dei maschi possiamo scegliere veramente<br />

le migliori pecore, per le femmine siamo “costretti” a prendere anche le madri la cui<br />

me<strong>di</strong>a si avvicina alla me<strong>di</strong>a della popolazione, cioè il cui apporto al progresso<br />

genetico è praticamente nullo.<br />

L’intensità <strong>di</strong> selezione, allora, è <strong>di</strong>rettamente proporzionale alla durata della<br />

carriera produttiva e riproduttiva (minore quota <strong>di</strong> rimonta), al rapporto<br />

riproduttivo ed alla fertilità (soprattutto alla prolificità). Per questo ultimo motivo,<br />

le specie prolifiche, come i suini che hanno 2,2 parti all’anno con 10-12 suinetti per<br />

parto, consentono intensità <strong>di</strong> selezione molto più elevate <strong>di</strong> quelle consentite dai<br />

bovini che sono una specie unipara e con fertilità annuale raramente superiore<br />

all’80-85%.<br />

Come è possibile calcolare l’inverso della relazione [5], cioè l’intensità <strong>di</strong> selezione<br />

ed il punto <strong>di</strong> troncatura della curva normale a partire dalla percentuale della<br />

popolazione da selezionare? Il problema si risolve con un integrale della [4] e con<br />

una serie <strong>di</strong> calcoli per stabilire la me<strong>di</strong>a della nuova <strong>di</strong>stribuzione dei fenotipi degli<br />

animali selezionati la cui soluzione, calcolata da Falconer, è riportata nella<br />

appen<strong>di</strong>ce <strong>di</strong> questo capitolo.<br />

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Esempio 7.4 Consideriamo la nostra popolazione <strong>di</strong> pecore Sarde e calcoliamo,<br />

nell’ipotesi dei dover mantenere il 40% <strong>delle</strong> femmine in riproduzione, quale è<br />

l’intensità <strong>di</strong> selezione e il limite produttivo inferiore. Dalla tabella riportata in<br />

appen<strong>di</strong>ce rileviamo che per p%=40, i = 0,966 e x = 0,253. Poiché la deviazione<br />

standard fenotipica è <strong>di</strong> 71 kg, il <strong>di</strong>fferenziale selettivo <strong>delle</strong> pecore selezionate è<br />

<strong>di</strong> +68,59 kg <strong>di</strong> latte ovvero la me<strong>di</strong>a del gruppo selezionato è <strong>di</strong> kg 253,39. Il<br />

punto <strong>di</strong> troncatura della <strong>di</strong>stribuzione dei fenotipi è posto per x=0,253, cioè 71⋅<br />

0,253= 17,96 kg <strong>di</strong> latte, il che significa che tutte le pecore con una produzione<br />

superiore ai kg 203 sono avviate alla riproduzione per la creazione della<br />

generazione successiva.<br />

A questo punto riesaminiamo la formula [3] secondo cui s = i sp ed otteniamo il<br />

progresso genetico espresso in funzione della <strong>di</strong>stribuzione dei fenotipi:<br />

[6] R = ih 2 sp<br />

che rappresenta l’equazione fondamentale del progresso genetico secondo cui il<br />

progresso genetico ottenibile da una generazione all’altra è <strong>di</strong>rettamente<br />

proporzionale all’intensità <strong>di</strong> selezione, all’ere<strong>di</strong>tabilità del carattere quantitativo<br />

esaminato ed alla sua variabilità.<br />

7.3 L’intervallo <strong>di</strong> generazione<br />

La relazione [6] permette <strong>di</strong> calcolare il progresso genetico ottenibile con un<br />

determinato schema selettivo da una generazione all’altra. Ciò che interessa a noi<br />

più da vicino è, però, il progresso genetico ottenibile nell’unità <strong>di</strong> tempo (che<br />

normalmente è 1 anno) cioè la velocità <strong>di</strong> selezione dR che si ottiene dalla<br />

<strong>di</strong>visione del progresso genetico per generazione per l’intervallo fra le generazioni T<br />

(in anni):<br />

[7] dR = ih 2 sp/T<br />

L’intervallo <strong>di</strong> generazione è il tempo che trascorre fra un evento me<strong>di</strong>o della vita <strong>di</strong><br />

una generazione e lo stesso evento nella generazione successiva. Nel caso della<br />

riproduzione esso è l’età me<strong>di</strong>a dei genitori alla nascita della progenie che sarà<br />

messa in selezione per la produzione della generazione successiva. Il calcolo<br />

dell’intervallo <strong>di</strong> generazione tiene conto <strong>di</strong> fattori zootecnici, quali l’età al primo<br />

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parto, l’interparto e la durata della carriera riproduttiva. Tanto più precocemente i<br />

riproduttori sono avviati alla riproduzione, tanto minore è l’intervallo fra le<br />

generazioni. Nel caso della valutazione dei riproduttori dopo progeny testing,<br />

l’intervallo <strong>di</strong> generazione è <strong>di</strong> gran lunga superiore a quello <strong>di</strong> schemi <strong>di</strong> selezione<br />

che prevedano performance test oppure pe<strong>di</strong>gree index.<br />

In genere nella pratica si adottano i seguenti intervalli <strong>di</strong> generazione (da Minvielle,<br />

1990)<br />

Specie T in anni i e (% p)<br />

maschi femmine maschi femmine<br />

bovini 3 8* 5 2,1 (4) 0,64 (60)<br />

ovini 2 4* 3,5 2,1 (4) 0,97 (40)<br />

suini 1,5 3* 1,5 2,5 (1,4) 1,4 (20)<br />

volatili 1,5 1,5 2,5 (1,4) 1,4 (20)<br />

Achtung!! in questa tabella l’intensità <strong>di</strong> selezione è riferita alla <strong>di</strong>stribuzione dei genotipi e non<br />

a quella dei fenotipi. Il perché lo vedremo in seguito.<br />

* Soggetti sottoposti a prova <strong>di</strong> progenie<br />

La tabella mostra, ad esempio, che l’intervallo <strong>di</strong> generazione <strong>delle</strong> scrofe è 3 volte<br />

inferiore a quello <strong>delle</strong> vacche.<br />

La relazione [7] completa la definizione <strong>di</strong> progresso genetico formulata in<br />

precedenza con la introduzione del concetto che la rapi<strong>di</strong>tà della selezione è<br />

inversamente proporzionale all’intervallo fra le generazioni. In altri termini, a<br />

parità <strong>di</strong> tutti gli altri fattori che con<strong>di</strong>zionano il progresso selettivo, il guadagno<br />

genetico atteso per anno è tanto maggiore quanto più breve è l’intervallo fra le<br />

generazioni.<br />

7.4 La velocità <strong>di</strong> selezione e l’in<strong>di</strong>ce genetico<br />

Abbiamo visto che la dR <strong>di</strong>pende <strong>di</strong>rettamente dall’ere<strong>di</strong>tabilità e dalla deviazione<br />

standard fenotipica. Se ricor<strong>di</strong>amo che la correlazione genotipo/fenotipo è espressa<br />

dal parametro h = sA/sP = rAP , la formula della velocità <strong>di</strong> selezione <strong>di</strong>venta:<br />

[8] dR = i rAP sA/ T.<br />

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Consideriamo ora che in pratica noi scegliamo gli animali non in base al fenotipo né<br />

al genotipo, ma in base alla stima del loro valore genetico, cioè sulla base degli<br />

in<strong>di</strong>ci genetici calcolati con uno dei vari sistemi visti in precedenza. Ora, la risposta<br />

alla selezione può essere espressa come nella [2] dalla regressione fra valore<br />

genetico reale (A) e valore genetico stimato (I) degli in<strong>di</strong>vidui selezionati. secondo<br />

la relazione:<br />

[2bis] R = bAI s<br />

Il <strong>di</strong>fferenziale selettivo è esprimibile in questo caso in unità <strong>di</strong> deviazioni standard<br />

dell’in<strong>di</strong>ce (σI) come s = i σI , che combinato con la [2bis] e <strong>di</strong>viso per l’intervallo <strong>di</strong><br />

generazione esprime la velocità <strong>di</strong> selezione in termini <strong>di</strong> variabilità dell’in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong><br />

selezione:<br />

[9] dR = i bAI σI / T<br />

Poiché il valore bAI = COV(IA)/V(I), il numeratore della [9] <strong>di</strong>venta i COV(IA)/ sI ;<br />

ricordando che la precisione dell’in<strong>di</strong>ce è la correlazione <strong>di</strong> questo con il reale<br />

valore genetico dell’animale rIA = COV(IA)/ sIsA, sostituendo questo valore alla<br />

[9] si ottiene:<br />

[10] dR = i rIA sA / T<br />

concettualmente uguale alla [8] e normalmente utilizzata per il calcolo del progresso<br />

genetico <strong>di</strong> un determinato schema <strong>di</strong> selezione. La relazione mostra che il<br />

guadagno genetico realizzabile da un determinato schema <strong>di</strong> selezione è<br />

<strong>di</strong>rettamente proporzionale alla intensità <strong>di</strong> selezione, alla accuratezza con cui si<br />

stima il valore genetico dei riproduttori, alla variabilità genetica del carattere<br />

oggetto della selezione ed è inversamente proporzionale all’intervallo fra le<br />

generazioni.<br />

Esempio 7.5 Consideriamo la popolazione <strong>di</strong> pecore <strong>di</strong> razza Sarda esaminata<br />

negli esempi precedenti e verifichiamo la velocità del progresso genetico ottenibile<br />

per via femminile. Sanna et al. riportano una deviazione standard genetica σA<br />

stimata <strong>di</strong> 19 kg e noi poniamo una accuratezza della stima del genotipo <strong>delle</strong><br />

madri del 62%; dalla tabella <strong>di</strong> Falconer e Mackay otteniamo per le pecore una<br />

intensità <strong>di</strong> selezione <strong>di</strong> 0,97 ed un intervallo <strong>di</strong> generazione <strong>di</strong> 3,5 anni; la dR è<br />

allora:<br />

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dR = 0,97 ⋅ 0,62 ⋅ 19 /3,5 = 3,26 kg <strong>di</strong> latte per anno<br />

che, considerata la me<strong>di</strong>a produttiva <strong>di</strong> 185 kg, rappresenta un guadagno genetico<br />

del 1,76% ovvero del 17,2% della deviazione standard genetica.<br />

In realtà la risposta alla selezione per una determinata generazione deriva almeno da<br />

due vie, quella maschile e quella femminile. Nonostante la pressione <strong>di</strong> selezione e<br />

l’accuratezza della stima del valore genetico siano, come già detto, normalmente<br />

<strong>di</strong>verse fra maschi e femmine, ogni generazione riceve esattamente la metà dei geni<br />

dalla madre e la metà dal padre, per cui il progresso genetico è la me<strong>di</strong>a dei due<br />

progressi genetici. A questo punto allora la velocità <strong>di</strong> selezione è data dalla<br />

relazione:<br />

[11] dR = ((i1 r1 + i2 r2) / (t1 + t2)) sA<br />

in cui il pe<strong>di</strong>ce “1” contrad<strong>di</strong>stingue i parametri relativi ai maschi e il pe<strong>di</strong>ce “2”<br />

quelli relativi alle femmine. Questa relazione, apparentemente semplice, non è la<br />

me<strong>di</strong>a ponderata del progresso genetico ottenibile separatamente per la via maschile<br />

e per quella femminile, me deriva dal seguente ragionamento (da Minvielle, 1990):<br />

1) consideriamo i riproduttori appartenenti alla stessa popolazione, per cui la<br />

varianza genetica è uguale in entrambi i sessi;<br />

2) accoppiamo a caso i maschi selezionati con le femmine selezionate <strong>di</strong> valore<br />

genetico me<strong>di</strong>o G1 e G2 rispettivamente;<br />

3) gli intervalli <strong>di</strong> generazione dei riproduttori sono rispettivamente t1 e t2;<br />

4) il valore genetico ad<strong>di</strong>tivo me<strong>di</strong>o della progenie è A = (G1 + G2)/2;<br />

5) nel caso dei genitori maschi, questi sono stati selezionati in una grande<br />

popolazione <strong>di</strong> maschi e femmine <strong>di</strong> valore me<strong>di</strong>o A* che è inferiore ad A poiché t1<br />

anni <strong>di</strong> selezione separano le due generazioni;<br />

6) quin<strong>di</strong> il valore A* = A - t1 DG ;<br />

7) la superiorità dei maschi selezionati rispetto alla popolazione <strong>di</strong> provenienza, cioè<br />

G1 - A*, è uguale semplicemente a i1r1sA , cioè al progresso selettivo ottenuto in<br />

una generazione <strong>di</strong> maschi;<br />

8) quin<strong>di</strong>, poiché G1 - A* = i1r1sA , sostituendo il valore <strong>di</strong> A* con l’espressione<br />

del punto 6), si avrà che i1r1sA = G1- A + t1 DG;<br />

9) analogamente per le femmine, i2r2sA = G2- A + t2 DG;<br />

10) sommando le due relazioni 8) e 9), si ha:<br />

i1r1sA + i2r2sA = (t1 + t2) DG - 2A + G1 + G2;<br />

11) ma la quantità - 2A + G1 + G2 = 0 come visto nella relazione del punto 4), per<br />

cui alla fine si ottiene la relazione [11], per DG che ha lo stesso significato <strong>di</strong> dR.<br />

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Negli schemi <strong>di</strong> selezione adottati per i bovini da latte, in realtà le vie della<br />

selezione sono 4: la via padri <strong>di</strong> toro, cioè i maschi che sono destinati a produrre i<br />

maschi della nuova generazione; la via madri <strong>di</strong> toro; la via padri <strong>di</strong> vacche e la via<br />

madri <strong>di</strong> vacche. La relazione [11] perciò <strong>di</strong>venta:<br />

[12] dR = ((i1 r1 + i2 r2+ i3 r3 + i4 r4) / (t1 + t2 + t3 + t4)) sA<br />

che risulta la modalità <strong>di</strong> calcolo del progresso genetico maggiormente impiegata<br />

nella valutazione pratica.<br />

7.5 Gli effetti della selezione sulla varianza<br />

La varianza genetica <strong>di</strong>pende dalla frequenza dei geni per cui, essendo la selezione<br />

il metodo <strong>di</strong> scelta <strong>di</strong> alcuni genotipi rispetto ad altri, ci si aspetta che essa cambi da<br />

una generazione all’altra. In altri termini, se pre<strong>di</strong>ligo per la creazione della<br />

generazione successiva gli animali che hanno il carattere desiderato, ad esempio la<br />

produzione <strong>di</strong> latte, determinato da un maggior numero <strong>di</strong> geni “alta produzione”<br />

rispetto alla me<strong>di</strong>a della popolazione, dovrei attendermi che questi geni tendano ad<br />

accumularsi in forma omozigote con il passare <strong>delle</strong> generazioni e, quin<strong>di</strong>, la<br />

varianza genetica si riduca. Questo fenomeno, inoltre, dovrebbe essere più evidente<br />

con il passare <strong>delle</strong> generazioni e, come conseguenza, dovrebbe portare al<br />

rallentamento della velocità <strong>di</strong> selezione ed, in ultima analisi, al suo arresto nel caso<br />

limite in cui gli animali ottenuti siano portatori omozigoti del carattere “alta<br />

produzione” per tutte le frazioni costituenti il poligene.<br />

In realtà esiste un fenomeno, osservabile nelle prime generazioni e la cui entità si<br />

<strong>di</strong>luisce con il passare <strong>delle</strong> generazioni, che è chiamato effetto Bulmer dallo<br />

stu<strong>di</strong>oso che per primo lo descrisse. L’effetto Bulmer è la riduzione della varianza<br />

fenotipica del gruppo <strong>di</strong> animali selezionato dovuta al fatto che questi sono una<br />

frazione or<strong>di</strong>nata, cioè posta al <strong>di</strong> sopra <strong>di</strong> una soglia, della <strong>di</strong>stribuzione originaria<br />

dei fenotipi; in altri termini, essendo gli animali selezionati per troncatura della<br />

<strong>di</strong>stribuzione normale, la loro variabilità interna sarà inferiore a quella della<br />

popolazione <strong>di</strong> provenienza. Il problema allora è: quanta parte <strong>di</strong> questa riduzione<br />

della variabilità è trasmessa alla progenie? Poniamo che V(P) sia la varianza<br />

fenotipica prima della selezione (quella cioè della popolazione <strong>di</strong> provenienza) e che<br />

V*(P) sia la varianza del gruppo parentale selezionato: la riduzione della varianza è<br />

funzione del parametro k secondo la relazione:<br />

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[13] V*(P) = (1-k) V(P)<br />

Il parametro k <strong>di</strong>pende dall’intensità <strong>di</strong> selezione (i) e dal punto <strong>di</strong> troncatura della<br />

<strong>di</strong>stribuzione normale (x) secondo la relazione:<br />

[14] k = i(i-x)<br />

Esempio 7.6 Consideriamo la nostra popolazione <strong>di</strong> ovini Sar<strong>di</strong> con le statistiche<br />

viste in precedenza; la deviazione standard fenotipica è <strong>di</strong> 71 kg per cui la<br />

varianza fenotipica V(P) = 5.041; se consideriamo che il gruppo <strong>di</strong> femmine<br />

selezionato rappresenta il 40% della popolazione, dalla tabella allegata possiamo<br />

ricavare i valori <strong>di</strong> i = 0,966 e <strong>di</strong> x = 0,253. La varianza fenotipica del gruppo <strong>di</strong><br />

pecore selezionate V*(P) si riduce, allora, a 5.041⋅[1- 0,966(0,966-0,253)] =1.568,<br />

corrispondente ad una deviazione standard <strong>di</strong> kg 39,6.<br />

Poiché, però, ciò che a noi importa per il calcolo della velocità <strong>di</strong> selezione è la<br />

varianza genetica VA , essa sarà ridotta nel gruppo selezionato (V*A ) della sola<br />

entità ere<strong>di</strong>tabile della varianza fenotipica, per cui la [13] <strong>di</strong>venta:<br />

[15] V*A = (1-h 2 k)VA<br />

La varianza genetica che passa nella generazione successiva è soltanto la metà <strong>di</strong><br />

quella della generazione parentale in quanto, a causa della ricombinazione genetica<br />

dovuta crossing-over, la restante metà è data da cosiddetto effetto <strong>di</strong> segregazione<br />

casuale (ESC) dei geni. In altri termini, se il genotipo <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo è la<br />

semisomma del genotipo paterno e <strong>di</strong> quello materno<br />

Gf = GP/2 + GM/2<br />

la varianza dei genotipi filiali (ricorriamo che le varianze sono dei quadrati) sarà<br />

V(Gf )= V(GP )/4 + V(GM )/4 + ESC<br />

A questo punto possiamo esprimere la [15] in forma generale per qualsiasi<br />

generazione (f) secondo cui soltanto la metà della variabilità genetica della<br />

generazione (f-1) si ritrova nella generazione (f), mentre l’altra metà deriva della<br />

variabilità della popolazione originaria:<br />

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[16] V(A)(f) = ½ [1-h 2 k]V(A)(f-1) + ½ V(A)<br />

Da questa formula si rileva che l’effetto Bulmer è sensibile soltanto nelle prime<br />

generazioni e <strong>di</strong>venta trascurabile a partire dalla 3 a -4 a.<br />

Esempio 7.7 Continuiamo a considerare la nostra popolazione <strong>di</strong> pecore <strong>di</strong> razza<br />

Sarda la cui deviazione standard genotipica è <strong>di</strong> kg 19 per cui la varianza genetica<br />

è <strong>di</strong> 361 kg 2 . Se applichiamo recursivamente la formula [16] all’esempio 7.5 e<br />

consideriamo una ere<strong>di</strong>tabilità del carattere produzione latte <strong>di</strong> 0,29, osserviamo<br />

la seguente riduzione della varianza con il passare <strong>delle</strong> generazioni:<br />

generazione V(G) %<br />

p 361 100,00<br />

1 324 89,76<br />

2 310 85,44<br />

3 304 83,51<br />

4 302 82,86<br />

5 301,5 82,70<br />

6 301,14 82,58<br />

Praticamente a partire dalla 4 a generazione non si osservano più riduzioni<br />

significative della varianza.<br />

7.6 Esiste un limite alla selezione?<br />

Come accennato nel paragrafo precedente, la selezione comporta la riduzione della<br />

varianza genetica per l’effetto Bulmer, nelle prime generazioni, e per l’effetto<br />

omozigosi a lungo termine. In entrambi i casi questa riduzione provoca, per la<br />

relazione fondamentale della velocità <strong>di</strong> selezione esposta nella equazione [10], una<br />

altrettanta riduzione della risposta alla selezione e, al limite, un suo arresto quando<br />

la varianza genetica è zero, cioè quando tutti gli animali sono <strong>di</strong>ventati omozigoti<br />

per quel carattere. Se consideriamo, ad esempio, il carattere oggetto <strong>di</strong> selezione<br />

costituito da due alleli (ad es colore del mantello Rosso AA, ubero Aa, bianco aa),<br />

non potremo fare più selezione quando tutti i nostri animali saranno rossi (a meno<br />

dello scarto degli animali mutati).<br />

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Poiché i caratteri quantitativi sono co<strong>di</strong>ficati da poligeni, non esiste alcun metodo<br />

per pre<strong>di</strong>re se esiste un limite alla selezione se non la esecuzione <strong>di</strong> idonee prove<br />

sperimentali. Queste possono essere ovviamente effettuate con animali che<br />

presentino cicli riproduttivi molto rapi<strong>di</strong> quali ad esempio gli insetti. Ed infatti le<br />

prove dell’esistenza <strong>di</strong> un limite alla selezione, evidenziato dal decremento della<br />

dR, sono state ottenute su Drosofila melanogaster in cui il numero <strong>di</strong> setole<br />

addominali ha cessato <strong>di</strong> aumentare a partire dalla 30 a generazione (Yoo, citato da<br />

Falconer).<br />

Nel caso degli animali zootecnici l’esistenza <strong>di</strong> un limite alla selezione ha una<br />

grande rilevanza in quanto gli sforzi degli allevatori, organizzativi e finanziari, sono<br />

concentrati per il continuo ottenimento <strong>di</strong> una risposta alla selezione. Questo è<br />

particolarmente vero per alcune specie, quali i polli o i suini, che sono sottoposte a<br />

selezione da lungo tempo e per le quali la selezione in questi ultimi anni è stata<br />

molto intensa. Fortunatamente, le principali specie zootecniche non sembrano<br />

arrivate al limite della selezione in quanto attualmente sono ancora riconoscibili<br />

gran<strong>di</strong> incrementi produttivi a seguito dei piani <strong>di</strong> selezione adottati (Smith, citato da<br />

Falconer).<br />

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Appen<strong>di</strong>ce 1 - Integrale della variabile zeta che consente <strong>di</strong> calcolare la relazione fra<br />

l’intensità <strong>di</strong> selezione i la percentuale della popolazione destinata alla selezione<br />

p% e l’ascissa (espressa anche essa in unità <strong>di</strong> deviazione standard) del punto <strong>di</strong><br />

troncatura della <strong>di</strong>stribuzione x cioè del livello produttivo al <strong>di</strong> sopra del quale tutti<br />

gli animali sono avviati alla selezione (da Falconer e Makcay, 1996).<br />

p% x i p% x i<br />

0,01 3,719 3,960 11 1,282 1,755<br />

0,05 3,291 3,554 12 1,175 1,667<br />

0,10 3,090 3,367 13 1,126 1,627<br />

0,20 2,878 3,70 14 1,080 1,590<br />

0,30 2,748 3,050 15 1,036 1,554<br />

0,40 2,652 2,962 20 0,842 1,400<br />

0,50 2,576 2,892 25 0,674 1,271<br />

1,00 2,326 2,665 30 0,524 1,159<br />

2,00 2,054 2,421 35 0,385 1,058<br />

3,00 1,881 2,268 40 0,253 0,966<br />

4,00 1,751 2,154 45 0,126 0,880<br />

5,00 1,654 2,063 50 0,000 0,798<br />

6,00 1,555 1,985<br />

7,00 1,476 1,918<br />

8,00 1,405 1,858<br />

9,00 1,341 1,804<br />

10,0 1,282 1,755<br />

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8. GLI SCHEMI DI SELEZIONE<br />

Gli schemi <strong>di</strong> selezione, come abbiamo visto nel capitolo 1, sono dei veri e propri<br />

progetti da applicare al flusso <strong>di</strong> animali negli allevamenti della specie interessata al<br />

fine del conseguimento del guadagno genetico (dR) ritenuto ottimale. Progettare uno<br />

schema <strong>di</strong> selezione significa, in sostanza, <strong>di</strong>segnare le modalità con cui sono scelti i<br />

riproduttori e quelle con le quali sono ottenuti i dati fenotipici che servono alla<br />

valutazione dei riproduttori stessi.<br />

In linea generale uno schema è classificabile all’interno <strong>di</strong> uno dei meto<strong>di</strong> selettivi<br />

illustrati nel capitolo 5 e si compone <strong>di</strong> un <strong>di</strong>agramma a blocchi in cui sono<br />

specificate le entità degli animali (parents) da utilizzare per la produzione della<br />

progenie, quelle dei flussi degli animali da una generazione all’altra in funzione dei<br />

vincoli rappresentati, normalmente, dalla riproducibilità della specie (fertilità cioè<br />

numero <strong>delle</strong> femmine che partoriscono su quelle in età riproduttiva; prolificità. cioè<br />

il numero dei nati per parto; rapporto riproduttivo fra i sessi, che <strong>di</strong>pende dalle<br />

modalità <strong>di</strong> inseminazione impiegate; ecc..) e dalla sua carriera riproduttiva me<strong>di</strong>a.<br />

Il caso più semplice <strong>di</strong> ottimizzazione <strong>di</strong> uno schema <strong>di</strong> selezione è quello che ha<br />

come obiettivo la massimizzazione del guadagno genetico dR nella popolazione;<br />

esso può essere schematicamente <strong>di</strong>viso in due fasi: la creazione del miglioramento<br />

e la sua <strong>di</strong>ffusione in tutta la popolazione.<br />

Prima <strong>di</strong> affrontare l’argomento occorre però considerare il fatto che il MG può<br />

essere prodotto in una parte della popolazione, il cosiddetto nucleo <strong>di</strong> selezione,<br />

oppure in tutta la popolazione. Se esiste una demarcazione netta fra i genotipi sui<br />

quali si effettua l’opera <strong>di</strong> selezione e quelli del resto della popolazione (la<br />

cosiddetta popolazione commerciale) siamo in presenza dei cosiddetti schemi a<br />

nucleo chiuso; se invece esiste uno scambio <strong>di</strong> geni fra i due gruppi <strong>di</strong> animali<br />

abbiamo i cosiddetti schemi a nucleo aperto. Il primo caso è frequente nel MG dei<br />

suini, in cui però la selezione segue dei criteri particolari <strong>di</strong> cui non facciamo cenno.<br />

Nel caso dei ruminanti, ed in particolare del carattere produzione <strong>di</strong> latte, gli schemi<br />

sono sempre del tipo nucleo aperto in cui un gruppo <strong>di</strong> animali <strong>di</strong> élite è sottoposto<br />

alla selezione e <strong>di</strong>ffonde nella popolazione commerciale il progresso genetico<br />

realizzato nel nucleo. In realtà i vari tipi <strong>di</strong> schemi alternativi <strong>di</strong>pendono dal grado <strong>di</strong><br />

apertura del nucleo come vedremo meglio in seguito.<br />

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8.1 La massimizzazione del guadagno genetico dR<br />

Sfortunatamente, secondo Minvielle, non esistono regole generali per decidere<br />

analiticamente il piano <strong>di</strong> selezione che combina l’intensità <strong>di</strong> selezione (i),<br />

l’accuratezza con cui è stimato un in<strong>di</strong>ce genetico (rAI) e l’intervallo <strong>di</strong> generazione<br />

(T) in modo tale da massimizzare il guadagno genetico (dR) (ve<strong>di</strong> relazione [10] del<br />

capitolo 7); le modalità <strong>di</strong> calcolo <strong>di</strong> questi parametri sono state già illustrate nei<br />

capitoli precedenti e, qui, ci basta ricordare che l’accuratezza <strong>di</strong>pende dal numero e<br />

dal tipo <strong>delle</strong> informazioni <strong>di</strong>sponibili e che l’intensità <strong>di</strong> selezione, e l’intervallo fra<br />

le generazioni, sono riferiti alla specie ed alle tecniche riproduttive adottate. Un<br />

aspetto importante riguarda il fatto che i tre parametri sono fra loro legati<br />

negativamente.<br />

L’antagonismo fra i parametri del guadagno genetico è principalmente quello che<br />

lega i e T da una parte e rAI e T dall’altra.<br />

Il primo <strong>di</strong>pende dal fatto che con intervalli <strong>di</strong> generazione più lunghi si ha riduzione<br />

del dR ma si hanno anche più can<strong>di</strong>dati alla selezione per cui i può essere<br />

maggiore.<br />

Il secondo <strong>di</strong>pende dal fatto che l’accuratezza è superiore per lunghi intervalli <strong>di</strong><br />

generazione per effetto del maggior numero <strong>di</strong> <strong>di</strong>scendenti da cui attingere le<br />

informazioni per i calcolo dell’IG del can<strong>di</strong>dato alla selezione.<br />

Un approccio funzionale potrebbe essere quello <strong>di</strong> verificare il cambiamento<br />

simultaneo del valore dei tre parametri, ma i calcoli da effettuare sono complessi ed<br />

esulano dagli scopi <strong>di</strong> questo corso. Occorre tuttavia tenere presente che la<br />

<strong>di</strong>scussione su questi antagonismi deve essere effettuata anticipatamente alla messa<br />

in opera <strong>di</strong> un piano <strong>di</strong> selezione e che la comparazione fra <strong>di</strong>fferenti dR ottenuti<br />

sotto <strong>di</strong>fferenti ipotesi <strong>di</strong> selezione non saranno vali<strong>di</strong> se questi non sono basati su<br />

parametri zootecnici realistici e su tecnologie realmente applicabili alla popolazione<br />

oggetto <strong>di</strong> selezione.<br />

8.2 La <strong>di</strong>ffusione del guadagno genetico<br />

Una volta calcolato il progresso genetico atteso nel nucleo <strong>di</strong> selezione per effetto <strong>di</strong><br />

un determinato schema <strong>di</strong> selezione, il problema è quello <strong>di</strong> verificare con quale<br />

rapi<strong>di</strong>tà esso si <strong>di</strong>ffonde nella popolazione commerciale. Se il calcolo del dR<br />

ottenuto nel nucleo è abbastanza semplice in quanto esso è la soluzione ottimizzata<br />

fra gli schemi <strong>di</strong> selezione alternativi presi in considerazione, la stima della<br />

<strong>di</strong>ffusione genetica incontra nella realtà operativa numerose <strong>di</strong>fficoltà (non tutti gli<br />

allevatori selezionano per lo stesso carattere, i parametri genetici sono sotto o<br />

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sopravalutati, ecc..). In generale una popolazione <strong>di</strong> animali domestici possiede una<br />

struttura piramidale in quanto il miglioramento genetico è effettuato su un limitato<br />

numero <strong>di</strong> animali posti alla sommità, da questi <strong>di</strong>ffonde verso uno sta<strong>di</strong>o centrale<br />

(detto <strong>di</strong> moltiplicazione) che interessa un numero maggiore <strong>di</strong> soggetti e da questo<br />

verso la base (popolazione commerciale) con un certo ritardo. Il problema della<br />

<strong>di</strong>ffusione del MG riguarda l’entità ed i tempi con cui il miglioramento è trasmesso<br />

dalla sommità alla base della piramide.<br />

Il calcolo della <strong>di</strong>ffusione, nell’ipotesi <strong>di</strong> un miglioramento dR costante fra le<br />

generazioni nel nucleo <strong>di</strong> selezione, è calcolato in base al numero <strong>di</strong> generazioni<br />

necessarie perché la base commerciale arrivi al livello genetico del nucleo da cui il<br />

miglioramento è partito. Il problema posto è quello del transito dei geni fra i<br />

<strong>di</strong>fferenti livelli della piramide ed è risolvibile con gli algoritmi della genetica <strong>di</strong><br />

popolazione che fanno riferimento alle migrazioni.<br />

Nel caso in cui la popolazione fosse sud<strong>di</strong>visa in soli due sta<strong>di</strong> (nucleo e<br />

commerciale) il ritardo genetico, espresso nell’unità <strong>di</strong> misura del carattere<br />

quantitativo considerato, è quantificabile con<br />

[1] dR[1 - (1-m) n ]/m<br />

in cui m è la frazione <strong>di</strong> animali trasferiti per generazione dal nucleo alla<br />

popolazione commerciale e n è il numero <strong>delle</strong> generazioni; dopo un elevato numero<br />

<strong>di</strong> generazioni (n →∞) la [1] <strong>di</strong>venta dR/m . Il ritardo genetico, espresso il numero<br />

<strong>di</strong> generazioni, è inversamente proporzionale al tasso <strong>di</strong> migrazione verso il basso<br />

(Minvielle):<br />

Tasso <strong>di</strong> migrazione 0,1 0,2 0,5 0,6<br />

dopo 5 generaz. 4,1 3,4 1,9 1,7.<br />

Ritardo genetico<br />

valore limite 10 5 2 1,7<br />

Nella pratica corrente <strong>di</strong>fficilmente si incontrano situazioni così semplici; <strong>di</strong> norma il<br />

flusso <strong>di</strong> animali fra i tre livelli (nucleo, moltiplicativo, commerciale) è più<br />

complesso e <strong>di</strong>pende dal grado <strong>di</strong> apertura del nucleo verso la base.<br />

Questo problema è affrontato dalla teoria dei cosiddetti schemi <strong>di</strong> selezione in<br />

(flusso) continuo.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

8.3 La ottimizzazione nel continuo degli schemi <strong>di</strong> selezione alternativi<br />

Il metodo classico per l’in<strong>di</strong>viduazione dello schema <strong>di</strong> selezione ottimale richiede,<br />

in primo luogo, che siano definiti il progresso genetico e la sua varianza (confronta<br />

il capitolo 1); successivamente i valori ottenuti sono or<strong>di</strong>nati in un insieme <strong>di</strong>screto<br />

in quanto altrettanto <strong>di</strong>screti, cioè separati tra loro, sono gli schemi <strong>di</strong> selezione<br />

alternativi da mettere a confronto. Questo modo <strong>di</strong> procedere ha però il <strong>di</strong>fetto<br />

fondamentale che gli schemi sottoposti al confronto hanno intervalli <strong>di</strong> generazione<br />

predeterminati; ma questo parametro, come abbiamo visto, con<strong>di</strong>ziona il guadagno<br />

genetico atteso. La possibilità <strong>di</strong> impiegare il metodo BLUP per la stima del valore<br />

riproduttivo (VR) dei can<strong>di</strong>dati alla selezione, consente <strong>di</strong> superare questa<br />

limitazione in quanto i VR stimati sono corretti per il trend genetico per cui l’IG <strong>di</strong><br />

animali appartenenti a <strong>di</strong>verse classi <strong>di</strong> età possono essere confrontati fra <strong>di</strong> loro.<br />

Una conseguenza importante è che possiamo scegliere gli animali con VR più alto<br />

in<strong>di</strong>pendentemente dalla classe <strong>di</strong> età a cui appartengono per cui l’intervallo <strong>di</strong><br />

generazione non risulta predeterminato, ma ottimizzato contemporaneamente<br />

all’in<strong>di</strong>viduazione dello schema selettivo con valore massimo del guadagno genetico<br />

atteso.<br />

Questo modo continuista <strong>di</strong> affrontare il problema dell’ottimizzazione equivale a<br />

considerare la totalità dei sistemi possibili come varianti <strong>di</strong> un unico schema <strong>di</strong><br />

selezione: lo schema a nucleo aperto. Variando l’apertura del nucleo da zero a uno<br />

si passa, senza soluzione <strong>di</strong> continuità, dallo schema a nucleo chiuso ai sistemi<br />

parzialmente aperti a quelli totalmente aperti verso la base, in cui il nucleo si<br />

<strong>di</strong>sperde nella popolazione <strong>di</strong> base <strong>di</strong>ssolvendosi in essa.<br />

Il sistema <strong>di</strong> selezione impiegato nel MG dei bovini da latte, conosciuto come<br />

schema convenzionale, è basato sul massiccio impiego della inseminazione<br />

artificiale e sulla valutazione dei tori con prova <strong>di</strong> progenie: tale schema può essere<br />

anche esso considerato come una sorta <strong>di</strong> nucleo aperto in cui i maschi nati nel<br />

nucleo corrispondono ai giovani tori in prova <strong>di</strong> progenie, le femmine nate nel<br />

nucleo corrispondono alle figlie <strong>delle</strong> madri <strong>di</strong> toro e infine le femmine nate nella<br />

base commerciale corrispondono alle figlie <strong>delle</strong> madri <strong>di</strong> vacche.<br />

Un modello per l’ottimizzazione in continuo degli schemi possibili prevede la<br />

selezione sulla base <strong>di</strong> in<strong>di</strong>ci, calcolati separatamente per ciascuna classe <strong>di</strong> età per<br />

il nucleo e per la popolazione <strong>di</strong> base , per i maschi e per la femmine. Il massimo <strong>di</strong><br />

informazione che si può combinare in un in<strong>di</strong>ce comprende le performances<br />

dell’in<strong>di</strong>viduo, della sua progenie, dei fratelli pieni e mezzi fratelli, dei genitori e dei<br />

loro fratelli e dei nonni paterni e materni.<br />

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Nella sua versione più semplice il modello richiede in ingresso l’in<strong>di</strong>cazione <strong>delle</strong><br />

seguenti variabili <strong>di</strong> stato: a) il numero degli animali in ciascuna classe <strong>di</strong> età e per<br />

ciascun raggruppamento; b) il numero <strong>di</strong> animali da selezionare per ciascun canale<br />

<strong>di</strong> flusso <strong>di</strong> geni il che significa la specificazione del tipo e dell’efficacia <strong>delle</strong><br />

tecniche riproduttive <strong>di</strong>sponibili; c) la numerosità <strong>delle</strong> figlie del padre messo in<br />

selezione; d) i parametri fenotipici del carattere obiettivo della selezione.<br />

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9. QTL E GENI MAGGIORI (Macciotta N.P.P.)<br />

I caratteri produttivi <strong>di</strong> interesse zootecnico sono in gran parte quantitativi: la loro<br />

manifestazione è cioè considerata come il risultato dell’azione <strong>di</strong> un grande numero<br />

<strong>di</strong> loci (poligeni) i cui effetti molto piccoli (infinitesimi) si sommano dando luogo<br />

alla espressione fenotipica del carattere (ad esempio la produzione del latte).<br />

Questo modello teorico, che ha consentito <strong>di</strong> ottenere indubbi risultati sotto l’aspetto<br />

applicativo (i meto<strong>di</strong> <strong>di</strong> stima del valore genetico degli animali si basano su <strong>di</strong> esso),<br />

fornisce comunque una visione alquanto semplicistica del problema: sembra<br />

piuttosto <strong>di</strong>fficile che tutti i geni che influenzano la produzione del latte abbiano<br />

un’azione infinitesima, cioè che una sostituzione allelica in uno <strong>di</strong> essi determini una<br />

variazione piccolissima nella quantità <strong>di</strong> latte prodotto. Una ipotesi più realistica<br />

sembra quella che prevede l’esistenza sia <strong>di</strong> loci ad effetto infinitesimo, che<br />

rappresentano la maggior parte, sia <strong>di</strong> altri che esercitano un’influenza tale da non<br />

poter passare inosservata. Questi ultimi sono i cosiddetti QTL: la sigla deriva dalle<br />

iniziali <strong>delle</strong> parole inglesi Quantitative (Quantitativo) Trait (Carattere) Locus, cioè<br />

locus che esercita un effetto su un carattere quantitativo.<br />

I QTLs, a loro volta, vengono <strong>di</strong>stinti per convenzione in due gruppi:<br />

Geni Maggiori, la cui presenza può essere evidenziata me<strong>di</strong>ante l’uso dei dati<br />

fenotipici e <strong>delle</strong> informazioni sulle parentele;<br />

QTL veri e propri, per la cui in<strong>di</strong>viduazione non sono sufficienti i dati fenotipici e le<br />

informazioni parentali, ma è necessario ricorrere all’uso dei marcatori genetici.<br />

L’in<strong>di</strong>viduazione <strong>di</strong> QTL e <strong>di</strong> geni maggiori rappresenta un vantaggio per il<br />

miglioramento genetico, sia in termini <strong>di</strong> migliore comprensione del determinismo<br />

genetico dei caratteri quantitativi sia, soprattutto, in termini <strong>di</strong> miglioramento<br />

dell’efficienza degli schemi <strong>di</strong> selezione (Selezione Assistita da marcatori),<br />

soprattutto nel caso <strong>di</strong> caratteri a bassa ere<strong>di</strong>tabilità o che possono essere misurati in<br />

un solo sesso.<br />

9.1 Geni Maggiori<br />

Un gene Maggiore, o gene ad effetto maggiore, è un gene allelico che esercita una<br />

influenza su un carattere quantitativo; come detto in precedenza, l’effetto deve<br />

essere tale da poter essere evidenziato con l’ausilio dei soli dati produttivi e <strong>delle</strong><br />

informazioni sulle parentele.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

Un esempio molto noto <strong>di</strong> gene maggiore è quello del Gene Booroola, identificato<br />

nella razza ovina australiana Merinos, che influenza la prolificità. La Merinos, razza<br />

specializzata per la produzione della lana, è caratterizzata da una modesta prolificità<br />

(valore me<strong>di</strong>o pari a 1,2 nati per parto); esiste però un ceppo, denominato appunto<br />

Booroola, che presenta valori me<strong>di</strong> <strong>di</strong> 2,5 nati/parto. La <strong>di</strong>fferenza nella prolificità<br />

me<strong>di</strong>a tra Merinos normale (M) e Merinos Booroola (MB) è ragguardevole e <strong>di</strong> non<br />

facile interpretazione; essa risulta ancor più sorprendente se si considera che una<br />

<strong>delle</strong> proprietà fondamentali dei caratteri quantitativi è quella <strong>di</strong> presentare una<br />

variabilità graduale (cioè continua), mentre in questo caso ci si trova chiaramente <strong>di</strong><br />

fronte ad un netto <strong>di</strong>vario (cioè ad una variabilità <strong>di</strong>scontinua). Ricor<strong>di</strong>amo (ve<strong>di</strong><br />

cap. 4) che la prolificità, come gran parte dei caratteri legati dalla sfera riproduttiva,<br />

presenta valori <strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tabilità piuttosto bassi (0,10-0,27) e che conseguentemente è<br />

preve<strong>di</strong>bile un limitato progresso genetico ottenibile per via selettiva: nel caso<br />

specifico va sottolineato invece che la MB è stata ottenuta dalla M me<strong>di</strong>ante una<br />

selezione attuata sulla sola linea femminile (i fratelli Sears, gli allevatori australiani<br />

che hanno creato la MB, sceglievano per la riproduzione le femmine nate da parti<br />

gemellari mentre i maschi li prendevano casualmente da allevamenti esterni: si pensi<br />

agli effetti sul progresso selettivo dei bovini da latte se si scegliessero solamente le<br />

vacche e si prendessero a caso i tori, un <strong>di</strong>sastro!). Con tale programma selettivo, i<br />

notevoli risultati ottenuti non potevano essere solamente dovuti all’aumento della<br />

frequenza degli alleli favorevoli in loci con un effetto piccolissimo sul carattere, ma<br />

l’unica spiegazione possibile era quella <strong>di</strong> un graduale aumento della frequenza<br />

degli in<strong>di</strong>vidui portatori <strong>di</strong> un allele favorevole in un singolo locus ad effetto<br />

maggiore sulla prolificità.<br />

Attualmente, si ritiene che al locus Booroola esistano almeno due alleli:<br />

F, che determina una alta prolificità e che si ritrova con elevatissima frequenza nelle<br />

MB;<br />

+, che determina una normale prolificità e che è largamente prevalente nella M.<br />

La <strong>di</strong>stinzione degli animali sulla base del loro genotipo è basata sui dati fenotipici,<br />

che consistono non nel numero <strong>di</strong> nati per parto, bensì in un carattere ad esso<br />

fortemente correlato: il tasso <strong>di</strong> ovulazione (TO), cioè il numero <strong>di</strong> cellule uovo che<br />

l’animale produce nel corso <strong>di</strong> un ciclo sessuale. I tre genotipi possibili vengono<br />

così <strong>di</strong>stinti:<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

FF<br />

F+<br />

++<br />

pecore che hanno avuto nel corso della loro carriera<br />

riproduttiva almeno un volta un TO≥5:<br />

pecore che hanno avuto nel corso della loro carriera<br />

riproduttiva almeno una volta un TO≥3 ma mai superiore a 4:<br />

pecore che nel corso della loro carriera riproduttiva non hanno<br />

mai avuto TO>2.<br />

L’effetto dell’allele F sulla prolificità è stato stimato pari ad 1 agnello per parto:<br />

cioè una pecora con genotipo F+ produce in me<strong>di</strong>a 1 agnello in più per parto<br />

rispetto ad una con genotipo ++. Di recente, grazie all’ausilio <strong>delle</strong> tecniche<br />

dell’ingegneria genetica, il gene Booroola è stato localizzato sul cromosoma 6 della<br />

specie ovina. Va però messo in evidenza che non è stato identificato il ruolo<br />

biochimico del gene Booroola, cioè non si conosce quale sia il prodotto <strong>di</strong>retto della<br />

sua attività (un enzima, un ormone etc.); tale caratteristica è comune alla maggior<br />

parte dei geni maggiori e QTL scoperti in campo zootecnico.<br />

Il gene Booroola controlla una quota importante della variabilità genetica della<br />

prolificità nella MB; il vantaggio selettivo che ne deriva può essere compreso<br />

considerando la storia della MB: i fratelli Sears hanno selezionato, anche se<br />

inconsciamente, a favore dell’allele F ottenendo dei risultati in termini <strong>di</strong><br />

miglioramento genetico assolutamente non raggiungibili nel caso <strong>di</strong> un totale<br />

controllo del carattere da parte <strong>di</strong> soli loci ad effetto infinitesimo.<br />

Oltre al gene Booroola sono stati in<strong>di</strong>viduati altri geni maggiori che influenzano le<br />

produzioni zootecniche:<br />

- il gene Weaver, messo in evidenza nella razza Bovina Brown, che è responsabile<br />

<strong>di</strong> una malattia che colpisce il sistema nervoso dei bovini, ma che influenza<br />

(sicuramente in maniera in<strong>di</strong>retta) anche la quantità <strong>di</strong> latte prodotto;<br />

- il gene dell’ipertrofia muscolare, evidenziato in alcune razze bovine da carne (Blu<br />

Belga, Charolaise, Piemontese) che determina la presenza della cosiddetta “doppia<br />

coscia”, caratteristica <strong>di</strong> pregio per gli animali destinati alla produzione della carne;<br />

- il gene della caseina αs1 che, nei caprini, influenza il contenuto proteico del latte.<br />

- il gene alotano, evidenziato nei suini, che influenza la qualità della carne.<br />

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9.2 Marcatori genetici<br />

L’identificazione del gene Booroola è stata possibile grazie all’osservazione dei<br />

fenotipi (prolificità o TO) e della trasmissione del carattere entro le famiglie<br />

(conoscenza dei rapporti <strong>di</strong> parentela). In altri casi l’effetto del singolo locus, pur<br />

essendo <strong>di</strong> una certa entità (cioè non infinitesimale), non è rilevabile in questo<br />

modo, ma bisogna ricorrere all’uso <strong>di</strong> marcatori genetici. Questo è il caso dei QTL<br />

propriamente detti; prima <strong>di</strong> passare alla loro trattazione è necessario però chiarire il<br />

concetto <strong>di</strong> marcatore genetico.<br />

Se due geni si trovano molto vicini su un cromosoma, allora la possibilità che tra<br />

essi avvenga una ricombinazione è piuttosto bassa. In questo caso i loci si <strong>di</strong>cono<br />

associati, cioè tra essi esiste quello che in inglese si chiama linkage (in italiano<br />

associazione). Le combinazioni alleliche che si trovano nei cromosomi parentali<br />

sono dette fasi <strong>di</strong> linkage. La conseguenza del linkage è che all’atto della meiosi, la<br />

trasmissione degli alleli <strong>di</strong> due geni associati non avviene in maniera in<strong>di</strong>pendente<br />

ma le combinazione alleliche presenti nei cromosomi parentali le ritroviamo anche<br />

nei cromosmi presenti nei gameti. Quando tra due geni esiste una stretto linkage, la<br />

seconda legge <strong>di</strong> Mendel sull’assortimento in<strong>di</strong>pendente degli alleli nei gameti non è<br />

più valida: si parla infatti <strong>di</strong> <strong>di</strong>sequilibrio <strong>di</strong> associazione (o <strong>di</strong> linkage).<br />

Il linkage sta alla base dell’utilizzazione dei marcatori genetici. Spesso i geni<br />

oggetto <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>o sono <strong>di</strong> <strong>di</strong>fficile identificazione: non si conosce quale realmente sia<br />

il gene che regola l’espressione del carattere che stiamo stu<strong>di</strong>ando; oppure non è<br />

possibile determinare il genotipo degli animali sulla base della manifestazione<br />

fenotipica del carattere; non si conosce la localizzazione cromosomica del gene e<br />

così via. In questi casi lo stu<strong>di</strong>o del gene viene condotto in<strong>di</strong>rettamente attraverso<br />

l’impiego <strong>di</strong> un altro gene ad esso strettamente associato, cioè si ricorre all’uso <strong>di</strong> un<br />

marcatore genetico.<br />

L’impiego <strong>di</strong> un marcatore genetico si basa sul fatto che, esistendo una forte<br />

associazione tra esso ed il gene oggetto <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>o, la segregazione degli alleli dei due<br />

loci non è in<strong>di</strong>pendente (esiste il <strong>di</strong>sequilibrio <strong>di</strong> associazione): cioè se A e B sono<br />

due loci associati su un cromosoma, ciascuno con due alleli (A1 e A2; B1 e B2), e il<br />

toro Gelsomino ha su un cromosoma la combinazione allelica A1 B1 e sul<br />

cromosoma omologo quella A2 B2, all’atto della formazione dei gameti l’allele A1<br />

andrà a finire nel nemasperma che contiene anche l’allele B1 (tranne il caso in cui si<br />

verifichino dei fenomeni <strong>di</strong> crossing-over, tanto più rari quanto più i due geni sono<br />

vicini fra loro). In questo modo i figli che hanno ere<strong>di</strong>tato l’allele A1 da Gelsomino,<br />

avranno ricevuto anche l’allele B1. Lo stesso <strong>di</strong>scorso vale per A2 e B2<br />

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Quin<strong>di</strong> in questo caso è possibile conoscere l’allele presente al locus B sulla base<br />

dell’allele che è presente al locus A; il locus A è un marcatore genetico del locus B.<br />

Va però tenuto ben presente il fatto che se si considera un altro toro, non parente <strong>di</strong><br />

Gelsomino, non è detto che anche in questo animale l’allele A1 si trovi associato a<br />

quello B1 e l’A2 al B2. Cioè la fase <strong>di</strong> associazione allele marcatore-allele gene <strong>di</strong><br />

interesse cambia da famiglia a famiglia e, entro la stessa famiglia, può cambiare con<br />

il passare <strong>delle</strong> generazioni (possibilità che si verifichino crossing over).<br />

Sulla base <strong>di</strong> quanto detto in precedenza, possiamo definire un marcatore genetico<br />

come gene che presenta le seguenti caratteristiche:<br />

a) deve essere strettamente associato con il gene oggetto <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>o, poiché più i due<br />

loci sono vicini, minore è la probabilità che tra essi si verifichi una ricombinazione. I<br />

risultati <strong>di</strong> numerose in<strong>di</strong>cano che la <strong>di</strong>stanza massima tra marcatore genetico e gene<br />

non dovrebbe superare i 20 cM.<br />

b) deve presentare un elevato polimorfismo (cioè avere più alleli). Il polimorfismo<br />

consente <strong>di</strong> stabilire l’origine <strong>di</strong> un allele: se l’allele portato da un in<strong>di</strong>viduo è<br />

presente nel padre e non nella madre, ovviamente l’in<strong>di</strong>viduo lo avrà ricevuto dal<br />

padre. E’ chiaro quin<strong>di</strong> che tanto maggiore sarà il polimorfismo <strong>di</strong> un locus<br />

marcatore, tanto maggiore sarà la possibilità che i genitori abbiano genotipo<br />

<strong>di</strong>fferente e maggiore sarà la probabilità <strong>di</strong> in<strong>di</strong>viduare l’origine dell’allele. Una<br />

<strong>delle</strong> ragioni della grande <strong>di</strong>ffusione dei marcatori a livello del DNA, ed in<br />

particolare dei microsatelliti, deriva proprio dall’elevatissimo polimorfismo che essi<br />

presentano.<br />

c) deve avere una sicura e facile identificazione genotipica. Cioè il genotipo al<br />

locus marcatore deve essere facilmente ed inequivocabilmente determinato. Sino a<br />

qualche tempo fa tale determinazione veniva fatta a livello fenotipico, ora grazie<br />

all’avvento dell’analisi genetica molecolare, la determinazione del genotipo o<br />

tipizzazione, viene fatta a livello <strong>di</strong> DNA. Tra i vantaggi <strong>di</strong> quest’ultima tecnica, va<br />

ricordato il fatto che essa consente <strong>di</strong> tipizzare gli animali in<strong>di</strong>pendentemente dalla<br />

manifestazione fenotipica del carattere e quin<strong>di</strong> il più precocemente possibile.<br />

d) deve avere un meccanismo ere<strong>di</strong>tario <strong>di</strong> tipo mendeliano semplice, in modo che<br />

la identificazione dell’origine degli alleli posseduti da un in<strong>di</strong>viduo sia il più agevole<br />

possibile. Ovviamente, un marcatore codominante sarà più informativo <strong>di</strong> uno i cui<br />

alleli presentano fenomeni <strong>di</strong> dominanza e recessività.<br />

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9.2.1 Genotipo del locus alotano nei suini<br />

Un esempio <strong>di</strong> impiego <strong>di</strong> marcatore genetico per lo stu<strong>di</strong>o <strong>di</strong> un gene <strong>di</strong> interesse<br />

economico è rappresentato dal caso del cosiddetto gene alotano. Nei suini è<br />

presente una patologia nota come Ipertermia Maligna che determina una rapida<br />

mo<strong>di</strong>ficazione post-mortem del tessuto muscolare: le carni dei suini colpiti da questa<br />

sindrome si presentano pallide, soffici ed essudative (carni PSE).<br />

A livello biochimico, tali caratteristiche negative <strong>delle</strong> carni sono determinate da una<br />

glicolisi muscolare troppo rapida con conseguente eccessivo abbassamento del pH<br />

del muscolo entro la prima ora post mortem; l’interazione tra basso pH e ed elevata<br />

temperatura determina una denaturazione <strong>delle</strong> proteine del muscolo con<br />

conseguenti scarsa capacità <strong>di</strong> ritenzione idrica, colore pallido (per effetto<br />

dell’ossidazione del ferro del gruppo eme dell’emoglobina) ed una carne<br />

eccessivamente molle. L’insorgenza <strong>di</strong> questa patologia è accentuata dalle<br />

situazioni <strong>di</strong> stress alle quali possono essere sottoposti gli animali ad esempio nel<br />

trasporto dall’allevamento al macello, e nelle <strong>di</strong>verse fasi della macellazione; infatti<br />

l’ipetermia maligna insieme con la sindrome PSE <strong>delle</strong> carni vengono compresa<br />

nella più ampia sindrome suina dello stress (PSS). Le carni PSE presentano <strong>delle</strong><br />

caratteristiche qualitative piuttosto scadenti <strong>delle</strong> carni con conseguente danno<br />

economico per il deprezzamento <strong>delle</strong> stesse. Per quanto riguarda la produzione<br />

della carne per il consumo fresco (suino magro da macelleria), le carni PSE<br />

presentano, oltre ad un aspetto poco attraente, anche <strong>delle</strong> maggiori per<strong>di</strong>te durante<br />

la fase <strong>di</strong> cottura ed una evidente stopposità all’atto della masticazione. Nella<br />

produzione del suino pesante destinato alla trasformazione in insaccati, le carni PSE<br />

comportano una riduzione <strong>delle</strong> rese in prosciutto cotto, mentre nella lavorazione<br />

del prosciutto crudo comportano maggiori cali <strong>di</strong> stagionatura, una sapore più salato<br />

e <strong>di</strong>fetti <strong>di</strong> colore. Il locus responsabile <strong>di</strong> tale anomalia, denominato appunto gene<br />

alotano (Hal), può presentare due alleli: uno dominante (N) che da luogo a carni<br />

normali, ed uno recessivo (n) che, se presente in forma omozigote (nn), determina la<br />

presenza <strong>di</strong> carni PSE; gli eterozigoti Nn presentano caratteristiche qualitative della<br />

carne comunque inferiori rispetto a quelle degli in<strong>di</strong>vidui “sani” (NN). La <strong>di</strong>ffusione<br />

dell’allele recessivo pare sia stata favorita in maniera involontaria dalla selezione<br />

che è stata operata nei suini a favore dell’aumento dei tagli magri nella carcassa in<br />

quanto questa caratteristica pare sia associata alla sensibilità allo stress (e quin<strong>di</strong><br />

all’allele n). I tre <strong>di</strong>versi genotipi al locus Hal e le rispettive espressioni fenotipiche<br />

sono:<br />

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Genotipo Fenotipo<br />

NN carni normali<br />

Nn carni normali<br />

Nn carni PSE<br />

La sindrome PSE può essere evidenziata nelle carni dopo la macellazione; il<br />

genotipo al locus Hal può essere determinato anche sugli animali vivi, attraverso un<br />

test che consiste nel mettere a contatto gli animali con il gas anestetico alotano (da<br />

cui deriva il nome del gene): gli animali nn, in presenza del gas, hanno un<br />

comportamento particolare (spasmi muscolari, irrigi<strong>di</strong>mento degli arti) e possono<br />

essere pertanto scartati dalla riproduzione. Il test però non è in grado <strong>di</strong> in<strong>di</strong>viduare<br />

gli eterozigoti Nn, che possiedono comunque l’allele n e possono trasmetterlo alla<br />

<strong>di</strong>scendenza. Pertanto è stato necessario ricorrere all’uso dei marcatori genetici. Il<br />

gene Hal si trova in un gruppo <strong>di</strong> sintenia <strong>di</strong> cui fa parte anche il gene dell’enzima<br />

fosfoesoso isomerasi (PHI), enzima presente nei globuli rossi, che può essere usato<br />

come marcatore genetico. Il genotipo degli animali al locus PHI, che presenta due<br />

alleli (A e B) codominanti è facilmente determinabile me<strong>di</strong>ante elettroforesi.<br />

Nel caso dei loci Hal e PHI si stabilisce una associazione fra alleli che rimane fissa<br />

nelle generazioni successive. Nella tabella 2a è riportato un esempio <strong>di</strong> previsione<br />

del genotipo alotano attraverso l’impiego del marcatore genetico PHI e del test<br />

alotano in una famiglia <strong>di</strong> suini.<br />

Tabella 2a. Previsione del genotipo alotano con l’uso del marcatore genetico PHI<br />

Test alotano Genotipo PHI Genotipo Hal<br />

Verro No test AB ?<br />

Scrofa No test AB ?<br />

Figli<br />

A Negativo AB NN o Nn<br />

B Positivo BB nn<br />

C Negativo AA NN o Nn<br />

D Negativo AB NN o Nn<br />

Il verro e la scrofa non sono stati sottoposti ad un test con l’alotano: tre figli<br />

(A,C.D) risultano negativi (possono essere NN oppure Nn) ed uno positivo (B,<br />

sicuramente nn).<br />

Come risalire al genotipo dei tre figli negativi e dei due genitori?<br />

Nella terza colonna della tabella 2a è in<strong>di</strong>cato il genotipo al locus PHI degli<br />

animali. Il figlio B, che è l’unico <strong>di</strong> cui conosciamo con certezza il genotipo Hal è<br />

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anche l’unico omozigote BB al locus PHI; tutti gli altri sono eterozigoti AB.<br />

Allora, poiché i loci PHI e Hal sono associati e quin<strong>di</strong> le loro combinazioni<br />

alleliche (aplotipi) si mantengono fisse e siccome B è nn nel locus Hal e BB nel<br />

locus PHI, l’aplotipo Hal-PHI sarà nB; quin<strong>di</strong>, nella famiglia <strong>di</strong> suini che stiamo<br />

esaminando ogni volta che nel locus Phi c’è l’allele B, nel locus Hal vi sarà<br />

l’allele n e, viceversa, A sarà associato ad N. Una volta stabilita la fase <strong>di</strong><br />

associazione tra gli alleli dei due loci è possibile ricostruire il genotipo al locus<br />

Hal <strong>di</strong> tutti i componenti della famiglia (Tabella 2b).<br />

Tabella 2b. Previsione del genotipo alotano con l’uso del marcatore genetico PHI<br />

Test alotano Genotipo PHI Genotipo Hal<br />

Verro no test AB Nn<br />

Scrofa<br />

Figli<br />

no test AB Nn<br />

A Negativo AB Nn<br />

B Positivo BB<br />

9.3nn<br />

C Negativo AA NN<br />

D Negativo AB Nn<br />

Va sottolineato che la fase <strong>di</strong> associazione PHI-Hal (A-N e B-n) è valida solo per la<br />

famiglia oggetto <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>o e non può essere estesa a tutta la popolazione suina: se si<br />

ripetesse l’analisi in un’altra famiglia si potrebbe trovare l’allele A <strong>di</strong> PHI associato<br />

con l’allele n <strong>di</strong> Hal. Inoltre, con<strong>di</strong>zione in<strong>di</strong>spensabile per l’applicazione <strong>di</strong> tale<br />

analisi è che nella famiglia sia presente almeno un componente positivo al test<br />

alotano.<br />

Nel 1991 un equipe <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>osi canadesi ha evidenziato che l’ipertermia maligna è<br />

adovuta ad una sostituzione <strong>di</strong> basi (C-T) nel nucleotide 1843 del gene CRC<br />

(Calcium Release Channel) che regola il flusso <strong>di</strong> Calcio nel reticolo<br />

sarcoplasmatico del muscolo scheletrico relassociato ad l’ipertermia maligna: la<br />

sostituzione <strong>delle</strong> basi determina una sostituzione aminoaci<strong>di</strong>ca in posizione 615<br />

della proteina (Arginina.-Cisteina) con una riduzione del flusso del Calcio. Il<br />

genotipo al locuc CRC oggi viene pertanto determinato <strong>di</strong>rettamente a livello del<br />

DNA me<strong>di</strong>ante un’analisi condotta con la tecnica della Reazione a Catena della<br />

Polimerasi (PCR) che permette l’identificazione precoce e sicura (cioè <strong>di</strong>stingue<br />

anche gli eterozigoti). Una recente indagine condotta con tale analisi su verri <strong>di</strong><br />

<strong>di</strong>verse razze suine allevato in Italia utilizzati in F.A. (Tabella 3) ha mostrato come<br />

nelle razze Large White italiana e la Landrace italiana, tra<strong>di</strong>zionalmente allevate in<br />

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Italia per la produzione del suino pesante razze e da anni selezionate per<br />

l’eliminazione alla sensibilità all’alotano (attraverso l’impiego <strong>di</strong> tale test sui verri<br />

da impiegare in F.A.), la frequenza dell’allele n sia molto ridotta, mentre in altre,<br />

come la Pietrain, che presentano <strong>delle</strong> caratteristiche eccezionali dal punto <strong>di</strong> vista<br />

della muscolosità e della resa in tagli magri della carcassa, la situazione è<br />

completamente rovesciata, con la stragrande prevalenza dell’allele n su quello N.<br />

Tabella 3. Frequenze geniche del locus alotano (CRC) nelle razzze suine allevate in<br />

Italia (russo et<br />

al., 1996)<br />

Razza Numero Frequenze alleliche<br />

N n<br />

Large White Italiana 257 0,967 0,033<br />

Landrace Italiana 150 0,897 0,103<br />

Duroc 154 0,929 0,071<br />

Landrace Belga 44 0,023 0,977<br />

Pietrain 37 0,027 0,973<br />

Hampsire 20 1,000 0,000<br />

9.3.1 Gene dell’ipertrofia muscolare (doppia coscia) nei bovini da carne<br />

Altro caso <strong>di</strong> gene ad effetto maggiore su caratteri <strong>di</strong> interesse zootecnico è quello<br />

del gene che determina ipertrofia muscolare nei bovini, carattere noto come doppia<br />

coscia. Tale carattere si manifesta in <strong>di</strong>verse razze bovine: la razza dove è stato<br />

maggiormente stu<strong>di</strong>ato è la Blu Belga; tra le razze italiane esso è presente nella<br />

razza Piemontese e anche in quella Marchigiana. A livello fenotipico, gli animali<br />

con il carattere doppia coscia, presentano: a) una ipertrofia muscolare generalizzata<br />

<strong>di</strong> circa il 20%, mentre tutti gli altri organi sono <strong>di</strong> <strong>di</strong>mensioni ridotte; b) tessuto<br />

muscolare con contenuto a<strong>di</strong>poso ridotto sino al 40% ed anche minore contenuto <strong>di</strong><br />

tessuto connettivo, caratteri entrambi apprezzati dal consumatore; 3) in<strong>di</strong>ce <strong>di</strong><br />

conversione alimentare inferiore del 9% rispetto alla norma.; c) aumento <strong>delle</strong><br />

<strong>di</strong>stocie (+15%) a causa del maggiore peso alla nascita ed alla conformazione dei<br />

vitelli.<br />

Il gene responsabile del carattere della doppia coscia è un locus autosomale nel<br />

quale sono presenti due alleli: uno normale (+) ed uno che determina l’ipertrofia<br />

muscolare (mh). Il tipo <strong>di</strong> rapporto che esiste tra questi due alleli non è del tutto<br />

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chiaro. In un primo momento si riteneva che l’allele mh fosse recessivo e che<br />

pertanto gli animali con genotipo (+/+) e (+/mh) fossero normali mentre gli animali<br />

(mh/mh) fossero quelli che manifestavano l’ipertrofia muscolare. In realtà una<br />

recente ricerca condotta su bovini <strong>di</strong> razza Piemontese e su loro incroci, ha<br />

evidenziato che gli eterozigoti e gli omozigoti +/+ non presentano <strong>di</strong>fferenze per<br />

quanto riguarda la <strong>di</strong>fficoltà <strong>di</strong> parto mentre le <strong>di</strong>fferenze esistono per il peso dei<br />

vitelli all nascita: gli animali +/+ pesavano kg 36,9, gli eterozigoti kg 40,8 e gli<br />

omozigoti mh/mh 41,2. Pertanto l’eterozigote è in posizione interme<strong>di</strong>a tra i due<br />

omozigoti anche se più spostato verso il genotipo mh/mh.<br />

A livello genomico, il responsabile del carattere della doppia coscia è stato stato<br />

identificato nel gene della miostatina (GDF8), un enzima che esercita una funzione<br />

<strong>di</strong> regolazione negativa sullo sviluppo <strong>delle</strong> masse muscolari e che nel bovino è<br />

localizzato sul cromosoma 2. Le variazioni genetiche che hanno causato la<br />

formazione dell’allele responsabile dell’ipertrofia muscolare non sono le stesse nelle<br />

<strong>di</strong>fferenti razze. Nella razza Piemontese l’allele che determina la doppia coscia è<br />

caratterizzato dalla mutazione alla posizione 938 del terzo esone, con una<br />

sostituzione <strong>di</strong> una guanina con una adenina; tale sostituzione causa nella proteina<br />

una sostituzione alla posizione 313 <strong>di</strong> una tirosina con una cisteina, fatto che<br />

inattiva la funzionalità della proteina e quin<strong>di</strong> determina l’ipertrofia muscolare. Nel<br />

caso invece della razza Blu Belga, c’è una delezione <strong>di</strong> una sequenza <strong>di</strong> 11 basi<br />

(819-829) nel terzo esone del gene della miostatina che determina una prematura<br />

interruzione nella fase <strong>di</strong> traduzione. Nella razza Marchigiana infine, gli in<strong>di</strong>vidui<br />

ipertrofici mostrano una sostituzione transversione Guanina – Timina in posizione<br />

874, con conseguente cambiamento <strong>di</strong> un codone che co<strong>di</strong>ficava l’acido glutammico<br />

in un codone <strong>di</strong> stop della traduzione. Questa mutazione fa si che una parte della<br />

proteina ricca in cisteina (6 aa), e che giocherebbe un ruolo importante nella<br />

struttura dell’enzima, non venga tradotta con conseguente per<strong>di</strong>ta dell’attività della<br />

proteina stessa.<br />

9.4 QTL<br />

Il primo esperimento in cui è stata evidenziata una associazione tra un locus<br />

marcatore ed un QTL è stato quello condotto da Sax nel 1923 su due varietà <strong>di</strong><br />

fagiolo (Phaseolus vulgaris) che <strong>di</strong>fferivano sensibilmente per il peso e per la<br />

colorazione del seme; il primo rappresentava il carattere quantitativo oggetto <strong>di</strong><br />

stu<strong>di</strong>o, il secondo il marcatore. La varietà gialla, omozigote dominante (PP) al<br />

locus responsabile della colorazione, presentava un peso me<strong>di</strong>o dei semi <strong>di</strong> 48<br />

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centigrammi; la varietà bianca, omozigote recessiva (pp), presentava un peso me<strong>di</strong>o<br />

dei semi pari 48 cg. Incrociando le due varietà Sax ottenne degli F1 ovviamente tutti<br />

eterozigoti Pp; incrociando gli F1 tra <strong>di</strong> loro ottenne una F2 con i seguenti genotipi e<br />

peso dei semi<br />

Genotipo marcatore PP Pp Pp<br />

Peso semi (cg) 30.7 28.3 26.4<br />

E’ evidente che a ciascuna classe <strong>di</strong> genotipi al marcatore corrispondeva un <strong>di</strong>verso<br />

peso me<strong>di</strong>o dei semi; ciò fu interpretato come la prova dell’esistenza <strong>di</strong> una<br />

associazione tra il locus responsabile della colorazione del seme e un QTL che<br />

influenzava il peso dei semi stessi. Per cui in<strong>di</strong>cando con A e a gli alleli del QTL che<br />

determina un peso superiore ed inferiore rispettivamente, i genotipi al QTl sarebbero<br />

i seguenti:<br />

Genotipo marcatore PP Pp pp<br />

Genotipo QTL AA Aa aa<br />

Peso semi (cg) 30.7 28.3 26.4<br />

L’effetto <strong>di</strong> sostituzione allelica al QTL può essere stimato dalla relazione:<br />

(peso semi PP - peso semi pp)/2 cioè (30.7-26.4)/2 = 2.15 g<br />

Si noti che l’effetto risultava perfettamente <strong>di</strong> tipo ad<strong>di</strong>tivo in quanto l’eterozigote<br />

Pp presentava un peso interme<strong>di</strong>o rispetto a quello dei due omozigoti.<br />

La ricerca dei QTL nelle specie animali <strong>di</strong> interesse zootecnico si presenta più<br />

complessa e <strong>di</strong>fficile: il principio fondamentale è lo stesso, cioè bisogna raggruppare<br />

gli animali in base all’allele marcatore posseduto e poi vedere se i due gruppi così<br />

costituiti <strong>di</strong>fferiscono tra loro nel carattere produttivo oggetto <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>o; per ovvi<br />

motivi <strong>di</strong> or<strong>di</strong>ne economico e tecnico però non è proponibile un approccio tipo<br />

quello visto in precedenza. Se si vuole ricercare, ad esempio, un eventuale QTL con<br />

effetto sulla produzione <strong>di</strong> latte nella razza ovina Sarda non è pensabile <strong>di</strong> costruirsi<br />

una popolazione ad hoc attraverso un piano <strong>di</strong> incroci come quello attuato da Sax (ci<br />

vorrebbe troppo tempo ed i costi sarebbero pazzeschi), ma la popolazione ovina<br />

Sarda deve essere analizzata così come è; ciò comporta, rispetto al lavoro <strong>di</strong> Sax, un<br />

maggiore sforzo soprattutto nella fase <strong>di</strong> elaborazione dei dati. L’analisi inoltre va<br />

condotta, come nel caso del gene Hal, entro le singole famiglie.<br />

Ad esempio, noi abbiamo l’Ariete Tommaso che è eterozigote ad un locus<br />

marcatore A (Tommaso è A1A2); separiamo le figlie <strong>di</strong> Tommaso (poniamo 60)<br />

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sulla base dell’allele marcatore che hanno ere<strong>di</strong>tato dal padre, in un gruppo tutte<br />

quelle che hanno A1 e nell’altro quelle che hanno A2, e confrontiamo le me<strong>di</strong>e<br />

produttive dei due <strong>di</strong>versi gruppi. Se le me<strong>di</strong>e dei due gruppi, opportunamente<br />

corrette per i principali fattori zootecnici che influenzano la produzione (or<strong>di</strong>ne <strong>di</strong><br />

parto, tipo <strong>di</strong> parto etc.), sono <strong>di</strong>verse in maniera statisticamente significativa<br />

possiamo concludere che entro la famiglia <strong>di</strong> Tommaso è associato al locus A un<br />

qualcosa (forse un QTL) che influenza la produzione del latte. Le elaborazioni<br />

statistiche che vengono realmente svolte per evidenziare la presenza del QTL sono<br />

estremamente complesse; inoltre, una con<strong>di</strong>zione essenziale è che si possa<br />

determinare con esattezza l’allele marcatore che ciascuna figlia ha ere<strong>di</strong>tato dal<br />

padre.<br />

Numerose ricerche sono in atto per la in<strong>di</strong>viduazione <strong>di</strong> QTL in <strong>di</strong>verse specie <strong>di</strong><br />

interesse zootecnico (bovini, ovini, suini, polli). Uno stu<strong>di</strong>o condotto recentemente<br />

dal Gruppo del Prof. Georges negli Stati Uniti su bovini da latte, ha evidenziato la<br />

presenza <strong>di</strong> QTL che influenzano la produzione quantitativa <strong>di</strong> latte, con effetti <strong>di</strong><br />

sostituzione allelica che possono portare a <strong>di</strong>fferenze nella produzione <strong>di</strong> latte pari<br />

ad oltre 300 chilogrammi per lattazione.<br />

9.5 Prospettive.<br />

Le recenti acquisizioni sui Geni Maggiori e QTL aprono indubbiamente <strong>delle</strong> nuove<br />

e allettanti prospettive per il miglioramento genetico; è necessaria però una attenta<br />

valutazione tecnica ed economica del problema. La ricerca <strong>di</strong> QTL in una<br />

popolazione <strong>di</strong> bovini da latte, ad esempio, comporta la necessità <strong>di</strong> <strong>di</strong>sporre oltre<br />

che dei dati relativi alle produzioni ed alle parentele (operazioni <strong>di</strong> routine nei<br />

programmi selettivi imperniati sulle prove <strong>di</strong> progenie quali quelli dei bovini da<br />

latte) anche del genotipo degli animali ai loci che fungono da marcatori genetici, con<br />

conseguente aumento del costo complessivo <strong>di</strong> attuazione del programma selettivo<br />

stesso. Di conseguenza , gli incrementi <strong>di</strong> progresso genetico ottenibili con in<br />

schemi <strong>di</strong> selezione che utilizzano i QTL (schemi MAS= Selezione Assistita da<br />

Marcatori) debbono essere mesi a confronto con il relativo l’aumento dei costi. Al<br />

giorno d’oggi il confronto sarebbe probabilmente a sfavore dell’utilizzo dei QTL,<br />

per lo meno in schemi selettivi quali quelli utilizzati per i bovini da latte, sia per gli<br />

elevati costi <strong>delle</strong> analisi sia per la complessità <strong>delle</strong> elaborazioni; è preve<strong>di</strong>bile però<br />

che in un futuro non troppo lontano, in considerazione del fatto che i criteri generali<br />

della selezione animale sembrano spostarsi verso schemi caratterizzati dall’aumento<br />

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della velocità del miglioramento genetico (schemi “giovanili”) piuttosto che verso<br />

quelli che pre<strong>di</strong>ligono l’aumento dell’accuratezza (i cosiddetti “schemi<br />

convenzionali”), tale situazione possa essere ribaltata.<br />

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10. LE RELAZIONI FRA GLI ANIMALI<br />

Arrivati a questo ultimo capitolo, siamo in grado <strong>di</strong> valutare l’importanza <strong>delle</strong><br />

informazioni fenotipiche che derivano non solo dall’animale can<strong>di</strong>dato alla<br />

selezione, ma anche dai suoi parenti. Il calcolo dell’in<strong>di</strong>ce genetico, effettuato sia<br />

nel modo tra<strong>di</strong>zionale che con la meto<strong>di</strong>ca BLUP, tiene conto del peso <strong>delle</strong><br />

informazioni provenienti dagli altri animali attraverso il grado <strong>di</strong> parentela che li<br />

lega con il soggetto interessato alla selezione.<br />

Gli animali parenti hanno un corredo genetico simile e l’accoppiamento fra <strong>di</strong> loro<br />

(inincrocio) produce una progenie che ha una frazione <strong>di</strong> omozigosi più elevata<br />

<strong>delle</strong> me<strong>di</strong>a della popolazione. Viceversa l’accoppiamento <strong>di</strong> animali con corre<strong>di</strong><br />

cromosomici molto <strong>di</strong>versi (esincrocio) da origine a figli con un grado <strong>di</strong><br />

eterozigosi superiore a quello me<strong>di</strong>o della popolazione a cui essi appartengono.<br />

La conoscenza del grado <strong>di</strong> parentela fra due in<strong>di</strong>vidui è perciò importante in<br />

zootecnica da un lato per l’applicazione dei sistemi <strong>di</strong> valutazione genetica dei<br />

can<strong>di</strong>dati alla selezione, dall’altro per le tecniche riproduttive dell’incrocio e della<br />

consanguineità.<br />

In questo capitolo apprenderemo le modalità <strong>di</strong> calcolo dei coefficienti <strong>di</strong> parentela<br />

e <strong>di</strong> consanguineità e faremo un breve accenno ai meto<strong>di</strong> <strong>di</strong> accoppiamento fra<br />

animali parenti.<br />

10.1 La relazione <strong>di</strong> parentela<br />

Gli animali <strong>di</strong> una popolazione zootecnica hanno una frazione <strong>di</strong> geni in comune, ma<br />

due animali parenti fra <strong>di</strong> loro presentano una frazione ad<strong>di</strong>zionale <strong>di</strong> geni uguali nel<br />

loro corredo genetico. Nel senso comune due in<strong>di</strong>vidui sono considerati parenti<br />

quando hanno un ascendente in comune per cui la frazione ad<strong>di</strong>zionale <strong>di</strong> geni<br />

comuni <strong>di</strong>pende dalla <strong>di</strong>stanza, espressa in atti fecondativi (o generazioni), che li<br />

separa dall’antenato comune. I gra<strong>di</strong> <strong>di</strong> parentela esprimono la probabilità che due<br />

in<strong>di</strong>vidui abbiano un gene in comune ed è intuitivo il fatto che parenti lontani siano<br />

coloro la cui probabilità <strong>di</strong> avere geni comuni è più bassa.<br />

La parentela è calcolata, sia in zootecnica che in tribunale per <strong>di</strong>rimere le<br />

controversie in materia <strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tà, in linea <strong>di</strong>retta ed in linea collaterale: la prima è<br />

quella che separa “<strong>di</strong>rettamente” un in<strong>di</strong>viduo dal suo ascendente (genitore, nonno,<br />

bisnonno); la seconda è quella che separa due in<strong>di</strong>vidui che hanno un ascendente<br />

comune. I gra<strong>di</strong> <strong>di</strong> parentela sono il numero <strong>di</strong> atti fecondativi intercorrenti fra gli<br />

in<strong>di</strong>vidui in considerazione e poiché per ogni passaggio la probabilità che sia<br />

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trasmesso un gene è del 50%, essi sono misurati da un coefficiente espresso in<br />

frazioni <strong>di</strong> unità.<br />

Esempio 10.1 Consideriamo questa struttura familiare<br />

A→B→C<br />

↓<br />

D<br />

↓<br />

E<br />

in cui le frecce in<strong>di</strong>cano gli atti fecondativi che separano gli in<strong>di</strong>vidui. Il grado <strong>di</strong><br />

parentela fra A e B (genitore/figlio) in linea <strong>di</strong>retta è <strong>di</strong> primo grado ed il suo<br />

coefficiente è 0,5 in quanto la probabilità che essi abbiano un gene in comune è<br />

del 50%; quella fra A e C (nonno/nipote) è sempre <strong>di</strong>retta, ma <strong>di</strong> 2° grado ed il suo<br />

coefficiente è <strong>di</strong> 0,25 (0,5 x 0,5). La parentela in linea collaterale fra C e E si<br />

computa in base agli atti fecondativi che separano i due in<strong>di</strong>vidui che, nel nostro<br />

caso, sono 4, per cui la parentela è <strong>di</strong> 4° grado ed il suo coefficiente è 0,0625.<br />

I gruppi <strong>di</strong> in<strong>di</strong>vidui parenti fra <strong>di</strong> loro prendono, in zootecnica, <strong>di</strong>verse<br />

denominazioni in base all’entità della parentela che li contrad<strong>di</strong>stingue.<br />

La famiglia è un gruppo <strong>di</strong> in<strong>di</strong>vidui <strong>di</strong>scendenti da antenati comuni; poiché però il<br />

corredo genetico ere<strong>di</strong>tato da questi antenati comuni si <strong>di</strong>mezza con il passare <strong>delle</strong><br />

generazioni, il concetto <strong>di</strong> famiglia si perde rapidamente.<br />

La linea è un insieme <strong>di</strong> animali caratterizzati da elevata consanguineità ottenuta<br />

con accoppiamenti fra in<strong>di</strong>vidui parenti; la creazione <strong>di</strong> linee parentali, <strong>di</strong> largo<br />

impiego nel miglioramento genetico dei vegetali, è utilizzata in zootecnica in alcune<br />

specie quali i suini e i conigli in cui esse sono sfruttate per l’incrocio con<br />

l’ottenimento dei cosiddetti ibri<strong>di</strong> commerciali.<br />

Il ceppo è un gruppo <strong>di</strong> animali abbastanza numeroso appartenenti ad una razza in<br />

cui gli accoppiamenti all’interno del gruppo si sono verificati, per varie cause, con<br />

una frequenza superiore a quelli del resto della razza. Ad esempio, nella razza<br />

bovina Frisona si riconoscono, oltre al ceppo originario olandese, i ceppi tedesco,<br />

britannico, italiano, ecc., che si sono originati per il fatto che all’interno dei confini<br />

degli stati (ed in alcuni casi anche <strong>di</strong> regioni geografiche molto limitate) esiste una<br />

maggiore facilità <strong>di</strong> scambio dei riproduttori per ragioni linguistiche; un fatto<br />

analogo avviene anche nel caso dei matrimoni (donne e buoi dei paesi tuoi).<br />

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10.2 Il coefficiente <strong>di</strong> parentela R<br />

Il coefficiente <strong>di</strong> parentela fra due animali A e B (RAB) è uguale alla frazione me<strong>di</strong>a<br />

<strong>di</strong> geni comuni che coppie <strong>di</strong> animali con la stessa relazione <strong>di</strong> parentela <strong>di</strong> A e B<br />

possiedono in più della frazione me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> geni comuni fra due in<strong>di</strong>vidui qualsiasi<br />

della popolazione. Come abbiamo illustrato nell’esempio, il calcolo del coefficiente<br />

<strong>di</strong> parentela è piuttosto facile se gli animali sono collegati in linea <strong>di</strong>retta, ma <strong>di</strong><br />

complica un po' se essi sono collegati in linea collaterale, soprattutto se essi hanno<br />

più <strong>di</strong> un ascendente comune.<br />

La conoscenza della struttura degli ascendenti, che per gli uomini è detta albero<br />

genealogico, nelle specie zootecniche è chiamata genealogia o pe<strong>di</strong>gree. Essa è<br />

normalmente riportata con i nomi (o con le matricole) degli ascendenti dell’animale<br />

in oggetto.<br />

Esempio 10.2 Ve<strong>di</strong>amo come può essere riportata la genealogia <strong>di</strong> Telemaco,<br />

ronzino baio del figlio <strong>di</strong> Don Chisciotte (della Mancia).<br />

(Nonno P) (Nonna P) (Nonno M) (Nonna P)<br />

Arconte (a) Geronzia(b) Fiorellino(e) Maga Magò(f)<br />

(Padre) (Madre)<br />

Fritto Misto(c) Sailor Moon(g)<br />

TELEMACO (x)<br />

e quella <strong>di</strong> Paride, mezzo fratello (suo malgrado) <strong>di</strong> Telemaco<br />

(Padre) (Madre)<br />

Fritto Misto (c) Biancaneve (h)<br />

PARIDE(y)<br />

e calcoliamo il coefficiente <strong>di</strong> parentela fra Maga Magò e Telemaco Rfx e notiamo<br />

come esso sia la risultante del prodotto fra i coefficienti <strong>di</strong> parentela fra Maga<br />

Magò e Sailor Moon (Rfg) e Sailor Moon e Telemaco (Rgx) = 0,5 x 0,5 = 0,25.<br />

Anche il coefficiente <strong>di</strong> parentela fra Paride e Telemaco è <strong>di</strong> 0,25.<br />

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In generale, il coefficiente <strong>di</strong> parentela fra due in<strong>di</strong>vidui X e Y in linea <strong>di</strong>retta<br />

separati da n generazioni è calcolato con<br />

[1] Rxy = 0,5 n<br />

quello in linea collaterale è ottenuto dal prodotto dei coefficienti calcolati in linea<br />

<strong>di</strong>retta.<br />

Esempio 10.2 (continua) Poniamo che vogliamo calcolare la parentela fra Paride<br />

e Galla Placi<strong>di</strong>a (z) sua sorella piena (cioè anche essa figlia <strong>di</strong> Fritto Misto e <strong>di</strong><br />

Biancaneve); in questo casi i parenti comuni sono 2, per cui il coefficiente <strong>di</strong><br />

parentela è la somma dei singoli coefficienti calcolati per via paterna e per via<br />

materna Ryz = 0,25 + 0,25 = 0,5: il grado <strong>di</strong> parentela tra fratelli pieni (non<br />

gemelli omozigoti che è l’unico caso negli animali in cui il coefficiente <strong>di</strong><br />

parentela è 1) è perciò uguale a quello intercorrente fra un genitore ed un figlio.<br />

In generale se X e Y sono imparentati tramite più ascendenti comuni, il coefficiente<br />

<strong>di</strong> parentela è calcolato con la relazione<br />

[2] Rxy = Σ 0,5 n(a)<br />

in cui la sommatoria è estesa a tutti gli ascendenti comuni per ciascuno dei quali<br />

sono calcolate il numero <strong>di</strong> generazioni per via <strong>di</strong>retta.<br />

10.3 La consanguineità<br />

Un animale è detto inincrociato (o consanguineo) quando esiste una relazione <strong>di</strong><br />

parentela fra il padre e la madre; gli accoppiamenti fra animali parenti sono detti<br />

accoppiamenti in inincrocio o in consanguineità.<br />

L’effetto della consanguineità è l’aumento <strong>di</strong> loci omozigoti nell’in<strong>di</strong>viduo<br />

inincrociato rispetto alla me<strong>di</strong>a della popolazione. La probabilità che un in<strong>di</strong>viduo x<br />

abbia un locus omozigote è calcolata dal coefficiente <strong>di</strong> consanguineità Fx e<br />

<strong>di</strong>pende dalla parentela fra i genitori Rcg. secondo la relazione<br />

[3] Fx = 0,5 Rcg.<br />

Notiamo subito (e ricor<strong>di</strong>amo bene) che il coefficiente <strong>di</strong> consanguineità è riferito ad<br />

un singolo animale, mentre quello <strong>di</strong> parentela a due animali.<br />

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Esempio 10.3 Poniamo che nell’esempio precedente colui che ha trascritto il nome<br />

dei genitori <strong>di</strong> Sailor Moon fosse leggermente ubriaco (capita..) e, una volta<br />

smaltita la sbornia, abbia accertato che il padre <strong>di</strong> Sailor non era Fiorellino, bensì<br />

Arconte. A questo punto Sailor Moon e Fritto misto risultano parenti (mezzi<br />

fratelli) con un coefficiente <strong>di</strong> parentela <strong>di</strong> 0,25. Il coefficiente <strong>di</strong> consanguineità <strong>di</strong><br />

Telemaco è allora 0,5 x 0,25 = 0,125, il che significa che la sua probabilità <strong>di</strong><br />

avere geni omozigoti rispetto al grado <strong>di</strong> omozigosi me<strong>di</strong>a della popolazione <strong>di</strong><br />

ronzini della Mancia è superiore del 12,5%.<br />

Analogamente al coefficiente <strong>di</strong> parentela, il coefficiente <strong>di</strong> consanguineità può<br />

essere calcolato <strong>di</strong>rettamente dal pe<strong>di</strong>gree dell’animale con la formula<br />

n(a) + 1<br />

[3] Fx = Σ 0,5<br />

dove la sommatoria è estesa a tutti gli ascendenti comuni (del padre e della madre <strong>di</strong><br />

x) ed n è il numero <strong>di</strong> frecce che collegano ,nel <strong>di</strong>agramma familiare, il padre e la<br />

madre attraverso tale ascendente.<br />

Qualora anche gli ascendenti <strong>di</strong> un animale siano essi stessi consanguinei, occorre<br />

tenere conto <strong>di</strong> ciò nel calcolo del coefficiente che <strong>di</strong>venta<br />

[4] Fx = Σ 0,5 n(a)+1 (1 + Fa)<br />

dove Fa sono i coefficienti <strong>di</strong> consanguineità degli ascendenti comuni al padre ed<br />

alla madre <strong>di</strong> x.<br />

10.4 L’impiego dell’inincrocio e dell’esincrocio in zootecnica<br />

Secondo Grasselli, la conoscenza sulle relazioni <strong>di</strong> parentela fra gli animali è<br />

sfruttata, nell’ambito del miglioramento genetico degli animali zootecnici, non solo<br />

per aumentare il numero <strong>di</strong> informazioni fenotipiche utilizzabili nella stima del<br />

valore genetico <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo, ma anche per la costruzione <strong>di</strong> veri e propri schemi<br />

<strong>di</strong> selezione che utilizzino adeguatamente i vantaggi derivanti dall’omozigosi oppure<br />

quelli dell’eterozigosi per alcuni caratteri produttivi. Di norma la consanguineità<br />

provoca effetti depressivi sull’espressione del carattere mentre l’eterozigosi ne<br />

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esalta l’espressione per effetto del meccanismo che nei vegetali prende il nome <strong>di</strong><br />

vigore ibrido.<br />

Le conseguenze negative dell’inincrocio per l’uomo e per gli animali sono note da<br />

molto tempo; Darwin scriveva che “le conseguenze dell’accoppiamento fra parenti<br />

sono la riduzione <strong>di</strong> statura, la per<strong>di</strong>ta <strong>di</strong> robustezza costituzionale e <strong>di</strong> fertilità,<br />

talvolta accompagnate dalla tendenza alle malformazioni”.<br />

Poiché la consanguineità comporta l’aumento della frazione <strong>di</strong> loci omozigoti<br />

rispetto alla me<strong>di</strong>a della popolazione, non dovremo notare <strong>di</strong>fferenze, nel caso <strong>di</strong><br />

caratteri quantitativi, fra in<strong>di</strong>vidui consanguinei e non a causa della stessa frazione<br />

<strong>di</strong> geni positivi e negativi che <strong>di</strong>venta omozigote. I caratteri legati alla vitalità<br />

dell’in<strong>di</strong>viduo non sono normalmente <strong>di</strong> tipo ad<strong>di</strong>tivo (dominanza, sovradominanza,<br />

ecc..) l’in<strong>di</strong>viduo eterozigote ha espressioni fenotipiche superiori rispetto a quello<br />

omozigote.<br />

Vi sono geni recessivi che sono responsabili <strong>di</strong> malformazioni, alcune ad<strong>di</strong>rittura<br />

letali, che si esprimono soltanto allo stato omozigote. La loro ricerca e<br />

l’eliminazione dei riproduttori portatori, che pur vitali e fertili, sono in grado <strong>di</strong><br />

trasmettere il carattere negativo alla <strong>di</strong>scendenza, costituisce uno degli strumenti<br />

concreti in mano alla selezione per contenere il <strong>di</strong>ffondersi dei geni indesiderati. Le<br />

tecniche <strong>di</strong> monitoraggio per tali geni fanno ricorso all’accoppiamento dei maschi<br />

can<strong>di</strong>dati alla selezione con le femmine sicuramente portatrici oppure con le proprie<br />

figlie; il responso dell’indagine è del tipo “ad esclusione” e riporta la probabilità<br />

che l’animale testato possa essere portatore del gene indesiderato.<br />

Poiché la consanguineità deprime in particolare la vitalità dell’in<strong>di</strong>viduo, gli animali<br />

inincrociati presentano in generale la depressione <strong>delle</strong> produzioni, evidente<br />

soprattutto nel caso in cui essi siano posti in con<strong>di</strong>zioni ambientali <strong>di</strong>fficili. La<br />

tabella seguente riporta gli effetti della consanguineità sui caratteri produttivi e<br />

riproduttivi <strong>delle</strong> principali specie zootecniche (da Piechner, pubblicato su<br />

Chapman).<br />

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Specie e carattere Cambiamento per<br />

ogni 1% <strong>di</strong> F (in %<br />

sulla me<strong>di</strong>a)<br />

Bovini<br />

produzione <strong>di</strong> latte -0,5<br />

tasso <strong>di</strong> concepimento -1,26<br />

peso alla nascita -0,70<br />

peso a 6 mesi -0,44<br />

peso a 12 mesi -0,16<br />

incremento postsvezzamento -0,20<br />

efficienza <strong>di</strong> conversione alimentare -0,32<br />

spermatozoi/eiaculato -0,50<br />

Suini<br />

numero nati vivi (figliata consanguinea) -0,28<br />

numero svezzati “ -0,73<br />

numero nati vivi (madri consanguinee) -0,70<br />

numero svezzati “ -0,46<br />

peso della ni<strong>di</strong>ata alla nascita -0,50<br />

incremento ponderale giornaliero -0,42<br />

Ovini<br />

produzione <strong>di</strong> latte -0,26<br />

peso corporeo all’anno <strong>di</strong> età -0,22<br />

peso del vello -0,70<br />

Polli<br />

fertilità -0,04<br />

produzione <strong>di</strong> uova -0,38<br />

taglia -0,20<br />

L’esincrocio è una tecnica che consente l’aumento del grado <strong>di</strong> eterozigosi negli<br />

animali che ne derivano i quali presentano, rispetto alla popolazione, <strong>di</strong> norma una<br />

robustezza costituzionale superiore che si riflette, in alcuni casi, in una performance<br />

produttiva superiore a quella che deriverebbe dalla me<strong>di</strong>a <strong>delle</strong> prestazioni paterne e<br />

materne. Il fenomeno dell’eterosi da cui ciò deriva, detto anche lussureggiamento<br />

degli ibri<strong>di</strong>, negli animali non è <strong>di</strong> norma così evidente come nei vegetali.<br />

Al contrario che per inincrocio, non esiste un coefficiente che misuri il grado <strong>di</strong><br />

eterosi, poiché una tale definizione comporterebbe la completa conoscenza del<br />

genotipo della popolazione da cui sono estratti gli in<strong>di</strong>vidui da accoppiare. Il grado<br />

<strong>di</strong> eterosi si misura allora semplicemente con la superiorità della me<strong>di</strong>a dei fenotipi<br />

rispetto a quella <strong>delle</strong> popolazioni da cui derivano i genitori.<br />

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Esempio 10.4 Poniamo <strong>di</strong> voler calcolare il grado <strong>di</strong> eterosi eventualmente<br />

esistente nell’incrocio fra le razze bovine Limousine (razza da carne francese) e<br />

Sarda (razza rustica isolana) e <strong>di</strong> <strong>di</strong>sporre dei dati degli accrescimenti me<strong>di</strong><br />

misurati sulle sue popolazioni che sono <strong>di</strong> kg 1,350 nella prima e kg 0,740 nella<br />

seconda. Se sono fatti accoppiare casualmente in<strong>di</strong>vidui <strong>delle</strong> due razze (e <strong>di</strong><br />

norma nella realtà avviene così) e si misurano gli accrescimenti in con<strong>di</strong>zioni<br />

analoghe a quelle utilizzate per il rilievo dei dati parentali, la me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> tali dati,<br />

risultata <strong>di</strong> kg 1,120), può essere confrontata nel seguente modo:<br />

me<strong>di</strong>a parentale = (1,350 + 740)/2 = 1,045<br />

me<strong>di</strong>a filiale = 1,120<br />

effetto <strong>di</strong> eterosi = +0,075<br />

sempre che i dati siano stati raccolti correttamente.<br />

L’eterosi è sfruttata in molti sistemi <strong>di</strong> produzione animale, particolarmente in<br />

suinicoltura ed in avicoltura: nel primo caso si assiste normalmente all’incrocio fra<br />

razze <strong>di</strong>verse (molto utilizzato è quello fra Large White x Landrace, Pietrain x<br />

Large White) oppure fra linee <strong>di</strong>verse della stessa razza; nel secondo caso si<br />

utilizzano schemi selettivi che fanno ricorso quasi esclusivamente all’incrocio fra<br />

linee. Questa tecnica prevede la creazione <strong>di</strong> linee inincrociate fortemente<br />

selezionate (grand parents) che sono incrociate fra loro con l’ottenimento dei<br />

cosiddetti parents i quali forniranno i prodotti finali da impiegare nella produzione.<br />

Lo schema <strong>di</strong> selezione è detto a due, tre, quattro (o più) linee in funzione del<br />

numero <strong>di</strong> linee che entrano nella costituzione del soggetto definitivo.<br />

La tecnica riproduttiva che sfrutta l’eterosi è, in pratica, detta incrocio ed in<strong>di</strong>ca<br />

l’accoppiamento <strong>di</strong> animali della stessa specie geneticamente molto <strong>di</strong>versi; questa<br />

denominazione <strong>di</strong> norma è utilizzata nel caso dell’impiego <strong>di</strong> due razza; la<br />

riproduzione entro la razza (o entro la linea) è invece chiamata accoppiamento.<br />

Pertanto, un toro <strong>di</strong> razza Charolais ed una vacca <strong>di</strong> razza Mo<strong>di</strong>cana sono incrociati<br />

fra <strong>di</strong> loro; due soggetti <strong>di</strong> razza ovina Sarda sono accoppiati fra loro.<br />

Fra i <strong>di</strong>versi tipi <strong>di</strong> incrocio, possiamo ricordare:<br />

a) l’incrocio industriale che si effettua, nella produzione della carne, fra due razze<br />

<strong>di</strong>fferenti per l’ottenimento <strong>di</strong> un prodotto (detto F1 = 1a generazione filiale) da<br />

destinare completamente alla macellazione; questa tecnica è detta industriale in<br />

quanto i prodotti ottenuti sono caratterizzati da grande uniformità morfologica quasi<br />

come i manufatti industriali;<br />

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b) l’incrocio <strong>di</strong> sostituzione che si attua qualora con la razza A si voglia assorbire<br />

gradualmente quella B; il caso classico è quello che, nel passato, ha portato la razza<br />

bovina Bruna a sostituire la razza Sarda in molte plaghe della Sardegna;<br />

c) l’incrocio continuo o ricorrente, in cui gli F1 sono accoppiati alternativamente<br />

con una <strong>delle</strong> due razze <strong>di</strong> provenienza per mantenere il grado in insanguamento<br />

<strong>delle</strong> generazioni entro limiti prefissati (37,5 - 66,5).<br />

Epilogo<br />

In un famoso film Alberto Sor<strong>di</strong>, che rimbrottava la moglie per non ricordo quale<br />

ragione, conclude il litigio <strong>di</strong>cendole: “Sta ‘mpò zitta te che nun semo nanche<br />

parenti”.<br />

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____________________________________________________________________________________<br />

11. BIBLIOGRAFIA CONSULTATA<br />

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Miglioramento genetico degli animali in produzione zootecnica<br />

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131

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